Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1445
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1445, 293 aa
1>>>pF1KE1445 293 - 293 aa - 293 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3353+/-0.000949; mu= 14.4973+/- 0.056
mean_var=57.4803+/-11.565, 0's: 0 Z-trim(104.0): 38 B-trim: 41 in 1/46
Lambda= 0.169167
statistics sampled from 7646 (7684) to 7646 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 2.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3684.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 ( 293) 2000 496.5 9.8e-141
CCDS3685.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 ( 204) 1295 324.4 4.4e-89
CCDS2343.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 464) 451 118.5 9.4e-27
CCDS2342.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 479) 451 118.5 9.7e-27
CCDS42799.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 496) 451 118.5 1e-26
CCDS42798.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 538) 451 118.5 1.1e-26
CCDS2339.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 479) 408 108.0 1.4e-23
CCDS2340.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 522) 408 108.0 1.5e-23
CCDS5879.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7 ( 452) 391 103.9 2.3e-22
CCDS3836.1 CASP3 gene_id:836|Hs108|chr4 ( 277) 386 102.6 3.5e-22
CCDS56159.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 455) 378 100.7 2.1e-21
CCDS56160.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 478) 366 97.8 1.7e-20
CCDS2338.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 521) 366 97.8 1.8e-20
CCDS58096.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 278) 352 94.3 1.1e-19
CCDS7581.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 303) 351 94.0 1.4e-19
CCDS7580.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 336) 351 94.1 1.6e-19
CCDS73200.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 388) 351 94.1 1.8e-19
CCDS159.2 CASP9 gene_id:842|Hs108|chr1 ( 333) 286 78.2 9.2e-15
CCDS158.1 CASP9 gene_id:842|Hs108|chr1 ( 416) 286 78.2 1.1e-14
CCDS53704.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 311) 235 65.7 4.8e-11
CCDS44718.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 292) 234 65.5 5.4e-11
CCDS8329.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 383) 235 65.8 5.8e-11
CCDS8330.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 404) 235 65.8 6.1e-11
CCDS44719.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 376) 234 65.5 6.8e-11
CCDS8328.2 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 434) 234 65.5 7.7e-11
CCDS44720.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 447) 234 65.5 8e-11
>>CCDS3684.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 (293 aa)
initn: 2000 init1: 2000 opt: 2000 Z-score: 2640.1 bits: 496.5 E(32554): 9.8e-141
Smith-Waterman score: 2000; 100.0% identity (100.0% similar) in 293 aa overlap (1-293:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSSASGLRRGHPAGGEENMTETDAFYKREMFDPAEKYKMDHRRRGIALIFNHERFFWHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MSSASGLRRGHPAGGEENMTETDAFYKREMFDPAEKYKMDHRRRGIALIFNHERFFWHLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LPERRGTCADRDNLTRRFSDLGFEVKCFNDLKAEELLLKIHEVSTVSHADADCFVCVFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LPERRGTCADRDNLTRRFSDLGFEVKCFNDLKAEELLLKIHEVSTVSHADADCFVCVFLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HGEGNHIYAYDAKIEIQTLTGLFKGDKCHSLVGKPKIFIIQACRGNQHDVPVIPLDVVDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 HGEGNHIYAYDAKIEIQTLTGLFKGDKCHSLVGKPKIFIIQACRGNQHDVPVIPLDVVDN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 QTEKLDTNITEVDAASVYTLPAGADFLMCYSVAEGYYSHRETVNGSWYIQDLCEMLGKYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 QTEKLDTNITEVDAASVYTLPAGADFLMCYSVAEGYYSHRETVNGSWYIQDLCEMLGKYG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE1 SSLEFTELLTLVNRKVSQRRVDFCKDPSAIGKKQVPCFASMLTKKLHFFPKSN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 SSLEFTELLTLVNRKVSQRRVDFCKDPSAIGKKQVPCFASMLTKKLHFFPKSN
250 260 270 280 290
>>CCDS3685.1 CASP6 gene_id:839|Hs108|chr4 (204 aa)
initn: 1295 init1: 1295 opt: 1295 Z-score: 1712.8 bits: 324.4 E(32554): 4.4e-89
Smith-Waterman score: 1295; 100.0% identity (100.0% similar) in 191 aa overlap (103-293:14-204)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 NLTRRFSDLGFEVKCFNDLKAEELLLKIHEVSTVSHADADCFVCVFLSHGEGNHIYAYDA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MSSASGLRRGHPAVSTVSHADADCFVCVFLSHGEGNHIYAYDA
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 KIEIQTLTGLFKGDKCHSLVGKPKIFIIQACRGNQHDVPVIPLDVVDNQTEKLDTNITEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KIEIQTLTGLFKGDKCHSLVGKPKIFIIQACRGNQHDVPVIPLDVVDNQTEKLDTNITEV
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 DAASVYTLPAGADFLMCYSVAEGYYSHRETVNGSWYIQDLCEMLGKYGSSLEFTELLTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 DAASVYTLPAGADFLMCYSVAEGYYSHRETVNGSWYIQDLCEMLGKYGSSLEFTELLTLV
110 120 130 140 150 160
260 270 280 290
pF1KE1 NRKVSQRRVDFCKDPSAIGKKQVPCFASMLTKKLHFFPKSN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 NRKVSQRRVDFCKDPSAIGKKQVPCFASMLTKKLHFFPKSN
170 180 190 200
>>CCDS2343.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 (464 aa)
initn: 443 init1: 169 opt: 451 Z-score: 593.8 bits: 118.5 E(32554): 9.4e-27
Smith-Waterman score: 452; 35.6% identity (61.5% similar) in 270 aa overlap (37-290:211-462)
10 20 30 40 50
pF1KE1 LRRGHPAGGEENMTETDAFYKREMFDPAEKYKMDHRRRGIALIFNHERFF--------WH
:.: . :: ::.:.. : :
CCDS23 FSKGEELCGVMTISDSPREQDSESQTLDKVYQMKSKPRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLH
190 200 210 220 230 240
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LTLPERRGTCADRDNLTRRFSDLGFEVKCFNDLKAEEL--LLKIHEVSTVSHADADCFVC
.. .: :: : :: : .: ::.: .: .:.. .:::... ..:.. :::.:
CCDS23 -SIRDRNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIYQL--MDHSNMDCFIC
250 260 270 280 290
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 VFLSHGEGNHIYAYDAK-IEIQTLTGLFKGDKCHSLVGKPKIFIIQACRGN--QHDVPVI
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CCDS23 CILSHGDKGIIYGTDGQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQGDNYQKGIPV-
300 310 320 330 340 350
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PLDVVDNQTEKLDTNITEVDAASVYT--LPAGADFLMCYSVAEGYYSHRETVNGSWYIQD
.:.. . :.: .: : .: ::::. ...... :.:. ..:.::::.
CCDS23 -------ETDSEEQPYLEMDLSSPQTRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQS
360 370 380 390 400
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LCEMLGKY-GSSLEFTELLTLVNRKVSQRRVDFCKDPSAIGKKQVPCFASMLTKKLHFFP
::. : . . .. .:: :: .::.. : . .:: :.: . : ::: ::
CCDS23 LCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNK-----DDKKNMGK-QMPQPTFTLRKKL-VFP
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 KSN
CCDS23 SD
>>CCDS2342.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 (479 aa)
initn: 443 init1: 169 opt: 451 Z-score: 593.6 bits: 118.5 E(32554): 9.7e-27
Smith-Waterman score: 452; 35.6% identity (61.5% similar) in 270 aa overlap (37-290:226-477)
10 20 30 40 50
pF1KE1 LRRGHPAGGEENMTETDAFYKREMFDPAEKYKMDHRRRGIALIFNHERFF--------WH
:.: . :: ::.:.. : :
CCDS23 FSNGEELCGVMTISDSPREQDSESQTLDKVYQMKSKPRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLH
200 210 220 230 240 250
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LTLPERRGTCADRDNLTRRFSDLGFEVKCFNDLKAEEL--LLKIHEVSTVSHADADCFVC
.. .: :: : :: : .: ::.: .: .:.. .:::... ..:.. :::.:
CCDS23 -SIRDRNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIYQL--MDHSNMDCFIC
260 270 280 290 300 310
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 VFLSHGEGNHIYAYDAK-IEIQTLTGLFKGDKCHSLVGKPKIFIIQACRGN--QHDVPVI
.::::. . ::. :.. : ::. : : :: ::.::::.:.::::.:. :. .::
CCDS23 CILSHGDKGIIYGTDGQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQGDNYQKGIPV-
320 330 340 350 360 370
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PLDVVDNQTEKLDTNITEVDAASVYT--LPAGADFLMCYSVAEGYYSHRETVNGSWYIQD
.:.. . :.: .: : .: ::::. ...... :.:. ..:.::::.
CCDS23 -------ETDSEEQPYLEMDLSSPQTRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQS
380 390 400 410 420
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LCEMLGKY-GSSLEFTELLTLVNRKVSQRRVDFCKDPSAIGKKQVPCFASMLTKKLHFFP
::. : . . .. .:: :: .::.. : . .:: :.: . : ::: ::
CCDS23 LCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNK-----DDKKNMGK-QMPQPTFTLRKKL-VFP
430 440 450 460 470
pF1KE1 KSN
CCDS23 SD
>>CCDS42799.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 (496 aa)
initn: 443 init1: 169 opt: 451 Z-score: 593.3 bits: 118.5 E(32554): 1e-26
Smith-Waterman score: 452; 35.6% identity (61.5% similar) in 270 aa overlap (37-290:243-494)
10 20 30 40 50
pF1KE1 LRRGHPAGGEENMTETDAFYKREMFDPAEKYKMDHRRRGIALIFNHERFF--------WH
:.: . :: ::.:.. : :
CCDS42 FSKGEELCGVMTISDSPREQDSESQTLDKVYQMKSKPRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLH
220 230 240 250 260 270
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LTLPERRGTCADRDNLTRRFSDLGFEVKCFNDLKAEEL--LLKIHEVSTVSHADADCFVC
.. .: :: : :: : .: ::.: .: .:.. .:::... ..:.. :::.:
CCDS42 -SIRDRNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIYQL--MDHSNMDCFIC
280 290 300 310 320
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 VFLSHGEGNHIYAYDAK-IEIQTLTGLFKGDKCHSLVGKPKIFIIQACRGN--QHDVPVI
.::::. . ::. :.. : ::. : : :: ::.::::.:.::::.:. :. .::
CCDS42 CILSHGDKGIIYGTDGQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQGDNYQKGIPV-
330 340 350 360 370 380
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PLDVVDNQTEKLDTNITEVDAASVYT--LPAGADFLMCYSVAEGYYSHRETVNGSWYIQD
.:.. . :.: .: : .: ::::. ...... :.:. ..:.::::.
CCDS42 -------ETDSEEQPYLEMDLSSPQTRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQS
390 400 410 420 430 440
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LCEMLGKY-GSSLEFTELLTLVNRKVSQRRVDFCKDPSAIGKKQVPCFASMLTKKLHFFP
::. : . . .. .:: :: .::.. : . .:: :.: . : ::: ::
CCDS42 LCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNK-----DDKKNMGK-QMPQPTFTLRKKL-VFP
450 460 470 480 490
pF1KE1 KSN
CCDS42 SD
>>CCDS42798.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 (538 aa)
initn: 443 init1: 169 opt: 451 Z-score: 592.7 bits: 118.5 E(32554): 1.1e-26
Smith-Waterman score: 452; 35.6% identity (61.5% similar) in 270 aa overlap (37-290:285-536)
10 20 30 40 50
pF1KE1 LRRGHPAGGEENMTETDAFYKREMFDPAEKYKMDHRRRGIALIFNHERFF--------WH
:.: . :: ::.:.. : :
CCDS42 FSNGEELCGVMTISDSPREQDSESQTLDKVYQMKSKPRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLH
260 270 280 290 300 310
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LTLPERRGTCADRDNLTRRFSDLGFEVKCFNDLKAEEL--LLKIHEVSTVSHADADCFVC
.. .: :: : :: : .: ::.: .: .:.. .:::... ..:.. :::.:
CCDS42 -SIRDRNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIYQL--MDHSNMDCFIC
320 330 340 350 360 370
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 VFLSHGEGNHIYAYDAK-IEIQTLTGLFKGDKCHSLVGKPKIFIIQACRGN--QHDVPVI
.::::. . ::. :.. : ::. : : :: ::.::::.:.::::.:. :. .::
CCDS42 CILSHGDKGIIYGTDGQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQGDNYQKGIPV-
380 390 400 410 420 430
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PLDVVDNQTEKLDTNITEVDAASVYT--LPAGADFLMCYSVAEGYYSHRETVNGSWYIQD
.:.. . :.: .: : .: ::::. ...... :.:. ..:.::::.
CCDS42 -------ETDSEEQPYLEMDLSSPQTRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQS
440 450 460 470 480
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LCEMLGKY-GSSLEFTELLTLVNRKVSQRRVDFCKDPSAIGKKQVPCFASMLTKKLHFFP
::. : . . .. .:: :: .::.. : . .:: :.: . : ::: ::
CCDS42 LCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNK-----DDKKNMGK-QMPQPTFTLRKKL-VFP
490 500 510 520 530
pF1KE1 KSN
CCDS42 SD
>>CCDS2339.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 (479 aa)
initn: 415 init1: 138 opt: 408 Z-score: 536.9 bits: 108.0 E(32554): 1.4e-23
Smith-Waterman score: 467; 36.7% identity (63.3% similar) in 281 aa overlap (14-290:210-471)
10 20 30 40
pF1KE1 MSSASGLRRGHPAGGEENMTETDAFYKREMFDPAEKYKMDHRR
: :: ...::. : . : :.:.. .
CCDS23 KLLRNIEKYKREKAIQIVTPPVDKEAESYQGEEELVSQTDVKTFLEALPRAAVYRMNRNH
180 190 200 210 220 230
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 RGIALIFNHERFFWHLTLPERRGTCADRDNLTRRFSDLGFEVKCFNDL-KAE-ELLLKIH
::. .: :.. : .: .:.:: : . :.. :. ::: :. :.. :.: :..:. .
CCDS23 RGLCVIVNNHSF---TSLKDRQGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKVEMEMVLQKQ
240 250 260 270 280 290
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 EVSTVSHADADCFVCVFLSHGEGNHIYAYD-AKIEIQTLTGLFKGDKCHSLVGKPKIFII
. . .:::.:::: .:.::. . .:. : : : :. . . : . .: :. :::.:.:
CCDS23 KCNP-AHADGDCFVFCILTHGRFGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRLAEKPKLFFI
300 310 320 330 340 350
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 QACRGNQHDVPVIPLDVVDNQTEKLDTNITEVDAASVYTLPAGADFLMCYSVAEGYYSHR
:::.:.. . : . ... . :. :.. . ..:: ::::. ... :: : :
CCDS23 QACQGEEIQ-PSVSIEADALNPEQAPTSLQD-------SIPAEADFLLGLATVPGYVSFR
360 370 380 390 400
230 240 250 260 270
pF1KE1 ETVNGSWYIQDLCEMLGKYGSSLE-FTELLTLVNRKVSQRRVDFCKDPSAIGKKQVPCFA
.. .::::::.::. : : : . .:: :: :: :::: :. . :::.: :
CCDS23 HVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSILTAVNDDVS-RRVD--KQGT---KKQMPQPA
410 420 430 440 450 460
280 290
pF1KE1 SMLTKKLHFFPKSN
: ::: ::
CCDS23 FTLRKKL-VFPVPLDALSL
470
>>CCDS2340.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 (522 aa)
initn: 358 init1: 138 opt: 408 Z-score: 536.2 bits: 108.0 E(32554): 1.5e-23
Smith-Waterman score: 452; 35.9% identity (62.1% similar) in 290 aa overlap (5-290:250-514)
10 20 30
pF1KE1 MSSASGLRRGHPAGGEENMTETDAFYKREMFDPA
: . :: :. : .... :: :
CCDS23 VKTFLEALPQESWQNKHAGSNGNRATNGAPSLVSRGMQ-GASANTLNSETSTKR-----A
220 230 240 250 260 270
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 EKYKMDHRRRGIALIFNHERFFWHLTLPERRGTCADRDNLTRRFSDLGFEVKCFNDL-KA
:.:.. .::. .: :.. : .: .:.:: : . :.. :. ::: :. :.. :.
CCDS23 AVYRMNRNHRGLCVIVNNHSF---TSLKDRQGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNVTKV
280 290 300 310 320 330
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 E-ELLLKIHEVSTVSHADADCFVCVFLSHGEGNHIYAYD-AKIEIQTLTGLFKGDKCHSL
: :..:. .. . .:::.:::: .:.::. . .:. : : : :. . . : . .: :
CCDS23 EMEMVLQKQKCNP-AHADGDCFVFCILTHGRFGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQCPRL
340 350 360 370 380
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