Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0835
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0835, 314 aa
1>>>pF1KE0835 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7418+/-0.00137; mu= 13.5821+/- 0.081
mean_var=74.8084+/-16.219, 0's: 0 Z-trim(99.6): 60 B-trim: 65 in 1/47
Lambda= 0.148286
statistics sampled from 5772 (5811) to 5772 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.501), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16
Scan time: 2.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 1976 432.7 1.8e-121
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 799 180.9 1.2e-45
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 652 149.4 3.3e-36
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 648 148.6 6.1e-36
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 642 147.3 1.5e-35
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 623 143.2 2.5e-34
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 598 137.9 9.9e-33
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 592 136.6 2.5e-32
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 590 136.2 3.3e-32
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 585 135.1 6.7e-32
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 584 134.9 8e-32
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 565 130.8 1.3e-30
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 563 130.4 1.8e-30
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 526 122.5 4.2e-28
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 516 120.3 1.8e-27
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 452 106.7 2.7e-23
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 449 106.0 4.2e-23
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 439 103.8 1.7e-22
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 439 103.9 1.7e-22
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 365 88.0 1e-17
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 340 82.7 4e-16
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 333 81.2 1.2e-15
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 322 78.8 5.7e-15
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 318 78.0 1e-14
>>CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 (314 aa)
initn: 1976 init1: 1976 opt: 1976 Z-score: 2294.2 bits: 432.7 E(32554): 1.8e-121
Smith-Waterman score: 1976; 98.7% identity (99.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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CCDS31 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAVRLLW
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CCDS31 FLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQTAVRLLW
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 HLRNYTKTPNALPL
:::::::::: :::
CCDS31 HLRNYTKTPNPLPL
310
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
initn: 785 init1: 465 opt: 799 Z-score: 933.3 bits: 180.9 E(32554): 1.2e-45
Smith-Waterman score: 799; 42.1% identity (72.0% similar) in 311 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
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CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSL--VLEIFIDISLNIIDK--SNLTLYLDESKTLYD
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CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 KLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMV
. : .:.:....:: . : :...:.::: :: : ..::. : :: ::::: ::.: :
CCDS86 ST---KLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAV
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 MSFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAV
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CCDS86 ISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 RLLWHLRNYTKTPNALPL
...:.. . :
CCDS86 KVIWKVMSILKGRKFQQHKQI
300 310
>>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa)
initn: 652 init1: 315 opt: 652 Z-score: 763.5 bits: 149.4 E(32554): 3.3e-36
Smith-Waterman score: 652; 39.2% identity (68.8% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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CCDS86 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKN-KLSTIGFILTGLAISRIFLIW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
.:. :.:. .. ..:.. : . . ..: . :. . :.:: ::::::.:::.: . .::
CCDS86 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLY-LDESKTLYDKLS
::. : : :.. ..: .:::: .::. .: :: .: :.. :. :. :
CCDS86 WLKSRTN-MVLPFMI--VFLLI-SSLLNFAYIAKILNDYKTKNDTVWDLNMYKSEY---F
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSF
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CCDS86 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAVRLL
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CCDS86 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 WHLRNYTKTPNALPL
.:. : :
CCDS86 QQLKCCEKRKNLRVT
300
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 601 init1: 581 opt: 648 Z-score: 758.7 bits: 148.6 E(32554): 6.1e-36
Smith-Waterman score: 648; 38.3% identity (69.5% similar) in 311 aa overlap (8-309:8-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
.::::. ..: ...: : :: ::: : .:.... .:::.: ::. : :
CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
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CCDS58 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFD--SLVLEI-FIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDK
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CCDS58 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEYYL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVM
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CCDS58 IHVLGTLWYLP---PLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SFLFLFIVHFFSLQVAN-GIFFMLWNNKYIKFVMLALNAF-PSCHSFILILGNSKLRQTA
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CCDS58 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNF--LPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTF
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 VRLLW----HLRNYTKTPNALPL
: .: ::. .: :
CCDS58 VVMLRCESGHLKPGSKGPIFS
300 310
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 667 init1: 362 opt: 642 Z-score: 751.9 bits: 147.3 E(32554): 1.5e-35
Smith-Waterman score: 642; 37.7% identity (69.2% similar) in 305 aa overlap (1-299:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
: . :.::.:: .:::...::: .:.::: . ::..:. ..:.::: :.:. : .
CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
:.. ..... : .:: . ... .: ..:.:. :..:::..:::.::: : :::
CCDS86 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLL-IFDSLVLEIFI--DISLNII--DKSNLTLYLDESKTLY
::.:... :.: ..:. : . .. ::. : . : .. : : :.: .. :: :
CCDS86 WLKWKID-MVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPY
130 140 150 160 170
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pF1KE0 -DKLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMK
. : ::..: ...:: . : :...: :: :::...:: . :::: :::.: ::.:
CCDS86 FEPL----TLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 MVMSFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQT
. ::.:.:.....: . . ..: . ..: .: .: ::.:::. :.:::::
CCDS86 TMTSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQT
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 AVRLLWHLRNYTKTPNALPL
::.:
CCDS86 FVRMLTCRKIACMI
300
>>CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 (317 aa)
initn: 486 init1: 384 opt: 623 Z-score: 729.8 bits: 143.2 E(32554): 2.5e-34
Smith-Waterman score: 634; 38.1% identity (71.4% similar) in 315 aa overlap (1-307:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
:. . .:: .. :.::::. ::: ::.:::: . .:..:. :.: ::: :::: :. :.
CCDS86 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRIS-LV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE0 VILFDSFLVGLA-SHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLF
..: :. :.. :..: .. . . .: . ::...:::: :. :::.:::.: .:.:
CCDS86 WLIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LWLRWRMNGMI-VMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESK-TLYDK
:.:.::.. .. :.::. :.::.. .:. .: :. :.: . : : : :. : ...
CCDS86 LYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALI-NIHINASINGY-RRNKTCSSDSSNFTRFSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVM
: .: . . . ::::.: :. .:.:..:. .: .... . : :.::.::: ..: :.
CCDS86 LIVLTSTVFI--FIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHR-GVKSVI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SFLFLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALN-----AFPSCHSFILILGNSKLR
.:..:. . :::. .:. .:... .. .. :. :.::::: .:::::.:::
CCDS86 TFFLLYAI--FSLS----FFISVWTSERLEENLIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLR
240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 QTAVRLLWHLRNYTKTPNALPL
:... .: :: . :
CCDS86 QASLSVLLWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
290 300 310
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 597 init1: 289 opt: 598 Z-score: 701.1 bits: 137.9 E(32554): 9.9e-33
Smith-Waterman score: 598; 35.8% identity (68.1% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
: : : :: :: .. :.:. ..: ::.::: : .: ::. :: ::: ::.: .: :
CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
:.... . . : . ... .. :. .: . ::...:::: :::::..:::.: . .::
CCDS53 VLVLNWYATEL-NPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLYLDESKTLYDKLSI
:. :........:. :..:. .:... .: . ..:.: . ...: ::
CCDS53 HLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINM-NQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMY--LSN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 LKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSFL
:. :....::.: : :.:.:. :: .: ....: . ::.: : ..: .:.. : :::
CCDS53 T-TVTILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 FLFIVHFFSLQVANGIFFMLWNNKYIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLRQTAVRLLW
.: ..:.:. .. : : :. . : ..:: : :::: ::.::.:: . .::
CCDS53 LLCAIYFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLW
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 HLRNYTKTPNALPL
:.: ..:
CCDS53 HVRYWVKGEKPSSS
300
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CCDS53 RIKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINM--DETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYH--S
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:.: ..:
CCDS53 RHVRYWVKDRSLRLHRFTRGALCVF
300 310
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa)
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CCDS53 M-TVTMVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFL
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CCDS53 LLCAIYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFW
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310
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CCDS53 QMRYWVKGEKTSSP
300
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
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CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
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CCDS86 EILVSWFL---ALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSP
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CCDS86 AFLYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIK---DWLDRYERNTTWNFSMSDFET
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CCDS86 LLVAAKVWAKR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]