Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1485
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1485, 423 aa
1>>>pF1KE1485 423 - 423 aa - 423 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8002+/-0.00106; mu= 14.0011+/- 0.063
mean_var=60.9284+/-12.490, 0's: 0 Z-trim(102.2): 30 B-trim: 12 in 1/47
Lambda= 0.164310
statistics sampled from 6828 (6851) to 6828 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 423) 2845 683.3 1.2e-196
CCDS73568.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 386) 1319 321.6 8.4e-88
CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 ( 417) 1155 282.7 4.6e-76
CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 ( 417) 1121 274.6 1.2e-73
CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8 ( 437) 1075 263.7 2.5e-70
CCDS2372.1 CPO gene_id:130749|Hs108|chr2 ( 374) 1028 252.6 4.8e-67
CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 ( 419) 921 227.2 2.3e-59
CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 436) 904 223.2 3.9e-58
CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7 ( 419) 870 215.1 1e-55
CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 421) 865 213.9 2.3e-55
CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 388) 789 195.9 5.6e-50
CCDS47713.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 403) 674 168.7 9.4e-42
>>CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 (423 aa)
initn: 2845 init1: 2845 opt: 2845 Z-score: 3644.1 bits: 683.3 E(32554): 1.2e-196
Smith-Waterman score: 2845; 99.5% identity (99.5% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFAFQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVLWQPVTAD
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CCDS94 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFAFQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVLWQPVTAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQQISNDTVSPRASASYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQQISNDTVSPRASASYY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNAIWIDCGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNAIWIDCGI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 HAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWKKNRMWRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 HAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWKKNRMWRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVASFLRRNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVASFLRRNI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 NQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVRAIEKTSKNTRYTHGHGSE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS94 NQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVRAIEKISKNTRYTHGHGSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYTKPTCREAFAAVSKIAWHVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS94 TLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYIKPTCREAFAAVSKIAWHVI
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RNV
:::
CCDS94 RNV
>>CCDS73568.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 (386 aa)
initn: 2578 init1: 1319 opt: 1319 Z-score: 1689.8 bits: 321.6 E(32554): 8.4e-88
Smith-Waterman score: 2508; 90.8% identity (90.8% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-386)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFAFQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVLWQPVTAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFAFQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVLWQPVTAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQQISNDTVSPRASASYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQQISNDTVSPRASASYY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNAIWIDCGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNAIWIDCGI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 HAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWKKNRMWRK
::::::::::::::::: ::::::
CCDS73 HAREWISPAFCLWFIGH-------------------------------------NRMWRK
190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVASFLRRNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVASFLRRNI
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 NQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVRAIEKTSKNTRYTHGHGSE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS73 NQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVRAIEKISKNTRYTHGHGSE
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYTKPTCREAFAAVSKIAWHVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS73 TLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYIKPTCREAFAAVSKIAWHVI
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 RNV
:::
CCDS73 RNV
>>CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 (417 aa)
initn: 1047 init1: 406 opt: 1155 Z-score: 1479.1 bits: 282.7 E(32554): 4.6e-76
Smith-Waterman score: 1155; 41.2% identity (73.9% similar) in 422 aa overlap (3-423:1-416)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFA-FQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVLWQPVTA
. .: ::: ..: .: :.. .:. . . .......:..: .: .:.: ..
CCDS33 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTTQIDFWKPDSV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 DLIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQQISNDTVSPRASASY
: .. : : :.: :. .:. :. . . .::......... :... . ::..
CCDS33 TQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQFDSRV---RATGHS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 YEQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNAIWIDCG
::.:.. . : .: . .. ..: .... ::..:: .:.::: :: : ::..:::
CCDS33 YEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLKV-GKAGQNKPAIFMDCG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IHAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWKKNRMWR
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CCDS33 FHAREWISPAFCQWFVREAVRTYGREIQVTELLDKLDFYVLPVLNIDGYIYTWTKSRFWR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 KNRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVASFLRRN
:.:: .... ::::: :::: . ::: ::: . :.::::: ::: :.::.:.:.: .
CCDS33 KTRSTHTGSSCIGTDPNRNF-DAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALADFIRNK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 INQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVRAIEKTSKNTRYTHGHGS
...::::...::::: ...::::. . .... ::. .:. .:. . . ..:.::.: :.
CCDS33 LSSIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELA-SLHGTKYTYGPGA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ETLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYTKPTCREAFAAVSKIAWHV
:.: : ::.::: :: ::.::::.:::::: ::::::: . ::.:.: :.. .: .:
CCDS33 TTIYPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYVASYV
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE1 IRNV
....
CCDS33 LEHLY
>>CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 (417 aa)
initn: 855 init1: 424 opt: 1121 Z-score: 1435.5 bits: 274.6 E(32554): 1.2e-73
Smith-Waterman score: 1121; 40.1% identity (72.4% similar) in 421 aa overlap (6-422:1-415)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFA---FQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVLWQPV
. ...:. :. ..: :. .:. . :. .:......:. : :. .: :
CCDS31 MRLILPVGLIATTLAIAPVRFDREKVFRVKPQDEKQADIIKDLAKTNELDFWYPG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 TADLIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQQIS-NDTVSPRAS
.. .. . .: : :. .. . ... :. . . .:. :... :..:.. .. . : :
CCDS31 ATHHVAANMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRHS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ASYYEQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNAIWI
: .:.. ..: .: : . ...:.:...:.:::. : ::::::. :... ..::.
CCDS31 ---YAKYNNWEKIVAWTEKMMDKYPEMVSRIKIGSTVEDNPLYVLKI-GEKNERRKAIFT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DCGIHAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWKKNR
:::::::::.::::: ::. . :. :: .:.:: ..::..:: ::::: .:: :::
CCDS31 DCGIHAREWVSPAFCQWFVYQATKTYGRNKIMTKLLDRMNFYILPVFNVDGYIWSWTKNR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 MWRKNRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVASFL
::::::: :..:::::::::: .. : ... :...: : :::: :.:::..:.
CCDS31 MWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNAS-WNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 RRNINQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVRAIEKTSKNTRYTHG
: ..:.::.::..::::: ..:::.:: . .::.:. ::. .. .. .: .::: .:
CCDS31 RSHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVL-STRYETRYIYG
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 HGSETLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYTKPTCREAFAAVSKIA
:.: :.. :: ::::::..:..:::: : .:::::: ::::::.. ::. ::
CCDS31 PIESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIA
350 360 370 380 390 400
420
pF1KE1 WHVIRNV
.....
CCDS31 KYILKHTS
410
>>CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8 (437 aa)
initn: 1027 init1: 360 opt: 1075 Z-score: 1376.2 bits: 263.7 E(32554): 2.5e-70
Smith-Waterman score: 1075; 39.1% identity (68.2% similar) in 425 aa overlap (1-421:15-434)
10 20 30 40
pF1KE1 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFA--FQSGQVLAALPRTSRQVQVLQN
. :: : .. :. ..:.. . . .:. .:.: ... .:..
CCDS62 MKCLGKRRGQAAAFLPLCWL--FLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKK
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 LTTTYEIVLWQPVTADLIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQ
.. .. :::: . . . . . . . . : :. ..: .::. :.. ...
CCDS62 ISYQLKVDLWQPSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTLEK
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 QISNDTVSPRASAS-Y-YEQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLK
: : : : : : :: ::::.:: .:.. ... : .. . :: :.: :..::
CCDS62 GSSLHTQRNRRSLSGYNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRSLFILK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 VSGKEQAAKNAIWIDCGIHAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPV
. :... : :.::::::::::::.:::: ::. . : . ..: . ::.:::
CCDS62 L-GRRSRLKRAVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFYIMPV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 VNVDGYDYSWKKNRMWRKNRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLY
::::: .:: ..:.:::.:: . .: :.: :::. : ::.:::: :..:::: .
CCDS62 FNVDGYHFSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVK-WCDEGASMHPCDDTYCGPF
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 PESEPEVKAVASFLRRNINQIKAYISMHSYSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVR
:::::::::::.:::.. ..:.::.:.:.:.: ...:::: . . . . .: .::
CCDS62 PESEPEVKAVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYKAVN
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 AIEKTSKNTRYTHGHGSETLYLAPGGGDDWIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYTK
:.... ..:: .: .: :::.. :.. :: : :: :.:..:::::: .:::::: :
CCDS62 ALQSVY-GVRYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEMLIK
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KE1 PTCREAFAAVSKIAWHVIRNV
::: :.. ::..:. :...
CCDS62 PTCTETMLAVKNITMHLLKKCP
420 430
>>CCDS2372.1 CPO gene_id:130749|Hs108|chr2 (374 aa)
initn: 964 init1: 539 opt: 1028 Z-score: 1317.2 bits: 252.6 E(32554): 4.8e-67
Smith-Waterman score: 1028; 45.9% identity (75.5% similar) in 314 aa overlap (103-415:29-340)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 NASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQQISNDTVSPRASASY-YEQYHSLNEIYS
.:.: . .::: . .: :. :: ..:::
CCDS23 MKPLLETLYLLGMLVPGGLGYDRSLAQHRQEIVDKSVSPWSLETYSYNIYHPMGEIYE
10 20 30 40 50
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 WIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNAIWIDCGIHAREWISPAFC
:.. :.:.. ...:. .: ..: .:.: ::.: :. ::.::::::::::.::::
CCDS23 WMREISEKYKEVVTQHFLGVTYETHPMYYLKISQPSGNPKKIIWMDCGIHAREWIAPAFC
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWKKNRMWRKNRSFYANNHCI
::. .: : . .. .::: .::::.::.:.::: :.: .:.:::.:: . :. :.
CCDS23 QWFVKEILQNHKDNSSIRKLLRNLDFYVLPVLNIDGYIYTWTTDRLWRKSRSPHNNGTCF
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 GTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVASFLRRNINQIKAYISMHS
:::::::: .. :: ::: . ..:.:: : ::::.::::::.. . ..: ...:::
CCDS23 GTDLNRNFNAS-WCSIGASRNCQDQTFCGTGPVSEPETKAVASFIESKKDDILCFLTMHS
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 YSQHIVFPYSYTRSKSKDHEELSLVASEAVRAIEKTSKNTRYTHGHGSETLYLAPGGGDD
:.: :. ::.::..::..: :. :...:. :. :.. .: : : ... :: . :.. :
CCDS23 YGQLILTPYGYTKNKSSNHPEMIQVGQKAANAL-KAKYGTNYRVGSSADILYASSGSSRD
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420
pF1KE1 WIYDLGIKYSFTIELRDTGTYGFLLPERYTKPTCREAFAAVSKIAWHVIRNV
: :.:: .:.:.::::.:::::.::: .:::.:.. :: ..
CCDS23 WARDIGIPFSYTFELRDSGTYGFVLPEAQIQPTCEETMEAVLSVLDDVYAKHWHSDSAGR
300 310 320 330 340 350
CCDS23 VTSATMLLGLLVSCMSLL
360 370
>>CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 872 init1: 304 opt: 921 Z-score: 1179.3 bits: 227.2 E(32554): 2.3e-59
Smith-Waterman score: 921; 38.3% identity (68.0% similar) in 412 aa overlap (14-419:16-414)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFAFQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVL--WQ-
..: . .: . ::: .: . .:.. : .: . .. : :.
CCDS58 MAMRLILFFGALFGHIYCLE---TFVGDQVLEIVPSNEEQIKNLLQLEAQEHLQLDFWKS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PVTADLIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQQISN---DTVS
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120 130 140 150 160 170
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CCDS58 VDFIKSH-GKVKAFITLHSYSQLLMFPYGYKCTKLDDFDELSEVAQKAAQSL-RSLHGTK
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CCDS58 YKVGPICSVIYQASGGSIDWSYDYGIKYSFAFELRDTGRYGFLLPARQILPTAEETWLGL
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420
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CCDS58 KAIMEHVRDHPY
410
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CCDS58 QETWMALRTIMEHTLNHPY
420 430
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CCDS58 VDFVKDHGN-IKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLY-GTK
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CCDS58 LTIMEHTLNHPY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]