Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1395
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1395, 360 aa
1>>>pF1KE1395 360 - 360 aa - 360 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3570+/-0.000385; mu= 16.5964+/- 0.024
mean_var=75.6505+/-15.278, 0's: 0 Z-trim(113.2): 65 B-trim: 88 in 1/50
Lambda= 0.147458
statistics sampled from 22373 (22450) to 22373 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 7.440
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003382 (OMIM: 147870) protein Wnt-2 precursor [ ( 360) 2591 560.7 1.8e-159
NP_078613 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform WN ( 391) 1850 403.1 5.5e-112
NP_004176 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform WN ( 372) 1785 389.2 7.6e-108
NP_001278809 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform ( 299) 1630 356.2 5.4e-98
XP_011532388 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1214 267.8 2.8e-71
XP_011532387 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1214 267.8 2.8e-71
XP_016862617 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1214 267.8 2.8e-71
XP_011532390 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1214 267.8 2.8e-71
XP_011532389 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1214 267.8 2.8e-71
XP_011532391 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1214 267.8 2.8e-71
NP_001243034 (OMIM: 164975,180700) protein Wnt-5a ( 365) 1214 267.8 2.8e-71
XP_006713387 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 365) 1214 267.8 2.8e-71
NP_003383 (OMIM: 164975,180700) protein Wnt-5a iso ( 380) 1214 267.8 2.9e-71
XP_016862616 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: prot ( 394) 1214 267.8 2.9e-71
NP_116031 (OMIM: 606361) protein Wnt-5b precursor ( 359) 1192 263.1 7e-70
NP_110402 (OMIM: 606361) protein Wnt-5b precursor ( 359) 1192 263.1 7e-70
NP_110388 (OMIM: 158330,603490,611812) protein Wnt ( 351) 1175 259.5 8.4e-69
XP_011539899 (OMIM: 158330,603490,611812) PREDICTE ( 373) 1161 256.5 7e-68
NP_478679 (OMIM: 601967) protein Wnt-7b precursor ( 349) 1144 252.9 8.1e-67
XP_011528668 (OMIM: 601967) PREDICTED: protein Wnt ( 353) 1144 252.9 8.2e-67
NP_110380 (OMIM: 165330,273395) proto-oncogene Wnt ( 355) 1142 252.4 1.1e-66
XP_011542621 (OMIM: 606359) PREDICTED: protein Wnt ( 446) 1129 249.7 9e-66
NP_149122 (OMIM: 606359) protein Wnt-3a precursor ( 352) 1124 248.6 1.6e-65
XP_011539900 (OMIM: 158330,603490,611812) PREDICTE ( 296) 1119 247.5 2.8e-65
NP_004616 (OMIM: 228930,276820,601570) protein Wnt ( 349) 1105 244.6 2.6e-64
XP_011532393 (OMIM: 228930,276820,601570) PREDICTE ( 282) 1008 223.9 3.5e-58
XP_005274288 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 354) 889 198.6 1.8e-50
NP_004617 (OMIM: 603699) protein Wnt-11 precursor ( 354) 889 198.6 1.8e-50
NP_476509 (OMIM: 606267) protein Wnt-16 isoform 1 ( 365) 875 195.7 1.4e-49
NP_057171 (OMIM: 606267) protein Wnt-16 isoform 2 ( 355) 871 194.8 2.5e-49
XP_016873730 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 251) 772 173.6 4.2e-43
XP_011543543 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 251) 772 173.6 4.2e-43
XP_011543541 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 364) 765 172.3 1.6e-42
XP_011543542 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 364) 765 172.3 1.6e-42
XP_011543540 (OMIM: 603699) PREDICTED: protein Wnt ( 364) 765 172.3 1.6e-42
NP_490645 (OMIM: 606360) protein Wnt-8a isoform 3 ( 351) 751 169.3 1.2e-41
NP_001287868 (OMIM: 606360) protein Wnt-8a isoform ( 369) 751 169.3 1.3e-41
NP_001287867 (OMIM: 606360) protein Wnt-8a isoform ( 386) 751 169.3 1.3e-41
XP_016865314 (OMIM: 606360) PREDICTED: protein Wnt ( 391) 751 169.3 1.3e-41
XP_016865313 (OMIM: 606360) PREDICTED: protein Wnt ( 408) 751 169.3 1.4e-41
XP_011541927 (OMIM: 606360) PREDICTED: protein Wnt ( 337) 739 166.7 6.8e-41
NP_003384 (OMIM: 601396) protein Wnt-8b precursor ( 351) 739 166.7 7.1e-41
NP_003386 (OMIM: 602863) protein Wnt-9a precursor ( 365) 738 166.5 8.4e-41
NP_005421 (OMIM: 164820,615220,615221) proto-oncog ( 370) 733 165.4 1.8e-40
XP_011542573 (OMIM: 602863) PREDICTED: protein Wnt ( 295) 722 163.0 7.5e-40
NP_006513 (OMIM: 604663) protein Wnt-6 precursor [ ( 365) 709 160.3 6.1e-39
XP_016875408 (OMIM: 225300,601906,617073) PREDICTE ( 267) 672 152.4 1.1e-36
XP_011537024 (OMIM: 225300,601906,617073) PREDICTE ( 267) 672 152.4 1.1e-36
NP_003385 (OMIM: 225300,601906,617073) protein Wnt ( 389) 672 152.5 1.5e-36
NP_003387 (OMIM: 602864) protein Wnt-9b isoform 1 ( 357) 642 146.1 1.2e-34
>>NP_003382 (OMIM: 147870) protein Wnt-2 precursor [Homo (360 aa)
initn: 2591 init1: 2591 opt: 2591 Z-score: 2984.0 bits: 560.7 E(85289): 1.8e-159
Smith-Waterman score: 2591; 100.0% identity (100.0% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNAPLGGIWLWLPLLLTWLTPEVNSSWWYMRATGGSSRVMCDNVPGLVSSQRQLCHRHPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MNAPLGGIWLWLPLLLTWLTPEVNSSWWYMRATGGSSRVMCDNVPGLVSSQRQLCHRHPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VMRAISQGVAEWTAECQHQFRQHRWNCNTLDRDHSLFGRVLLRSSRESAFVYAISSAGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VMRAISQGVAEWTAECQHQFRQHRWNCNTLDRDHSLFGRVLLRSSRESAFVYAISSAGVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FAITRACSQGEVKSCSCDPKKMGSAKDSKGIFDWGGCSDNIDYGIKFARAFVDAKERKGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 FAITRACSQGEVKSCSCDPKKMGSAKDSKGIFDWGGCSDNIDYGIKFARAFVDAKERKGK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DARALMNLHNNRAGRKAVKRFLKQECKCHGVSGSCTLRTCWLAMADFRKTGDYLWRKYNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DARALMNLHNNRAGRKAVKRFLKQECKCHGVSGSCTLRTCWLAMADFRKTGDYLWRKYNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 AIQVVMNQDGTGFTVANERFKKPTKNDLVYFENSPDYCIRDREAGSLGTAGRVCNLTSRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AIQVVMNQDGTGFTVANERFKKPTKNDLVYFENSPDYCIRDREAGSLGTAGRVCNLTSRG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 MDSCEVMCCGRGYDTSHVTRMTKCGCKFHWCCAVRCQDCLEALDVHTCKAPKNADWTTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MDSCEVMCCGRGYDTSHVTRMTKCGCKFHWCCAVRCQDCLEALDVHTCKAPKNADWTTAT
310 320 330 340 350 360
>>NP_078613 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform WNT-2B (391 aa)
initn: 1881 init1: 1780 opt: 1850 Z-score: 2131.6 bits: 403.1 E(85289): 5.5e-112
Smith-Waterman score: 1850; 68.5% identity (87.5% similar) in 359 aa overlap (2-360:36-391)
10 20 30
pF1KE1 MNAPLGGIWLWLPLLLTWLTPEVNSSWWYMR
.: :: : : :::: : .:..::::.
NP_078 GAEEAAQLPLRRASAPVPVPSPAAPDGSRASARLGLACLLLLLLLT-LPARVDTSWWYIG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 ATGGSSRVMCDNVPGLVSSQRQLCHRHPDVMRAISQGVAEWTAECQHQFRQHRWNCNTLD
: : .::.:::.::::: :::::.:.::.::....:. :: :::::::.:::::.:::
NP_078 ALG--ARVICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMRSVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLD
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 RDHSLFGRVLLRSSRESAFVYAISSAGVVFAITRACSQGEVKSCSCDPKKMGSAKDSKGI
:::..::::.::::::.:::::::::::: ::::::::::.. ::::: : .:..:
NP_078 RDHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAITRACSQGELSVCSCDPYTRGRHHDQRGD
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 FDWGGCSDNIDYGIKFARAFVDAKERKGKDARALMNLHNNRAGRKAVKRFLKQECKCHGV
:::::::::: ::..::.:::::::.. ::::::::::::: :: ::.:::: :::::::
NP_078 FDWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKEKRLKDARALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 SGSCTLRTCWLAMADFRKTGDYLWRKYNGAIQVVMNQDGTGFTVANERFKKPTKNDLVYF
:::::::::: :..:::.::::: :.:.::.::. .:::..::.: . ... :..:::::
NP_078 SGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRRYDGAVQVMATQDGANFTAARQGYRRATRTDLVYF
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 ENSPDYCIRDREAGSLGTAGRVCNLTSRGMDSCEVMCCGRGYDTSHVTRMTKCGCKFHWC
.::::::. :. :::::::::::. ::.: :.::.:::::::::..:::.:.: ::::::
NP_078 DNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKTSKGTDGCEIMCCGRGYDTTRVTRVTQCECKFHWC
310 320 330 340 350 360
340 350 360
pF1KE1 CAVRCQDCLEALDVHTCKAPKNADWTTAT
:::::..: ...:::::::::.:.: :
NP_078 CAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWLDQT
370 380 390
>>NP_004176 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform WNT-2B (372 aa)
initn: 1817 init1: 1779 opt: 1785 Z-score: 2057.1 bits: 389.2 E(85289): 7.6e-108
Smith-Waterman score: 1785; 69.9% identity (89.2% similar) in 332 aa overlap (29-360:43-372)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MNAPLGGIWLWLPLLLTWLTPEVNSSWWYMRATGGSSRVMCDNVPGLVSSQRQLCHRH
:. : : .::.:::.::::: :::::.:.
NP_004 FGIQLKTEGSLRTAVPGIPTQSAFNKCLQRYIGALG--ARVICDNIPGLVSRQRQLCQRY
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PDVMRAISQGVAEWTAECQHQFRQHRWNCNTLDRDHSLFGRVLLRSSRESAFVYAISSAG
::.::....:. :: :::::::.:::::.::::::..::::.::::::.::::::::::
NP_004 PDIMRSVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLDRDHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAG
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 VVFAITRACSQGEVKSCSCDPKKMGSAKDSKGIFDWGGCSDNIDYGIKFARAFVDAKERK
:: ::::::::::.. ::::: : .:..: :::::::::: ::..::.:::::::..
NP_004 VVHAITRACSQGELSVCSCDPYTRGRHHDQRGDFDWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKEKR
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 GKDARALMNLHNNRAGRKAVKRFLKQECKCHGVSGSCTLRTCWLAMADFRKTGDYLWRKY
::::::::::::: :: ::.:::: ::::::::::::::::: :..:::.::::: :.:
NP_004 LKDARALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRRY
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NGAIQVVMNQDGTGFTVANERFKKPTKNDLVYFENSPDYCIRDREAGSLGTAGRVCNLTS
.::.::. .:::..::.: . ... :..:::::.::::::. :. :::::::::::. ::
NP_004 DGAVQVMATQDGANFTAARQGYRRATRTDLVYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKTS
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 RGMDSCEVMCCGRGYDTSHVTRMTKCGCKFHWCCAVRCQDCLEALDVHTCKAPKNADWTT
.: :.::.:::::::::..:::.:.: :::::::::::..: ...:::::::::.:.:
NP_004 KGTDGCEIMCCGRGYDTTRVTRVTQCECKFHWCCAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWLD
320 330 340 350 360 370
360
pF1KE1 AT
:
NP_004 QT
>>NP_001278809 (OMIM: 601968) protein Wnt-2b isoform 3 [ (299 aa)
initn: 1668 init1: 1630 opt: 1630 Z-score: 1880.3 bits: 356.2 E(85289): 5.4e-98
Smith-Waterman score: 1630; 70.6% identity (89.6% similar) in 299 aa overlap (62-360:1-299)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 ATGGSSRVMCDNVPGLVSSQRQLCHRHPDVMRAISQGVAEWTAECQHQFRQHRWNCNTLD
::....:. :: :::::::.:::::.:::
NP_001 MRSVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLD
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 RDHSLFGRVLLRSSRESAFVYAISSAGVVFAITRACSQGEVKSCSCDPKKMGSAKDSKGI
:::..::::.::::::.:::::::::::: ::::::::::.. ::::: : .:..:
NP_001 RDHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAITRACSQGELSVCSCDPYTRGRHHDQRGD
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 FDWGGCSDNIDYGIKFARAFVDAKERKGKDARALMNLHNNRAGRKAVKRFLKQECKCHGV
:::::::::: ::..::.:::::::.. ::::::::::::: :: ::.:::: :::::::
NP_001 FDWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKEKRLKDARALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGV
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 SGSCTLRTCWLAMADFRKTGDYLWRKYNGAIQVVMNQDGTGFTVANERFKKPTKNDLVYF
:::::::::: :..:::.::::: :.:.::.::. .:::..::.: . ... :..:::::
NP_001 SGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRRYDGAVQVMATQDGANFTAARQGYRRATRTDLVYF
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 ENSPDYCIRDREAGSLGTAGRVCNLTSRGMDSCEVMCCGRGYDTSHVTRMTKCGCKFHWC
.::::::. :. :::::::::::. ::.: :.::.:::::::::..:::.:.: ::::::
NP_001 DNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKTSKGTDGCEIMCCGRGYDTTRVTRVTQCECKFHWC
220 230 240 250 260 270
340 350 360
pF1KE1 CAVRCQDCLEALDVHTCKAPKNADWTTAT
:::::..: ...:::::::::.:.: :
NP_001 CAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWLDQT
280 290
>>XP_011532388 (OMIM: 164975,180700) PREDICTED: protein (365 aa)
initn: 1064 init1: 453 opt: 1214 Z-score: 1400.8 bits: 267.8 E(85289): 2.8e-71
Smith-Waterman score: 1215; 49.6% identity (74.8% similar) in 341 aa overlap (25-349:29-365)
10 20 30 40
pF1KE1 MNAPLGGIWLWLPLLLTWLTPEVNSSWWYMRATGG---------SSRVMCDNVPGL
.::: . .. ... .:... ::
XP_011 MAGSAMSSKFFLVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEVYIIGAQPLCSQLAGL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 VSSQRQLCHRHPDVMRAISQGVAEWTAECQHQFRQHRWNCNTLDRDHSLFGRVLLRSSRE
..:..::: . : :. :..:. :::.:::..::::.:.: . :.::::. .:::
XP_011 SQGQKKLCHLYQDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVD-NTSVFGRVMQIGSRE
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 SAFVYAISSAGVVFAITRACSQGEVKSCSCDPKKMGSAKDSKGIFDWGGCSDNIDYGIKF
.::.::.:.:::: :..::: .::...:.:. . . :: . ::::.:::::: .:
XP_011 TAFTYAVSAAGVVNAMSRACREGELSTCGCS--RAARPKDLPRDWLWGGCGDNIDYGYRF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 ARAFVDAKER-----KG--KDARALMNLHNNRAGRKAVKRFLKQECKCHGVSGSCTLRTC
:. ::::.:: :: ..:: :::::::.:::..: . ::::::::::.:.::
XP_011 AKEFVDARERERIHAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKCHGVSGSCSLKTC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 WLAMADFRKTGDYLWRKYNGAIQVVMNQDGTGFTVANERFKKPTKNDLVYFENSPDYCIR
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XP_011 WLQLADFRKVGDALKEKYDSAAAMRLNSRGKLVQV-NSRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVR
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360 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]