Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1418
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1418, 409 aa
1>>>pF1KE1418 409 - 409 aa - 409 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1401+/-0.000526; mu= 18.2529+/- 0.032
mean_var=76.8397+/-15.990, 0's: 0 Z-trim(107.6): 85 B-trim: 978 in 1/51
Lambda= 0.146312
statistics sampled from 15621 (15703) to 15621 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 7.780
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000315 (OMIM: 180297,185000,268150) ammonium tr ( 409) 2655 570.7 2.3e-162
NP_001307970 (OMIM: 605381) ammonium transporter R ( 479) 1360 297.4 5e-80
NP_057405 (OMIM: 605381) ammonium transporter Rh t ( 479) 1360 297.4 5e-80
XP_011513090 (OMIM: 180297,185000,268150) PREDICTE ( 217) 1340 292.9 5.2e-79
XP_016857347 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 414) 1296 283.8 5.3e-76
XP_016857346 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 428) 1296 283.8 5.4e-76
NP_065140 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh t ( 458) 1296 283.9 5.7e-76
NP_001243325 (OMIM: 607079) ammonium transporter R ( 428) 1223 268.4 2.4e-71
NP_001243324 (OMIM: 607079) ammonium transporter R ( 389) 1179 259.1 1.4e-68
NP_057208 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) polypep ( 417) 771 173.0 1.2e-42
NP_065231 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 417) 758 170.3 8.1e-42
XP_016857348 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 291) 756 169.7 8.3e-42
XP_011508101 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 400) 756 169.8 1.1e-41
XP_011540191 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 374) 754 169.4 1.3e-41
XP_011540190 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 377) 754 169.4 1.4e-41
XP_011540193 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 361) 735 165.4 2.1e-40
NP_001269799 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 463) 676 153.0 1.4e-36
NP_001317359 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh( ( 372) 652 147.8 4.1e-35
XP_005246014 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 396) 652 147.9 4.3e-35
XP_006710873 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 425) 652 147.9 4.5e-35
NP_001269798 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 396) 651 147.7 4.9e-35
XP_016857504 (OMIM: 111680) PREDICTED: blood group ( 425) 651 147.7 5.2e-35
NP_001269801 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 431) 651 147.7 5.2e-35
NP_001269800 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 493) 651 147.7 5.8e-35
NP_001121163 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 321) 636 144.4 3.8e-34
NP_001269797 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 378) 636 144.5 4.3e-34
NP_619524 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 354) 614 139.8 1e-32
XP_016857503 (OMIM: 111690,111700) PREDICTED: bloo ( 378) 614 139.8 1.1e-32
XP_011508102 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium tr ( 296) 572 130.9 4.1e-30
NP_001269796 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) poly ( 251) 537 123.4 6.1e-28
NP_619522 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 266) 246 62.0 2e-09
NP_619523 (OMIM: 111690,111700) blood group Rh(CE) ( 267) 170 46.0 0.00013
>>NP_000315 (OMIM: 180297,185000,268150) ammonium transp (409 aa)
initn: 2655 init1: 2655 opt: 2655 Z-score: 3035.9 bits: 570.7 E(85289): 2.3e-162
Smith-Waterman score: 2655; 99.5% identity (99.8% similar) in 409 aa overlap (1-409:1-409)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQSQGQKFNIGIKNMINADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_000 IFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGILQSQGQKFNIGIKNMINADF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIAEPGDKQCRAI
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FGLAVAGILYRSGLRKGHENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIAEPGDKQCRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMAIHPFGSMIIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMAIHPFGSMIIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAVAMGASNTSMAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAVAMGASNTSMAM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KE1 QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR
370 380 390 400
>>NP_001307970 (OMIM: 605381) ammonium transporter Rh ty (479 aa)
initn: 1500 init1: 997 opt: 1360 Z-score: 1557.7 bits: 297.4 E(85289): 5e-80
Smith-Waterman score: 1510; 50.7% identity (80.6% similar) in 434 aa overlap (1-407:7-440)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDM-GIFFELY
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NP_001 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQKFNI
: :::::::.:::::::::::..::::.::.:.:.::.:.::. ..:: .. : . . .
NP_001 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGA
:..:.::::: .:.: ..:::::::.:: :.::::......:: ::... ...:..: :.
NP_001 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA
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NP_001 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA
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NP_001 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAVA
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NP_001 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA
310 320 330 340 350 360
360 370 380
pF1KE1 MGA-----------------------SNTSMAMQAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPL
.. . :. .: .: ... :..::...::::.::.
NP_001 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF
370 380 390 400 410 420
390 400
pF1KE1 WGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR
::::::.::..:.:::..:.
NP_001 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
430 440 450 460 470
>>NP_057405 (OMIM: 605381) ammonium transporter Rh type (479 aa)
initn: 1500 init1: 997 opt: 1360 Z-score: 1557.7 bits: 297.4 E(85289): 5e-80
Smith-Waterman score: 1510; 50.7% identity (80.6% similar) in 434 aa overlap (1-407:7-440)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDM-GIFFELY
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NP_057 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQKFNI
: :::::::.:::::::::::..::::.::.:.:.::.:.::. ..:: .. : . . .
NP_057 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGA
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NP_057 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA
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NP_057 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA
::.: :: .::: ::::::::. :.:: ....:::.::::::::::::::::: :.:
NP_057 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAVA
. :.:..::: . :..:.::. .:::.. ..:.:.::::..::::.::..::..: :..:
NP_057 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA
310 320 330 340 350 360
360 370 380
pF1KE1 MGA-----------------------SNTSMAMQAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPL
.. . :. .: .: ... :..::...::::.::.
NP_057 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF
370 380 390 400 410 420
390 400
pF1KE1 WGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR
::::::.::..:.:::..:.
NP_057 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
430 440 450 460 470
>>XP_011513090 (OMIM: 180297,185000,268150) PREDICTED: a (217 aa)
initn: 1340 init1: 1340 opt: 1340 Z-score: 1539.5 bits: 292.9 E(85289): 5.2e-79
Smith-Waterman score: 1340; 99.1% identity (99.5% similar) in 213 aa overlap (1-213:1-213)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQSQGQKFNIGIKNMINADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
XP_011 IFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGILQSQGQKFNIGIKNMINADF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIAEPGDKQCRAI
:::::::::::::::::.:::::::::::::::
XP_011 FGLAVAGILYRSGLRKGHENEESAYYSDLFAMIDNQD
190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMAIHPFGSMIIG
>>XP_016857347 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium transp (414 aa)
initn: 1253 init1: 951 opt: 1296 Z-score: 1485.5 bits: 283.8 E(85289): 5.3e-76
Smith-Waterman score: 1297; 50.9% identity (79.5% similar) in 405 aa overlap (2-382:12-414)
10 20 30 40
pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDMGIFF
:. .::. . :. : :::..::.: .:: .. .. : .. .: ..:
XP_016 MAGSPSRAAGRRLQLPLLCLFLQGATAVLFAVFVRYNHKTDAALWHRSNHSN-ADNEFYF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 ELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQK
. :: :::::.:.::::::::.::..:::::::...:.::..:::.:.::: :.: .: .
XP_016 R-YPSFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGGH
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 FNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASD
...:...:::::: :..::::::::::::.:::.:.:..::.:.:. ::... ... . :
XP_016 IHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVRD
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 IGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNS
:.:::::.:::::::... .::: :.:... . :.:.:::::::::.:::.::::::.
XP_016 AGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 AIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCA
:.. : : :. .:::.:::: .: .::.:.:: . :.:.:::::::.:::::.::: .
XP_016 ALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 DMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIV
.: . :::.. : .:: ::.:::::.::.. .:....::::::::::.:::.:.: :..
XP_016 EMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
pF1KE1 A-------------------VAMGA-SNTSMAM-QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLP
. .: : : ::.:: : .: .. : ::: . ::.
XP_016 VAGLATHEAYGDGLESVFPLIAEGQRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLL
360 370 380 390 400 410
390 400
pF1KE1 LWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR
>>XP_016857346 (OMIM: 607079) PREDICTED: ammonium transp (428 aa)
initn: 1284 init1: 951 opt: 1296 Z-score: 1485.3 bits: 283.8 E(85289): 5.4e-76
Smith-Waterman score: 1307; 50.1% identity (77.8% similar) in 423 aa overlap (2-400:12-424)
10 20 30 40
pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDMGIFF
:. .::. . :. : :::..::.: .:: .. .. : .. .: ..:
XP_016 MAGSPSRAAGRRLQLPLLCLFLQGATAVLFAVFVRYNHKTDAALWHRSNHSN-ADNEFYF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 ELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQK
. :: :::::.:.::::::::.::..:::::::...:.::..:::.:.::: :.: .: .
XP_016 R-YPSFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGGH
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 FNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASD
...:...:::::: :..::::::::::::.:::.:.:..::.:.:. ::... ... . :
XP_016 IHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVRD
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 IGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNS
:.:::::.:::::::... .::: :.:... . :.:.:::::::::.:::.::::::.
XP_016 AGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 AIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCA
:.. : : :. .:::.:::: .: .::.:.:: . :.:.:::::::.:::::.::: .
XP_016 ALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 DMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIV
.: . :::.. : .:: ::.:::::.::.. .:....::::::::::.:::.:.: :..
XP_016 EMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
pF1KE1 A-------------------VAMGA-SNTSMAM-QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLP
. .: : : ::.:: : .: .. : ::: . :.:: :
XP_016 VAGLATHEAYGDGLESVFPLIAEGQRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGIILAL-
360 370 380 390 400 410
390 400
pF1KE1 LWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR
:.: : :
XP_016 -------QGCCDYSGKQD
420
>>NP_065140 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh type (458 aa)
initn: 1370 init1: 951 opt: 1296 Z-score: 1484.9 bits: 283.9 E(85289): 5.7e-76
Smith-Waterman score: 1392; 50.8% identity (79.7% similar) in 429 aa overlap (2-406:12-438)
10 20 30 40
pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDMGIFF
:. .::. . :. : :::..::.: .:: .. .. : .. .: ..:
NP_065 MAGSPSRAAGRRLQLPLLCLFLQGATAVLFAVFVRYNHKTDAALWHRSNHSN-ADNEFYF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 ELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQK
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NP_065 R-YPSFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGGH
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 FNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASD
...:...:::::: :..::::::::::::.:::.:.:..::.:.:. ::... ... . :
NP_065 IHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVRD
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 IGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNS
:.:::::.:::::::... .::: :.:... . :.:.:::::::::.:::.::::::.
NP_065 AGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 AIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCA
:.. : : :. .:::.:::: .: .::.:.:: . :.:.:::::::.:::::.::: .
NP_065 ALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 DMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIV
.: . :::.. : .:: ::.:::::.::.. .:....::::::::::.:::.:.: :..
NP_065 EMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
pF1KE1 A-------------------VAMGA-SNTSMAM-QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLP
. .: : : ::.:: : .: .. : ::: . ::.::::
NP_065 VAGLATHEAYGDGLESVFPLIAEGQRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLLLKLP
360 370 380 390 400 410
390 400
pF1KE1 LWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR
. .: :.. :.:.:.:.::
NP_065 FLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHEDKAQRPLRVEEADTQA
420 430 440 450
>>NP_001243325 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh ty (428 aa)
initn: 1312 init1: 951 opt: 1223 Z-score: 1402.0 bits: 268.4 E(85289): 2.4e-71
Smith-Waterman score: 1319; 53.3% identity (81.2% similar) in 377 aa overlap (52-406:32-408)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 LFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVG
: :::::.:.::::::::.::..:::::::
NP_001 NFTFATQKSLTLLPRLECNGAISAHCNLHLPGFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVG
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 INLLVAALGLQWGTIVQGTLQS-QGQKFNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQ
...:.::..:::.:.::: :.: .: ....:...:::::: :..::::::::::::.:::
NP_001 FTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGGHIHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQ
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 MLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGREN
.:.:..::.:.:. ::... ... . : :.:::::.:::::::... .::: :.:...
NP_001 LLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVRDAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHR
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 EESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSL
. :.:.:::::::::.:::.::::::.:.. : : :. .:::.:::: .: .::.:.:
NP_001 QGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFNAALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSAL
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 VEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTT
: . :.:.:::::::.:::::.::: ..: . :::.. : .:: ::.:::::.::.. .
NP_001 VGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTSSEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILES
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360
pF1KE1 KLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVA-------------------VAMGA-SNTSMAM
:....::::::::::.:::.:.: :... .: : : ::.::
NP_001 KFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGVLVAGLATHEAYGDGLESVFPLIAEGQRSATSQAM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KE1 -QAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR
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NP_001 HQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLLLKLPFLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHEDKAQRPLRV
370 380 390 400 410 420
NP_001 EEADTQA
>>NP_001243324 (OMIM: 607079) ammonium transporter Rh ty (389 aa)
initn: 1268 init1: 951 opt: 1179 Z-score: 1352.4 bits: 259.1 E(85289): 1.4e-68
Smith-Waterman score: 1275; 52.8% identity (81.0% similar) in 369 aa overlap (60-406:1-369)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 QTVLEQLNITKPTDMGIFFELYPLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAAL
:.::::::::.::..:::::::...:.::.
NP_001 MVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAF
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 GLQWGTIVQGTLQS-QGQKFNIGIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILE
.:::.:.::: :.: .: ....:...:::::: :..::::::::::::.:::.:.:..::
NP_001 ALQWSTLVQGFLHSFHGGHIHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLE
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 IVFFAHNEYLVSEIFKASDIGASMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGRENEESAYYSD
.:.:. ::... ... . : :.:::::.:::::::... .::: :.:... . :.:.::
NP_001 VVLFGINEFVLLHLLGVRDAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSD
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 LFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIAEPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLN
:::::::.:::.::::::.:.. : : :. .:::.:::: .: .::.:.:: . :.:.
NP_001 LFAMIGTIFLWIFWPSFNAALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLD
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 MVHIQNATLAGGVAVGTCADMAIHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTC
:::::::.:::::.::: ..: . :::.. : .:: ::.:::::.::.. .:....:::
NP_001 MVHIQNAALAGGVVVGTSSEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTC
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360
pF1KE1 GVHNLHGLPGVVGGLAGIVA-------------------VAMGA-SNTSMAM-QAAALGS
:::::::.:::.:.: :... .: : : ::.:: : .:
NP_001 GVHNLHGMPGVLGALLGVLVAGLATHEAYGDGLESVFPLIAEGQRSATSQAMHQLFGLFV
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400
pF1KE1 SIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR
.. : ::: . ::.::::. .: :.. :.:.:.:.::
NP_001 TLMFASVGGGLGGLLLKLPFLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHEDKAQRPLRVEEADTQA
340 350 360 370 380
>>NP_057208 (OMIM: 111680) blood group Rh(D) polypeptide (417 aa)
initn: 813 init1: 511 opt: 771 Z-score: 886.5 bits: 173.0 E(85289): 1.2e-42
Smith-Waterman score: 822; 36.5% identity (70.4% similar) in 416 aa overlap (1-406:9-411)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEYETDQTVLEQLNITKPTDMGIFFELYP
.: .:: :..:: :.:.:: .:..: : .. .: ... ..:
NP_057 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHY--DASLEDQKGLVASYQVG-------
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGTL-QSQGQKFNIG
::. :: .:.::: . ......:::..::.. :::.::. ...: : : . : :
NP_057 --QDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKVVIT
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 IKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGAS
. .. : .:: .:::: :::::.. .:...:...:.. ... ....:.::...
NP_057 LFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYHMNM
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 MTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGREN-EESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA
: :..:.:::::.:: : . : .: :. ...: .: ::.:.:::::::::::::.
NP_057 MHIYVFAAYFGLSVAWCLPKP-LPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSALL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA
. .. :. :::...:. :.::.. :::.. .::.. .....:.::::::::: .
NP_057 RSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCHLI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE1 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRI-HDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAV
:. .:..: .::..:: : :.: . : : :.. .:. .: :..: . :: .
NP_057 PSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPGCCNRVLGIPHSSIMGYNF-SLLGLLGEIIYIVLL
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 AM---GASNTSMAMQA----AALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPLWGQPSDQNCYDDSVY
.. ::.: ...:. . :. .: :...::.:::.:.: .: : . . .::.:.
NP_057 VLDTVGAGNGMIGFQVLLSIGELSLAIVIALTSGLLTGLLLNLKIWKAPHEAKYFDDQVF
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 WKVPKTR
:: :
NP_057 WKFPHLAVGF
410
409 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 23:01:17 2016 done: Sun Nov 6 23:01:18 2016
Total Scan time: 7.780 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]