Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0987
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0987, 616 aa
1>>>pF1KE0987 616 - 616 aa - 616 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6177+/-0.00119; mu= 3.3012+/- 0.068
mean_var=295.4355+/-68.503, 0's: 0 Z-trim(110.2): 508 B-trim: 114 in 1/51
Lambda= 0.074618
statistics sampled from 10789 (11410) to 10789 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.35), width: 16
Scan time: 3.830
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12555.1 HIPK4 gene_id:147746|Hs108|chr19 ( 616) 4208 467.6 2.2e-131
CCDS75666.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1171) 1139 137.5 9.5e-32
CCDS75667.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1198) 1139 137.5 9.6e-32
CCDS868.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1075) 1134 136.9 1.3e-31
CCDS867.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1210) 1134 137.0 1.4e-31
CCDS41634.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1194) 1095 132.8 2.6e-30
CCDS7884.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1215) 1095 132.8 2.6e-30
CCDS13654.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 529) 645 83.9 5.8e-16
CCDS42926.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 584) 645 84.0 6.2e-16
CCDS13653.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 754) 645 84.1 7.3e-16
CCDS42925.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 763) 645 84.1 7.3e-16
CCDS8530.1 DYRK4 gene_id:8798|Hs108|chr12 ( 520) 622 81.4 3.2e-15
CCDS46075.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 589) 620 81.3 4e-15
CCDS12544.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 601) 613 80.5 6.8e-15
CCDS12543.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 629) 613 80.6 7.1e-15
CCDS8979.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 ( 528) 588 77.8 4.1e-14
CCDS8978.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 ( 601) 588 77.9 4.4e-14
CCDS31000.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 ( 568) 572 76.1 1.4e-13
CCDS30999.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 ( 588) 572 76.1 1.4e-13
>>CCDS12555.1 HIPK4 gene_id:147746|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 4208 init1: 4208 opt: 4208 Z-score: 2472.2 bits: 467.6 E(32554): 2.2e-131
Smith-Waterman score: 4208; 100.0% identity (100.0% similar) in 616 aa overlap (1-616:1-616)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSTIQSETDCYDIIEVLGKGTFGEVAKGWRRSTGEMVAIKILKNDAYRNRIIKNELKLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSTIQSETDCYDIIEVLGKGTFGEVAKGWRRSTGEMVAIKILKNDAYRNRIIKNELKLLH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 CMRGLDPEEAHVIRFLEFFHDALKFYLVFELLEQNLFEFQKENNFAPLPARHIRTVTLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CMRGLDPEEAHVIRFLEFFHDALKFYLVFELLEQNLFEFQKENNFAPLPARHIRTVTLQV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LTALARLKELAIIHADLKPENIMLVDQTRCPFRVKVIDFGSASIFSEVRYVKEPYIQSRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LTALARLKELAIIHADLKPENIMLVDQTRCPFRVKVIDFGSASIFSEVRYVKEPYIQSRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 YRAPEILLGLPFCEKVDVWSLGCVMAELHLGWPLYPGNNEYDQVRYICETQGLPKPHLLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YRAPEILLGLPFCEKVDVWSLGCVMAELHLGWPLYPGNNEYDQVRYICETQGLPKPHLLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AACKAHHFFKRNPHPDAANPWQLKSSADYLAETKVRPLERRKYMLKSLDQIETVNGGSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AACKAHHFFKRNPHPDAANPWQLKSSADYLAETKVRPLERRKYMLKSLDQIETVNGGSVA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SRLTFPDREALAEHADLKSMVELIKRMLTWESHERISPSAALRHPFVSMQQLRSAHETTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SRLTFPDREALAEHADLKSMVELIKRMLTWESHERISPSAALRHPFVSMQQLRSAHETTH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 YYQLSLRSYRLSLQVEGKPPTPVVAAEDGTPYYCLAEEKEAAGMGSVAGSSPFFREEKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YYQLSLRSYRLSLQVEGKPPTPVVAAEDGTPYYCLAEEKEAAGMGSVAGSSPFFREEKAP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 GMQRAIDQLDDLSLQEAGHGLWGETCTNAVSDMMVPLKAAITGHHVPDSGPEPILAFYSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GMQRAIDQLDDLSLQEAGHGLWGETCTNAVSDMMVPLKAAITGHHVPDSGPEPILAFYSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 RLAGRHKARKPPAGSKSDSNFSNLIRLSQVSPEDDRPCRGSSWEEGEHLGASAEPLAILQ
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CCDS12 RLAGRHKARKPPAGSKSDSNFSNLIRLSQVSPEDDRPCRGSSWEEGEHLGASAEPLAILQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 RDEDGPNIDNMTMEAERPDPELFDPSSCPGEWLSEPDCTLESVRGPRAQGLPPRRSHQHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RDEDGPNIDNMTMEAERPDPELFDPSSCPGEWLSEPDCTLESVRGPRAQGLPPRRSHQHG
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE0 PPRGATSFLQHVTGHH
::::::::::::::::
CCDS12 PPRGATSFLQHVTGHH
610
>>CCDS75666.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1171 aa)
initn: 1146 init1: 532 opt: 1139 Z-score: 683.5 bits: 137.5 E(32554): 9.5e-32
Smith-Waterman score: 1139; 50.6% identity (74.4% similar) in 356 aa overlap (6-360:194-540)
10 20 30
pF1KE0 MSTIQSETDCYDIIEVLGKGTFGEVAKGWRRSTGE
: :. :...: ::.::::.:.: :.:.:.:
CCDS75 ATATTSTATSKNSGSNSEGDYQLVQHEVLCSMTNTYEVLEFLGRGTFGQVVKCWKRGTNE
170 180 190 200 210 220
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 MVAIKILKNDAYRNRIIKNELKLLHCMRGLDPEEAHVIRFLEFFHDALKFYLVFELLEQN
.:::::::: : . :...: . . .. . .: : :. . ::::.::::
CCDS75 IVAIKILKNHPSYARQGQIEVSILARLSTESADDYNFVRAYECFQHKNHTCLVFEMLEQN
230 240 250 260 270 280
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 LFEFQKENNFAPLPARHIRTVTLQVLTALARLKELAIIHADLKPENIMLVDQTRCPFRVK
:..: :.:.:.::: ..:: : :: ::: .:: :..:::::::::::::: .: :.:::
CCDS75 LYDFLKQNKFSPLPLKYIRPVLQQVATALMKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPSRQPYRVK
290 300 310 320 330 340
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VIDFGSASIFSEVRYVKEPYIQSRFYRAPEILLGLPFCEKVDVWSLGCVMAELHLGWPLY
:::::::: :.. : :.:::.::::::.::::::: .:.::::::.::: ::::::
CCDS75 VIDFGSASHVSKA--VCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLY
350 360 370 380 390 400
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 PGNNEYDQVRYICETQGLPKPHLLHAACKAHHFFKRNPHPDAANP-WQLKSSADYLAETK
:: .::::.::: .::::: .:: :. :. .::.:. :. : :.::. :. :::
CCDS75 PGASEYDQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRDT--DSPYPLWRLKTPDDHEAETG
410 420 430 440 450
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 VRPLERRKYMLKSLDQIETVNGGSVASRLTFPDREALAEHADLKSMVELIKRMLTWESHE
.. : :::... ::.. :: ... : : :.:.:: . ...:.:.::: .. .
CCDS75 IKSKEARKYIFNCLDDMAQVN---MTTDLEGSD--MLVEKADRREFIDLLKKMLTIDADK
460 470 480 490 500 510
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RISPSAALRHPFVSMQQLRSAHETTHYYQLSLRSYRLSLQVEGKPPTPVVAAEDGTPYYC
::.: .: ::::.: .: . ..::
CCDS75 RITPIETLNHPFVTMTHLLDFPHSTHVKSCFQNMEICKRRVNMYDTVNQSKTPFITHVAP
520 530 540 550 560 570
>>CCDS75667.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1198 aa)
initn: 1146 init1: 532 opt: 1139 Z-score: 683.4 bits: 137.5 E(32554): 9.6e-32
Smith-Waterman score: 1139; 50.6% identity (74.4% similar) in 356 aa overlap (6-360:194-540)
10 20 30
pF1KE0 MSTIQSETDCYDIIEVLGKGTFGEVAKGWRRSTGE
: :. :...: ::.::::.:.: :.:.:.:
CCDS75 ATATTSTATSKNSGSNSEGDYQLVQHEVLCSMTNTYEVLEFLGRGTFGQVVKCWKRGTNE
170 180 190 200 210 220
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 MVAIKILKNDAYRNRIIKNELKLLHCMRGLDPEEAHVIRFLEFFHDALKFYLVFELLEQN
.:::::::: : . :...: . . .. . .: : :. . ::::.::::
CCDS75 IVAIKILKNHPSYARQGQIEVSILARLSTESADDYNFVRAYECFQHKNHTCLVFEMLEQN
230 240 250 260 270 280
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 LFEFQKENNFAPLPARHIRTVTLQVLTALARLKELAIIHADLKPENIMLVDQTRCPFRVK
:..: :.:.:.::: ..:: : :: ::: .:: :..:::::::::::::: .: :.:::
CCDS75 LYDFLKQNKFSPLPLKYIRPVLQQVATALMKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPSRQPYRVK
290 300 310 320 330 340
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VIDFGSASIFSEVRYVKEPYIQSRFYRAPEILLGLPFCEKVDVWSLGCVMAELHLGWPLY
:::::::: :.. : :.:::.::::::.::::::: .:.::::::.::: ::::::
CCDS75 VIDFGSASHVSKA--VCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLY
350 360 370 380 390 400
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 PGNNEYDQVRYICETQGLPKPHLLHAACKAHHFFKRNPHPDAANP-WQLKSSADYLAETK
:: .::::.::: .::::: .:: :. :. .::.:. :. : :.::. :. :::
CCDS75 PGASEYDQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRDT--DSPYPLWRLKTPDDHEAETG
410 420 430 440 450
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 VRPLERRKYMLKSLDQIETVNGGSVASRLTFPDREALAEHADLKSMVELIKRMLTWESHE
.. : :::... ::.. :: ... : : :.:.:: . ...:.:.::: .. .
CCDS75 IKSKEARKYIFNCLDDMAQVN---MTTDLEGSD--MLVEKADRREFIDLLKKMLTIDADK
460 470 480 490 500 510
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RISPSAALRHPFVSMQQLRSAHETTHYYQLSLRSYRLSLQVEGKPPTPVVAAEDGTPYYC
::.: .: ::::.: .: . ..::
CCDS75 RITPIETLNHPFVTMTHLLDFPHSTHVKSCFQNMEICKRRVNMYDTVNQSKTPFITHVAP
520 530 540 550 560 570
>>CCDS868.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1075 aa)
initn: 1143 init1: 546 opt: 1134 Z-score: 681.0 bits: 136.9 E(32554): 1.3e-31
Smith-Waterman score: 1134; 50.3% identity (74.2% similar) in 356 aa overlap (6-360:185-531)
10 20 30
pF1KE0 MSTIQSETDCYDIIEVLGKGTFGEVAKGWRRSTGE
: :. :...: ::.::::.::: :.::: :
CCDS86 AAATTTTVTTKSSSSSGEGDYQLVQHEILCSMTNSYEVLEFLGRGTFGQVAKCWKRSTKE
160 170 180 190 200 210
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 MVAIKILKNDAYRNRIIKNELKLLHCMRGLDPEEAHVIRFLEFFHDALKFYLVFELLEQN
.:::::::: : . :...: . . . .: . .: : :. . ::::.::::
CCDS86 IVAIKILKNHPSYARQGQIEVSILSRLSSENADEYNFVRSYECFQHKNHTCLVFEMLEQN
220 230 240 250 260 270
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 LFEFQKENNFAPLPARHIRTVTLQVLTALARLKELAIIHADLKPENIMLVDQTRCPFRVK
:..: :.:.:.::: ..:: . :: ::: .:: :..:::::::::::::: .: :.:::
CCDS86 LYDFLKQNKFSPLPLKYIRPILQQVATALMKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVK
280 290 300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VIDFGSASIFSEVRYVKEPYIQSRFYRAPEILLGLPFCEKVDVWSLGCVMAELHLGWPLY
:::::::: :.. : :.:::.::::::.::::::: .:.::::::.::: ::::::
CCDS86 VIDFGSASHVSKA--VCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLY
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 PGNNEYDQVRYICETQGLPKPHLLHAACKAHHFFKRNPHPDAANP-WQLKSSADYLAETK
:: .::::.::: .::::: .:: :. :. .::.:.: . . : :.::. .. ::
CCDS86 PGASEYDQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRDP--NLGYPLWRLKTPEEHELETG
400 410 420 430 440 450
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 VRPLERRKYMLKSLDQIETVNGGSVASRLTFPDREALAEHADLKSMVELIKRMLTWESHE
.. : :::... ::.. :: ... : : :::.:: . ...:.:.::: .. .
CCDS86 IKSKEARKYIFNCLDDMAQVN---MSTDLEGTD--MLAEKADRREYIDLLKKMLTIDADK
460 470 480 490 500
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RISPSAALRHPFVSMQQLRSAHETTHYYQLSLRSYRLSLQVEGKPPTPVVAAEDGTPYYC
::.: .: : ::.: .: . ...:
CCDS86 RITPLKTLNHQFVTMTHLLDFPHSNHVKSCFQNMEICKRRVHMYDTVSQIKSPFTTHVAP
510 520 530 540 550 560
>>CCDS867.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1210 aa)
initn: 1143 init1: 546 opt: 1134 Z-score: 680.4 bits: 137.0 E(32554): 1.4e-31
Smith-Waterman score: 1134; 50.3% identity (74.2% similar) in 356 aa overlap (6-360:185-531)
10 20 30
pF1KE0 MSTIQSETDCYDIIEVLGKGTFGEVAKGWRRSTGE
: :. :...: ::.::::.::: :.::: :
CCDS86 AAATTTTVTTKSSSSSGEGDYQLVQHEILCSMTNSYEVLEFLGRGTFGQVAKCWKRSTKE
160 170 180 190 200 210
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 MVAIKILKNDAYRNRIIKNELKLLHCMRGLDPEEAHVIRFLEFFHDALKFYLVFELLEQN
.:::::::: : . :...: . . . .: . .: : :. . ::::.::::
CCDS86 IVAIKILKNHPSYARQGQIEVSILSRLSSENADEYNFVRSYECFQHKNHTCLVFEMLEQN
220 230 240 250 260 270
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 LFEFQKENNFAPLPARHIRTVTLQVLTALARLKELAIIHADLKPENIMLVDQTRCPFRVK
:..: :.:.:.::: ..:: . :: ::: .:: :..:::::::::::::: .: :.:::
CCDS86 LYDFLKQNKFSPLPLKYIRPILQQVATALMKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVK
280 290 300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 VIDFGSASIFSEVRYVKEPYIQSRFYRAPEILLGLPFCEKVDVWSLGCVMAELHLGWPLY
:::::::: :.. : :.:::.::::::.::::::: .:.::::::.::: ::::::
CCDS86 VIDFGSASHVSKA--VCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLY
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 PGNNEYDQVRYICETQGLPKPHLLHAACKAHHFFKRNPHPDAANP-WQLKSSADYLAETK
:: .::::.::: .::::: .:: :. :. .::.:.: . . : :.::. .. ::
CCDS86 PGASEYDQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRDP--NLGYPLWRLKTPEEHELETG
400 410 420 430 440 450
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 VRPLERRKYMLKSLDQIETVNGGSVASRLTFPDREALAEHADLKSMVELIKRMLTWESHE
.. : :::... ::.. :: ... : : :::.:: . ...:.:.::: .. .
CCDS86 IKSKEARKYIFNCLDDMAQVN---MSTDLEGTD--MLAEKADRREYIDLLKKMLTIDADK
460 470 480 490 500
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RISPSAALRHPFVSMQQLRSAHETTHYYQLSLRSYRLSLQVEGKPPTPVVAAEDGTPYYC
::.: .: : ::.: .: . ...:
CCDS86 RITPLKTLNHQFVTMTHLLDFPHSNHVKSCFQNMEICKRRVHMYDTVSQIKSPFTTHVAP
510 520 530 540 550 560
>>CCDS41634.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1194 aa)
initn: 1100 init1: 518 opt: 1095 Z-score: 657.8 bits: 132.8 E(32554): 2.6e-30
Smith-Waterman score: 1095; 48.1% identity (72.7% similar) in 362 aa overlap (4-360:185-538)
10 20
pF1KE0 MSTIQSETDC-----YDIIEVLGKGTFGEVAKG
.: :. : :.... ::.::::.:.:
CCDS41 QTNMGNPVTVVTATTGSKQNCTTGEGDYQLVQHEVLCSMKNTYEVLDFLGRGTFGQVVKC
160 170 180 190 200 210
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 WRRSTGEMVAIKILKNDAYRNRIIKNELKLLHCMRGLDPEEAHVIRFLEFFHDALKFYLV
:.:.:.:.:::::::: : . :...: . . .: . .: : :. . ::
CCDS41 WKRGTNEIVAIKILKNHPSYARQGQIEVSILARLSTENADEYNFVRAYECFQHRNHTCLV
220 230 240 250 260 270
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 FELLEQNLFEFQKENNFAPLPARHIRTVTLQVLTALARLKELAIIHADLKPENIMLVDQT
::.:::::..: :.:.:.::: . :: . :: ::: .:: :..:::::::::::::: .
CCDS41 FEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKVIRPILQQVATALKKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPV
280 290 300 310 320 330
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 RCPFRVKVIDFGSASIFSEVRYVKEPYIQSRFYRAPEILLGLPFCEKVDVWSLGCVMAEL
: :.::::::::::: : . : :.:::.::::::.::::::: .:.::::::.:::
CCDS41 RQPYRVKVIDFGSASHVS--KTVCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAEL
340 350 360 370 380 390
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CCDS41 FLGWPLYPGALEYDQIRYISQTQGLPGEQLLNVGTKSTRFFCKETDMSHSG-WRLKTLEE
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CCDS41 HEAETGMKSKEARKYIFNSLDDVAHVN-----TVMDLEGSDLLAEKADRREFVSLLKKML
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10 20
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210 220 230 240 250 260
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CCDS78 FLGWPLYPGALEYDQIRYISQTQGLPGEQLLNVGTKSTRFFCKETDMSHSG-WRLKTLEE
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CCDS78 HEAETGMKSKEARKYIFNSLDDVAHVN-----TVMDLEGSDLLAEKADRREFVSLLKKML
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CCDS78 LIDADLRITPAETLNHPFVNMKHLLDFPHSNHVKSCFHIMDICKSHLNSCDTNNHNKTSL
510 520 530 540 550 560
390 400 410 420 430 440
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CCDS78 LRPVASSSTATLTANFTKIGTLRSQALTTSAHSVVHHGIPLQAGTAQFGCGDAFQQTLII
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CCDS13 FSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEK--LPDGT--WNLKKTKD--GKRE
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CCDS13 YKPPGTRK-----LHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFK---DLILRMLDYDPKT
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::.: ::.: :
CCDS13 RIQPYYALQHSFFKKTADEGTNTSNSVSTSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGASAISCSSWL
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10 20 30
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CCDS42 IKIIKNKKAFLNQA-QIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNL
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CCDS42 YDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSA--I
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CCDS42 FSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEK--LPDGT--WNLKKTKD--GKRE
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40 50 60 70 80 90
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CCDS13 IKIIKNKKAFLNQA-QIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNL
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CCDS13 YDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSA--I
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300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 YPGNNEYDQVRYICETQGLPKPHLLHAACKAHHFFKRNPHPDAANPWQLKSSADYLAETK
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CCDS13 FSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEK--LPDGT--WNLKKTKD--GKRE
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pF1KE0 VRPLERRKYMLKSLDQIETVNGGSVASRLTFPDREALAEHADLKSMVELIKRMLTWESHE
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CCDS13 YKPPGTRK-----LHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFK---DLILRMLDYDPKT
410 420 430 440 450
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pF1KE0 RISPSAALRHPFVSMQQLRSAHETTHYYQLSLRSYRLSLQVEGKPPTPVVAAEDGTPYYC
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CCDS13 RIQPYYALQHSFFKKTADEGTNTSNSVSTSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSGR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]