Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1413
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1413, 500 aa
1>>>pF1KE1413 500 - 500 aa - 500 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1428+/-0.00121; mu= 5.7325+/- 0.073
mean_var=156.4796+/-30.948, 0's: 0 Z-trim(107.1): 50 B-trim: 6 in 1/52
Lambda= 0.102529
statistics sampled from 9354 (9398) to 9354 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 3.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 3178 482.3 5.3e-136
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 613 102.9 8.5e-22
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 551 93.7 4.4e-19
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 510 87.6 2.9e-17
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 437 76.8 5.1e-14
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 420 74.3 2.8e-13
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 405 72.1 1.4e-12
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 401 71.5 2.1e-12
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 394 70.4 4e-12
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 390 69.9 6.1e-12
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 390 69.9 6.3e-12
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 390 69.9 6.3e-12
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 388 69.6 7.3e-12
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 383 68.8 1.3e-11
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 382 68.7 1.4e-11
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 376 67.8 2.7e-11
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 368 66.6 5.5e-11
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 367 66.5 6.6e-11
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 365 66.2 8.5e-11
>>CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 (500 aa)
initn: 3178 init1: 3178 opt: 3178 Z-score: 2555.2 bits: 482.3 E(32554): 5.3e-136
Smith-Waterman score: 3178; 99.8% identity (100.0% similar) in 500 aa overlap (1-500:1-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASRLTLLTLLLLLLAGDRASSNPNATSSSSQDPESLQDRGEGKVATTVISKMLFVEPIL
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CCDS79 MASRLTLLTLLLLLLAGDRASSNPNATSSSSQDPESLQDRGEGKVATTVISKMLFVEPIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EVSSLPTTNSTTNSATKITANTTDEPTTQPTTEPTTQPTIQPTQPTTQLPTDSPTQPTTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 EVSSLPTTNSTTNSATKITANTTDEPTTQPTTEPTTQPTIQPTQPTTQLPTDSPTQPTTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SFCPGPVTLCSDLESHSTEAVLGDALVDFSLKLYHAFSAMKKVETNMAFSPFSIASLLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 SFCPGPVTLCSDLESHSTEAVLGDALVDFSLKLYHAFSAMKKVETNMAFSPFSIASLLTQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VLLGAGENTKTNLESILSYPKDFTCVHQALKGFTTKGVTSVSQIFHSPDLAIRDTFVNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 VLLGAGENTKTNLESILSYPKDFTCVHQALKGFTTKGVTSVSQIFHSPDLAIRDTFVNAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RTLYSSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKNTNNKISRLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 RTLYSSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKNTNNKISRLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TTFDPKKTRMEPFHFKNSVIKVPMMNSKKYPVAHFIDQTLKAKVGQLQLSHNLSLVILVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 TTFDPKKTRMEPFHFKNSVIKVPMMNSKKYPVAHFIDQTLKAKVGQLQLSHNLSLVILVP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 QNLKHRLEDMEQALSPSVFKAIMEKLEMSKFQPTLLTLPRIKVTTSQDMLSIMEKLEFFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS79 QNLKHRLEDMEQALSPSVFKAIMEKLEMSKFQPTLLTLPRIKVTTSQDMLSIMEKLEFFD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 FSYDLNLCGLTEDPDLQVSAMQHQTVLELTETGVEAAAASAISVARTLLVFEVQQPFLFM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS79 FSYDLNLCGLTEDPDLQVSAMQHQTVLELTETGVEAAAASAISVARTLLVFEVQQPFLFV
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE1 LWDQQHKFPVFMGRVYDPRA
::::::::::::::::::::
CCDS79 LWDQQHKFPVFMGRVYDPRA
490 500
>>CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 (491 aa)
initn: 483 init1: 172 opt: 613 Z-score: 504.8 bits: 102.9 E(32554): 8.5e-22
Smith-Waterman score: 613; 28.5% identity (65.6% similar) in 410 aa overlap (95-498:36-436)
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LPTTNSTTNSATKITANTTDEPTTQPTTEPTTQPTIQPTQPTTQLPTDSPTQPTTGSFCP
:. :. . ..: : : . .: .
CCDS11 GLLVLSWSCLQGPCSVFSPVSAMEPLGRQLTSGPNQEQVSPLTLLKLGNQ-EPGGQTALK
10 20 30 40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GPVTLCSDLESHSTEAVLGDALVDFSLKLYHAFSAMKKVETNMAFSPFSIASLLTQVLLG
.: .:: . :. :.. :. :. .. :. .. :. .::.:.: :... ::
CCDS11 SPPGVCSRDPTPEQTHRLARAMMAFTADLF-SLVAQTSTCPNLILSPLSVALALSHLALG
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AGENTKTNLESILSYPKDFTCVHQAL----KGFTTKGVTSVSQIFHSPDLAIRDTFVNAS
: ..: :...: . . :. . : . . . ..... . . :.. :.. :
CCDS11 AQNHTLQRLQQVL-HAGSGPCLPHLLSRLCQDLGPGAFRLAARMYLQKGFPIKEDFLEQS
130 140 150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RTLYSSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKNTNNKISRLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWK
. :....: :..... .: :: :: . :..::...:..:: :: :.:::::.... :.
CCDS11 EQLFGAKPVSLTGKQEDDLANINQWVKEATEGKIQEFLSGLPEDTVLLLLNAIHFQGFWR
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350
pF1KE1 TTFDPKKTRMEPFHFKNS-VIKVPMMNSKKYPVAHFIDQTLKAKVGQLQLSHNLSLVILV
. :::. :. . ::. .. .. : ::... ::. :. . . .:... ...:.:.:.::
CCDS11 NKFDPSLTQRDSFHLDEQFTVPVEMMQARTYPLRWFLLEQPEIQVAHFPFKNNMSFVVLV
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PQNLKHRLEDMEQALSPSVFKAIMEKLEMSKFQPTLLTLPRIKVTTSQDMLSIMEKLEFF
: : .. :.:. . .. : . :: . ::.. . ..:... . .: .
CCDS11 PT---HFEWNVSQVLANLSWDTLHPPLVWER--PTKVRLPKLYLKHQMDLVATLSQLGLQ
310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 DFSYDLNLCGLTEDPDLQVSAMQHQTVLELTETGVEAAAASAISVAR-TLLVFEVQQPFL
.. .: :..:. .: ::..:::..:::.:.:::::::..:...: .: : :..:::
CCDS11 ELFQAPDLRGISEQ-SLVVSGVQHQSTLELSEVGVEAAAATSIAMSRMSLSSFSVNRPFL
360 370 380 390 400 410
480 490 500
pF1KE1 FMLWDQQHKFPVFMGRVYDPRA
:..... .:.:.: : .:
CCDS11 FFIFEDTTGLPLFVGSVRNPNPSAPRELKEQQDSPGNKDFLQSLKGFPRGDKLFGPDLKL
420 430 440 450 460 470
>>CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 (427 aa)
initn: 471 init1: 172 opt: 551 Z-score: 456.2 bits: 93.7 E(32554): 4.4e-19
Smith-Waterman score: 551; 30.1% identity (68.7% similar) in 335 aa overlap (170-498:45-372)
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 AVLGDALVDFSLKLYHAFSAMKKVETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGENTKTNLESILSY
::... .: .:: :: ..: :...: .
CCDS54 LQGPCSVFSPVSAMEPLGRQLTSGPNQEQVSPLTLLKLGNQVQPGAQNHTLQRLQQVL-H
20 30 40 50 60 70
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 PKDFTCVHQAL----KGFTTKGVTSVSQIFHSPDLAIRDTFVNASRTLYSSSPRVLSNNS
. :. . : . . . ..... . . :.. :.. :. :....: :....
CCDS54 AGSGPCLPHLLSRLCQDLGPGAFRLAARMYLQKGFPIKEDFLEQSEQLFGAKPVSLTGKQ
80 90 100 110 120 130
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 DANLELINTWVAKNTNNKISRLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDPKKTRMEPFHF
. .: :: :: . :..::...:..:: :: :.:::::.... :.. :::. :. . ::.
CCDS54 EDDLANINQWVKEATEGKIQEFLSGLPEDTVLLLLNAIHFQGFWRNKFDPSLTQRDSFHL
140 150 160 170 180 190
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 KNS-VIKVPMMNSKKYPVAHFIDQTLKAKVGQLQLSHNLSLVILVPQNLKHRLEDMEQAL
.. .. : ::... ::. :. . . .:... ...:.:.:.::: : .. :.:
CCDS54 DEQFTVPVEMMQARTYPLRWFLLEQPEIQVAHFPFKNNMSFVVLVP---THFEWNVSQVL
200 210 220 230 240 250
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 SPSVFKAIMEKLEMSKFQPTLLTLPRIKVTTSQDMLSIMEKLEFFDFSYDLNLCGLTEDP
. . .. : . :: . ::.. . ..:... . .: . .. .: :..:.
CCDS54 ANLSWDTLHPPLVWER--PTKVRLPKLYLKHQMDLVATLSQLGLQELFQAPDLRGISEQ-
260 270 280 290 300
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 DLQVSAMQHQTVLELTETGVEAAAASAISVAR-TLLVFEVQQPFLFMLWDQQHKFPVFMG
.: ::..:::..:::.:.:::::::..:...: .: : :..::::..... .:.:.:
CCDS54 SLVVSGVQHQSTLELSEVGVEAAAATSIAMSRMSLSSFSVNRPFLFFIFEDTTGLPLFVG
310 320 330 340 350 360
500
pF1KE1 RVYDPRA
: .:
CCDS54 SVRNPNPSAPRELKEQQDSPGNKDFLQSLKGFPRGDKLFGPDLKLVPPMEEDYPQFGSPK
370 380 390 400 410 420
>>CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 (418 aa)
initn: 416 init1: 194 opt: 510 Z-score: 423.5 bits: 87.6 E(32554): 2.9e-17
Smith-Waterman score: 510; 25.2% identity (63.6% similar) in 404 aa overlap (106-499:18-416)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 TKITANTTDEPTTQPTTEPTTQPTIQPTQPTTQLPTDSPTQPTTGSFCPGPVTLCSDLES
. : :.. : . . : .. :
CCDS11 MQALVLLLCIGALLGHSSCQNPASPPEEGSPDPDSTGALVEEEDPFF
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 HSTEAVLGDALVDFSLKLYHAFSAMKKVETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGENTKTNLES
. :. :. .:. ::.. :. . . ::. .::.:.:. :. . ::: . :.. ..
CCDS11 KVPVNKLAAAVSNFGYDLYRVRSSTSPT-TNVLLSPLSVATALSALSLGAEQRTESIIHR
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240
pF1KE1 ILSYP----KDFTCVHQALKGFTT---KGVTSVSQIFHSPDLAIRDTFVNASRTLYSSSP
: : :. ... : .: :.. :.:.: : :...:: . :.. :
CCDS11 ALYYDLISSPDIHGTYKELLDTVTAPQKNLKSASRIVFEKKLRIKSSFVAPLEKSYGTRP
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RVLSNNSDANLELINTWVAKNTNNKISRLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDPKKT
:::..: .:. ::.:: . ..:..: .:.. ..::.. .....: : :: .::
CCDS11 RVLTGNPRLDLQEINNWVQAQMKGKLARSTKEIPDEISILLLGVAHFKGQWVTKFDSRKT
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RMEPFHF-KNSVIKVPMMNSKKYPVAHFIDQTLKAKVGQLQLSHNLSLVILVPQNLKHRL
.: :.. .. ...::::.. : . . .:. :. :..:: :. ..:.....: .. . :
CCDS11 SLEDFYLDEERTVRVPMMSDPKAVLRYGLDSDLSCKIAQLPLTGSMSIIFFLPLKVTQNL
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 EDMEQALSPSVFKAIMEKLEMSKFQPTLLTLPRIKVTTSQDMLSIMEKLEFFDFSYDLNL
.:..:. : : ... :.. : ..::.:..:.. .. . ...... .. . ..
CCDS11 TLIEESLT-SEFIHDIDR-ELKTVQ-AVLTVPKLKLSYEGEVTKSLQEMKLQSLFDSPDF
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 CGLTEDPDLQVSAMQHQTVLELTETGVEAAAASAISVARTL--LVFEVQQPFLFMLWDQQ
.: : .... ..:.. .: .: :. .. . ... :. : ....:::.:.: : .
CCDS11 SKITGKP-IKLTQVEHRAGFEWNEDGAGTTPSPGLQPAHLTFPLDYHLNQPFIFVLRDTD
350 360 370 380 390 400
490 500
pF1KE1 HKFPVFMGRVYDPRA
.:.:.. :::
CCDS11 TGALLFIGKILDPRGP
410
>>CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 (423 aa)
initn: 345 init1: 155 opt: 437 Z-score: 365.1 bits: 76.8 E(32554): 5.1e-14
Smith-Waterman score: 500; 28.4% identity (63.8% similar) in 412 aa overlap (122-499:17-421)
100 110 120 130 140
pF1KE1 TEPTTQPTIQPTQPTTQLPTDSPTQPTTGSFCPG-------PV---TLCSDLESHSTEAV
:::. :. .: .. ....:..
CCDS32 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVD
10 20 30 40
150 160 170 180 190
pF1KE1 LG--DALVDFSLKLYHAFSAMKKVETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGENTKTNLESILSY
:: .: :::...::. . ..: . :. :::.::.. :. . ::: ..: :.. . :..
CCDS32 LGLASANVDFAFSLYKQL-VLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKF
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240
pF1KE1 PKDFTC---VHQALKGFTTKGVTSVSQI--------FHSPDLAIRDTFVNASRTLYSSSP
: .::... . : ... : . .:.. : :.. .. ::.:
CCDS32 NLTETSEAEIHQSFQHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEA
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RVLS-NNSDANLELINTWVAKNTNNKISRLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDPKK
. . ..: : .::: .: ..: .::. :. .: :.: .::.: :...:::. :::.
CCDS32 FATDFQDSAAAKKLINDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQD
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TRMEPFHF-KNSVIKVPMMNSKKYPVAHFIDQTLKAKVGQLQLSHNLSLVILVPQNLKHR
:.. :.. :.. . ::::. .. . .: :. :. : .:. . : : ....:. . .
CCDS32 THQSRFYLSKKKWVMVPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPD--QDK
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LEDMEQALSPSVFKAIMEKLEMSKFQPTLLTLPRIKVTTSQDMLSIMEKLEFFD-FSYDL
.:..: : : ..: ..::. .. : ::..... . .. .:. .: . . :.
CCDS32 MEEVEAMLLPETLKRWRDSLEFREIGE--LYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKA
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470
pF1KE1 NLCGLTEDPDLQVSAMQHQTVLELTETGVEAAAASAISVA------RTLLVFEVQQPFLF
.: :.: .: :: . :..::.. : :.::.::.:.... .: . . ..:::.
CCDS32 DLSGITGARNLAVSQVVHKAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLM
350 360 370 380 390 400
480 490 500
pF1KE1 MLW--DQQHKFPVFMGRVYDPRA
.. : :. : ::..: .:.
CCDS32 IIVPTDTQNIF--FMSKVTNPKQA
410 420
>>CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 (406 aa)
initn: 310 init1: 146 opt: 420 Z-score: 351.8 bits: 74.3 E(32554): 2.8e-13
Smith-Waterman score: 455; 29.3% identity (64.5% similar) in 386 aa overlap (136-498:35-406)
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 TTQLPTDSPTQPTTGSFCPGPVTLCSDLESHSTEAVLGDALVDFSLKLYHAFSAMKKVET
: .: .. ::.. ::.:... ..
CCDS99 LLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVEDLHVGATVAPSSRRDFTFDLYRALASAAPSQS
10 20 30 40 50 60
170 180 190 200 210
pF1KE1 NMAFSPFSIASLLTQVLLGAGENTKTN-LESI-LSYPKD--------FTCVHQALKGFTT
. ::: ::. :... :::: .:: . ::.. :. :. : . : :.
CCDS99 -IFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHRGFQQLLQELNQPRD
70 80 90 100 110 120
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 KGVTSVSQIFHSPDLAI--RDTFVNASRTLY--SSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKNTN
:... . . ::.. .::::.: .::: .. : . ... : .. :: .:::.:.
CCDS99 GFQLSLGNALFT-DLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGA-MKQINDYVAKQTK
130 140 150 160 170 180
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 NKISRLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWKTTFDPKKTRMEPFHFKN-SVIKVPMMNSKKY
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CCDS99 GKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSETVVRVPMM-SRED
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CCDS99 DESGTRAAAATGTIFTFRSARLNSQRLVFN--RPFLMFIVDNN---ILFLGKVNRP
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CCDS99 LTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIPPEVKFNKPFVFLMIEQNTKSPLFMGKVVNPTQK
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CCDS99 TAYSMPPVIKVDRPFHFMIYEETSGMLLFLGRVVNPTLL
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 21:16:51 2016 done: Sun Nov 6 21:16:51 2016
Total Scan time: 3.520 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]