FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1308, 524 aa
1>>>pF1KE1308 524 - 524 aa - 524 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6757+/-0.000745; mu= 12.3870+/- 0.045
mean_var=97.5051+/-19.806, 0's: 0 Z-trim(112.0): 15 B-trim: 560 in 1/49
Lambda= 0.129886
statistics sampled from 12855 (12869) to 12855 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.395), width: 16
Scan time: 2.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2760.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3 ( 524) 3571 679.2 3e-195
CCDS2761.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3 ( 484) 2336 447.8 1.3e-125
CCDS13066.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 539) 1296 252.9 6.6e-67
CCDS74700.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 516) 1268 247.7 2.4e-65
CCDS13065.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 566) 1268 247.7 2.6e-65
CCDS13067.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 580) 1268 247.7 2.7e-65
CCDS74701.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 ( 489) 1156 226.7 4.8e-59
CCDS4203.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5 ( 400) 860 171.2 2e-42
CCDS4202.1 CDC25C gene_id:995|Hs108|chr5 ( 473) 860 171.2 2.3e-42
>>CCDS2760.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3 (524 aa)
initn: 3571 init1: 3571 opt: 3571 Z-score: 3618.8 bits: 679.2 E(32554): 3e-195
Smith-Waterman score: 3571; 100.0% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASAAGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSDYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QPLEVKNNSNLQRMGSSESTDSGFCLDSPGPLDSKENLENPMRRIHSLPQKLLGCSPALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QPLEVKNNSNLQRMGSSESTDSGFCLDSPGPLDSKENLENPMRRIHSLPQKLLGCSPALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RSHSDSLDHDIFQLIDPDENKENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGKDLFTQRQNSAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RSHSDSLDHDIFQLIDPDENKENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGKDLFTQRQNSAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ARMLSSNERDSSEPGNFIPLFTPQSPVTATLSDEDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 WTAPLVMRTTNLDNRCKLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ESTNPEKAHETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ESTNPEKAHETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 DGKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DGKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE1 CEPPSYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CEPPSYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
490 500 510 520
>>CCDS2761.1 CDC25A gene_id:993|Hs108|chr3 (484 aa)
initn: 2327 init1: 2327 opt: 2336 Z-score: 2368.6 bits: 447.8 E(32554): 1.3e-125
Smith-Waterman score: 3203; 92.4% identity (92.4% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-484)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASAAGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSDYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASAAGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSDYE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QPLEVKNNSNLQRMGSSESTDSGFCLDSPGPLDSKENLENPMRRIHSLPQKLLGCSPALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QPLEVKNNSNLQRMGSSESTDSGFCLDSPGPLDSKENLENPMRRIHSLPQKLLGCSPALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RSHSDSLDHDIFQLIDPDENKENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGKDLFTQRQNSAP
:::::::::::::::::::::::
CCDS27 RSHSDSLDHDIFQLIDPDENKEN-------------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 ARMLSSNERDSSEPGNFIPLFTPQSPVTATLSDEDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ---LSSNERDSSEPGNFIPLFTPQSPVTATLSDEDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 WTAPLVMRTTNLDNRCKLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 WTAPLVMRTTNLDNRCKLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPK
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ESTNPEKAHETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ESTNPEKAHETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYI
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPT
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 DGKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DGKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSY
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KE1 CEPPSYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CEPPSYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
450 460 470 480
>>CCDS13066.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 (539 aa)
initn: 1303 init1: 532 opt: 1296 Z-score: 1314.6 bits: 252.9 E(32554): 6.6e-67
Smith-Waterman score: 1345; 44.6% identity (69.6% similar) in 523 aa overlap (30-522:39-537)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASA-AGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSD
:.:. . :.. ::::.:: :: .: ::::.
CCDS13 APGSALSPAGVCGGAQRPGHLPGLLLGSHGLLGSPVRAAASSPVTTLTQTMHDLAGLGSE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE1 YEQP----LEVKNNSNLQRMG-------------SSESTDSGFCLDSPGPLDSKENLENP
. : .. : : ... ::::.:.:.:.:::.:.: . ..
CCDS13 TPKSQVGTLLFRSRSRLTHLSLSRRASESSLSSESSESSDAGLCMDSPSPMDPHMAEQTF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 MRRIHSLPQKLLGCSPALKRSHSDSLDHDIFQLIDPDENKENEAFEFKKPVRPVSRGCLH
. :.. . . . . :..: :: . :: .: :: : .:. . :
CCDS13 EQAIQAASRIIRNEQFAIRR----------FQSM-PD------GFVFKMPWKPTHPSSTH
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE1 SHGLQEGK-DLFTQRQNSAPARMLSSNERDSSEPGNFIPLFTPQSPVTATLSD--EDDGF
. . .. . :.:: .::: : : .: . : .. :: . .: . .: :::::
CCDS13 ALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDR-KMEVEELSPLALGRFSLTPAEGDTEEDDGF
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VDLLDGENLKNEEETPSCMASLWTAPLVM-------RTTNLDNRC-KLFDSPSLCSSSTR
::.:... ::... .: : :: .:::: . . ..: .:: :::. : :
CCDS13 VDILESD-LKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEEEKDLVMYSKCQRLFRSPSMPCSVIR
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 SVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPKESTNPEKAHETLHQSLSLASSPKGTIENIL
.::: :: :... : ..:::.:.. :.:. . :. . . .: :: . :::.:
CCDS13 PILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVT--PPEEQQEAEEPKARVLRSKSLCHD---EIENLL
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 DNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYISPEIMASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYE
:.: :.::::.::..:..:: :::::::::::: :...:.:::.:.. .:::.:::::::
CCDS13 DSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALLTGKFSNIVDKFVIVDCRYPYE
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440
pF1KE1 YEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPTD-GKRVIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERD
::::::: :::: .:...:.::::.::.: . ::::..:::::::::::::::..::::
CCDS13 YEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRVILIFHCEFSSERGPRMCRFIRERD
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 RLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSYCEPPSYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWA
: :.::.:.:::.:.::::::::: . ..::: .::::.:: ::..:: :: :.:.::
CCDS13 RAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQDYRPMNHEAFKDELKTFRLKTRSWA
470 480 490 500 510 520
510 520
pF1KE1 GEKSKREMYSRLKKL
::.:.::. :::.
CCDS13 GERSRRELCSRLQDQ
530
>>CCDS74700.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 (516 aa)
initn: 1299 init1: 532 opt: 1268 Z-score: 1286.6 bits: 247.7 E(32554): 2.4e-65
Smith-Waterman score: 1360; 46.5% identity (71.9% similar) in 484 aa overlap (76-522:39-514)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 TVTMDQLQGLGSDYEQPLEVKNNSNLQRMGSSESTDSGFCLDSPGPLD---SKENLENPM
::::.:.:.:.:::.:.: .....:. .
CCDS74 QVGTLLFRSRSRLTHLSLSRRASESSLSSESSESSDAGLCMDSPSPMDPHMAEQTFEQAI
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140
pF1KE1 --------------RRIHSLPQKLLGCSPALKRSHSDSLDHDIFQLIDPD--------EN
::..:.: .::: ::.: :. ..: : . . :.
CCDS74 QAASRIIRNEQFAIRRFQSMPVRLLGHSPVL-RNITNSQAPDGRRKSEAGSGAASSSGED
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190
pF1KE1 KENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGK-DLFTQRQNSAPARMLSSNERDSSEPGNFIP
:::..: :: : .:. . :. . .. . :.:: .::: : : .: . : .. :
CCDS74 KENDGFVFKMPWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDR-KMEVEELSP
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LFTPQSPVTATLSD--EDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASLWTAPLVM-------RTT
: . .: . .: :::::::.:... ::... .: : :: .:::: .
CCDS74 LALGRFSLTPAEGDTEEDDGFVDILESD-LKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEEEKDL
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300
pF1KE1 NLDNRC-KLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPKESTNPEKAH
. ..: .:: :::. : : .::: :: :... : ..:::.:.. :.:. . :. .
CCDS74 VMYSKCQRLFRSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVT--PPEEQQEAEEPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYISPEIMASVL
. .: :: . :::.::.: :.::::.::..:..:: :::::::::::: :...:
CCDS74 ARVLRSKSLCHDE---IENLLDSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPTD-GKRVIVV
.:::.:.. .:::.:::::::::::::: :::: .:...:.::::.::.: . ::::..
CCDS74 TGKFSNIVDKFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRVILI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 FHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSYCEPPSYRP
:::::::::::::::..::::: :.::.:.:::.:.::::::::: . ..::: .:::
CCDS74 FHCEFSSERGPRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQDYRP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE1 MHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
:.:: ::..:: :: :.:.::::.:.::. :::.
CCDS74 MNHEAFKDELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
490 500 510
>>CCDS13065.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 (566 aa)
initn: 1273 init1: 532 opt: 1268 Z-score: 1286.0 bits: 247.7 E(32554): 2.6e-65
Smith-Waterman score: 1408; 45.3% identity (71.2% similar) in 534 aa overlap (30-522:39-564)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASA-AGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSD
:.:. . :.. ::::.:: :: .: ::::
CCDS13 APGSALSPAGVCGGAQRPGHLPGLLLGSHGLLGSPVRAAASSPVTTLTQTMHDLAGLGSR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE1 YEQP-LEVKNNSNLQRMGS--SESTDSGFCLDSPGPLD---SKENLENPM----------
. : .. .. . ..: :::.:.:.:.:::.:.: .....:. .
CCDS13 SRLTHLSLSRRASESSLSSESSESSDAGLCMDSPSPMDPHMAEQTFEQAIQAASRIIRNE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE1 ----RRIHSLPQKLLGCSPALKRSHSDSLDHDIFQLIDPD--------ENKENEAFEFKK
::..:.: .::: ::.: :. ..: : . . :.:::..: ::
CCDS13 QFAIRRFQSMPVRLLGHSPVL-RNITNSQAPDGRRKSEAGSGAASSSGEDKENDGFVFKM
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KE1 PVRPVSRGCLHSHGLQEGK-DLFTQRQNSAPARMLSSNERDSSEPGNFIPLFTPQSPVTA
: .:. . :. . .. . :.:: .::: : : .: . : .. :: . .:
CCDS13 PWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDR-KMEVEELSPLALGRFSLTP
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250
pF1KE1 TLSD--EDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASLWTAPLVM-------RTTNLDNRC-KLF
. .: :::::::.:... ::... .: : :: .:::: . . ..: .::
CCDS13 AEGDTEEDDGFVDILESD-LKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEEEKDLVMYSKCQRLF
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 DSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPKESTNPEKAHETLHQSLSLA
:::. : : .::: :: :... : ..:::.:.. :.:. . :. . . .: ::
CCDS13 RSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVT--PPEEQQEAEEPKARVLRSKSLC
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 SSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYISPEIMASVLNGKFANLIKE
. :::.::.: :.::::.::..:..:: :::::::::::: :...:.:::.:.. .
CCDS13 HD---EIENLLDSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALLTGKFSNIVDK
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 FVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPTD-GKRVIVVFHCEFSSERG
:::.:::::::::::::: :::: .:...:.::::.::.: . ::::..::::::::::
CCDS13 FVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRVILIFHCEFSSERG
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 PRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSYCEPPSYRPMHHEDFKEDL
:::::..::::: :.::.:.:::.:.::::::::: . ..::: .::::.:: ::..:
CCDS13 PRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQDYRPMNHEAFKDEL
490 500 510 520 530 540
500 510 520
pF1KE1 KKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
: :: :.:.::::.:.::. :::.
CCDS13 KTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
550 560
>>CCDS13067.1 CDC25B gene_id:994|Hs108|chr20 (580 aa)
initn: 1360 init1: 532 opt: 1268 Z-score: 1285.8 bits: 247.7 E(32554): 2.7e-65
Smith-Waterman score: 1398; 44.5% identity (69.5% similar) in 548 aa overlap (30-522:39-578)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MELGPEPPHRRRLLFACSPPPASQPVVKALFGASA-AGGLSPVTNLTVTMDQLQGLGSD
:.:. . :.. ::::.:: :: .: ::::.
CCDS13 APGSALSPAGVCGGAQRPGHLPGLLLGSHGLLGSPVRAAASSPVTTLTQTMHDLAGLGSE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90
pF1KE1 YEQP----LEVKNNSNLQRMG-------------SSESTDSGFCLDSPGPLD---SKENL
. : .. : : ... ::::.:.:.:.:::.:.: .....
CCDS13 TPKSQVGTLLFRSRSRLTHLSLSRRASESSLSSESSESSDAGLCMDSPSPMDPHMAEQTF
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100 110 120 130
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CCDS13 EQAIQAASRIIRNEQFAIRRFQSMPVRLLGHSPVL-RNITNSQAPDGRRKSEAGSGAASS
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 --ENKENEAFEFKKPVRPVSRGCLHSHGLQEGK-DLFTQRQNSAPARMLSSNERDSSEPG
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CCDS13 SGEDKENDGFVFKMPWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDR-KMEVE
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240
pF1KE1 NFIPLFTPQSPVTATLSD--EDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASLWTAPLVM------
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CCDS13 ELSPLALGRFSLTPAEGDTEEDDGFVDILESD-LKDDDAVPPGMESLISAPLVKTLEKEE
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 -RTTNLDNRC-KLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEESPPGSTKRRKSMSGASPKESTNP
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CCDS13 EKDLVMYSKCQRLFRSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVT--PPEEQQEA
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EKAHETLHQSLSLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYISPEIM
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CCDS13 EEPKARVLRSKSLCHD---EIENLLDSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETM
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 ASVLNGKFANLIKEFVIIDCRYPYEYEGGHIKGAVNLHMEEEVEDFLLKKPIVPTD-GKR
...:.:::.:.. .:::.:::::::::::::: :::: .:...:.::::.::.: . ::
CCDS13 VALLTGKFSNIVDKFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKR
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430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VIVVFHCEFSSERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSYCEPP
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CCDS13 VILIFHCEFSSERGPRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQ
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490 500 510 520
pF1KE1 SYRPMHHEDFKEDLKKFRTKSRTWAGEKSKREMYSRLKKL
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CCDS13 DYRPMNHEAFKDELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
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pF1KE1 --------------RRIHSLPQKLLGCSPALKRSHSDSLDHDIFQLIDPD--------EN
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CCDS74 QAASRIIRNEQFAIRRFQSMPVRLLGHSPVL-RNITNSQAPDGRRKSEAGSGAASSSGED
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CCDS74 KENDGFVFKMPWKPTHPSSTHALAEWASRREAFAQRPSSAPDLMCLSPDR-KMEVEELSP
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pF1KE1 LFTPQSPVTATLSD--EDDGFVDLLDGENLKNEEETPSCMASLWTAPLVMRTTNLDNRC-
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CCDS74 LALGRFSLTPAEGDTEEDDGFVDILESD-LKD---------------LVMYS-----KCQ
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CCDS74 RLFRSPSMPCSVIRPILKRLERPQDRDTPVQNKRRRSVT--PPEEQQEAEEPKARVLRSK
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pF1KE1 SLASSPKGTIENILDNDPRDLIGDFSKGYLFHTVAGKHQDLKYISPEIMASVLNGKFANL
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CCDS74 SLCHDE---IENLLDSDHRELIGDYSKAFLLQTVDGKHQDLKYISPETMVALLTGKFSNI
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CCDS74 VDKFVIVDCRYPYEYEGGHIKTAVNLPLERDAESFLLKSPIAPCSLDKRVILIFHCEFSS
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pF1KE1 ERGPRMCRYVRERDRLGNEYPKLHYPELYVLKGGYKEFFMKCQSYCEPPSYRPMHHEDFK
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CCDS74 ERGPRMCRFIRERDRAVNDYPSLYYPEMYILKGGYKEFFPQHPNFCEPQDYRPMNHEAFK
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CCDS74 DELKTFRLKTRSWAGERSRRELCSRLQDQ
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pF1KE1 GENLKNEEETPSCMASLWTAPLVMRTTNLDNRCKLFDSPSLCSSSTRSVLKRPERSQEES
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CCDS42 SKVCALPTVSGKHQDLKYVNPETVAALLSGKFQGLIEKFYVIDCRYPYEYLGGHIQGALN
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::::.:::::..:: . . ::: :: ::::.: : .: . :..:.. ::.. ::. .
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: :
CCDS42 LVKDMSP
400
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CCDS42 CSSSANKENDNGNLVDSEMKYLGSPITT---------VPKLDKNPNLGEDQAEEISDELM
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. . :....:: . :: ..:..: . ::::::: . ::.::::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]