Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1457
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1457, 1269 aa
1>>>pF1KE1457 1269 - 1269 aa - 1269 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7545+/-0.00119; mu= 16.6706+/- 0.072
mean_var=138.6761+/-28.902, 0's: 0 Z-trim(106.6): 195 B-trim: 302 in 2/48
Lambda= 0.108911
statistics sampled from 8854 (9073) to 8854 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 4.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11192.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1269) 8502 1349.0 0
CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1258) 8368 1327.9 0
CCDS58522.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1214) 7335 1165.6 0
CCDS8959.1 AVIL gene_id:10677|Hs108|chr12 ( 819) 536 97.1 1.9e-19
CCDS47546.1 SCIN gene_id:85477|Hs108|chr7 ( 468) 516 93.8 1.1e-18
CCDS47545.1 SCIN gene_id:85477|Hs108|chr7 ( 715) 516 93.9 1.5e-18
CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 536) 491 89.9 1.9e-17
CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 582) 489 89.6 2.5e-17
CCDS2417.1 VIL1 gene_id:7429|Hs108|chr2 ( 827) 489 89.8 3.3e-17
CCDS6828.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 782) 472 87.1 2e-16
CCDS75891.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 748) 469 86.6 2.7e-16
CCDS6829.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 731) 464 85.8 4.5e-16
CCDS65118.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 739) 464 85.8 4.6e-16
CCDS48011.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 742) 464 85.8 4.6e-16
CCDS75890.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 767) 464 85.8 4.7e-16
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6 ( 524) 439 81.7 5.4e-15
CCDS1974.1 CAPG gene_id:822|Hs108|chr2 ( 348) 436 81.1 5.5e-15
CCDS81341.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1 (1495) 445 83.1 6.1e-15
CCDS645.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1 (1537) 445 83.1 6.2e-15
CCDS6411.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1630) 437 81.9 1.5e-14
CCDS6412.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1655) 437 81.9 1.6e-14
CCDS34172.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1302) 401 76.1 6.6e-13
CCDS58954.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1346) 401 76.1 6.8e-13
CCDS58951.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1367) 401 76.1 6.8e-13
CCDS3990.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1371) 401 76.1 6.9e-13
CCDS58953.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1412) 401 76.1 7e-13
CCDS58952.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1419) 401 76.1 7e-13
CCDS46951.1 LRRIQ4 gene_id:344657|Hs108|chr3 ( 560) 390 74.1 1.2e-12
CCDS58715.1 CAPG gene_id:822|Hs108|chr2 ( 333) 381 72.4 2.1e-12
CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1 ( 803) 386 73.6 2.4e-12
CCDS2670.2 VILL gene_id:50853|Hs108|chr3 ( 856) 378 72.3 5.9e-12
CCDS55124.1 LRRD1 gene_id:401387|Hs108|chr7 ( 860) 371 71.2 1.3e-11
CCDS646.1 LRRC40 gene_id:55631|Hs108|chr1 ( 602) 367 70.5 1.5e-11
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 364 70.2 2.9e-11
>>CCDS11192.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1269 aa)
initn: 8502 init1: 8502 opt: 8502 Z-score: 7224.5 bits: 1349.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8502; 100.0% identity (100.0% similar) in 1269 aa overlap (1-1269:1-1269)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEATGVLPFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNRTGLCYLPEELAALQKLEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEATGVLPFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNRTGLCYLPEELAALQKLEH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSHNQLTECP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSHNQLTECP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVHLQTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVHLQTLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LNGNPLLHAQLRQLPAMTALQTLHLRSTQRTQSNLPTSLEGLSNLADVDLSCNDLTRVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LNGNPLLHAQLRQLPAMTALQTLHLRSTQRTQSNLPTSLEGLSNLADVDLSCNDLTRVPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CLYTLPSLRRLNLSSNQITELSLCIDQWVHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLSKLKKLYLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CLYTLPSLRRLNLSSNQITELSLCIDQWVHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLSKLKKLYLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SNKLDFDGLPSGIGKLTNLEEFMAANNNLELVPESLCRCPKLRKLVLNKNHLVTLPEAIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SNKLDFDGLPSGIGKLTNLEEFMAANNNLELVPESLCRCPKLRKLVLNKNHLVTLPEAIH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 FLTEIEVLDVRENPNLVMPPKPADRAAEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAAGSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLTEIEVLDVRENPNLVMPPKPADRAAEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAAGSGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 KDPMARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEESADARAPSGKVRRWDQGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KDPMARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEESADARAPSGKVRRWDQGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 EKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LNWEIYYWIGGEATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LNWEIYYWIGGEATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 IEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGTSLDPRFVFLLDRGLDIYVWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGTSLDPRFVFLLDRGLDIYVWR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 GAQATLSSTTKARLFAEKINKNERKGKAEITLLVQGQELPEFWEALGGEPSEIKKHVPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GAQATLSSTTKARLFAEKINKNERKGKAEITLLVQGQELPEFWEALGGEPSEIKKHVPED
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 FWPPQPKLYKVGLGLGYLELPQINYKLSVEHKQRPKVELMPRMRLLQSLLDTRCVYILDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FWPPQPKLYKVGLGLGYLELPQINYKLSVEHKQRPKVELMPRMRLLQSLLDTRCVYILDC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 WSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHATVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHATVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 VLTVDYTRNAEAVLQSPGLSGKVKRDAEKKDQMKADLTALFLPRQPPMSLAEAEQLMEEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VLTVDYTRNAEAVLQSPGLSGKVKRDAEKKDQMKADLTALFLPRQPPMSLAEAEQLMEEW
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 NEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFYTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEEKKEDKEEKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFYTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEEKKEDKEEKAE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 GKEGEEATAEAEEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKEGEEATAEAEEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 MTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKAVQGAQQPSLYQIRTNGSALCTRCIQINTDSSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKAVQGAQQPSLYQIRTNGSALCTRCIQINTDSSLL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 NSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE1 ENFFWVGIGAQKPYDDDAEYMKHTRLFRCSNEKGYFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENFFWVGIGAQKPYDDDAEYMKHTRLFRCSNEKGYFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLDN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 GQEVYMWVGTQTSQVEIKLSLKACQVYIQHMRSKEHERPRRLRLVRKGNEQHAFTRCFHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GQEVYMWVGTQTSQVEIKLSLKACQVYIQHMRSKEHERPRRLRLVRKGNEQHAFTRCFHA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 WSAFCKALA
:::::::::
CCDS11 WSAFCKALA
>>CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1258 aa)
initn: 8363 init1: 8363 opt: 8368 Z-score: 7110.8 bits: 1327.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8368; 99.4% identity (99.5% similar) in 1258 aa overlap (13-1269:1-1258)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MEATGVLPFVRGVDLSG-NDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNRTGLCYLPEELAALQKLE
.:: : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDLRGLRPVPGGYFPENVKAMTSLRWLKLNRTGLCYLPEELAALQKLE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 HLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSHNQLTEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSHNQLTEC
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 PRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVHLQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVHLQTL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VLNGNPLLHAQLRQLPAMTALQTLHLRSTQRTQSNLPTSLEGLSNLADVDLSCNDLTRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VLNGNPLLHAQLRQLPAMTALQTLHLRSTQRTQSNLPTSLEGLSNLADVDLSCNDLTRVP
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 ECLYTLPSLRRLNLSSNQITELSLCIDQWVHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLSKLKKLYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ECLYTLPSLRRLNLSSNQITELSLCIDQWVHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLSKLKKLYL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 NSNKLDFDGLPSGIGKLTNLEEFMAANNNLELVPESLCRCPKLRKLVLNKNHLVTLPEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NSNKLDFDGLPSGIGKLTNLEEFMAANNNLELVPESLCRCPKLRKLVLNKNHLVTLPEAI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 HFLTEIEVLDVRENPNLVMPPKPADRAAEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAAGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HFLTEIEVLDVRENPNLVMPPKPADRAAEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAAGSG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 PKDPMARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEESADARAPSGKVRRWDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKDPMARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEESADARAPSGKVRRWDQG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 LEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSG
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 SLNWEIYYWIGGEATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLNWEIYYWIGGEATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDIS
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 YIEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGTSLDPRFVFLLDRGLDIYVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YIEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGTSLDPRFVFLLDRGLDIYVW
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 RGAQATLSSTTKARLFAEKINKNERKGKAEITLLVQGQELPEFWEALGGEPSEIKKHVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RGAQATLSSTTKARLFAEKINKNERKGKAEITLLVQGQELPEFWEALGGEPSEIKKHVPE
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 DFWPPQPKLYKVGLGLGYLELPQINYKLSVEHKQRPKVELMPRMRLLQSLLDTRCVYILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DFWPPQPKLYKVGLGLGYLELPQINYKLSVEHKQRPKVELMPRMRLLQSLLDTRCVYILD
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 CWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHATVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHATVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWD
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 DVLTVDYTRNAEAVLQSPGLSGKVKRDAEKKDQMKADLTALFLPRQPPMSLAEAEQLMEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DVLTVDYTRNAEAVLQSPGLSGKVKRDAEKKDQMKADLTALFLPRQPPMSLAEAEQLMEE
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 WNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFYTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEEKKEDKEEKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFYTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEEKKEDKEEKA
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 EGKEGEEATAEAEEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EGKEGEEATAEAEEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVV
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE1 RMTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKAVQGAQQPSLYQIRTNGSALCTRCIQINTDSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RMTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKAVQGAQQPSLYQIRTNGSALCTRCIQINTDSSL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE1 LNSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LNSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE1 PENFFWVGIGAQKPYDDDAEYMKHTRLFRCSNEKGYFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PENFFWVGIGAQKPYDDDAEYMKHTRLFRCSNEKGYFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLD
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE1 NGQEVYMWVGTQTSQVEIKLSLKACQVYIQHMRSKEHERPRRLRLVRKGNEQHAFTRCFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NGQEVYMWVGTQTSQVEIKLSLKACQVYIQHMRSKEHERPRRLRLVRKGNEQHAFTRCFH
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1260
pF1KE1 AWSAFCKALA
::::::::::
CCDS58 AWSAFCKALA
1250
>>CCDS58522.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1214 aa)
initn: 6833 init1: 5835 opt: 7335 Z-score: 6233.8 bits: 1165.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8021; 95.7% identity (95.7% similar) in 1269 aa overlap (1-1269:1-1214)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEATGVLPFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNRTGLCYLPEELAALQKLEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MEATGVLPFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNRTGLCYLPEELAALQKLEH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSHNQLTECP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSHNQLTECP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLVHLQTLV
:::::::::::::::::
CCDS58 RELENAKNMLVLNLSHN-------------------------------------------
130
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LNGNPLLHAQLRQLPAMTALQTLHLRSTQRTQSNLPTSLEGLSNLADVDLSCNDLTRVPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 -----------RQLPAMTALQTLHLRSTQRTQSNLPTSLEGLSNLADVDLSCNDLTRVPE
140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CLYTLPSLRRLNLSSNQITELSLCIDQWVHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLSKLKKLYLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CLYTLPSLRRLNLSSNQITELSLCIDQWVHVETLNLSRNQLTSLPSAICKLSKLKKLYLN
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SNKLDFDGLPSGIGKLTNLEEFMAANNNLELVPESLCRCPKLRKLVLNKNHLVTLPEAIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SNKLDFDGLPSGIGKLTNLEEFMAANNNLELVPESLCRCPKLRKLVLNKNHLVTLPEAIH
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 FLTEIEVLDVRENPNLVMPPKPADRAAEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAAAGSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS58 FLTEIEVLDVRENPNLVMPPKPADRAAEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVAAAAA-GSGP
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 KDPMARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEESADARAPSGKVRRWDQGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDPMARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEESADARAPSGKVRRWDQGL
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 EKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGS
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LNWEIYYWIGGEATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LNWEIYYWIGGEATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISY
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 IEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGTSLDPRFVFLLDRGLDIYVWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IEGGTASGFYTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGTSLDPRFVFLLDRGLDIYVWR
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 GAQATLSSTTKARLFAEKINKNERKGKAEITLLVQGQELPEFWEALGGEPSEIKKHVPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAQATLSSTTKARLFAEKINKNERKGKAEITLLVQGQELPEFWEALGGEPSEIKKHVPED
610 620 630 640 650 660
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 FWPPQPKLYKVGLGLGYLELPQINYKLSVEHKQRPKVELMPRMRLLQSLLDTRCVYILDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FWPPQPKLYKVGLGLGYLELPQINYKLSVEHKQRPKVELMPRMRLLQSLLDTRCVYILDC
670 680 690 700 710 720
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 WSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHATVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHATVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDD
730 740 750 760 770 780
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 VLTVDYTRNAEAVLQSPGLSGKVKRDAEKKDQMKADLTALFLPRQPPMSLAEAEQLMEEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VLTVDYTRNAEAVLQSPGLSGKVKRDAEKKDQMKADLTALFLPRQPPMSLAEAEQLMEEW
790 800 810 820 830 840
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 NEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFYTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEEKKEDKEEKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFYTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEEKKEDKEEKAE
850 860 870 880 890 900
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 GKEGEEATAEAEEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GKEGEEATAEAEEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVR
910 920 930 940 950 960
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 MTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKAVQGAQQPSLYQIRTNGSALCTRCIQINTDSSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKAVQGAQQPSLYQIRTNGSALCTRCIQINTDSSLL
970 980 990 1000 1010 1020
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 NSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE1 ENFFWVGIGAQKPYDDDAEYMKHTRLFRCSNEKGYFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ENFFWVGIGAQKPYDDDAEYMKHTRLFRCSNEKGYFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLDN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 GQEVYMWVGTQTSQVEIKLSLKACQVYIQHMRSKEHERPRRLRLVRKGNEQHAFTRCFHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GQEVYMWVGTQTSQVEIKLSLKACQVYIQHMRSKEHERPRRLRLVRKGNEQHAFTRCFHA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE1 WSAFCKALA
:::::::::
CCDS58 WSAFCKALA
1210
>>CCDS8959.1 AVIL gene_id:10677|Hs108|chr12 (819 aa)
initn: 460 init1: 201 opt: 536 Z-score: 462.5 bits: 97.1 E(32554): 1.9e-19
Smith-Waterman score: 979; 29.9% identity (56.8% similar) in 783 aa overlap (499-1261:14-711)
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 PSGKVRRWDQGLEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCY
::. .:.::.. .:: . ::.:::.:::
CCDS89 MPLTSAFRAVDNDPGIIVWRIEKMELALVPVSAHGNFYEGDCY
10 20 30 40
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 IVLKTFLDDSGSLNWEIYYWIGGEATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESE
..:.: : :. .:..::: ... :...:.::....: .:::. :: . ::.
CCDS89 VILSTRRVAS-LLSQDIHFWIGKDSSQDEQSCAAIYTTQLDDYLGGSPVQHREVQYHESD
50 60 70 80 90 100
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 EFLQVFDNDISYIEGGTASGFYTVE-DTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGTSLDPRFV
: : . : : .::.:::. :: .:. : :. .: ::.::. : .. :.. :
CCDS89 TFRGYFKQGIIYKQGGVASGMKHVETNTYDVKRLLHVKGKRNIRATEVEMSWDSFNRGDV
110 120 130 140 150 160
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 FLLDRGLDIYVWRGAQATLSSTTKARLFAEKINKNERKGKAEITLLVQGQEL--PEFWEA
:::: : : : : ... . :: :.:. : :: :.:.: .. .: ::. ..
CCDS89 FLLDLGKVIIQWNGPESNSGERLKAMLLAKDIRDRERGGRAKIGVIEGDKEAASPELMKV
170 180 190 200 210 220
710 720 730 740 750
pF1KE1 LG---GEPSEIKKHVPEDFWPPQPK----LYKVGLGLGYLELPQINYKLSVEHKQRPKVE
: :. : :: ::... . : ::... . : : . .. ::
CCDS89 LQDTLGRRSIIKPTVPDEIIDQKQKSTIMLYHISDSAGQLAVTEVA--------TRP---
230 240 250 260 270
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 LMPRMRLLQSLLDTRCVYILD-CWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHA
:.:.::. :::: . ...: :. . . . ::.. . . : : .
CCDS89 ------LVQDLLNHDDCYILDQSGTKIYVWKGKGATKAEKQAAMSKALGFIKMKSYPSST
280 290 300 310 320
820 830 840 850 860 870
pF1KE1 TVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAVLQSPGLSGKVKRDAEKKDQMKADL
.: .:.:. .:: :..:. . : : . .. : : .:: .: : :.
CCDS89 NVETVNDGAESAMFKQLFQKWS---VKDQTMGLGKTF-SIGKIAKVFQD-------KFDV
330 340 350 360 370
880 890 900 910 920 930
pF1KE1 TALFLPRQPPMSLAEAEQLMEEWNEDLDGMEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFYTQDCYVFL
: .: .: . : :..... : .: . .:. ... . . .: :: :::. :
CCDS89 T--LLHTKPEV--AAQERMVDDGN---GKVEVWRIENLELVPVEYQWYGFFYGGDCYLVL
380 390 400 410 420
940 950 960 970 980 990
pF1KE1 CRYWVPVEYEEEEKKEDKEEKAEGKEGEEATAEAEEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGW
: : .:: :.. :.:.::::.::.
CCDS89 YTYEV-----------------NGK-------------PHH----ILYIWQGRHASQ-DE
430 440 450
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE1 LTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRG--KRKAVQGAQQP-
:. . . . : : ::. . : .:.. :: :..: .: .::. . :
CCDS89 LAASAYQAVEVDRQFDGAAVQVRVRMGTEPRHFMAIFKGKLVIFEGGTSRKGNAEPDPPV
460 470 480 490 500 510
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE1 SLYQIRTNGSALCTRCIQINTDSSLLNSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEA
:.::. : .. :. ... . .: :::. :.:.. : : : :..:. ::
CCDS89 RLFQIHGNDKS-NTKAVEVPAFASSLNSNDVFLLRTQAEH-------YLWYGKGSSGDER
520 530 540 550 560
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE1 KLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEPENFFWVGIGAQKPYDDDAEYMK-----HTRLFRC
.:... . . : :.... ::.:: .: : .:.. :: .: . .. ..:::.:
CCDS89 AMAKELASLLCDG--SENTVAEGQEPAEF-WDLLGGKTPYANDKRLQQEILDVQSRLFEC
570 580 590 600 610 620
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE1 SNEKGYFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLDNGQEVYMWVGTQTSQVEIKLSLKACQVYIQ
::. : :.::: .:: :::: :.::::. ..:..:.:.... .: . .: . : :..
CCDS89 SNKTGQFVVTE-ITDFTQDDLNPTDVMLLDTWDQVFLWIGAEANATEKESALATAQQYLH
630 640 650 660 670 680
1230 1240 1250 1260
pF1KE1 -HMRSKEHERPRRLRLVRKGNEQHAFTRCFHAWSAFCKALA
: ... . : . ....: : :: : ::
CCDS89 THPSGRDPDTP--ILIIKQGFEPPIFTGWFLAWDPNIWSAGKTYEQLKEELGDAAAIMRI
690 700 710 720 730
CCDS89 TADMKNATLSLNSNDSEPKYYPIAVLLKNQNQELPEDVNPAKKENYLSEQDFVSVFGITR
740 750 760 770 780 790
>>CCDS47546.1 SCIN gene_id:85477|Hs108|chr7 (468 aa)
initn: 430 init1: 225 opt: 516 Z-score: 448.7 bits: 93.8 E(32554): 1.1e-18
Smith-Waterman score: 612; 30.1% identity (58.1% similar) in 511 aa overlap (769-1263:30-465)
740 750 760 770 780 790
pF1KE1 ELPQINYKLSVEHKQRPKVELMPRMRLLQSLLDTRCVYILD--CWSDVFIWLGRKSPRLV
::. .: .::: ...:.: :. .
CCDS47 MAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAMLLSEEC-FILDHGAAKQIFVWKGKDANPQE
10 20 30 40 50
800 810 820 830 840 850
pF1KE1 RAAALKLGQELCGMLHRPRHATVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAVLQS
: ::.: ..:. ... ... .. :: :. .:: ::.: : : ::
CCDS47 RKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRDK---D---------QS
60 70 80 90 100
860 870 880 890 900 910
pF1KE1 PGLSGKVKRDAEKKDQMKA-DLTALFLPRQPPMSLAEAEQLMEEWNEDLDG-MEGFVLEG
:. ::: .:: :.: . : : .: :. :.. : . : .: .: . .:.
CCDS47 DGF-GKV-YVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMA---AQHNMVD---DGSGKVEIWRVEN
110 120 130 140 150
920 930 940 950 960 970
pF1KE1 KKFARLPEEEFGHFYTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEEKKEDKEEKAEGKEGEEATAEAEEK
. .. .. .:.:: :::..: : : .:.
CCDS47 NGRIQVDQNSYGEFYGGDCYIILYTY--P----------------RGQ------------
160 170 180
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE1 QPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHF
:.: ::: .:. :: . : ... . :. .:..: .: ..:: :
CCDS47 --------IIYTWQGANATR-DELTTSAFLTVQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPVHLLSLF
190 200 210 220 230
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 KRK-FIIHR-GKRKAVQGAQQPS----LYQIRTNGSALCTRCIQINTDSSLLNSEFCFIL
: : .::.. : : .:.: :. :.:.: : ... :: .....:.. :::. :.:
CCDS47 KDKPLIIYKNGTSK--KGGQAPAPPTRLFQVRRNLASI-TRIVEVDVDANSLNSNDVFVL
240 250 260 270 280 290
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 KVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEPENFFWVGI
:.: .:.: : :::.... .: : :: . ... . . :.::::::.: : ..
CCDS47 KLP----QNSG--YIWVGKGASQEEEKGAEYVASVL---KCKTLRIQEGEEPEEF-WNSL
300 310 320 330 340
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE1 GAQKPYDD----DAEYMKHT-RLFRCSNEKGYFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLDNGQE
:..: :. ... : ::. :::. : :.. : ..: :::::.::.:::: ..
CCDS47 GGKKDYQTSPLLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQDDLAEDDVMLLDAWEQ
350 360 370 380 390 400
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 VYMWVGTQTSQVEIKLSLKACQVYIQHMRSKEHER-PRRLRLVRKGNEQHAFTRCFHAWS
...:.: ....:: : :::. ..:.. : . .: : . ....:.: .:: : .:.
CCDS47 IFIWIGKDANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTP--IVIIKQGHEPPTFTGWFLGWD
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 AFCKALA
.
CCDS47 SSKW
>>CCDS47545.1 SCIN gene_id:85477|Hs108|chr7 (715 aa)
initn: 597 init1: 225 opt: 516 Z-score: 446.3 bits: 93.9 E(32554): 1.5e-18
Smith-Waterman score: 996; 29.2% identity (58.1% similar) in 797 aa overlap (487-1263:6-712)
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 NKKQEESADARAPSGKVRRWDQGLEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEE
: : :.. .:. :: .:.::.. : : .
CCDS47 MARELYHEEFAR-AGKQAGLQVWRIEKLELVPVPQ
10 20 30
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 AFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGSLNWEIYYWIGGEATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAEC
. :: :: .: :.::.: . : .......:.: : . :... .:: .:.. .:::..
CCDS47 SAHGDFYVGDAYLVLHTAKTSRG-FTYHLHFWLGKECSQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKP
40 50 60 70 80 90
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 RTVREEMGDESEEFLQVFDNDISYIEGGTASGF-YTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPV
:: .: ::..:.. : . ..: ::.:::. ... . . :. .: :.. .. :
CCDS47 VQNRELQGYESNDFVSYFKGGLKYKAGGVASGLNHVLTNDLTAKRLLHVKGRRVVRATEV
100 110 120 130 140 150
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 PLKGTSLDPRFVFLLDRGLDIYVWRGAQATLSSTTKARLFAEKINKNERKGKAEITLLVQ
::. :.. :..: : .:: : :.. . :: : : :::::..:. .. .
CCDS47 PLSWDSFNKGDCFIIDLGTEIYQWCGSSCNKYERLKANQVATGIRYNERKGRSELIVVEE
160 170 180 190 200 210
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 GQELPEFWEALGGEPSEIKKHVPEDFWPP-----QPKLYKVGLGLGYLELPQINYKLSVE
:.: :. ..:: .: .:. . ::: :. . : . ...:
CCDS47 GSEPSELIKVLGEKPELPDGGDDDDIIADISNRKMAKLYMVSDASGSM-------RVTVV
220 230 240 250 260
760 770 780 790 800
pF1KE1 HKQRPKVELMPRMRLLQSLLDTRCVYILD--CWSDVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELC
.. : : ::. .: .::: ...:.: :. . : ::.: ..:.
CCDS47 AEENPFSMAM--------LLSEEC-FILDHGAAKQIFVWKGKDANPQERKAAMKTAEEFL
270 280 290 300 310
810 820 830 840 850 860
pF1KE1 GMLHRPRHATVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAVLQSPGLSGKVKRDAE
... ... .. :: :. .:: ::.: : .. :: :. ::: .:
CCDS47 QQMNYSKNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRD-------KD-----QSDGF-GKV-YVTE
320 330 340 350 360
870 880 890 900 910 920
pF1KE1 KKDQMKA-DLTALFLPRQPPMSLAEAEQLMEEWNEDLDG-MEGFVLEGKKFARLPEEEFG
: :.: . : : .: :. :.. : .: .: .: . .:.. .. .. .:
CCDS47 KVAQIKQIPFDASKLHSSPQMA---AQHNMV---DDGSGKVEIWRVENNGRIQVDQNSYG
370 380 390 400 410
930 940 950 960 970 980
pF1KE1 HFYTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEEKKEDKEEKAEGKEGEEATAEAEEKQPEEDFQCIVYF
.:: :::..: : : .:. :.:
CCDS47 EFYGGDCYIIL--YTYP-------------------RGQ-----------------IIYT
420 430
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE1 WQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRK
::: .:. :: . : ... . :. .:..: .: ..:: :: : .: .
CCDS47 WQGANATR-DELTTSAFLTVQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPVHLLSLFKDKPLIIYKNGT
440 450 460 470 480 490
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE1 AVQGAQQPS----LYQIRTNGSALCTRCIQINTDSSLLNSEFCFILKVPFESEDNQGIVY
. .:.: :. :.:.: : ... :: .....:.. :::. :.::.: .:.: :
CCDS47 SKKGGQAPAPPTRLFQVRRNLASI-TRIVEVDVDANSLNSNDVFVLKLP----QNSG--Y
500 510 520 530 540 550
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE1 AWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEGEEPENFFWVGIGAQKPYDD----DA
:::.... .: : :: . ... . . :.::::::.: : ..:..: :. ..
CCDS47 IWVGKGASQEEEKGAEYVASVL---KCKTLRIQEGEEPEEF-WNSLGGKKDYQTSPLLET
560 570 580 590 600
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE1 EYMKHT-RLFRCSNEKGYFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLDNGQEVYMWVGTQTSQVEI
. : ::. :::. : :.. : ..: :::::.::.:::: .....:.: ....::
CCDS47 QAEDHPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQDDLAEDDVMLLDAWEQIFIWIGKDANEVEK
610 620 630 640 650 660
1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 KLSLKACQVYIQHMRSKEHER-PRRLRLVRKGNEQHAFTRCFHAWSAFCKALA
: :::. ..:.. : . .: : . ....:.: .:: : .:..
CCDS47 KESLKSAKMYLETDPSGRDKRTP--IVIIKQGHEPPTFTGWFLGWDSSKW
670 680 690 700 710
>>CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 (536 aa)
initn: 387 init1: 167 opt: 491 Z-score: 426.7 bits: 89.9 E(32554): 1.9e-17
Smith-Waterman score: 529; 31.0% identity (64.3% similar) in 364 aa overlap (13-373:105-458)
10 20 30 40
pF1KE1 MEATGVLPFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNR
.::: ... .: ..: .:.: : :
CCDS58 PNPAPGTRKKSSNAEVIKELNKCREENSMRLDLSKRSIH--ILPSSIKELTQLTELYLYS
80 90 100 110 120 130
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 TGLCYLPEELAALQKLEHLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFK
. : :: :.. : .: :..:.:.::.: :..: .:: . : :.:.. .:. ...
CCDS58 NKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLRE--IPSVVYR
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 LDDLSVLDLSHNQLTECPRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENR
::.:..: : :..: ....: ... .:.. .:.: .: .. ::..: : : ::
CCDS58 LDSLTTLYLRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIKQLPAEIG-NLSSLSRLGLRYNR
200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 LESLPPQMRRLVHLQTLVLNGNPLLHAQLRQLPAMTALQTLHLRST--QRTQSNLPTSLE
: ..: .. . :. : :..: . : ... :..: : . : . :...
CCDS58 LSAIPRSLAKCSALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQF-
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270
pF1KE1 GLSNLADVDLSCNDLTRVPECLYTLPS-LRRLNLSSNQITELSLCIDQWVHVETLNLSRN
:.. .... : ....: ... . : .::...::.: : : . :. . :::. :
CCDS58 --STIYSLNMEHNRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATN
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 QLTSLPSAICKLSKLKKLYLNSNKLDFDGLPSGIGKLTNLEEFMAANNNLELVPESLCRC
:::..: . : .:. : :..: : :: :.:.: .:.:. .:.:: .:. .
CCDS58 QLTKIPEDVSGLVSLEVLILSNNLL--KKLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYL
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 PKLRKLVLNKNHLVTLPEAIHFLTEIEVLDVRENPNLVMPPKPADRAAEWYNIDFSLQNQ
:.::::..:.:.:::..: ::.. : . ::
CCDS58 KDLQKLVLTNNQLTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNL
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 LRLAGASPATVAAAAAAGSGPKDPMARKMRLRRRKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKK
CCDS58 HSLPFELALCSKLSIMSIENCPLSHLPPQIVAGGPSFIIQFLKMQGPYRAMV
490 500 510 520 530
>>CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 (582 aa)
initn: 387 init1: 167 opt: 489 Z-score: 424.5 bits: 89.6 E(32554): 2.5e-17
Smith-Waterman score: 513; 30.7% identity (63.1% similar) in 352 aa overlap (25-373:161-504)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MEATGVLPFVRGVDLSGNDFKGGYFPENVKAMTSLRWLKLNRTGLCYLPEELAA
.:... . .:: : : .. : .: .
CCDS75 YSNKLQSLPAEVGCLVNLMTLALSENSLTSLPDSLDNLKKLRMLDLRHNKLREIPSVVYR
140 150 160 170 180 190
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LQKLEHLSVSHNNLTTLHGELSSLPSLRAIVARANSLKNSGVPDDIFKLDDLSVLDLSHN
:..: : . : .::.. ....: .: . : :..:. .: .: .: .: .::..::
CCDS75 LDSLTTLYLRFNRITTVEKDIKNLSKLSMLSIRENKIKQ--LPAEIGELCNLITLDVAHN
200 210 220 230 240
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 QLTECPRELENAKNMLVLNLSHNSIDTIPNQLFINLTDLLYLDLSENRLESLPPQMRRLV
:: . :.:. : .. :.:.:: . .:. . ::..: : : ::: ..: .. .
CCDS75 QLEHLPKEIGNCTQITNLDLQHNELLDLPDTIG-NLSSLSRLGLRYNRLSAIPRSLAKCS
250 260 270 280 290 300
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 HLQTLVLNGNPLLHAQLRQLPAMTALQTLHLRST--QRTQSNLPTSLEGLSNLADVDLSC
:. : :..: . : ... :..: : . : . :... :.. ....
CCDS75 ALEELNLENNNISTLPESLLSSLVKLNSLTLARNCFQLYPVGGPSQF---STIYSLNMEH
310 320 330 340 350 360
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NDLTRVPECLYTLPS-LRRLNLSSNQITELSLCIDQWVHVETLNLSRNQLTSLPSAICKL
: ....: ... . : .::...::.: : : . :. . :::. ::::..: . :
CCDS75 NRINKIPFGIFSRAKVLSKLNMKDNQLTSLPLDFGTWTSMVELNLATNQLTKIPEDVSGL
370 380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SKLKKLYLNSNKLDFDGLPSGIGKLTNLEEFMAANNNLELVPESLCRCPKLRKLVLNKNH
.:. : :..: : :: :.:.: .:.:. .:.:: .:. . :.::::..:.
CCDS75 VSLEVLILSNNLLK--KLPHGLGNLRKLRELDLEENKLESLPNEIAYLKDLQKLVLTNNQ
430 440 450 460 470 480
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LVTLPEAIHFLTEIEVLDVRENPNLVMPPKPADRAAEWYNIDFSLQNQLRLAGASPATVA
:.:::..: ::.. : . ::
CCDS75 LTTLPRGIGHLTNLTHLGLGENLLTHLPEEIGTLENLEELYLNDNPNLHSLPFELALCSK
490 500 510 520 530 540
>>CCDS2417.1 VIL1 gene_id:7429|Hs108|chr2 (827 aa)
initn: 425 init1: 177 opt: 489 Z-score: 422.5 bits: 89.8 E(32554): 3.3e-17
Smith-Waterman score: 943; 28.4% identity (57.5% similar) in 783 aa overlap (499-1264:17-717)
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 PSGKVRRWDQGLEKPRLDYSEFFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCY
::: ::.:: . : : . :.:...:::
CCDS24 MTKLSAQVKGSLNITTPGLQIWRIEAMQMVPVPSSTFGSFFDGDCY
10 20 30 40
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 IVLKTFLDDSGSLNWEIYYWIGGEATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESE
:.: .. ..::...:.:::: ...::... .::..... ..: .. :: .:.:::
CCDS24 IIL-AIHKTASSLSYDIHYWIGQDSSLDEQGAAAIYTTQMDDFLKGRAVQHREVQGNESE
50 60 70 80 90 100
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 EFLQVFDNDISYIEGGTASGFYTVEDTHY-VTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGTSLDPRFV
: : . . .::.:::. :: . : : :. .: ::.:. : .. :.. :
CCDS24 AFRGYFKQGLVIRKGGVASGMKHVETNSYDVQRLLHVKGKRNVVAGEVEMSWKSFNRGDV
110 120 130 140 150 160
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 FLLDRGLDIYVWRGAQATLSSTTKARLFAEKINKNERKGKAEITLLVQGQEL--PEFWEA
:::: : : : : ..: .. .:..: .:: :.. . .. .:: :.. :.
CCDS24 FLLDLGKLIIQWNGPESTRMERLRGMTLAKEIRDQERGGRTYVGVVDGENELASPKLMEV
170 180 190 200 210 220
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 LG---GEPSEIKKHVPEDFWPPQPKLYKVGLGLGYLELPQINYKLSVEHKQRPKVELMPR
.. :. :.: ::. : :..: : .. . : . : ::
CCDS24 MNHVLGKRRELKAAVPDTVVEPA---LKAALKLYHVSDSEGNLVVR-EVATRP-------
230 240 250 260 270
770 780 790 800 810 820
pF1KE1 MRLLQSLLDTRCVYILDCWS-DVFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHATVSR
: :.::. . :::: . ...: :.:. . . .:.. . .. . : . :
CCDS24 --LTQDLLSHEDCYILDQGGLKIYVWKGKKANEQEKKGAMSHALNFIKAKQYPPSTQVEV
280 290 300 310 320 330
830 840 850 860 870 880
pF1KE1 SLEGTEAQVFKAKFKNWDDVLTVDYTRNAEAVLQSPGLSGKVKRDAEKKDQMKADLTALF
. .:.:. ::. :..: . : . : . :.: : .:.: : :..
CCDS24 QNDGAESAVFQQLFQKWT-------ASNRTSGLGKTHTVGSVA----KVEQVKFDATSMH
340 350 360 370 380
890 900 910 920 930 940
pF1KE1 LPRQPPMSLAEAEQLMEEWNEDLDG-MEGFVLEGKKFARLPEEEFGHFYTQDCYVFLCRY
. .: .. :.: : .: .: .. . .:. ... . . .:::: :::..: :
CCDS24 V--KPQVA---AQQKMV---DDGSGEVQVWRIENLELVPVDSKWLGHFYGGDCYLLLYTY
390 400 410 420 430
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 WVPVEYEEEEKKEDKEEKAEGKEGEEATAEAEEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTF
. ::: . ..: ::: .::. .:
CCDS24 LIG-----------------------------EKQ-----HYLLYVWQGSQASQ-DEITA
440 450
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE1 TFSLQKKFESLFPGKLEVVRMTQQQENPKFLSHFKRKFIIHRGKRKAVQGAQQ-PS--LY
. ... . :. .:. . .: :...: :: ......: . ... . :: :.
CCDS24 SAYQAVILDQKYNGEPVQIRVPMGKEPPHLMSIFKGRMVVYQGGTSRTNNLETGPSTRLF
460 470 480 490 500 510
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE1 QIRTNGSALCTRCIQINTDSSLLNSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLA
:.. .: : :. ... . ...:::. :.:: .:. : : :.. . :: ..:
CCDS24 QVQGTG-ANNTKAFEVPARANFLNSNDVFVLK-------TQSCCYLWCGKGCSGDEREMA
520 530 540 550 560 570
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE1 EDILNTMFDTSYSKQVINEGEEPENFFWVGIGAQKPYDDDAEYMKHT-----RLFRCSNE
. . .:. : :::. ::.:: :: :...:.. :: . . .... :::.:::.
CCDS24 KMVADTISRT--EKQVVVEGQEPANF-WMALGGKAPYANTKRLQEENLVITPRLFECSNK
580 590 600 610 620
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE1 KGYFAVTEKCSDFCQDDLADDDIMLLDNGQEVYMWVGTQTSQVEIKLSLKACQVYIQ-HM
: : .:: :: :::: .::..::: ..:..:.: .... : : . . : :.. :
CCDS24 TGRFLATE-IPDFNQDDLEEDDVFLLDVWDQVFFWIGKHANEEEKKAAATTAQEYLKTHP
630 640 650 660 670 680
1240 1250 1260
pF1KE1 RSKEHERPRRLRLVRKGNEQHAFTRCFHAWSAFCKALA
... : : . .:..:.: .:: : ::. :
CCDS24 SGRDPETP--IIVVKQGHEPPTFTGWFLAWDPFKWSNTKSYEDLKAELGNSRDWSQITAE
690 700 710 720 730 740
CCDS24 VTSPKVDVFNANSNLSSGPLPIFPLEQLVNKPVEELPEGVDPSRKEEHLSIEDFTQAFGM
750 760 770 780 790 800
>>CCDS6828.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 (782 aa)
initn: 717 init1: 298 opt: 472 Z-score: 408.4 bits: 87.1 E(32554): 2e-16
Smith-Waterman score: 924; 28.3% identity (55.6% similar) in 822 aa overlap (463-1261:34-763)
440 450 460 470 480
pF1KE1 RKDSAQDDQAKQVLKGMSDVAQEKNKKQEESADARAPSGKV---RRWDQGLEKPRLDYSE
...: ::.:.: : .. .:.: :
CCDS68 HRPAPALLCALSLALCALSLPVRAATASRGASQAGAPQGRVPEARPNSMVVEHP-----E
10 20 30 40 50
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 FFTEDVGQLPGLTIWQIENFVPVLVEEAFHGKFYEADCYIVLKTFLDDSGSLNWEIYYWI
:. .:. ::: ::..:.: : : ..: :. .: :..::: .:.:.....::.
CCDS68 FL--KAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWL
60 70 80 90 100 110
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 GGEATLDKKACSAIHAVNLRNYLGAECRTVREEMGDESEEFLQVFDNDISYIEGGTASGF
:.: . :... .:: .:.: .::... :: .: :: :: : . ..: .::.::::
CCDS68 GNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGLKYKKGGVASGF
120 130 140 150 160 170
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 -YTVEDTHYVTRMYRVYGKKNIKLEPVPLKGTSLDPRFVFLLDRGLDIYVWRGAQATLSS
..: . : :...: :.. .. ::.. :.. :.:: : .:. : :....
CCDS68 KHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNNGDCFILDLGNNIHQWCGSNSNRYE
180 190 200 210 220 230
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 TTKARLFAEKINKNERKGKAEITLLVQGQELPEFWEALGGEPSE---IKKHVPEDFWPPQ
:: .. : :::.:.:.. . .: : . ..:: .:. . . :: .
CCDS68 RLKATQVSKGIRDNERSGRARVHVSEEGTEPEAMLQVLGPKPALPAGTEDTAKEDAANRK
240 250 260 270 280 290
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 -PKLYKVGLGLGYLELPQINYKLSVEHKQRPKVELMPRMRLLQSLLDTRCVYILDCWSD-
:::::. : : . ..:. . : . :. : .. .::: .:
CCDS68 LAKLYKVSNGAGTM-------SVSLVADENP---------FAQGALKSEDCFILDHGKDG
300 310 320 330 340
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 -VFIWLGRKSPRLVRAAALKLGQELCGMLHRPRHATVSRSLEGTEAQVFKAKFKNWDDVL
.:.: :... : :::: .... . :... :: :: :. .:: :::: :
CCDS68 KIFVWKGKQANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDP-
350 360 370 380 390
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 TVDYTRNAEAVLQSPGLSGKVKRDAEKKDQMKADLTALFLPRQPPMSLAEAEQLMEEWNE
: :. :: : ... . .. . : : . :. :.. :. .
CCDS68 --D---------QTDGL-GLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMA---AQHGMD---D
400 410 420 430 440
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 DLDGMEG-FVLEGKKFARLPEEEFGHFYTQDCYVFLCRYWVPVEYEEEEKKEDKEEKAEG
: :.. . .::.. . . .:.:: : :..: : . :
CCDS68 DGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNY-----------------RHGG
450 460 470 480
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 KEGEEATAEAEEKQPEEDFQCIVYFWQGREASNMGWLTFTFSLQKKFESLFPGKLEVVRM
..:. :.: ::: . :.. .. . : ... . : :.
CCDS68 RQGQ-----------------IIYNWQGAQ-STQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRV
490 500 510 520
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE1 TQQQENPKFLSHFKRK-FIIHRGKRKAVQGAQQPS---LYQIRTNGSALCTRCIQINTDS
.: .: ...: : : .::..: . : :. :.:.:.: :: :: ... .
CCDS68 VQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSREGGQTAPASTRLFQVRAN-SAGATRAVEVLPKA
530 540 550 560 570 580
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE1 SLLNSEFCFILKVPFESEDNQGIVYAWVGRASDPDEAKLAEDILNTMFDTSYSKQVINEG
. :::. :.::.: . .: ::: ... : :...: .. . :: ::
CCDS68 GALNSNDAFVLKTP-------SAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLRVL--RAQPVQVA-EG
590 600 610 620 630
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE1 EEPENFFWVGIGAQ-----KPYDDDAEYMKHT-RLFRCSNEKGYFAVTEKCSDFCQDDLA
::..: : ..:.. .: : .. : ::: :::. : :.. : ... :.:::
CCDS68 SEPDGF-WEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKIGRFVIEEVPGELMQEDLA
640 650 660 670 680 690
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE1 DDDIMLLDNGQEVYMWVGTQTSQVEIKLSLKACQVYIQHMRSKEHERPRR--LRLVRKGN
::.::::. ..:..::: .... : .: . . ::. . .: :: . .:..:
CCDS68 TDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSQEEEKTEALTSAKRYIE---TDPANRDRRTPITVVKQGF
700 710 720 730 740 750
1250 1260
pF1KE1 EQHAFTRCFHAWSAFCKALA
: .:. : .:
CCDS68 EPPSFVGWFLGWDDDYWSVDPLDRAMAELAA
760 770 780
1269 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 06:45:25 2016 done: Tue Nov 8 06:45:26 2016
Total Scan time: 4.820 Total Display time: 0.390
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]