Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1373
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1373, 439 aa
1>>>pF1KE1373 439 - 439 aa - 439 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6160+/-0.0008; mu= 11.4618+/- 0.048
mean_var=99.2888+/-19.924, 0's: 0 Z-trim(110.4): 102 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.128714
statistics sampled from 11450 (11565) to 11450 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.355), width: 16
Scan time: 3.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 2499 474.4 1.1e-133
CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 2436 462.7 4.8e-130
CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 2436 462.7 4.8e-130
CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 2434 462.3 6.2e-130
CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 2434 462.3 6.2e-130
CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 2431 461.8 8.9e-130
CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 2349 446.5 2.7e-125
CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 2300 437.4 1.8e-122
CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 2297 436.9 2.3e-122
CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 2297 436.9 2.6e-122
CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 2279 433.5 2.1e-121
CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 2149 409.3 3.9e-114
CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 1924 367.6 1.9e-101
CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 1924 367.6 1.9e-101
CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 1906 364.2 1.6e-100
CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 1846 353.1 3.6e-97
CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 1746 334.5 1.4e-91
CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 1694 324.9 1.3e-88
CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 1692 324.5 1.7e-88
CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 1249 242.1 5.4e-64
CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 1071 209.2 7.5e-54
CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 813 161.2 1.3e-39
CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 769 153.1 4.9e-37
CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 758 151.0 2.2e-36
CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 754 150.3 3.7e-36
CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 735 146.8 4.1e-35
CCDS42618.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 447) 722 144.4 2.2e-34
CCDS12902.1 LILRB4 gene_id:11006|Hs108|chr19 ( 448) 722 144.4 2.2e-34
CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 707 141.5 1.1e-33
CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 553 112.9 5e-25
CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 509 104.7 1.5e-22
CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 467 96.9 3.2e-20
CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 460 95.6 6.5e-20
CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 450 93.7 2.5e-19
CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 450 93.8 2.6e-19
CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 450 93.8 2.6e-19
CCDS55490.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1327) 400 84.8 5.7e-16
CCDS14629.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1336) 400 84.8 5.7e-16
CCDS55491.1 IGSF1 gene_id:3547|Hs108|chrX (1341) 400 84.8 5.7e-16
CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 339) 340 73.4 4e-13
CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 620) 340 73.5 6.7e-13
CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 321) 328 71.1 1.8e-12
CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 302 66.3 4.4e-11
CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 302 66.3 4.6e-11
CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 302 66.3 4.6e-11
CCDS46173.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19 ( 271) 297 65.3 8.4e-11
>>CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 (489 aa)
initn: 2499 init1: 2499 opt: 2499 Z-score: 2513.4 bits: 474.4 E(32554): 1.1e-133
Smith-Waterman score: 2499; 84.9% identity (92.7% similar) in 438 aa overlap (1-438:1-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL
:: :.:::::: ::: :::::::: :::::::::::::::::::::: ::: ::::::.:
CCDS12 MTPIVTVLICLRLSLGPRTHVQAGTLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLWCQGILETQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG
::::::: ::::::::.:::::::: ::::::.::: :.:::::.: :: ::::::::::
CCDS12 YREKKTAPWITRIPQEIVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCFYGSHTAGWSEPSDPLELVVTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA
:: :::::::::::::::::::..: ::::: .:::::::::::::::::. ...: :::
CCDS12 AYIKPTLSALPSPVVTSGGNVTLHCVSQVAFGSFILCKEGEDEHPQCLNSQPRTHGWSRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE
::::::::::::::::::.::: .:.::::::::: ::: ::::::::::::::.:::::
CCDS12 IFSVGPVSPSRRWSYRCYAYDSNSPHVWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA
.::.:: ::..::::::::: ::::: :: :::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS12 SLTLQCVSDVSYDRFVLYKEGERDFLQLPGPQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCSGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE
::::::::::::::::::.::.:.:::.::.::::::::::::::::: : .:::::::
CCDS12 YNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFRGRPFISVHPGPTVASGENVTLLCQSWGPFHTFLLTKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS
::::.::::.: .. :::::::::::::::.::::::::::::::::.:::: :::.::
CCDS12 GAADAPLRLRSIHEYPKYQAEFPMSPVTSAHSGTYRCYGSLSSNPYLLSHPSDSLELMVS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE1 GAAETLSPPQNKSDSKAGE
::::::::::::::::::
CCDS12 GAAETLSPPQNKSDSKAGAANTLSPSQNKTASHPQDYTVENLIRMGIAGLVLVVLGILLF
430 440 450 460 470 480
>>CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (650 aa)
initn: 2423 init1: 2423 opt: 2436 Z-score: 2448.3 bits: 462.7 E(32554): 4.8e-130
Smith-Waterman score: 2436; 83.6% identity (89.5% similar) in 438 aa overlap (1-438:1-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL
:: :::::::::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::. :::::.:
CCDS42 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG
::::::: ::::::::::::::::: ::::::.::: : ::: :.: :::::::::::::
CCDS42 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA
:: :::::: :::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS42 AYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE
::::::::::::: ::::.::: .:: :::::::: ::: ::::::::::::::.::: :
CCDS42 IFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA
::.::::::::.::::::. ::::: : :::::::::::::::::::::::: : ::
CCDS42 TLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE
.:::::::::::::::::.::. : :::.::::::::::::::::::: :.:::::::
CCDS42 HNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS
::::.: ::.: ::.::::::::.::::::::::::::: ::.::::::::::::::::
CCDS42 GAADDPWRLRSTYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE1 GAAETLSPPQNKSDSKAGE
: . : : . : .:
CCDS42 GPSGGPSSPTTGPTSTSGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVILLLLLLLLLF
430 440 450 460 470 480
>>CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (651 aa)
initn: 2423 init1: 2423 opt: 2436 Z-score: 2448.3 bits: 462.7 E(32554): 4.8e-130
Smith-Waterman score: 2436; 83.6% identity (89.5% similar) in 438 aa overlap (1-438:1-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL
:: :::::::::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::. :::::.:
CCDS42 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG
::::::: ::::::::::::::::: ::::::.::: : ::: :.: :::::::::::::
CCDS42 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA
:: :::::: :::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS42 AYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE
::::::::::::: ::::.::: .:: :::::::: ::: ::::::::::::::.::: :
CCDS42 IFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA
::.::::::::.::::::. ::::: : :::::::::::::::::::::::: : ::
CCDS42 TLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE
.:::::::::::::::::.::. : :::.::::::::::::::::::: :.:::::::
CCDS42 HNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS
::::.: ::.: ::.::::::::.::::::::::::::: ::.::::::::::::::::
CCDS42 GAADDPWRLRSTYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE1 GAAETLSPPQNKSDSKAGE
: . : : . : .:
CCDS42 GPSGGPSSPTTGPTSTSGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVILLLLLLLLLF
430 440 450 460 470 480
>>CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (651 aa)
initn: 2423 init1: 2423 opt: 2434 Z-score: 2446.3 bits: 462.3 E(32554): 6.2e-130
Smith-Waterman score: 2434; 83.4% identity (90.2% similar) in 439 aa overlap (1-438:1-439)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL
:: :::::::::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::. :::::.:
CCDS42 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG
::::::: ::::::::::::::::: ::::::.::: : ::: :.: :::::::::::::
CCDS42 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA
:: :::::: :::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS42 AYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE
::::::::::::: ::::.::: .:: :::::::: ::: ::::::::::::::.::: :
CCDS42 IFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA
::.::::::::.::::::. ::::: : :::::::::::::::::::::::: : ::
CCDS42 TLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE
.:::::::::::::::::.::. : :::.::::::::::::::::::: :.:::::::
CCDS42 HNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS
::::.: ::.: ::.::::::::.::::::::::::::: ::.::::::::::::::::
CCDS42 GAADDPWRLRSTYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE1 G-AAETLSPPQNKSDSKAGE
: .. :: . ....::
CCDS42 GPSGGPSSPTTGPTSTSAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVILLLLLLLLL
430 440 450 460 470 480
>>CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (652 aa)
initn: 2423 init1: 2423 opt: 2434 Z-score: 2446.2 bits: 462.3 E(32554): 6.2e-130
Smith-Waterman score: 2434; 83.4% identity (90.2% similar) in 439 aa overlap (1-438:1-439)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL
:: :::::::::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::. :::::.:
CCDS42 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG
::::::: ::::::::::::::::: ::::::.::: : ::: :.: :::::::::::::
CCDS42 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA
:: :::::: :::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS42 AYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE
::::::::::::: ::::.::: .:: :::::::: ::: ::::::::::::::.::: :
CCDS42 IFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA
::.::::::::.::::::. ::::: : :::::::::::::::::::::::: : ::
CCDS42 TLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE
.:::::::::::::::::.::. : :::.::::::::::::::::::: :.:::::::
CCDS42 HNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS
::::.: ::.: ::.::::::::.::::::::::::::: ::.::::::::::::::::
CCDS42 GAADDPWRLRSTYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE1 G-AAETLSPPQNKSDSKAGE
: .. :: . ....::
CCDS42 GPSGGPSSPTTGPTSTSAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVILLLLLLLLL
430 440 450 460 470 480
>>CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (634 aa)
initn: 2818 init1: 2431 opt: 2431 Z-score: 2443.4 bits: 461.8 E(32554): 8.9e-130
Smith-Waterman score: 2431; 83.3% identity (89.7% similar) in 438 aa overlap (1-438:1-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL
:: :::::::::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::. :::::.:
CCDS62 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG
::::::: ::::::::::::::::: ::::::.::: : ::: :.: :::::::::::::
CCDS62 YREKKTAPWITRIPQELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGRSESSDPLELVVTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA
:: :::::: :::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS62 AYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE
::::::::::::: ::::.::: .:: :::::::: ::: ::::::::::::::.::: :
CCDS62 IFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA
::.::::::::.::::::. ::::: : :::::::::::::::::::::::: : ::
CCDS62 TLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE
.:::::::::::::::::.::. : :::.::::::::::::::::::: :.:::::::
CCDS62 HNLSSEWSAPSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS
::::.: ::.: ::.::::::::.::::::::::::::: ::.::::::::::::::::
CCDS62 GAADDPWRLRSTYQSQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVS
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE1 GAAETLSPPQNKSDSKAGE
.. : . :: ..:
CCDS62 AGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVILLLLLLLLLFLILRHRRQGKHWTSTQ
430 440 450 460 470 480
>>CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 (483 aa)
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Smith-Waterman score: 2349; 81.8% identity (90.3% similar) in 435 aa overlap (1-435:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL
:: :::::::::::: :::::::: :::::::::::::: :::::::::::::...::::
CCDS46 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVIIQGSPVTLRCQGSLQAEEYHL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG
:::.:.: :. :: :: :.::::: :::::::::: : : ::. . :: ::::::::::
CCDS46 YRENKSASWVRRI-QEPGKNGQFPIPSITWEHAGRYHCQYYSHNHS-SEYSDPLELVVTG
70 80 90 100 110
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pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA
::::::::::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::: ::::::::: : :
CCDS46 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTLQCVSQVAFDGFILCKEGEDEHPQRLNSHSHARGWSWA
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pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE
::::::::::::::::::.::: .::::::::::: ::::::::::::::::::.:::::
CCDS46 IFSVGPVSPSRRWSYRCYAYDSNSPYVWSLPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPMVAPGE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA
.::.:: ::.:::::::::: :::::::: ::::::::::::::::: :.:::: : .:
CCDS46 SLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGWQPQAGLSQANFTLGPVSPSHGGQYRCYSA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE
.::::::::::::::::::::. :: :::.: :::: :.::::::::.: .::::::::
CCDS46 HNLSSEWSAPSDPLDILITGQFYDRPSLSVQPVPTVAPGKNVTLLCQSRGQFHTFLLTKE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS
::. ::.:.:..:... :::: :.::::::.::::::.:::::::::. ::::::::::
CCDS46 GAGHPPLHLRSEHQAQQNQAEFRMGPVTSAHVGTYRCYSSLSSNPYLLSLPSDPLELVVS
360 370 380 390 400 410
430
pF1KE1 GAAETLSPPQNKSDSKAGE
::::::: :::.::
CCDS46 EAAETLSPSQNKTDSTTTSLGQHPQDYTVENLIRMGVAGLVLVVLGILLFEAQHSQRSLQ
420 430 440 450 460 470
>>CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 (597 aa)
initn: 2300 init1: 1789 opt: 2300 Z-score: 2312.3 bits: 437.4 E(32554): 1.8e-122
Smith-Waterman score: 2300; 79.2% identity (87.9% similar) in 438 aa overlap (1-438:1-437)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL
:: :.:::::::::: :::.::.: .::::::::: ::::::::::: ::::::.:::.:
CCDS42 MTPIVTVLICLGLSLGPRTRVQTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG
:::::.: ::::: ::::.::: : ::::::.::: : : :.. :: :::: ::.::
CCDS42 YREKKSASWITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQYYSRAR-WSELSDPLVLVMTG
70 80 90 100 110
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pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA
:: :::::: ::::::::: ::.::.::::: ::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS42 AYPKPTLSAQPSPVVTSGGRVTLQCESQVAFGGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE
:::::::::.::::.:::::: .::::: ::::: :::::::::::::::::::.::::
CCDS42 IFSVGPVSPNRRWSHRCYGYDLNSPYVWSSPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPVMAPGE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA
.::.:: ::.:::::::::: ::. : ::::::::::::::::::::::::::: : ::
CCDS42 SLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE
.::::: ::::::::::::::::. ::.::.::::::::::::::::: .:::::::
CCDS42 HNLSSECSAPSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQFHTFLLTKA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS
::::.::::.: .. :::::::::::::::::::::::::.:.::::.:::.:::::::
CCDS42 GAADAPLRLRSIHEYPKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLNSDPYLLSHPSEPLELVVS
360 370 380 390 400 410
430
pF1KE1 GAAETLSPPQNKSDSKAGE
: . ::: . : :
CCDS42 GPSMGSSPPPTGPISTPGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVVLLLLLLLLLF
420 430 440 450 460 470
>>CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 (510 aa)
initn: 2300 init1: 1789 opt: 2297 Z-score: 2310.4 bits: 436.9 E(32554): 2.3e-122
Smith-Waterman score: 2297; 80.4% identity (89.0% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-428)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL
:: :.:::::::::: :::.::.: .::::::::: ::::::::::: ::::::.:::.:
CCDS62 MTPIVTVLICLGLSLGPRTRVQTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG
:::::.: ::::: ::::.::: : ::::::.::: : : :.. :: :::: ::.::
CCDS62 YREKKSASWITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQYYSRAR-WSELSDPLVLVMTG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA
:: :::::: ::::::::: ::.::.::::: ::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS62 AYPKPTLSAQPSPVVTSGGRVTLQCESQVAFGGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE
:::::::::.::::.:::::: .::::: ::::: :::::::::::::::::::.::::
CCDS62 IFSVGPVSPNRRWSHRCYGYDLNSPYVWSSPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPVMAPGE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA
.::.:: ::.:::::::::: ::. : ::::::::::::::::::::::::::: : ::
CCDS62 SLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE
.::::: ::::::::::::::::. ::.::.::::::::::::::::: .:::::::
CCDS62 HNLSSECSAPSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQFHTFLLTKA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS
::::.::::.: .. :::::::::::::::::::::::::.:.::::.:::.:::::::
CCDS62 GAADAPLRLRSIHEYPKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLNSDPYLLSHPSEPLELVVS
360 370 380 390 400 410
430
pF1KE1 GAAETLSPPQNKSDSKAGE
: . :::
CCDS62 GPSMGSSPPPTGPISTPAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVVLLLLLLLLL
420 430 440 450 460 470
>>CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 (598 aa)
initn: 2300 init1: 1789 opt: 2297 Z-score: 2309.3 bits: 436.9 E(32554): 2.6e-122
Smith-Waterman score: 2297; 80.4% identity (89.0% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-428)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTSILTVLICLGLSLDPRTHVQAGPLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGSLETQEYHL
:: :.:::::::::: :::.::.: .::::::::: ::::::::::: ::::::.:::.:
CCDS12 MTPIVTVLICLGLSLGPRTRVQTGTIPKPTLWAEPDSVITQGSPVTLSCQGSLEAQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YREKKTALWITRIPQELVKKGQFPILSITWEHAGRYCCIYGSHTVGLSESSDPLELVVTG
:::::.: ::::: ::::.::: : ::::::.::: : : :.. :: :::: ::.::
CCDS12 YREKKSASWITRIRPELVKNGQFHIPSITWEHTGRYGCQYYSRAR-WSELSDPLVLVMTG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AYSKPTLSALPSPVVTSGGNVTIQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSHSHARGSSRA
:: :::::: ::::::::: ::.::.::::: ::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS12 AYPKPTLSAQPSPVVTSGGRVTLQCESQVAFGGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHARGSSRA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IFSVGPVSPSRRWSYRCYGYDSRAPYVWSLPSDLLGLLVPGVSKKPSLSVQPGPVVAPGE
:::::::::.::::.:::::: .::::: ::::: :::::::::::::::::::.::::
CCDS12 IFSVGPVSPNRRWSHRCYGYDLNSPYVWSSPSDLLELLVPGVSKKPSLSVQPGPVMAPGE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KLTFQCGSDAGYDRFVLYKEWGRDFLQRPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYTCSGA
.::.:: ::.:::::::::: ::. : ::::::::::::::::::::::::::: : ::
CCDS12 SLTLQCVSDVGYDRFVLYKEGERDLRQLPGRQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YNLSSEWSAPSDPLDILITGQIRARPFLSVRPGPTVASGENVTLLCQSQGGMHTFLLTKE
.::::: ::::::::::::::::. ::.::.::::::::::::::::: .:::::::
CCDS12 HNLSSECSAPSDPLDILITGQIRGTPFISVQPGPTVASGENVTLLCQSWRQFHTFLLTKA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GAADSPLRLKSKRQSHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLSSNPYLLTHPSDPLELVVS
::::.::::.: .. :::::::::::::::::::::::::.:.::::.:::.:::::::
CCDS12 GAADAPLRLRSIHEYPKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSLNSDPYLLSHPSEPLELVVS
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: . :::
CCDS12 GPSMGSSPPPTGPISTPAGPEDQPLTPTGSDPQSGLGRHLGVVIGILVAVVLLLLLLLLL
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439 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]