Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0898
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0898, 1369 aa
1>>>pF1KE0898 1369 - 1369 aa - 1369 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3854+/-0.00114; mu= 14.8105+/- 0.069
mean_var=161.6523+/-31.414, 0's: 0 Z-trim(107.2): 46 B-trim: 26 in 1/52
Lambda= 0.100875
statistics sampled from 9373 (9404) to 9373 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 5.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369) 8928 1312.9 0
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 1330 207.0 2.2e-52
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 1163 182.7 4.5e-45
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 1004 159.7 5.5e-38
CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194) 861 138.8 8.8e-32
CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270) 772 125.9 7.3e-28
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386) 771 125.8 8.6e-28
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143) 748 122.3 7.6e-27
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 ( 795) 647 107.5 1.5e-22
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 ( 707) 567 95.8 4.5e-19
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 672) 556 94.2 1.3e-18
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 703) 556 94.2 1.4e-18
CCDS9987.2 TDRD9 gene_id:122402|Hs108|chr14 (1382) 476 82.8 7.2e-15
CCDS7652.1 DHX32 gene_id:55760|Hs108|chr10 ( 743) 441 77.5 1.6e-13
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227) 415 73.9 3.1e-12
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 702) 406 72.4 5.1e-12
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 779) 406 72.4 5.5e-12
CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181) 408 72.9 6.1e-12
CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220) 408 72.9 6.3e-12
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041) 393 70.6 2.5e-11
CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12 (1157) 386 69.7 5.5e-11
>>CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369 aa)
initn: 8928 init1: 8928 opt: 8928 Z-score: 7028.1 bits: 1312.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8928; 100.0% identity (100.0% similar) in 1369 aa overlap (1-1369:1-1369)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGGKNKKHKAPAAAVVRAAVSASRAKSAEAGIAGEAQSKKPVSRPATAAAAAAGSREPRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MGGKNKKHKAPAAAVVRAAVSASRAKSAEAGIAGEAQSKKPVSRPATAAAAAAGSREPRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KQGPKIYSFNSTNDSSGPANLDKSILKVVINNKLEQRIIGVINEHKKQNNDKGMISGRLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KQGPKIYSFNSTNDSSGPANLDKSILKVVINNKLEQRIIGVINEHKKQNNDKGMISGRLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 AKKLQDLYMALQAFSFKTKDIEDAMTNTLLYGGDLHSALDWLCLNLSDDALPEGFSQEFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AKKLQDLYMALQAFSFKTKDIEDAMTNTLLYGGDLHSALDWLCLNLSDDALPEGFSQEFE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 EQQPKSRPKFQSPQIQATISPPLQPKTKTYEEDPKSKPKKEEKNMEVNMKEWILRYAEQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EQQPKSRPKFQSPQIQATISPPLQPKTKTYEEDPKSKPKKEEKNMEVNMKEWILRYAEQQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NEEEKNENSKSLEEEEKFDPNERYLHLAAKLLDAKEQAATFKLEKNKQGQKEAQEKIRKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NEEEKNENSKSLEEEEKFDPNERYLHLAAKLLDAKEQAATFKLEKNKQGQKEAQEKIRKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QREMETLEDHPVFNPAMKISHQQNERKKPPVATEGESALNFNLFEKSAAATEEEKDKKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QREMETLEDHPVFNPAMKISHQQNERKKPPVATEGESALNFNLFEKSAAATEEEKDKKKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 PHDVRNFDYTARSWTGKSPKQFLIDWVRKNLPKSPNPSFEKVPVGRYWKCRVRVIKSEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PHDVRNFDYTARSWTGKSPKQFLIDWVRKNLPKSPNPSFEKVPVGRYWKCRVRVIKSEDD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 VLVVCPTILTEDGMQAQHLGATLALYRLVKGQSVHQLLPPTYRDVWLEWSDAEKKREELN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLVVCPTILTEDGMQAQHLGATLALYRLVKGQSVHQLLPPTYRDVWLEWSDAEKKREELN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 KMETNKPRDLFIAKLLNKLKQQQQQQQQHSENKRENSEDPEESWENLVSDEDFSALSLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KMETNKPRDLFIAKLLNKLKQQQQQQQQHSENKRENSEDPEESWENLVSDEDFSALSLES
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 ANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETGSG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 KSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSLCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSLCG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 YQIRMESRACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YQIRMESRACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 ILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 SEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 NPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 IALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 QMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 HIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE0 KIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAMADSDHLTIYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAMADSDHLTIYN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE0 AYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE0 GNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEKLACIVETAQGKAQVHPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEKLACIVETAQGKAQVHPSS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE0 VNRDLQTHGWLLYQEKIRYARVYLRETTLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VNRDLQTHGWLLYQEKIRYARVYLRETTLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360
pF1KE0 APVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLENDKILQIITELIKTENN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 APVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLENDKILQIITELIKTENN
1330 1340 1350 1360
>>CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008 aa)
initn: 1380 init1: 590 opt: 1330 Z-score: 1053.9 bits: 207.0 E(32554): 2.2e-52
Smith-Waterman score: 1995; 39.9% identity (69.7% similar) in 887 aa overlap (497-1367:138-990)
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 LEWSDAEKKREELNKMETNKPRDLFIAKLLNKLKQQQQQ---QQQHSENKRENSEDPEES
::: :... :... :. : ..:
CCDS31 KESEAQISWFAPEDHGYGTEVSTKNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYIDRDS
110 120 130 140 150 160
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 WENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVE
: :..... .. .:.. .:::. .: .: : .. . :..:: . . .:.
CCDS31 -EYLLQENEPDG-TLDQKLLEDLQKKKNDLR-------YIEMQHFREKLPSYGMQKELVN
170 180 190 200 210
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 TLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVC
. :.:.:..:::: ::.::: .:.:.. . .. ..: : :::::::::::.:.:.::
CCDS31 LIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYI-ERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVA
220 230 240 250 260 270
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 DELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESR-ACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVD
: . : : :: :::::..:: .. .::::::..:. :: : ::.:::...:
CCDS31 AERAESCGSG--NST-GYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLD
280 290 300 310 320 330
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 EVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVE
:.:::..::: :. ..:..:. ::::..::::::...:::: :: .::...: : ..::
CCDS31 EIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVV
340 350 360 370 380 390
770 780 790 800 810 820
pF1KE0 VFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADL
. :::.::. .: :. .:. ..: . . .: : :.: : .
CCDS31 EYLLEDVIEKIRYVPEQ-KEHRSQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDY------V
400 410 420 430 440
830 840 850 860 870 880
pF1KE0 NPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQ
. ..::. : .: .:. :..:.::. :. :. ... .::.:.:::: .:.
CCDS31 RELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYI----VLEEEDGAILVFLPGWDNIST
450 460 470 480 490 500
890 900 910 920 930 940
pF1KE0 LYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDV
:.::: .. : :... .: :::.. : .:. .: ::::::::.:::::::.::: ::
CCDS31 LHDLLMSQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDV
510 520 530 540 550 560
950 960 970 980 990 1000
pF1KE0 VFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGF
:.::: :. ::... ....:.. .::::.: ::.::::::. : :...:. : .
CCDS31 VYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLL
570 580 590 600 610 620
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE0 MDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELN
::..:::::.:::::::.: ::. :::. .:::. ... .. : ...: . .
CCDS31 DDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQ
630 640 650 660 670 680
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE0 EPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEAD
: .::::: ::: :::. .::::..:::.: ::::: :.:: .. :.::. :.:.. ::
CCDS31 E-ELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIAD
690 700 710 720 730 740
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE0 LAKSALAM-ADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQEL
.. :: . :::::. ::. ::..::..: .: : :: . ::. ..: :...: ..
CCDS31 ARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRG-FRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQF
750 760 770 780 790 800
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE0 IKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTE
. . .::: :: . . :.: :.. . ..:::. :::: .:.:: .. .
CCDS31 AEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNEK-----IIKAVICAGLYPKVAKI--RLNLGKKR
810 820 830 840 850
1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE0 KLACIVETAQGKAQVHPSSVNRDLQT---HGWLLYQEKIRYARVYLRETTLITPFPVLLF
:.. . ..: . :::.::: . :: ..::.:. :.: . .:: . : ..:. .:.:
CCDS31 KMVKVYTKTDGLVAVHPKSVNVE-QTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFF
860 870 880 890 900 910
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE0 GGDIEVQ--HRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLENDK-
:::: .: . .. ...: :: ::.:..:: . :.:: .: .:..:.:.:. ::
CCDS31 GGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPVDWNDTK
920 930 940 950 960 970
1360
pF1KE0 -----ILQIITELIKTENN
.:. : .::::.
CCDS31 SRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS
980 990 1000
>>CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (994 aa)
initn: 1310 init1: 449 opt: 1163 Z-score: 922.7 bits: 182.7 E(32554): 4.5e-45
Smith-Waterman score: 1914; 39.3% identity (68.8% similar) in 887 aa overlap (497-1367:138-976)
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 LEWSDAEKKREELNKMETNKPRDLFIAKLLNKLKQQQQQ---QQQHSENKRENSEDPEES
::: :... :... :. : ..:
CCDS54 KESEAQISWFAPEDHGYGTEVSTKNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYIDRDS
110 120 130 140 150 160
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 WENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVE
: :..... .. .:.. .:::. .: .: : .. . :..:: . . .:.
CCDS54 -EYLLQENEPDG-TLDQKLLEDLQKKKNDLR-------YIEMQHFREKLPSYGMQKELVN
170 180 190 200 210
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 TLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVC
. :.:.:..:::: ::.::: .:.:.. . .. ..: : :::::::::::.:.:.::
CCDS54 LIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYI-ERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVA
220 230 240 250 260 270
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 DELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESR-ACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVD
: . : : :: :::::..:: .. .::::::..:. :: : ::.:::...:
CCDS54 AERAESCGSG--NST-GYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLD
280 290 300 310 320 330
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 EVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVE
:.:::..::: :. ..:..:. ::::..::::::...:::: :: .::...: : ..::
CCDS54 EIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVV
340 350 360 370 380 390
770 780 790 800 810 820
pF1KE0 VFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADL
. :::.::. .: :. .:. ..: . . .: : :.: : .
CCDS54 EYLLEDVIEKIRYVPEQ-KEHRSQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDY------V
400 410 420 430 440
830 840 850 860 870 880
pF1KE0 NPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQ
. ..::. : .: .:. :..:.::. :. :. ... .::.:.:::: .:.
CCDS54 RELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYI----VLEEEDGAILVFLPGWDNIST
450 460 470 480 490 500
890 900 910 920 930 940
pF1KE0 LYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDV
:.::: .. . ..:. .:: .: ::::::::.:::::::.::: ::
CCDS54 LHDLLMSQ----------VMFKSVNQTQ----VFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDV
510 520 530 540
950 960 970 980 990 1000
pF1KE0 VFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGF
:.::: :. ::... ....:.. .::::.: ::.::::::. : :...:. : .
CCDS54 VYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLL
550 560 570 580 590 600
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE0 MDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELN
::..:::::.:::::::.: ::. :::. .:::. ... .. : ...: . .
CCDS54 DDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQ
610 620 630 640 650 660
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE0 EPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEAD
: .::::: ::: :::. .::::..:::.: ::::: :.:: .. :.::. :.:.. ::
CCDS54 E-ELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIAD
670 680 690 700 710 720
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE0 LAKSALAM-ADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQEL
.. :: . :::::. ::. ::..::..: .: : :: . ::. ..: :...: ..
CCDS54 ARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRG-FRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQF
730 740 750 760 770 780
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE0 IKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTE
. . .::: :: . . :.: :.. . ..:::. :::: .:.:: .. .
CCDS54 AEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNEK-----IIKAVICAGLYPKVAKI--RLNLGKKR
790 800 810 820 830 840
1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE0 KLACIVETAQGKAQVHPSSVNRDLQT---HGWLLYQEKIRYARVYLRETTLITPFPVLLF
:.. . ..: . :::.::: . :: ..::.:. :.: . .:: . : ..:. .:.:
CCDS54 KMVKVYTKTDGLVAVHPKSVNVE-QTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFF
850 860 870 880 890
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE0 GGDIEVQ--HRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLENDK-
:::: .: . .. ...: :: ::.:..:: . :.:: .: .:..:.:.:. ::
CCDS54 GGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPVDWNDTK
900 910 920 930 940 950
1360
pF1KE0 -----ILQIITELIKTENN
.:. : .::::.
CCDS54 SRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS
960 970 980 990
>>CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430 aa)
initn: 1384 init1: 479 opt: 1004 Z-score: 795.5 bits: 159.7 E(32554): 5.5e-38
Smith-Waterman score: 1376; 33.7% identity (58.8% similar) in 894 aa overlap (569-1300:190-1065)
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 ESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETG
::.::::.... ::. .:...::...::::
CCDS41 NREMSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQEEIVKIIKENKVVLIVGETG
160 170 180 190 200 210
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 SGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSL
:::.::.:.:::.: . : . : : ::::::..:...:.:: : . : .
CCDS41 SGKTTQIPQFLLDDCFKN---GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIG-----QT
220 230 240 250 260 270
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 CGYQIRMESRACESTRLLYCTTGVLLRKLQE-DGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLII
:::::.:::. .: : .::.::::: :. :. ::.:.::::::::::. :::::
CCDS41 IGYQIRLESRVSPKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTK
280 290 300 310 320 330
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 LKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVL
:...:::. :.::: ::..: . : :: ::.. :.:: . :. . ::::.. ::..
CCDS41 LRDLLQKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTN
340 350 360 370 380 390
780 790 800
pF1KE0 EKDSEYCQKFLEEEEEVT-----------------------INVTSKA-----GG-----
.. .: .. .::.. : .:::.. ::
CCDS41 KEMLKYKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFS
400 410 420 430 440 450
810 820 830
pF1KE0 ------IKKYQEYIPVQTGA-------HADLNPFYQ--------------KYSSRTQHAI
.. . .. . : : :.. : : ..: . :.
CCDS41 QLTEKDVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATAL
460 470 480 490 500 510
840 850 860
pF1KE0 LYM-----------------NPHK------INLDL--------ILELLAYLDKSPQFRNI
. : :. . :: :..:: . . .: :.
CCDS41 MVAAGRGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNL
520 530 540 550 560 570
870
pF1KE0 E--------------------------------------------------GAVLIFLPG
. :::::::::
CCDS41 DESSLVQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPG
580 590 600 610 620 630
880 890 900 910 920 930
pF1KE0 LAHIQQLYD-LLSNDRRFY--SERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIA
.: : : .: .:.:: ..::.:. ::: ..:.:: .. :: :::::.:.::::
CCDS41 YDEIVGLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIA
640 650 660 670 680 690
940 950 960 970 980 990
pF1KE0 ETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRM
::.::. :::::::.:..::... . .. : ...:::::.::.::::: : :.:::.
CCDS41 ETSITVNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRL
700 710 720 730 740 750
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE0 YTRERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCLHI-MKCNLGSP-EDFLSKALDPPQLQVISNAMN
..: ::........::.::.::.::::: . .. : ::: :: .:: .. ::..
CCDS41 FSRLRFQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQ
760 770 780 790 800 810
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE0 LLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPF
.:. : : . : :: :: ::: :::. ..:::.. .... ::::. :.: ... ..::
CCDS41 MLKTIDAMDTWED-LTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPF
820 830 840 850 860 870
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE0 TTPI--GRKDEADLAKSAL-AMADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNR
. : ..: : : .. . : : :::... :. .:.:::..: :. .:..:::..
CCDS41 VLPTQASQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA---FCEKNFLSQ
880 890 900 910 920
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE0 TSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNV
... . .. .:. ..:.:: . . :. . . . .. :..::.::::.: :.
CCDS41 ATMEIIIGMRTQLLGQLRASGFVRARGG----GDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNL
930 940 950 960 970 980
1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE0 GKI-----IYT--KSVDVTEKLACIVETAQGKAQVHPSS----VNRDLQTHGWLLYQEKI
.. . : : : . : .. : : .. :.. . . : : ::.:.:
CCDS41 VHVDRENLVLTGPKEKKVRFHPASVLSQPQYK-KIPPANGQAAAIKALPTD-WLIYDEMT
990 1000 1010 1020 1030 1040
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE0 RYARVY-LRETTLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLI
: :. .: . .:: .:.: :
CCDS41 RAHRIANIRCCSAVTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTAN
1050 1060 1070 1080 1090 1100
>>CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194 aa)
initn: 1042 init1: 534 opt: 861 Z-score: 684.1 bits: 138.8 E(32554): 8.8e-32
Smith-Waterman score: 1441; 34.6% identity (64.7% similar) in 855 aa overlap (538-1365:406-1180)
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 QHSENKRENSEDPEESWENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLK
::. .:. . . .:.:. : .:
CCDS27 LRLQSDDILPLGKDSGPLSDPITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLELWRR--RGPVWQ----
380 390 400 410 420
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 ERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVC
: :::: :::.:......: :::..:.:: ::.:..:..::: . .: ....::..
CCDS27 EAPQLPVDPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYV-TEGRGARCNVII
430 440 450 460 470 480
630 640 650 660 670 680
pF1KE0 TQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRA-CESTRLLYCTTGVLLRK
::::::::::.:.:: ::: :. : .. :.:.:.::. .. ::.::.:.::::
CCDS27 TQPRRISAVSVAQRVSHELG----PSLRRNV-GFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRK
490 500 510 520 530 540
690 700 710 720 730 740
pF1KE0 LQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYF
:: . : .::::::::::::.:..:::::.:: . . :.:.::::: :.:.:: ::
CCDS27 LQSNPSLEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYF
550 560 570 580 590 600
750 760 770 780 790 800
pF1KE0 THCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIK
::.... : :::. .::::. . :
CCDS27 GGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILAKLG--------------------------------
610 620 630
810 820 830 840 850 860
pF1KE0 KYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNI
:.: :. : .... :. . :. .:::. .:. ..: :.
CCDS27 KHQ-YL------HR-----HRHHESEDECAL--------DLDLVTDLVLHIDA----RGE
640 650 660
870 880 890 900 910 920
pF1KE0 EGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKI
:..: :::: .:. . . :.. .. .: .. .:: . .:: : : :: :::::
CCDS27 PGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQEALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKI
670 680 690 700 710 720
930 940 950 960 970 980
pF1KE0 VLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVR
:::::::::.::: :.: :.:.: ::..: ....: : ..::.:...::.::::: .
CCDS27 VLATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQ
730 740 750 760 770 780
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE0 DGFCFRMYTRERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPE----DFLSKALDPPQ
.:: .... : :.: .. ..::::::.:::.: ... .. :: .:::::.: :.
CCDS27 SGFAYHLFPRSRLEKMVPFQVPEILRTPLENL---VLQAKIHMPEKTAVEFLSKAVDSPN
790 800 810 820 830 840
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE0 LQVISNAMNLLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLA
......:. ::..::. . : :: :::.:: . .. ...: ....::: :: :. ...
CCDS27 IKAVDEAVILLQEIGVLDQRE-YLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVV
850 860 870 880 890 900
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE0 AVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAM-ADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYC
. .: ..::.. . . :.: .:. :. . ::::.. : ::... . :. .:
CCDS27 SCLT-RDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYL
910 920 930 940 950 960
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KE0 RRNFLNRTSLLTLED-VKQELIKLVKA--AGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKA
..:.: :: .. .:: .. .: .: :. : .: . :. :. : :.:.
CCDS27 EENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSE-----EEELVKG
970 980 990 1000 1010
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE0 VLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEKL---ACIVETAQGKAQVHPSSVNRD---LQTHGWLL
::.:::: :. .. : : :. . .: .:. .: :..::. :... ::
CCDS27 VLMAGLYPNLIQVRQGK-VTRQGKFKPNSVTYRTKSGNILLHKSTINREATRLRSR-WLT
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE0 YQEKIRY-ARVYLRETTLITPFPVLLF-GGDIEVQHRERL----LSIDGWIYFQAPVKIA
: .. . :..:... . :. :::. ::.... : :: . . ... . .
CCDS27 YFMAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTV
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1330 1340 1350 1360
pF1KE0 VIFKQLRV----LIDSVLRKKLEN--PKMSLENDKILQIITELIKTENN
..:.:: ... ::..: :... :. ..: ...::..
CCDS27 RLLKELRRALGRMVERSLRSELAALPPSVQEEHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD
1140 1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270 aa)
initn: 1273 init1: 536 opt: 772 Z-score: 613.7 bits: 125.9 E(32554): 7.3e-28
Smith-Waterman score: 1559; 33.8% identity (63.1% similar) in 946 aa overlap (435-1365:249-1136)
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 GRYWKCRVRVIKSEDDVLVVCPTILTEDGMQAQHLGATLALYRLVK---GQSVHQLLPPT
: :::.. : :.: :..:.
CCDS41 IKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQSCALSLVRQLYHLGVVEAYSGLTKKKEGETVEPYKVNL
220 230 240 250 260 270
470 480 490 500 510
pF1KE0 YRDVWLEWSDAEKKREELNKMETNKPRDLFIAKLLN--KLKQQQQQQQQHSENKRENSED
.: :: . .. .::: :.: . :: :: : . .:.:.. . :
CCDS41 SQD--LE-HQLQNIIQELNLEILPPPEDPSVPVALNIGKLAQFEPSQRQNQVGVVPWSP-
280 290 300 310 320 330
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 PEESWENLVSDE-DFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHR
:. .:. .:.. : . :.. . . ... .:. .:.. : .:.::. ::: : .
CCDS41 PQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFE
340 350 360 370 380 390
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 DSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSL
. :.:..... ::.. : :: ::.::::.:.:.:.. :. .:..:::: ::::::::::.
CCDS41 SEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQND-RAAECNIVVTQPRRISAVSV
400 410 420 430 440 450
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 ANRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMES-RACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVS
:.:: : : : :: :::..:.:: . ...::.::::::: : :. ..:
CCDS41 AERVAFERGEE--PGKS---CGYSVRFESILPRPHASIMFCTVGVLLRKL-EAGI-RGIS
460 470 480 490 500
700 710 720 730 740 750
pF1KE0 HVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGR
::::::.:::....::::..:....: .....:::::.:. : :: .:::... ::
CCDS41 HVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGR
510 520 530 540 550 560
760 770 780 790 800 810
pF1KE0 SYPVEVFHLEDIIEETGFVLE-KDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQT
.:::. . ::: :. : :: ::.. .: . :. : . : .:: :
CCDS41 TYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDGGEDDDANCNLICG-----DEYGP---
570 580 590 600 610
820 830 840 850 860 870
pF1KE0 GAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPG
.:. .. .: .. ..:: :: :.. :. ::::.::::
CCDS41 ---------------ETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETL----NVPGAVLVFLPG
620 630 640 650
880 890 900 910 920 930
pF1KE0 LAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETG
: . : . .: :.::... ::: . ..: .: : :: :..:.::::::.
CCDS41 WNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETS
660 670 680 690 700 710
940 950 960 970 980 990
pF1KE0 ITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTR
::: :::.:::. . : . . ..:.. . ...::.. ::.::::::: ::::.. .:
CCDS41 ITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSR
720 730 740 750 760 770
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE0 ERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKI
::: . . .::..:.::.:. : : ::. .::.::..:: :... .: . ::..
CCDS41 ARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLREL
780 790 800 810 820 830
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE0 GACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIG
: . :. .:::::. :: ::.. ..:::.:.: :: : . :.::. :: . :
CCDS41 DALDAND-ELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINE-G
840 850 860 870 880 890
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE0 RKDEADLAKSALAMADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLED
.. . . .. . :::... ... .: ::. :: ..:: .:... :: ..: .
CCDS41 KR-LGYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARM-GGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWE
900 910 920 930 940 950
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE0 VKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKS
.: .: ... .:: . :. : . .. .. .. ..:. :.: :: : :
CCDS41 AKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDN----NLDVVISLLAFGVYPNV---CYHK-
960 970 980 990 1000
1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE0 VDVTEKLACIVETAQGK-AQVHPSSVN-----RDLQTHG-WLLYQEKIRYARVYLRETTL
:: . :..:. : .: :::: .:.. . .... :::: . . ::
CCDS41 ----EKRK--ILTTEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE0 ITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKM
.::. .:::.. .:: ... .: :: .: . :. . ::. ..... . ..: .
CCDS41 VTPLQLLLFASK-KVQSDGQIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAI
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1350 1360
pF1KE0 SLENDKILQIITELIKTENN
. : . . . ..:.
CCDS41 ISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSY
1130 1140 1150 1160 1170 1180
>>CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386 aa)
initn: 1763 init1: 477 opt: 771 Z-score: 612.4 bits: 125.8 E(32554): 8.6e-28
Smith-Waterman score: 1966; 38.2% identity (68.1% similar) in 936 aa overlap (476-1351:445-1366)
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 YRLVKGQSVHQLLPPTYRDVWLEWSDAEKKREELNKMETNK---PRDLFIAKLLNKLKQQ
: ..:. .: : . :... . ....
CCDS18 LEEESEIVKLLTNTHHKYSDPPVNFLPVPSRTRINNPACHKTVIPNNSFVSNQIPEVEKA
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550
pF1KE0 QQQQQQHSENKRENSEDPEESWENL---VSDE-DFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQS
...... .. .::. :: .: . :..: :... : . . . :: :.
CCDS18 SESEESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGK----ICKQFRMKQA
480 490 500 510 520 530
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 TPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEW
. ..:..:.:::.::....:..:.. :..:.:::..: :: ::.::.:.:.:.: : :
CCDS18 SRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSL-NGP
540 550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KE0 EASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRACESTRLLYC
. ::.:::::::::.:.:.:: : . . : :::::.:: .::::::
CCDS18 PEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVG-----LTVGYQIRLESVKSSATRLLYC
590 600 610 620 630 640
680 690 700 710 720 730
pF1KE0 TTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVD
:::::::.:. : :..:::.::::::::. .:::::..::.:...: :..::::::..
CCDS18 TTGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLN
650 660 670 680 690 700
740 750 760 770 780
pF1KE0 SEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLE---------
.: :: ::. ::.. : ::..::. : ::: : : .::. : : ... .
CCDS18 AELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFFLEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKEKLKAR
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 ------EEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPH
:: : . .. . . .. .: : .: :. :. . ... :. .
CCDS18 RNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFE
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890
pF1KE0 KINLDLILELLAYL-DKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRF---YSERYK
:.::.:: :: .. : . .. ::.:.::::::.:..::. :... : :.:
CCDS18 KVNLELIEALLEWIVDGKHSYP--PGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRRSNRCV
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KE0 VIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHES
. ::: ::...: :.:. :: :: ::...::::::.::: :::.:::.:. ::..: :
CCDS18 IHPLHSSLSSEEQQAVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDAS
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE0 SQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEG-FMDYSVPEILRVPLEEL
. : :: .::::.:.::::.:::::: .: ::...: .... .. ..::: :::::.:
CCDS18 KGMESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQL
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE0 CLHIMKCNLGSPEDF---LSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAA
::.: .. : ... .:. ..::. . . . :: .:: .: .::::: :::.
CCDS18 CLRIKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDE-RLTPLGYHLAS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE0 LPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAMADSDH
:::.:.:::...::.:: ::::. :.:: .. ::::..: .:.::. : .:.:.::.
CCDS18 LPVDVRIGKLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFANSDY
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE0 LTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFS----
:.. .:: ::. . .:: :. .:::.:::. : . ..:... .:.. ::.
CCDS18 LALLQAYKGWQLSTKEG-VRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFAREGL
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1200 1210 1220 1230
pF1KE0 -SSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIA-------LLKAVLVAGLYDNV-------GKIIYTKS
. .:. . . .: :..:.: :.:: :: ::. :..
CCDS18 RAREIEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTST
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE0 --VDVTEKLACI--VETAQGKAQVHPSSVNRDLQTHG--WLLYQEKIRYARVYLRETTLI
: . : : . : .: ...:::::: ... .:::.:::. .::..:. ...
CCDS18 GAVRMQPKSAELKFVTKNDGYVHIHPSSVNYQVRHFDSPYLLYHEKIKTSRVFIRDCSMV
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE0 TPFPVLLFGG---DIEVQHRERLLSID-GWIYFQAPV-KIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLE
. .:..:::: ....:. : ..:.: ::: : : ..: . :.:: .:..:. :..
CCDS18 SVYPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIK
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1350 1360
pF1KE0 NPKMSLENDKILQIITELIKTENN
::...:
CCDS18 NPSIDLCTCPRGSRIISTIVKLVTTQ
1370 1380
>>CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143 aa)
initn: 1311 init1: 442 opt: 748 Z-score: 595.4 bits: 122.3 E(32554): 7.6e-27
Smith-Waterman score: 1190; 35.7% identity (61.9% similar) in 638 aa overlap (553-1190:143-696)
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 SWENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIV
: . :. . :: .:: ::. .. . :.
CCDS12 PATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRIL
120 130 140 150 160 170
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 ETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRV
.:::.:.::::::.:: :::::::..:: :. ...:::::::. .:::.::
CCDS12 QTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLA--------AGFSHVACTQPRRIACISLAKRV
180 190 200 210 220
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 CDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVD
: . : : :::::.:: .:.... :.:.:::..:.. : . .:::
CCDS12 GFESLSQYG-----SQVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVD
230 240 250 260 270
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 EVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVE
::::: ...:::: .:...: : ::..::::::.. ::.::.. :.... :: .:.
CCDS12 EVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPIT
280 290 300 310 320 330
770 780 790 800 810 820
pF1KE0 VFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADL
: . .: : : :::. . :
CCDS12 VV----------------------YQPQEAEPT---TSKSEKL---------------DP
340 350
830 840 850 860 870 880
pF1KE0 NPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQ
:: . .: :: :. : : .:.:: :.:.:.
CCDS12 RPFLR---------VLESIDHKY--------------PPEER---GDLLVFLSGMAEISA
360 370 380 390
890 900 910 920 930 940
pF1KE0 LYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDV
. . .. ...:. :. ::: ::. :: .: . :::::: .:.::::::..:: .
CCDS12 VLEA-AQTYASHTQRWVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGI
400 410 420 430 440 450
950 960 970 980 990 1000
pF1KE0 VFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGF
::.:.:..:: .: ..... : : ..:.::: ::.:::::. : :::.:.. ...:
CCDS12 RFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAF
460 470 480 490 500 510
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE0 MDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELN
: :::: :: :. : :.. . ..:.:. : ..:: . .:. :: :: . .
CCDS12 APYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTF--PFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSS
520 530 540 550 560 570
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE0 EPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEAD
: :::.:. :: :::.: ::::::.:..:. ..:: :.::... .:::: . :
CCDS12 EA-LTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECA
580 590 600 610 620
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE0 LAKSALAMADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELI
:. : ..: .:..:.. .: ....: . :. .::: ... : . ......
CCDS12 AARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERS-RNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFK
630 640 650 660 670 680
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE0 KLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEK
.:.. :.
CCDS12 ELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGG
690 700 710 720 730 740
>>CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 (795 aa)
initn: 1079 init1: 345 opt: 647 Z-score: 518.1 bits: 107.5 E(32554): 1.5e-22
Smith-Waterman score: 1124; 31.0% identity (56.7% similar) in 838 aa overlap (463-1292:40-755)
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 GMQAQHLGATLALYRLVKGQSVHQLLPPTYRDVWLEWSDAEKKREELNKMETNKPRD-LF
:: . .: :..::. .. : . ..
CCDS33 GEDYPSGKKRAGTDGKDRDRDRDREDRSKDRDRERDRGDREREREKEKEKELRASTNAML
10 20 30 40 50 60
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 IAKLLNKLKQQQQQQQQHSENKRENSEDPEESWENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRN
:. : :: ... .. :: .. ..... . . . :. .: :
CCDS33 ISAGLPPLKASHSAHSTHSAHSTHSTHSAHSTHAG-------------HAGHTSLPQCIN
70 80 90 100 110
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 LFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLE
: .: ::.: .::.: ::::....: ... : ::. :..:::::::.::.:.. .:
CCDS33 PFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQWCVE
120 130 140 150 160 170
620 630 640 650 660 670
pF1KE0 DLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRACE
. . : ...::::::..:.:.:.:: ::. : . ::.::.:. .
CCDS33 --YMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLG-----QEVGYSIRFEDCSSA
180 190 200 210 220
680 690 700 710 720 730
pF1KE0 STRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLI
.: : : : :.:::. ..: :: . .:.::.:::.. .:.:. .:::....::::..:
CCDS33 KTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVI
230 240 250 260 270 280
740 750 760 770 780 790
pF1KE0 LMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEE
.::::.:. ::. :: .::.: : ::..:::.:. . : .. : . ::
CCDS33 VMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPE--PERDYLEAAIRTVIQIHMCEE
290 300 310 320 330 340
800 810 820 830 840 850
pF1KE0 EEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLIL
:: : ::.:
CCDS33 EE----------G-------------------------------------------DLLL
350
860 870 880 890 900 910
pF1KE0 ELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQD
: . . . . :. : . : .. : :.: :.: : :.
CCDS33 FLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDI------------------KIIPLYSTLPPQQ
360 370 380 390
920 930 940 950 960
pF1KE0 QAAAFTLPPP----GV--RKIVLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSL
: : ::: :. ::.:..::::::..:: :::::: : .:.. :. .. ::
CCDS33 QQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESL
400 410 420 430 440 450
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 VETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGFM-DYSVPEILRVPLEELCLHIMK
. : .::::: :: :::::.: : :::.::.. .. : : . ::::: : . :.. :
CCDS33 LVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKK
460 470 480 490 500 510
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 CNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGK
:: . .::: ... :..:: ..: . .. :: ::. .: .:.. ...:
CCDS33 --LGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALN-DDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAK
520 530 540 550 560 570
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE0 MLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAMADSDHLTIYNAYLG
:.: . ..: . : ...:... . :. : : :: :: .: :.::::. :.: .
CCDS33 MVIASCDYNCSNEVLSITAMLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHA
580 590 600 610 620 630
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE0 WKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRA
.:. .. . .: ::.: ::.. ..:.:.: ... .. :.
CCDS33 FKQNHES------VQWCYDNFINYRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLP----------RRS
640 650 660 670
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE0 SQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEKLACIVETAQGKAQVHPSSVNRD
.. : . .. .::.: . .:... : .: : .: :.:::.: :
CCDS33 TDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHY-LTVKDNQVV-------QLHPSTV-LD
680 690 700 710 720
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE0 LQTHGWLLYQEKIRYARVYLRETTLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQAPVK
. . :.::.: . .. :.: : : :
CCDS33 HKPE-WVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWLVKIAPQYYDMSNFPQCEAKRQLDRIIAKL
730 740 750 760 770 780
>>CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 (707 aa)
initn: 829 init1: 422 opt: 567 Z-score: 455.9 bits: 95.8 E(32554): 4.5e-19
Smith-Waterman score: 902; 28.5% identity (56.5% similar) in 744 aa overlap (558-1285:60-703)
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 VSDEDFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVETLKR
..: . . .:..::.:. : ... :.
CCDS11 RQVVMLLTAGSGGRGGGGGRRQQPPLAQPSASPYPEAVELQRRSLPIFQARGQLLAQLRN
30 40 50 60 70 80
590 600 610 620 630 640
pF1KE0 HRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVCDELG
.:. :::::::.::.:..: : . . . :. :::::..:.:::.:: ::
CCDS11 LDNAVLIGETGSGKTTQIPQYLYEGGI-----SRQGIIAVTQPRRVAAISLATRVSDEKR
90 100 110 120 130 140
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 CENGPGGRNSLCGYQIRMESRACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHER
: : .: :: .:... . :.::. . : :.:::. :.:: . : ::.::.:::
CCDS11 TELG-----KLVGYTVRFDDVTSEDTRIKFLTDGMLLREAISDSLLRKYSCVILDEAHER
150 160 170 180 190
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 SVQSDFLLIILKEILQKRSDL-----HLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVE
....: :. ..: ..:..: ..:.::::.: . :: ::. :.: . ::..:..
CCDS11 TIHTDVLFGVVKAAQKRRKELGKLPLKVIVMSATMDVDLFSQYFNGAPVLYLEGRQHPIQ
200 210 220 230 240 250
770 780 790 800 810 820
pF1KE0 VFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADL
::. . . ..:. :: :
CCDS11 VFYTK--------------------------------------QPQNDYL------HAAL
260 270
830 840 850 860 870 880
pF1KE0 NPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQ
.: .. ..:. ..: :.:: : .:.
CCDS11 VSVFQIHQ----------------------------EAPSSQDI----LVFLTGQEEIEA
280 290 300
890 900 910 920 930
pF1KE0 LYDLLSNDRRFYSE---RYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITI
. . . . . :. :.. : .: .: : : ::....::::::.:::
CCDS11 MSKTCRDIAKHLPDGCPAMLVLPLYASLPYAQQLRVFQGAPKGYRKVIISTNIAETSITI
310 320 330 340 350 360
940 950 960 970 980 990
pF1KE0 PDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERF
. .:.::: .: .::. .: . :. :::..: :: ::::: .:.:.:.::...:
CCDS11 TGIKYVVDTGMVKAKKYNPDSGLEVLAVQRVSKTQAWQRTGRAGREDSGICYRLYTEDEF
370 380 390 400 410 420
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE0 EGFMDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGS--PEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIG
: : ..:::: : : . :... .. . ::.:: .: ..:. ..:: :
CCDS11 EKFDKMTVPEIQRCNLASVMLQLLAMKVPNVLTFDFMSKP-SPDHIQAAIAQLDLL---G
430 440 450 460 470
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE0 ACELNEPKLT--PLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPI
: : .. .:: :.:...::.:.. :..: .... : : . . :...... : . .:
CCDS11 ALEHKDDQLTLTPMGRKMAAFPLEPKFAKTILMSPKFHCTEEILTIVSLLSVDSVLHNPP
480 490 500 510 520 530
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE0 GRKDEADLAKSALAMADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLE
.:..:.. ... . ...::.:. : : .:. :: .. .:..::.: .. .
CCDS11 SRREEVQGVRKKFISSEGDHMTLLNIYRTFKNL---GGNKD---WCKENFVNSKNMTLVA
540 550 560 570 580 590
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE0 DVKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLS-FQEIALLKAVLVAGLYDNVGKI-IY
.:. .: . .. ... . :. : . : :. : :. . . :. . :.
CCDS11 EVRAQLRDICLKMSMPIASSRGDVESVRRCLAHSLFMSTAELQPDGTYATTDTHQPVAIH
600 610 620 630 640 650
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE0 TKSVDVTEKLACIVETAQGKAQVHPSSVNRDLQT--HGWLLYQEKIRYARVYLRETTLIT
.:: : ::.: : . . ::: . :: :. .: : ::
CCDS11 PSSVLFHCKPACVVYT---ELLYTNKCYMRDLCVIDAQWL-YEAAPEYFRRKLRTARN
660 670 680 690 700
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE0 PFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSL
1369 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 11:22:46 2016 done: Sun Nov 6 11:22:47 2016
Total Scan time: 5.030 Total Display time: 0.490
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]