Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0835
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0835, 314 aa
1>>>pF1KE0835 314 - 314 aa - 314 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0934+/-0.000594; mu= 16.9358+/- 0.036
mean_var=74.7521+/-16.078, 0's: 0 Z-trim(105.8): 92 B-trim: 148 in 1/49
Lambda= 0.148341
statistics sampled from 13928 (13987) to 13928 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.475), E-opt: 0.2 (0.164), width: 16
Scan time: 6.190
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 1976 433.0 3.7e-121
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 799 181.1 2.5e-45
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 652 149.7 7.3e-36
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 648 148.8 1.3e-35
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 642 147.5 3.2e-35
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 623 143.5 5.5e-34
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 598 138.1 2.2e-32
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 592 136.8 5.5e-32
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 590 136.4 7.2e-32
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 585 135.3 1.5e-31
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 584 135.1 1.8e-31
XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 570 132.1 1.4e-30
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 570 132.1 1.4e-30
XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 570 132.1 1.4e-30
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 565 131.0 2.9e-30
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 563 130.6 4e-30
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 526 122.7 9.3e-28
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 516 120.6 4.1e-27
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 446 105.6 1.4e-22
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 439 104.1 3.8e-22
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 439 104.1 3.8e-22
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 365 88.3 2.3e-17
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 340 82.9 9e-16
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 333 81.4 2.7e-15
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 322 79.0 1.3e-14
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 318 78.2 2.3e-14
>>NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 member (314 aa)
initn: 1976 init1: 1976 opt: 1976 Z-score: 2296.1 bits: 433.0 E(85289): 3.7e-121
Smith-Waterman score: 1976; 98.7% identity (99.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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NP_852 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_852 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_852 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_852 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAVRLLW
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NP_852 FLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQTAVRLLW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 HLRNYTKTPNALPL
:::::::::: :::
NP_852 HLRNYTKTPNPLPL
310
>>NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 member (318 aa)
initn: 785 init1: 465 opt: 799 Z-score: 934.7 bits: 181.1 E(85289): 2.5e-45
Smith-Waterman score: 799; 42.1% identity (72.0% similar) in 311 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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NP_076 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
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NP_076 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSL--VLEIFIDISLNIIDK--SNLTLYLDESKTLYD
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NP_076 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 KLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMV
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NP_076 ST---KLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAV
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 MSFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAV
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NP_076 ISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 RLLWHLRNYTKTPNALPL
...:.. . :
NP_076 KVIWKVMSILKGRKFQQHKQI
300 310
>>NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 member (307 aa)
initn: 652 init1: 315 opt: 652 Z-score: 764.9 bits: 149.7 E(85289): 7.3e-36
Smith-Waterman score: 652; 39.2% identity (68.8% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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NP_076 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKN-KLSTIGFILTGLAISRIFLIW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
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NP_076 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLY-LDESKTLYDKLS
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NP_076 WLKSRTN-MVLPFMI--VFLLI-SSLLNFAYIAKILNDYKTKNDTVWDLNMYKSEY---F
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSF
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NP_076 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAVRLL
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NP_076 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 WHLRNYTKTPNALPL
.:. : :
NP_076 QQLKCCEKRKNLRVT
300
>>NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 member (316 aa)
initn: 601 init1: 581 opt: 648 Z-score: 760.1 bits: 148.8 E(85289): 1.3e-35
Smith-Waterman score: 648; 38.3% identity (69.5% similar) in 311 aa overlap (8-309:8-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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NP_058 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
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NP_058 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFD--SLVLEI-FIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDK
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NP_058 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVM
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NP_058 IHVLGTLWYLP---PLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SFLFLFIVHFFSLQVAN-GIFFMLWNNKYIKFVMLALNAF-PSCHSFILILGNSKLRQTA
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NP_058 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNF--LPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTF
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 VRLLW----HLRNYTKTPNALPL
: .: ::. .: :
NP_058 VVMLRCESGHLKPGSKGPIFS
300 310
>>NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 667 init1: 362 opt: 642 Z-score: 753.3 bits: 147.5 E(85289): 3.2e-35
Smith-Waterman score: 642; 37.7% identity (69.2% similar) in 305 aa overlap (1-299:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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NP_076 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
:.. ..... : .:: . ... .: ..:.:. :..:::..:::.::: : :::
NP_076 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLL-IFDSLVLEIFI--DISLNII--DKSNLTLYLDESKTLY
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NP_076 WLKWKID-MVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPY
130 140 150 160 170
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pF1KE0 -DKLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMK
. : ::..: ...:: . : :...: :: :::...:: . :::: :::.: ::.:
NP_076 FEPL----TLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 MVMSFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQT
. ::.:.:.....: . . ..: . ..: .: .: ::.:::. :.:::::
NP_076 TMTSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQT
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 AVRLLWHLRNYTKTPNALPL
::.:
NP_076 FVRMLTCRKIACMI
300
>>NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 member (317 aa)
initn: 486 init1: 384 opt: 623 Z-score: 731.2 bits: 143.5 E(85289): 5.5e-34
Smith-Waterman score: 634; 38.1% identity (71.4% similar) in 315 aa overlap (1-307:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
:. . .:: .. :.::::. ::: ::.:::: . .:..:. :.: ::: :::: :. :.
NP_076 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRIS-LV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 VILFDSFLVGLA-SHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLF
..: :. :.. :..: .. . . .: . ::...:::: :. :::.:::.: .:.:
NP_076 WLIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LWLRWRMNGMI-VMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESK-TLYDK
:.:.::.. .. :.::. :.::.. .:. .: :. :.: . : : : :. : ...
NP_076 LYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALI-NIHINASINGY-RRNKTCSSDSSNFTRFSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVM
: .: . . . ::::.: :. .:.:..:. .: .... . : :.::.::: ..: :.
NP_076 LIVLTSTVFI--FIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHR-GVKSVI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALN-----AFPSCHSFILILGNSKLR
.:..:. . :::. .:. .:... .. .. :. :.::::: .:::::.:::
NP_076 TFFLLYAI--FSLS----FFISVWTSERLEENLIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLR
240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 QTAVRLLWHLRNYTKTPNALPL
:... .: :: . :
NP_076 QASLSVLLWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
290 300 310
>>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 597 init1: 289 opt: 598 Z-score: 702.4 bits: 138.1 E(85289): 2.2e-32
Smith-Waterman score: 598; 35.8% identity (68.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
: : : :: :: .. :.:. ..: ::.::: : .: ::. :: ::: ::.: .: :
NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
:.... . . : . ... .. :. .: . ::...:::: :::::..:::.: . .::
NP_795 VLVLNWYATEL-NPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI
:. :........:. :..:. .:... .: . ..:.: . ...: ::
NP_795 HLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINM-NQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMY--LSN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL
:. :....::.: : :.:.:. :: .: ....: . ::.: : ..: .:.. : :::
NP_795 T-TVTILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAVRLLW
.: ..:.:. .. : : :. . : ..:: : :::: ::.::.:: . .::
NP_795 LLCAIYFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLW
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 HLRNYTKTPNALPL
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300
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310
pF1KE0 HLRNYTKTPNALPL
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NP_795 QMRYWVKGEKTSSP
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NP_076 LLVAAKVWAKR
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start: Tue Nov 8 00:46:19 2016 done: Tue Nov 8 00:46:20 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]