Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1451
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1451, 359 aa
1>>>pF1KE1451 359 - 359 aa - 359 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4015+/-0.000795; mu= 16.5773+/- 0.048
mean_var=77.2748+/-15.065, 0's: 0 Z-trim(109.3): 27 B-trim: 46 in 1/50
Lambda= 0.145900
statistics sampled from 10740 (10767) to 10740 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.331), width: 16
Scan time: 2.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 ( 359) 2540 543.9 8e-155
CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 365) 2125 456.5 1.6e-128
CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 380) 2125 456.5 1.6e-128
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 372) 1233 268.8 5.4e-72
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 391) 1231 268.4 7.5e-72
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 ( 349) 1206 263.1 2.6e-70
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 ( 360) 1192 260.1 2.1e-69
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 ( 352) 1187 259.1 4.2e-69
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 ( 351) 1170 255.5 5e-68
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 ( 355) 1160 253.4 2.2e-67
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 ( 349) 1157 252.8 3.3e-67
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 299) 1139 248.9 4.1e-66
CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 365) 1037 227.5 1.4e-59
CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 355) 1028 225.6 5.1e-59
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11 ( 354) 964 212.1 5.7e-55
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 351) 868 191.9 6.9e-49
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 369) 868 191.9 7.2e-49
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 ( 351) 863 190.9 1.4e-48
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 ( 370) 746 166.3 3.9e-41
CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2 ( 365) 673 150.9 1.6e-36
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 ( 389) 661 148.4 9.8e-36
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 357) 484 111.1 1.5e-24
CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2 ( 417) 461 106.3 4.9e-23
CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 ( 365) 389 91.1 1.6e-18
CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 329) 303 73.0 4.1e-13
>>CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 (359 aa)
initn: 2540 init1: 2540 opt: 2540 Z-score: 2893.1 bits: 543.9 E(32554): 8e-155
Smith-Waterman score: 2540; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANSWWSLALNPVQRPEMFIIGAQPVCSQLPGLSPGQRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANSWWSLALNPVQRPEMFIIGAQPVCSQLPGLSPGQRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADNASVFGRVMQIGSRETAFTHAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 LCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADNASVFGRVMQIGSRETAFTHAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLPRDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFVDARE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 SAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLPRDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFVDARE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 REKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLAEFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 REKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLAEFRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VGDRLKEKYDSAAAMRVTRKGRLELVNSRFTQPTPEDLVYVDPSPDYCLRNESTGSLGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 VGDRLKEKYDSAAAMRVTRKGRLELVNSRFTQPTPEDLVYVDPSPDYCLRNESTGSLGTQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE1 GRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKCTEIVDQYICK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 GRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKCTEIVDQYICK
310 320 330 340 350
>>CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 (365 aa)
initn: 2107 init1: 2039 opt: 2125 Z-score: 2420.9 bits: 456.5 E(32554): 1.6e-128
Smith-Waterman score: 2125; 80.3% identity (94.4% similar) in 360 aa overlap (1-359:6-365)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANSWWSLALN-PVQRPEMFIIGAQPVCSQLPGL
: : ..: . :.. :.::.. .:::::::..: ::: :..::::::.:::: ::
CCDS58 MAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEVYIIGAQPLCSQLAGL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SPGQRKLCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADNASVFGRVMQIGSRET
: ::.:::.:::.:: ::::::::::::::.:::.:::::::.::.::::::::::::::
CCDS58 SQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDNTSVFGRVMQIGSRET
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 AFTHAVSAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLPRDWLWGGCGDNVEYGYRFAKE
:::.::::::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::..::::::::
CCDS58 AFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWGGCGDNIDYGYRFAKE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 FVDAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQ
::::::::. :::: :..:.::::.:::::::.::..::::::::::::::::::::::
CCDS58 FVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LAEFRKVGDRLKEKYDSAAAMRVTRKGRLELVNSRFTQPTPEDLVYVDPSPDYCLRNEST
::.:::::: ::::::::::::.. .:.: :::::..:: .::::.:::::::.:::::
CCDS58 LADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVRNEST
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKCTEIVD
:::::::::::::::::::::::::::::.:::.::.:::::::::::.:.:::::::::
CCDS58 GSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFHWCCYVKCKKCTEIVD
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 QYICK
:..::
CCDS58 QFVCK
>>CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 (380 aa)
initn: 2107 init1: 2039 opt: 2125 Z-score: 2420.6 bits: 456.5 E(32554): 1.6e-128
Smith-Waterman score: 2125; 80.3% identity (94.4% similar) in 360 aa overlap (1-359:21-380)
10 20 30
pF1KE1 MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANSWWSLALN-PVQRPEM
: : ..: . :.. :.::.. .:::::::..: ::: :.
CCDS46 MKKSIGILSPGVALGMAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 FIIGAQPVCSQLPGLSPGQRKLCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADN
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CCDS46 YIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDN
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 ASVFGRVMQIGSRETAFTHAVSAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPKDLPRDWLWG
.:::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS46 TSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCSRAARPKDLPRDWLWG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 GCGDNVEYGYRFAKEFVDAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKC
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CCDS46 GCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKC
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 HGVSGSCSLKTCWLQLAEFRKVGDRLKEKYDSAAAMRVTRKGRLELVNSRFTQPTPEDLV
:::::::::::::::::.:::::: ::::::::::::.. .:.: :::::..:: .:::
CCDS46 HGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSRGKLVQVNSRFNSPTTQDLV
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 YVDPSPDYCLRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFH
:.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::.::::::::
CCDS46 YIDPSPDYCVRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYDQFKTVQTERCHCKFH
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KE1 WCCFVRCKKCTEIVDQYICK
:::.:.::::::::::..::
CCDS46 WCCYVKCKKCTEIVDQFVCK
370 380
>>CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 (372 aa)
initn: 1234 init1: 433 opt: 1233 Z-score: 1406.0 bits: 268.8 E(32554): 5.4e-72
Smith-Waterman score: 1233; 50.6% identity (76.3% similar) in 334 aa overlap (30-359:35-361)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANSWWSLALNPVQRPEMFIIGAQPVCSQLPGLSPGQR
:.: . . .::. .:...::: ::
CCDS84 LGVVAISIFGIQLKTEGSLRTAVPGIPTQSAFNKCLQRYIGALGARVICDNIPGLVSRQR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KLCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTAD-NASVFGRVMQIGSRETAFTH
.::: : . : .::::. :.:::::::..::::.: : . .:::::: .:::.::..
CCDS84 QLCQRYPDIMRSVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLDRDHTVFGRVMLRSSREAAFVY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 AVSAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARPK--DLPRDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFV
:.:.::::.::.::: .::::.:.:. .: . : :. ::::.::..:: :::: ::
CCDS84 AISSAGVVHAITRACSQGELSVCSCDPYTRGRHHDQRGDFDWGGCSDNIHYGVRFAKAFV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLA
::.:.. ...:.::::.::. :: :: .. . ::::::::::.:.::: :.
CCDS84 DAKEKRL-------KDARALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRALS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 EFRKVGDRLKEKYDSAAAMRVTRKG-RLELVNSRFTQPTPEDLVYVDPSPDYCLRNESTG
.::..:: :...::.:. . .:. : . . . . . : :::: : :::::. ....:
CCDS84 DFRRTGDYLRRRYDGAVQVMATQDGANFTAARQGYRRATRTDLVYFDNSPDYCVLDKAAG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKCTEIVDQ
:::: ::.:.:::.: ::::.:::::::. . ..: .:.::::::: ::::.: . ::
CCDS84 SLGTAGRVCSKTSKGTDGCEIMCCGRGYDTTRVTRVTQCECKFHWCCAVRCKECRNTVDV
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YICK
. ::
CCDS84 HTCKAPKKAEWLDQT
360 370
>>CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 (391 aa)
initn: 1255 init1: 433 opt: 1231 Z-score: 1403.5 bits: 268.4 E(32554): 7.5e-72
Smith-Waterman score: 1238; 49.0% identity (73.8% similar) in 363 aa overlap (1-359:41-380)
10 20 30
pF1KE1 MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANSWWSLA
. ::::. ::. :.. : ::: ..
CCDS84 AQLPLRRASAPVPVPSPAAPDGSRASARLGLACLLLLL---LLTLPARVDT---SWWYIG
20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 LNPVQRPEMFIIGAQPVCSQLPGLSPGQRKLCQLYQEHMAYIGEGAKTGIKECQHQFRQR
.::. .:...::: ::.::: : . : .::::. :.:::::::..
CCDS84 ----------ALGARVICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMRSVGEGAREWIRECQHQFRHH
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KE1 RWNCSTAD-NASVFGRVMQIGSRETAFTHAVSAAGVVNAISRACREGELSTCGCSRTARP
::::.: : . .:::::: .:::.::..:.:.::::.::.::: .::::.:.:. .:
CCDS84 RWNCTTLDRDHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAITRACSQGELSVCSCDPYTRG
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 K--DLPRDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFVDAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRR
. : :. ::::.::..:: :::: ::::.:.. ...:.::::.::. ::
CCDS84 RHHDQRGDFDWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKEKRL-------KDARALMNLHNNRCGRT
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 AVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLAEFRKVGDRLKEKYDSAAAMRVTRKG-RLELV
:: .. . ::::::::::.:.::: :..::..:: :...::.:. . .:. : . .
CCDS84 AVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRRYDGAVQVMATQDGANFTAA
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 NSRFTQPTPEDLVYVDPSPDYCLRNESTGSLGTQGRLCNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQF
. . . : :::: : :::::. ....::::: ::.:.:::.: ::::.:::::::.
CCDS84 RQGYRRATRTDLVYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKTSKGTDGCEIMCCGRGYDTT
290 300 310 320 330 340
330 340 350
pF1KE1 KSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKCTEIVDQYICK
. ..: .:.::::::: ::::.: . :: . ::
CCDS84 RVTRVTQCECKFHWCCAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWLDQT
350 360 370 380 390
>>CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 (349 aa)
initn: 712 init1: 712 opt: 1206 Z-score: 1375.7 bits: 263.1 E(32554): 2.6e-70
Smith-Waterman score: 1206; 49.7% identity (75.5% similar) in 326 aa overlap (42-359:32-349)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 LLSSWAQLLTDANSWWSLALNPVQRPEMFIIGAQPVCSQLPGLSPGQRKLCQLYQEHMAY
.::. .:...:::.: :: .:: . .
CCDS33 HRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAIIV
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 IGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADNASVFGRVMQIGSRETAFTHAVSAAGVVNAISR
:::::. ::.:::.::: :::::. . .:::. ...::::.:::.:..::::..:..
CCDS33 IGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHAVTA
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 ACREGELSTCGCSRTARPK-DLPRDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFVDAREREKNFAKGSE
:: .:.::.:::.: . . . : ::::. .:.:: :...:::::: .::
CCDS33 ACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKN------
130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 EQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLAEFRKVGDRLKEKYD
.: ::::.::::::... .. ::::::::::. :::: : .::.:: :::::.
CCDS33 --ARRLMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKYN
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300
pF1KE1 SAAAMRVTRKGRLE------LVNSR-FTQPTPEDLVYVDPSPDYCLRNESTGSLGTQGRL
.:. ..:.: .::. . . : . .: ::::.. ::.:: .. .:::.::::::
CCDS33 AAVQVEVVRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE1 CNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKCTEIVDQYICK
::.:: : :::. :::::::: . ..: .:.:::::::::.:. :.: .. . ::
CCDS33 CNRTSPGADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
300 310 320 330 340
>>CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 (360 aa)
initn: 1188 init1: 451 opt: 1192 Z-score: 1359.6 bits: 260.1 E(32554): 2.1e-69
Smith-Waterman score: 1201; 48.6% identity (73.7% similar) in 354 aa overlap (12-359:14-349)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MPSLLLLFTAALLSSWAQLLTDANS-WWSLALNPVQRPEMFIIGAQPV-CSQLPGLSP
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CCDS57 MNAPLGGIWLWLPLLLTW--LTPEVNSSWWYMRATG---------GSSRVMCDNVPGLVS
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pF1KE1 EFVDAREREKNFAKGSEEQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWL
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CCDS57 AFVDAKER-----KGKD--ARALMNLHNNRAGRKAVKRFLKQECKCHGVSGSCTLRTCWL
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CCDS57 EAGSLGTAGRVCNLTSRGMDSCEVMCCGRGYDTSHVTRMTKCGCKFHWCCAVRCQDCLEA
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CCDS57 LDVHTCKAPKNADWTTAT
350 360
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CCDS15 RVYDVHTCK
350
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CCDS22 QVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGV
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CCDS22 LGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELH
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:.
CCDS22 TCR
350
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CCDS11 LRFCRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFV
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CCDS11 IRIYDVHTCK
350
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]