Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1162
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1162, 567 aa
1>>>pF1KE1162 567 - 567 aa - 567 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2569+/-0.000693; mu= 17.7273+/- 0.043
mean_var=371.2370+/-77.450, 0's: 0 Z-trim(111.6): 2072 B-trim: 119 in 2/56
Lambda= 0.066565
statistics sampled from 17923 (20225) to 17923 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 9.670
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001008801 (OMIM: 616841) zinc finger protein 46 ( 522) 1841 192.4 3e-48
XP_016882932 (OMIM: 616841) PREDICTED: zinc finger ( 541) 1841 192.4 3.1e-48
XP_016882933 (OMIM: 616841) PREDICTED: zinc finger ( 469) 1814 189.7 1.7e-47
NP_001284554 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 458) 1793 187.7 7e-47
NP_001284553 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 492) 1793 187.8 7.2e-47
NP_653285 (OMIM: 613910) zinc finger protein 480 i ( 535) 1793 187.8 7.4e-47
XP_011524767 (OMIM: 613910) PREDICTED: zinc finger ( 535) 1793 187.8 7.4e-47
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1790 187.9 1.1e-46
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 1790 187.9 1.1e-46
NP_001099020 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_001264880 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_001264878 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_001264877 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_001264881 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_001099022 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_001099019 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
XP_016882440 (OMIM: 194558) PREDICTED: zinc finger ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_001099021 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_060770 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 [H ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_001264876 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_001264874 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_001264875 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1669 175.9 2.8e-43
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1628 172.3 5e-42
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1628 172.3 5e-42
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1628 172.3 5.2e-42
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1628 172.3 5.2e-42
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1628 172.3 5.2e-42
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1628 172.3 5.2e-42
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1628 172.3 5.2e-42
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1628 172.3 5.2e-42
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1628 172.3 5.2e-42
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1628 172.3 5.2e-42
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1628 172.3 5.2e-42
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1628 172.3 5.2e-42
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1628 172.3 5.2e-42
>>NP_001008801 (OMIM: 616841) zinc finger protein 468 is (522 aa)
initn: 1540 init1: 1540 opt: 1841 Z-score: 987.2 bits: 192.4 E(85289): 3e-48
Smith-Waterman score: 1841; 55.7% identity (75.7% similar) in 481 aa overlap (58-535:48-522)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 CNGAISAHCNLRLPDSNDSPASASRVAGITDLSRNCVIKELAPQQEGNPGEVFHTVTLEQ
:.: .:..: :. .:: ::.:: ::..
NP_001 SQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLVSLDISSKCMLKTLSSTGQGNT-EVIHTGTLHR
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 HEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSI
. .: : ::::.::.: :: :. ::..:: : . . . ..:. :.:.: ::: :
NP_001 QASHHIGEFCFHEIEKDIHGFEFQWKEDETNGHAAPMTEIKELAGSTGQHDQRHAGNKRI
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 KHQLGLSF---LPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSNK
: ::: :: ::.:: ::.:::: :.::::.:..:::: : . :::.:::
NP_001 KDQLGSSFHLHLPEPH---IFQSEGKIG--NQVEKSINNASSVSTSQRICCRPKTHISNK
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 CGTDFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKV
:.. . ::::::. . .::: .. :. :..: .: . .:. : :: :::.::::
NP_001 YGNNSLHSSLLTQKWEVHMREKSFECIQSFKSFNCSSLLKKHQIIHLEEKQCKCDVCGKV
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 FSQKSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRN
:.:: :: : : :::::::::::: ..:..:: : .:. .:::::::.: ::::::::.
NP_001 FNQKRYLACHRRCHTGEKPYKCNECGKTFGHNSSLFIHKALHTGEKPYECEECDKVFSRK
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 SCLALHQKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLA
: : :.. : ::::: :: : .::. : :..: ..:.:.::: ::::::::.. :.::
NP_001 SHLERHKRIHTGEKPYKCKVCDEAFAYNSYLAKHTILHTGEKPYTCNECGKVFNRLSTLA
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 THQRIHTGEKPYKCNECGKVFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRR
:.:.:::::::::.:: ::::. : : :: :::.:::::::.:: :::: .:.: :::
NP_001 RHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSRKSHLERHRRIHSGEKPYKCEECCKVFSRKSNLERHRR
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 VHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTG
.:::::::::. : :::. :.:. :: .::::::::::.::: :. ::: :. .:::
NP_001 IHTGEKPYKCKVCDKAFQRDSHLAQHQRVHTGEKPYKCNECGKTFGQTSSLIIHRRLHTG
440 450 460 470 480 490
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 EKPYKCNECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPY
:::::::::::.:: .:. :. .:.:.::
NP_001 EKPYKCNECGKTFSQMSSLVYHHRLHSGEKP
500 510 520
pF1KE1 KRN
>>XP_016882932 (OMIM: 616841) PREDICTED: zinc finger pro (541 aa)
initn: 1540 init1: 1540 opt: 1841 Z-score: 987.1 bits: 192.4 E(85289): 3.1e-48
Smith-Waterman score: 1841; 55.7% identity (75.7% similar) in 481 aa overlap (58-535:67-541)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 CNGAISAHCNLRLPDSNDSPASASRVAGITDLSRNCVIKELAPQQEGNPGEVFHTVTLEQ
:.: .:..: :. .:: ::.:: ::..
XP_016 SQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLVSLDISSKCMLKTLSSTGQGNT-EVIHTGTLHR
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 HEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSI
. .: : ::::.::.: :: :. ::..:: : . . . ..:. :.:.: ::: :
XP_016 QASHHIGEFCFHEIEKDIHGFEFQWKEDETNGHAAPMTEIKELAGSTGQHDQRHAGNKRI
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 KHQLGLSF---LPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSNK
: ::: :: ::.:: ::.:::: :.::::.:..:::: : . :::.:::
XP_016 KDQLGSSFHLHLPEPH---IFQSEGKIG--NQVEKSINNASSVSTSQRICCRPKTHISNK
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 CGTDFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKV
:.. . ::::::. . .::: .. :. :..: .: . .:. : :: :::.::::
XP_016 YGNNSLHSSLLTQKWEVHMREKSFECIQSFKSFNCSSLLKKHQIIHLEEKQCKCDVCGKV
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 FSQKSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRN
:.:: :: : : :::::::::::: ..:..:: : .:. .:::::::.: ::::::::.
XP_016 FNQKRYLACHRRCHTGEKPYKCNECGKTFGHNSSLFIHKALHTGEKPYECEECDKVFSRK
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 SCLALHQKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLA
: : :.. : ::::: :: : .::. : :..: ..:.:.::: ::::::::.. :.::
XP_016 SHLERHKRIHTGEKPYKCKVCDEAFAYNSYLAKHTILHTGEKPYTCNECGKVFNRLSTLA
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 THQRIHTGEKPYKCNECGKVFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRR
:.:.:::::::::.:: ::::. : : :: :::.:::::::.:: :::: .:.: :::
XP_016 RHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSRKSHLERHRRIHSGEKPYKCEECCKVFSRKSNLERHRR
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 VHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTG
.:::::::::. : :::. :.:. :: .::::::::::.::: :. ::: :. .:::
XP_016 IHTGEKPYKCKVCDKAFQRDSHLAQHQRVHTGEKPYKCNECGKTFGQTSSLIIHRRLHTG
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 EKPYKCNECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPY
:::::::::::.:: .:. :. .:.:.::
XP_016 EKPYKCNECGKTFSQMSSLVYHHRLHSGEKP
520 530 540
pF1KE1 KRN
>>XP_016882933 (OMIM: 616841) PREDICTED: zinc finger pro (469 aa)
initn: 1540 init1: 1540 opt: 1814 Z-score: 973.5 bits: 189.7 E(85289): 1.7e-47
Smith-Waterman score: 1814; 55.8% identity (75.6% similar) in 475 aa overlap (64-535:1-469)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 AHCNLRLPDSNDSPASASRVAGITDLSRNCVIKELAPQQEGNPGEVFHTVTLEQHEKHDI
..: :. .:: ::.:: ::... .: :
XP_016 MLKTLSSTGQGNT-EVIHTGTLHRQASHHI
10 20
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 EEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSIKHQLGL
::::.::.: :: :. ::..:: : . . . ..:. :.:.: ::: :: :::
XP_016 GEFCFHEIEKDIHGFEFQWKEDETNGHAAPMTEIKELAGSTGQHDQRHAGNKRIKDQLGS
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 SF---LPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSNKCGTDFI
:: ::.:: ::.:::: :.::::.:..:::: : . :::.::: :.. .
XP_016 SFHLHLPEPH---IFQSEGKI--GNQVEKSINNASSVSTSQRICCRPKTHISNKYGNNSL
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 CSSLLTQEQKSCIREKPYRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQKSN
::::::. . .::: .. :. :..: .: . .:. : :: :::.:::::.::
XP_016 HSSLLTQKWEVHMREKSFECIQSFKSFNCSSLLKKHQIIHLEEKQCKCDVCGKVFNQKRY
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 LARHWRVHTGEKPYKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALH
:: : : :::::::::::: ..:..:: : .:. .:::::::.: ::::::::.: : :
XP_016 LACHRRCHTGEKPYKCNECGKTFGHNSSLFIHKALHTGEKPYECEECDKVFSRKSHLERH
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 QKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIH
.. : ::::: :: : .::. : :..: ..:.:.::: ::::::::.. :.:: :.:.:
XP_016 KRIHTGEKPYKCKVCDEAFAYNSYLAKHTILHTGEKPYTCNECGKVFNRLSTLARHHRLH
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 TGEKPYKCNECGKVFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEK
::::::::.:: ::::. : : :: :::.:::::::.:: :::: .:.: :::.:::::
XP_016 TGEKPYKCEECDKVFSRKSHLERHRRIHSGEKPYKCEECCKVFSRKSNLERHRRIHTGEK
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 PYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKC
::::. : :::. :.:. :: .::::::::::.::: :. ::: :. .:::::::::
XP_016 PYKCKVCDKAFQRDSHLAQHQRVHTGEKPYKCNECGKTFGQTSSLIIHRRLHTGEKPYKC
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560
pF1KE1 NECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
:::::.:: .:. :. .:.:.::
XP_016 NECGKTFSQMSSLVYHHRLHSGEKP
450 460
>>NP_001284554 (OMIM: 613910) zinc finger protein 480 is (458 aa)
initn: 1636 init1: 1636 opt: 1793 Z-score: 962.7 bits: 187.7 E(85289): 7e-47
Smith-Waterman score: 1793; 62.4% identity (80.0% similar) in 415 aa overlap (144-558:44-456)
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSIKHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYE
.: ::.:::.:: : ::. : : :
NP_001 EVKIAKNSDGRECIKGVNTGSSYALGSNAEDKPIKKQLGVSFHLHLSELELFPDERVING
20 30 40 50 60 70
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 CNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSNKCGTDFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIEC
::.::. .::.:::: : .::.::: . :. .:: ::.: :::: .:::::. :
NP_001 CNQVENFINHSSSVSCLQEMSSSVKTPIFNR--NDFDDSSFLPQEQKVHLREKPYECNEH
80 90 100 110 120 130
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQKSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSF
.:.. .: .: .:: :. :: :::. ::::::..:.::.: :.:::::::::: : . :
NP_001 SKVFRVSSSLTKHQVIHTVEKPYKCNSCGKVFSRNSHLAEHCRIHTGEKPYKCNVCGKVF
140 150 160 170 180 190
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRS
: :: .: :.:.:: ::::.: :: :::: :: :: ::. : :::: :.::::.:: .:
NP_001 SYNSNFARHQRIHTREKPYECNECGKVFSNNSYLARHQRIHAEEKPYKCNECGKGFSHKS
200 210 220 230 240 250
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 TLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSQTSSLAR
.:.:: :..:.:::::.::::.: . . :. ::.::::::::::::::::: :.: ::.
NP_001 SLANHWRIYTGEKPYKCDECGKAFYRIALLVRHQKIHTGEKPYKCNECGKVFIQNSHLAQ
260 270 280 290 300 310
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 HWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVI
::::::::::::::::::::. :.:: :::.::::::::::::::::: .:.:..: ::
NP_001 HWRIHTGEKPYKCNECGKVFNQLSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSEYSGLSAHLVI
320 330 340 350 360 370
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 HTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGK
:::::::::..:::.: . :::.:: :::::.::::::::: :. .:.::. ::::.
NP_001 HTGEKPYKCSECGKAFRHKLSLTNHQRIHTGERPYKCNECGKVFNRIAHLARHRKIHTGE
380 390 400 410 420 430
540 550 560
pF1KE1 KPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
:::::..:::.:: : .: ::
NP_001 KPYKCNECGKAFSRISYLAQHWTIHMG
440 450
>>NP_001284553 (OMIM: 613910) zinc finger protein 480 is (492 aa)
initn: 1636 init1: 1636 opt: 1793 Z-score: 962.5 bits: 187.8 E(85289): 7.2e-47
Smith-Waterman score: 1793; 62.4% identity (80.0% similar) in 415 aa overlap (144-558:78-490)
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSIKHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYE
.: ::.:::.:: : ::. : : :
NP_001 QRALYKDVMLENYRNLVSLGSSYALGSNAEDKPIKKQLGVSFHLHLSELELFPDERVING
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 CNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSNKCGTDFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIEC
::.::. .::.:::: : .::.::: . :. .:: ::.: :::: .:::::. :
NP_001 CNQVENFINHSSSVSCLQEMSSSVKTPIFNR--NDFDDSSFLPQEQKVHLREKPYECNEH
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQKSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSF
.:.. .: .: .:: :. :: :::. ::::::..:.::.: :.:::::::::: : . :
NP_001 SKVFRVSSSLTKHQVIHTVEKPYKCNSCGKVFSRNSHLAEHCRIHTGEKPYKCNVCGKVF
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRS
: :: .: :.:.:: ::::.: :: :::: :: :: ::. : :::: :.::::.:: .:
NP_001 SYNSNFARHQRIHTREKPYECNECGKVFSNNSYLARHQRIHAEEKPYKCNECGKGFSHKS
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 TLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSQTSSLAR
.:.:: :..:.:::::.::::.: . . :. ::.::::::::::::::::: :.: ::.
NP_001 SLANHWRIYTGEKPYKCDECGKAFYRIALLVRHQKIHTGEKPYKCNECGKVFIQNSHLAQ
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 HWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVI
::::::::::::::::::::. :.:: :::.::::::::::::::::: .:.:..: ::
NP_001 HWRIHTGEKPYKCNECGKVFNQLSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSEYSGLSAHLVI
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 HTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGK
:::::::::..:::.: . :::.:: :::::.::::::::: :. .:.::. ::::.
NP_001 HTGEKPYKCSECGKAFRHKLSLTNHQRIHTGERPYKCNECGKVFNRIAHLARHRKIHTGE
410 420 430 440 450 460
540 550 560
pF1KE1 KPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
:::::..:::.:: : .: ::
NP_001 KPYKCNECGKAFSRISYLAQHWTIHMG
470 480 490
>>NP_653285 (OMIM: 613910) zinc finger protein 480 isofo (535 aa)
initn: 1636 init1: 1636 opt: 1793 Z-score: 962.2 bits: 187.8 E(85289): 7.4e-47
Smith-Waterman score: 1793; 62.4% identity (80.0% similar) in 415 aa overlap (144-558:121-533)
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSIKHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYE
.: ::.:::.:: : ::. : : :
NP_653 EVKIAKNSDGRECIKGVNTGSSYALGSNAEDKPIKKQLGVSFHLHLSELELFPDERVING
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 CNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSNKCGTDFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIEC
::.::. .::.:::: : .::.::: . :. .:: ::.: :::: .:::::. :
NP_653 CNQVENFINHSSSVSCLQEMSSSVKTPIFNR--NDFDDSSFLPQEQKVHLREKPYECNEH
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQKSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSF
.:.. .: .: .:: :. :: :::. ::::::..:.::.: :.:::::::::: : . :
NP_653 SKVFRVSSSLTKHQVIHTVEKPYKCNSCGKVFSRNSHLAEHCRIHTGEKPYKCNVCGKVF
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRS
: :: .: :.:.:: ::::.: :: :::: :: :: ::. : :::: :.::::.:: .:
NP_653 SYNSNFARHQRIHTREKPYECNECGKVFSNNSYLARHQRIHAEEKPYKCNECGKGFSHKS
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 TLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSQTSSLAR
.:.:: :..:.:::::.::::.: . . :. ::.::::::::::::::::: :.: ::.
NP_653 SLANHWRIYTGEKPYKCDECGKAFYRIALLVRHQKIHTGEKPYKCNECGKVFIQNSHLAQ
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 HWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVI
::::::::::::::::::::. :.:: :::.::::::::::::::::: .:.:..: ::
NP_653 HWRIHTGEKPYKCNECGKVFNQLSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSEYSGLSAHLVI
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 HTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGK
:::::::::..:::.: . :::.:: :::::.::::::::: :. .:.::. ::::.
NP_653 HTGEKPYKCSECGKAFRHKLSLTNHQRIHTGERPYKCNECGKVFNRIAHLARHRKIHTGE
450 460 470 480 490 500
540 550 560
pF1KE1 KPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
:::::..:::.:: : .: ::
NP_653 KPYKCNECGKAFSRISYLAQHWTIHMG
510 520 530
>>XP_011524767 (OMIM: 613910) PREDICTED: zinc finger pro (535 aa)
initn: 1636 init1: 1636 opt: 1793 Z-score: 962.2 bits: 187.8 E(85289): 7.4e-47
Smith-Waterman score: 1793; 62.4% identity (80.0% similar) in 415 aa overlap (144-558:121-533)
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSIKHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYE
.: ::.:::.:: : ::. : : :
XP_011 EVKIAKNSDGRECIKGVNTGSSYALGSNAEDKPIKKQLGVSFHLHLSELELFPDERVING
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 CNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSNKCGTDFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIEC
::.::. .::.:::: : .::.::: . :. .:: ::.: :::: .:::::. :
XP_011 CNQVENFINHSSSVSCLQEMSSSVKTPIFNR--NDFDDSSFLPQEQKVHLREKPYECNEH
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 DKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQKSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSF
.:.. .: .: .:: :. :: :::. ::::::..:.::.: :.:::::::::: : . :
XP_011 SKVFRVSSSLTKHQVIHTVEKPYKCNSCGKVFSRNSHLAEHCRIHTGEKPYKCNVCGKVF
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRS
: :: .: :.:.:: ::::.: :: :::: :: :: ::. : :::: :.::::.:: .:
XP_011 SYNSNFARHQRIHTREKPYECNECGKVFSNNSYLARHQRIHAEEKPYKCNECGKGFSHKS
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 TLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSQTSSLAR
.:.:: :..:.:::::.::::.: . . :. ::.::::::::::::::::: :.: ::.
XP_011 SLANHWRIYTGEKPYKCDECGKAFYRIALLVRHQKIHTGEKPYKCNECGKVFIQNSHLAQ
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 HWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVI
::::::::::::::::::::. :.:: :::.::::::::::::::::: .:.:..: ::
XP_011 HWRIHTGEKPYKCNECGKVFNQLSNLARHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSEYSGLSAHLVI
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 HTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGK
:::::::::..:::.: . :::.:: :::::.::::::::: :. .:.::. ::::.
XP_011 HTGEKPYKCSECGKAFRHKLSLTNHQRIHTGERPYKCNECGKVFNRIAHLARHRKIHTGE
450 460 470 480 490 500
540 550 560
pF1KE1 KPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
:::::..:::.:: : .: ::
XP_011 KPYKCNECGKAFSRISYLAQHWTIHMG
510 520 530
>>NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
initn: 8391 init1: 1765 opt: 1790 Z-score: 959.4 bits: 187.9 E(85289): 1.1e-46
Smith-Waterman score: 2020; 59.2% identity (76.8% similar) in 488 aa overlap (105-565:102-586)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 NPGEVFHTVTLEQHEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRR
.:::.:::::: : . : : ::. .:
NP_001 STEAVFHTVVLERHESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEG---KR
80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 DQRDRRGIGNKSIKHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQILS
:::::: : :: ...:::.:: : ::: ::.:::.::::.::::.:.:::::: : .
NP_001 DQRDRRDIENKLMNNQLGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIP
130 140 150 160 170 180
200 210 220
pF1KE1 STVKTHVS------------------NKCGTDFICS---------SLLTQEQKSCIREKP
:.:.:: : :.:: . :. : ::.... :::
NP_001 SSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 YRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQKSNLARHWRVHTGEKPYKCN
:. :: :... :..:..:: :.::: ::: ::::: ..: :: : :.::::::::::
NP_001 YKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCN
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 ECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQKTHIGEKPYTCKECGK
:: ..: .: :. :. .::::::.:: :: :.:..:: : : . : ::::: :.::::
NP_001 ECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGK
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 AFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSQ
::::::.:. ::.::.:.:::::::::::: .: :. :.:.::::::::::::::.::.
NP_001 AFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSM
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 TSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNL
:.:: : :::: ::.:::::.:::. ::.::.:::.::::::::::::::::::.:.:
NP_001 HSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSL
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 TTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKSFSVRPNLTRHQ
::::.::.::::::: .:::.:. .: : .:. ::.:::::::::::: :. .:.::
NP_001 TTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHW
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560
pF1KE1 IIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
.:::.:::::.:::..:: : .: :: ::: :::::
NP_001 RVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHT
550 560 570 580 590 600
NP_001 GEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKP
610 620 630 640 650 660
>--
initn: 1042 init1: 1042 opt: 1042 Z-score: 571.2 bits: 116.0 E(85289): 4.5e-25
Smith-Waterman score: 1042; 70.4% identity (88.8% similar) in 196 aa overlap (314-509:587-782)
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 YKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQKTHIGEKPYTCK
:.:: ::: .:: :: :.. : ::::: :.
NP_001 YKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCN
560 570 580 590 600 610
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 ECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTGEKPYKCNECGK
:::::::..:.::.:.:::.:.::::::.:::::.:.: ::.::: :::::::.::::::
NP_001 ECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGK
620 630 640 650 660 670
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 VFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSV
.:: :::. : ::::.::::::::::::. :.:::.:::.:::::::.:.:::::: :
NP_001 AFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRV
680 690 700 710 720 730
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 HSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKSFSVRPNL
.:.::::..:::::: ::::.::: : :.:..:. .::::::::
NP_001 RSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
740 750 760 770 780
530 540 550 560
pF1KE1 TRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
>>NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
initn: 8391 init1: 1765 opt: 1790 Z-score: 959.4 bits: 187.9 E(85289): 1.1e-46
Smith-Waterman score: 2020; 59.2% identity (76.8% similar) in 488 aa overlap (105-565:102-586)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 NPGEVFHTVTLEQHEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRR
.:::.:::::: : . : : ::. .:
NP_001 STEAVFHTVVLERHESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEG---KR
80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 DQRDRRGIGNKSIKHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQILS
:::::: : :: ...:::.:: : ::: ::.:::.::::.::::.:.:::::: : .
NP_001 DQRDRRDIENKLMNNQLGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIP
130 140 150 160 170 180
200 210 220
pF1KE1 STVKTHVS------------------NKCGTDFICS---------SLLTQEQKSCIREKP
:.:.:: : :.:: . :. : ::.... :::
NP_001 SSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 YRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQKSNLARHWRVHTGEKPYKCN
:. :: :... :..:..:: :.::: ::: ::::: ..: :: : :.::::::::::
NP_001 YKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCN
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 ECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQKTHIGEKPYTCKECGK
:: ..: .: :. :. .::::::.:: :: :.:..:: : : . : ::::: :.::::
NP_001 ECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGK
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 AFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSQ
::::::.:. ::.::.:.:::::::::::: .: :. :.:.::::::::::::::.::.
NP_001 AFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSM
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 TSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNL
:.:: : :::: ::.:::::.:::. ::.::.:::.::::::::::::::::::.:.:
NP_001 HSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSL
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 TTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKSFSVRPNLTRHQ
::::.::.::::::: .:::.:. .: : .:. ::.:::::::::::: :. .:.::
NP_001 TTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHW
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560
pF1KE1 IIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
.:::.:::::.:::..:: : .: :: ::: :::::
NP_001 RVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHT
550 560 570 580 590 600
NP_001 GEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKP
610 620 630 640 650 660
>--
initn: 1042 init1: 1042 opt: 1042 Z-score: 571.2 bits: 116.0 E(85289): 4.5e-25
Smith-Waterman score: 1042; 70.4% identity (88.8% similar) in 196 aa overlap (314-509:587-782)
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 YKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQKTHIGEKPYTCK
:.:: ::: .:: :: :.. : ::::: :.
NP_001 YKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCN
560 570 580 590 600 610
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 ECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTGEKPYKCNECGK
:::::::..:.::.:.:::.:.::::::.:::::.:.: ::.::: :::::::.::::::
NP_001 ECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGK
620 630 640 650 660 670
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 VFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSV
.:: :::. : ::::.::::::::::::. :.:::.:::.:::::::.:.:::::: :
NP_001 AFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRV
680 690 700 710 720 730
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 HSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKSFSVRPNL
.:.::::..:::::: ::::.::: : :.:..:. .::::::::
NP_001 RSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
740 750 760 770 780
530 540 550 560
pF1KE1 TRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
>>NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
initn: 8391 init1: 1765 opt: 1790 Z-score: 959.4 bits: 187.9 E(85289): 1.1e-46
Smith-Waterman score: 2020; 59.2% identity (76.8% similar) in 488 aa overlap (105-565:102-586)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 NPGEVFHTVTLEQHEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRR
.:::.:::::: : . : : ::. .:
NP_001 STEAVFHTVVLERHESPDIEDFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEG---KR
80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 DQRDRRGIGNKSIKHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQILS
:::::: : :: ...:::.:: : ::: ::.:::.::::.::::.:.:::::: : .
NP_001 DQRDRRDIENKLMNNQLGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIP
130 140 150 160 170 180
200 210 220
pF1KE1 STVKTHVS------------------NKCGTDFICS---------SLLTQEQKSCIREKP
:.:.:: : :.:: . :. : ::.... :::
NP_001 SSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 YRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQKSNLARHWRVHTGEKPYKCN
:. :: :... :..:..:: :.::: ::: ::::: ..: :: : :.::::::::::
NP_001 YKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCN
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 ECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQKTHIGEKPYTCKECGK
:: ..: .: :. :. .::::::.:: :: :.:..:: : : . : ::::: :.::::
NP_001 ECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGK
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 AFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSQ
::::::.:. ::.::.:.:::::::::::: .: :. :.:.::::::::::::::.::.
NP_001 AFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSM
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 TSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNL
:.:: : :::: ::.:::::.:::. ::.::.:::.::::::::::::::::::.:.:
NP_001 HSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSL
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 TTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKSFSVRPNLTRHQ
::::.::.::::::: .:::.:. .: : .:. ::.:::::::::::: :. .:.::
NP_001 TTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHW
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560
pF1KE1 IIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
.:::.:::::.:::..:: : .: :: ::: :::::
NP_001 RVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHT
550 560 570 580 590 600
NP_001 GEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKP
610 620 630 640 650 660
>--
initn: 1042 init1: 1042 opt: 1042 Z-score: 571.2 bits: 116.0 E(85289): 4.5e-25
Smith-Waterman score: 1042; 70.4% identity (88.8% similar) in 196 aa overlap (314-509:587-782)
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 YKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQKTHIGEKPYTCK
:.:: ::: .:: :: :.. : ::::: :.
NP_001 YKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCN
560 570 580 590 600 610
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 ECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTGEKPYKCNECGK
:::::::..:.::.:.:::.:.::::::.:::::.:.: ::.::: :::::::.::::::
NP_001 ECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGK
620 630 640 650 660 670
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 VFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSV
.:: :::. : ::::.::::::::::::. :.:::.:::.:::::::.:.:::::: :
NP_001 AFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRV
680 690 700 710 720 730
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 HSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKSFSVRPNL
.:.::::..:::::: ::::.::: : :.:..:. .::::::::
NP_001 RSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
740 750 760 770 780
530 540 550 560
pF1KE1 TRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
567 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 22:05:29 2016 done: Sun Nov 6 22:05:30 2016
Total Scan time: 9.670 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]