Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1156
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1156, 464 aa
1>>>pF1KE1156 464 - 464 aa - 464 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5073+/-0.000897; mu= 20.6034+/- 0.056
mean_var=346.4819+/-65.292, 0's: 0 Z-trim(111.0): 2080 B-trim: 120 in 2/51
Lambda= 0.068902
statistics sampled from 17110 (19440) to 17110 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.228), width: 16
Scan time: 8.110
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001078853 (OMIM: 604085) zinc finger protein 15 ( 437) 1609 175.2 3.2e-43
NP_001316385 (OMIM: 613840) zinc finger protein 30 ( 567) 1546 169.1 2.7e-41
NP_001277248 (OMIM: 613840) zinc finger protein 30 ( 617) 1546 169.2 2.8e-41
NP_065708 (OMIM: 613840) zinc finger protein 304 i ( 659) 1546 169.3 2.9e-41
XP_011525447 (OMIM: 613840) PREDICTED: zinc finger ( 664) 1546 169.3 2.9e-41
NP_001277247 (OMIM: 613840) zinc finger protein 30 ( 706) 1546 169.3 3e-41
XP_016881627 (OMIM: 606956) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1530 167.4 7.7e-41
NP_005764 (OMIM: 606956) zinc finger protein 256 [ ( 627) 1530 167.6 8.6e-41
NP_001252529 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 503) 1522 166.6 1.4e-40
NP_001252528 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 555) 1522 166.7 1.4e-40
NP_942152 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 i ( 564) 1522 166.7 1.4e-40
NP_006376 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 i ( 577) 1522 166.8 1.4e-40
NP_001252527 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 616) 1522 166.8 1.5e-40
NP_001309235 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 627) 1522 166.8 1.5e-40
NP_001252526 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 629) 1522 166.8 1.5e-40
NP_001264878 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_001099022 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_060770 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 [H ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_001264880 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_001264877 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_001099021 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_001264876 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_001264874 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_001099020 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_001099019 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_001264881 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_001264875 (OMIM: 194558) zinc finger protein 83 ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
XP_016882440 (OMIM: 194558) PREDICTED: zinc finger ( 516) 1502 164.7 5.5e-40
NP_003424 (OMIM: 604074) zinc finger protein 132 [ ( 706) 1501 164.9 6.6e-40
NP_653285 (OMIM: 613910) zinc finger protein 480 i ( 535) 1485 163.0 1.8e-39
XP_011524767 (OMIM: 613910) PREDICTED: zinc finger ( 535) 1485 163.0 1.8e-39
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1481 162.7 2.5e-39
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1481 162.8 2.5e-39
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1481 162.8 2.5e-39
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1481 162.8 2.6e-39
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1481 162.8 2.6e-39
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1481 162.8 2.6e-39
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1481 162.8 2.6e-39
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1481 162.8 2.6e-39
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1481 162.8 2.6e-39
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1481 162.8 2.6e-39
NP_001273627 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 364) 1476 161.8 2.9e-39
XP_006717342 (OMIM: 194552) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1476 162.0 3.2e-39
NP_001273626 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1476 162.0 3.2e-39
NP_001273625 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1476 162.0 3.2e-39
NP_001309189 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1476 162.0 3.2e-39
NP_009066 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 is ( 498) 1476 162.1 3.2e-39
NP_003437 (OMIM: 300024) zinc finger protein 157 [ ( 506) 1468 161.3 5.7e-39
XP_011540503 (OMIM: 611703) PREDICTED: zinc finger ( 452) 1459 160.3 1e-38
NP_001070663 (OMIM: 611703) zinc finger protein 43 ( 470) 1459 160.3 1e-38
>>NP_001078853 (OMIM: 604085) zinc finger protein 154 [H (437 aa)
initn: 2786 init1: 1606 opt: 1609 Z-score: 896.9 bits: 175.2 E(85289): 3.2e-43
Smith-Waterman score: 1791; 54.3% identity (76.3% similar) in 460 aa overlap (1-460:1-436)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAAALRDPAQGYVTFEDVAVYFSQEEWRLLDDAQRLLYRNVMLENFTLLASLGCWHGAE
::::.:: :.:: ::::::::.:: ::: :::.::: :::.:::::..::.::
NP_001 MAAATLRTPTQGTVTFEDVAVHFSWEEWGLLDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDV-----
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 AEEAPEQIASVGLLSSNIQQHQKQHCGEKPLKRQQGRVPVLRSCKVHLSEKSLQSREVGK
.::::: ::: .. . ::. ...: :.: . :::::
NP_001 -------------------HHQKQHLGEKHFRSNVGRALFVKTCTFHVSGEPSTCREVGK
60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ALLISSGVLKHQVTHTGEKSHRSSKSREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHA
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NP_001 DFLAKLGFLHQQAAHTGEQSNSKSDGGAISHRGKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GKKTYECSECGKLFRDMSNLFIHQIVHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQRVHTGEKP
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NP_001 TERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 FTCSECGKAFRHNSTLVQHHKIHTGVRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHTGERPYKCS
:.:::: : ..:.:..:...::: :::::::::: :: :.:..:. ::::::::.::
NP_001 HECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ECGKFYSHKSNLIKHWRVHTGERPYKCSDCGKFFTQCSSLMQHQKVHTGEKPFKCNECGR
:::::....:.:::: .::.: :::.::.::: :.: :::..:..:::::.:.::.:::.
NP_001 ECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGK
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 FFRENSTLVRHQRVHTGAKPYECRECGKFFSQSSTLMQHRKVHIGEKPFKCNECGRLFRE
: . :.:..:. :::: .:::: :::::: ::.: .:..:: : .:..:.:::. : .
NP_001 SFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQ
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460
pF1KE1 NSSLVKHQRVHTGAKPYECRECGKFFRHNSSLFKHRRIHTGEMQ
::.:.::.::::: ::::: :::: : :::::.::.:::.
NP_001 NSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGKSFSHNSSLIKHQRIHSR
400 410 420 430
>>NP_001316385 (OMIM: 613840) zinc finger protein 304 is (567 aa)
initn: 1539 init1: 1539 opt: 1546 Z-score: 862.3 bits: 169.1 E(85289): 2.7e-41
Smith-Waterman score: 1580; 51.8% identity (76.7% similar) in 407 aa overlap (75-462:115-520)
50 60 70 80 90
pF1KE1 ENFTLLASLGCWHGAEAEEAPEQIASVGLLSSNIQQHQKQH-------CGEKPLKRQQGR
::...::: .. ::.. :
NP_001 PDSSGLFQHQTTYNRVSPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEG-KAFLDT
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140
pF1KE1 VPVLRSCKVHLSEKSLQSREVGKALLISSGVLKHQVTHTGEKSHRSS------------K
.: : .: . .. :... .:....:. :.:: :: . :
NP_001 FTLLDSQMTHAEVRPFRCLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLK
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 SREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHAGKKTYECSECGKLFRDMSNLFIHQI
.. ::.::::: ::::::::..: ::::::.:.:...:.:::::: . :.: ::
NP_001 MHQKFHTGKRHYTCSECGKAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQR
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 VHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQRVHTGEKPFTCSECGKAFRHNSTLVQHHKIHTG
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NP_001 IHTGERPYKCNKCGKAFSRKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTG
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 VRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHTGERPYKCSECGKFYSHKSNLIKHWRVHTGERPY
.::::: ::::.:: ::::.::.::::: : : ::.::: .. :..:..: .::: :::
NP_001 ARPYECIECGKFFSHNSSLIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPY
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 KCSDCGKFFTQCSSLMQHQKVHTGEKPFKCNECGRFFRENSTLVRHQRVHTGAKPYECRE
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NP_001 ECSECGKAFSRKDTLVQHQKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECNE
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 CGKFFSQSSTLMQHRKVHIGEKPFKCNECGRLFRENSSLVKHQRVHTGAKPYECRECGKF
::: ::..:.:. :..:: : .:. :.:::. . .: ::.:..:::::.:::: :::::
NP_001 CGKCFSHNSSLILHQRVHTGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKF
450 460 470 480 490 500
450 460
pF1KE1 FRHNSSLFKHRRIHTGEMQ
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NP_001 FSRNSGLILHQRVHTGEKPYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAAS
510 520 530 540 550 560
>>NP_001277248 (OMIM: 613840) zinc finger protein 304 is (617 aa)
initn: 1539 init1: 1539 opt: 1546 Z-score: 862.0 bits: 169.2 E(85289): 2.8e-41
Smith-Waterman score: 1580; 51.8% identity (76.7% similar) in 407 aa overlap (75-462:165-570)
50 60 70 80 90
pF1KE1 ENFTLLASLGCWHGAEAEEAPEQIASVGLLSSNIQQHQKQH-------CGEKPLKRQQGR
::...::: .. ::.. :
NP_001 PDSSGLFQHQTTYNRVSPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEG-KAFLDT
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140
pF1KE1 VPVLRSCKVHLSEKSLQSREVGKALLISSGVLKHQVTHTGEKSHRSS------------K
.: : .: . .. :... .:....:. :.:: :: . :
NP_001 FTLLDSQMTHAEVRPFRCLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLK
200 210 220 230 240 250
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 SREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHAGKKTYECSECGKLFRDMSNLFIHQI
.. ::.::::: ::::::::..: ::::::.:.:...:.:::::: . :.: ::
NP_001 MHQKFHTGKRHYTCSECGKAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQR
260 270 280 290 300 310
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 VHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQRVHTGEKPFTCSECGKAFRHNSTLVQHHKIHTG
.::::::: :..:::.:::. :..::: ::::.:. :::::: : ..: :..: .::::
NP_001 IHTGERPYKCNKCGKAFSRKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTG
320 330 340 350 360 370
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 VRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHTGERPYKCSECGKFYSHKSNLIKHWRVHTGERPY
.::::: ::::.:: ::::.::.::::: : : ::.::: .. :..:..: .::: :::
NP_001 ARPYECIECGKFFSHNSSLIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPY
380 390 400 410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 KCSDCGKFFTQCSSLMQHQKVHTGEKPFKCNECGRFFRENSTLVRHQRVHTGAKPYECRE
.::.::: :.. ..:.::::.::::.:..:.:::.:: ..:.:. :::.::::::::: :
NP_001 ECSECGKAFSRKDTLVQHQKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECNE
440 450 460 470 480 490
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 CGKFFSQSSTLMQHRKVHIGEKPFKCNECGRLFRENSSLVKHQRVHTGAKPYECRECGKF
::: ::..:.:. :..:: : .:. :.:::. . .: ::.:..:::::.:::: :::::
NP_001 CGKCFSHNSSLILHQRVHTGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKF
500 510 520 530 540 550
450 460
pF1KE1 FRHNSSLFKHRRIHTGEMQ
: .::.:. :.:.::::
NP_001 FSRNSGLILHQRVHTGEKPYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAAS
560 570 580 590 600 610
>>NP_065708 (OMIM: 613840) zinc finger protein 304 isofo (659 aa)
initn: 1539 init1: 1539 opt: 1546 Z-score: 861.8 bits: 169.3 E(85289): 2.9e-41
Smith-Waterman score: 1580; 51.8% identity (76.7% similar) in 407 aa overlap (75-462:207-612)
50 60 70 80 90
pF1KE1 ENFTLLASLGCWHGAEAEEAPEQIASVGLLSSNIQQHQKQH-------CGEKPLKRQQGR
::...::: .. ::.. :
NP_065 PDSSGLFQHQTTYNRVSPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEG-KAFLDT
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140
pF1KE1 VPVLRSCKVHLSEKSLQSREVGKALLISSGVLKHQVTHTGEKSHRSS------------K
.: : .: . .. :... .:....:. :.:: :: . :
NP_065 FTLLDSQMTHAEVRPFRCLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLK
240 250 260 270 280 290
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 SREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHAGKKTYECSECGKLFRDMSNLFIHQI
.. ::.::::: ::::::::..: ::::::.:.:...:.:::::: . :.: ::
NP_065 MHQKFHTGKRHYTCSECGKAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQR
300 310 320 330 340 350
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 VHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQRVHTGEKPFTCSECGKAFRHNSTLVQHHKIHTG
.::::::: :..:::.:::. :..::: ::::.:. :::::: : ..: :..: .::::
NP_065 IHTGERPYKCNKCGKAFSRKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTG
360 370 380 390 400 410
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 VRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHTGERPYKCSECGKFYSHKSNLIKHWRVHTGERPY
.::::: ::::.:: ::::.::.::::: : : ::.::: .. :..:..: .::: :::
NP_065 ARPYECIECGKFFSHNSSLIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPY
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 KCSDCGKFFTQCSSLMQHQKVHTGEKPFKCNECGRFFRENSTLVRHQRVHTGAKPYECRE
.::.::: :.. ..:.::::.::::.:..:.:::.:: ..:.:. :::.::::::::: :
NP_065 ECSECGKAFSRKDTLVQHQKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECNE
480 490 500 510 520 530
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 CGKFFSQSSTLMQHRKVHIGEKPFKCNECGRLFRENSSLVKHQRVHTGAKPYECRECGKF
::: ::..:.:. :..:: : .:. :.:::. . .: ::.:..:::::.:::: :::::
NP_065 CGKCFSHNSSLILHQRVHTGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKF
540 550 560 570 580 590
450 460
pF1KE1 FRHNSSLFKHRRIHTGEMQ
: .::.:. :.:.::::
NP_065 FSRNSGLILHQRVHTGEKPYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAAS
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 547 init1: 281 opt: 347 Z-score: 217.7 bits: 50.1 E(85289): 2.2e-05
Smith-Waterman score: 348; 33.8% identity (62.2% similar) in 222 aa overlap (1-222:1-204)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAAALRDPAQGYVTFEDVAVYFSQEEWRLLDDAQRLLYRNVMLENFTLLASLGCWHGAE
::::.: : .:. :::::: ::::.:::.::..:::.:::.::::::.:.:.:: : ::
NP_065 MAAAVLMDRVQSCVTFEDVFVYFSREEWELLEEAQRFLYRDVMLENFALVATLGFWCEAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 AEEAPEQIASVGLLSSNIQQHQKQHCGEKPLKRQQGRVPVLRSCKVHLSEKSLQSREVGK
: :: .:: .:. .. .: . . :.:.. .::.:. :. .. .
NP_065 HEAPSEQSVSVEGVSQVRTAESGLFQKAHPCEMCD---PLLKDI-LHLAEH--QGSHLTQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ALLISSGVLKHQVTHTGEKSHRSSKSREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHA
: . :. ... . ... ..... : :. .. .. : .: :. .:
NP_065 KLC-TRGLCRRRFSFSANFYQHQKQ-----HNGENCFRGDDGGASF------VKSCTVHM
120 130 140 150 160
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pF1KE1 GKKTYECSECGKLFRDMSNLFIHQIVHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQRVHTGEKP
... : : : . : :.:: :: ... : ..: .::
NP_065 LGRSFTCREEGMDLPDSSGLFQHQTTYNRVSPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQML
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 FTCSECGKAFRHNSTLVQHHKIHTGVRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHTGERPYKCS
NP_065 FSCGDEGKAFLDTFTLLDSQMTHAEVRPFRCLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCK
230 240 250 260 270 280
>>XP_011525447 (OMIM: 613840) PREDICTED: zinc finger pro (664 aa)
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Smith-Waterman score: 1580; 51.8% identity (76.7% similar) in 407 aa overlap (75-462:212-617)
50 60 70 80 90
pF1KE1 ENFTLLASLGCWHGAEAEEAPEQIASVGLLSSNIQQHQKQH-------CGEKPLKRQQGR
::...::: .. ::.. :
XP_011 PDSSGLFQHQTTYNRVSPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEG-KAFLDT
190 200 210 220 230 240
100 110 120 130 140
pF1KE1 VPVLRSCKVHLSEKSLQSREVGKALLISSGVLKHQVTHTGEKSHRSS------------K
.: : .: . .. :... .:....:. :.:: :: . :
XP_011 FTLLDSQMTHAEVRPFRCLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLK
250 260 270 280 290 300
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 SREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHAGKKTYECSECGKLFRDMSNLFIHQI
.. ::.::::: ::::::::..: ::::::.:.:...:.:::::: . :.: ::
XP_011 MHQKFHTGKRHYTCSECGKAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQR
310 320 330 340 350 360
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 VHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQRVHTGEKPFTCSECGKAFRHNSTLVQHHKIHTG
.::::::: :..:::.:::. :..::: ::::.:. :::::: : ..: :..: .::::
XP_011 IHTGERPYKCNKCGKAFSRKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTG
370 380 390 400 410 420
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 VRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHTGERPYKCSECGKFYSHKSNLIKHWRVHTGERPY
.::::: ::::.:: ::::.::.::::: : : ::.::: .. :..:..: .::: :::
XP_011 ARPYECIECGKFFSHNSSLIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPY
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pF1KE1 KCSDCGKFFTQCSSLMQHQKVHTGEKPFKCNECGRFFRENSTLVRHQRVHTGAKPYECRE
.::.::: :.. ..:.::::.::::.:..:.:::.:: ..:.:. :::.::::::::: :
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::: ::..:.:. :..:: : .:. :.:::. . .: ::.:..:::::.:::: :::::
XP_011 CGKCFSHNSSLILHQRVHTGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKF
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pF1KE1 FRHNSSLFKHRRIHTGEMQ
: .::.:. :.:.::::
XP_011 FSRNSGLILHQRVHTGEKPYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAAS
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>>NP_001277247 (OMIM: 613840) zinc finger protein 304 is (706 aa)
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Smith-Waterman score: 1580; 51.8% identity (76.7% similar) in 407 aa overlap (75-462:254-659)
50 60 70 80 90
pF1KE1 ENFTLLASLGCWHGAEAEEAPEQIASVGLLSSNIQQHQKQH-------CGEKPLKRQQGR
::...::: .. ::.. :
NP_001 PDSSGLFQHQTTYNRVSPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYDGQMLFSCGDEG-KAFLDT
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pF1KE1 VPVLRSCKVHLSEKSLQSREVGKALLISSGVLKHQVTHTGEKSHRSS------------K
.: : .: . .. :... .:....:. :.:: :: . :
NP_001 FTLLDSQMTHAEVRPFRCLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEISHVCKECGKAFIHLHHLK
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pF1KE1 SREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHAGKKTYECSECGKLFRDMSNLFIHQI
.. ::.::::: ::::::::..: ::::::.:.:...:.:::::: . :.: ::
NP_001 MHQKFHTGKRHYTCSECGKAFSRKDTLVQHQRVHTGERSYDCSECGKAYSRSSHLVQHQR
350 360 370 380 390 400
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 VHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQRVHTGEKPFTCSECGKAFRHNSTLVQHHKIHTG
.::::::: :..:::.:::. :..::: ::::.:. :::::: : ..: :..: .::::
NP_001 IHTGERPYKCNKCGKAFSRKDTLVQHQRFHTGERPYECSECGKFFSQSSHLIEHWRIHTG
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pF1KE1 VRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHTGERPYKCSECGKFYSHKSNLIKHWRVHTGERPY
.::::: ::::.:: ::::.::.::::: : : ::.::: .. :..:..: .::: :::
NP_001 ARPYECIECGKFFSHNSSLIKHRRVHTGARSYVCSKCGKAFGCKDTLVQHQIIHTGARPY
470 480 490 500 510 520
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pF1KE1 KCSDCGKFFTQCSSLMQHQKVHTGEKPFKCNECGRFFRENSTLVRHQRVHTGAKPYECRE
.::.::: :.. ..:.::::.::::.:..:.:::.:: ..:.:. :::.::::::::: :
NP_001 ECSECGKAFSRKDTLVQHQKIHTGERPYECGECGKFFSHSSNLIVHQRIHTGAKPYECNE
530 540 550 560 570 580
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 CGKFFSQSSTLMQHRKVHIGEKPFKCNECGRLFRENSSLVKHQRVHTGAKPYECRECGKF
::: ::..:.:. :..:: : .:. :.:::. . .: ::.:..:::::.:::: :::::
NP_001 CGKCFSHNSSLILHQRVHTGARPYVCSECGKAYISSSHLVQHKKVHTGARPYECSECGKF
590 600 610 620 630 640
450 460
pF1KE1 FRHNSSLFKHRRIHTGEMQ
: .::.:. :.:.::::
NP_001 FSRNSGLILHQRVHTGEKPYVCSECGKAYSRSSHLVRHQKAHTGERAHECNSFGGPLAAS
650 660 670 680 690 700
>--
initn: 500 init1: 234 opt: 329 Z-score: 207.8 bits: 48.4 E(85289): 7.8e-05
Smith-Waterman score: 353; 30.1% identity (53.5% similar) in 286 aa overlap (1-278:1-251)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAAAALRDPAQGYVTFEDVAVYFSQEEWRLLDDAQRLLYRNVMLENFTLLASLG------
::::.: : .:. :::::: ::::.:::.::..:::.:::.::::::.:.:.:.
NP_001 MAAAVLMDRVQSCVTFEDVFVYFSREEWELLEEAQRFLYRDVMLENFALVATLAFIFPVP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 CWHGAEAEEAPEQIASVGLLSSNIQQHQKQHCGEKPLKRQQGRVPVLRSCKVHLSEKSLQ
: .. . . : . . ...... . : : . ..: :... : :
NP_001 CSCAVGGGRKPWVPDRADITAATVKETYRGH-GPAEWELEEGFW-----CEAEHEAPSEQ
70 80 90 100 110
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pF1KE1 SREVGKALLISSGVLKHQVTHTG--EKSHRSSKSREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLL
: : :: . .....: .:.: : : . . :
NP_001 SVSV-------EGVSQVRTAESGLFQKAH----------------PCEMCDPLLKDILHL
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VQHQRLHAGKKTYECSECGKLFRDMSNLFIHQIVHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQ
..:: : .: . : . : .:.. :: :.:: :: .. . .: ...
NP_001 AEHQGSHLTQKLCTRGLCRRRFSFSANFYQHQKQHNGE------NCFRGDDGGASFVKSC
160 170 180 190 200
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pF1KE1 RVHTGEKPFTCSECGKAFRHNSTLVQHHKIHTGVRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHT
:: . ::: : : . .: : ::. .. : : . .:: . :
NP_001 TVHMLGRSFTCREEGMDLPDSSGLFQHQTTYNRVSPCRRTECMESFPHSSSLRQHQGDYD
210 220 230 240 250 260
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pF1KE1 GERPYKCSECGKFYSHKSNLIKHWRVHTGERPYKCSDCGKFFTQCSSLMQHQKVHTGEKP
NP_001 GQMLFSCGDEGKAFLDTFTLLDSQMTHAEVRPFRCLPCGNVFKEKSALINHRKIHSGEIS
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>>XP_016881627 (OMIM: 606956) PREDICTED: zinc finger pro (474 aa)
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pF1KE1 SSNIQQHQKQHCGEKPLKRQQGRVPVLRSCKVHLSEKSLQSREVGKALLISSGVLKHQVT
.:: ::: : ::. ::... :.
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80 90 100 110 120 130
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pF1KE1 HTGEKSHRSSKSREAF------------HAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHAGK
::: . :. .. . : :.:.: ::::::::.:... :. :::.:.:
XP_016 HTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGM
140 150 160 170 180 190
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pF1KE1 KTYECSECGKLFRDMSNLFIHQIVHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQRVHTGEKPFT
. :::::::: : :.:. :: :::: ::: ::.::::::.. :::.:.:.: :: :.
XP_016 RPYECSECGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYE
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pF1KE1 CSECGKAFRHNSTLVQHHKIHTGVRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHTGERPYKCSEC
:::::: : . : . ::...::::: .:: ::::::: . .:. :.:::::::::.::::
XP_016 CSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSEC
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GKFYSHKSNLIKHWRVHTGERPYKCSDCGKFFTQCSSLMQHQKVHTGEKPFKCNECGRFF
:: .. :: ::.::.:::: :::.:..::: ::. :.:.:::.:::::.:..:::::.::
XP_016 GKSFTCKSYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFF
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pF1KE1 RENSTLVRHQRVHTGAKPYECRECGKFFSQSSTLMQHRKVHIGEKPFKCNECGRLFRENS
..:.:.::.: ::: .:::: :: : ::. :.:..::.:: ::.:..:.:::. : ..:
XP_016 SQSSSLIRHRRSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSS
380 390 400 410 420 430
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pF1KE1 SLVKHQRVHTGAKPYECRECGKFFRHNSSLFKHRRIHTGEMQ
.:..:::.:.: .:::: .::::: ::.:.::. .: :
XP_016 NLTNHQRIHSGERPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
440 450 460 470
>>NP_005764 (OMIM: 606956) zinc finger protein 256 [Homo (627 aa)
initn: 1487 init1: 1487 opt: 1530 Z-score: 853.4 bits: 167.6 E(85289): 8.6e-41
Smith-Waterman score: 1572; 55.0% identity (78.0% similar) in 369 aa overlap (105-461:259-627)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 SSNIQQHQKQHCGEKPLKRQQGRVPVLRSCKVHLSEKSLQSREVGKALLISSGVLKHQVT
.:: ::: : ::. ::... :.
NP_005 HQGDLIRERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRI
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pF1KE1 HTGEKSHRSSKSREAF------------HAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHAGK
::: . :. .. . : :.:.: ::::::::.:... :. :::.:.:
NP_005 HTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGM
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pF1KE1 KTYECSECGKLFRDMSNLFIHQIVHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQRVHTGEKPFT
. :::::::: : :.:. :: :::: ::: ::.::::::.. :::.:.:.: :: :.
NP_005 RPYECSECGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYE
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pF1KE1 CSECGKAFRHNSTLVQHHKIHTGVRPYECSECGKLFSFNSSLMKHQRVHTGERPYKCSEC
:::::: : . : . ::...::::: .:: ::::::: . .:. :.:::::::::.::::
NP_005 CSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSEC
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310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GKFYSHKSNLIKHWRVHTGERPYKCSDCGKFFTQCSSLMQHQKVHTGEKPFKCNECGRFF
:: .. :: ::.::.:::: :::.:..::: ::. :.:.:::.:::::.:..:::::.::
NP_005 GKSFTCKSYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFF
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pF1KE1 RENSTLVRHQRVHTGAKPYECRECGKFFSQSSTLMQHRKVHIGEKPFKCNECGRLFRENS
..:.:.::.: ::: .:::: :: : ::. :.:..::.:: ::.:..:.:::. : ..:
NP_005 SQSSSLIRHRRSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSS
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pF1KE1 SLVKHQRVHTGAKPYECRECGKFFRHNSSLFKHRRIHTGEMQ
.:..:::.:.: .:::: .::::: ::.:.::. .: :
NP_005 NLTNHQRIHSGERPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
590 600 610 620
>--
initn: 1039 init1: 244 opt: 447 Z-score: 271.5 bits: 60.0 E(85289): 2.2e-08
Smith-Waterman score: 488; 39.8% identity (56.4% similar) in 259 aa overlap (1-203:1-257)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAAALRDPAQGYVTFEDVAVYFSQEEWRLLDDAQRLLYRNVMLENFTLLASLGCWHGAE
:::: : :::: ::::::::::: .:: :::.::. ::..:::::.:: .::: ::
NP_005 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGG-SGAG
10 20 30 40 50
70
pF1KE1 AEEAPEQ-------IASVGL----------------------------------------
:::: : ...: .
NP_005 DEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYT
60 70 80 90 100 110
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pF1KE1 ---------LSSNIQQHQKQHCGEKPLKRQQGRVPVLRSCKVHLSEKSLQSREVGKALLI
... ..:::::: :.: .. . :: : :: ..: : . .:::: .:.
NP_005 DGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLV
120 130 140 150 160 170
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pF1KE1 SSGVLKHQVTHTGEKSHRSSKSREAFHAGKRHYKCSECGKAFGQKYLLVQHQRLHAGKKT
: :..:..:: .::.:. :: :::. : ::. .:: :::. :.. :::: ...
NP_005 RSRFLQQQAAHTRKKSNRT-KSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERS
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 YECSECGKLFRDMSNLFIHQIVHTGERPYGCSNCGKSFSRNAHLIEHQRVHTGEKPFTCS
: :::::: : .: :
NP_005 YMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCD
240 250 260 270 280 290
>>NP_001252529 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 is (503 aa)
initn: 1503 init1: 1503 opt: 1522 Z-score: 849.7 bits: 166.6 E(85289): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 1547; 46.0% identity (70.8% similar) in 483 aa overlap (9-462:23-501)
10 20 30 40
pF1KE1 MAAAALRDPAQGYVTFEDVAVYFSQEEWRLLDDAQRLLYRNVMLEN
:.. .. : : . ...: ..:. ..:..
NP_001 MLENFALTSSLGCWCGVEHEETPSEQRISGERVPQFRTSKEGSSSQNADSCEICCLVLRD
10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 FTLLAS-LGCWHGAEAEEAPEQIASVGLLSSNIQQHQKQHCGEKPLKRQQGRVPVLRSCK
. :: : : . . .:. .:.:.::::.:: : :.. . .::
NP_001 ILHLAEHQGTNCGQKLHTCGKQF----YISANLQQHQRQHITEAPFRSYVDTASFTQSCI
70 80 90 100 110
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pF1KE1 VHLSEKSLQSREVGKALLISSGVLKHQVTHTGEKSHRSSKSREAFHAGKRH---------
::.::: . ::. : .: . :....:.:::: . :.: ::..:: :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]