Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1530
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1530, 446 aa
1>>>pF1KE1530 446 - 446 aa - 446 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2195+/-0.00091; mu= 18.1521+/- 0.055
mean_var=67.6694+/-13.643, 0's: 0 Z-trim(105.9): 35 B-trim: 135 in 1/50
Lambda= 0.155911
statistics sampled from 8626 (8661) to 8626 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16
Scan time: 2.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11858.1 TUBB6 gene_id:84617|Hs108|chr18 ( 446) 3006 685.2 3.4e-197
CCDS10988.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 ( 450) 2810 641.2 6.4e-184
CCDS12168.1 TUBB4A gene_id:10382|Hs108|chr19 ( 444) 2776 633.5 1.3e-181
CCDS4485.1 TUBB2B gene_id:347733|Hs108|chr6 ( 445) 2760 629.9 1.5e-180
CCDS7039.1 TUBB4B gene_id:10383|Hs108|chr9 ( 445) 2754 628.6 3.9e-180
CCDS4484.1 TUBB2A gene_id:7280|Hs108|chr6 ( 445) 2745 626.5 1.6e-179
CCDS4687.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 ( 444) 2741 625.6 3e-179
CCDS7051.1 TUBB8 gene_id:347688|Hs108|chr10 ( 444) 2614 597.1 1.2e-170
CCDS13475.1 TUBB1 gene_id:81027|Hs108|chr20 ( 451) 2414 552.1 4.2e-157
CCDS56012.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 ( 378) 2370 542.1 3.4e-154
CCDS78124.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 ( 372) 2328 532.7 2.4e-151
CCDS8782.1 TUBA1C gene_id:84790|Hs108|chr12 ( 449) 1281 297.2 2.2e-80
CCDS2438.1 TUBA4A gene_id:7277|Hs108|chr2 ( 448) 1280 297.0 2.5e-80
CCDS31792.1 TUBA1B gene_id:10376|Hs108|chr12 ( 451) 1274 295.7 6.5e-80
CCDS76556.1 TUBA1C gene_id:84790|Hs108|chr12 ( 519) 1274 295.7 7.3e-80
CCDS8781.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 451) 1266 293.9 2.3e-79
CCDS58227.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 451) 1266 293.9 2.3e-79
CCDS33290.1 TUBA3D gene_id:113457|Hs108|chr2 ( 450) 1256 291.6 1.1e-78
CCDS9284.1 TUBA3C gene_id:7278|Hs108|chr13 ( 450) 1256 291.6 1.1e-78
CCDS13751.1 TUBA8 gene_id:51807|Hs108|chr22 ( 449) 1235 286.9 2.8e-77
CCDS63131.1 TUBA4A gene_id:7277|Hs108|chr2 ( 433) 1228 285.3 8.2e-77
CCDS2158.1 TUBA3E gene_id:112714|Hs108|chr2 ( 450) 1227 285.1 9.8e-77
CCDS58226.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 416) 1157 269.3 5.1e-72
CCDS54495.1 TUBA8 gene_id:51807|Hs108|chr22 ( 383) 1091 254.5 1.4e-67
CCDS53491.1 TUBAL3 gene_id:79861|Hs108|chr10 ( 406) 1081 252.2 7e-67
CCDS7066.2 TUBAL3 gene_id:79861|Hs108|chr10 ( 446) 1081 252.3 7.5e-67
CCDS11433.1 TUBG1 gene_id:7283|Hs108|chr17 ( 451) 1003 234.7 1.4e-61
CCDS32658.1 TUBG2 gene_id:27175|Hs108|chr17 ( 451) 994 232.7 5.9e-61
CCDS77153.1 TUBB6 gene_id:84617|Hs108|chr18 ( 104) 634 151.3 4.2e-37
CCDS5100.1 TUBE1 gene_id:51175|Hs108|chr6 ( 475) 517 125.4 1.2e-28
CCDS54154.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 396) 453 111.0 2.3e-24
CCDS11620.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 453) 453 111.0 2.5e-24
CCDS54152.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 351) 428 105.3 1e-22
CCDS54153.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 398) 428 105.3 1.1e-22
>>CCDS11858.1 TUBB6 gene_id:84617|Hs108|chr18 (446 aa)
initn: 3006 init1: 3006 opt: 3006 Z-score: 3653.8 bits: 685.2 E(32554): 3.4e-197
Smith-Waterman score: 3006; 100.0% identity (100.0% similar) in 446 aa overlap (1-446:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG
::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG
430 440
>>CCDS10988.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 (450 aa)
initn: 2810 init1: 2810 opt: 2810 Z-score: 3415.4 bits: 641.2 E(32554): 6.4e-184
Smith-Waterman score: 2810; 93.0% identity (98.4% similar) in 443 aa overlap (1-443:1-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
:::::::::::::::::.::::::::::::::.:.::::: ::::::.:::::.::.:::
CCDS10 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPSGNYVGDSDLQLERISVYYNEASSHKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
::: ::::::::::::::: ::.:::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::
CCDS10 PRAILVDLEPGTMDSVRSGAFGHLFRPDNFIFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
:::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::.::::::::::
CCDS10 RKECENCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKVREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS10 EPYNATLSIHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLATPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:::
CCDS10 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AACDPRHGRYLTVATVFRGRMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
:::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS10 LKMSSTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG
::::::::::.. : .::.:::
CCDS10 EYQQYQDATAEEEGEMYEDDEEESEAQGPK
430 440 450
>>CCDS12168.1 TUBB4A gene_id:10382|Hs108|chr19 (444 aa)
initn: 2772 init1: 2772 opt: 2776 Z-score: 3374.2 bits: 633.5 E(32554): 1.3e-181
Smith-Waterman score: 2776; 92.3% identity (97.5% similar) in 443 aa overlap (1-443:1-441)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
::::::.::::::::::.::::::::::::::.: : ::: ::::::::::::... .::
CCDS12 MREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGNYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
:::.:::::::::::::::::::.::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
::: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS12 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS12 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS12 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
::::::::::::::.:::: :::::::::::..:::::::::::::::::.:::::::::
CCDS12 AACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLSVQSKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS12 LKMAATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG
::::::::::..:: ::.: ::
CCDS12 EYQQYQDATAEEGE--FEEEAEEEVA
430 440
>>CCDS4485.1 TUBB2B gene_id:347733|Hs108|chr6 (445 aa)
initn: 2740 init1: 2740 opt: 2760 Z-score: 3354.7 bits: 629.9 E(32554): 1.5e-180
Smith-Waterman score: 2760; 91.4% identity (97.3% similar) in 443 aa overlap (1-443:1-442)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
:::::::::::::::::.::::::::::::::.:.: ::: ::::::::::::....:::
CCDS44 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEATGNKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
::: :::::::::::::::::::.::::::.:::.:::::::::::::::::::.:::::
CCDS44 PRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
::: : ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS44 RKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS44 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::
CCDS44 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
::::::::::::::..::: ::::::::::: .:.:::::::::::::::.:::::::::
CCDS44 AACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
:::..::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS44 LKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG
::::::::::.. : ::.:: :
CCDS44 EYQQYQDATADEQGE-FEEEEGEDEA
430 440
>>CCDS7039.1 TUBB4B gene_id:10383|Hs108|chr9 (445 aa)
initn: 2776 init1: 2754 opt: 2754 Z-score: 3347.4 bits: 628.6 E(32554): 3.9e-180
Smith-Waterman score: 2754; 91.4% identity (97.1% similar) in 443 aa overlap (1-443:1-442)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
::::::.::::::::::.::::::::::::::.: : ::: ::::::::::::... :::
CCDS70 MREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
:::.:::::::::::::::::::.::::::.:::.:::::::::::::::::::.:::::
CCDS70 PRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
::: : ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::
CCDS70 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS70 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS70 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
::::::::::::::.:::: ::::::::::: .:.:::::::::::::::.:::::::::
CCDS70 AACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
:::..::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS70 LKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG
::::::::::.. : ::.: ::
CCDS70 EYQQYQDATAEE-EGEFEEEAEEEVA
430 440
>>CCDS4484.1 TUBB2A gene_id:7280|Hs108|chr6 (445 aa)
initn: 2725 init1: 2725 opt: 2745 Z-score: 3336.5 bits: 626.5 E(32554): 1.6e-179
Smith-Waterman score: 2745; 91.2% identity (97.1% similar) in 443 aa overlap (1-443:1-442)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
:::::::::::::::::.::::::::::::::.:.: ::: ::::::::::::....:::
CCDS44 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
::: :::::::::::::::::::.::::::.:::.:::::::::::::::::::.:::::
CCDS44 PRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
::: : ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS44 RKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS44 EPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::
CCDS44 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
::::::::::::::..::: ::::::::::: .:.:::::::::::::::.:::::::::
CCDS44 AACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
:::..::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS44 LKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG
::::::::::.. : ::.:: :
CCDS44 EYQQYQDATADEQGE-FEEEEGEDEA
430 440
>>CCDS4687.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 (444 aa)
initn: 2741 init1: 2741 opt: 2741 Z-score: 3331.6 bits: 625.6 E(32554): 3e-179
Smith-Waterman score: 2741; 91.0% identity (96.6% similar) in 443 aa overlap (1-443:1-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
:::::::::::::::::.::::::::::::::.: : ::: :::.::.:::::... :::
CCDS46 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
::: :::::::::::::::::::.::::::.:::.:::::::::::::::::::.:::::
CCDS46 PRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
::: : ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::
CCDS46 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS46 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::
CCDS46 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
::::::::::::::.:::: ::::::::::: .:.:::::::::::::::.:::::::::
CCDS46 AACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
:::: ::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG
::::::::::.. :. :. :::
CCDS46 EYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA
430 440
>>CCDS7051.1 TUBB8 gene_id:347688|Hs108|chr10 (444 aa)
initn: 2610 init1: 2610 opt: 2614 Z-score: 3177.3 bits: 597.1 E(32554): 1.2e-170
Smith-Waterman score: 2614; 85.8% identity (94.8% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
::::: : ::::::::.::::::::::.:: :: : ::: ::::::::::::.:. .::
CCDS70 MREIVLTQIGQCGNQIGAKFWEVISDEHAIDSAGTYHGDSHLQLERINVYYNEASGGRYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
:::.:::::::::::::::::::.:::::::::: :::::::::::::::::...:.:::
CCDS70 PRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFIFGQCGAGNNWAKGHYTEGAELMESVMDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
::: : :::::::::::::::::::::::::.::::::.::::.::::..::::::::::
CCDS70 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLLSKIREEYPDRIINTFSILPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
::::::::::::.::.:::.::::::::::: .:::: :::::::::::::::::::: :
CCDS70 EPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSKTLKLPTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::
CCDS70 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVAELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
::::::::::::.:..::: : :.::::::. ::.::::::..:.:::::.:::::::::
CCDS70 AACDPRHGRYLTAAAIFRGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWLPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
:::..:::::.:::::::::.::::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS70 LKMSATFIGNNTAIQELFKRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE1 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG
::::::::::.. :: : :::.
CCDS70 EYQQYQDATAEE-EEDEEYAEEEVA
430 440
>>CCDS13475.1 TUBB1 gene_id:81027|Hs108|chr20 (451 aa)
initn: 2441 init1: 2411 opt: 2414 Z-score: 2934.0 bits: 552.1 E(32554): 4.2e-157
Smith-Waterman score: 2414; 78.4% identity (92.8% similar) in 445 aa overlap (1-443:1-445)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
:::::::: ::::::::.::::.:..::::: ::. : ::::::::.:::::. ..:::
CCDS13 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
:::.:::::::::::.::. .: ::.::.:. :..:::::::::::::::::.. ::.::
CCDS13 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
:.: : ::::::::..:::::::::::::::..:::::.::::::.::::::::::::::
CCDS13 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
:::::.::.:::.::.: .:::::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::
CCDS13 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.: ::::::::::: :
CCDS13 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
:::: :.::::::: .::: :: ::::.:.:..:..::: ::::::::::::::::::::
CCDS13 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
:.::.:::::.:::::.:.:.::.:::::.::::.::.:.:::: :: :::.:..::::
CCDS13 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE1 EYQQYQDATA--NDGEEAFEDEEEEIDG
::::.::: : .. ::. :. : :
CCDS13 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
430 440 450
>>CCDS56012.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 (378 aa)
initn: 2370 init1: 2370 opt: 2370 Z-score: 2881.7 bits: 542.1 E(32554): 3.4e-154
Smith-Waterman score: 2370; 93.8% identity (98.7% similar) in 371 aa overlap (73-443:1-371)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 QLERINVYYNESSSQKYVPRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWA
::::::: ::.:::::::::::.:::::::
CCDS56 MDSVRSGAFGHLFRPDNFIFGQSGAGNNWA
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 KGHYTEGAELVDAVLDVVRKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDR
::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::
CCDS56 KGHYTEGAELVDSVLDVVRKECENCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKVREEYPDR
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 IMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTY
:::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS56 IMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSIHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLATPTY
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 GDLNHLVSATMSGVTTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS56 GDLNHLVSATMSGVTTSLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYR
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 ALTVPELTQQMFDARNMMAACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFV
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS56 ALTVPELTQQMFDAKNMMAACDPRHGRYLTVATVFRGRMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFV
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 EWIPNNVKVAVCDIPPRGLKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEG
:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::
CCDS56 EWIPNNVKVAVCDIPPRGLKMSSTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEG
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440
pF1KE1 MDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG
::::::::::::::::::::::::::::.. : .::.:::
CCDS56 MDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEGEMYEDDEEESEAQGPK
340 350 360 370
446 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 02:37:44 2016 done: Mon Nov 7 02:37:45 2016
Total Scan time: 2.550 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]