Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1465
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1465, 376 aa
1>>>pF1KE1465 376 - 376 aa - 376 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7572+/-0.000388; mu= 11.4178+/- 0.024
mean_var=144.4939+/-30.483, 0's: 0 Z-trim(117.9): 348 B-trim: 1535 in 1/52
Lambda= 0.106696
statistics sampled from 29975 (30399) to 29975 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16
Scan time: 9.150
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002014 (OMIM: 600245) fibromodulin precursor [H ( 376) 2569 407.0 3.8e-113
NP_002336 (OMIM: 600616) lumican precursor [Homo s ( 338) 1030 170.0 7.2e-42
NP_958505 (OMIM: 601914) prolargin precursor [Homo ( 382) 858 143.6 7.3e-34
NP_002716 (OMIM: 601914) prolargin precursor [Homo ( 382) 858 143.6 7.3e-34
NP_008966 (OMIM: 217300,603288) keratocan precurso ( 352) 813 136.6 8.4e-32
NP_060150 (OMIM: 603932,607850,608135) asporin iso ( 379) 436 78.6 2.6e-14
NP_001184225 (OMIM: 603479) extracellular matrix p ( 643) 434 78.5 4.7e-14
NP_001184224 (OMIM: 603479) extracellular matrix p ( 677) 434 78.5 4.9e-14
NP_001384 (OMIM: 603479) extracellular matrix prot ( 699) 434 78.6 5e-14
XP_016874406 (OMIM: 125255,610048) PREDICTED: deco ( 359) 425 76.9 8.1e-14
NP_598010 (OMIM: 125255,610048) decorin isoform a ( 359) 425 76.9 8.1e-14
XP_006719333 (OMIM: 125255,610048) PREDICTED: deco ( 359) 425 76.9 8.1e-14
XP_005268750 (OMIM: 125255,610048) PREDICTED: deco ( 359) 425 76.9 8.1e-14
NP_001911 (OMIM: 125255,610048) decorin isoform a ( 359) 425 76.9 8.1e-14
XP_016885213 (OMIM: 300106,301870) PREDICTED: bigl ( 368) 420 76.1 1.4e-13
NP_001702 (OMIM: 300106,301870) biglycan prepropro ( 368) 420 76.1 1.4e-13
XP_011527506 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 400 73.3 1.8e-12
NP_037413 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repea ( 649) 400 73.3 1.8e-12
NP_938205 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repea ( 649) 400 73.3 1.8e-12
XP_005260739 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 400 73.3 1.8e-12
XP_011527507 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 400 73.3 1.8e-12
XP_005273918 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-ric ( 674) 394 72.4 3.5e-12
NP_037412 (OMIM: 604806) leucine-rich repeat trans ( 674) 394 72.4 3.5e-12
XP_011543185 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-ric ( 674) 394 72.4 3.5e-12
XP_011534913 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12
XP_016876622 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12
NP_001333074 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 390 71.8 5.3e-12
NP_001333075 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 390 71.8 5.3e-12
XP_016876623 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12
NP_001333073 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 390 71.8 5.3e-12
XP_016876620 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12
XP_016876621 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12
XP_016876624 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12
NP_001333072 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 390 71.8 5.3e-12
XP_016876618 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12
XP_005267547 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12
NP_037363 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat trans ( 660) 390 71.8 5.3e-12
XP_016876619 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 390 71.8 5.3e-12
XP_011538979 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 402) 356 66.3 1.4e-10
XP_005270514 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 613) 356 66.5 1.9e-10
NP_001186009 (OMIM: 608661) podocan isoform 2 [Hom ( 642) 356 66.5 1.9e-10
NP_001186010 (OMIM: 608661) podocan isoform 2 [Hom ( 642) 356 66.5 1.9e-10
XP_016855783 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 652) 356 66.5 2e-10
NP_714914 (OMIM: 608661) podocan isoform 1 [Homo s ( 661) 356 66.5 2e-10
NP_001264155 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-co ( 883) 314 60.2 2.2e-08
NP_003658 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-conta ( 907) 311 59.7 3e-08
NP_004961 (OMIM: 601489,615961) insulin-like growt ( 605) 304 58.5 4.8e-08
NP_001139478 (OMIM: 601489,615961) insulin-like gr ( 643) 304 58.5 5e-08
NP_071426 (OMIM: 610486) leucine-rich repeat-conta ( 653) 302 58.2 6.3e-08
XP_011514763 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653) 302 58.2 6.3e-08
>>NP_002014 (OMIM: 600245) fibromodulin precursor [Homo (376 aa)
initn: 2569 init1: 2569 opt: 2569 Z-score: 2152.4 bits: 407.0 E(85289): 3.8e-113
Smith-Waterman score: 2569; 100.0% identity (100.0% similar) in 376 aa overlap (1-376:1-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MQWTSLLLLAGLFSLSQAQYEDDPHWWFHYLRSQQSTYYDPYDPYPYETYEPYPYGVDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MQWTSLLLLAGLFSLSQAQYEDDPHWWFHYLRSQQSTYYDPYDPYPYETYEPYPYGVDEG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PAYTYGSPSPPDPRDCPQECDCPPNFPTAMYCDNRNLKYLPFVPSRMKYVYFQNNQITSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PAYTYGSPSPPDPRDCPQECDCPPNFPTAMYCDNRNLKYLPFVPSRMKYVYFQNNQITSI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKLRHLERLYLDHNNLTRMPGPLPRSLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKLRHLERLYLDHNNLTRMPGPLPRSLRE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQEVGSSMRGLRSLILLDLSYNHLRKVPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQEVGSSMRGLRSLILLDLSYNHLRKVPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 GLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLLYVRLSHNSLTNNGLASNTFNSSSLLELDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLLYVRLSHNSLTNNGLASNTFNSSSLLELDL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEFSISSFCTVVDVVNFSKLQVLRLDGNEIKRSAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEFSISSFCTVVDVVNFSKLQVLRLDGNEIKRSAM
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE1 PADAPLCLRLASLIEI
::::::::::::::::
NP_002 PADAPLCLRLASLIEI
370
>>NP_002336 (OMIM: 600616) lumican precursor [Homo sapie (338 aa)
initn: 1216 init1: 920 opt: 1030 Z-score: 872.7 bits: 170.0 E(85289): 7.2e-42
Smith-Waterman score: 1030; 46.5% identity (79.2% similar) in 318 aa overlap (61-376:26-337)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 LRSQQSTYYDPYDPYPYETYEPYPYGVDEGPAYTYGSPSPPDPRDCPQECDCPPNFPTAM
: ::. :: .: ::.:: ..:.::
NP_002 MSLSAFTLFLALIGGTSGQYYDYDFPLSIYGQSSP----NCAPECNCPESYPSAM
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 YCDNRNLKYLPFVPSRMKYVYFQNNQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKV
:::. .:: .:.:: .::.:..:::: :.: .:.:.: : :. : : . ..:. .:
NP_002 YCDELKLKSVPMVPPGIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHNLLENSKIKGRV
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 FSKLRHLERLYLDHNNLTRMPGPLPRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHN
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NP_002 FSKLKQLKKLHINHNNLTESVGPLPKSLEDLQLTHNKITKL--GSFEGLVNLTFIHLQHN
120 130 140 150 160
220 230 240 250 260
pF1KE1 EIQE--VGSSMRGLRSLILLDLSYNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAP
...: :.....::.:: ::::.:.. ..:.::: .: ::...:.. ..:: ::.
NP_002 RLKEDAVSAAFKGLKSLEYLDLSFNQIARLPSGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKRFN
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 KLLYVRLSHNSLTNNGLASNTFNSSSLLELDLSYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEF
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NP_002 ALQYLRLSHNELADSGIPGNSFNVSSLVELDLSYNKLKNIPTVNENLENYYLEVNQLEKF
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370
pF1KE1 SISSFCTVVDVVNFSKLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI
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NP_002 DIKSFCKILGPLSYSKIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN
290 300 310 320 330
>>NP_958505 (OMIM: 601914) prolargin precursor [Homo sap (382 aa)
initn: 966 init1: 360 opt: 858 Z-score: 728.9 bits: 143.6 E(85289): 7.3e-34
Smith-Waterman score: 905; 40.2% identity (68.6% similar) in 388 aa overlap (3-376:7-382)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MQWTSLLLLAGLFSLSQAQYEDDPHWWFHY-LRSQQSTYYDPYDPYPYETYEPYPY
: :: : : :..:.: :. : . : : : : ::
NP_958 MRSPLCW--LLPLLILASVAQGQPTRRPRPGTGPGRRPRPRPRPTPSFPQPDEPAEP---
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GVDEGPAYTYGSPSP-PDPRDCPQECDCPPNFPTAMYCDNRNLKYLPFVPSRMKYVYFQN
.: : : :: : :::.:: :::.::.:.:::.:::. .: .: :..:.:.::
NP_958 -TDLPPPLPPGPPSIFP---DCPRECYCPPDFPSALYCDSRNLRKVPVIPPRIHYLYLQN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 NQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKLRHLERLYLDHNNLTRMPGPL
: :: . :.::::: :: : .:.: :. ..:. :: : ::...:.: ..:. :
NP_958 NFITELPVESFQNATGLRWINLDNNRIR--KIDQRVLEKLPGLVFLYMEKNQLEEVPSAL
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQE---VGSSMRGLRSLILLDLS
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NP_958 PRNLEQLRLSQNHISRIPPGVFSKLENLLLLDLQHNRLSDGVFKPDTFHGLKNLMQLNLA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 YNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLLYVRLSHNSLTNNGLASNTFN
.: :::.: .:.:..:::.. :.. :.:..::.. :.: ..::..:.::. :: .:.::
NP_958 HNILRKMPPRVPTAIHQLYLDSNKIETIPNGYFKSFPNLAFIRLNYNKLTDRGLPKNSFN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE1 SSSLLELDLSYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEFSISSFCT--VV-------DVVNF
:.:: : ::.:.....: .:. ::.:::..: :.... ...: .: :. :
NP_958 ISNLLVLHLSHNRISSVPAINNRLEHLYLNNNSIEKINGTQICPNDLVAFHDFSSDLENV
290 300 310 320 330 340
350 360 370
pF1KE1 SKLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI
.:. :::::: .: .: : .:.:: . . :
NP_958 PHLRYLRLDGNYLK-PPIPLDLMMCFRLLQSVVI
350 360 370 380
>>NP_002716 (OMIM: 601914) prolargin precursor [Homo sap (382 aa)
initn: 966 init1: 360 opt: 858 Z-score: 728.9 bits: 143.6 E(85289): 7.3e-34
Smith-Waterman score: 905; 40.2% identity (68.6% similar) in 388 aa overlap (3-376:7-382)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MQWTSLLLLAGLFSLSQAQYEDDPHWWFHY-LRSQQSTYYDPYDPYPYETYEPYPY
: :: : : :..:.: :. : . : : : : ::
NP_002 MRSPLCW--LLPLLILASVAQGQPTRRPRPGTGPGRRPRPRPRPTPSFPQPDEPAEP---
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GVDEGPAYTYGSPSP-PDPRDCPQECDCPPNFPTAMYCDNRNLKYLPFVPSRMKYVYFQN
.: : : :: : :::.:: :::.::.:.:::.:::. .: .: :..:.:.::
NP_002 -TDLPPPLPPGPPSIFP---DCPRECYCPPDFPSALYCDSRNLRKVPVIPPRIHYLYLQN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 NQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKLRHLERLYLDHNNLTRMPGPL
: :: . :.::::: :: : .:.: :. ..:. :: : ::...:.: ..:. :
NP_002 NFITELPVESFQNATGLRWINLDNNRIR--KIDQRVLEKLPGLVFLYMEKNQLEEVPSAL
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQE---VGSSMRGLRSLILLDLS
::.:..:.:..:.:::.: ... :::: : ::::.... ....::..:. :.:.
NP_002 PRNLEQLRLSQNHISRIPPGVFSKLENLLLLDLQHNRLSDGVFKPDTFHGLKNLMQLNLA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 YNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLLYVRLSHNSLTNNGLASNTFN
.: :::.: .:.:..:::.. :.. :.:..::.. :.: ..::..:.::. :: .:.::
NP_002 HNILRKMPPRVPTAIHQLYLDSNKIETIPNGYFKSFPNLAFIRLNYNKLTDRGLPKNSFN
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE1 SSSLLELDLSYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEFSISSFCT--VV-------DVVNF
:.:: : ::.:.....: .:. ::.:::..: :.... ...: .: :. :
NP_002 ISNLLVLHLSHNRISSVPAINNRLEHLYLNNNSIEKINGTQICPNDLVAFHDFSSDLENV
290 300 310 320 330 340
350 360 370
pF1KE1 SKLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI
.:. :::::: .: .: : .:.:: . . :
NP_002 PHLRYLRLDGNYLK-PPIPLDLMMCFRLLQSVVI
350 360 370 380
>>NP_008966 (OMIM: 217300,603288) keratocan precursor [H (352 aa)
initn: 889 init1: 492 opt: 813 Z-score: 691.9 bits: 136.6 E(85289): 8.4e-32
Smith-Waterman score: 865; 41.9% identity (75.4% similar) in 313 aa overlap (75-376:41-352)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 YPYETYEPYPYGVDEGPAYTYGSPSPPDPRDCPQECDCPPNFPTAMYCDNRNLKYLPFVP
.::.:: :::.::::.::.::.:: .: .:
NP_008 VLFITDTVWSRSVRQVYEVHDSDDWTIHDFECPMECFCPPSFPTALYCENRGLKEIPAIP
20 30 40 50 60 70
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 SRMKYVYFQNNQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKLRHLERLYLDH
::. :.:.::: : .: : :.::: : :: :. :.::. . . ..:.:..: :.:.
NP_008 SRIWYLYLQNNLIETIPEKPFENATQLRWINLNKNKITNYGIEKGALSQLKKLLFLFLED
80 90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 NNLTRMPGPLPRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQEVG---SSMRG
:.: ..:.::::::..:.: .:..::.:.... .::::: : ::.:.. . . ....:
NP_008 NELEEVPSPLPRSLEQLQLARNKVSRIPQGTFSNLENLTLLDLQNNKLVDNAFQRDTFKG
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 LRSLILLDLSYNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLLYVRLSHNSLT
:..:. :... : ::..: ::. ::....:.. .:..:: ::. ..::.::.:.
NP_008 LKNLMQLNMAKNALRNMPPRLPANTMQLFLDNNSIEGIPENYFNVIPKVAFLRLNHNKLS
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 NNGLASNTFNSSSLLELDLSYNQLQKIPPVNTNLENLYLQGNRINEFSISSFCTVVDVV-
..:: : :. ::.:.:.::.::: :.: ....:..:.:. :.:. ..: .: ...
NP_008 DEGLPSRGFDVSSILDLQLSHNQLTKVPRISAHLQHLHLDHNKIKSVNVSVICPSPSMLP
260 270 280 290 300 310
350 360 370
pF1KE1 ----NFS---KLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI
.:: .:. ::::::::: .: :.:: . . :
NP_008 AERDSFSYGPHLRYLRLDGNEIK-PPIPMALMTCFRLLQAVII
320 330 340 350
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pF1KE1 PYETYEPYPYGVDEGPAYTYGSPSPPDPRDCPQECDCPPNFPTAMYCDNRNLKYLPF-VP
:: :.: . ...:.. .: .: .:
NP_060 DDDDDDDEDNSLFPTREPRSHFFPFDLFPMCPFGCQC---YSRVVHCSDLGLTSVPTNIP
50 60 70 80 90 100
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... .:::.: :.:. : . :.: . :..:..: :. :.: ..:.::::.:
NP_060 FDTRMLDLQNNKIKEIKENDFKGLTSLYGLILNNNKLT--KIHPKAFLTTKKLRRLYLSH
110 120 130 140 150
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pF1KE1 NNLTRMPGPLPRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQEVG---SSMRG
:.:...: ::.:: ::.. .:..... .....:.. : .: .. : ... : ....:
NP_060 NQLSEIPLNLPKSLAELRIHENKVKKIQKDTFKGMNALHVLEMSANPLDNNGIEPGAFEG
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. ... . .. .: .:: ::: .: .:....:.. :: :. .: . :..:..:
NP_060 V-TVFHIRIAEAKLTSVPKGLPPTLLELHLDYNKISTVELEDFKRYKELQRLGLGNNKIT
220 230 240 250 260 270
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pF1KE1 N--NGLASNTFNSSSLLELDLSYNQLQKIP---PVNTNLENLYLQGNRINEFSISSFCTV
. :: .: . :. : :.:.::: : :. ..:..: : . ....:: .
NP_060 DIENGSLANI---PRVREIHLENNKLKKIPSGLPELKYLQIIFLHSNSIARVGVNDFCPT
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pF1KE1 VDVVNFSKLQVLRLDGNEIKRSAM-PADAPLCLRLASLIEI
: .. : ... : .: .: : ::
NP_060 VPKMKKSLYSAISLFNNPVKYWEMQPATFRCVLSRMSVQLGNFGM
340 350 360 370
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40 50 60 70 80 90
pF1KE1 TYYDPYDPYPYETYEPYPYGVDEGPAYTYGSPSPPDPRDCPQ-ECDCPPNFPTAMYCDNR
:: : :: . : .. : . : :
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: .: .. .. . . .:.:.:: . .:.. .: . : :.:::. .: :.:. :
NP_001 MLTQIPPLTAPQITSLELTGNSIASIPDEAFNGLPNLERLDLSKNNITSSGIGPKAFKLL
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160 170 180 190 200 210
pF1KE1 RHLERLYLDHNNLTRMPGPLPRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQE
..: :: .: ::: ..:. :: .:.::....:... . ...: :..:..: :. :...:
NP_001 KKLMRLNMDGNNLIQIPSQLPSTLEELKVNENNLQAIDEESLSDLNQLVTLELEGNNLSE
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220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VGSS---MRGLRSLILLDLSYNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLL
.. . .. :.:: : :. :..: .:.:::...:.::.:.:.. . . : . :.
NP_001 ANVNPLAFKPLKSLAYLRLGKNKFRIIPQGLPGSIEELYLENNQIEEITEICFNHTRKIN
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280 290 300 310 320
pF1KE1 YVRLSHNSLTNNGLASNTF-NSSSLLELDLSYNQLQKIPP-VNTNLENLYLQGNRINEFS
. : .:.. .: .: .. :. .: .:::::.: ..: . .: .: : ::.:
NP_001 VIVLRYNKIEENRIAPLAWINQENLESIDLSYNKLYHVPSYLPKSLLHLVLLGNQIERIP
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330 340 350 360 370
pF1KE1 ISSFCTVVDVVNFSKLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI
NP_001 GYVFGHMEPGLEYLYLSFNKLADDGMDRVSFYGAYHSLRELFLDHNDLKSIPPGIQEMKA
560 570 580 590 600 610
>>NP_001184224 (OMIM: 603479) extracellular matrix prote (677 aa)
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Smith-Waterman score: 434; 31.6% identity (66.5% similar) in 266 aa overlap (67-325:282-546)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 TYYDPYDPYPYETYEPYPYGVDEGPAYTYGSPSPPDPRDCPQ-ECDCPPNFPTAMYCDNR
:: : :: . : .. : . : :
NP_001 DEEEEGEEGEEDEEDEEDPVRGDMFRMPSRSPLPAPPRGTLRLPSGCSLSYRT-ISCINA
260 270 280 290 300 310
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 NLKYLP-FVPSRMKYVYFQNNQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKL
: .: .. .. . . .:.:.:: . .:.. .: . : :.:::. .: :.:. :
NP_001 MLTQIPPLTAPQITSLELTGNSIASIPDEAFNGLPNLERLDLSKNNITSSGIGPKAFKLL
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 RHLERLYLDHNNLTRMPGPLPRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQE
..: :: .: ::: ..:. :: .:.::....:... . ...: :..:..: :. :...:
NP_001 KKLMRLNMDGNNLIQIPSQLPSTLEELKVNENNLQAIDEESLSDLNQLVTLELEGNNLSE
380 390 400 410 420 430
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VGSS---MRGLRSLILLDLSYNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLL
.. . .. :.:: : :. :..: .:.:::...:.::.:.:.. . . : . :.
NP_001 ANVNPLAFKPLKSLAYLRLGKNKFRIIPQGLPGSIEELYLENNQIEEITEICFNHTRKIN
440 450 460 470 480 490
280 290 300 310 320
pF1KE1 YVRLSHNSLTNNGLASNTF-NSSSLLELDLSYNQLQKIPP-VNTNLENLYLQGNRINEFS
. : .:.. .: .: .. :. .: .:::::.: ..: . .: .: : ::.:
NP_001 VIVLRYNKIEENRIAPLAWINQENLESIDLSYNKLYHVPSYLPKSLLHLVLLGNQIERIP
500 510 520 530 540 550
330 340 350 360 370
pF1KE1 ISSFCTVVDVVNFSKLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI
NP_001 GYVFGHMEPGLEYLYLSFNKLADDGMDRVSFYGAYHSLRELFLDHNDLKSIPPGIQEMKA
560 570 580 590 600 610
>>NP_001384 (OMIM: 603479) extracellular matrix protein (699 aa)
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pF1KE1 TYYDPYDPYPYETYEPYPYGVDEGPAYTYGSPSPPDPRDCPQ-ECDCPPNFPTAMYCDNR
:: : :: . : .. : . : :
NP_001 DEEEEGEEGEEDEEDEEDPVRGDMFRMPSRSPLPAPPRGTLRLPSGCSLSYRT-ISCINA
280 290 300 310 320 330
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 NLKYLP-FVPSRMKYVYFQNNQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGRKVFSKL
: .: .. .. . . .:.:.:: . .:.. .: . : :.:::. .: :.:. :
NP_001 MLTQIPPLTAPQITSLELTGNSIASIPDEAFNGLPNLERLDLSKNNITSSGIGPKAFKLL
340 350 360 370 380 390
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 RHLERLYLDHNNLTRMPGPLPRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQHNEIQE
..: :: .: ::: ..:. :: .:.::....:... . ...: :..:..: :. :...:
NP_001 KKLMRLNMDGNNLIQIPSQLPSTLEELKVNENNLQAIDEESLSDLNQLVTLELEGNNLSE
400 410 420 430 440 450
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VGSS---MRGLRSLILLDLSYNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFRGAPKLL
.. . .. :.:: : :. :..: .:.:::...:.::.:.:.. . . : . :.
NP_001 ANVNPLAFKPLKSLAYLRLGKNKFRIIPQGLPGSIEELYLENNQIEEITEICFNHTRKIN
460 470 480 490 500 510
280 290 300 310 320
pF1KE1 YVRLSHNSLTNNGLASNTF-NSSSLLELDLSYNQLQKIPP-VNTNLENLYLQGNRINEFS
. : .:.. .: .: .. :. .: .:::::.: ..: . .: .: : ::.:
NP_001 VIVLRYNKIEENRIAPLAWINQENLESIDLSYNKLYHVPSYLPKSLLHLVLLGNQIERIP
520 530 540 550 560 570
330 340 350 360 370
pF1KE1 ISSFCTVVDVVNFSKLQVLRLDGNEIKRSAMPADAPLCLRLASLIEI
NP_001 GYVFGHMEPGLEYLYLSFNKLADDGMDRVSFYGAYHSLRELFLDHNDLKSIPPGIQEMKA
580 590 600 610 620 630
>>XP_016874406 (OMIM: 125255,610048) PREDICTED: decorin (359 aa)
initn: 307 init1: 155 opt: 425 Z-score: 369.0 bits: 76.9 E(85289): 8.1e-14
Smith-Waterman score: 425; 27.6% identity (61.0% similar) in 326 aa overlap (68-376:38-355)
40 50 60 70 80
pF1KE1 YYDPYDPYPYETYEPYPYGVDEGPAYTYGSPSPPDPRD--------CPQECDCPPNFPTA
: :: :: :: .:.: .
XP_016 LLLAQVSWAGPFQQRGLFDFMLEDEASGIGPEVPDDRDFEPSLGPVCPFRCQC---HLRV
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 MYCDNRNLKYLPF-VPSRMKYVYFQNNQITSIQEGVFDNATGLLWIALHGNQITSDKVGR
. :.. .: .: .: . .:::.:: :..: : : .: . : .:.:. ::.
XP_016 VQCSDLGLDKVPKDLPPDTTLLDLQNNKITEIKDGDFKNLKNLHALILVNNKIS--KVSP
70 80 90 100 110 120
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pF1KE1 KVFSKLRHLERLYLDHNNLTRMPGPLPRSLRELHLDHNQISRVPNNALEGLENLTALYLQ
.:. : .::::::..:.: ..: .:..:.::. .:.:..: . ...::... .. :
XP_016 GAFTPLVKLERLYLSKNQLKELPEKMPKTLQELRAHENEITKVRKVTFNGLNQMIVIELG
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 HNEIQEVG---SSMRGLRSLILLDLSYNHLRKVPDGLPSALEQLYMEHNNVYTVPDSYFR
: .. : ....:...: . .. ... ..:.::: .: .:... :.. : . ..
XP_016 TNPLKSSGIENGAFQGMKKLSYIRIADTNITSIPQGLPPSLTELHLDGNKISRVDAASLK
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 GAPKLLYVRLSHNSLT--NNGLASNTFNSSSLLELDLSYNQLQKIP---PVNTNLENLYL
: .: . :: ::.. .:: .:: : :: :. :.: ..: . .. .::
XP_016 GLNNLAKLGLSFNSISAVDNGSLANT---PHLRELHLDNNKLTRVPGGLAEHKYIQVVYL
250 260 270 280 290
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XP_016 HNNNISVVGSSDFCPPGHNTKKASYSGVSLFSNPVQYWEIQPSTFRCVYVRSAIQLGNYK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]