FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0992, 631 aa
1>>>pF1KE0992 631 - 631 aa - 631 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9455+/-0.00115; mu= 7.9037+/- 0.068
mean_var=316.4473+/-72.059, 0's: 0 Z-trim(110.0): 658 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.072098
statistics sampled from 10528 (11268) to 10528 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.346), width: 16
Scan time: 3.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 4314 463.5 3.7e-130
CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs108|chr5 ( 620) 2551 280.1 5.9e-75
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 2051 228.0 2.4e-59
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 659) 1981 220.9 4.3e-57
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 693) 1981 220.9 4.4e-57
CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs108|chrX ( 675) 1575 178.7 2.3e-44
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 1148 134.1 4.5e-31
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 1148 134.1 4.6e-31
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 1146 133.9 5.2e-31
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 1146 133.9 5.3e-31
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 1149 134.7 6.6e-31
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 1149 134.7 6.7e-31
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 1136 132.9 1.1e-30
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 505) 1133 132.5 1.3e-30
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 1136 133.3 1.6e-30
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 1136 133.3 1.6e-30
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 1136 133.3 1.6e-30
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 1136 133.3 1.6e-30
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 1136 133.4 1.7e-30
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 1136 133.4 1.7e-30
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 1136 133.4 1.7e-30
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 1114 130.6 5.4e-30
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 1112 130.4 6.2e-30
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 1107 129.9 8.9e-30
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 1103 129.5 1.2e-29
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 1102 129.3 1.2e-29
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 1089 127.9 3.1e-29
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 1085 127.5 4.2e-29
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1 ( 529) 1073 126.3 1e-28
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 1068 125.8 1.4e-28
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 434) 1053 124.1 3.9e-28
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20 ( 488) 814 99.3 1.3e-20
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs108|chr15 ( 450) 809 98.8 1.7e-20
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 776 95.6 2.4e-19
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 776 95.6 2.5e-19
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 771 94.8 2.7e-19
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 775 95.5 2.7e-19
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 775 95.6 2.8e-19
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 771 95.2 3.8e-19
CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs108|chr20 ( 451) 759 93.6 6.4e-19
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 482) 758 93.5 7.1e-19
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 742 92.3 3.4e-18
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 742 92.3 3.4e-18
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 742 92.3 3.4e-18
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037) 742 92.3 3.5e-18
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038) 742 92.3 3.5e-18
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 736 91.6 5.2e-18
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 718 89.8 1.9e-17
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 718 89.8 1.9e-17
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 718 89.8 2e-17
>>CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 (631 aa)
initn: 4314 init1: 4314 opt: 4314 Z-score: 2450.1 bits: 463.5 E(32554): 3.7e-130
Smith-Waterman score: 4314; 100.0% identity (100.0% similar) in 631 aa overlap (1-631:1-631)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MNFNTILEEILIKRSQQKKKTSPLNYKERLFVLTKSMLTYYEGRAEKKYRKGFIDVSKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MNFNTILEEILIKRSQQKKKTSPLNYKERLFVLTKSMLTYYEGRAEKKYRKGFIDVSKIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 CVEIVKNDDGVIPCQNKYPFQVVHDANTLYIFAPSPQSRDLWVKKLKEEIKNNNNIMIKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CVEIVKNDDGVIPCQNKYPFQVVHDANTLYIFAPSPQSRDLWVKKLKEEIKNNNNIMIKY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HPKFWTDGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNLFESSIRKALPPAPETKKRRPPPPIPLEEEDNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HPKFWTDGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNLFESSIRKALPPAPETKKRRPPPPIPLEEEDNS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 EEIVVAMYDFQAAEGHDLRLERGQEYLILEKNDVHWWRARDKYGNEGYIPSNYVTGKKSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EEIVVAMYDFQAAEGHDLRLERGQEYLILEKNDVHWWRARDKYGNEGYIPSNYVTGKKSN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NLDQYEWYCRNMNRSKAEQLLRSEDKEGGFMVRDSSQPGLYTVSLYTKFGGEGSSGFRHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NLDQYEWYCRNMNRSKAEQLLRSEDKEGGFMVRDSSQPGLYTVSLYTKFGGEGSSGFRHY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 HIKETTTSPKKYYLAEKHAFGSIPEIIEYHKHNAAGLVTRLRYPVSVKGKNAPTTAGFSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HIKETTTSPKKYYLAEKHAFGSIPEIIEYHKHNAAGLVTRLRYPVSVKGKNAPTTAGFSY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EKWEINPSELTFMRELGSGLFGVVRLGKWRAQYKVAIKAIREGAMCEEDFIEEAKVMMKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKWEINPSELTFMRELGSGLFGVVRLGKWRAQYKVAIKAIREGAMCEEDFIEEAKVMMKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 THPKLVQLYGVCTQQKPIYIVTEFMERGCLLNFLRQRQGHFSRDVLLSMCQDVCEGMEYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 THPKLVQLYGVCTQQKPIYIVTEFMERGCLLNFLRQRQGHFSRDVLLSMCQDVCEGMEYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 ERNSFIHRDLAARNCLVSEAGVVKVSDFGMARYVLDDQYTSSSGAKFPVKWCPPEVFNYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERNSFIHRDLAARNCLVSEAGVVKVSDFGMARYVLDDQYTSSSGAKFPVKWCPPEVFNYS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 RFSSKSDVWSFGVLMWEVFTEGRMPFEKYTNYEVVTMVTRGHRLYQPKLASNYVYEVMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RFSSKSDVWSFGVLMWEVFTEGRMPFEKYTNYEVVTMVTRGHRLYQPKLASNYVYEVMLR
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE0 CWQEKPEGRPSFEDLLRTIDELVECEETFGR
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CWQEKPEGRPSFEDLLRTIDELVECEETFGR
610 620 630
>>CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs108|chr5 (620 aa)
initn: 2455 init1: 1521 opt: 2551 Z-score: 1459.1 bits: 280.1 E(32554): 5.9e-75
Smith-Waterman score: 2551; 58.6% identity (81.9% similar) in 626 aa overlap (1-624:1-617)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNFNTILEEILIKRSQQKKKTSPLNYKERLFVLTKSMLTYYEGRAEKKYR-KGFIDVSKI
:: .::: :::.::::..::: :.: :.:::::. :.:.: : :: :: :..:.:
CCDS43 MNNFILLEEQLIKKSQQKRRTSPSNFKVRFFVLTKASLAYFEDRHGKKRTLKGSIELSRI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KCVEIVKNDDGVIPCQNKYPFQVVHDANTLYIFAPSPQSRDLWVKKLKEEIKNNNNIMIK
:::::::.: . :::. ::::::::: ::.:::. .::. :: :::: .:::... :
CCDS43 KCVEIVKSDIS-IPCHYKYPFQVVHDNYLLYVFAPDRESRQRWVLALKEETRNNNSLVPK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YHPKFWTDGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNLFESSIRKALPPAPETKKRRPPPPIPLEEEDN
:::.:: ::...:: : :::: :: .:. ... .: :::.:: ..: :: : .
CCDS43 YHPNFWMDGKWRCCSQLEKLATGCAQYDPTKNASKKPLPPTPEDNRR------PLWEPE-
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 SEEIVVAMYDFQAAEGHDLRLERGQEYLILEKNDVHWWRARDKYGNEGYIPSNYVTGKKS
: .:.:.::.:. . ..: :.:..:: .:.....::::..:. :.:::.::.:.. :.
CCDS43 -ETVVIALYDYQTNDPQELALRRNEEYCLLDSSEIHWWRVQDRNGHEGYVPSSYLVEKSP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 NNLDQYEWYCRNMNRSKAEQLLRSEDKEGGFMVRDSSQPGLYTVSLYTK-FGGEGSSGFR
:::. :::: ....:.:::.:: . :::.:::::: : ::::..:: .:.. ..
CCDS43 NNLETYEWYNKSISRDKAEKLLLDTGKEGAFMVRDSRTAGTYTVSVFTKAVVSENNPCIK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 HYHIKETTTSPKKYYLAEKHAFGSIPEIIEYHKHNAAGLVTRLRYPVSVKGKNAPTTAGF
:::::::. .::.::.:::..: ::: .:.::.::..:::::::::: ..::.:::.
CCDS43 HYHIKETNDNPKRYYVAEKYVFDSIPLLINYHQHNGGGLVTRLRYPVCFGRQKAPVTAGL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 SYEKWEINPSELTFMRELGSGLFGVVRLGKWRAQYKVAIKAIREGAMCEEDFIEEAKVMM
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CCDS43 RYGKWVIDPSELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIREGAMSEEDFIEEAEVMM
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 KLTHPKLVQLYGVCTQQKPIYIVTEFMERGCLLNFLRQRQGHFSRDVLLSMCQDVCEGME
::.::::::::::: .: :: .: ::::.::: ..:: ..: :. ..::.:: ::::::
CCDS43 KLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 YLERNSFIHRDLAARNCLVSEAGVVKVSDFGMARYVLDDQYTSSSGAKFPVKWCPPEVFN
:::. ::::::::::::.: :.:::::::.:.:::::::::.:.:::::: ::::.
CCDS43 YLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGMTRFVLDDQYTSSTGTKFPVKWASPEVFS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 YSRFSSKSDVWSFGVLMWEVFTEGRMPFEKYTNYEVVTMVTRGHRLYQPKLASNYVYEVM
.::.:::::::::::::::::.::..:.:. .: ::: .. : :::.:.:::..::..:
CCDS43 FSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIM
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KE0 LRCWQEKPEGRPSFEDLLRTIDELVECEETFGR
.::.:.:: ::.: ::: . :..:
CCDS43 NHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIAESGL
600 610 620
>>CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 (527 aa)
initn: 2038 init1: 1574 opt: 2051 Z-score: 1178.8 bits: 228.0 E(32554): 2.4e-59
Smith-Waterman score: 2051; 62.6% identity (85.1% similar) in 463 aa overlap (162-624:65-525)
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 CCRQTEKLAPGCEKYNLFESSIRKALPPAPETKKRRPPPPIPLEEEDNSEEIVVAMYDFQ
. .::.: ::.: : . . : :.:::
CCDS34 DEELPEKYTQRRRPWLSQLSNKKQSNTGRVQPSKRKPLPPLPPSEVAEEKIQVKALYDFL
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 AAEGHDLRLERGQEYLILEKNDVHWWRARDKYGNEGYIPSNYVTGKKSNNLDQYEWYCRN
: .: :.:..::::::: . :::.:::. :::: ::::::: .: .::. :::: ::
CCDS34 PREPCNLALRRAEEYLILEKYNPHWWKARDRLGNEGLIPSNYVTENKITNLEIYEWYHRN
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 MNRSKAEQLLRSEDKEGGFMVRDSSQPGLYTVSLYTKFGGEGSSGFRHYHIKETTTSPKK
..:..::.:::.:.:::.:.:::: . : ::.:.. ....::.::.. .. .
CCDS34 ITRNQAEHLLRQESKEGAFIVRDSRHLGSYTISVFMGARRSTEAAIKHYQIKKNDSG--Q
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 YYLAEKHAFGSIPEIIEYHKHNAAGLVTRLRYPVSVKGKNAPTTAGFSYEKWEINPSELT
.:.::.::: ::::.: ::.::::::.:::::::.. :. :.:::::::::::.::::.
CCDS34 WYVAERHAFQSIPELIWYHQHNAAGLMTRLRYPVGLMGSCLPATAGFSYEKWEIDPSELA
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 FMRELGSGLFGVVRLGKWRAQYKVAIKAIREGAMCEEDFIEEAKVMMKLTHPKLVQLYGV
:..:.::: ::::.::.::.. .:::::: ::.: ::::::::::::::.: ::::::::
CCDS34 FIKEIGSGQFGVVHLGEWRSHIQVAIKAINEGSMSEEDFIEEAKVMMKLSHSKLVQLYGV
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 CTQQKPIYIVTEFMERGCLLNFLRQRQGHFSRDVLLSMCQDVCEGMEYLERNSFIHRDLA
: :.::.:::::::: :::::.::. .:.. ...:::.:::.::::::::::..::::::
CCDS34 CIQRKPLYIVTEFMENGCLLNYLRENKGKLRKEMLLSVCQDICEGMEYLERNGYIHRDLA
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 ARNCLVSEAGVVKVSDFGMARYVLDDQYTSSSGAKFPVKWCPPEVFNYSRFSSKSDVWSF
::::::: . .::.:::::.::::::.:.:: :::::.:: ::::: ....:::::::::
CCDS34 ARNCLVSSTCIVKISDFGMTRYVLDDEYVSSFGAKFPIKWSPPEVFLFNKYSSKSDVWSF
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 GVLMWEVFTEGRMPFEKYTNYEVVTMVTRGHRLYQPKLASNYVYEVMLRCWQEKPEGRPS
:::::::::::.::::. .: .:: ...: :::.:.:: .:::: ::.:::::::.
CCDS34 GVLMWEVFTEGKMPFENKSNLQVVEAISEGFRLYRPHLAPMSIYEVMYSCWHEKPEGRPT
460 470 480 490 500 510
620 630
pF1KE0 FEDLLRTIDELVECEETFGR
: .:::.. :..:
CCDS34 FAELLRAVTEIAETW
520
>>CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX (659 aa)
initn: 2174 init1: 1469 opt: 1981 Z-score: 1138.4 bits: 220.9 E(32554): 4.3e-57
Smith-Waterman score: 2399; 53.7% identity (78.8% similar) in 657 aa overlap (6-626:5-658)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MNFNTILEEILIKRSQQKKKTSPLNYKERLFVLTKSMLTYYEG---RAEKKYRKGFIDVS
::: :..:::::::::::::.:.:::.:: :.::: :... .:: :::
CCDS14 MAAVILESIFLKRSQQKKKTSPLNFKKRLFLLTVHKLSYYEYDFERGRRGSKKGSIDVE
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KE0 KIKCVEIV---KND--DGVIPCQNK---------------YPFQVVHDANTLYIFAPSPQ
:: ::: : :: . :: ... ::::::.: . ::.:.:. .
CCDS14 KITCVETVVPEKNPPPERQIPRRGEESSEMEQISIIERFPYPFQVVYDEGPLYVFSPTEE
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 SRDLWVKKLKEEIKNNNNIMIKYHPKFWTDGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNLFESSIR---
: :...::. :. :.... :::: :: ::.: :: :: : : ::. . ..:..
CCDS14 LRKRWIHQLKNVIRYNSDLVQKYHPCFWIDGQYLCCSQTAKNAMGCQILENRNGSLKPGS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KE0 ------KALPPAPETKK--RRPPPPIPLEEEDNSEEI--VVAMYDFQAAEGHDLRLERGQ
: :::.:: . ..: :: : .. :. :::.::.. ...::.:..:.
CCDS14 SHRKTKKPLPPTPEEDQILKKPLPPEPAAAPVSTSELKKVVALYDYMPMNANDLQLRKGD
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 EYLILEKNDVHWWRARDKYGNEGYIPSNYVTGKKSNNLDQYEWYCRNMNRSKAEQLLRSE
::.:::.... ::::::: :.:::::::::: . .....:::: ..:.::.:::::..:
CCDS14 EYFILEESNLPWWRARDKNGQEGYIPSNYVT-EAEDSIEMYEWYSKHMTRSQAEQLLKQE
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270 280 290 300 310 320
pF1KE0 DKEGGFMVRDSSQPGLYTVSLYTKFGGEGSSGFRHYHIKETTTSPKKYYLAEKHAFGSIP
:::::.:::::. : ::::...: :. .. .::: . .: ..::::::: :..::
CCDS14 GKEGGFIVRDSSKAGKYTVSVFAKSTGDPQGVIRHYVV--CSTPQSQYYLAEKHLFSTIP
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 EIIEYHKHNAAGLVTRLRYPVSVKGKNAPTTAGFSYEKWEINPSELTFMRELGSGLFGVV
:.:.::.::.:::..::.:::: ..::::.:::..: .:::.:..:::..:::.: ::::
CCDS14 ELINYHQHNSAGLISRLKYPVSQQNKNAPSTAGLGYGSWEIDPKDLTFLKELGTGQFGVV
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390 400 410 420 430 440
pF1KE0 RLGKWRAQYKVAIKAIREGAMCEEDFIEEAKVMMKLTHPKLVQLYGVCTQQKPIYIVTEF
. ::::.:: :::: :.::.: :..:::::::::.:.: ::::::::::.:.::.:.::.
CCDS14 KYGKWRGQYDVAIKMIKEGSMSEDEFIEEAKVMMNLSHEKLVQLYGVCTKQRPIFIITEY
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450 460 470 480 490 500
pF1KE0 MERGCLLNFLRQRQGHFSRDVLLSMCQDVCEGMEYLERNSFIHRDLAARNCLVSEAGVVK
: :::::.::. . .:. . :: ::.::::.::::: ..:.:::::::::::.. ::::
CCDS14 MANGCLLNYLREMRHRFQTQQLLEMCKDVCEAMEYLESKQFLHRDLAARNCLVNDQGVVK
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510 520 530 540 550 560
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:::::..::::::.:::: :.::::.: ::::. ::.::::::.:.:::::::... :.:
CCDS14 VSDFGLSRYVLDDEYTSSVGSKFPVRWSPPEVLMYSKFSSKSDIWAFGVLMWEIYSLGKM
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570 580 590 600 610 620
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:.:..:: :.. ...: :::.:.:::. :: .: ::.:: . ::.:. :: .: ....
CCDS14 PYERFTNSETAEHIAQGLRLYRPHLASEKVYTIMYSCWHEKADERPTFKILLSNILDVMD
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630
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:
CCDS14 EES
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10 20 30
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40 50 60 70
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CCDS76 HKLSYYEYDFERGRRGSKKGSIDVEKITCVETVVPEKNPPPERQIPRRGEESSEMEQISI
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80 90 100 110 120 130
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140 150 160 170 180
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: :: : : ::. . ..:.. : :::.:: . ..: :: : ..
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190 200 210 220 230
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CCDS76 ELKKVVALYDYMPMNANDLQLRKGDEYFILEESNLPWWRARDKNGQEGYIPSNYVT-EAE
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: . .: ..::::::: :..:::.:.::.::.:::..::.:::: ..::::.:::..
CCDS76 YVV--CSTPQSQYYLAEKHLFSTIPELINYHQHNSAGLISRLKYPVSQQNKNAPSTAGLG
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360 370 380 390 400 410
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CCDS76 YGSWEIDPKDLTFLKELGTGQFGVVKYGKWRGQYDVAIKMIKEGSMSEDEFIEEAKVMMN
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:.: ::::::::::.:.::.:.::.: :::::.::. . .:. . :: ::.::::.:::
CCDS76 LSHEKLVQLYGVCTKQRPIFIITEYMANGCLLNYLREMRHRFQTQQLLEMCKDVCEAMEY
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CCDS76 SCWHEKADERPTFKILLSNILDVMDEES
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CCDS14 MDTKSILEELLLKRSQQKKKMSPNNYKERLFVLTKTNLSYYEYDKMKRGSRKGSIEIKKI
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CCDS14 RCVEKV-NLEEQTPVERQYPFQIVYKDGLLYVYASNEESRSQWLKALQKEIRGNPHLLVK
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CCDS14 LKMDAPSSSTTLAQYDNESKKNYGSQPPSSSTSLAQYDSNSKKIYGSQPNFNMQYIPRED
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220 230 240 250
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CCDS14 FPDWWQVRKLKSSSSSEDVASSNQKERNVNHTTSKISWEFPESSSSEEEENLDDYDWFAG
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CCDS14 FGILMWEVFSLGKQPYDLYDNSQVVLKVSQGHRLYRPHLASDTIYQIMYSCWHELPEKRP
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620 630
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CCDS14 TFQQLLSSIEPLREKDKH
660 670
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110 120 130 140 150
pF1KE0 VKKLKEEIKNNNNIMIKYHPKFWTDGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNLFESSIRKALP---P
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CCDS54 MGCMKSKFLQVGGNTFSKTETSASPHCPVYVP
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160 170 180 190 200 210
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CCDS54 DP-TSTIKPGPNSHNSNTPGIREAGSEDIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESG
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220 230 240 250 260 270
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CCDS54 -EWWKARSLATRKEGYIPSNYVA--RVDSLETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFM
100 110 120 130 140
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CCDS54 IRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDT-VKHYKIR--TLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHY
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CCDS54 KKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKP----WEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYN
210 220 230 240 250 260
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. :::.:... :.: : :. ::.:: : : :::.:..: :.. ::::.:::: .: :
CCDS54 KHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKLVKLHAVVTKE-PIYIITEFMAKGSL
270 280 290 300 310 320
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pF1KE0 LNFLRQRQGHFSR-DVLLSMCQDVCEGMEYLERNSFIHRDLAARNCLVSEAGVVKVSDFG
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CCDS54 LDFLKSDEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFG
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pF1KE0 MARYVLDDQYTSSSGAKFPVKWCPPEVFNYSRFSSKSDVWSFGVLMWEVFTEGRMPFEKY
.:: . :..::. :::::.:: ::..:.. :. ::::::::.:. :. : ::.:. .
CCDS54 LARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGM
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pF1KE0 TNYEVVTMVTRGHRLYQPKLASNYVYEVMLRCWQEKPEGRPSFEDLLRTIDELVECEETF
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CCDS54 SNPEVIRALERGYRMPRPENCPEELYNIMMRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQ
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630
pF1KE0 GR
CCDS54 YQQQP
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pF1KE0 VKKLKEEIKNNNNIMIKYHPKFWTDGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNLFESSIRKALP---P
: ... : : . .. :.: : :
CCDS33 MGGRSSCEDPGCPRDEERAPRMGCMKSKFLQVGGNTFSKTETSASPHCPVYVP
10 20 30 40 50
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 APETKKRRPPPP-----IPLEEEDNSEEI-VVAMYDFQAAEGHDLRLERGQEYLILEKND
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CCDS33 DP-TSTIKPGPNSHNSNTPGIREAGSEDIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESG
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pF1KE0 VHWWRARD-KYGNEGYIPSNYVTGKKSNNLDQYEWYCRNMNRSKAE-QLLRSEDKEGGFM
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CCDS33 -EWWKARSLATRKEGYIPSNYVA--RVDSLETEEWFFKGISRKDAERQLLAPGNMLGSFM
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.::: . : :..:. .:.. .::.:. : . .:.. . .:... :.....
CCDS33 IRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDT-VKHYKIR--TLDNGGFYISPRSTFSTLQELVDHY
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pF1KE0 KHNAAGLVTRLRYPVSVKGKNAPTTAGFSYEKWEINPSELTFMRELGSGLFGVVRLGKWR
:.. :: .: : . . : . . ::: : . ..::.: :: : .. .
CCDS33 KKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKP----WEKDAWEIPRESLKLEKKLGAGQFGEVWMATYN
230 240 250 260 270 280
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. :::.:... :.: : :. ::.:: : : :::.:..: :.. ::::.:::: .: :
CCDS33 KHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKLVKLHAVVTKE-PIYIITEFMAKGSL
290 300 310 320 330 340
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pF1KE0 LNFLRQRQGHFSR-DVLLSMCQDVCEGMEYLERNSFIHRDLAARNCLVSEAGVVKVSDFG
:.::.. .: . :... .. ::: ..:. ..::::: : : ::: . : :..:::
CCDS33 LDFLKSDEGSKQPLPKLIDFSAQIAEGMAFIEQRNYIHRDLRAANILVSASLVCKIADFG
350 360 370 380 390 400
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pF1KE0 MARYVLDDQYTSSSGAKFPVKWCPPEVFNYSRFSSKSDVWSFGVLMWEVFTEGRMPFEKY
.:: . :..::. :::::.:: ::..:.. :. ::::::::.:. :. : ::.:. .
CCDS33 LARVIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINFGSFTIKSDVWSFGILLMEIVTYGRIPYPGM
410 420 430 440 450 460
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pF1KE0 TNYEVVTMVTRGHRLYQPKLASNYVYEVMLRCWQEKPEGRPSFEDLLRTIDELVECEETF
.: ::. . ::.:. .:. . .:..:.:::...:: ::.:: . ..:.. :.
CCDS33 SNPEVIRALERGYRMPRPENCPEELYNIMMRCWKNRPEERPTFEYIQSVLDDFYTATESQ
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630
pF1KE0 GR
CCDS33 YQQQP
>>CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 (504 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]