Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0602
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0602, 358 aa
1>>>pF1KE0602 358 - 358 aa - 358 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7888+/-0.00121; mu= 3.3033+/- 0.069
mean_var=243.8483+/-56.991, 0's: 0 Z-trim(107.6): 686 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.082132
statistics sampled from 8888 (9681) to 8888 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 2464 305.7 4e-83
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 1834 230.9 9.9e-61
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 1534 195.4 5.4e-50
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 1260 163.2 4.3e-40
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 1260 163.3 4.7e-40
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 1038 136.9 3.4e-32
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 1038 137.0 4e-32
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 976 129.9 8.9e-30
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 976 129.9 9.3e-30
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 794 107.7 1.3e-23
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 766 104.4 1.3e-22
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 762 103.9 1.8e-22
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 761 103.8 1.9e-22
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 700 97.0 4.7e-20
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 695 96.1 4.9e-20
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 689 95.6 1.1e-19
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 689 95.7 1.2e-19
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 689 95.7 1.2e-19
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 673 93.5 3e-19
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 665 92.7 7.4e-19
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 665 92.7 7.4e-19
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 654 91.4 1.8e-18
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 654 91.4 1.8e-18
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 654 91.5 1.9e-18
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 651 91.0 2.2e-18
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 651 91.0 2.3e-18
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 638 89.5 7e-18
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 612 86.3 4.6e-17
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 592 84.0 2.6e-16
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 592 84.0 2.7e-16
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 592 84.0 2.8e-16
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 575 82.0 1.1e-15
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 567 81.0 1.9e-15
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 567 81.0 2e-15
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 566 80.8 2e-15
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 563 80.4 2.5e-15
CCDS9971.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 419) 563 80.5 2.8e-15
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 561 80.2 3.1e-15
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 556 79.6 4.5e-15
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 554 79.4 5.3e-15
CCDS81854.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 418) 554 79.5 5.9e-15
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 550 78.9 7e-15
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 556 80.0 7.2e-15
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 556 80.0 7.4e-15
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 550 78.9 7.5e-15
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 556 80.0 7.5e-15
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 551 79.4 1.1e-14
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 551 79.4 1.1e-14
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 551 79.4 1.1e-14
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 551 79.4 1.1e-14
>>CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 (358 aa)
initn: 2464 init1: 2464 opt: 2464 Z-score: 1605.9 bits: 305.7 E(32554): 4e-83
Smith-Waterman score: 2464; 99.7% identity (100.0% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE0 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQLTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI
310 320 330 340 350
>>CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 (276 aa)
initn: 1834 init1: 1834 opt: 1834 Z-score: 1203.8 bits: 230.9 E(32554): 9.9e-61
Smith-Waterman score: 1834; 100.0% identity (100.0% similar) in 267 aa overlap (1-267:1-267)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGRVPIASRTE
250 260 270
>>CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 (315 aa)
initn: 1514 init1: 849 opt: 1534 Z-score: 1011.0 bits: 195.4 E(32554): 5.4e-50
Smith-Waterman score: 1534; 70.5% identity (88.7% similar) in 302 aa overlap (2-303:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
::::::..: :::::::::::::. .::.::.:::.:::::::.:::::::::::::::
CCDS33 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
:::::::.:::::::..::::::::::.:.::.: :: . ..::. ::::::.::::
CCDS33 HPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
:::::::.:::::::::...::.::::::..: :.: :::::::::::.::::::::::
CCDS33 HNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
: ::.:::::::::::.: ::::::::::::::: .::: ::::::..:..: .: :..
CCDS33 GSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGIS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
::.::::: :: :: .. ::...::::.:.: .:::: :::. ::....: . :
CCDS33 IPEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDSFQEAQIKRKA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE0 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI
.:.
CCDS33 RNEGRNRRRQQVLPLKS
300 310
>>CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 (493 aa)
initn: 1255 init1: 1255 opt: 1260 Z-score: 833.3 bits: 163.2 E(32554): 4.3e-40
Smith-Waterman score: 1260; 55.7% identity (81.9% similar) in 309 aa overlap (2-310:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
:::::..: .::::::.:.::::.:::.::::::::::.:: ..::::.:::..::::.
CCDS35 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
: :::::::: ..:.: .::::. :::.: .:. . :. ..:.. .: .....:::.
CCDS35 HENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
:: ::::.::::::... .:.::::::::: :..:.. :::::::::::.:::::::..:
CCDS35 HNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
: ::::::::. .:.. : ::.:: ::.:::: : ::.::::::..:. : :.::.
CCDS35 GKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
.:. .. :::: ..:..: .. : : :::.:: .: : .:::: .:. : ...:
CCDS35 LPEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE0 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI
. ..: :
CCDS35 LQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 (570 aa)
initn: 1255 init1: 1255 opt: 1260 Z-score: 832.6 bits: 163.3 E(32554): 4.7e-40
Smith-Waterman score: 1260; 55.7% identity (81.9% similar) in 309 aa overlap (2-310:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
:::::..: .::::::.:.::::.:::.::::::::::.:: ..::::.:::..::::.
CCDS82 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
: :::::::: ..:.: .::::. :::.: .:. . :. ..:.. .: .....:::.
CCDS82 HENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
:: ::::.::::::... .:.::::::::: :..:.. :::::::::::.:::::::..:
CCDS82 HNIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
: ::::::::. .:.. : ::.:: ::.:::: : ::.::::::..:. : :.::.
CCDS82 GKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
.:. .. :::: ..:..: .. : : :::.:: .: : .:::: .:. : ...:
CCDS82 LPEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE0 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI
. ..: :
CCDS82 LQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGS
300 310 320 330 340 350
>>CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (455 aa)
initn: 871 init1: 871 opt: 1038 Z-score: 691.5 bits: 136.9 E(32554): 3.4e-32
Smith-Waterman score: 1038; 49.2% identity (78.6% similar) in 299 aa overlap (2-300:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
:: :: .::.::::::.:.::....:::::::: : : .. : .:::.:::..:::..
CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSV-NKIAMREIKFLKQFH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
: :::::.::::.:...:::::. ::::: ::..: .:. . ... .: :.:... :.
CCDS47 HENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
.: ::::.::::::... .. ::::::::: :..:.: :::::::::::.:::.. ::.:
CCDS47 NNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
: :::.::.::.. :. .: : :..::.: :. : .:.: :. :..:: . :.::
CCDS47 GKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
.:. . . . :.:... ....::..::..:.. .:::: :: :: . :
CCDS47 LPQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE0 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI
CCDS47 LKAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKV
300 310 320 330 340 350
>>CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (592 aa)
initn: 871 init1: 871 opt: 1038 Z-score: 690.2 bits: 137.0 E(32554): 4e-32
Smith-Waterman score: 1038; 49.2% identity (78.6% similar) in 299 aa overlap (2-300:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
:: :: .::.::::::.:.::....:::::::: : : .. : .:::.:::..:::..
CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSV-NKIAMREIKFLKQFH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
: :::::.::::.:...:::::. ::::: ::..: .:. . ... .: :.:... :.
CCDS47 HENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
.: ::::.::::::... .. ::::::::: :..:.: :::::::::::.:::.. ::.:
CCDS47 NNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
: :::.::.::.. :. .: : :..::.: :. : .:.: :. :..:: . :.::
CCDS47 GKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE
.:. . . . :.:... ....::..::..:.. .:::: :: :: . :
CCDS47 LPQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE0 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI
CCDS47 LKAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKV
300 310 320 330 340 350
>>CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (960 aa)
initn: 846 init1: 745 opt: 976 Z-score: 648.1 bits: 129.9 E(32554): 8.9e-30
Smith-Waterman score: 988; 43.0% identity (75.1% similar) in 358 aa overlap (1-356:9-354)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALRE
.:.:.: .: .:::.::::.:::...: .::::::: .::.. .:. .:::
CCDS83 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 IRMLKQLKHPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTL
..::. ::. :.:.: :.:::. .:.::::: ....:. :... ::: . ::: .: .
CCDS83 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 QAVNFCHKHNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLT-GPSDYYTDYVATRWYRSP
.:...:::.. .:::.::::.::....:.::::::::: :. : . ::.::::::::::
CCDS83 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ELLVGDTQYGPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFS
:::.: . :: ::.:..::...:: .: ::.::.:..:::. :.:.:: : .....:
CCDS83 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TNQYFSGVKIPDPEDMEPLELKFPNISYPAL-GLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFEN
.: : :...: . . :: .. .: .: :.:. :..::..: :: :.:: :..
CCDS83 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IREIEDLAKEHNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTKK
: .. .:.:.. :: .: .:.: :. :. :. : . ... : ..
CCDS83 QRLLD------RSPSRSAKRK--PYH--VESSTLSNRNQAGKSTALQS-HHRSNSKDIQN
300 310 320 330 340
pF1KE0 LNYRFPNI
:. .:
CCDS83 LSVGLPRADEGLPANESFLNGNLAGASLSPLHTKTYQASSQPGSTSKDLTNNNIPHLLSP
350 360 370 380 390 400
>>CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030 aa)
initn: 846 init1: 745 opt: 976 Z-score: 647.8 bits: 129.9 E(32554): 9.3e-30
Smith-Waterman score: 988; 43.0% identity (75.1% similar) in 358 aa overlap (1-356:9-354)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALRE
.:.:.: .: .:::.::::.:::...: .::::::: .::.. .:. .:::
CCDS14 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 IRMLKQLKHPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTL
..::. ::. :.:.: :.:::. .:.::::: ....:. :... ::: . ::: .: .
CCDS14 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 QAVNFCHKHNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLT-GPSDYYTDYVATRWYRSP
.:...:::.. .:::.::::.::....:.::::::::: :. : . ::.::::::::::
CCDS14 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ELLVGDTQYGPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFS
:::.: . :: ::.:..::...:: .: ::.::.:..:::. :.:.:: : .....:
CCDS14 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TNQYFSGVKIPDPEDMEPLELKFPNISYPAL-GLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFEN
.: : :...: . . :: .. .: .: :.:. :..::..: :: :.:: :..
CCDS14 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 IREIEDLAKEHNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTKK
: .. .:.:.. :: .: .:.: :. :. :. : . ... : ..
CCDS14 QRLLD------RSPSRSAKRK--PYH--VESSTLSNRNQAGKSTALQS-HHRSNSKDIQN
300 310 320 330 340
pF1KE0 LNYRFPNI
:. .:
CCDS14 LSVGLPRADEGLPANESFLNGNLAGASLSPLHTKTYQASSQPGSTSKDLTNNNIPHLLSP
350 360 370 380 390 400
>>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 (305 aa)
initn: 785 init1: 446 opt: 794 Z-score: 537.3 bits: 107.7 E(32554): 1.3e-23
Smith-Waterman score: 794; 44.3% identity (68.8% similar) in 298 aa overlap (2-288:1-286)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKF---LESEDDPVIKKIALREIRMLK
:. ..:. :::::.::::.: .::.:::.::.::. :: : : . :.::: .::
CCDS11 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVP---STAIREISLLK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 QLKHPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRG-VPEHLVKSITWQTLQAVN
.:::::.: ::.: . .:.:.::::. .. . . .: . .: ::.:: .: ::.:.
CCDS11 ELKHPNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 FCHKHNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVG
:::.: ::::.::.:.::.. ..::: :::.:: . : :: :.: :::.::.:.:
CCDS11 FCHSHRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DTQYGPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYF
. : ::.:.:::.:::... :.:: :..:::. : . :: : ... .
CCDS11 SKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLG--TP-------SEDTW
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE0 SGV-KIPDPEDMEP------LELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFE
:: ..:: . : :: ::. . :: :..::.::.: . : ::::
CCDS11 PGVTQLPDYKGSFPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFS
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 NIREIEDLAKEHNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTK
CCDS11 SPEPSPAARQYVLQRFRH
290 300
358 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 14:26:51 2016 done: Sun Nov 6 14:26:51 2016
Total Scan time: 2.580 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]