Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1424
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1424, 556 aa
1>>>pF1KE1424 556 - 556 aa - 556 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0548+/-0.00136; mu= 13.9575+/- 0.081
mean_var=65.0740+/-12.945, 0's: 0 Z-trim(98.5): 39 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.158990
statistics sampled from 5354 (5385) to 5354 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.509), E-opt: 0.2 (0.165), width: 16
Scan time: 3.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 556) 3500 812.5 0
CCDS43522.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 401) 2534 590.9 9.6e-169
CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 543) 903 216.8 5.3e-56
CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 539) 874 210.2 5.3e-54
CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 545) 848 204.2 3.4e-52
CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 520) 844 203.3 6.1e-52
CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 541) 842 202.8 8.6e-52
CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 499) 838 201.9 1.5e-51
CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 503) 833 200.8 3.4e-51
CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 531) 755 182.9 8.6e-46
CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 530) 742 179.9 6.8e-45
CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 509) 707 171.8 1.7e-42
CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 507) 683 166.3 7.7e-41
CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 456) 675 164.5 2.5e-40
CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 535) 653 159.5 9.6e-39
CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 448) 598 146.8 5.1e-35
CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 486) 598 146.8 5.5e-35
CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 486) 578 142.3 1.3e-33
CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 339) 572 140.9 2.4e-33
CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 485) 573 141.1 2.9e-33
CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 488) 564 139.0 1.2e-32
CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 475) 509 126.4 7.5e-29
CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 529) 499 124.1 4.1e-28
CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 548) 499 124.1 4.2e-28
CCDS54106.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 493) 386 98.2 2.4e-20
CCDS13738.1 CCT8L2 gene_id:150160|Hs108|chr22 ( 557) 280 73.9 5.7e-13
>>CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 (556 aa)
initn: 3500 init1: 3500 opt: 3500 Z-score: 4338.0 bits: 812.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3500; 100.0% identity (100.0% similar) in 556 aa overlap (1-556:1-556)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEGPLSVFGDRSTGETIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MEGPLSVFGDRSTGETIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 ILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YRLACKEAVRYINENLIVNTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINGDFFANMVVDAVLAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 YRLACKEAVRYINENLIVNTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINGDFFANMVVDAVLAIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 YTDIRGQPRYPVNSVNILKAHGRSQMESMLISGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 YTDIRGQPRYPVNSVNILKAHGRSQMESMLISGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEVVQERICDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 VEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEVVQERICDDE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LILIKNTKARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVKRVLESKSVVPGGGAVEAALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LILIKNTKARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVKRVLESKSVVPGGGAVEAALS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 IYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 IYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPER
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 KNLKWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 KNLKWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDD
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE1 KHGSYEDAVHSGALND
::::::::::::::::
CCDS52 KHGSYEDAVHSGALND
550
>>CCDS43522.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 (401 aa)
initn: 2534 init1: 2534 opt: 2534 Z-score: 3143.0 bits: 590.9 E(32554): 9.6e-169
Smith-Waterman score: 2534; 100.0% identity (100.0% similar) in 401 aa overlap (156-556:1-401)
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KEAVRYINENLIVNTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINGDFFANMVVDAVLAIKYTDIR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSSKIIGINGDFFANMVVDAVLAIKYTDIR
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GQPRYPVNSVNILKAHGRSQMESMLISGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GQPRYPVNSVNILKAHGRSQMESMLISGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTK
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 MKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGA
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 MAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEVVQERICDDELILIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEVVQERICDDELILIK
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NTKARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVKRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NTKARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVKRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLEN
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 YATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKW
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 IGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGSY
340 350 360 370 380 390
550
pF1KE1 EDAVHSGALND
:::::::::::
CCDS43 EDAVHSGALND
400
>>CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (543 aa)
initn: 991 init1: 377 opt: 903 Z-score: 1118.9 bits: 216.8 E(32554): 5.3e-56
Smith-Waterman score: 1015; 36.8% identity (65.6% similar) in 538 aa overlap (10-540:14-528)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MEGPLSVFGDRSTGETIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITN
: : : .:. : ::. :...::: :.::..:: : .::.:
CCDS46 MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATISN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 DGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTS
:::::::::.: :::::.: ..: :: :::::::::...:::.::.. :.. .::
CCDS46 DGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 VISGYRLACKEAVRYINENLIV--NTDEL-GRDCLINAAKTSMSSKIIGINGDFFANMVV
.: ..: : . :: :.: .. ..:.. : : . : :..:::.:. . :::.:::
CCDS46 IIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DAVLAIKYTDIRGQPRYPVNSVNILKAHGRSQMESMLISGYALN---CVVGSQGMPKRIV
:::. . :. .. ..: :..: . .:.:..: :.. .: . .::.
CCDS46 DAVMMLD--DL-----LQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYH
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTG
: ::: :. :. : .... . : . : . : .: ....:: .::.:.:.
CCDS46 NPKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEE
: :. .::.. . . :: ..:::: : :..: ... : : .::. .
CCDS46 PIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNAL------SADVLGRCQV
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE1 VVQERICDDELILIKNT-KARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVKRVLESKSVV
. .: .. .. . ::.: . :. ::..:: .: :::::::. .:.:.... :::
CCDS46 FEETQIGGERYNFFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFM-EETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVV
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 PGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRA
::::.: :: ::..:. .. ...:: :. .:..: .:: : ::. :.:... ::::
CCDS46 AGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRA
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 FHNEAQVNPERKNLKWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDD
: .. . : :.:..: :: .: :.::..:....: :.::: :. .:.
CCDS46 RHAQGGT--------WYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDE
470 480 490 500 510
530 540 550
pF1KE1 LIKLHPESKDDKHGSYEDAVHSGALND
:: .:.: :
CCDS46 TIK-NPRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
520 530 540
>>CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 (539 aa)
initn: 695 init1: 395 opt: 874 Z-score: 1083.0 bits: 210.2 E(32554): 5.3e-54
Smith-Waterman score: 943; 33.0% identity (66.0% similar) in 533 aa overlap (8-531:24-536)
10 20 30 40
pF1KE1 MEGPLSVFGDRSTGETIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKM
. ::. :: .:. :: ..:. ...:::: :.:::
CCDS33 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 LVDDIGDVTITNDGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNA
. : :::::::::::::: ..: ::::..: ::. :: :.:::::::::::. :: .
CCDS33 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 DELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVRYINENLIVNTDELG-RDCLINAAKTSMSSKIIGI
.:... :::: . ... : ..... ... . ::. :. :.:.: ::..::...
CCDS33 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTD--MSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQ
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 NGDFFANMVVDAVLAIKYTDIRGQPRYPVNSVNILKAHGRSQMESMLISGYALNCVVGSQ
..... : :.::. : : . ...:.: : . . :. : .:. :...
CCDS33 YSSLLSPMSVNAVM--KVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 GMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGA
:. :. .:::. ..: :. : . :.:..: ..:.. ..: . ...: ::
CCDS33 GIT-RVEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGC
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE1 NVILTTGGI-----DDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEE
::.: .: .:. :... . :... . ..:.. : :. :. . .:...
CCDS33 NVLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGT---KPVAHID---
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 TFEAAMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKART---SASIILRGANDFMCDEMERSLHDA
: : :::.:: ...: . :.: : . ...:..::.: .. .: :::.:::
CCDS33 QFTADMLGSAE-LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDA
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 LCVVKRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVN
:::.. ........ :::: : :.. : .:. .... :. . :: .. :::.::: :
CCDS33 LCVIRCLVKKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAEN
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 AAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLK
:. . . :..:: : ... : :... .: . . : .: .:.:..:
CCDS33 AGLNPISTVTELRNRHAQGE--------KTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALT
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550
pF1KE1 FATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGSYEDAVHSGALND
.:::.. .::.:::..
CCDS33 LATETVRSILKIDDVVNTR
530
>>CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 (545 aa)
initn: 844 init1: 393 opt: 848 Z-score: 1050.7 bits: 204.2 E(32554): 3.4e-52
Smith-Waterman score: 981; 34.0% identity (65.1% similar) in 541 aa overlap (11-548:16-542)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MEGPLSVFGDRSTGETIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTIT
: .:. ..: :. :: .::.:... ::: .. :::.: .: ...:
CCDS11 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 NDGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPT
::: .::. ..:.::::: . :.. ::.:::::::::.:.:.:.:. :.....:..:::
CCDS11 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 SVISGYRLACKEAVRYINENLIVNTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINGDFFANMVVDA
:::.:: : . . . ... . .: : ..: ..:...: :. ... :...::
CCDS11 VVISAYRKALDDMISTL-KKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALDA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VLAIKYTDIRGQPRYPVNS-VNILKAHGRSQMESMLISGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKI
: ... . :. . ... . . : : .: .. : .: : : . : : .:
CCDS11 VKMVQFEE-NGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 ACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDD
. :: ::. : . ... :: : . .: : : . .. . :. .:..: ::.:
CCDS11 VLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 MCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEVVQE
. .:...:. :.::: : : .:::.: :: :.: .:. ... .: : . .
CCDS11 LAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIK-----
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 RICDDELILIKNTKARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVKRVLESKSVVPGGGA
.: :. . .: . : . .:.::::. . .:.::.:.::. : . :: . ..::::::
CCDS11 KIGDEYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 VEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEA
: :.. : . . .: . :: :..: ::: :: : . .. :...::: : .
CCDS11 SEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKH--T
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 QVNPERKNLKWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLH
: : : : :.. .: : :. :..:: ::... : :.:.:. .:::::... :
CCDS11 QENCET----W-GVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGH
480 490 500 510 520
540 550
pF1KE1 PESKDD--KHGSYEDAVHSGALND
.. :: ..:. ::
CCDS11 KKKGDDQSRQGGAPDAGQE
530 540
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10 20 30 40 50
pF1KE1 MEGPLSVFGDRSTGETIRS---QNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITND
. : : ::.. ...::: ..:: ...:::: :::::.:: ::::.:::
CCDS82 MNSSLGPTIEKLSVSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTND
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSV
:::::....:.: ::.. ::. :: :.:::::.::..:. ::..:..:. . ::: .
CCDS82 GATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ISGYRLACKEAVRY---INENLIVNTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINGDFFANMVVD
.::. : . :... :.....:. . . ::..:::...::... .:...:.
CCDS82 ADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDT--EPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIAVN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 AVLAIKYTDIRGQPRYPVNSVNILKAHGR--SQME-SMLISGYALNCVVGSQGMPKRIVN
:::.. .:.. : :. ...:..:. ...: . ::.: .. . :::.. .
CCDS82 AVLTV--ADME---RRDVD-FELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVED
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 AKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGG
:::: : .. : : .. .:. : ... :.. .: ::.: ::::. . :
CCDS82 AKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 IDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEV
.:: . ... . ::: : ... :: :.:. :. ...: .:. .. : ..:.
CCDS82 FDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKL---GFAGLVQEI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 VQERICDDELILIKNTKARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVKRVLESKSVVPG
. :....:.. : ...:..::.: .. .: .:::::::::.. ..... :: :
CCDS82 -SFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 GGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFH
:::.: . .. . . : . . :: :. :: .: ::: .:. :.... . ....:: .
CCDS82 GGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQ
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 NEAQVNPERKNLKWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLI
. ..:: .:.: . : :: :.: : : .....::. . ::.:::.
CCDS82 VK-EMNPA------LGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIR
470 480 490 500 510
540 550
pF1KE1 KLHPESKDDKHGSYEDAVHSGALND
:
CCDS82 KPGESEE
520
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10 20 30 40
pF1KE1 MEGPLSVFGDRSTGETIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKM
:...:. .::: ..:: ...:::: :::::
CCDS38 ASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSH-IMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKM
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50 60 70 80 90 100
pF1KE1 LVDDIGDVTITNDGATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNA
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CCDS38 MVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEA
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110 120 130 140 150 160
pF1KE1 DELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVRY---INENLIVNTDELGRDCLINAAKTSMSSKII
..:. . ::: . .::. : . :... :.....:. . . ::..:::...::..
CCDS38 EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDT--EPLIQTAKTTLGSKVV
130 140 150 160 170
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pF1KE1 GINGDFFANMVVDAVLAIKYTDIRGQPRYPVNSVNILKAHGR--SQME-SMLISGYALNC
. .:...:.:::.. .:.. : :. ...:..:. ...: . ::.: ..
CCDS38 NSCHRQMAEIAVNAVLTV--ADME---RRDVD-FELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKI
. :::.. .:::: : .. : : .. .:. : ... :.. .: ::.:
CCDS38 DFSHPQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 LATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEE
::::. . :.:: . ... . ::: : ... :: :.:. :. ...: .:.
CCDS38 KETGANLAICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 TFEAAMLGQAEEVVQERICDDELILIKNTKARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCV
: : ..:. . :....:.. : ...:..::.: .. .: .:::::::::
CCDS38 LGFA---GLVQEI-SFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCV
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pF1KE1 VKRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQ
.. ..... :: ::::.: . .. . . : . . :: :. :: .: ::: .:. :...
CCDS38 IRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGM
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 DSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNLKWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFAT
. . ....:: .. ..:: .:.: . : :: :.: : : .....::
CCDS38 NPIQTMTEVRA-RQVKEMNPA------LGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLAT
470 480 490 500 510 520
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pF1KE1 EAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHGSYEDAVHSGALND
. . ::.:::. :
CCDS38 QMVRMILKIDDIRKPGESEE
530 540
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pF1KE1 RSTGETIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGATILKLLEVEHP
.::..:: : .::.::::::::::.: ::
CCDS54 MDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHP
10 20 30
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pF1KE1 AAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVR
:::.: ..: :: :::::::::...:::.::.. :.. .:: .: ..: : . ::
CCDS54 AAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLAVN
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180
pF1KE1 YINENLIV--NTDEL-GRDCLINAAKTSMSSKIIGINGDFFANMVVDAVLAIKYTDIRGQ
:.: .. ..:.. : : . : :..:::.:. . :::.::::::. . :.
CCDS54 KIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLD--DL---
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pF1KE1 PRYPVNSVNILKAHGRSQMESMLISGYALN---CVVGSQGMPKRIVNAKIACLDFSLQKT
.. ..: :..: . .:.:..: :.. .: . .::. : ::: :. :.
CCDS54 --LQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALLNVELELK
150 160 170 180 190 200
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pF1KE1 KMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDDMCLKYFVEAG
: .... . : . : . : .: ....:: .::.:.:. : :. .::..
CCDS54 AEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRD
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEVVQERICDDELILI
. . :: ..:::: : :..: ... : : .::. . . .: .. ..
CCDS54 MFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALS------ADVLGRCQVFEETQIGGERYNFF
270 280 290 300 310
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pF1KE1 KNT-KARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVKRVLESKSVVPGGGAVEAALSIYL
. ::.: . :. ::..:: .: :::::::. .:.:.... ::: ::::.: :: ::
CCDS54 TGCPKAKTCTFILRGGAEQFM-EETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYL
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 ENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEAQVNPERKNL
..:. .. ...:: :. .:..: .:: : ::. :.:... :::: : .. .
CCDS54 RDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGGT-------
380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 KWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLHPESKDDKHG
: :.:..: :: .: :.::..:....: :.::: :. .:. :: .:.: :
CCDS54 -WYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIK-NPRSTVDAPT
430 440 450 460 470 480
550
pF1KE1 SYEDAVHSGALND
CCDS54 AAGRGRGRGRPH
490
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEGPLSVFGDRSTGETIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDGAT
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CCDS77 MAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDGAT
10 20 30
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pF1KE1 ILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVISG
::....:.: ::.. ::. :: :.:::::.::..:. ::..:..:. . ::: . .:
CCDS77 ILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIADG
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pF1KE1 YRLACKEAVRY---INENLIVNTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINGDFFANMVVDAVL
:. : . :... :.....:. . . ::..:::...::... .:...:.:::
CCDS77 YEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDT--EPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIAVNAVL
100 110 120 130 140 150
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pF1KE1 AIKYTDIRGQPRYPVNSVNILKAHGR--SQME-SMLISGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKI
.. .:.. : :. ...:..:. ...: . ::.: .. . :::.. .:::
CCDS77 TV--ADME---RRDVD-FELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
160 170 180 190 200 210
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pF1KE1 ACLDFSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKILATGANVILTTGGIDD
: : .. : : .. .:. : ... :.. .: ::.: ::::. . :.::
CCDS77 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDD
220 230 240 250 260 270
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pF1KE1 MCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEVVQE
. ... . ::: : ... :: :.:. :. ...: .:. : : ..:. .
CCDS77 EANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFA---GLVQEI-SF
280 290 300 310 320
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pF1KE1 RICDDELILIKNTKARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVKRVLESKSVVPGGGA
:....:.. : ...:..::.: .. .: .:::::::::.. ..... :: ::::
CCDS77 GTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGA
330 340 350 360 370 380
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pF1KE1 VEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRAFHNEA
.: . .. . . : . . :: :. :: .: ::: .:. :.... . ....:: ..
CCDS77 AEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRA-RQVK
390 400 410 420 430 440
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pF1KE1 QVNPERKNLKWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDDLIKLH
..:: .:.: . : :: :.: : : .....::. . ::.:::. :
CCDS77 EMNPA------LGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPG
450 460 470 480 490
540 550
pF1KE1 PESKDDKHGSYEDAVHSGALND
CCDS77 ESEE
500
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pF1KE1 MEGPLSVFGDRSTGETIRSQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDIGDVTITNDG
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CCDS55 MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
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pF1KE1 ATILKLLEVEHPAAKVLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKQKIHPTSVI
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CCDS55 NVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIT
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pF1KE1 SGYRLACKEAVRYINENLIVNTDELGRDCLINAAKTSMSSKIIGINGDFFANMVVDAVLA
:.. : ..:.....: . . :. :. ::..:.::. .:. . .: ... :::..::
CCDS55 EGFEAAKEKALQFLEE--VKVSREMDRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVVDSILA
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pF1KE1 IKYTDIRGQPRYPVNSVNILKAHGRSQMESMLISGYALNCVVGSQGMPKRIVNAKIACLD
:: : .: . ..:.. . .:. .. :: : .:. . : ::. .: : .
CCDS55 IKKQD---EP-IDLFMIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAYILTCN
180 190 200 210 220 230
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pF1KE1 FSLQKTKMKLGVQVVITDPEKLDQIRQRESDITKERIQKIL-----ATGAN----VILTT
::. : ... . :. ... . : . ..:..::. . : . :...
CCDS55 VSLEYEKTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGFVVINQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KE1 GGIDDMCLKYFVEAGAMAVRRVLKRDLKRIAKASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAE
::: . : . . : .:.::. .:...:.. : :.. :... .: . ::.:
CCDS55 KGIDPFSLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPD------CLGHAG
300 310 320 330 340
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pF1KE1 EVVQERICDDELILIKNTKARTSASIILRGANDFMCDEMERSLHDALCVVKRVLESKSVV
: . . .... .:.. . :......: : ... ...:.: .:: .... ::
CCDS55 LVYEYTLGEEKFTFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVV
350 360 370 380 390 400
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pF1KE1 PGGGAVEAALSIYLENYATSMGSREQLAIAEFARSLLVIPNTLAVNAAQDSTDLVAKLRA
::.::::.:.. : .. :. .: ::.. :: .::.::..:: :.. : . ..:..:
CCDS55 PGAGAVEVAMAEALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQA
410 420 430 440 450 460
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pF1KE1 FHNEAQVNPERKNLKWIGLDLSNGKPRDNKQAGVFEPTIVKVKSLKFATEAAITILRIDD
:.:. . .:.::..:.: ..::.. :: . :. : : .:: .:.
CCDS55 EHSESG--------QLVGVDLNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDE
470 480 490 500 510 520
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pF1KE1 LIKLHPESKDDKHGSYEDAVHSGALND
...
CCDS55 IMRAGMSSLKG
530
556 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]