Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1314
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1314, 559 aa
1>>>pF1KE1314 559 - 559 aa - 559 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7944+/-0.00125; mu= 11.1270+/- 0.074
mean_var=116.7865+/-22.002, 0's: 0 Z-trim(104.6): 68 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.118680
statistics sampled from 7915 (7975) to 7915 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 3.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3929.1 C9 gene_id:735|Hs108|chr5 ( 559) 3796 661.8 6.1e-190
CCDS606.1 C8A gene_id:731|Hs108|chr1 ( 584) 906 167.0 5.7e-41
CCDS60151.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 529) 488 95.4 1.9e-19
CCDS60152.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 539) 488 95.4 1.9e-19
CCDS30730.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 591) 488 95.4 2e-19
CCDS3936.1 C6 gene_id:729|Hs108|chr5 ( 934) 453 89.6 1.9e-17
CCDS47201.1 C7 gene_id:730|Hs108|chr5 ( 843) 423 84.4 6e-16
>>CCDS3929.1 C9 gene_id:735|Hs108|chr5 (559 aa)
initn: 3796 init1: 3796 opt: 3796 Z-score: 3523.5 bits: 661.8 E(32554): 6.1e-190
Smith-Waterman score: 3796; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSACRSFAVAICILEISILTAQYTTSYDPELTESSGSASHIDCRMSPWSEWSQCDPCLRQ
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CCDS39 MSACRSFAVAICILEISILTAQYTTSYDPELTESSGSASHIDCRMSPWSEWSQCDPCLRQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 MFRSRSIEVFGQFNGKRCTDAVGDRRQCVPTEPCEDAEDDCGNDFQCSTGRCIKMRLRCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MFRSRSIEVFGQFNGKRCTDAVGDRRQCVPTEPCEDAEDDCGNDFQCSTGRCIKMRLRCN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GDNDCGDFSDEDDCESEPRPPCRDRVVEESELARTAGYGINILGMDPLSTPFDNEFYNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 GDNDCGDFSDEDDCESEPRPPCRDRVVEESELARTAGYGINILGMDPLSTPFDNEFYNGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 CNRDRDGNTLTYYRRPWNVASLIYETKGEKNFRTEHYEEQIEAFKSIIQEKTSNFNAAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 CNRDRDGNTLTYYRRPWNVASLIYETKGEKNFRTEHYEEQIEAFKSIIQEKTSNFNAAIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LKFTPTETNKAEQCCEETASSISLHGKGSFRFSYSKNETYQLFLSYSSKKEKMFLHVKGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LKFTPTETNKAEQCCEETASSISLHGKGSFRFSYSKNETYQLFLSYSSKKEKMFLHVKGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 IHLGRFVMRNRDVVLTTTFVDDIKALPTTYEKGEYFAFLETYGTHYSSSGSLGGLYELIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 IHLGRFVMRNRDVVLTTTFVDDIKALPTTYEKGEYFAFLETYGTHYSSSGSLGGLYELIY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 VLDKASMKRKGVELKDIKRCLGYHLDVSLAFSEISVGAEFNKDDCVKRGEGRAVNITSEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 VLDKASMKRKGVELKDIKRCLGYHLDVSLAFSEISVGAEFNKDDCVKRGEGRAVNITSEN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LIDDVVSLIRGGTRKYAFELKEKLLRGTVIDVTDFVNWASSINDAPVLISQKLSPIYNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LIDDVVSLIRGGTRKYAFELKEKLLRGTVIDVTDFVNWASSINDAPVLISQKLSPIYNLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PVKMKNAHLKKQNLERAIEDYINEFSVRKCHTCQNGGTVILMDGKCLCACPFKFEGIACE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 PVKMKNAHLKKQNLERAIEDYINEFSVRKCHTCQNGGTVILMDGKCLCACPFKFEGIACE
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE1 ISKQKISEGLPALEFPNEK
:::::::::::::::::::
CCDS39 ISKQKISEGLPALEFPNEK
550
>>CCDS606.1 C8A gene_id:731|Hs108|chr1 (584 aa)
initn: 695 init1: 327 opt: 906 Z-score: 849.0 bits: 167.0 E(32554): 5.7e-41
Smith-Waterman score: 939; 30.1% identity (60.5% similar) in 569 aa overlap (7-552:2-538)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSACRSFAVAICILEISILTAQYTTSYDPELTES---SGSASHIDCRMSPWSEWSQCDPC
:::.. :: :..: : .. . .... ... . . :..: ::::..: ::
CCDS60 MFAVVFFIL--SLMTCQPGVTAQEKVNQRVRRAATPAAVTCQLSNWSEWTDCFPC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LRQMFRSRSIEVFGQFNGKRCTDAVGDRRQCVPTEPCEDAEDDCGNDFQCS-TGRCIKMR
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CCDS60 QDKKYRHRSLLQPNKFGGTICSGDIWDQASCSSSTTCVR-QAQCGQDFQCKETGRCLKRH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LRCNGDNDCGDFSDEDDCESEPRPPCRD-RVVEESELARTAGYGINILGMDPLSTPFDNE
: ::::.:: : ::::::: . : .: : .. :. : ::: .. .. .:
CCDS60 LVCNGDQDCLDGSDEDDCE-DVRAIDEDCSQYEPIPGSQKAALGYNILTQEDAQSVYDAS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KE1 FYNG-----------------LCNRDRDGNTLTYYRRPWNVASLIYETKGEKNFRTEHYE
.:.: :.: :. :.:.:.: . .:. .. .. .: :.
CCDS60 YYGGQCETVYNGEWRELRYDSTCERLYYGDDEKYFRKPYNFLKYHFEALADTGISSEFYD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 EQIEAFKSIIQEKTSNFNAAISLKFTPTETNKAEQCCEETASSISLHGKGSFRFSYSKNE
. . .... ..:...:...:.. : :.: : : : :.:..
CCDS60 NANDLLSKVKKDKSDSFGVTIGIG--P-------------AGSPLLVGVG---VSHSQDT
240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 TYQLFLSYSSKKEKMFLHVKGEIHLGRFVMRNRDVVLTTTFVDDIKALPTTYEKGEYFAF
.. :. ..:. .: .. ... ..: ::. :..: ..... :: :. : : :
CCDS60 SFLNELNKYNEKKFIFTRIFTKVQTAHFKMRKDDIMLDEGMLQSLMELPDQYNYGMYAKF
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 LETYGTHYSSSGSLGGLYELIYVLDKASMKRKGVELKDIKRCLGYHLDVSLAFSEISVGA
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CCDS60 INDYGTHYITSGSMGGIYEYILVIDKAKMESLGITSRDITTCFGGSLGIQYE-DKINVGG
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 EFNKDDCVKRGEGRAVNITSENLIDDVVSLIRGGTRKYAFELKEKLLRGTVIDVTDFVNW
.. : : : : :.. . ..:..: .:::. .. : .. :.:. . .:
CCDS60 GLSGDHCKKFGGGKTERARKAMAVEDIISRVRGGSSGWSGGLAQN--RSTI----TYRSW
400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 ASSINDAPVLISQKLSPIYNLV-PVKMKNAHLKKQNLERAIEDYINEFSVRKCHTCQNGG
. :.. ::.:. ...::.... ... . :.:::.::...:. ::.. .: : :.:
CCDS60 GRSLKYNPVVIDFEMQPIHEVLRHTSLGPLEAKRQNLRRALDQYLMEFNACRCGPCFNNG
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550
pF1KE1 TVILMDGKCLCACPFKFEGIACEISKQKISEGLPALEFPNEK
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CCDS60 VPILEGTSCRCQCRLGSLGAACE---QTQTEGAKADGSWSCWSSWSVCRAGIQERRRECD
510 520 530 540 550 560
CCDS60 NPAPQNGGASCPGRKVQTQAC
570 580
>>CCDS60151.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 (529 aa)
initn: 595 init1: 250 opt: 488 Z-score: 462.8 bits: 95.4 E(32554): 1.9e-19
Smith-Waterman score: 722; 29.0% identity (60.8% similar) in 479 aa overlap (72-545:32-478)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 DCRMSPWSEWSQCDPCLRQMFRSRSIEVFGQFNGKRCTDAVGDRRQCVPTEPCEDAEDDC
::.:. :. . . ..:: ..:: .. :
CCDS60 DTCMTLAFTLSGRFFMLLSQYRYAYLLQPSQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPC-GSQVRC
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 GNDFQCS-TGRCIKMRLRCNGDNDCGDFSDEDDCESEPRPPCRDRVVEESELARTAGYGI
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CCDS60 -EGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCGDQSDEANCR-RIYKKCQHEMDQYWGIGSLAS-GI
70 80 90 100 110
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 NILGMDPLSTPFDNEFYNGLCNRDRDGNTLTYYRRPWNVASLIYETKGEKNFRTEHYEEQ
:.. . . .:...: : :. :: .:.:.:: : .:.:. .: ..::
CCDS60 NLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNT--RFRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYESY
120 130 140 150 160 170
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 IEAFKSIIQEKTSNFNAAISLKFTPTETNKAEQCCEETASSISLHGKGSFRFSYSKNETY
. :. . :: .. ....:. : : : :: : .:: .: ... .
CCDS60 SD-FERNVTEKMAS-KSGFSFGF------KIPGIFELGISSQSDRGKHYIR----RTKRF
180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 QLFLSYSSKKEKMFLHVKGEIHLGRFVMRNRDVVLTTTFVDDIKALPTTYEKGEYFAFLE
:. ...:::.......... .. :...: :.. .: :: : ::: ...
CCDS60 -------SHTKSVFLHARSDLEVAHYKLKPRSLMLHYEFLQRVKRLPLEYSYGEYRDLFR
230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 TYGTHYSSSGSLGGLYELIYVLDKASMKRKGVELKDIKRCLGYHLDVSLAFSEISVGAEF
.:::: . . :::.:: :..: .:.: :.... : . .. :. :. :.
CCDS60 DFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACAKNDFKIGGAIEEVYVSLGV
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450
pF1KE1 NKDDCVKRG---EGRAVNITSENLIDDVVSLIRGGTRKYAFELKEKLLRGTVIDVTDFVN
. : :: : . : .....:.: :.:::. .. : . : . :. . .
CCDS60 SVGKC--RGILNEIKDRN-KRDTMVEDLVVLVRGGASEHITTLAYQEL--PTADLMQ--E
340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 WASSINDAPVLISQKLSPIYNLVPVK-MKNAHLKKQNLERAIEDYINEFSVRKCHTCQNG
:..... :..:. :. :.:.:: . . . .::...:.:.. .: : .: ::..
CCDS60 WGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFAYSSTVRQNMKQALEEFQKEVSSCHCAPCQGN
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550
pF1KE1 GTVILMDGKCLCACPFKFEGIACEISKQKISEGLPALEFPNEK
:. .: ..: : :: .:.:::.: .:
CCDS60 GVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACEVSYRKNTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRKTRQRQCNNP
450 460 470 480 490 500
>>CCDS60152.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 (539 aa)
initn: 705 init1: 250 opt: 488 Z-score: 462.7 bits: 95.4 E(32554): 1.9e-19
Smith-Waterman score: 832; 29.6% identity (61.0% similar) in 510 aa overlap (41-545:11-488)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 ICILEISILTAQYTTSYDPELTESSGSASHIDCRMSPWSEWSQCDPCLRQMFRSRSIEVF
:::..: :: :. :::: .. .: .
CCDS60 MRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQP
10 20 30 40
80 90 100 110 120
pF1KE1 GQFNGKRCTDAVGDRRQCVPTEPCEDAEDDCGNDFQCS-TGRCIKMRLRCNGDNDCGDFS
.::.:. :. . . ..:: ..:: .. : . : :. ::::.. :: ::::::::: :
CCDS60 SQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPC-GSQVRC-EGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCGDQS
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DEDDCESEPRPPCRDRVVEESELARTAGYGINILGMDPLSTPFDNEFYNGLCNRDRDGNT
:: .:. . :. .. . .. :. :::.. . . .:...: : :. ::
CCDS60 DEANCR-RIYKKCQHEMDQYWGIGSLAS-GINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LTYYRRPWNVASLIYETKGEKNFRTEHYEEQIEAFKSIIQEKTSNFNAAISLKFTPTETN
.:.:.:: : .:.:. .: ..:: . :. . :: .. ....:. :
CCDS60 --RFRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYESYSD-FERNVTEKMAS-KSGFSFGF------
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KAEQCCEETASSISLHGKGSFRFSYSKNETYQLFLSYSSKKEKMFLHVKGEIHLGRFVMR
: : :: : .:: .: ... . :. ...:::.......... ..
CCDS60 KIPGIFELGISSQSDRGKHYIR----RTKRF-------SHTKSVFLHARSDLEVAHYKLK
210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 NRDVVLTTTFVDDIKALPTTYEKGEYFAFLETYGTHYSSSGSLGGLYELIYVLDKASMKR
:...: :.. .: :: : ::: ... .:::: . . :::.:: :..: .:.:
CCDS60 PRSLMLHYEFLQRVKRLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMER
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 KGVELKDIKRCLGYHLDVSLAFSEISVGAEFNKDDCVKRG---EGRAVNITSENLIDDVV
:.... : . .. :. :. :. . : :: : . : .....:.:
CCDS60 GDYTLNNVHACAKNDFKIGGAIEEVYVSLGVSVGKC--RGILNEIKDRN-KRDTMVEDLV
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SLIRGGTRKYAFELKEKLLRGTVIDVTDFVNWASSINDAPVLISQKLSPIYNLVPVK-MK
:.:::. .. : . : . :. . .:..... :..:. :. :.:.:: . .
CCDS60 VLVRGGASEHITTLAYQEL--PTADLMQ--EWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFA
380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 NAHLKKQNLERAIEDYINEFSVRKCHTCQNGGTVILMDGKCLCACPFKFEGIACEISKQK
. .::...:.:.. .: : .: ::..:. .: ..: : :: .:.:::.: .:
CCDS60 YSSTVRQNMKQALEEFQKEVSSCHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACEVSYRK
430 440 450 460 470 480
550
pF1KE1 ISEGLPALEFPNEK
CCDS60 NTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRKTRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS
490 500 510 520 530
>>CCDS30730.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 (591 aa)
initn: 705 init1: 250 opt: 488 Z-score: 462.1 bits: 95.4 E(32554): 2e-19
Smith-Waterman score: 832; 29.6% identity (61.0% similar) in 510 aa overlap (41-545:63-540)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 ICILEISILTAQYTTSYDPELTESSGSASHIDCRMSPWSEWSQCDPCLRQMFRSRSIEVF
:::..: :: :. :::: .. .: .
CCDS30 ERPHSFGSNAVNKSFAKSRQMRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQP
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120
pF1KE1 GQFNGKRCTDAVGDRRQCVPTEPCEDAEDDCGNDFQCS-TGRCIKMRLRCNGDNDCGDFS
.::.:. :. . . ..:: ..:: .. : . : :. ::::.. :: ::::::::: :
CCDS30 SQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPC-GSQVRC-EGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCGDQS
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DEDDCESEPRPPCRDRVVEESELARTAGYGINILGMDPLSTPFDNEFYNGLCNRDRDGNT
:: .:. . :. .. . .. :. :::.. . . .:...: : :. ::
CCDS30 DEANCR-RIYKKCQHEMDQYWGIGSLAS-GINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNT
160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LTYYRRPWNVASLIYETKGEKNFRTEHYEEQIEAFKSIIQEKTSNFNAAISLKFTPTETN
.:.:.:: : .:.:. .: ..:: . :. . :: .. ....:. :
CCDS30 --RFRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYESYSD-FERNVTEKMAS-KSGFSFGF------
210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KAEQCCEETASSISLHGKGSFRFSYSKNETYQLFLSYSSKKEKMFLHVKGEIHLGRFVMR
: : :: : .:: .: ... . :. ...:::.......... ..
CCDS30 KIPGIFELGISSQSDRGKHYIR----RTKRF-------SHTKSVFLHARSDLEVAHYKLK
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 NRDVVLTTTFVDDIKALPTTYEKGEYFAFLETYGTHYSSSGSLGGLYELIYVLDKASMKR
:...: :.. .: :: : ::: ... .:::: . . :::.:: :..: .:.:
CCDS30 PRSLMLHYEFLQRVKRLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 KGVELKDIKRCLGYHLDVSLAFSEISVGAEFNKDDCVKRG---EGRAVNITSENLIDDVV
:.... : . .. :. :. :. . : :: : . : .....:.:
CCDS30 GDYTLNNVHACAKNDFKIGGAIEEVYVSLGVSVGKC--RGILNEIKDRN-KRDTMVEDLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SLIRGGTRKYAFELKEKLLRGTVIDVTDFVNWASSINDAPVLISQKLSPIYNLVPVK-MK
:.:::. .. : . : . :. . .:..... :..:. :. :.:.:: . .
CCDS30 VLVRGGASEHITTLAYQEL--PTADLMQ--EWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 NAHLKKQNLERAIEDYINEFSVRKCHTCQNGGTVILMDGKCLCACPFKFEGIACEISKQK
. .::...:.:.. .: : .: ::..:. .: ..: : :: .:.:::.: .:
CCDS30 YSSTVRQNMKQALEEFQKEVSSCHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACEVSYRK
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE1 ISEGLPALEFPNEK
CCDS30 NTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRKTRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS
550 560 570 580 590
>>CCDS3936.1 C6 gene_id:729|Hs108|chr5 (934 aa)
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240 250 260 270 280 290
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. .: :. . ... . ..: ... .. : ::.. :....
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::
CCDS39 ENCEKQSPDYKSNAVDGQWGCWSSWSTCDATYKRSRTRECNNPAPQRGGKRCEGEKRQEE
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CCDS47 GDSDCDEDSADEDRCEDSERRPSCDIDKPPPNIELT---GNGYNELTGQFRNRVINTKSF
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CCDS47 ---VKHTSTE---------HTSSS---RKRSFFRSSSSSSRSYTSHTNEIHKGKSYQLLV
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