Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0991
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0991, 626 aa
1>>>pF1KE0991 626 - 626 aa - 626 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5154+/-0.000953; mu= -6.2619+/- 0.057
mean_var=465.7302+/-97.662, 0's: 0 Z-trim(117.3): 480 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.059430
statistics sampled from 17479 (18043) to 17479 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.818), E-opt: 0.2 (0.554), width: 16
Scan time: 4.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6580.1 TESK1 gene_id:7016|Hs108|chr9 ( 626) 4426 393.9 3.3e-109
CCDS41323.1 TESK2 gene_id:10420|Hs108|chr1 ( 571) 1336 128.9 1.8e-29
CCDS56491.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7 ( 613) 661 71.1 4.9e-12
CCDS5563.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7 ( 647) 661 71.1 5.1e-12
>>CCDS6580.1 TESK1 gene_id:7016|Hs108|chr9 (626 aa)
initn: 4426 init1: 4426 opt: 4426 Z-score: 2074.0 bits: 393.9 E(32554): 3.3e-109
Smith-Waterman score: 4426; 100.0% identity (100.0% similar) in 626 aa overlap (1-626:1-626)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGRGRPSSYRALRSAVSSLARVDDFHCA
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CCDS65 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGRGRPSSYRALRSAVSSLARVDDFHCA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 EKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLKMNKLPSNRGNTLREVQLMNRLRHPNILRFMGVCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLKMNKLPSNRGNTLREVQLMNRLRHPNILRFMGVCV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEPLSWPVRLHLALDIARGLRYLHSKGVFHRDLTSKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEPLSWPVRLHLALDIARGLRYLHSKGVFHRDLTSKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 CLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDEKADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 CLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDEKADV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 FAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEPST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPRPDPRLSRSRSDLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPRPDPRLSRSRSDLF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVLPLVPPSPFPSTQLPLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVLPLVPPSPFPSTQLPLVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 TPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRRMETALPGPGPPAVGPSAEEKMECEGSSPEPEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRRMETALPGPGPPAVGPSAEEKMECEGSSPEPEPP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 GPAPQLPLAVATDNFISTCSSASQPWSPRSGPVLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GPAPQLPLAVATDNFISTCSSASQPWSPRSGPVLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LPRAAALERTEPSPPPSAPREPDEGLPCPGCCLGPFSFGFLSMCPRPTPAVARYRNLNCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LPRAAALERTEPSPPPSAPREPDEGLPCPGCCLGPFSFGFLSMCPRPTPAVARYRNLNCE
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE0 AGSLLCHRGHHAKPPTPSLQLPGARS
::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 AGSLLCHRGHHAKPPTPSLQLPGARS
610 620
>>CCDS41323.1 TESK2 gene_id:10420|Hs108|chr1 (571 aa)
initn: 1189 init1: 752 opt: 1336 Z-score: 642.7 bits: 128.9 E(32554): 1.8e-29
Smith-Waterman score: 1547; 54.2% identity (68.8% similar) in 509 aa overlap (25-500:25-516)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGRGR--PSSYRALRSAVSSLARVDDFH
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CCDS41 MDRSKRNSIAGFPPRVERLEEFEGGGGGEGNVSQVGRVWPSSYRALISAFSRLTRLDDFT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 CAEKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLKMNKLPSNRGNTLREVQLMNRLRHPNILRFMGV
: ::::.::::::.::::: :::::.:::: : :::.: :.:::::::: ::::::::::
CCDS41 C-EKIGSGFFSEVFKVRHRASGQVMALKMNTLSSNRANMLKEVQLMNRLSHPNILRFMGV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 CVHQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEPLSWPVRLHLALDIARGLRYLHSKGVFHRDLTS
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CCDS41 CVHQGQLHALTEYINSGNLEQLLDSNLHLPWTVRVKLAYDIAVGLSYLHFKGIFHRDLTS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 KNCLVRREDRGFTAVVGDFGLAEKIPVYREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDEKA
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CCDS41 KNCLIKRDENGYSAVVADFGLAEKIPDVSMGSEK--LAVVGSPFWMAPEVLRDEPYNEKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAFRTLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEP
:::..::.:::.:::. ::::::::::.:::: ::. .::: :: :: :...:::..:
CCDS41 DVFSYGIILCEIIARIQADPDYLPRTENFGLDYDAFQHMVGD-CPPDFLQLTFNCCNMDP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE0 STRAPFTEITQHLEWILEQLPEPA--------PLTRTALTHNQGSVARGGPSATLPR--P
. : :.:: . :: :: .: : : .: : . : .. . .:. :
CCDS41 KLRPSFVEIGKTLEEILSRLQEEEQERDRKLQPTARGLLEKAPGVKRLSSLDDKIPHKSP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE0 DPR----LSRSRSDLFL--PP------SPESPPNWGDNLT-RVNPFSLREDLRGGKIKLL
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CCDS41 CPRRTIWLSRSQSDIFSRKPPRTVSVLDPYYRPRDGAARTPKVNPFSARQDLMGGKIKFF
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 DTPSKPVLPLVPP--SPFPSTQLPLVTTPETLVQPGTPARRCRSLPSSPELPRRMETALP
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CCDS41 DLPSKSVISLVFDLDAPGPGT-MPLADWQEPLA-P--PIRRWRSLPGSPEFLHQEACPFV
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE0 G------PGPPAVGPSAEEKMECEGSSPEPEPPGPAPQLPLAVATDNFISTCSSASQPWS
: ::: : . ... :: : :: : : . . ::
CCDS41 GREESLSDGPPPRLSSLKYRVK-------EIPPFRASALPAAQAHEAM--DCSILQEENG
480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 PRSGPVLNNNPPAVVVNSPQGWAGEPWNRAQHSLPRAAALERTEPSPPPSAPREPDEGLP
CCDS41 FGSRPQGTSPCPAGASEEMEVEERPAGSTPATFSTSGIGLQTQGKQDG
530 540 550 560 570
>>CCDS56491.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7 (613 aa)
initn: 731 init1: 319 opt: 661 Z-score: 329.5 bits: 71.1 E(32554): 4.9e-12
Smith-Waterman score: 778; 40.2% identity (65.9% similar) in 346 aa overlap (24-349:269-610)
10 20 30 40
pF1KE0 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGR----GRPSSYRALRSAVS
:: :. :. .. :: : :..
CCDS56 LSSPAYTPSGEAGSSARQKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVV-CRPH
240 250 260 270 280 290
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 SLARVDDFHCAEKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLK-MNKLPSNRGNT-LREVQLMNRL
. : .:. .: .: : :... :: ::..:.:::.: . .. . : :.::..: :
CCDS56 RIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCL
300 310 320 330 340 350
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 RHPNILRFMGVCVHQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEP-LSWPVRLHLALDIARGLRYL
.:::.:.:.:: .. .:. .:::..::::. ...: . : :. .: ::: :. ::
CCDS56 EHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYL
360 370 380 390 400 410
170 180 190 200 210
pF1KE0 HSKGVFHRDLTSKNCLVRREDRGFTAVVGDFGLA----------EKIPVYREGARKEPLA
:: ...::::.:.::::: :... .::.::::: : . .. ::. .
CCDS56 HSMNIIHRDLNSHNCLVR-ENKN--VVVADFGLARLMVDEKTQPEGLRSLKKPDRKKRYT
420 430 440 450 460 470
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 VVGSPYWMAPEVLRGELYDEKADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAF-R
:::.:::::::.. :. ::::.:::.:::::::.:.:: ::::::::: ::::.: .:
CCDS56 VVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLD
480 490 500 510 520 530
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 TLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEPSTRAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQG-
.:: :. ....::.:.: : :... . :: . .: :: ..:
CCDS56 RYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHLPLGPQLEQLDRGF
540 550 560 570 580 590
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 -SVARGGPSATLPRPDPRLSRSRSDLFLPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIK
. : : :. .:.
CCDS56 WETYRRGESGLPAHPEVPD
600 610
>>CCDS5563.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7 (647 aa)
initn: 731 init1: 319 opt: 661 Z-score: 329.3 bits: 71.1 E(32554): 5.1e-12
Smith-Waterman score: 778; 40.2% identity (65.9% similar) in 346 aa overlap (24-349:303-644)
10 20 30 40
pF1KE0 MAGERPPLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGR----GRPSSYRALRSAVS
:: :. :. .. :: : :..
CCDS55 LSSPAYTPSGEAGSSARQKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVV-CRPH
280 290 300 310 320 330
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 SLARVDDFHCAEKIGAGFFSEVYKVRHRQSGQVMVLK-MNKLPSNRGNT-LREVQLMNRL
. : .:. .: .: : :... :: ::..:.:::.: . .. . : :.::..: :
CCDS55 RIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCL
340 350 360 370 380 390
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 RHPNILRFMGVCVHQGQLHALTEYMNGGTLEQLLSSPEP-LSWPVRLHLALDIARGLRYL
.:::.:.:.:: .. .:. .:::..::::. ...: . : :. .: ::: :. ::
CCDS55 EHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYL
400 410 420 430 440 450
170 180 190 200 210
pF1KE0 HSKGVFHRDLTSKNCLVRREDRGFTAVVGDFGLA----------EKIPVYREGARKEPLA
:: ...::::.:.::::: :... .::.::::: : . .. ::. .
CCDS55 HSMNIIHRDLNSHNCLVR-ENKN--VVVADFGLARLMVDEKTQPEGLRSLKKPDRKKRYT
460 470 480 490 500
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 VVGSPYWMAPEVLRGELYDEKADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAF-R
:::.:::::::.. :. ::::.:::.:::::::.:.:: ::::::::: ::::.: .:
CCDS55 VVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLD
510 520 530 540 550 560
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 TLVGDDCPLPFLLLAIHCCNLEPSTRAPFTEITQHLEWILEQLPEPAPLTRTALTHNQG-
.:: :. ....::.:.: : :... . :: . .: :: ..:
CCDS55 RYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHLPLGPQLEQLDRGF
570 580 590 600 610 620
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 -SVARGGPSATLPRPDPRLSRSRSDLFLPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIK
. : : :. .:.
CCDS55 WETYRRGESGLPAHPEVPD
630 640
626 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 16:24:51 2016 done: Mon Nov 7 16:24:51 2016
Total Scan time: 4.230 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]