Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0658
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0658, 389 aa
1>>>pF1KE0658 389 - 389 aa - 389 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4019+/-0.00075; mu= 16.5134+/- 0.045
mean_var=164.6532+/-63.158, 0's: 0 Z-trim(109.9): 222 B-trim: 1336 in 2/48
Lambda= 0.099951
statistics sampled from 10659 (11223) to 10659 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.345), width: 16
Scan time: 3.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2570.1 OXTR gene_id:5021|Hs108|chr3 ( 389) 2580 384.6 8.3e-107
CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 ( 418) 1249 192.7 5.2e-49
CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 371) 915 144.5 1.5e-34
CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 ( 424) 812 129.7 4.9e-30
CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 309) 756 121.4 1.1e-27
CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 371) 443 76.4 4.7e-14
CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 377) 443 76.4 4.8e-14
CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 390) 443 76.4 4.8e-14
>>CCDS2570.1 OXTR gene_id:5021|Hs108|chr3 (389 aa)
initn: 2580 init1: 2580 opt: 2580 Z-score: 2031.0 bits: 384.6 E(32554): 8.3e-107
Smith-Waterman score: 2580; 100.0% identity (100.0% similar) in 389 aa overlap (1-389:1-389)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGALAANWSAEAANASAAPPGAEGNRTAGPPRRNEALARVEVAVLCLILLLALSGNACV
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CCDS25 MEGALAANWSAEAANASAAPPGAEGNRTAGPPRRNEALARVEVAVLCLILLLALSGNACV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LLALRTTRQKHSRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRFYGPDLLCRLVKYLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LLALRTTRQKHSRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRFYGPDLLCRLVKYLQV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VGMFASTYLLLLMSLDRCLAICQPLRSLRRRTDRLAVLATWLGCLVASAPQVHIFSLREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VGMFASTYLLLLMSLDRCLAICQPLRSLRRRTDRLAVLATWLGCLVASAPQVHIFSLREV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ADGVFDCWAVFIQPWGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYGLISFKIWQNLRLKTAAAAA
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CCDS25 ADGVFDCWAVFIQPWGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYGLISFKIWQNLRLKTAAAAA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AEAPEGAAAGDGGRVALARVSSVKLISKAKIRTVKMTFIIVLAFIVCWTPFFFVQMWSVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 AEAPEGAAAGDGGRVALARVSSVKLISKAKIRTVKMTFIIVLAFIVCWTPFFFVQMWSVW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 DANAPKEASAFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFHELVQRFLCCSASYLKGRRLGET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DANAPKEASAFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFHELVQRFLCCSASYLKGRRLGET
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE0 SASKKSNSSSFVLSHRSSSQRSCSQPSTA
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SASKKSNSSSFVLSHRSSSQRSCSQPSTA
370 380
>>CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 (418 aa)
initn: 1060 init1: 504 opt: 1249 Z-score: 993.4 bits: 192.7 E(32554): 5.2e-49
Smith-Waterman score: 1249; 49.7% identity (75.5% similar) in 380 aa overlap (13-382:25-398)
10 20 30 40
pF1KE0 MEGALAANWSAEAANAS-AAPPGAEGNRTAGPPR--RNEALARVEVAV
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CCDS89 MRLSAGPDAGPSGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGN---GPPRDVRNEELAKLEIAV
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 LCLILLLALSGNACVLLALRTTRQKHSRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRF
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CCDS89 LAVTFAVAVLGNSSVLLALHRTPRKTSRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 YGPDLLCRLVKYLQVVGMFASTYLLLLMSLDRCLAICQPLRSLRR--RTDRLAVLATWLG
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CCDS89 RGPDWLCRVVKHLQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQPARRSRLMIAAAWVL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 CLVASAPQVHIFSLREVAD--GVFDCWAVFIQPWGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYG
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CCDS89 SFVLSTPQYFVFSMIEVNNVTKARDCWATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LISFKIWQNLRLKTAAAAAAEAPEGAAAGDGGRVALARVSSVKLISKAKIRTVKMTFIIV
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CCDS89 FICYNIWCNVRGKTASRQSKGAEQAGVAFQKGFLLAPCVSSVKSISRAKIRTVKMTFVIV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE0 LAFIVCWTPFFFVQMWSVWDANA---PKEASAFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFH
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CCDS89 TAYIVCWAPFFIIQMWSVWDPMSVWTESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFFSGHLLQ
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KE0 ELVQRFLCCSASYLKGRRLGETSASKKSNSSSFVLSHRSSSQRSCSQPSTA
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CCDS89 DCVQSFPCCQNMKEKFNKEDTDSMSRRQ---TFYSNNRSPTNSTGMWKDSPKSSKSIKFI
360 370 380 390 400 410
CCDS89 PVST
>>CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX (371 aa)
initn: 807 init1: 331 opt: 915 Z-score: 733.6 bits: 144.5 E(32554): 1.5e-34
Smith-Waterman score: 923; 42.3% identity (67.0% similar) in 388 aa overlap (13-379:4-371)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEGALAANWSAEAANASAAP-----PGAEGNRTAGPP--RRNEALARVEVAVLCLILLLA
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CCDS14 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LSGNACVLLAL-RTTRQKH-SRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRFYGPDLL
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CCDS14 ALSNGLVLAALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE0 CRLVKYLQVVGMFASTYLLLLMSLDRCLAICQPLRSLRRRT----DRLAVLATWLGCLVA
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CCDS14 CRAVKYLQMVGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNR-PVLVAWAFSLLL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SAPQVHIFSLREV--ADGVFDCWAVFIQPWGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYGLISF
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CCDS14 SLPQLFIFAQRNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KIWQNLRLKTAAAAAAEAPEGAAAGDGGRVALARVSSV---KLISKAKIRTVKMTFIIVL
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CCDS14 EIHASL-----VPGPSERP-------GGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVV
240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 AFIVCWTPFFFVQMWSVWDANAPKEASAFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFHELVQ
....::.:::.::.:..:: .:: :.. :...::::::::: ::::: :.. . :: .
CCDS14 VYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEAPLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSEL-R
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380
pF1KE0 RFLCCSASYLKGRR---LGETSASKKSNSSSFVLSHRSSSQRSCSQPSTA
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CCDS14 SLLCCA----RGRTPPSLGPQDESCTTASSS--LAKDTSS
340 350 360 370
>>CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 (424 aa)
initn: 1154 init1: 494 opt: 812 Z-score: 652.8 bits: 129.7 E(32554): 4.9e-30
Smith-Waterman score: 1224; 52.3% identity (75.5% similar) in 371 aa overlap (15-368:8-378)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEGALAANWSAEAANASAAPPGAEGNRTAGPPR--RNEALARVEVAVLCLILLLALSGNA
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CCDS73 MDSGPLWDANPTPRGTLSAPNATTPWLGRDEELAKVEIGVLATVLVLATGGNL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 CVLLALRTTRQKHSRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRFYGPDLLCRLVKYL
:::.: .:.::. .:. ::...::.::.::::::::::::.:: ::::::: ::::
CCDS73 AVLLTLGQLGRKRSRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGPDLLCRAVKYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 QVVGMFASTYLLLLMSLDRCLAICQPLRSLRR--RTDRLAVLATWLGCLVASAPQVHIFS
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CCDS73 QVLSMFASTYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQPGQSTYLLIAAPWLLAAIFSLPQVFIFS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LREV--ADGVFDCWAVFIQPWGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYGLISFKIWQNLRLK
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CCDS73 LREVIQGSGVLDCWADFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLICHEICKNLKVK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE0 TAAAAAA-------EAPEGAAAGDGGRVALARVSSVKLISKAKIRTVKMTFIIVLAFIVC
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CCDS73 TQAWRVGGGGWRTWDRPSPSTLAATTRGLPSRVSSINTISRAKIRTVKMTFVIVLAYIAC
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 WTPFFFVQMWSVWDANAPKEAS---AFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFHELVQRF
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CCDS73 WAPFFSVQMWSVWDKNAPDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYMGFNSHLLPRPLRHL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
pF1KE0 LCCSASYLKGRR-LGETSASKKSNSSSFVLSHRSSSQRSCSQPSTA
::.. . :: :.. : :.. ..
CCDS73 ACCGGPQPRMRRRLSDGSLSSRHTTLLTRSSCPATLSLSLSLTLSGRPRPEESPRDLELA
360 370 380 390 400 410
>>CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX (309 aa)
initn: 666 init1: 331 opt: 756 Z-score: 610.5 bits: 121.4 E(32554): 1.1e-27
Smith-Waterman score: 761; 42.2% identity (67.1% similar) in 313 aa overlap (13-307:4-303)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEGALAANWSAEAANASAAP-----PGAEGNRTAGPP--RRNEALARVEVAVLCLILLLA
:...::.: :. .: . : :. :::.:.:.: .... .
CCDS55 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LSGNACVLLAL-RTTRQKH-SRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRFYGPDLL
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CCDS55 ALSNGLVLAALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE0 CRLVKYLQVVGMFASTYLLLLMSLDRCLAICQPLRSLRRRT----DRLAVLATWLGCLVA
:: :::::.:::.::.:..: :.::: :::.:. . :. . .: ::..: :.
CCDS55 CRAVKYLQMVGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNR-PVLVAWAFSLLL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SAPQVHIFSLREV--ADGVFDCWAVFIQPWGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYGLISF
: ::. ::. :.: ..:: :::: : .::: ..:.:::.: :...:.. .::: ::
CCDS55 SLPQLFIFAQRNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 KIWQNLRLKTAAAAAAEAPEGAAAGDGGRVALARVSSV---KLISKAKIRTVKMTFIIVL
.: .: .: : . ::: :..: .: : .::.::..::.
CCDS55 EIHASL-----------VP-GPSERPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVV
240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 AFIVCWTPFFFVQMWSVWDANAPKEASAFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFHELVQ
....::.:::.::.:..:: .:: :
CCDS55 VYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEAPLEGGCSRG
280 290 300
>>CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (371 aa)
initn: 575 init1: 228 opt: 443 Z-score: 365.8 bits: 76.4 E(32554): 4.7e-14
Smith-Waterman score: 570; 32.0% identity (67.7% similar) in 300 aa overlap (42-336:52-337)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 EAANASAAPPGAEGNRTAGPPRRNEALARVEVAVLCLILLLALSGNACVLLALRTTRQKH
.. .: ....... ::. ::.. :.:.
CCDS54 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWR-RKKK
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 SRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRFYGPDLLCRLVKYLQVVGMFASTYLLL
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CCDS54 SRMTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDFTAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYVLV
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 LMSLDRCLAICQPLRSLR-RRTDRLAVLATWLGCLVASAPQVHIFSLREVADGVFDCWAV
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CCDS54 SLSIDRYHAIVYPMKFLQGEKQARVLIVIAWSLSFLFSIPTLIIFGKRTLSNGEVQCWAL
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240
pF1KE0 FIQP--WGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYGLISFKIWQNLRLKTAAAAAAEAPEGAA
. . : : :.: ... ::..:. ... ::.. :: .. :: .. .. .:
CCDS54 WPDDSYWTP--YMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIVIRTIW--IKSKTYETVISNCSDGKL
210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AGDGGRVALARVSSVKLISKAKIRTVKMTFIIVLAFIVCWTPFFFVQMWSVWD--ANAPK
.. .: :::::::...:...::.:::: ::.:.:. .. . .. .. .
CCDS54 CSSYNR---------GLISKAKIKAIKYSIIIILAFICCWSPYFLFDILDNFNLLPDTQE
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EASAFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFHELVQRFLCCSASYLKGRRLGETSASKKS
. : .:.. : .::: :: :: .:.. .
CCDS54 RFYASVIIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCREQRSQDSRMTFRERTERHEMQILSK
310 320 330 340 350 360
>>CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (377 aa)
initn: 575 init1: 228 opt: 443 Z-score: 365.7 bits: 76.4 E(32554): 4.8e-14
Smith-Waterman score: 570; 32.0% identity (67.7% similar) in 300 aa overlap (42-336:52-337)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 EAANASAAPPGAEGNRTAGPPRRNEALARVEVAVLCLILLLALSGNACVLLALRTTRQKH
.. .: ....... ::. ::.. :.:.
CCDS54 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWR-RKKK
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 SRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRFYGPDLLCRLVKYLQVVGMFASTYLLL
::. ::. .:.:.: ... ..: .. : .: : .:::.::.:.::::: ..::::.:.
CCDS54 SRMTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDFTAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYVLV
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 LMSLDRCLAICQPLRSLR-RRTDRLAVLATWLGCLVASAPQVHIFSLREVADGVFDCWAV
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CCDS54 SLSIDRYHAIVYPMKFLQGEKQARVLIVIAWSLSFLFSIPTLIIFGKRTLSNGEVQCWAL
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240
pF1KE0 FIQP--WGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYGLISFKIWQNLRLKTAAAAAAEAPEGAA
. . : : :.: ... ::..:. ... ::.. :: .. :: .. .. .:
CCDS54 WPDDSYWTP--YMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIVIRTIW--IKSKTYETVISNCSDGKL
210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 AGDGGRVALARVSSVKLISKAKIRTVKMTFIIVLAFIVCWTPFFFVQMWSVWD--ANAPK
.. .: :::::::...:...::.:::: ::.:.:. .. . .. .. .
CCDS54 CSSYNR---------GLISKAKIKAIKYSIIIILAFICCWSPYFLFDILDNFNLLPDTQE
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EASAFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFHELVQRFLCCSASYLKGRRLGETSASKKS
. : .:.. : .::: :: :: .:.. .
CCDS54 RFYASVIIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCRVIRLRQLQEAALMLCPQRENWKGTW
310 320 330 340 350 360
>>CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (390 aa)
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