Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1120
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1120, 364 aa
1>>>pF1KE1120 364 - 364 aa - 364 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8160+/-0.000893; mu= 19.3353+/- 0.054
mean_var=129.8224+/-46.515, 0's: 0 Z-trim(106.5): 271 B-trim: 1058 in 2/47
Lambda= 0.112564
statistics sampled from 8545 (9030) to 8545 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14743.1 OPN1MW gene_id:2652|Hs108|chrX ( 364) 2496 417.3 1e-116
CCDS35447.1 OPN1MW2 gene_id:728458|Hs108|chrX ( 364) 2496 417.3 1e-116
CCDS83509.1 OPN1MW3 gene_id:101060233|Hs108|chrX ( 364) 2496 417.3 1e-116
CCDS14742.1 OPN1LW gene_id:5956|Hs108|chrX ( 364) 2427 406.1 2.5e-113
CCDS5806.1 OPN1SW gene_id:611|Hs108|chr7 ( 348) 1033 179.7 3.4e-45
CCDS3063.1 RHO gene_id:6010|Hs108|chr3 ( 348) 1002 174.6 1.1e-43
CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1 ( 402) 512 95.2 1.1e-19
CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4 ( 337) 507 94.2 1.7e-19
CCDS4923.1 OPN5 gene_id:221391|Hs108|chr6 ( 354) 446 84.4 1.7e-16
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 382 74.2 2.7e-13
CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 489) 361 70.8 2.9e-12
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 350 68.8 8.9e-12
CCDS3848.1 MTNR1A gene_id:4543|Hs108|chr4 ( 350) 346 68.1 1.3e-11
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 338 67.0 3.7e-11
>>CCDS14743.1 OPN1MW gene_id:2652|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 2496 init1: 2496 opt: 2496 Z-score: 2208.7 bits: 417.3 E(32554): 1e-116
Smith-Waterman score: 2496; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM
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CCDS14 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFV
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CCDS14 IFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSS
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CCDS14 PLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSS
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VSPA
::::
CCDS14 VSPA
>>CCDS35447.1 OPN1MW2 gene_id:728458|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 2496 init1: 2496 opt: 2496 Z-score: 2208.7 bits: 417.3 E(32554): 1e-116
Smith-Waterman score: 2496; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM
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CCDS35 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSS
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VSPA
::::
CCDS35 VSPA
>>CCDS83509.1 OPN1MW3 gene_id:101060233|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 2496 init1: 2496 opt: 2496 Z-score: 2208.7 bits: 417.3 E(32554): 1e-116
Smith-Waterman score: 2496; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSS
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VSPA
::::
CCDS83 VSPA
>>CCDS14742.1 OPN1LW gene_id:5956|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 2427 init1: 2427 opt: 2427 Z-score: 2148.2 bits: 406.1 E(32554): 2.5e-113
Smith-Waterman score: 2427; 96.4% identity (98.6% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFV
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::
CCDS14 IFVVTASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISIVNQVSGYFV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::.::::
CCDS14 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCIIPLAIIMLCYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPFH
:::::::::::::::::::::::::::::::::..:.: :::::.:::::::::::: ::
CCDS14 QVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMIFAYCVCWGPYTFFACFAAANPGYAFH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSS
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PLMAALPAYFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSS
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VSPA
::::
CCDS14 VSPA
>>CCDS5806.1 OPN1SW gene_id:611|Hs108|chr7 (348 aa)
initn: 1052 init1: 963 opt: 1033 Z-score: 924.9 bits: 179.7 E(32554): 3.4e-45
Smith-Waterman score: 1033; 44.3% identity (74.8% similar) in 345 aa overlap (23-363:5-347)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWM
.. .. . : .:. ::..::.::::: :...: ...:
CCDS58 MRKMSEEEFYLFKNISSV-GPWDGPQYHIAPVWAFYLQAAFM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFV
: . . :..::.::...::::.:::.::::.. . . ... : . ::::
CCDS58 GTVFLIGFPLNAMVLVATLRYKKLRQPLNYILVNVSFGGFLLCIFSVFPVFVASCNGYFV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWA
.:. .:.:::. .. :.. ::::....::..:.:::::: ::..: :.. . .: .
CCDS58 FGRHVCALEGFLGTVAGLVTGWSLAFLAFERYIVICKPFGNFRFSSKHALTVVLATWTIG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE1 AVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFS-GSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCY
. ::.:::::. :.::. ::::: .. :..: . .:: :.. : :.:::.: . :
CCDS58 IGVSIPPFFGWSRFIPEGLQCSCGPDWYTVGTKYRS-ESYTWFLFIFCFIVPLSLICFSY
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LQVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGYPF
:. :..::: ::.:: .:::::.::.::::::: .:: :. ::: :: . . : .. .
CCDS58 TQLLRALKAVAAQQQESATTQKAEREVSRMVVVMVGSFCVCYVPYAAFAMYMVNNRNHGL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 HPLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLF-GKKVDDGSELSSASKTEVSSV
....:.::.::: ::::.:: :::.::. ::... :: . : :. :..:::::.:
CCDS58 DLRLVTIPSFFSKSACIYNPIIYCFMNKQFQACIMKMVCGKAMTDESDTCSSQKTEVSTV
290 300 310 320 330 340
360
pF1KE1 SS--VSPA
:: :.:
CCDS58 SSTQVGPN
>>CCDS3063.1 RHO gene_id:6010|Hs108|chr3 (348 aa)
initn: 977 init1: 977 opt: 1002 Z-score: 897.7 bits: 174.6 E(32554): 1.1e-43
Smith-Waterman score: 1002; 44.3% identity (74.2% similar) in 345 aa overlap (21-359:2-346)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNST---RGPFEGPNYHIAPRWVYHLTS
..:.. : ::.: :.::: :.:..: : . . .
CCDS30 MNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 VWMIFVVIASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYG
..:..... . : :.: .:.. :::: :::.::.::::::: .. . : .. ....:
CCDS30 AYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 YFVLGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSW
:::.: : :::. ..: : .::::.... ::..:::::..: :: . ::.:.::.:
CCDS30 YFVFGPTGCNLEGFFATLGGEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTW
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IWAAVWTAPPIFGWSRYWPHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVL
. : . .:::. ::::: :.::. ::: : .. . . .:..: ..:. :. :: .
CCDS30 VMALACAAPPLAGWSRYIPEGLQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 CYLQVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANPGY
:: :. .... .: ::.:: .::::::::::::..::.:: .:: ::: : . .. :
CCDS30 CYGQLVFTVKEAAAQQQESATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 PFHPLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLF--GKK-VDDGSELSSASKTE
: :.. ..::::::::.:::::::..::.:::::.: . ::. . : ...::::
CCDS30 NFGPIFMTIPAFFAKSAAIYNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTE
290 300 310 320 330 340
360
pF1KE1 VSSVSSVSPA
.:.:.
CCDS30 TSQVAPA
>>CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 523 init1: 223 opt: 512 Z-score: 467.0 bits: 95.2 E(32554): 1.1e-19
Smith-Waterman score: 512; 30.9% identity (64.3% similar) in 311 aa overlap (38-337:23-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 QRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRW---VYHLTSVWMIFVV
:: . . :: . .:. .. . .
CCDS31 MYSGNRSGGHGYWDGGGAAGAEGPAPAGTLSPAPLFSPGTYERLALLLGSIG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETVIASTISVVNQVYGYFVLGHP
. .: .: :::. .::..:: : . .:::....:: .... :.. :. . . .:
CCDS31 LLGVGNNLLVLVLYYKFQRLRTPTHLLLVNISLSDLLVSLFGVTFTFVSCLRNGWVWDTV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 MCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWMVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWAAVWT
:: .:.. :: ::... .:.....::.. : . . :. : .:.. :... .:.
CCDS31 GCVWDGFSGSLFGIVSIATLTVLAYERYIRVVHAR-VINFS--WAWRAITYIWLYSLAWA
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 APPIFGWSRYW--PHGLKTSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCITPLSIIVLCYLQV
. :..::.:: ::: .: : : .. .:... :.. : ..::..:. :: ..
CCDS31 GAPLLGWNRYILDVHGL--GCTVDWKSKDAND--SSFVLFLFLGCLVVPLGVIAHCYGHI
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE1 WLAIRAVAKQQKESESTQ-----KAEKEVTRMVVVMVLAFCFCWGPYAFFACFAAANP-G
.:: . . .. .. : : ::....: .:...: :: :: . :: ..: :
CCDS31 LYSIRML-RCVEDLQTIQVIKILKYEKKLAKMCFLMIFTFLVCWMPY-IVICFLVVNGHG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YPFHPLMAALPAFFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVS
. : .. . .:::: :.::::::::: :.:: .:::.
CCDS31 HLVTPTISIVSYLFAKSNTVYNPVIYVFMIRKFRRSLLQLLCLRLLRCQRPAKDLPAAGS
290 300 310 320 330 340
360
pF1KE1 SVSSVSPA
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.: . ... . :: ..... :.::... :: .: :.:. .... :: . .
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... .::.: :.:. : :.::.. .:. . . : :: . .::::.:.:::
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:..:::.:: .. .: : :. :: .: .: ... .. ::
CCDS49 AAMYNPIIYQVIDYKFACCQTGGLKATKKKSLEGFRLHTVTTVRKSSAVLEIHEEWE
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:. . . : : .: ...: ..... : :. . . ..:: : : ...::::.:.
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. . . ....: ...:. : . .. .: ::... .:. :. .:..:. .: :
CCDS73 SFTQAPVFFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSMITLTAIALDRYLVITRPLATF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]