FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1183, 703 aa
1>>>pF1KE1183 703 - 703 aa - 703 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6165+/-0.000754; mu= 15.4883+/- 0.046
mean_var=111.0946+/-21.932, 0's: 0 Z-trim(112.2): 29 B-trim: 15 in 1/53
Lambda= 0.121682
statistics sampled from 12972 (13001) to 12972 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.399), width: 16
Scan time: 3.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32169.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 ( 715) 4034 718.9 6.3e-207
CCDS55954.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 ( 430) 2625 471.4 1.2e-132
CCDS8022.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 ( 668) 2163 390.4 4.5e-108
CCDS46267.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 515) 1968 356.1 7.3e-98
CCDS82441.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 594) 1968 356.2 8.2e-98
CCDS62900.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 ( 537) 1955 353.9 3.7e-97
CCDS81576.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 ( 495) 1665 302.9 7.3e-82
CCDS95.1 RERE gene_id:473|Hs108|chr1 (1566) 416 84.0 1.9e-15
>>CCDS32169.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 (715 aa)
initn: 3996 init1: 3996 opt: 4034 Z-score: 3828.5 bits: 718.9 E(32554): 6.3e-207
Smith-Waterman score: 4706; 98.2% identity (98.3% similar) in 715 aa overlap (1-703:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 KHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 KPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLCASC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLCASC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 WTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSPHGLPARSSGSPKFAMKTRQAFYLHTTKLTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSPHGLPARSSGSPKFAMKTRQAFYLHTTKLTR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 IARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLPEASQSPLVLKQAVRKPLEAVLRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLPEASQSPLVLKQAVRKPLEAVLRY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE1 LETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINNGSPTILGKRSYEQHNGVDG-------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINNGSPTILGKRSYEQHNGVDGNMKKRLL
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640
pF1KE1 -----LANHGQTRHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMNWIDAPDDVFYM
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MPSRGLANHGQARHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMNWIDAPDDVFYM
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 ATEETRKIRKLLSSSETKRAARRPYKPIALRQSQALPPRPPPPAPVNDEPIVIED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ATEETRKIRKLLSSSETKRAARRPYKPIALRQSQALPPRPPPPAPVNDEPIVIED
670 680 690 700 710
>>CCDS55954.1 MTA1 gene_id:9112|Hs108|chr14 (430 aa)
initn: 2625 init1: 2625 opt: 2625 Z-score: 2494.9 bits: 471.4 E(32554): 1.2e-132
Smith-Waterman score: 2625; 99.5% identity (99.7% similar) in 399 aa overlap (1-399:1-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 KHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 KPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLCASC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .
CCDS55 KPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYMSSLRILLDILEEIWWLENANPV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 WTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSPHGLPARSSGSPKFAMKTRQAFYLHTTKLTR
CCDS55 RWREARTKPQ
430
>>CCDS8022.1 MTA2 gene_id:9219|Hs108|chr11 (668 aa)
initn: 2315 init1: 1511 opt: 2163 Z-score: 2053.8 bits: 390.4 E(32554): 4.5e-108
Smith-Waterman score: 2663; 59.7% identity (77.1% similar) in 717 aa overlap (1-703:1-668)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::..:::::::.: .:::
CCDS80 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLVRRIEELNKTANGNVEAKVVCLFRRRDISSSLNSLAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 KHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPAT
..: :.::: ..: . :. .:::.:::::::::.::::::
CCDS80 SNAR-----------------EFEEESKQP---GVSEQQRHQLKHRELFLSRQFESLPAT
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDL
::::::::::::::. :..:::.:: ::::::.:: :::::::.:::::: .:::.: :
CCDS80 HIRGKCSVTLLNETDILSQYLEKEDCFFYSLVFDPVQKTLLADQGEIRVGCKYQAEIPDR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
: ::: :.:.:...: .::. :::::.::::::::::.:::::::::::::.:::::::
CCDS80 LVEGESDNRNQQKMEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSIRQPSLHM
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL
::::::::::::::::::..: ::..::.:.:::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS80 SAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRDEMEEWSASEAMLFEEAL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN
:::::::.::.:::::::::.::...::::::::::.::::::::::.:::::::::.:.
CCDS80 EKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLKAAEADSKLKQVYIPTYT
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 KPNPNQISVNNVKAGVVNGTGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLCASC
::::::: . : :. ::.: : .::::.:::: :::.::::::::::::::
CCDS80 KPNPNQIISVGSKPGM-NGAGFQ-----KGLTCESCHTTQSAQWYAWGPPNMQCRLCASC
350 360 370 380 390
430 440 450 460 470
pF1KE1 WTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSPH-GLPARSSGSP--------KFAMKTRQAF
: ::::::::: ::.:.: : .. . : . : .: :: :. :.::.:
CCDS80 WIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPYTTSANRAKLLAKNRQTF
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 YLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLPEASQSPLVLKQAVR
:.::::::.:::.::..:.: .:::.:: :::. ::::::. :::.:...:: .. ::
CCDS80 LLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSIRLPKAAKTPLKIHPLVR
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 KPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINNGSPTILGKRSYEQHNGV
:: .... : .. : :: :. .. . .. ... : : :. ::.:: :.
CCDS80 LPLATIVKDLVAQA-PLKP---KTPRGTKTPINRNQLSQ--NRGLGGIMVKRAYETMAGA
520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 DGLANHGQTRHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMNWIDAPDDVFYMATE
:. : . ::. . ::..: : .::...: :::. : ..::.
CCDS80 -GV----------P---FSANGRPLASG---IRSSSQPAAKRQKLNPADAPNPVVFVATK
570 580 590 600 610
660 670 680 690 700
pF1KE1 ETRKIRKLLSSSETKRAARRPYKPIALRQSQ-ALPPRPPPPAPVN----DEPIVIED
.:: .:: :. : .:::::: :. .. . :. : : ::: . .::::.::
CCDS80 DTRALRKALTHLEMRRAARRPNLPLKVKPTLIAVRPPVPLPAPSHPASTNEPIVLED
620 630 640 650 660
>>CCDS46267.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 (515 aa)
initn: 2259 init1: 1641 opt: 1968 Z-score: 1870.4 bits: 356.1 E(32554): 7.3e-98
Smith-Waterman score: 2537; 74.1% identity (86.5% similar) in 526 aa overlap (1-512:1-509)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::: :::
CCDS46 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTASGNVEAKVVCFYRRRDISNTLIMLAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 KHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPAT
::: ::::: :. .:: .: ::::.::::::::: ::::::
CCDS46 KHAK-----------------EIEEESETTVEADLTDKQKHQLKHRELFLSRQYESLPAT
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDL
::::::::.:::::::. :::..:: :::::::::. ::::::::::::: :::::: ..
CCDS46 HIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADKGEIRVGPRYQADIPEM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
: ::: : :.::.::..::. ..::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS46 LLEGESDEREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL
::::::::::::::::::... ::.:.:::.::: ::::::::::::::::::.::::::
CCDS46 SAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSASEASLFEEAL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN
:::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.
CCDS46 EKYGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPTYS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KE1 KPNPNQISVNNVKAGVVNG---TGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLC
::::::::..: : :.::: : :.: ::::::::.:::.:::::::::::::::
CCDS46 KPNPNQISTSNGKPGAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQSHQWYSWGPPNMQCRLC
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KE1 ASCWTYWKKYGGLKMPTRLDGER--PGPN------RSNMSPH---GLPARSSGSPKFAMK
: :: ::::::::::::. . :. :.:. ::..: . :.:.:..:::: :.:
CCDS46 AICWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAMQGMPVRNTGSPKSAVK
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 TRQAFYLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLPEASQSPLVL
:::::.:::: .:..::..:.. :: .:::.:.. :: :::.:::
CCDS46 TRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIRAECKMLLNS
470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 KQAVRKPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINNGSPTILGKRSYE
>>CCDS82441.1 MTA3 gene_id:57504|Hs108|chr2 (594 aa)
initn: 2389 init1: 1641 opt: 1968 Z-score: 1869.5 bits: 356.2 E(32554): 8.2e-98
Smith-Waterman score: 2699; 69.7% identity (83.6% similar) in 608 aa overlap (1-594:1-588)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTANGNVEAKVVCFYRRRDISSTLIALAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::: :::
CCDS82 MAANMYRVGDYVYFENSSSNPYLIRRIEELNKTASGNVEAKVVCFYRRRDISNTLIMLAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 KHATLSVCYKAGPGADNGEEGEIEEEMENPEMVDLPEKLKHQLRHRELFLSRQLESLPAT
::: ::::: :. .:: .: ::::.::::::::: ::::::
CCDS82 KHAK-----------------EIEEESETTVEADLTDKQKHQLKHRELFLSRQYESLPAT
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HIRGKCSVTLLNETESLKSYLEREDFFFYSLVYDPQQKTLLADKGEIRVGNRYQADITDL
::::::::.:::::::. :::..:: :::::::::. ::::::::::::: :::::: ..
CCDS82 HIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADKGEIRVGPRYQADIPEM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LKEGEEDGRDQSRLETQVWEAHNPLTDKQIDQFLVVARSVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
: ::: : :.::.::..::. ..::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS82 LLEGESDEREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSSSVRQPSLHM
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SAAAASRDITLFHAMDTLHKNIYDISKAISALVPQGGPVLCRDEMEEWSASEANLFEEAL
::::::::::::::::::... ::.:.:::.::: ::::::::::::::::::.::::::
CCDS82 SAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSASEASLFEEAL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPNYN
:::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.
CCDS82 EKYGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKLKQVYIPTYS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KE1 KPNPNQISVNNVKAGVVNG---TGAPGQSPGAGRACESCYTTQSYQWYSWGPPNMQCRLC
::::::::..: : :.::: : :.: ::::::::.:::.:::::::::::::::
CCDS82 KPNPNQISTSNGKPGAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQSHQWYSWGPPNMQCRLC
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KE1 ASCWTYWKKYGGLKMPTRLDGER--PGPN------RSNMSPH---GLPARSSGSPKFAMK
: :: ::::::::::::. . :. :.:. ::..: . :.:.:..:::: :.:
CCDS82 AICWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAMQGMPVRNTGSPKSAVK
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470 480 490 500 510 520
pF1KE1 TRQAFYLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLPEASQSPLVL
:::::.:::: .:..::..:.. :: .:::.:.. :: :::.:: . : : : :::
CCDS82 TRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIRAEYADRHAELSGSPLKS
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 KQAVRKPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINNGSPTILGKRSYE
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CCDS82 K-STRKPLACIIGYLEIHP-AKKPNVIRSTPS-LQTPTTKRMLTTPNHTSLSILGKRNYS
530 540 550 560 570 580
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pF1KE1 QHNGVDGLANHGQTRHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMNWIDAPDDVF
.:::.: :
CCDS82 HHNGLDELTCCVSD
590
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CCDS62 RQYESLPATHIRGKCSVALLNETESVLSYLDKEDTFFYSLVYDPSLKTLLADKGEIRVGP
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:::::: ..: ::: : :.::.::..::. ..::::.::::::::::.::::::::::::
CCDS62 RYQADIPEMLLEGESDEREQSKLEVKVWDPNSPLTDRQIDQFLVVARAVGTFARALDCSS
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:::::::::::::::::::::::::::... ::.:.:::.::: ::::::::::::::::
CCDS62 SVRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLYRHSYDLSSAISVLVPLGGPVLCRDEMEEWSAS
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pF1KE1 EANLFEEALEKYGKDFTDIQQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKL
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CCDS62 EASLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLTSIIEYYYMWKTTDRYVQQKRLKAAEAESKL
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::::::.: ::::::::..: : :.::: : :.: ::::::::.:::.::::::
CCDS62 KQVYIPTY-KPNPNQISTSNGKPGAVNGAVGTTFQPQNPLLGRACESCYATQSHQWYSWG
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CCDS62 PPNMQCRLCAICWLYWKKYGGLKMPTQSEEEKLSPSPTTEDPRVRSHVSRQAMQGMPVRN
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pF1KE1 SGSPKFAMKTRQAFYLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTARLP
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CCDS62 TGSPKSAVKTRQAFFLHTTYFTKFARQVCKNTLRLRQAARRPFVAINYAAIRAEYADRHA
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pF1KE1 EASQSPLVLKQAVRKPLEAVLRYLETHPRPPKPDPVKSVSSVLSSLTPAKVAPVINNGSP
: : ::: : ..:::: .. ::: :: ::. ..:. : :.. : .. . :. :
CCDS62 ELSGSPLKSK-STRKPLACIIGYLEIHP-AKKPNVIRSTPS-LQTPTTKRMLTTPNHTSL
460 470 480 490 500 510
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pF1KE1 TILGKRSYEQHNGVDGLANHGQTRHMGPSRNLLLNGKSYPTKVRLIRGGSLPPVKRRRMN
.:::::.: .:::.: :
CCDS62 SILGKRNYSHHNGLDELTCCVSD
520 530
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CCDS81 MEMKVWDPDNPLTDRQIDQFLVVARAVGTF
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:::::::::.:::::::::::::::::::::::::..: ::..::.:.::::::::::::
CCDS81 ARALDCSSSIRQPSLHMSAAAASRDITLFHAMDTLQRNGYDLAKAMSTLVPQGGPVLCRD
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CCDS81 EMEEWSASEAMLFEEALEKYGKDFNDIRQDFLPWKSLASIVQFYYMWKTTDRYIQQKRLK
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::::.:::::::::.:.::::::: . : :. ::.: : .::::.:::: :
CCDS81 AAEADSKLKQVYIPTYTKPNPNQIISVGSKPGM-NGAGFQ-----KGLTCESCHTTQSAQ
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pF1KE1 WYSWGPPNMQCRLCASCWTYWKKYGGLKMPTRLDGERPGPNRSNMSPH-GLPARSSGSP-
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CCDS81 WYAWGPPNMQCRLCASCWIYWKKYGGLKTPTQLEGATRGTTEPHSRGHLSRPEAQSLSPY
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pF1KE1 -------KFAMKTRQAFYLHTTKLTRIARRLCREILRPWHAARHPYLPINSAAIKAECTA
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CCDS81 TTSANRAKLLAKNRQTFLLQTTKLTRLARRMCRDLLQPRRAARRPYAPINANAIKAECSI
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:::.:...:: .. :: :: .... : .. : :: :. .. . .. ... :
CCDS81 RLPKAAKTPLKIHPLVRLPLATIVKDLVAQA-PLKP---KTPRGTKTPINRNQLSQ--NR
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CCDS81 GLGGIMVKRAYETMAGA-GVPFSANGR---P----LASG---------IRSSSQPAAKRQ
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700
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. .::::.::
CCDS81 SHPASTNEPIVLED
490
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CCDS95 DIFAAREFKARVDSFFYILGYNPETRRLNSTQGEIRVGPSHQAKLPDLQPFPSPDGDTVT
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. : :: ..: .. ..: .:::...:: : .:. . . .::::: : .
CCDS95 QHEELVWMP--GVNDCDLLMYLRAARSMAAFAGMCDGGST------EDGCVAASRDDTTL
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CCDS95 NALNTLHESGYDAGKALQRLVKKPVPKLIE---KCWTEDEVKRFVKGLRQYGKNFFRIRK
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CCDS95 ELLPNKETGELITFYYYWKKTPEAASSRAHRRHRRQAVFRRIKTRTASTP-VNTPSRPPS
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. .. : . : :.. .. .: ... ..:....: : . :..
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pF1KE1 VIED
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 22:02:40 2016 done: Sun Nov 6 22:02:41 2016
Total Scan time: 3.870 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]