Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0765
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0765, 339 aa
1>>>pF1KE0765 339 - 339 aa - 339 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6631+/-0.00131; mu= 14.1804+/- 0.078
mean_var=176.8321+/-77.502, 0's: 0 Z-trim(102.3): 442 B-trim: 769 in 2/47
Lambda= 0.096448
statistics sampled from 6269 (6879) to 6269 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 2.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 2315 335.4 3.9e-92
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 983 150.1 2.5e-36
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 941 144.3 1.4e-34
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 920 141.3 1.1e-33
CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 351) 755 118.4 8.8e-27
CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 306) 712 112.3 5.2e-25
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 561 91.4 1.2e-18
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 450 76.0 5.3e-14
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 450 76.0 5.6e-14
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 403 69.6 5.6e-12
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 392 68.0 1.5e-11
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 379 66.1 5.2e-11
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 379 66.3 5.9e-11
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 377 65.9 6.5e-11
>>CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 (339 aa)
initn: 2315 init1: 2315 opt: 2315 Z-score: 1767.5 bits: 335.4 E(32554): 3.9e-92
Smith-Waterman score: 2315; 100.0% identity (100.0% similar) in 339 aa overlap (1-339:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHFKQLHTPTNW
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CCDS51 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHFKQLHTPTNW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASIFHLSFISID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASIFHLSFISID
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 RYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEIYYKHVHCRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 RYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEIYYKHVHCRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISDANQKLQIGLEMKNG
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CCDS51 GCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISDANQKLQIGLEMKNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLIWFGYLNSTFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 ISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLIWFGYLNSTFN
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE0 PMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
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CCDS51 PMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
310 320 330
>>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 (348 aa)
initn: 981 init1: 512 opt: 983 Z-score: 765.8 bits: 150.1 E(32554): 2.5e-36
Smith-Waterman score: 983; 42.8% identity (73.1% similar) in 334 aa overlap (4-336:13-343)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHF
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CCDS75 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KQLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASI
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CCDS75 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FHLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEI
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CCDS75 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YYKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLI-SDANQK
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CCDS75 VVA-LTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLL-FFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LQIGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLI
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CCDS75 QSSSESYKERVAK-RERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE0 WFGYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
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CCDS75 WCVYYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
300 310 320 330 340
>>CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 (345 aa)
initn: 932 init1: 506 opt: 941 Z-score: 734.2 bits: 144.3 E(32554): 1.4e-34
Smith-Waterman score: 941; 41.1% identity (71.2% similar) in 333 aa overlap (4-336:13-343)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHF
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CCDS51 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KQLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASI
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CCDS51 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FHLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEI
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CCDS51 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYS-GAVFYTGVYDDGLEE
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YYKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISDANQKL
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CCDS51 LSDALNCIGGCQTVVNQ-NWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 QIGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLIW
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CCDS51 ESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCW
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE0 FGYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
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CCDS51 CAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
300 310 320 330 340
>>CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 (342 aa)
initn: 887 init1: 481 opt: 920 Z-score: 718.4 bits: 141.3 E(32554): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 920; 39.3% identity (71.4% similar) in 336 aa overlap (1-336:9-342)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHFK
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CCDS51 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHFK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 QLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASIF
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CCDS51 QLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 HLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEIY
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CCDS51 HLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEELV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISDANQKLQ
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CCDS51 -SALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLL-FFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVE
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 IGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLIWF
. : . ..::::.::::... .:.: : :. . ..: :. .. : . .. :
CCDS51 SSSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE0 GYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
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CCDS51 AYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
300 310 320 330 340
>>CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (351 aa)
initn: 1065 init1: 610 opt: 755 Z-score: 594.3 bits: 118.4 E(32554): 8.8e-27
Smith-Waterman score: 1111; 50.6% identity (76.7% similar) in 322 aa overlap (5-324:25-335)
10 20 30 40
pF1KE0 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVG
: . : :: .:. : ::...::.:. :. :. :
CCDS34 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 NLIVIVSISHFKQLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHT
:: .:.:::.:::::::::.:: ::: .::::: .:::::.::.:.::::: .::::.
CCDS34 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 STDIMLSSASIFHLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIF
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CCDS34 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LELNFKGAEEIYYKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQ
: : : : : : ..: :.:.:. :. ::..:. :::.:. .: .:. .....
CCDS34 SEAYADGIEG-YDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKH
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE0 ARLISD--ANQKLQIGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLH
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CCDS34 AHAINNLRENQNNQV----------KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLN
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 YIIPPTLNDVLIWFGYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELS
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CCDS34 FSTPVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKE
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 S
CCDS34 SE
350
>>CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (306 aa)
initn: 1029 init1: 574 opt: 712 Z-score: 562.5 bits: 112.3 E(32554): 5.2e-25
Smith-Waterman score: 1068; 51.5% identity (77.7% similar) in 301 aa overlap (26-324:1-290)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHFKQLHTPTNW
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CCDS51 MYSFMAGSIFITIFGNLAMIISISYFKQLHTPTNF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASIFHLSFISID
:: ::: .::::: .:::::.::.:.::::: .::::. : :.::: .::::: ..::
CCDS51 LILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYYSFDLMLSITSIFHLCSVAID
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 RYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEIYYKHVHCRG
:.::.: :: :..:..: :: .... ::::..::::..: : : : : : : .
CCDS51 RFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVFSEAYADGIEG-YDILVACSS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE0 GCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISD--ANQKLQIGLEMK
.: :.:.:. :. ::..:. :::.:. .: .:. .....:. :.. ::. :.
CCDS51 SCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHAHAINNLRENQNNQV-----
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 NGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLIWFGYLNST
.:..::.::::::.::::.:: : :. ..::::.. : .: :.: ::::.:::
CCDS51 -----KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDALTWFGYFNST
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330
pF1KE0 FNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
::..:.:::::::.:::..:.::::
CCDS51 CNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
270 280 290 300
>>CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 (337 aa)
initn: 762 init1: 440 opt: 561 Z-score: 448.5 bits: 91.4 E(32554): 1.2e-18
Smith-Waterman score: 893; 39.8% identity (71.0% similar) in 334 aa overlap (4-336:16-337)
10 20 30 40
pF1KE0 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSI
::... : :: .. . .. .: . .: ..::..: ..
CCDS51 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQV-NGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 SHFKQLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSS
:.:: ::::::.:. :.: .:..:: ::.: : .::.: ::.::. .:..:: : ..
CCDS51 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ASIFHLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGA
.::::: ::::::. :.:::: : .:... : .:. .:.::: :. .:: . .
CCDS51 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPA--AYTSLFLYTDVVET
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 E-EIYYKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISDA
. . ... : :.:.....:. : :.: :..: ::. .: .:...: .::. :.
CCDS51 RLSQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNF-PLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 NQKLQIGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLND
...: : .. .::::.:::::..:..:.:: :: : :..: .::.: :: . :
CCDS51 SKSLA-------GAAK-HERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFD
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE0 VLIWFGYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
..:::.:.::. ::..:.: : :::::::. : :.:. .. :. :
CCDS51 IFIWFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
290 300 310 320 330
>>CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 (359 aa)
initn: 570 init1: 345 opt: 450 Z-score: 364.8 bits: 76.0 E(32554): 5.3e-14
Smith-Waterman score: 608; 32.3% identity (65.5% similar) in 316 aa overlap (19-333:14-317)
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pF1KE0 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHFKQLHTPTNW
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