Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0957
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0957, 493 aa
1>>>pF1KE0957 493 - 493 aa - 493 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4789+/-0.00183; mu= -8.0588+/- 0.102
mean_var=449.8893+/-104.547, 0's: 0 Z-trim(105.2): 148 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.060467
statistics sampled from 8224 (8316) to 8224 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 3.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2205.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 493) 3323 305.6 7.9e-83
CCDS46434.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 443) 2983 275.9 6.3e-74
CCDS6738.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 503) 2185 206.3 6.2e-53
CCDS78413.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 507) 2165 204.6 2.1e-52
CCDS8816.1 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 505) 2148 203.1 5.8e-52
CCDS46433.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 413) 2100 198.8 9.3e-51
CCDS44893.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 453) 2051 194.6 1.9e-49
CCDS47998.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 426) 1762 169.4 7.1e-42
CCDS46432.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 336) 1584 153.7 2.9e-37
CCDS7378.1 BMPR1A gene_id:657|Hs108|chr10 ( 532) 1577 153.3 5.9e-37
CCDS3642.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4 ( 502) 1576 153.2 6.1e-37
CCDS58919.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4 ( 532) 1576 153.3 6.3e-37
CCDS2206.1 ACVR1 gene_id:90|Hs108|chr2 ( 509) 1539 150.0 5.7e-36
CCDS31804.1 ACVRL1 gene_id:94|Hs108|chr12 ( 503) 1411 138.8 1.3e-32
CCDS44894.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 546) 1281 127.5 3.6e-29
CCDS63030.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 ( 405) 788 84.4 2.6e-16
CCDS33301.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 ( 513) 788 84.5 3e-16
CCDS2648.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3 ( 567) 758 81.9 2e-15
CCDS33727.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3 ( 592) 758 81.9 2e-15
CCDS2679.1 ACVR2B gene_id:93|Hs108|chr3 ( 512) 754 81.5 2.4e-15
>>CCDS2205.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 (493 aa)
initn: 3323 init1: 3323 opt: 3323 Z-score: 1600.5 bits: 305.6 E(32554): 7.9e-83
Smith-Waterman score: 3323; 99.6% identity (99.8% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTRALCSALRQALLLLAAAAELSPGLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTNGKEQVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MTRALCSALRQALLLLAAAAELSPGLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTNGKEQVI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KSCVSLPELNAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTASPNAPKLGPMELAIIITV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 KSCVSLPELNAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTASPNAPKLGPMELAIIITV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PVCLLSIAAMLTVWACQGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTLKDLIYDVTASGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PVCLLSIAAMLTVWACQGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTLKDLIYDVTASGSG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERYWFREAEIYQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS22 SGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERSWFREAEIYQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTMAGMIKLALSIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS22 TVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTVAGMIKLALSIA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 MVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKK
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE0 TISQLCVKEDCKA
:::::::::::::
CCDS22 TISQLCVKEDCKA
490
>>CCDS46434.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 (443 aa)
initn: 2983 init1: 2983 opt: 2983 Z-score: 1440.7 bits: 275.9 E(32554): 6.3e-74
Smith-Waterman score: 2983; 99.5% identity (99.8% similar) in 443 aa overlap (51-493:1-443)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 ELSPGLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTNGKEQVIKSCVSLPELNAQVFCHSSNN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLTNGKEQVIKSCVSLPELNAQVFCHSSNN
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 VTKTECCFTDFCNNITLHLPTASPNAPKLGPMELAIIITVPVCLLSIAAMLTVWACQGRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VTKTECCFTDFCNNITLHLPTASPNAPKLGPMELAIIITVPVCLLSIAAMLTVWACQGRQ
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 CSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTLKDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTLKDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQEI
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 VGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERYWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDN
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDN
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 GTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTMAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQGKPAIA
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTVAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQGKPAIA
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 HRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMNV
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 NIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQKF
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490
pF1KE0 RPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
400 410 420 430 440
>>CCDS6738.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 (503 aa)
initn: 2130 init1: 1881 opt: 2185 Z-score: 1063.9 bits: 206.3 E(32554): 6.2e-53
Smith-Waterman score: 2191; 67.3% identity (81.5% similar) in 504 aa overlap (4-492:3-502)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTRALCSALRQALLLL------AAAAELSPG---LKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVM
: .: : :::: :::: : :: :.: : :: ..:::: :.: :..::
CCDS67 MEAAVAAPRPRLLLLVLAAAAAAAAALLPGATALQCFCHLCTKDNFTCVTDGLCFVSVT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE0 LTNGKEQVIKSCVSLPEL---NAQVFCHSSN---NVTKTECCFTDFCNNITLHLPTASPN
:. : . :.. .: . : :. .:: : :: : ::.: .:::. .
CCDS67 ETTDKVIHNSMCIAEIDLIPRDRPFVCAPSSKTGSVTTTYCCNQDHCNKI--ELPTTVKS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 APKLGPMELAIIITVPVCLLSIAAMLTVWACQGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGK
.: :::.::: .:. :::.. :. :: :. :..: ... :: :.: . ... :
CCDS67 SPGLGPVELAAVIAGPVCFVCISLMLMVYICHNRTVIHHR--VPNEEDPSLDRPFISEGT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 TLKDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFS
::::::::.:.::::::::::::::::::::::: .:::::::::.:.: ::.:::::::
CCDS67 TLKDLIYDMTTSGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 SRDERYWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRN
::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.:::::
CCDS67 SREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 IVTMAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLA
::. :::::::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::: :: :::::::
CCDS67 TVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 VKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRC
:.::: .:::: : .::::::::::.:::..:.. ::::::::::..:::.:::::::
CCDS67 VRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRC
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 SVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECW
:.::: :.:::::::.::::::.::::::::.::.::.:::.::::::::::..::::::
CCDS67 SIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECW
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KE0 YANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
::::::::::::::::.::: .: :
CCDS67 YANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM
480 490 500
>>CCDS78413.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 (507 aa)
initn: 2136 init1: 1909 opt: 2165 Z-score: 1054.4 bits: 204.6 E(32554): 2.1e-52
Smith-Waterman score: 2186; 66.9% identity (81.3% similar) in 508 aa overlap (4-492:3-506)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTRALCSALRQALLLL------AAAAELSPG---LKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVM
: .: : :::: :::: : :: :.: : :: ..:::: :.: :..::
CCDS78 MEAAVAAPRPRLLLLVLAAAAAAAAALLPGATALQCFCHLCTKDNFTCVTDGLCFVSVT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE0 LTNGKEQVIKSCVSLPEL---NAQVFCHSSN---NVTKTECCFTDFCNNITLHLPTASP-
:. : . :.. .: . : :. .:: : :: : ::.: .:::..:
CCDS78 ETTDKVIHNSMCIAEIDLIPRDRPFVCAPSSKTGSVTTTYCCNQDHCNKI--ELPTTGPF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ---NAPKLGPMELAIIITVPVCLLSIAAMLTVWACQGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLV
..: :::.::: .:. :::.. :. :: :. :..: ... :: :.: . ..
CCDS78 SVKSSPGLGPVELAAVIAGPVCFVCISLMLMVYICHNRTVIHHR--VPNEEDPSLDRPFI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 NAGKTLKDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAV
. : ::::::::.:.::::::::::::::::::::::: .:::::::::.:.: ::.:::
CCDS78 SEGTTLKDLIYDMTTSGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KIFSSRDERYWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDY
::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::
CCDS78 KIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LNRNIVTMAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIAD
::: ::. :::::::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::: :: :::
CCDS78 LNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIAD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 LGLAVKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEI
:::::.::: .:::: : .::::::::::.:::..:.. ::::::::::..:::.:::
CCDS78 LGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEI
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 ARRCSVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIM
:::::.::: :.:::::::.::::::.::::::::.::.::.:::.::::::::::..::
CCDS78 ARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIM
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KE0 RECWYANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
::::::::::::::::::::.::: .: :
CCDS78 RECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM
480 490 500
>>CCDS8816.1 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 (505 aa)
initn: 2099 init1: 1838 opt: 2148 Z-score: 1046.4 bits: 203.1 E(32554): 5.8e-52
Smith-Waterman score: 2156; 65.6% identity (84.5% similar) in 491 aa overlap (13-492:15-504)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTRALCSALRQALLLLAAAAELSP----GLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTN
.::::... .: .: :.: : ..:.::.:.::: .:.. .
CCDS88 MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE0 GKEQVIKSCVSLPEL---NAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTAS---PNAPK
: :. ...:. :: . .: ::... .:.::.::.:: : :..:.. :. :.
CCDS88 GMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 L-GPMELAIIITVPVCLLSIAAMLTVWACQGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTL
. ::.::. ::. :: :: . ... . . .: :....: ..:.: : : . :::
CCDS88 MWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCL-SKDKTL
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 KDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSR
.::.::...:::::::::.::::.:::::::::.:::::::::.::: : ::::::::::
CCDS88 QDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 DERYWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIV
.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::: :
CCDS88 EERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 TMAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVK
:. :::::::: ::::::::::::::::::.:::::.::::::::: ::::::::::.
CCDS88 TIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVR
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 HDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSV
::.. .:::: : .::::::::::.::.:.:.. :.::: ::::..:::::::::::.
CCDS88 HDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 GGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYA
::. :::::::::.::::::::::::::::::.::.::: ::: :::::::..:::::::
CCDS88 GGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYA
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KE0 NGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
::::::::::::::.::: :.:: :
CCDS88 NGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
480 490 500
>>CCDS46433.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 (413 aa)
initn: 2100 init1: 2100 opt: 2100 Z-score: 1024.8 bits: 198.8 E(32554): 9.3e-51
Smith-Waterman score: 2622; 83.4% identity (83.6% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-413)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTRALCSALRQALLLLAAAAELSPGLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTNGKEQVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTRALCSALRQALLLLAAAAELSPGLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTNGKEQVI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KSCVSLPELNAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTASPNAPKLGPMELAIIITV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KSCVSLPELNAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPT-------------------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PVCLLSIAAMLTVWACQGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTLKDLIYDVTASGSG
CCDS46 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERYWFREAEIYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS46 -GLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERSWFREAEIYQ
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTMAGMIKLALSIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS46 TVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTVAGMIKLALSIA
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQN
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYD
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 MVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKK
350 360 370 380 390 400
490
pF1KE0 TISQLCVKEDCKA
:::::::::::::
CCDS46 TISQLCVKEDCKA
410
>>CCDS44893.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 (453 aa)
initn: 1971 init1: 1838 opt: 2051 Z-score: 1001.2 bits: 194.6 E(32554): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 2051; 67.8% identity (85.6% similar) in 451 aa overlap (49-492:3-452)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 AAELSPGLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTNGKEQVIKSCVSLPEL---NAQVFC
:.. .: :. ...:. :: . .:
CCDS44 MVSIFNLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYC
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 HSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTAS---PNAPKL-GPMELAIIITVPVCLLSIAAML
::... .:.::.::.:: : :..:.. :. :.. ::.::. ::. :: :: . ..
CCDS44 LSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIII
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 TVWACQGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTLKDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTI
. . . .: :....: ..:.: : : . :::.::.::...:::::::::.::::.
CCDS44 VFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCL-SKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTV
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 ARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERYWFREAEIYQTVMLRHENILG
:::::::::.:::::::::.::: : ::::::::::.:: ::::::::::::::::::::
CCDS44 ARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILG
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 FIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTMAGMIKLALSIASGLAHLHMEIV
:::::::::::::::::::.:::.:::.::::: ::. :::::::: ::::::::::::
CCDS44 FIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIV
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 GTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAP
::::::.:::::.::::::::: ::::::::::.::.. .:::: : .:::::::::
CCDS44 GTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAP
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 EMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEM
:.::.:.:.. :.::: ::::..:::::::::::. ::. :::::::::.::::::::::
CCDS44 EVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEM
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 RKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDC
::::::::.::.::: ::: :::::::..:::::::::::::::::::::.::: :.::
CCDS44 RKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDV
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 KA
:
CCDS44 KI
>>CCDS47998.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 (426 aa)
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Smith-Waterman score: 1799; 60.1% identity (70.2% similar) in 504 aa overlap (4-492:3-425)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MTRALCSALRQALLLL------AAAAELSPG---LKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVM
: .: : :::: :::: : :: :.: : :: ..:::: :.: :..::
CCDS47 MEAAVAAPRPRLLLLVLAAAAAAAAALLPGATALQCFCHLCTKDNFTCVTDGLCFVSVT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE0 LTNGKEQVIKSCVSLPEL---NAQVFCHSSN---NVTKTECCFTDFCNNITLHLPTASPN
:. : . :.. .: . : :. .:: : :: : ::.: .:::
CCDS47 ETTDKVIHNSMCIAEIDLIPRDRPFVCAPSSKTGSVTTTYCCNQDHCNKI--ELPT----
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 APKLGPMELAIIITVPVCLLSIAAMLTVWACQGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGK
CCDS47 ------------------------------------------------------------
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 TLKDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFS
.:::::::::::::::::: .:::::::::.:.: ::.:::::::
CCDS47 ---------------TGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFS
120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 SRDERYWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRN
::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.:::::
CCDS47 SREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRY
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 IVTMAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLA
::. :::::::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::: :: :::::::
CCDS47 TVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLA
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 VKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRC
:.::: .:::: : .::::::::::.:::..:.. ::::::::::..:::.:::::::
CCDS47 VRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRC
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 SVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECW
:.::: :.:::::::.::::::.::::::::.::.::.:::.::::::::::..::::::
CCDS47 SIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECW
340 350 360 370 380 390
470 480 490
pF1KE0 YANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
::::::::::::::::.::: .: :
CCDS47 YANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM
400 410 420
>>CCDS46432.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 (336 aa)
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Smith-Waterman score: 1954; 68.0% identity (68.2% similar) in 493 aa overlap (1-493:1-336)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MTRALCSALRQALLLLAAAAELSPGLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTNGKEQVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTRALCSALRQALLLLAAAAELSPGLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTNGKEQVI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KSCVSLPELNAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTASPNAPKLGPMELAIIITV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KSCVSLPELNAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPT-------------------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PVCLLSIAAMLTVWACQGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTLKDLIYDVTASGSG
CCDS46 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERYWFREAEIYQ
CCDS46 ------------------------------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTMAGMIKLALSIA
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS46 ------------------DNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTVAGMIKLALSIA
110 120 130 140
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQN
150 160 170 180 190 200
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pF1KE0 PKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYD
210 220 230 240 250 260
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 MVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKK
270 280 290 300 310 320
490
pF1KE0 TISQLCVKEDCKA
:::::::::::::
CCDS46 TISQLCVKEDCKA
330
>>CCDS7378.1 BMPR1A gene_id:657|Hs108|chr10 (532 aa)
initn: 1458 init1: 1415 opt: 1577 Z-score: 776.9 bits: 153.3 E(32554): 5.9e-37
Smith-Waterman score: 1577; 50.9% identity (72.8% similar) in 489 aa overlap (18-492:51-531)
10 20 30 40
pF1KE0 MTRALCSALRQALLLLAAAAELSPGLKCVCL-LC--DSSNFTCQTEG
: . : ::: : : :. : :: :.:
CCDS73 VQGQNLDSMLHGTGMKSDSDQKKSENGVTLAPEDTLPFLKCYCSGHCPDDAINNTCITNG
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 ACWASVMLTNGKEQVIKS-CVSLPELNAQVFCHSS--NNVTKT-ECCFTDFCNNITLHLP
:.: . . : .. : :.. . : :..: .. .: ::: :..::. :
CCDS73 HCFAIIEEDDQGETTLASGCMKYEGSDFQ--CKDSPKAQLRRTIECCRTNLCNQYLQ--P
90 100 110 120 130
110 120 130 140 150
pF1KE0 TASPNAPKLGPME------LAIIITVPVCLLSIAAMLTVWACQGRQC-SYRKKKRPNVEE
: : . .::. :...:.. ::.... . . . : . : : ...: : .
CCDS73 TLPPVV--IGPFFDGSIRWLVLLISMAVCIIAMIIFSSCF-CYKHYCKSISSRRRYNRDL
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 PLSECNLVNAGKTLKDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGR
.: .. .:..::::: . .::::::::::::::::. : . . :::::.:::: :.
CCDS73 EQDEA-FIPVGESLKDLIDQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVRQVGKGRYGEVWMGK
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 WCGEDVAVKIFSSRDERYWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYH
: :: ::::.: . .: ::::.::::::..:::::::::::: : .:.::::.:...::
CCDS73 WRGEKVAVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTGSWTQLYLITDYH
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 EQGSLYDYLNRNIVTMAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKK
:.:::::.:. . ...::: : : :: ::: :: ::::::::::::.::::::.::
CCDS73 ENGSLYDFLKCATLDTRALLKLAYSAACGLCHLHTEIYGTQGKPAIAHRDLKSKNILIKK
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 CETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYS
.: ::::::::: .: : .:.: : .::::::::::.::...: : :. . :::::
CCDS73 NGSCCIADLGLAVKFNSDTNEVDVPLNTRVGTKRYMAPEVLDESLNKNHFQPYIMADIYS
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 VGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEA
::. ::.:::: .::::::::::::.::::::: :.::.::: ...:: . :.:.: :
CCDS73 FGLIIWEMARRCITGGIVEEYQLPYYNMVPSDPSYEDMREVVCVKRLRPIVSNRWNSDEC
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490
pF1KE0 LRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
::.. ..: ::: : :.::::::::::.... ..: :
CCDS73 LRAVLKLMSECWAHNPASRLTALRIKKTLAKMVESQDVKI
500 510 520 530
493 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 00:38:04 2016 done: Mon Nov 7 00:38:05 2016
Total Scan time: 3.090 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]