Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1150
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1150, 486 aa
1>>>pF1KE1150 486 - 486 aa - 486 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9319+/-0.00232; mu= 17.3215+/- 0.139
mean_var=303.7429+/-54.438, 0's: 0 Z-trim(104.1): 948 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.073590
statistics sampled from 6676 (7730) to 6676 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.56), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 2.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12216.2 ZNF561 gene_id:93134|Hs108|chr19 ( 486) 3373 373.1 3.7e-103
CCDS82286.1 ZNF561 gene_id:93134|Hs108|chr19 ( 417) 2913 324.2 1.7e-88
CCDS74280.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 ( 425) 2502 280.5 2.4e-75
CCDS45956.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 ( 426) 2490 279.3 5.7e-75
CCDS12217.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 ( 354) 2084 236.0 5e-62
CCDS12213.1 ZNF266 gene_id:10781|Hs108|chr19 ( 549) 1332 156.5 6.6e-38
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1309 154.0 3.3e-37
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1302 153.5 6.6e-37
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1280 150.9 2.8e-36
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 1281 151.2 3e-36
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1278 151.0 3.8e-36
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 1252 148.2 2.5e-35
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1250 147.7 2.5e-35
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1250 147.9 2.9e-35
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1250 148.0 2.9e-35
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1250 148.0 3e-35
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1242 146.9 4.7e-35
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 1237 146.5 7.3e-35
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 1236 146.3 7.4e-35
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1237 147.0 9.5e-35
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1237 147.0 9.6e-35
CCDS32902.1 ZNF121 gene_id:7675|Hs108|chr19 ( 390) 1229 145.3 1.1e-34
CCDS77228.1 ZNF121 gene_id:7675|Hs108|chr19 ( 390) 1229 145.3 1.1e-34
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1231 145.8 1.1e-34
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1231 145.9 1.1e-34
CCDS45550.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 ( 729) 1230 145.9 1.3e-34
CCDS73928.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 ( 757) 1230 146.0 1.4e-34
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1224 144.9 1.7e-34
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1224 145.7 2.6e-34
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1224 145.7 2.6e-34
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1217 144.7 3.7e-34
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1217 144.7 3.8e-34
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1217 144.7 3.8e-34
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1213 144.0 4.4e-34
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1213 144.0 4.4e-34
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 1212 143.9 4.8e-34
CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 1209 143.3 5.2e-34
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1212 144.1 5.2e-34
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1209 143.6 5.9e-34
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1208 143.6 6.7e-34
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1208 143.7 7.1e-34
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1208 143.7 7.1e-34
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1208 143.7 7.2e-34
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1208 143.7 7.2e-34
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1205 143.1 7.7e-34
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1205 143.2 8e-34
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 1203 143.0 9.6e-34
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1203 143.1 1e-33
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1203 143.2 1e-33
CCDS42496.1 ZNF846 gene_id:162993|Hs108|chr19 ( 533) 1196 142.1 1.4e-33
>>CCDS12216.2 ZNF561 gene_id:93134|Hs108|chr19 (486 aa)
initn: 3373 init1: 3373 opt: 3373 Z-score: 1965.6 bits: 373.1 E(32554): 3.7e-103
Smith-Waterman score: 3373; 100.0% identity (100.0% similar) in 486 aa overlap (1-486:1-486)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAIYLSRGFFSREPICPFEEKTKVERMVEDYLASGYQDSVTFDDVAVDFTPEEWALLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAAIYLSRGFFSREPICPFEEKTKVERMVEDYLASGYQDSVTFDDVAVDFTPEEWALLDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TEKYLYRDVMLENYMNLASVEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFSGIQMTRGYSGWKLCDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TEKYLYRDVMLENYMNLASVEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFSGIQMTRGYSGWKLCDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KNCGEVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNCYGKDTLSVHKEASTGQELSKFNPCGKVFTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KNCGEVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNCYGKDTLSVHKEASTGQELSKFNPCGKVFTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHTDEKLCEFQEYGRAVTASSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHTDEKLCEFQEYGRAVTASSHL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEKSFECKECGRSFRNSSCLNDHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEKSFECKECGRSFRNSSCLNDHI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 QIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSGLSIHIRSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSGLSIHIRSHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECGKTFITSSRRSKHLKTHSGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECGKTFITSSRRSKHLKTHSGEKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 FVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFAVSSRLSRHERIHTGEKPYECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFAVSSRLSRHERIHTGEKPYECK
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 DMSVTI
::::::
CCDS12 DMSVTI
>>CCDS82286.1 ZNF561 gene_id:93134|Hs108|chr19 (417 aa)
initn: 2913 init1: 2913 opt: 2913 Z-score: 1702.2 bits: 324.2 E(32554): 1.7e-88
Smith-Waterman score: 2913; 100.0% identity (100.0% similar) in 417 aa overlap (70-486:1-417)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 SVTFDDVAVDFTPEEWALLDTTEKYLYRDVMLENYMNLASVEWEIQPRTKRSSLQQGFLK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MLENYMNLASVEWEIQPRTKRSSLQQGFLK
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 NQIFSGIQMTRGYSGWKLCDCKNCGEVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNCYGKDTLSVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NQIFSGIQMTRGYSGWKLCDCKNCGEVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNCYGKDTLSVH
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 KEASTGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KEASTGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIH
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 TDEKLCEFQEYGRAVTASSHLKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TDEKLCEFQEYGRAVTASSHLKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEK
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 SFECKECGRSFRNSSCLNDHIQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SFECKECGRSFRNSSCLNDHIQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYEC
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 KECGQAFAQYSGLSIHIRSHSGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KECGQAFAQYSGLSIHIRSHSGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECG
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 KTFITSSRRSKHLKTHSGEKPFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KTFITSSRRSKHLKTHSGEKPFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFA
340 350 360 370 380 390
460 470 480
pF1KE1 VSSRLSRHERIHTGEKPYECKDMSVTI
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VSSRLSRHERIHTGEKPYECKDMSVTI
400 410
>>CCDS74280.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 (425 aa)
initn: 3065 init1: 1848 opt: 2502 Z-score: 1466.3 bits: 280.5 E(32554): 2.4e-75
Smith-Waterman score: 2502; 84.1% identity (93.0% similar) in 427 aa overlap (1-419:1-425)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAIYLSRGFFSREPICPFEEKTKVERMVEDYLASGYQDSVTFDDVAVDFTPEEWALLDT
:.:. .:.::: ::::::::::::. ::::. ...::::::::::::.:::::::::::
CCDS74 MSAFDMSHGFFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE1 TEKYLYRDVMLENYMNLASV--------EWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFSGIQMTRGY
:.:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::.::::::.:
CCDS74 TQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTGIQMTRSY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 SGWKLCDCKNCGEVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNCYGKDTLSVHKEASTGQELSKFN
::::::. :::::: ::::::::::.:::::: ::::::::..::::::: ::::::::
CCDS74 SGWKLCE--NCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISVHKEASIGQELSKFN
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 PCGKVFTLTPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHTDEKLCEFQEYGR
:::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::: :::::::: :
CCDS74 PCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECER
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 AVTASSHLKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEKSFECKECGRSFRN
:.:.::::::::::::::::.:::.::::::::::: : .::::::::::::::::::::
CCDS74 AITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFRN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SSCLNDHIQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSGL
:: .: :::::::::::::: :::::::::.::.::::::::::::::::::::.::.::
CCDS74 SSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTGL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 SIHIRSHSGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECGKTFITSSRRSKHL
.::::.:.:.::::::::::::. :..: :: ::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS74 AIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKHL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 KTHSGEKPFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFAVSSRLSRHERIHT
::::::.
CCDS74 KTHSGER
420
>>CCDS45956.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 (426 aa)
initn: 3423 init1: 1848 opt: 2490 Z-score: 1459.4 bits: 279.3 E(32554): 5.7e-75
Smith-Waterman score: 2490; 83.9% identity (92.8% similar) in 428 aa overlap (1-419:1-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAIYLSRGFFSREPICPFEEKTKVERMVEDYLASGYQDSVTFDDVAVDFTPEEWALLDT
:.:. .:.::: ::::::::::::. ::::. ...::::::::::::.:::::::::::
CCDS45 MSAFDMSHGFFPREPICPFEEKTKIGTMVEDHRSNSYQDSVTFDDVAVEFTPEEWALLDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE1 TEKYLYRDVMLENYMNLASV--------EWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFSGIQM-TRG
:.:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::.:::: ::.
CCDS45 TQKYLYRDVMLENYMNLASVDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFTGIQMQTRS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 YSGWKLCDCKNCGEVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNCYGKDTLSVHKEASTGQELSKF
:::::::. :::::: ::::::::::.:::::: ::::::::..::::::: :::::::
CCDS45 YSGWKLCE--NCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISVHKEASIGQELSKF
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 NPCGKVFTLTPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHTDEKLCEFQEYG
::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS45 NPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHIGEKLCEFQECE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RAVTASSHLKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEKSFECKECGRSFR
::.:.::::::::::::::::.:::.::::::::::: : .:::::::::::::::::::
CCDS45 RAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGEKSFECKECGRSFR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 NSSCLNDHIQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSG
::: .: :::::::::::::: :::::::::.::.::::::::::::::::::::.::.:
CCDS45 NSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYECKECGQAFTQYTG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LSIHIRSHSGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECGKTFITSSRRSKH
:.::::.:.:.::::::::::::. :..: :: ::::::::::::::::::::::.::::
CCDS45 LAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVECGKTFITSSHRSKH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 LKTHSGEKPFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFAVSSRLSRHERIH
:::::::.
CCDS45 LKTHSGER
420
>>CCDS12217.1 ZNF562 gene_id:54811|Hs108|chr19 (354 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KE1 SVTFDDVAVDFTPEEWALLDTTEKYLYRDVMLENYMNLASVEWEIQPRTKRSSLQQGFLK
: .... . :::::::::::::::::::
CCDS12 MSAFDMSHDFFFCLTSEWEIQPRTKRSSLQQGFLK
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 NQIFSGIQM-TRGYSGWKLCDCKNCGEVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNCYGKDTLSV
::::.:::: ::.:::::::. :::::: ::::::::::.:::::: ::::::::..::
CCDS12 NQIFTGIQMQTRSYSGWKLCE--NCGEVFSEQFCLKTHMRAQNGGNTFEGNCYGKDSISV
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 HKEASTGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGI
::::: :::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HKEASIGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEILNGRQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGI
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 HTDEKLCEFQEYGRAVTASSHLKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGE
: :::::::: ::.:.::::::::::::::::.:::.::::::::::: : .::::::
CCDS12 HIGEKLCEFQECERAITTSSHLKQCVAVHTGKKSEKTKNCGKSFTNFSQLSAHAKTHKGE
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 KSFECKECGRSFRNSSCLNDHIQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYE
:::::::::::::::: .: :::::::::::::: :::::::::.::.::::::::::::
CCDS12 KSFECKECGRSFRNSSSFNVHIQIHTGIKPHKCTECGKAFTRSTHLTQHVRTHTGIKPYE
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 CKECGQAFAQYSGLSIHIRSHSGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVEC
::::::::.::.::.::::.:.:.::::::::::::. :..: :: ::::::::::::::
CCDS12 CKECGQAFTQYTGLAIHIRNHTGEKPYQCKECGKAFNRSSTLTQHRRIHTGEKPYECVEC
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 GKTFITSSRRSKHLKTHSGEKPFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAF
::::::::.:::::::::::.
CCDS12 GKTFITSSHRSKHLKTHSGER
340 350
>>CCDS12213.1 ZNF266 gene_id:10781|Hs108|chr19 (549 aa)
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50 60 70 80 90 100
pF1KE1 VAVDFTPEEWALLDTTEKYLYRDVMLENYMNLASVEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFSG
.. . ::..: .::. .::: : . ::
CCDS12 KNLATVGYQLFKPSLISWLEQEESRTVQRGDFQASEWKVQLKTKELALQQDVLGEPTSSG
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 IQMTRGYSGWKLCDCKNCGEVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNCYGKDTLSVHKEASTG
::: ...: .. : :.::.: :. :::::.:.::. :: : :: : :..::..:::
CCDS12 IQMIGSHNGGEVSDVKQCGDVSSEHSCLKTHVRTQNSENTFECYLYGVDFLTLHKKTSTG
70 80 90 100 110 120
170 180
pF1KE1 QELSKFNPCGKVFTLTPG------------------------------------------
.. : :. :::.:.:.:
CCDS12 EQRSVFSQCGKAFSLNPDVVCQRTCTGEKAFDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNGESLHE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KE1 -------------LAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHTDE--------
:::.... ...:::::::::::.: : :. ::: :: .
CCDS12 WKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKEC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KE1 -----KLCEFQEY---------------GRAVTASSHLKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSF
. :.. .. ::: :.:: :.: . .:.:.: . :.:: .:
CCDS12 GKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKECGIAF
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 TNFSQLYAPVKTHKGEKSFECKECGRSFRNSSCLNDHIQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRST
: ::: .::: .. :::: ::.::::::::.::..:::::::.:: ::::::...
CCDS12 TRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNS
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 QLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSGLSIHIRSHSGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQ
.::.:.:::.: .::::::::.:::. : :: : :.:.:.::..: .:::::. :..:
CCDS12 DLTKHARTHSGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAISSNLSG
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 HTRIHTGEKPYECVECGKTFITSSRRSKHLKTHSGEKPFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRT
: ::::::::.::.::::.: :: ..:..:::..:::.: ::::: . . .:.:.:
CCDS12 HLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVNLHMRI
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480
pF1KE1 HTGEKPFVCKECGKAFAVSSRLSRHERIHTGEKPYECKDMSVTI
::::::. ::.:::.:. :. .. ::: ::::::::::.
CCDS12 HTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHTGEKPYECKECGKAFSSSSSFRNHERRHADE
490 500 510 520 530 540
CCDS12 RLSA
>>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 (475 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 RGFFSREPICPFEEKTKVERMVEDYLASGYQDSVTFDDVAVDFTPEEWALLDTTEKYLYR
. :: :.::..::. ::: :: ... :::
CCDS12 MAEGSVMFSDVSIDFSQEEWDCLDPVQRDLYR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DVMLENYMNLASVE-WEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFSGIQMTRGYSG--WKLCDCKNCG
::::::: ::.:. . .:.. : :.:: :. . : ..::: . ..:. : .
CCDS12 DVMLENYGNLVSMGLYTPKPQVI-SLLEQG--KEPWMVGRELTRGLCSDLESMCETKLLS
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KE1 ---EVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNCYGKDTLSV--HKEASTGQELSKFNPCGKVFT
::.. ..: . : . . : : . .: :.: : . : ..:. ..::
CCDS12 LKKEVYEIELCQREIMGLTKHG--LEYSSFG-DVLEYRSHLAKQLGYPNGHFSQ--EIFT
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 --LTPG------LAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHTDEKLCEFQEYG
: :..: . : .::.::.:::.:. ... .:. :: :: : .: :
CCDS12 PEYMPTFIQQTFLTLHQIINNEDRPYECKKCGKAFSQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECG
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RAVTASSHLKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEKSFECKECGRSFR
. . .::. . . .:::.: . :.:::.:. : : . : :.: .::::::..:
CCDS12 KFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFS
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 NSSCLNDHIQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSG
: : :: .:::: ::..: ::::::.:.:: .:.: ::: :::::::::.::.: :
CCDS12 YCSNLIDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSK
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LSIHIRSHSGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECGKTFITSSRRSKH
: : : :.:.:::.::::::::.....: .: :::::::::.: ::::.: ::. .:
CCDS12 LVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQH
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 LKTHSGEKPFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFAVSSRLSRHERIH
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CCDS12 QRIHAGEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIH
390 400 410 420 430 440
480
pF1KE1 TGEKPYECKDMSVTI
::::::.::.
CCDS12 TGEKPYNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK
450 460 470
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
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70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LYRDVMLENYMNLASVEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFSGIQMTRGYSGWKLCDCKNCG
..: .:. .. : : ..: :: .::.:
CCDS12 CGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQ--RLHTGEKLYECKECR
230 240 250 260 270 280
130 140 150 160 170
pF1KE1 EVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEGNCYGK-----DTLSVHKEASTGQELSKFNPCGKVFT
.:: . : : :...: . : . :: . :: :.. .:.. . . ::..:
CCDS12 KVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAFI
290 300 310 320 330 340
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LTPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHTDEKLCEFQEYGRAVTASSH
: : .. ....::::.::::.: ..: .:. :::.:: : .: :. . .:.
CCDS12 RGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQ
350 360 370 380 390 400
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEKSFECKECGRSFRNSSCLNDH
: : .:::.: . :.:::.:. : : . : ::: .::::::..: .: :..:
CCDS12 LTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQH
410 420 430 440 450 460
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 IQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSGLSIHIRSH
.:::: ::..: :::.: :..:::.: : ::: :::::::: .::.: : :: : : :
CCDS12 ERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLH
470 480 490 500 510 520
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 SGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECGKTFITSSRRSKHLKTHSGEK
.:.::: :.::::::. . :::: :::::::::.: ::::.:: .:. ..: . :.:::
CCDS12 TGEKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEK
530 540 550 560 570 580
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 PFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFAVSSRLSRHERIHTGEKPYEC
:. :: ::::: ..:.:..: : ::::::. :.:: :::. ::.::::.:::::::::.:
CCDS12 PYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQC
590 600 610 620 630 640
480
pF1KE1 KDMSVTI
:.
CCDS12 KECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM
650 660 670 680
>--
initn: 618 init1: 618 opt: 633 Z-score: 392.2 bits: 82.5 E(32554): 1.6e-15
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320 330 340 350 360 370
pF1KE1 KAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSGLSIHIRSHSGKKPYQCKECGKAFT
: :.. :: : : :: .:::.::::::::
CCDS12 LEAKGKMEKQQENQKEYFRQGMIIYDKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPYKCKECGKAFR
90 100 110 120 130 140
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 TSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECGKTFITSSRRSKHLKTHSGEKPFVCKICGKAFLYSSR
.. : :: :::::::::: .:::.: .:. : : . :.::::..:: ::::: ::.
CCDS12 RASHLTQHQSIHTGEKPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQ
150 160 170 180 190 200
440 450 460 470 480
pF1KE1 LNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFAVSSRLSRHERIHTGEKPYECKDMSVTI
: .: : ::::::. :.:::::: ::.:.::...::::::::::.
CCDS12 LILHHRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLH
210 220 230 240 250 260
CCDS12 QRLHTGEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIH
270 280 290 300 310 320
>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 (470 aa)
initn: 2166 init1: 1147 opt: 1280 Z-score: 764.8 bits: 150.9 E(32554): 2.8e-36
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAAIYLSRGFFSREPICPFEEKTKVERMVEDYLASGYQDSVTFDDVAVDFTPEEWALLDT
:. : .: : :::.:.:. .: ::: ::.
CCDS23 MAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRPLDA
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TEKYLYRDVMLENYMNLASVEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFSGIQMTRGYSGWKLCDC
... :::::: ::: :..:...::. ... . :..: .:. : .. . .
CCDS23 AQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSENEVNP------KQEISEDVQF--GTTSERPAEN
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KE1 KNCGEVFREQFCLKTHMRVQNGGNTSEG-NCYGKDTLS---VHKEASTGQELSKFNPCGK
. . .: : . . : : :.: : . .. ::::. :: . . :::
CCDS23 AEENPESEEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGK
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VFTLTPGLAVHLEVLNARQPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHTDEKLCEFQEYGRAVTA
.:. : : .. .. .:::: ::::::. . : .:. :: :. . .: :..
CCDS23 AFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGR
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 SSHLKQCVAVHTGKKSKKTKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEKSFECKECGRSFRNSSCL
:::: : ..:::.: .: ..::::: .:.: .::.::: .::.:::.:: :: :
CCDS23 SSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 NDHIQIHTGIKPHKCTYCGKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSGLSIHI
.: . ::: ::..:. ::..:.. ..: .: :.::: .::.: :::. :.: : : :
CCDS23 AQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHR
270 280 290 300 310 320
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pF1KE1 RSHSGKKPYQCKECGKAFTTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECGKTFITSSRRSKHLKTHS
:.:.:.:::.:.:::. :. . :.:: : ::::::::: :::.: ::. : : :.
CCDS23 RAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHT
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 GEKPFVCKICGKAFLYSSRLNVHLRTHTGEKPFVCKECGKAFAVSSRLSRHERIHTGEKP
::::. :. : ..: : : : ::::::::. : .:::.:. :: : :.:.::::::
CCDS23 GEKPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKP
390 400 410 420 430 440
480
pF1KE1 YECKDMSVTI
::: .
CCDS23 YECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
450 460 470
>>CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 (642 aa)
initn: 5300 init1: 1208 opt: 1281 Z-score: 764.3 bits: 151.2 E(32554): 3e-36
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80 90 100 110 120 130
pF1KE1 VEWEIQPRTKRSSLQQGFLKNQIFSGIQMTRGYSGWKLCDCKNCGEVFREQFCLKTHMRV
:...: : .::.::..:. :.: ::..
CCDS42 SLKRNTEVKSCECHECGKAFVDHSSLKSHIRSHTGSKPYQCKECGKAFHFLACFKKHMKT
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 QNGGNTSE-GNCYGKDTLS----VHKEASTGQELSKFNPCGKVFTLTPGLAVHLEVLNAR
. . : .: . : .: . :. . . ::: :. . .:. : .. ..
CCDS42 PTEEKPYECKECTKAFSCSSFFRAHMKIHIGKTNYECKECGKGFSCSSSLTEHKRIHSGD
250 260 270 280 290 300
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 QPYKCKECGKGFKYFASLDNHMGIHTDEKLCEFQEYGRAVTASSHLKQCVAVHTGKKSKK
.::.::::::.:. .::..: ::. .: : .: :.: ..:::: . .:::.: .
CCDS42 KPYECKECGKAFSCSSSLSKHKRIHSGDKPYECKECGKAFSSSSHLIIHIRIHTGEKPYE
310 320 330 340 350 360
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 TKKCGKSFTNFSQLYAPVKTHKGEKSFECKECGRSFRNSSCLNDHIQIHTGIKPHKCTYC
:.:::.:.. :.: . .:: ::: ..:::::... : :. :.. ::: ::..: :
CCDS42 CKECGKAFSESSKLTVHGRTHTGEKPYKCKECGKAYNCPSSLSIHMRKHTGEKPYECLEC
370 380 390 400 410 420
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 GKAFTRSTQLTEHVRTHTGIKPYECKECGQAFAQYSGLSIHIRSHSGKKPYQCKECGKAF
:::: :.:. ::.... :::::::::.::. :.. :.:.:.:: :.::::::.:
CCDS42 GKAFYLPTSLNTHVKNQSREKPYECKECGKAFSCPSSFRAHVRDHTGKIQYECKECGKTF
430 440 450 460 470 480
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 TTSTSLIQHTRIHTGEKPYECVECGKTFITSSRRSKHLKTHSGEKPFVCKICGKAFLYSS
. :.:: .: : :.::::::: ::::.::.::. . :..::.::::. :: :::::.: :
CCDS42 SRSSSLTEHLRTHSGEKPYECKECGKAFISSSHLTVHIRTHTGEKPYECKKCGKAFIYPS
490 500 510 520 530 540
440 450 460 470 480
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