Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1155
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1155, 506 aa
1>>>pF1KE1155 506 - 506 aa - 506 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6693+/-0.000436; mu= 6.7941+/- 0.027
mean_var=129.3647+/-26.217, 0's: 0 Z-trim(114.2): 75 B-trim: 257 in 1/52
Lambda= 0.112763
statistics sampled from 23859 (23934) to 23859 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 9.850
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011513299 (OMIM: 603778) PREDICTED: chromodomai ( 522) 1337 229.3 2.2e-59
NP_001137442 (OMIM: 603778) chromodomain Y-like pr ( 412) 1334 228.7 2.5e-59
NP_001137443 (OMIM: 603778) chromodomain Y-like pr ( 412) 1334 228.7 2.5e-59
NP_004815 (OMIM: 603778) chromodomain Y-like prote ( 544) 1334 228.8 3.1e-59
NP_004816 (OMIM: 400018,415000) testis-specific ch ( 541) 1111 192.5 2.6e-48
NP_733841 (OMIM: 400016,415000) testis-specific ch ( 540) 1109 192.2 3.3e-48
NP_004671 (OMIM: 400016,415000) testis-specific ch ( 554) 1082 187.8 7e-47
XP_011529814 (OMIM: 400016,415000) PREDICTED: test ( 470) 856 151.0 7.1e-36
NP_006108 (OMIM: 608024) enoyl-CoA delta isomerase ( 364) 594 108.3 3.9e-23
NP_001159482 (OMIM: 608024) enoyl-CoA delta isomer ( 364) 594 108.3 3.9e-23
NP_996667 (OMIM: 608024) enoyl-CoA delta isomerase ( 394) 594 108.3 4.1e-23
NP_004083 (OMIM: 602292,616277) enoyl-CoA hydratas ( 290) 292 59.2 2e-08
NP_001389 (OMIM: 600696) delta(3,5)-Delta(2,4)-die ( 328) 282 57.6 6.7e-08
XP_016865659 (OMIM: 608024) PREDICTED: enoyl-CoA d ( 334) 269 55.4 3e-07
XP_006715020 (OMIM: 608024) PREDICTED: enoyl-CoA d ( 364) 269 55.5 3.2e-07
XP_016881937 (OMIM: 600696) PREDICTED: delta(3,5)- ( 248) 265 54.7 3.6e-07
XP_016870338 (OMIM: 250950,600529) PREDICTED: meth ( 323) 240 50.7 7.5e-06
NP_001689 (OMIM: 250950,600529) methylglutaconyl-C ( 339) 240 50.7 7.9e-06
XP_005252126 (OMIM: 250950,600529) PREDICTED: meth ( 298) 230 49.1 2.2e-05
XP_005252124 (OMIM: 250950,600529) PREDICTED: meth ( 333) 230 49.1 2.4e-05
XP_005252123 (OMIM: 250950,600529) PREDICTED: meth ( 349) 230 49.1 2.5e-05
NP_059990 (OMIM: 611626) M-phase phosphoprotein 8 ( 860) 235 50.1 3.1e-05
XP_011533426 (OMIM: 611626) PREDICTED: M-phase pho ( 879) 235 50.1 3.2e-05
XP_016870340 (OMIM: 250950,600529) PREDICTED: meth ( 214) 210 45.8 0.00016
XP_016870339 (OMIM: 250950,600529) PREDICTED: meth ( 230) 210 45.8 0.00017
XP_011517104 (OMIM: 250950,600529) PREDICTED: meth ( 230) 210 45.8 0.00017
NP_000173 (OMIM: 600890,609015,609016) trifunction ( 763) 216 47.0 0.00024
NP_001120794 (OMIM: 604478) chromobox protein homo ( 191) 190 42.5 0.0013
NP_001120793 (OMIM: 604478) chromobox protein homo ( 191) 190 42.5 0.0013
NP_036249 (OMIM: 604478) chromobox protein homolog ( 191) 190 42.5 0.0013
XP_006717213 (OMIM: 250950,600529) PREDICTED: meth ( 320) 185 41.8 0.0037
NP_057671 (OMIM: 604477) chromobox protein homolog ( 183) 175 40.0 0.007
XP_005249668 (OMIM: 604477) PREDICTED: chromobox p ( 183) 175 40.0 0.007
NP_009207 (OMIM: 604477) chromobox protein homolog ( 183) 175 40.0 0.007
NP_001293119 (OMIM: 250950,600529) methylglutacony ( 310) 178 40.6 0.0079
NP_006798 (OMIM: 604511) chromobox protein homolog ( 185) 174 39.9 0.008
NP_001120700 (OMIM: 604511) chromobox protein homo ( 185) 174 39.9 0.008
>>XP_011513299 (OMIM: 603778) PREDICTED: chromodomain Y- (522 aa)
initn: 1651 init1: 1309 opt: 1337 Z-score: 1187.2 bits: 229.3 E(85289): 2.2e-59
Smith-Waterman score: 1635; 51.6% identity (74.0% similar) in 531 aa overlap (1-505:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
::: .::::::::::::::::: :::.::::: : .::::::.::..:::.: .:: :
XP_011 MASEELYEVERIVDKRKNKKGKTEYLVRWKGYDSEDDTWEPEQHLVNCEEYIHDFNRRHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE1 SKDKRIKSGKQSSTS-----KLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGK---SKGT-----SHKRK
:.:. . . :: : . : . . : : . :: ::.. :.: .
XP_011 EKQKESTLTRTNRTSPNNARKQISRSTNSNFSKTSPKALVIGKDHESKNSQLFAASQKFR
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 RINPPLAKPKKGYSGKPSSGGDRATKT-VSYRTTPSGLQ------IMPLKKSQNGMENGD
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XP_011 KNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSESPEKLDPVEQGQEDTVAPE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE1 AGSEKDERHF-GNGSHQPGLDLNDHVGE---QDMGECDVNHAT-LAENGLGSALTNGGLN
...:: . : :... . .. : : . :: :: :: : . .
XP_011 VAAEKPVGALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAMATGLAVNGKGVTAS-----
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 LHSPVKRK-LEAEKDYVFDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFTHILLSSQTSDNNA
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XP_011 -----KRKFIDDRRDQPFDKRLRFSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 LTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSSDRRKESTRIAEA
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XP_011 LNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEA
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 IRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQTPYATIRLTPAGCS
::.::..::::::::.::.::::.:::::::::::.:::.:::::::::.:. .: :::
XP_011 IRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGASILPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 SYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEVMLRVKEMASCSAV
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XP_011 TVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPV
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE1 VLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDKIYEV
:::::: ::: .: ::..::.:: .::..:.:..:.::...::: :: :
XP_011 VLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF
480 490 500 510 520
>>NP_001137442 (OMIM: 603778) chromodomain Y-like protei (412 aa)
initn: 1338 init1: 1309 opt: 1334 Z-score: 1186.2 bits: 228.7 E(85289): 2.5e-59
Smith-Waterman score: 1350; 55.4% identity (78.5% similar) in 395 aa overlap (135-505:17-411)
110 120 130 140 150
pF1KE1 KRKRINPPLAKPKKGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQ------IMPLKKSQNGMEN
:. ::. .:.: . :....:.
NP_001 MDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSESPEKLDPVEQGQEDTVA
10 20 30 40
160 170 180 190 200
pF1KE1 GDAGSEKDERHF-GNGSHQPGLDLNDHVGE---QDMGECDVNHAT-LAENGLGS-----A
....:: . : :... . .. : : . :: :: :: :. :
NP_001 PEVAAEKPVGALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAMATGLAVNGKGTSPFMDA
50 60 70 80 90 100
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 LT-NGGLNLHSPV------KRK-LEAEKDYVFDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGF
:: :: :... : ::: .. ..: ::::::.::::.:: :.:::::::..::
NP_001 LTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLRFSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGF
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 THILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRL
::::::...:.::.:.::.:.::. :: .::.:::::.:::::::::: :::. :.: ::
NP_001 THILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRL
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 SSDRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQ
..::..:::..:::::.::..::::::::.::.::::.:::::::::::.:::.::::::
NP_001 TDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGASILPLCDVVWANEKAWFQ
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 TPYATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQE
:::.:. .: :::. ::.:.: : :::::. ::::::::::..::::::::: ::.::
NP_001 TPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQE
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450 460 470 480 490 500
pF1KE1 VMLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQ
::.:.::.:::. ::::::: ::: .: ::..::.:: .::..:.:..:.::...:::
NP_001 VMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQ
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 DKIYEV
:: :
NP_001 RKIDEF
410
>>NP_001137443 (OMIM: 603778) chromodomain Y-like protei (412 aa)
initn: 1338 init1: 1309 opt: 1334 Z-score: 1186.2 bits: 228.7 E(85289): 2.5e-59
Smith-Waterman score: 1350; 55.4% identity (78.5% similar) in 395 aa overlap (135-505:17-411)
110 120 130 140 150
pF1KE1 KRKRINPPLAKPKKGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQ------IMPLKKSQNGMEN
:. ::. .:.: . :....:.
NP_001 MDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSESPEKLDPVEQGQEDTVA
10 20 30 40
160 170 180 190 200
pF1KE1 GDAGSEKDERHF-GNGSHQPGLDLNDHVGE---QDMGECDVNHAT-LAENGLGS-----A
....:: . : :... . .. : : . :: :: :: :. :
NP_001 PEVAAEKPVGALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAMATGLAVNGKGTSPFMDA
50 60 70 80 90 100
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 LT-NGGLNLHSPV------KRK-LEAEKDYVFDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGF
:: :: :... : ::: .. ..: ::::::.::::.:: :.:::::::..::
NP_001 LTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLRFSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGF
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 THILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRL
::::::...:.::.:.::.:.::. :: .::.:::::.:::::::::: :::. :.: ::
NP_001 THILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRL
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 SSDRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQ
..::..:::..:::::.::..::::::::.::.::::.:::::::::::.:::.::::::
NP_001 TDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGASILPLCDVVWANEKAWFQ
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 TPYATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQE
:::.:. .: :::. ::.:.: : :::::. ::::::::::..::::::::: ::.::
NP_001 TPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQE
290 300 310 320 330 340
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 VMLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQ
::.:.::.:::. ::::::: ::: .: ::..::.:: .::..:.:..:.::...:::
NP_001 VMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQ
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 DKIYEV
:: :
NP_001 RKIDEF
410
>>NP_004815 (OMIM: 603778) chromodomain Y-like protein i (544 aa)
initn: 1651 init1: 1309 opt: 1334 Z-score: 1184.3 bits: 228.8 E(85289): 3.1e-59
Smith-Waterman score: 1637; 51.6% identity (73.9% similar) in 537 aa overlap (7-505:7-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
:::::::::::::::: :::.::::: : .::::::.::..:::.: .:: :
NP_004 MASEELYEVERIVDKRKNKKGKTEYLVRWKGYDSEDDTWEPEQHLVNCEEYIHDFNRRHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE1 SKDKRIKSGKQSSTS-----KLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGK---SKGT-----SHKRK
:.:. . . :: : . : . . : : . :: ::.. :.: .
NP_004 EKQKESTLTRTNRTSPNNARKQISRSTNSNFSKTSPKALVIGKDHESKNSQLFAASQKFR
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 RINPPLAKPKKGYSGKPSSGGDRATKT-VSYRTTPSGLQ------IMPLKKSQNGMENGD
. . : . .:... :. . :. :. ::. .:.: . :....:. .
NP_004 KNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSESPEKLDPVEQGQEDTVAPE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE1 AGSEKDERHF-GNGSHQPGLDLNDHVGE---QDMGECDVNHAT-LAENGLGS-----ALT
...:: . : :... . .. : : . :: :: :: :. :::
NP_004 VAAEKPVGALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAMATGLAVNGKGTSPFMDALT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KE1 -NGGLNLHSPV------KRK-LEAEKDYVFDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFTH
:: :... : ::: .. ..: ::::::.::::.:: :.:::::::..::::
NP_004 ANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLRFSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGFTH
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 ILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSS
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NP_004 ILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLTD
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 DRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQTP
::..:::..:::::.::..::::::::.::.::::.:::::::::::.:::.::::::::
NP_004 DRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGASILPLCDVVWANEKAWFQTP
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 YATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEVM
:.:. .: :::. ::.:.: : :::::. ::::::::::..::::::::: ::.::::
NP_004 YTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVM
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450 460 470 480 490 500
pF1KE1 LRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDK
.:.::.:::. ::::::: ::: .: ::..::.:: .::..:.:..:.::...::: :
NP_004 VRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRK
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 IYEV
: :
NP_004 IDEF
>>NP_004816 (OMIM: 400018,415000) testis-specific chromo (541 aa)
initn: 1290 init1: 1068 opt: 1111 Z-score: 988.3 bits: 192.5 E(85289): 2.6e-48
Smith-Waterman score: 1332; 41.6% identity (69.9% similar) in 538 aa overlap (7-505:6-540)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
.::: :::::..:.:. .::.::::: . .::::::.::..::. . .:: .
NP_004 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 SKDKRIK---SGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGKSKGTSHKRKRINPPLAKPK
:.:.. ... :.. : ::. ... .. :. : .: :.:.. .: :
NP_004 EKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDK---HHRSKNCKLFAASK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQIMPL--KKSQNG---MENGD--AGSEKDERHF
. :. .: . . : . :. ::. .: .:. : :....: :
NP_004 NVRRKAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVF
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE1 GNGSHQPGLDLNDHVGEQDMG----------ECDVNHATLAENGLGSAL-----------
. : .: : .. : ... .. : . :::
NP_004 KVTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPL
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 -TNGGLNLHSPVKRKLEAEKDYV-------FDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFT
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NP_004 AANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFT
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 HILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLS
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NP_004 QIVLSTRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVRHLR
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 SDRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQT
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NP_004 NDRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQT
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 PYATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEV
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NP_004 PYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEV
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450 460 470 480 490 500
pF1KE1 MLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQD
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NP_004 MIQIKELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVEN
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 KIYEV
:: :
NP_004 KIDEF
540
>>NP_733841 (OMIM: 400016,415000) testis-specific chromo (540 aa)
initn: 1298 init1: 1061 opt: 1109 Z-score: 986.6 bits: 192.2 E(85289): 3.3e-48
Smith-Waterman score: 1325; 41.5% identity (70.2% similar) in 537 aa overlap (7-505:6-539)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
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NP_733 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQT
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pF1KE1 SKDKRIK---SGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGKSKGTSHKRKRINPPLAKPK
:.:.. ... :.. : ::. ... .. :. : .: :.:.. .: :
NP_733 EKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDK---HHRSKNRKLFAASK
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pF1KE1 KGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQIMPL-KKSQNG---MENGD--AGSEKDERHF-
. : .: . . : . :. .:. .: .:. : :....: :
NP_733 NVRRKAASILSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKTVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVFK
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE1 ---GN---------GSHQPGLDLNDHVGE---QDMGECDVNHATLAENGLGSAL------
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NP_733 VTEGKLLRDPLSRPGAEQTGIQNKTQIHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPLA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 TNGGLNLHSPVKRK-------LEAEKDYVFDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFTH
.:: ..:. : : . .: : :......: .:: .:::::.::.:::.
NP_733 ANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRDQPFIKKMHFTIRLTESASTYRDIVVKKEDGFTQ
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270 280 290 300 310 320
pF1KE1 ILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSS
:.::......:::. :..::. :: .::.:::::.:.::.::::: :::..:.. .: .
NP_733 IVLSTRSTEKNALNTEVIKEIVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVKHLRN
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330 340 350 360 370 380
pF1KE1 DRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQTP
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NP_733 NRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTP
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390 400 410 420 430 440
pF1KE1 YATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEVM
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NP_733 YTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVM
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450 460 470 480 490 500
pF1KE1 LRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDK
...::.:: . .:::: : ::: .: ::..::.:: .:...:::..:..:...:...:
NP_733 IQIKELASYNPIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENK
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 IYEV
: :
NP_733 IDEF
540
>>NP_004671 (OMIM: 400016,415000) testis-specific chromo (554 aa)
initn: 1271 init1: 1034 opt: 1082 Z-score: 962.6 bits: 187.8 E(85289): 7e-47
Smith-Waterman score: 1298; 41.5% identity (69.9% similar) in 528 aa overlap (7-496:6-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
.::: :::::..:.:. .::.::::: . .::::::.::..::. . .:: .
NP_004 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 SKDKRIK---SGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGKSKGTSHKRKRINPPLAKPK
:.:.. ... :.. : ::. ... .. :. : .: :.:.. .: :
NP_004 EKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDK---HHRSKNRKLFAASK
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pF1KE1 KGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQIMPL-KKSQNG---MENGD--AGSEKDERHF-
. : .: . . : . :. .:. .: .:. : :....: :
NP_004 NVRRKAASILSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKTVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVFK
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE1 ---GN---------GSHQPGLDLNDHVGE---QDMGECDVNHATLAENGLGSAL------
:. :..: :.. . .. : : .. :: . . : ..
NP_004 VTEGKLLRDPLSRPGAEQTGIQNKTQIHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPLA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 TNGGLNLHSPVKRK-------LEAEKDYVFDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFTH
.:: ..:. : : . .: : :......: .:: .:::::.::.:::.
NP_004 ANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRDQPFIKKMHFTIRLTESASTYRDIVVKKEDGFTQ
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 ILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSS
:.::......:::. :..::. :: .::.:::::.:.::.::::: :::..:.. .: .
NP_004 IVLSTRSTEKNALNTEVIKEIVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVKHLRN
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330 340 350 360 370 380
pF1KE1 DRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQTP
.: : .....:..::..::::::::::..::::.:::::::::::.:::.::::::::
NP_004 NRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTP
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pF1KE1 YATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEVM
:.:. .: :::: :::...: : :::::. ::::::.:::..::::::: ::.::::
NP_004 YTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVM
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pF1KE1 LRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDK
...::.:: . .:::: : ::: .: ::..::.:: .:...:::..:..:..
NP_004 IQIKELASYNPIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKIPLLG
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 IYEV
NP_004 YKAAFPPRKTQNDQRWCP
540 550
>>XP_011529814 (OMIM: 400016,415000) PREDICTED: testis-s (470 aa)
initn: 1083 init1: 846 opt: 856 Z-score: 765.1 bits: 151.0 E(85289): 7.1e-36
Smith-Waterman score: 1072; 40.3% identity (68.2% similar) in 462 aa overlap (7-430:6-464)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
.::: :::::..:.:. .::.::::: . .::::::.::..::. . .:: .
XP_011 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQT
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70 80 90 100 110
pF1KE1 SKDKRIK---SGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGKSKGTSHKRKRINPPLAKPK
:.:.. ... :.. : ::. ... .. :. : .: :.:.. .: :
XP_011 EKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDK---HHRSKNRKLFAASK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQIMPL-KKSQNG---MENGD--AGSEKDERHF-
. : .: . . : . :. .:. .: .:. : :....: :
XP_011 NVRRKAASILSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKTVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVFK
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE1 ---GN---------GSHQPGLDLNDHVGE---QDMGECDVNHATLAENGLGSAL------
:. :..: :.. . .. : : .. :: . . : ..
XP_011 VTEGKLLRDPLSRPGAEQTGIQNKTQIHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPLA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 TNGGLNLHSPVKRK-------LEAEKDYVFDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFTH
.:: ..:. : : . .: : :......: .:: .:::::.::.:::.
XP_011 ANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRDQPFIKKMHFTIRLTESASTYRDIVVKKEDGFTQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KE1 ILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSS
:.::......:::. :..::. :: .::.:::::.:.::.::::: :::..:.. .: .
XP_011 IVLSTRSTEKNALNTEVIKEIVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVKHLRN
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.: : .....:..::..::::::::::..::::.:::::::::::.:::.::::::::
XP_011 NRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTP
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pF1KE1 YATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEVM
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pF1KE1 LRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDK
>>NP_006108 (OMIM: 608024) enoyl-CoA delta isomerase 2, (364 aa)
initn: 588 init1: 532 opt: 594 Z-score: 536.4 bits: 108.3 E(85289): 3.9e-23
Smith-Waterman score: 594; 37.8% identity (72.4% similar) in 254 aa overlap (249-502:109-361)
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 PVKRKLEAEKDYVFDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFTHILLSSQTSDNNALTPE
:. .:: .:.:.:.:... . . .::.. :
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pF1KE1 IMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSSDRRKESTRIAEAIRDF
...:. ::: :. ::: . .:.. :. . :: : . . . .... : .:.:
NP_006 MYHEIMRALKAASKDDSIITVLTGNGDYYSSGNDLTNFTDIPPGGVEEKAKNNAVLLREF
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pF1KE1 VKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQTPYATIRLTPAGCSSYTF
: ::.: ::.....::::.:.....: : : :.::..: :.::.. . .: :::::::
NP_006 VGCFIDFPKPLIAVVNGPAVGISVTLLGLFDAVYASDRATFHTPFSHLGQSPEGCSSYTF
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pF1KE1 PQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEVMLRVKEMASCSAVVLEE
:.:.. : :.:::. :.:::: :::..:::..:: .::..:: :.: .:. .:.
NP_006 PKIMSPAKATEMLIFGKKLTAGEACAQGLVTEVFPDSTFQKEVWTRLKAFAKLPPNALRI
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pF1KE1 SKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDKIYEV
:: ..:. . :. :: .:: .:. : :.. ... ..:. :
NP_006 SKEVIRKREREKLHAVNAEECNVLQGRWLSDECTNAVVNFLSRKSKL
320 330 340 350 360
>>NP_001159482 (OMIM: 608024) enoyl-CoA delta isomerase (364 aa)
initn: 588 init1: 532 opt: 594 Z-score: 536.4 bits: 108.3 E(85289): 3.9e-23
Smith-Waterman score: 594; 37.8% identity (72.4% similar) in 254 aa overlap (249-502:109-361)
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 PVKRKLEAEKDYVFDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFTHILLSSQTSDNNALTPE
:. .:: .:.:.:.:... . . .::.. :
NP_001 QNYVDLVSSLSPSLESSSQVEPGTDRKSTGFETLVVTSEDGITKIMFN-RPKKKNAINTE
80 90 100 110 120 130
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pF1KE1 IMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSSDRRKESTRIAEAIRDF
...:. ::: :. ::: . .:.. :. . :: : . . . .... : .:.:
NP_001 MYHEIMRALKAASKDDSIITVLTGNGDYYSSGNDLTNFTDIPPGGVEEKAKNNAVLLREF
140 150 160 170 180 190
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pF1KE1 VKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQTPYATIRLTPAGCSSYTF
: ::.: ::.....::::.:.....: : : :.::..: :.::.. . .: :::::::
NP_001 VGCFIDFPKPLIAVVNGPAVGISVTLLGLFDAVYASDRATFHTPFSHLGQSPEGCSSYTF
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pF1KE1 PQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEVMLRVKEMASCSAVVLEE
:.:.. : :.:::. :.:::: :::..:::..:: .::..:: :.: .:. .:.
NP_001 PKIMSPAKATEMLIFGKKLTAGEACAQGLVTEVFPDSTFQKEVWTRLKAFAKLPPNALRI
260 270 280 290 300 310
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pF1KE1 SKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDKIYEV
:: ..:. . :. :: .:: .:. : :.. ... ..:. :
NP_001 SKEVIRKREREKLHAVNAEECNVLQGRWLSDECTNAVVNFLSRKSKL
320 330 340 350 360
506 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 12:18:11 2016 done: Sun Nov 6 12:18:13 2016
Total Scan time: 9.850 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]