FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1151, 486 aa
1>>>pF1KE1151 486 - 486 aa - 486 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3887+/-0.00101; mu= 4.2485+/- 0.060
mean_var=213.8938+/-45.245, 0's: 0 Z-trim(111.9): 131 B-trim: 506 in 1/51
Lambda= 0.087695
statistics sampled from 12630 (12772) to 12630 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.392), width: 16
Scan time: 3.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 3372 439.5 3.7e-123
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 1349 183.6 4.1e-46
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 1319 179.8 5.6e-45
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 1215 166.6 5.1e-41
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 1159 159.6 7.1e-39
CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 1084 150.1 5e-36
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 948 132.9 7.6e-31
CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 933 131.0 2.8e-30
CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 851 120.6 3.8e-27
CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 851 120.6 4e-27
CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 812 115.7 1.2e-25
CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 791 113.0 7e-25
CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 789 112.7 8.3e-25
CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 789 112.7 8.3e-25
CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 771 110.5 4.3e-24
CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 759 109.0 1.2e-23
CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 ( 452) 750 107.8 2.5e-23
CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 746 107.3 3.6e-23
CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 744 107.1 4.6e-23
CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 741 106.7 5.8e-23
CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 736 105.9 6.8e-23
CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 736 105.9 7.2e-23
CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 743 107.1 7.4e-23
CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 ( 452) 727 104.9 1.9e-22
CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 ( 452) 726 104.8 2.1e-22
CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 717 103.7 4.9e-22
CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 ( 452) 705 102.1 1.3e-21
CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 665 97.1 4.9e-20
CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 ( 450) 648 94.9 1.9e-19
CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 630 92.5 7.7e-19
CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 ( 475) 622 91.6 2e-18
CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 613 90.5 4.4e-18
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 592 87.8 2.9e-17
CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 313) 584 86.6 4.1e-17
CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 407) 584 86.7 5e-17
CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 523) 584 86.8 6e-17
CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 466) 582 86.5 6.5e-17
CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 527) 582 86.6 7.1e-17
CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 ( 526) 581 86.5 7.8e-17
CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16 ( 477) 577 85.9 1e-16
CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 572 85.2 1.4e-16
CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 574 85.6 1.6e-16
CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 572 85.3 1.6e-16
CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 535) 570 85.1 2.1e-16
CCDS4460.2 BTNL9 gene_id:153579|Hs108|chr5 ( 535) 567 84.7 2.7e-16
CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 461) 559 83.6 4.9e-16
CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 513) 559 83.7 5.3e-16
CCDS3850.2 TRIML2 gene_id:205860|Hs108|chr4 ( 437) 547 82.1 1.3e-15
CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6 ( 425) 540 81.2 2.4e-15
CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 526 79.5 9.2e-15
>>CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 (486 aa)
initn: 3372 init1: 3372 opt: 3372 Z-score: 2324.5 bits: 439.5 E(32554): 3.7e-123
Smith-Waterman score: 3372; 99.8% identity (99.8% similar) in 486 aa overlap (1-486:1-486)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVCDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVCDA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 GPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQERC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQERC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPATA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 QRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPATA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 HPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEWGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 HPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEWGL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYEAG
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 GVCQDTLPRKGETTPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYEAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 EISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGSGNWASRDHLDPASD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 EISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGSGNWASRDHLDPASD
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VRDDHL
::::::
CCDS16 VRDDHL
>>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 (475 aa)
initn: 1300 init1: 1026 opt: 1349 Z-score: 941.4 bits: 183.6 E(32554): 4.1e-46
Smith-Waterman score: 1349; 44.5% identity (71.2% similar) in 479 aa overlap (1-468:1-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
:: : . :.. ::.::: . ::::..:::::: .:::. ..:: .:: :
CCDS44 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQV------GKGGGSVCPVC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGAR--RCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC
: : ...:::::::..:....... : :.. ::: ::: : :::.: ::::::
CCDS44 RQRFLLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWVC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ
. .:: : .::.::: :: :::.:: .:.. : : :.... : . ::. :: :
CCDS44 AQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE
..:.. :: ....::..::::::..:: .:: :. : :....:.:::.::.:: .::..
CCDS44 KSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPA
::. :: ::. : :: ::.. . . . ::...: .:: ...:: : . :::
CCDS44 RCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLDPD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 TAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEW
::.: :.:. : :.:. :. ...:.: ::::..: .:: : : ::.::::: : :
CCDS44 TANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTGKEAW
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 GLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRC-IGIFLDY
::::.:.. :::. . : ..: :..:: . ..: . . :..:: .:. : : .::::::
CCDS44 DLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPL-HLQVPPCQVGIFLDY
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE1 EAGEISFYNVTD-GSYIYTFNQL-FSGLLRPYF---FI---CDATPLILPPTTIAGSGNW
::: .::::.:: :: ::.:.. :.: :::.: : ...:: : : .:...:.
CCDS44 EAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQGST
420 430 440 450 460 470
470 480
pF1KE1 ASRDHLDPASDVRDDHL
CCDS44 DY
>>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 (468 aa)
initn: 1304 init1: 999 opt: 1319 Z-score: 921.0 bits: 179.8 E(32554): 5.6e-45
Smith-Waterman score: 1319; 45.5% identity (66.9% similar) in 475 aa overlap (1-468:1-463)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
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CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRR-CW---GQPEGPYACPEC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 R--GPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC
: .: : ..:::: :: ..: .::: . : : : :. :: .. :: .:
CCDS31 RELSPQR--NLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAAC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ
. . :: .::. :::.:: . ..::. .:: .::...::: .:.. . :.:.. :: :
CCDS31 ERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE
:: :::. : .::.:::. :.::: :: .: ::::. ..: ::: : :: ::.
CCDS31 RQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPA
::: ::::::. .. .: : . : : .::::.:.: .:: : ::.:. :: :::
CCDS31 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 TAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEW
::.: :.:. : :::: :. . .:..::::: ::.:: . :.:::::::: ::. . :
CCDS31 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSW
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 GLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYE
.::::.... :: . : :: : : .: :. : .:: . :: .:::::::
CCDS31 ALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL-GSYYNSSERALAPLR--DPPRRVGIFLDYE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 AGEISFYNVTDGSYIYTFNQL-FSGLLRPYFFICDATPLILPPTTI----AGSGNWASRD
::..:::..:::: .. : .. ::: ::: : ...: : :: .:::.
CCDS31 AGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPT---PMTICRPKGGSGDTLAPQ
420 430 440 450 460
480
pF1KE1 HLDPASDVRDDHL
>>CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 (465 aa)
initn: 1250 init1: 464 opt: 1215 Z-score: 849.9 bits: 166.6 E(32554): 5.1e-41
Smith-Waterman score: 1215; 40.6% identity (68.4% similar) in 468 aa overlap (1-460:1-462)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQ--GGVYACP
:: . ... :.: : .::... .:::..::::.: ::..: .. . : .. ::
CCDS45 MASTTSTKKMMEEATCSICLSLMTNPVSINCGHSYCHLCITDFFKNPSQKQLRQETFCCP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 QCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC
:::.::. ...:::.::..:.:.... : .:::.. :::.. .:: :
CCDS45 QCRAPFHMDSLRPNKQLGSLIEALKETDQ-----EMSCEEHGEQFHLFCEDEGQLICWRC
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALT-QEANVGKKTVIWKEKVEM
. .:.:. : :: .... .:. ::: :. . :.::: : :. ... . . :::::..
CCDS45 ERAPQHKGHTTALVEDVCQGYKEKLQKAVTKL-KQLEDRCTEQKLSTAMRITKWKEKVQI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 QRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQ
:::..: .:.. . :: .::. : ::: ::. ::.:::. .. : .:. :: ::.
CCDS45 QRQKIRSDFKNLQCFLHEEEKSYLWRLEKEEQQTLSRLRDYEAGLGLKSNELKSHILELE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 ERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIP----GRRELLRKFQVDV
:.:: : ::..: .:::: :: .: . .::.: : . ...::. ::.:
CCDS45 EKCQGSAQKLLQNVNDTLSRSWAVKLETSEAVSLELHTMCNVSKLYFDVKKMLRSHQVSV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 KLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVG
::: ::: :.:. : :.: : .. .. .:: ..::.:: ..:.:::.:.:: ::
CCDS45 TLDPDTAHHELILSEDRRQVTRGYTQENQDTSSRRFTAFPCVLGCEGFTSGRRYFEVDVG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 EGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGI
::. : ::::.... : :..: :.: : : . :..:.:: . : :.: .::
CCDS45 EGTGWDLGVCMENVQRGTGMKQEPQSGFWTLRLCKKKGYVALTSPPTSLHLHEQPLLVGI
360 370 380 390 400 410
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CCDS34 FALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLAT
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CCDS34 EGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTP
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.:: .:. .::::::::: .::::::: :.::::.. :. : : :. .
CCDS34 FTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKN
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CCDS34 AAPLTIRPPTDWE
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CCDS15 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ
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CCDS15 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL
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CCDS15 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE
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CCDS15 DVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEV
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CCDS15 GMNITGD-ALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALTPVMLMEP
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CCDS15 MWVKG
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CCDS38 EYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLRE
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CCDS38 VEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKCPELFSFRLT-KYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQV
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CCDS38 DVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVE
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CCDS38 VGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKI
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CCDS38 GIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDCFTEAVWPYFYTGTDSEPLKICSVSDSER
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CCDS38 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTP----LSCPEC
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CCDS38 WRTLEGPHFQSNERLGR-LASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQGGSAF
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CCDS38 VAQSHGANRVHLSS---EAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEK---ERVKLCQE
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CCDS38 ETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMI
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CCDS38 AQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEI
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CCDS38 TLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVG
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CCDS38 NKTEWEVGICKDSVSRKGN-LPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKV
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CCDS38 GVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSH
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CCDS38 V
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CCDS31 QTSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPGKQLKAVLCADHGEKLQLFCQEDGKVICWLC
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CCDS31 ERSQEHRGHHTFLVEEVAQEYQEKFQESLKKLKNEEQEAEKLTAFIREKKTSWKNQMEPE
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CCDS31 RCRIQTEFNQLRNILDRVEQRELKKLEQEEKKGLRIIEEAENDLVHQTQSLRELISDLER
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CCDS31 RCQGSTMELLQDVSDVTERSEFWTLRKPEALPTKLRSMFRAPDLKRMLRVCRELTDVQSY
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CCDS31 WVDVTLNPHTANLNLVLAKNRRQVRFVGAKVSGPSCLEKH--YDCSVLGSQHFSSGKHYW
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CCDS31 EVDVAKKTAWILGVCSNSLGPTFSFNHFAQNHSAYSRYQPQSGYWVIGLQHNHEYRAYED
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pF1KE1 ASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSY-IYTFNQL-FSGLLRPYFFICDA
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CCDS31 SSPSLLLSMTVPPRRVGVFLDYEAGTVSFYNVTNHGFPIYTFSKYYFPTTLCPYFNPCNC
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460 470 480
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CCDS31 VIPMTLRRPSS
480
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10 20 30
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CCDS31 ILQAGNILEIRVGQAGARRVATMTSPVLVDIREEVTCPICLELLTEPLSIDCGHSFCQAC
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CCDS31 ITPNGRESVIGQEGERSCPVCQTSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPGKQLKAVLCA
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pF1KE1 RHGEDLSRFCEEDEAALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDA
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CCDS31 DHGEKLQLFCQEDGKVICWLCERSQEHRGHHTFLVEEVAQEYQEKFQESLKKLKNEEQEA
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pF1KE1 LTQEANVGKKTVIWKEKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRE
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CCDS31 EKLTAFIREKKTSWKNQMEPERCRIQTEFNQLRNILDRVEQRELKKLEQEEKKGLRIIEE
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pF1KE1 SKSRLVQQSKALKELADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTAC
... ::.:...:.:: ..:..::: .. ::. : : ::. : . : .: .:..
CCDS31 AENDLVHQTQSLRELISDLERRCQGSTMELLQDVSDVTERSEFWTLRKPEALPTKLRSMF
250 260 270 280 290 300
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pF1KE1 CIPGRRELLR---------KFQVDVKLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPER
: ...:: .. ::: :.: ::. .:.:. . :.:. . :. :.
CCDS31 RAPDLKRMLRVCRELTDVQSYWVDVTLNPHTANLNLVLAKNRRQVRFVGAKVSGPSCLEK
310 320 330 340 350 360
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CCDS31 H--YDCSVLGSQHFSSGKHYWEVDVAKKTAWILGVCSNSLGPTFSFNHFAQNHSAYSRYQ
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pF1KE1 PENGVWALWLLKGNEYMVL--ASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSY-I
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