Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1340
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1340, 802 aa
1>>>pF1KE1340 802 - 802 aa - 802 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3180+/-0.00124; mu= -3.9999+/- 0.071
mean_var=441.6168+/-101.970, 0's: 0 Z-trim(111.4): 424 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.061031
statistics sampled from 11866 (12365) to 11866 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.38), width: 16
Scan time: 4.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 5442 495.0 2.1e-139
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 3134 291.8 3.1e-78
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 3055 284.8 3.9e-76
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 3035 283.0 1.3e-75
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 3022 281.9 2.9e-75
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 3002 280.1 9.3e-75
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 2954 275.8 1.7e-73
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 2950 275.5 2.2e-73
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 2949 275.5 2.5e-73
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 2949 275.5 2.5e-73
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 2939 274.5 4.4e-73
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 2940 274.7 4.4e-73
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 2940 274.7 4.5e-73
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 2929 273.7 8.6e-73
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 2916 272.6 1.9e-72
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 2875 268.9 2.1e-71
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 2816 263.7 7.6e-70
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 2788 261.3 4.5e-69
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 2629 247.3 7.4e-65
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 2484 234.5 5e-61
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 2423 229.0 1.8e-59
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 1927 185.4 2.8e-46
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 1841 177.8 5.3e-44
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 1831 177.0 9.9e-44
CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1072) 1114 114.0 1.3e-24
CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1114) 1114 114.1 1.3e-24
CCDS482.1 TIE1 gene_id:7075|Hs108|chr1 (1138) 831 89.2 4.3e-17
CCDS78389.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 ( 976) 828 88.8 4.7e-17
CCDS75825.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1081) 828 88.9 5e-17
CCDS6519.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1124) 828 88.9 5.1e-17
CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 783) 798 86.1 2.5e-16
CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 869) 798 86.1 2.7e-16
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 796 85.9 2.8e-16
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 796 85.9 2.9e-16
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 755 82.3 3.6e-15
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 751 81.9 4.6e-15
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 740 81.0 9.1e-15
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 730 80.1 1.7e-14
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 724 80.1 4.7e-14
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (1338) 713 78.9 6.4e-14
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 704 77.8 8.2e-14
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 705 78.0 8.3e-14
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356) 704 78.1 1.1e-13
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 698 77.5 1.6e-13
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 698 77.6 1.6e-13
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 695 77.3 1.9e-13
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 695 77.3 1.9e-13
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 ( 943) 690 76.6 2.1e-13
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 689 76.7 2.7e-13
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 972) 678 75.6 4.4e-13
>>CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 (802 aa)
initn: 5442 init1: 5442 opt: 5442 Z-score: 2616.2 bits: 495.0 E(32554): 2.1e-139
Smith-Waterman score: 5442; 100.0% identity (100.0% similar) in 802 aa overlap (1-802:1-802)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRLLLALLGVLLSVPGPPVLSLEASEEVELEPCLAPSLEQQEQELTVALGQPVRLCCGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MRLLLALLGVLLSVPGPPVLSLEASEEVELEPCLAPSLEQQEQELTVALGQPVRLCCGRA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ERGGHWYKEGSRLAPAGRVRGWRGRLEIASFLPEDAGRYLCLARGSMIVLQNLTLITGDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERGGHWYKEGSRLAPAGRVRGWRGRLEIASFLPEDAGRYLCLARGSMIVLQNLTLITGDS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LTSSNDDEDPKSHRDPSNRHSYPQQAPYWTHPQRMEKKLHAVPAGNTVKFRCPAAGNPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LTSSNDDEDPKSHRDPSNRHSYPQQAPYWTHPQRMEKKLHAVPAGNTVKFRCPAAGNPTP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TIRWLKDGQAFHGENRIGGIRLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVENAVGSIRYNYLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TIRWLKDGQAFHGENRIGGIRLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVENAVGSIRYNYLLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VLERSPHRPILQAGLPANTTAVVGSDVELLCKVYSDAQPHIQWLKHIVINGSSFGADGFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VLERSPHRPILQAGLPANTTAVVGSDVELLCKVYSDAQPHIQWLKHIVINGSSFGADGFP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YVQVLKTADINSSEVEVLYLRNVSAEDAGEYTCLAGNSIGLSYQSAWLTVLPEEDPTWTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YVQVLKTADINSSEVEVLYLRNVSAEDAGEYTCLAGNSIGLSYQSAWLTVLPEEDPTWTA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 AAPEARYTDIILYASGSLALAVLLLLAGLYRGQALHGRHPRPPATVQKLSRFPLARQFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AAPEARYTDIILYASGSLALAVLLLLAGLYRGQALHGRHPRPPATVQKLSRFPLARQFSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 ESGSSGKSSSSLVRGVRLSSSGPALLAGLVSLDLPLDPLWEFPRDRLVLGKPLGEGCFGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ESGSSGKSSSSLVRGVRLSSSGPALLAGLVSLDLPLDPLWEFPRDRLVLGKPLGEGCFGQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 VVRAEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIGRHKNIINLLGVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VVRAEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIGRHKNIINLLGVC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 TQEGPLYVIVECAAKGNLREFLRARRPPGPDLSPDGPRSSEGPLSFPVLVSCAYQVARGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TQEGPLYVIVECAAKGNLREFLRARRPPGPDLSPDGPRSSEGPLSFPVLVSCAYQVARGM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 QYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHIDYYKKTSNGRLPVKWMAPEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHIDYYKKTSNGRLPVKWMAPEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 LFDRVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFSLLREGHRMDRPPHCPPELYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LFDRVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFSLLREGHRMDRPPHCPPELYG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 LMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVLLAVSEEYLDLRLTFGPYSPSGGDASSTCSSSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVLLAVSEEYLDLRLTFGPYSPSGGDASSTCSSSDS
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KE1 VFSHDPLPLGSSSFPFGSGVQT
::::::::::::::::::::::
CCDS44 VFSHDPLPLGSSSFPFGSGVQT
790 800
>>CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 (806 aa)
initn: 2737 init1: 1760 opt: 3134 Z-score: 1517.9 bits: 291.8 E(32554): 3.1e-78
Smith-Waterman score: 3134; 63.0% identity (79.0% similar) in 795 aa overlap (5-788:8-795)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MRLLLALLGVLLSVPGPPVLSLEASEEVELEPCLAPSLE--QQEQELTVALGQPVRL
::: .. : : :: . ..: . .:. : :::: :. . :. :.:
CCDS33 MGAPACALALCVAVAIVAGASSESLGTEQRVVGRAAEVPGPEPGQQEQ-LVFGSGDAVEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 CC---GRAERGGH-WYKEGSRLAPAGRVRGWRGRLEIASFLPEDAGRYLCLARGSMIVLQ
: : . : : :.:. :.:. :: ::.. . ::.: : : : .. ::
CCDS33 SCPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 NLTLITGDSLTSSNDDEDPKSHRDPSNRHSYPQQAPYWTHPQRMEKKLHAVPAGNTVKFR
.... . :. ::.:::: . : .. . :::::.:.::.::: ::::.:::.::
CCDS33 HFSVRVTDA-PSSGDDEDGE---DEAEDTGVDTGAPYWTRPERMDKKLLAVPAANTVRFR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 CPAAGNPTPTIRWLKDGQAFHGENRIGGIRLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVENAVG
:::::::::.: :::.:. :.::.:::::.::::.::::::::::::::.:::.::: :
CCDS33 CPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 SIRYNYLLDVLERSPHRPILQAGLPANTTAVVGSDVELLCKVYSDAQPHIQWLKHIVING
::: .: :::::::::::::::::::: :::.:::::. ::::::::::::::::. .::
CCDS33 SIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE1 SSFGADGFPYVQVLKTADINSS--EVEVLYLRNVSAEDAGEYTCLAGNSIGLSYQSAWLT
:. : :: ::: ::::: :.. :.::: :.::. :::::::::::::::.:..::::.
CCDS33 SKVGPDGTPYVTVLKTAGANTTDKELEVLSLHNVTFEDAGEYTCLAGNSIGFSHHSAWLV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 VLPEEDPTWTAAAPEARYTDIILYASGSLALAVLLLLAGLYRGQALHGRHPRPPATVQKL
::: :. : . :. :. :. : . . ... . : : .. . : ::.:.
CCDS33 VLPAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGSP-TVHKI
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 SRFPLARQFSLESGSSGKSSSSLVRGVRLSSS-GPALLAGLVSLDLPLDPLWEFPRDRLV
::::: :: ::::..: .:.. ::: .::::. ::.: :.. :.:: :: ::. : ::.
CCDS33 SRFPLKRQVSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTL-ANVSELELPADPKWELSRARLT
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 LGKPLGEGCFGQVVRAEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIG
:::::::::::::: :::.:.: : . :::::::::.:.::::.:::::::.::.::
CCDS33 LGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIG
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 RHKNIINLLGVCTQEGPLYVIVECAAKGNLREFLRARRPPGPDLSPDGPRSSEGPLSFPV
.:::::::::.::: :::::.:: ::::::::::::::::: : : : . : :.:
CCDS33 KHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTFKD
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 LVSCAYQVARGMQYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHIDYYKKTSN
::::::::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::::::: ::..::::::.:
CCDS33 LVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTN
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 GRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFSLLREGHRM
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::
CCDS33 GRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRM
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 DRPPHCPPELYGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVLLAVS-EEYLDLRLTFGPYSPS
:.: .: .:: .:::::::::::::::::::: ::.:: ..: .::::: : :::.
CCDS33 DKPANCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSTDEYLDLSAPFEQYSPG
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800
pF1KE1 GGDA-SSTCSSSDSVFSHDPLPLGSSSFPFGSGVQT
: :. ::. :..::::.:: ::
CCDS33 GQDTPSSSSSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSRT
780 790 800
>>CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 (819 aa)
initn: 2746 init1: 1643 opt: 3055 Z-score: 1480.3 bits: 284.8 E(32554): 3.9e-76
Smith-Waterman score: 3074; 59.2% identity (79.6% similar) in 800 aa overlap (4-788:10-802)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MRLLLALLGVLLSVPGPPVLSLEASEEVELEPCLAPSLEQQEQ-ELTVAL-GQP
:... . ::. : :. :.. ::: :. : : :. :: :.
CCDS81 MVSWGRFICLVVVTMATLSLARP---SFSLVEDTTLEPEEPPTKYQISQPEVYVAAPGES
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 VRLCCGRAERGG-HWYKEGSRLAPAGRVRGWRGRLEIASFLPEDAGRYLCLARGSMIVLQ
... : . . : :.: .:.: .:. :.: . :.:.: : : : ..
CCDS81 LEVRCLLKDAAVISWTKDGVHLGPNNRTVLIGEYLQIKGATPRDSGLYACTASRTVDSET
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 NLTLIT-GDSLTSSNDDEDPKSHRDPSNRHSYPQQAPYWTHPQRMEKKLHAVPAGNTVKF
... :...:..:..: . .: ...: ..:::::. ..:::.::::::.:::::
CCDS81 WYFMVNVTDAISSGDDEDDTDGAEDFVSENSNNKRAPYWTNTEKMEKRLHAVPAANTVKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RCPAAGNPTPTIRWLKDGQAFHGENRIGGIRLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVENAV
::::.::: ::.::::.:. :. :.:::: ..:.:::::.::::::::.:.:::.:::
CCDS81 RCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWSLIMESVVPSDKGNYTCVVENEY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 GSIRYNYLLDVLERSPHRPILQAGLPANTTAVVGSDVELLCKVYSDAQPHIQWLKHIVIN
::: ..: :::.::::::::::::::::...:::.:::..:::::::::::::.::. :
CCDS81 GSINHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVEFVCKVYSDAQPHIQWIKHVEKN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE1 GSSFGADGFPYVQVLKTADINSS--EVEVLYLRNVSAEDAGEYTCLAGNSIGLSYQSAWL
::..: ::.::..:::.: .:.. :.::::.:::. :::::::::::::::.:..::::
CCDS81 GSKYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFHSAWL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 TVLPEED-PTWTAAAPEARYTDIILYASGSLALAVLLLLAGLYRGQALHGRHP---RPPA
:::: .:.:. : .: .: : . .: ... . : : . ..: ::
CCDS81 TVLPAPGREKEITASPD--YLEIAIYCIGVFLIACMVVTVILCRMKNTT-KKPDFSSQPA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 TVQKLS-RFPLARQFSLESGSSGKSSSSLVR-GVRLSSSGPA-LLAGLVSLDLPLDPLWE
:.::. :.:: :: : ::.:: .:.. ::: .::::.. . .:::. .:: :: ::
CCDS81 -VHKLTKRIPLRRQVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPKWE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 FPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVRAEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEM
::::.:.:::::::::::::: ::: :.: .: .: :::::::::.:..:::.::::::
CCDS81 FPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVSEM
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 EVMKLIGRHKNIINLLGVCTQEGPLYVIVECAAKGNLREFLRARRPPGPDLSPDGPRSSE
:.::.::.:::::::::.:::.:::::::: :.::::::.:::::::: . : : : :
CCDS81 EMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRVPE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 GPLSFPVLVSCAYQVARGMQYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHID
..: ::::.::.::::.:: :.::::::::::::::::.:::::::::::: ...::
CCDS81 EQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINNID
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650 660 670 680 690 700
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:::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::.:
CCDS81 YYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKL
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710 720 730 740 750 760
pF1KE1 LREGHRMDRPPHCPPELYGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVL-LAVSEEYLDLRLT
:.::::::.: .: ::: .::.::::.:::::::::::: ::..: :...::::::
CCDS81 LKEGHRMDKPANCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRILTLTTNEEYLDLSQP
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770 780 790 800
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. :::: :. :.:::.: :::: ::.:
CCDS81 LEQYSPSYPDTRSSCSSGDDSVFSPDPMPYEPCLPQYPHINGSVKT
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10 20 30 40 50
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:... . ::. : :. :.. ::: :. : : :. :: :.
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10 20 30 40 50
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... : . . : :.: .:.: .:. :.: . :.:.: : : : ..
CCDS31 LEVRCLLKDAAVISWTKDGVHLGPNNRTVLIGEYLQIKGATPRDSGLYACTASRTVDSET
60 70 80 90 100 110
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pF1KE1 NLTLIT-GDSLTSSNDDEDPKSHRDPSNRHSYPQQAPYWTHPQRMEKKLHAVPAGNTVKF
... :...:..:..: . .: ...: ..:::::. ..:::.::::::.:::::
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::::.::: ::.::::.:. :. :.:::: ..:.:::::.::::::::.:.:::.:::
CCDS31 RCPAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWSLIMESVVPSDKGNYTCVVENEY
180 190 200 210 220 230
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pF1KE1 GSIRYNYLLDVLERSPHRPILQAGLPANTTAVVGSDVELLCKVYSDAQPHIQWLKHIVIN
::: ..: :::.::::::::::::::::...:::.:::..:::::::::::::.::. :
CCDS31 GSINHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVEFVCKVYSDAQPHIQWIKHVEKN
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::..: ::.::..:::.: .:.. :.::::.:::. :::::::::::::::.:..::::
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300 310 320 330 340 350
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pF1KE1 TVLPEED-PTWTAAAPEARYTDIILYASGSLALAVLLLLAGLYRGQALHGRHP---RPPA
:::: .:.:. : .: .: : . .: ... . : : . ..: ::
CCDS31 TVLPAPGREKEITASPD--YLEIAIYCIGVFLIACMVVTVILCRMKNTT-KKPDFSSQPA
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pF1KE1 TVQKLS-RFPLARQFSL--ESGSSGKSSSSLVR-GVRLSSSGPA-LLAGLVSLDLPLDPL
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CCDS31 -VHKLTKRIPLRRQVTVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPK
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460 470 480 490 500 510
pF1KE1 WEFPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVRAEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVS
::::::.:.:::::::::::::: ::: :.: .: .: :::::::::.:..:::.::::
CCDS31 WEFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVS
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:::.::.::.:::::::::.:::.:::::::: :.::::::.:::::::: . : : :
CCDS31 EMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRV
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580 590 600 610 620 630
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: ..: ::::.::.::::.:: :.::::::::::::::::.:::::::::::: ...
CCDS31 PEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINN
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640 650 660 670 680 690
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:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::
CCDS31 IDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELF
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700 710 720 730 740 750
pF1KE1 SLLREGHRMDRPPHCPPELYGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVL-LAVSEEYLDLR
.::.::::::.: .: ::: .::.::::.:::::::::::: ::..: :...::::::
CCDS31 KLLKEGHRMDKPANCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRILTLTTNEEYLDLS
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760 770 780 790 800
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. :::: :. :.:::.: :::: ::.:
CCDS31 QPLEQYSPSYPDTRSSCSSGDDSVFSPDPMPYEPCLPQYPHINGSVKT
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::: .. : : :: . ..: . .:. : :::: :. . :. :.:
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CCDS54 SCPPPGGGPMGPTVWVKDGTGLVPSERVLVGPQRLQVLNASHEDSGAYSCRQRLTQRVLC
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.... . :. ::.:::: . : .. . :::::.:.::.::: ::::.:::.::
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:::::::::.: :::.:. :.::.:::::.::::.::::::::::::::.:::.::: :
CCDS54 CPAAGNPTPSISWLKNGREFRGEHRIGGIKLRHQQWSLVMESVVPSDRGNYTCVVENKFG
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::: .: :::::::::::::::::::: :::.:::::. ::::::::::::::::. .::
CCDS54 SIRQTYTLDVLERSPHRPILQAGLPANQTAVLGSDVEFHCKVYSDAQPHIQWLKHVEVNG
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:. : :: ::: :::. .: :..: : : ::: .:.::: : : : ::.. .. ::.:
CCDS54 SKVGPDGTPYVTVLKSWISESVEADVRLRLANVSERDGGEYLCRATNFIGVAEKAFWLSV
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:. . : :: :. :. :. : . . ... . : : .. . : ::.
CCDS54 HGPRAAEEELVEADEAGSVYAGILSYGVGFFLFILVVAAVTLCRLRSPPKKGLGSP-TVH
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:.::::: :: ::::..: .:.. ::: .::::. ::.: :.. :.:: :: ::. : :
CCDS54 KISRFPLKRQVSLESNASMSSNTPLVRIARLSSGEGPTL-ANVSELELPADPKWELSRAR
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:.:::::::::::::: :::.:.: : . :::::::::.:.::::.:::::::.::.
CCDS54 LTLGKPLGEGCFGQVVMAEAIGIDKDRAAKPVTVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKM
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::.:::::::::.::: :::::.:: ::::::::::::::::: : : : . : :.:
CCDS54 IGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPPGLDYSFDTCKPPEEQLTF
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pF1KE1 PVLVSCAYQVARGMQYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHIDYYKKT
::::::::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::::::: ::..::::::
CCDS54 KDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKT
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650 660 670 680 690 700
pF1KE1 SNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFSLLREGH
.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::
CCDS54 TNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGH
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pF1KE1 RMDRPPHCPPELYGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVLLAVS-EEYLDLRLTFGPYS
:::.: .: .:: .:::::::::::::::::::: ::.:: ..: .::::: : ::
CCDS54 RMDKPANCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTSTDEYLDLSAPFEQYS
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pF1KE1 PSGGDA-SSTCSSSDSVFSHDPLPLGSSSFPFGSGVQT
:.: :. ::. :..::::.:: ::
CCDS54 PGGQDTPSSSSSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSRT
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pF1KE1 GSRLAPAGRVRGWRGRLEIASFLPEDAGRYLCLARGSMIVLQNLTLITGDSLTSSNDDED
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CCDS73 MVSWGRFICLVVVTMATLSLARPSFSLVEDTTLEPEDAISSGDDEDD
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pF1KE1 PKSHRDPSNRHSYPQQAPYWTHPQRMEKKLHAVPAGNTVKFRCPAAGNPTPTIRWLKDGQ
. .: ...: ..:::::. ..:::.::::::.:::::::::.::: ::.::::.:.
CCDS73 TDGAEDFVSENSNNKRAPYWTNTEKMEKRLHAVPAANTVKFRCPAGGNPMPTMRWLKNGK
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190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AFHGENRIGGIRLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVENAVGSIRYNYLLDVLERSPHRP
:. :.:::: ..:.:::::.::::::::.:.:::.::: ::: ..: :::.:::::::
CCDS73 EFKQEHRIGGYKVRNQHWSLIMESVVPSDKGNYTCVVENEYGSINHTYHLDVVERSPHRP
110 120 130 140 150 160
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:::::::::...:::.:::..:::::::::::::.::. :::..: ::.::..:::.:
CCDS73 ILQAGLPANASTVVGGDVEFVCKVYSDAQPHIQWIKHVEKNGSKYGPDGLPYLKVLKAAG
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pF1KE1 INSS--EVEVLYLRNVSAEDAGEYTCLAGNSIGLSYQSAWLTVLPEED-PTWTAAAPEAR
.:.. :.::::.:::. :::::::::::::::.:..:::::::: .:.:.
CCDS73 VNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFHSAWLTVLPAPGREKEITASPD--
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 YTDIILYASGSLALAVLLLLAGLYRGQALHGRHP---RPPATVQKLS-RFPLARQFSL--
: .: .: : . .: ... . : : . ..: :: :.::. :.:: :: ..
CCDS73 YLEIAIYCIGVFLIACMVVTVILCRMKNTT-KKPDFSSQPA-VHKLTKRIPLRRQVTVSA
290 300 310 320 330 340
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pF1KE1 ESGSSGKSSSSLVR-GVRLSSSGPA-LLAGLVSLDLPLDPLWEFPRDRLVLGKPLGEGCF
::.:: .:.. ::: .::::.. . .:::. .:: :: ::::::.:.::::::::::
CCDS73 ESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPKWEFPRDKLTLGKPLGEGCF
350 360 370 380 390 400
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pF1KE1 GQVVRAEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIGRHKNIINLLG
:::: ::: :.: .: .: :::::::::.:..:::.:::::::.::.::.:::::::::
CCDS73 GQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLG
410 420 430 440 450 460
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pF1KE1 VCTQEGPLYVIVECAAKGNLREFLRARRPPGPDLSPDGPRSSEGPLSFPVLVSCAYQVAR
.:::.:::::::: :.::::::.:::::::: . : : : : ..: ::::.::.::
CCDS73 ACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRVPEEQMTFKDLVSCTYQLAR
470 480 490 500 510 520
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pF1KE1 GMQYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHIDYYKKTSNGRLPVKWMAP
::.:: :.::::::::::::::::.:::::::::::: ...:::::::.:::::::::::
CCDS73 GMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINNIDYYKKTTNGRLPVKWMAP
530 540 550 560 570 580
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pF1KE1 EALFDRVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFSLLREGHRMDRPPHCPPEL
::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::.::.::::::.: .: ::
CCDS73 EALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPANCTNEL
590 600 610 620 630 640
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 YGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVL-LAVSEEYLDLRLTFGPYSPSGGDASSTCSS
: .::.::::.:::::::::::: ::..: :...:::::: . :::: :. :.:::
CCDS73 YMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRILTLTTNEEYLDLSQPLEQYSPSYPDTRSSCSS
650 660 670 680 690 700
780 790 800
pF1KE1 SD-SVFSHDPLPLGSSSFPFGSGVQT
.: :::: ::.:
CCDS73 GDDSVFSPDPMPYEPCLPQYPHINGSVKT
710 720 730
>>CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 (704 aa)
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120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LTLITGDSLTSSNDDEDPKSHRDPSNRHSYPQQAPYWTHPQRMEKKLHAVPAGNTVKFRC
:. :::::. ..:::.::::::.:::::::
CCDS44 GRFICLVVVTMATLSLARPSFSLVEDTTLEPEGAPYWTNTEKMEKRLHAVPAANTVKFRC
10 20 30 40 50 60
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PAAGNPTPTIRWLKDGQAFHGENRIGGIRLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVENAVGS
::.::: ::.::::.:. :. :.:::: ..:.:::::.::::::::.:.:::.::: ::
CCDS44 PAGGNPMPTMRWLKNGKEFKQEHRIGGYKVRNQHWSLIMESVVPSDKGNYTCVVENEYGS
70 80 90 100 110 120
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pF1KE1 IRYNYLLDVLERSPHRPILQAGLPANTTAVVGSDVELLCKVYSDAQPHIQWLKHIVINGS
: ..: :::.::::::::::::::::...:::.:::..:::::::::::::.::. :::
CCDS44 INHTYHLDVVERSPHRPILQAGLPANASTVVGGDVEFVCKVYSDAQPHIQWIKHVEKNGS
130 140 150 160 170 180
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SFGADGFPYVQVLKTADINSS--EVEVLYLRNVSAEDAGEYTCLAGNSIGLSYQSAWLTV
..: ::.::..:::.: .:.. :.::::.:::. :::::::::::::::.:..::::::
CCDS44 KYGPDGLPYLKVLKAAGVNTTDKEIEVLYIRNVTFEDAGEYTCLAGNSIGISFHSAWLTV
190 200 210 220 230 240
360 370 380 390 400
pF1KE1 LPEED-PTWTAAAPEARYTDIILYASGSLALAVLLLLAGLYRGQALHGRHP---RPPATV
:: .:.:. : .: .: : . .: ... . : : . ..: :: :
CCDS44 LPAPGREKEITASPD--YLEIAIYCIGVFLIACMVVTVILCRMKNTT-KKPDFSSQPA-V
250 260 270 280 290 300
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 QKLS-RFPLARQFSLESGSSGKSSSSLVR-GVRLSSSGPA-LLAGLVSLDLPLDPLWEFP
.::. :.:: :: : ::.:: .:.. ::: .::::.. . .:::. .:: :: ::::
CCDS44 HKLTKRIPLRRQVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTADTPMLAGVSEYELPEDPKWEFP
310 320 330 340 350 360
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 RDRLVLGKPLGEGCFGQVVRAEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEMEV
::.:.:::::::::::::: ::: :.: .: .: :::::::::.:..:::.:::::::.
CCDS44 RDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVAVKMLKDDATEKDLSDLVSEMEM
370 380 390 400 410 420
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 MKLIGRHKNIINLLGVCTQEGPLYVIVECAAKGNLREFLRARRPPGPDLSPDGPRSSEGP
::.::.:::::::::.:::.:::::::: :.::::::.:::::::: . : : : :
CCDS44 MKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLRARRPPGMEYSYDINRVPEEQ
430 440 450 460 470 480
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 LSFPVLVSCAYQVARGMQYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHIDYY
..: ::::.::.::::.:: :.::::::::::::::::.:::::::::::: ...::::
CCDS44 MTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTENNVMKIADFGLARDINNIDYY
490 500 510 520 530 540
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 KKTSNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFSLLR
:::.:::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::.::.
CCDS44 KKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLK
550 560 570 580 590 600
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 EGHRMDRPPHCPPELYGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVL-LAVSEEYLDLRLTFG
::::::.: .: ::: .::.::::.:::::::::::: ::..: :...:::::: .
CCDS44 EGHRMDKPANCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRILTLTTNEEYLDLSQPLE
610 620 630 640 650 660
770 780 790 800
pF1KE1 PYSPSGGDASSTCSSSD-SVFSHDPLPLGSSSFPFGSGVQT
:::: :. :.:::.: :::: ::.:
CCDS44 QYSPSYPDTRSSCSSGDDSVFSPDPMPYEPCLPQYPHINGSVKT
670 680 690 700
>>CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 (731 aa)
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Smith-Waterman score: 2950; 63.0% identity (82.8% similar) in 703 aa overlap (100-788:18-711)
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GSRLAPAGRVRGWRGRLEIASFLPEDAGRYLCLARGSMIVLQNLTLITGDSLTSS--NDD
:: :: : :: :.: :: .::
CCDS43 MWSWKCLLFWAVLVTATLCTARPSP------TLPEQDALPSSEDDDD
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EDPKSHRDPSNRHSYPQQ-APYWTHPQRMEKKLHAVPAGNTVKFRCPAAGNPTPTIRWLK
.: .: .. . .. :. ::::: :..::::::::::..::::.::..:.:.::.::::
CCDS43 DDDSSSEEKETDNTKPNPVAPYWTSPEKMEKKLHAVPAAKTVKFKCPSSGTPNPTLRWLK
50 60 70 80 90 100
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pF1KE1 DGQAFHGENRIGGIRLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVENAVGSIRYNYLLDVLERSP
.:. :. ..:::: ..:. ::..:.::::::.:.:::.::: ::: ..: :::.::::
CCDS43 NGKEFKPDHRIGGYKVRYATWSIIMDSVVPSDKGNYTCIVENEYGSINHTYQLDVVERSP
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HRPILQAGLPANTTAVVGSDVELLCKVYSDAQPHIQWLKHIVINGSSFGADGFPYVQVLK
:::::::::::: :...::.::..:::::: :::::::::: .:::..: :..::::.::
CCDS43 HRPILQAGLPANKTVALGSNVEFMCKVYSDPQPHIQWLKHIEVNGSKIGPDNLPYVQILK
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TADINSS--EVEVLYLRNVSAEDAGEYTCLAGNSIGLSYQSAWLTVLP--EEDPTWTAAA
:: .:.. :.:::.::::: :::::::::::::::::..::::::: :: : :.
CCDS43 TAGVNTTDKEMEVLHLRNVSFEDAGEYTCLAGNSIGLSHHSAWLTVLEALEERP---AVM
230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 PEARYTDIILYASGSLALAVLLLLAGLYRGQALHGRHP-RPPATVQKLSR-FPLARQFSL
: .::.: .:.. .. .. . .:. .. . . .:.::.. .:: :: ..
CCDS43 TSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHSQMAVHKLAKSIPLRRQVTV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470
pF1KE1 ESGSSGKSSSS--LVRGVRLSSSGPALLAGLVSLDLPLDPLWEFPRDRLVLGKPLGEGCF
. ::.. .:. ::: :::::: .:::. .:: :: ::.::::::::::::::::
CCDS43 SADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWELPRDRLVLGKPLGEGCF
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 GQVVRAEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIGRHKNIINLLG
:::: :::.:.: .:.... :::::::..:..:::.::.::::.::.::.:::::::::
CCDS43 GQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLG
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 VCTQEGPLYVIVECAAKGNLREFLRARRPPGPDLSPDGPRSSEGPLSFPVLVSCAYQVAR
.:::.:::::::: :.::::::.:.:::::: . . .. : :: ::::::::::
CCDS43 ACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEYCYNPSHNPEEQLSSKDLVSCAYQVAR
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 GMQYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHIDYYKKTSNGRLPVKWMAP
::.:: :.::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::.:::::::::::
CCDS43 GMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAP
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 EALFDRVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFSLLREGHRMDRPPHCPPEL
::::::.:::::::::::.:::::::::::::::.::::::.::.::::::.: .: ::
CCDS43 EALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNEL
580 590 600 610 620 630
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 YGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVL-LAVSEEYLDLRLTFGPYSPSGGDA-SSTCS
: .::.::::.:::::::::::: ::... :. ..::::: . . :::: :. :::::
CCDS43 YMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQEYLDLSMPLDQYSPSFPDTRSSTCS
640 650 660 670 680 690
780 790 800
pF1KE1 SS-DSVFSHDPLPLGSSSFPFGSGVQT
:. ::::::.:::
CCDS43 SGEDSVFSHEPLPEEPCLPRHPAQLANGGLKRR
700 710 720 730
>>CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 (812 aa)
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Smith-Waterman score: 3016; 60.9% identity (82.4% similar) in 739 aa overlap (65-788:57-792)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 APSLEQQEQELTVALGQPVRLCCGRAERGGHWYKEGSRLAPAGRVRGWRGRLEIASFLPE
.: ..: .:: ..:.: ..:. . .:
CCDS55 GAPVEVESFLVHPGDLLQLRCRLRDDVQSINWLRDGVQLAESNRTRITGEEVEVQDSVPA
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140
pF1KE1 DAGRYLCLARG-SMIVLQNLTLITGDSLTSS--NDDEDPKSHRDPSNRHSYPQQ---APY
:.: : :.. . : ... ..:.: :: .::.: .: .. . .. :.. :::
CCDS55 DSGLYACVTSSPSGSDTTYFSVNVSDALPSSEDDDDDDDSSSEEKETDNTKPNRMPVAPY
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 WTHPQRMEKKLHAVPAGNTVKFRCPAAGNPTPTIRWLKDGQAFHGENRIGGIRLRHQHWS
:: :..::::::::::..::::.::..:.:.::.::::.:. :. ..:::: ..:. ::
CCDS55 WTSPEKMEKKLHAVPAAKTVKFKCPSSGTPNPTLRWLKNGKEFKPDHRIGGYKVRYATWS
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 LVMESVVPSDRGTYTCLVENAVGSIRYNYLLDVLERSPHRPILQAGLPANTTAVVGSDVE
..:.::::::.:.:::.::: ::: ..: :::.:::::::::::::::: :...::.::
CCDS55 IIMDSVVPSDKGNYTCIVENEYGSINHTYQLDVVERSPHRPILQAGLPANKTVALGSNVE
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 LLCKVYSDAQPHIQWLKHIVINGSSFGADGFPYVQVLKTADINSS--EVEVLYLRNVSAE
..:::::: :::::::::: .:::..: :..::::.:::: .:.. :.:::.::::: :
CCDS55 FMCKVYSDPQPHIQWLKHIEVNGSKIGPDNLPYVQILKTAGVNTTDKEMEVLHLRNVSFE
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 DAGEYTCLAGNSIGLSYQSAWLTVLP--EEDPTWTAAAPEARYTDIILYASGSLALAVLL
::::::::::::::::..::::::: :: : :. : .::.: .:.. .. ..
CCDS55 DAGEYTCLAGNSIGLSHHSAWLTVLEALEERP---AVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMV
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 LLAGLYRGQALHGRHP-RPPATVQKLSR-FPLARQFSLESGSSGKSSSSLVRGVRLSSSG
. .:. .. . . .:.::.. .:: :: : .:..: .:. ::: ::::::
CCDS55 GSVIVYKMKSGTKKSDFHSQMAVHKLAKSIPLRRQVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSG
390 400 410 420 430 440
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pF1KE1 PALLAGLVSLDLPLDPLWEFPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVRAEAFGMDPARPDQASTVAV
.:::. .:: :: ::.:::::::::::::::::::: :::.:.: .:.... :::
CCDS55 TPMLAGVSEYELPEDPRWELPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAV
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 KMLKDNASDKDLADLVSEMEVMKLIGRHKNIINLLGVCTQEGPLYVIVECAAKGNLREFL
::::..:..:::.::.::::.::.::.:::::::::.:::.:::::::: :.::::::.:
CCDS55 KMLKSDATEKDLSDLISEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYL
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KE1 RARRPPGPDLSPDGPRSSEGPLSFPVLVSCAYQVARGMQYLESRKCIHRDLAARNVLVTE
.:::::: . . .. : :: ::::::::::::.:: :.::::::::::::::::
CCDS55 QARRPPGLEYCYNPSHNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTE
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KE1 DNVMKIADFGLARGVHHIDYYKKTSNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGILLWEI
::::::::::::: .:::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::.:::::
CCDS55 DNVMKIADFGLARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEI
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KE1 FTLGGSPYPGIPVEELFSLLREGHRMDRPPHCPPELYGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEA
::::::::::.::::::.::.::::::.: .: ::: .::.::::.::::::::::::
CCDS55 FTLGGSPYPGVPVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVED
690 700 710 720 730 740
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pF1KE1 LDKVL-LAVSEEYLDLRLTFGPYSPSGGDA-SSTCSSS-DSVFSHDPLPLGSSSFPFGSG
::... :. ..::::: . . :::: :. ::::::. ::::::.:::
CCDS55 LDRIVALTSNQEYLDLSMPLDQYSPSFPDTRSSTCSSGEDSVFSHEPLPEEPCLPRHPAQ
750 760 770 780 790 800
800
pF1KE1 VQT
CCDS55 LANGGLKRR
810
>>CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 (820 aa)
initn: 2629 init1: 1715 opt: 2949 Z-score: 1429.8 bits: 275.5 E(32554): 2.5e-73
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10 20 30 40 50
pF1KE1 LALLGVLLSVPGPPVLSLEASEEVELEPCLAPSLEQQEQ------ELTVALGQPVRL---
.:.: .: : :. : .: :
CCDS55 MWSWKCLLFWAVLVTATLCTARPSPTLPEQAQPWGAPVEVESFLVHPGDLLQL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 -CCGRAE-RGGHWYKEGSRLAPAGRVRGWRGRLEIASFLPEDAGRYLCLARG-SMIVLQN
: : . .. .: ..: .:: ..:.: ..:. . .: :.: : :.. . :
CCDS55 RCRLRDDVQSINWLRDGVQLAESNRTRITGEEVEVQDSVPADSGLYACVTSSPSGSDTTY
60 70 80 90 100 110
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pF1KE1 LTLITGDSLTSS--NDDEDPKSHRDPSNRHSYPQQ---APYWTHPQRMEKKLHAVPAGNT
... ..:.: :: .::.: .: .. . .. :.. ::::: :..::::::::::..:
CCDS55 FSVNVSDALPSSEDDDDDDDSSSEEKETDNTKPNRMPVAPYWTSPEKMEKKLHAVPAAKT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 VKFRCPAAGNPTPTIRWLKDGQAFHGENRIGGIRLRHQHWSLVMESVVPSDRGTYTCLVE
:::.::..:.:.::.::::.:. :. ..:::: ..:. ::..:.::::::.:.:::.::
CCDS55 VKFKCPSSGTPNPTLRWLKNGKEFKPDHRIGGYKVRYATWSIIMDSVVPSDKGNYTCIVE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 NAVGSIRYNYLLDVLERSPHRPILQAGLPANTTAVVGSDVELLCKVYSDAQPHIQWLKHI
: ::: ..: :::.:::::::::::::::: :...::.::..:::::: ::::::::::
CCDS55 NEYGSINHTYQLDVVERSPHRPILQAGLPANKTVALGSNVEFMCKVYSDPQPHIQWLKHI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 VINGSSFGADGFPYVQVLKTADINSS--EVEVLYLRNVSAEDAGEYTCLAGNSIGLSYQS
.:::..: :..::::.:::: .:.. :.:::.::::: :::::::::::::::::..:
CCDS55 EVNGSKIGPDNLPYVQILKTAGVNTTDKEMEVLHLRNVSFEDAGEYTCLAGNSIGLSHHS
300 310 320 330 340 350
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pF1KE1 AWLTVLP--EEDPTWTAAAPEARYTDIILYASGSLALAVLLLLAGLYRGQALHGRHP-RP
:::::: :: : :. : .::.: .:.. .. .. . .:. .. . .
CCDS55 AWLTVLEALEERP---AVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 PATVQKLSR-FPLARQFSLESGSSGKSSSSLVRGVRLSSSGPALLAGLVSLDLPLDPLWE
.:.::.. .:: :: : .:..: .:. ::: :::::: .:::. .:: :: ::
CCDS55 QMAVHKLAKSIPLRRQVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWE
420 430 440 450 460 470
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pF1KE1 FPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVRAEAFGMDPARPDQASTVAVKMLKDNASDKDLADLVSEM
.:::::::::::::::::::: :::.:.: .:.... :::::::..:..:::.::.:::
CCDS55 LPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEM
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 EVMKLIGRHKNIINLLGVCTQEGPLYVIVECAAKGNLREFLRARRPPGPDLSPDGPRSSE
:.::.::.:::::::::.:::.:::::::: :.::::::.:.:::::: . . .. :
CCDS55 EMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEYCYNPSHNPE
540 550 560 570 580 590
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pF1KE1 GPLSFPVLVSCAYQVARGMQYLESRKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARGVHHID
:: ::::::::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::::::: .::::
CCDS55 EQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDIHHID
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 YYKKTSNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGILLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFSL
:::::.:::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::.::::::.:
CCDS55 YYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPVEELFKL
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 LREGHRMDRPPHCPPELYGLMRECWHAAPSQRPTFKQLVEALDKVL-LAVSEEYLDLRLT
:.::::::.: .: ::: .::.::::.:::::::::::: ::... :. ..::::: .
CCDS55 LKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQEYLDLSMP
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800
pF1KE1 FGPYSPSGGDA-SSTCSSS-DSVFSHDPLPLGSSSFPFGSGVQT
. :::: :. ::::::. ::::::.:::
CCDS55 LDQYSPSFPDTRSSTCSSGEDSVFSHEPLPEEPCLPRHPAQLANGGLKRR
780 790 800 810 820
802 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 23:04:21 2016 done: Sun Nov 6 23:04:21 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]