Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0892
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0892, 324 aa
1>>>pF1KE0892 324 - 324 aa - 324 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2327+/-0.00124; mu= 10.1791+/- 0.072
mean_var=119.0516+/-39.835, 0's: 0 Z-trim(101.1): 393 B-trim: 735 in 2/44
Lambda= 0.117546
statistics sampled from 5894 (6388) to 5894 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.527), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16
Scan time: 1.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 2095 367.3 9.2e-102
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1606 284.4 8.2e-77
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1372 244.7 7.2e-65
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1348 240.6 1.2e-63
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1335 238.4 5.6e-63
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1072 193.8 1.5e-49
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1069 193.3 2.1e-49
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1055 190.9 1.1e-48
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 1038 188.0 8.2e-48
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1031 186.9 1.9e-47
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1029 186.5 2.4e-47
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1029 186.5 2.4e-47
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1027 186.2 3e-47
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1025 185.8 3.8e-47
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1024 185.7 4.4e-47
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1012 183.6 1.7e-46
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 1006 182.6 3.6e-46
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 985 179.1 4.2e-45
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 976 177.5 1.2e-44
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 974 177.2 1.5e-44
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 971 176.7 2.2e-44
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 969 176.3 2.7e-44
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 968 176.2 3.1e-44
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 966 175.8 3.9e-44
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 966 175.8 4e-44
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 963 175.3 5.5e-44
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 961 175.0 7e-44
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 955 174.0 1.6e-43
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 953 173.6 1.8e-43
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 952 173.5 2.1e-43
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 951 173.3 2.2e-43
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 951 173.3 2.3e-43
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 950 173.1 2.5e-43
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 947 172.6 3.6e-43
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 944 172.1 5.1e-43
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 942 171.8 6.5e-43
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 938 171.1 1.1e-42
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 937 170.9 1.2e-42
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 935 170.6 1.5e-42
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 933 170.2 1.9e-42
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 932 170.1 2.1e-42
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 928 169.4 3.4e-42
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 928 169.4 3.4e-42
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 927 169.2 3.8e-42
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 926 169.0 4.3e-42
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 924 168.7 5.5e-42
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 921 168.2 7.6e-42
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 920 168.0 8.9e-42
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 919 167.9 9.6e-42
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 919 167.9 9.8e-42
>>CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 (324 aa)
initn: 2095 init1: 2095 opt: 2095 Z-score: 1940.4 bits: 367.3 E(32554): 9.2e-102
Smith-Waterman score: 2095; 100.0% identity (100.0% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGMSNLTRLSEFILLGLSSRSEDQRPLFALFLIIYLVTLMGNLLIILAIHSDPRLQNPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MGMSNLTRLSEFILLGLSSRSEDQRPLFALFLIIYLVTLMGNLLIILAIHSDPRLQNPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSILSFADICYTTVIVPKMLVNFLSEKKTISYAECLAQMYFFLVFGNIDSYLLAAMAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FFLSILSFADICYTTVIVPKMLVNFLSEKKTISYAECLAQMYFFLVFGNIDSYLLAAMAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 NRCVAICNPFHYVTVMNRRCCVLLLAFPITFSYFHSLLHVLLVNRLTFCTSNVIHHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NRCVAICNPFHYVTVMNRRCCVLLLAFPITFSYFHSLLHVLLVNRLTFCTSNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VNPVLKLSCSSTFVNEIVAMTEGLASVMAPFVCIIISYLRILIAVLKIPSAAGKHKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VNPVLKLSCSSTFVNEIVAMTEGLASVMAPFVCIIISYLRILIAVLKIPSAAGKHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSSHLTVVILFYGSISYVYLQPLSSYTVKDRIATINYTVLTSVLNPFIYSLRNKDMKRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CSSHLTVVILFYGSISYVYLQPLSSYTVKDRIATINYTVLTSVLNPFIYSLRNKDMKRGL
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 QKLINKIKSQMSRFSTKTNKICGP
::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QKLINKIKSQMSRFSTKTNKICGP
310 320
>>CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 (310 aa)
initn: 1673 init1: 1606 opt: 1606 Z-score: 1492.5 bits: 284.4 E(32554): 8.2e-77
Smith-Waterman score: 1606; 78.1% identity (93.2% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGMSNLTRLSEFILLGLSSRSEDQRPLFALFLIIYLVTLMGNLLIILAIHSDPRLQNPMY
:: .:::: ::::::::::: :::.::::.:: :::.:..:::::::::.:: :::.:::
CCDS35 MGRNNLTRPSEFILLGLSSRPEDQKPLFAVFLPIYLITVIGNLLIILAIRSDTRLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLSILSFADICYTTVIVPKMLVNFLSEKKTISYAECLAQMYFFLVFGNIDSYLLAAMAI
::::::::.::::.:::.:::::::::: :::::.:::.::::::.::: ::::::::::
CCDS35 FFLSILSFVDICYVTVIIPKMLVNFLSETKTISYSECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAMAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 NRCVAICNPFHYVTVMNRRCCVLLLAFPITFSYFHSLLHVLLVNRLTFCTSNVIHHFFCD
.: :::::::::.:.:..:::::::.. . . .::::::.::.:.: ::.::::::::::
CCDS35 DRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFCIPHFHSLLHILLTNQLIFCASNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VNPVLKLSCSSTFVNEIVAMTEGLASVMAPFVCIIISYLRILIAVLKIPSAAGKHKAFST
.::::::::: ::.::..:::::: .:.:: :::::::::::.::::::::::.:::::
CCDS35 DQPVLKLSCSSHFVKEITVMTEGLAVIMTPFSCIIISYLRILITVLKIPSAAGKRKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSSHLTVVILFYGSISYVYLQPLSSYTVKDRIATINYTVLTSVLNPFIYSLRNKDMKRGL
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CCDS35 CGSHLTVVTLFYGSISYLYFQPLSNYTVKDQIATIIYTVLTPMLNPFIYSLRNKDMKQGL
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 QKLINKIKSQMSRFSTKTNKICGP
::....: :
CCDS35 AKLMHRMKCQ
310
>>CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 (309 aa)
initn: 1416 init1: 1367 opt: 1372 Z-score: 1278.1 bits: 244.7 E(32554): 7.2e-65
Smith-Waterman score: 1372; 68.4% identity (89.8% similar) in 304 aa overlap (3-306:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGMSNLTRLSEFILLGLSSRSEDQRPLFALFLIIYLVTLMGNLLIILAIHSDPRLQNPM
... . .::::::::::: :::. ::.::::.::::. :::::::::. .:.::.::
CCDS35 MERINHTSSVSEFILLGLSSRPEDQKTLFVLFLIVYLVTITGNLLIILAIRFNPHLQTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLSILSFADICYTTVIVPKMLVNFLSEKKTISYAECLAQMYFFLVFGNIDSYLLAAMA
:::::.::..:::.:: .:::::.:::::::::::: ::.::::. ..:: :: :::.::
CCDS35 YFFLSFLSLTDICFTTSVVPKMLMNFLSEKKTISYAGCLTQMYFLYALGNSDSCLLAVMA
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 INRCVAICNPFHYVTVMNRRCCVLLLAFPITFSYFHSLLHVLLVNRLTFCTSNVIHHFFC
..: ::.:.::::::.:... ::::.:: .: ..:::::.::.:::::: :::::::.:
CCDS35 FDRYVAVCDPFHYVTTMSHHHCVLLVAFSCSFPHLHSLLHTLLLNRLTFCDSNVIHHFLC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DVNPVLKLSCSSTFVNEIVAMTEGLASVMAPFVCIIISYLRILIAVLKIPSAAGKHKAFS
:..::::::::: :::::: :::. ... :.:: .::.::: .::::::..::.::::
CCDS35 DLSPVLKLSCSSIFVNEIVQMTEAPIVLVTRFLCIAFSYIRILTTVLKIPSTSGKRKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCSSHLTVVILFYGSISYVYLQPLSSYTVKDRIATINYTVLTSVLNPFIYSLRNKDMKRG
::. .:::: :::::: ::::: :.:.:::..::: ::::.:.::::::::::::.:.:
CCDS35 TCGFYLTVVTLFYGSIFCVYLQPPSTYAVKDHVATIVYTVLSSMLNPFIYSLRNKDLKQG
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE0 LQKLINKIKSQMSRFSTKTNKICGP
:.::..:
CCDS35 LRKLMSKRS
>>CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1363 init1: 1166 opt: 1348 Z-score: 1256.0 bits: 240.6 E(32554): 1.2e-63
Smith-Waterman score: 1348; 67.9% identity (89.6% similar) in 299 aa overlap (10-307:11-309)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGMSNLTRLSEFILLGLSSRSEDQRPLFALFLIIYLVTLMGNLLIILAIHSDPRLQNPM
: :::::::: . :.::::.:::.::.. .::.::: ::.:::::..::
CCDS35 MEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPQLQKPLFAIFLIMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLSILSFADICYTTVIVPKMLVNFLSEKKTISYAECLAQMYFFLVFGNIDSYLLAAMA
::::: ::: :::.::::::::::::::: :.:::. ::::::::..::: ::::::.::
CCDS35 YFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 INRCVAICNPFHYVTVMNRRCCVLLLAFPITFSYFHSLLHVLLVNRLTFCTSNVIHHFFC
:.: ::::::.:: .::. : :.:.: ..:..:::..:::..::.::.:..:.::::
CCDS35 IDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSCSISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DVNPVLKLSCSSTFVNEIVAMTEGLASVMAPFVCIIISYLRILIAVLKIPSAAGKHKAFS
:..::::::::.: ...:.::: :: ...::.:::.:::::...::.::::::: ::::
CCDS35 DTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFLCIIFSYLRIMVTVLRIPSAAGKWKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCSSHLTVVILFYGSISYVYLQPLSSYTV-KDRIATINYTVLTSVLNPFIYSLRNKDMKR
::.::::.: :::::: :::..::: :.: .::.::. :::.: .:::::::::::::::
CCDS35 TCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKR
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE0 GLQKLINKIKSQMSRFSTKTNKICGP
::.:: ..:
CCDS35 GLKKLQDRIYR
310
>>CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1337 init1: 1158 opt: 1335 Z-score: 1244.1 bits: 238.4 E(32554): 5.6e-63
Smith-Waterman score: 1335; 67.1% identity (88.4% similar) in 301 aa overlap (10-309:11-311)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MGMSNLTRLSEFILLGLSSRSEDQRPLFALFLIIYLVTLMGNLLIILAIHSDPRLQNPM
: :::::::: . :.::::.:::.::.: .::.::::::.:::::..::
CCDS35 METKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFLIMYLLTAVGNVLIILAIYSDPRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YFFLSILSFADICYTTVIVPKMLVNFLSEKKTISYAECLAQMYFFLVFGNIDSYLLAAMA
::::: ::: :::.::::::::::::::: : :::. :: :::::..::: ::::::.::
CCDS35 YFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKIISYVGCLIQMYFFMAFGNTDSYLLASMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 INRCVAICNPFHYVTVMNRRCCVLLLAFPITFSYFHSLLHVLLVNRLTFCTSNVIHHFFC
:.: ::::::.:: .::. :.:.: ..:..:::..:::..::.::.:..:.::::
CCDS35 IDRLVAICNPLHYDVVMKPWHCLLMLLGSCSISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DVNPVLKLSCSSTFVNEIVAMTEGLASVMAPFVCIIISYLRILIAVLKIPSAAGKHKAFS
:..::::::::.: ...:.::: :: ...::.: :.:::.:...::.::::::: ::::
CCDS35 DTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFLCTIFSYLQIIVTVLRIPSAAGKWKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCSSHLTVVILFYGSISYVYLQPLSSYTV-KDRIATINYTVLTSVLNPFIYSLRNKDMKR
::.::::::.:::::. :::..::: :.: : :.::. :::.: .:::::::::::::::
CCDS35 TCGSHLTVVVLFYGSVIYVYFRPLSMYSVMKGRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKR
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE0 GLQKLINKIKSQMSRFSTKTNKICGP
::.:: ..: :
CCDS35 GLKKLRHRIYS
310
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1080 init1: 925 opt: 1072 Z-score: 1003.1 bits: 193.8 E(32554): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 1072; 51.0% identity (83.1% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGMSNLTRLSEFILLGLSSRSEDQRPLFALFLIIYLVTLMGNLLIILAIHSDPRLQNPMY
:. .: . .:::.::::: . ..:. ::..:: .::.:..:::::::.. : :..:::
CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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310
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CCDS32 LRKLVNRKITSSS
310
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CCDS41 FFLSNLAFVDICFTSTTVPQMVVNILTGTKTISFAGCLTQLFFFVSFVNMDSLLLCVMAY
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CCDS41 DRYVAICHPLHYTARMNLCLCVQLVAGLWLVTYLHALLHTVLIAQLSFCASNIIHHFFCD
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CCDS41 LQKMLLKCTVFQQQ
310
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CCDS35 MDNSNWTSVSHFVLLGISTHPEEQIPLFLVFSLMYAINISGNLAIITLILSAPRLHIPMY
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CCDS35 IFLSNLALTDICFTSTTVPKMLQIIFSPTKVISYTGCLAQTYFFICFAVMENFILAVMAY
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CCDS35 DRYIAICHPFHYTMILTRMLCVKMVVMCHALSHLHAMLHTFLIGQLIFCADNRIPHFFCD
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CCDS35 LYALMKISCTSTYLNTLMIHTEGAVVISGALAFITASYACIILVVLRIPSAKGRWKTFST
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CCDS35 CGSHLTVVAIFYGTLSWVYFRPLSSYSVTKGRIITVVYTVVTPMLNPFIYSLRNGDVKGG
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CCDS35 FMKWMSRMQTFFFR
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CCDS11 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
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CCDS11 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
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CCDS11 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
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CCDS11 CASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYSVKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRNKDMHGAL
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CCDS11 GRLLDKHFKRLT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]