Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0600
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0600, 5300 aa
1>>>pF1KE0600 5300 - 5300 aa - 5300 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6801+/-0.00179; mu= 5.8352+/- 0.107
mean_var=339.9590+/-69.962, 0's: 0 Z-trim(105.5): 174 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.069560
statistics sampled from 8323 (8469) to 8323 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 15.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS435.1 MACF1 gene_id:23499|Hs108|chr1 (5430) 15195 1542.6 0
CCDS47443.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (5171) 8379 858.6 0
CCDS75474.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (5537) 8379 858.6 0
CCDS4959.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (2649) 3289 347.5 1.1e-93
CCDS47936.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4515) 2812 299.9 4.2e-79
CCDS43771.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4525) 2812 299.9 4.2e-79
CCDS43770.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4533) 2812 299.9 4.2e-79
CCDS43773.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4547) 2812 299.9 4.2e-79
CCDS43775.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4547) 2812 299.9 4.2e-79
CCDS43774.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4551) 2812 299.9 4.2e-79
CCDS43769.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4574) 2812 299.9 4.2e-79
CCDS43772.1 PLEC gene_id:5339|Hs108|chr8 (4684) 2812 299.9 4.3e-79
CCDS4501.1 DSP gene_id:1832|Hs108|chr6 (2871) 1235 141.5 1.3e-31
CCDS47368.1 DSP gene_id:1832|Hs108|chr6 (2272) 1120 129.8 3.3e-28
CCDS32100.1 SPTB gene_id:6710|Hs108|chr14 (2137) 869 104.6 1.2e-20
CCDS32099.1 SPTB gene_id:6710|Hs108|chr14 (2328) 869 104.6 1.3e-20
CCDS55395.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (3681) 873 105.2 1.3e-20
CCDS14233.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (3685) 864 104.3 2.5e-20
CCDS8150.1 SPTBN2 gene_id:6712|Hs108|chr11 (2390) 853 103.0 3.9e-20
CCDS33198.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2 (2364) 843 102.0 7.8e-20
CCDS33199.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2 (2155) 832 100.9 1.6e-19
CCDS12559.1 SPTBN4 gene_id:57731|Hs108|chr19 (2564) 830 100.8 2.1e-19
CCDS34547.1 UTRN gene_id:7402|Hs108|chr6 (3433) 810 98.9 1e-18
CCDS76439.1 ACTN3 gene_id:89|Hs108|chr11 ( 944) 754 92.8 1.9e-17
CCDS5236.2 SYNE1 gene_id:23345|Hs108|chr6 (8797) 774 95.6 2.5e-17
CCDS1613.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1 ( 894) 742 91.5 4.3e-17
CCDS60455.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1 ( 894) 724 89.7 1.5e-16
CCDS12518.1 ACTN4 gene_id:81|Hs108|chr19 ( 911) 724 89.7 1.5e-16
CCDS45129.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 887) 693 86.6 1.3e-15
CCDS9792.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 892) 693 86.6 1.3e-15
CCDS45130.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14 ( 914) 693 86.6 1.3e-15
CCDS5235.1 SYNE1 gene_id:23345|Hs108|chr6 (8749) 695 87.7 6.1e-15
CCDS61599.1 SPTBN5 gene_id:51332|Hs108|chr15 (3674) 641 81.9 1.4e-13
CCDS41963.1 SYNE2 gene_id:23224|Hs108|chr14 (6885) 632 81.3 4.1e-13
CCDS9761.2 SYNE2 gene_id:23224|Hs108|chr14 (6907) 632 81.3 4.1e-13
CCDS48036.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9 (2477) 596 77.3 2.3e-12
CCDS10526.1 PPL gene_id:5493|Hs108|chr16 (1756) 584 75.9 4.2e-12
>>CCDS435.1 MACF1 gene_id:23499|Hs108|chr1 (5430 aa)
initn: 27577 init1: 15110 opt: 15195 Z-score: 8248.7 bits: 1542.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 33284; 97.6% identity (97.6% similar) in 5332 aa overlap (1-5202:1-5332)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSSSDEETLSERSCRSERSCRSERSYRSERSGSLSPCPPGDTLPWNLPLHEQKKRKSQDS
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CCDS43 MSSSDEETLSERSCRSERSCRSERSYRSERSGSLSPCPPGDTLPWNLPLHEQKKRKSQDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VLDPAERAVVRVADERDRVQKKTFTKWVNKHLMKVRKHINDLYEDLRDGHNLISLLEVLS
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CCDS43 VLDPAERAVVRVADERDRVQKKTFTKWVNKHLMKVRKHINDLYEDLRDGHNLISLLEVLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GIKLPREKGRMRFHRLQNVQIALDFLKQRQVKLVNIRNDDITDGNPKLTLGLIWTIILHF
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CCDS43 GIKLPREKGRMRFHRLQNVQIALDFLKQRQVKLVNIRNDDITDGNPKLTLGLIWTIILHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 QISDIYISGESGDMSAKEKLLLWTQKVTAGYTGIKCTNFSSCWSDGKMFNALIHRYRPDL
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CCDS43 QISDIYISGESGDMSAKEKLLLWTQKVTAGYTGIKCTNFSSCWSDGKMFNALIHRYRPDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VDMERVQIQSNRENLEQAFEVAERLGVTRLLDAEDVDVPSPDEKSVITYVSSIYDAFPKV
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CCDS43 VDMERVQIQSNRENLEQAFEVAERLGVTRLLDAEDVDVPSPDEKSVITYVSSIYDAFPKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PEGGEGISATEVDSRWQEYQSRVDSLIPWIKQHTILMSDKTFPQNPVELKALYNQYIHFK
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CCDS43 PEGGEGISATEVDSRWQEYQSRVDSLIPWIKQHTILMSDKTFPQNPVELKALYNQYIHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 ETEILAKEREKGRIEELYKLLEVWIEFGRIKLPQGYHPNDVEEEWGKLIIEMLEREKSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ETEILAKEREKGRIEELYKLLEVWIEFGRIKLPQGYHPNDVEEEWGKLIIEMLEREKSLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 PAVERLELLLQIANKIQNGALNCEEKLTLAKNTLQADAAHLESGQPVQCESDVIMYIQEC
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CCDS43 PAVERLELLLQIANKIQNGALNCEEKLTLAKNTLQADAAHLESGQPVQCESDVIMYIQEC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 EGLIRQLQVDLQILRDENYYQLEELAFRVMRLQDELVTLRLECTNLYRKGHFTSLELVPP
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CCDS43 EGLIRQLQVDLQILRDENYYQLEELAFRVMRLQDELVTLRLECTNLYRKGHFTSLELVPP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 STLTTTHLKAEPLTKATHSSSTSWFRKPMTRAELVAISSSEDEGNLRFVYELLSWVEEMQ
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CCDS43 STLTTTHLKAEPLTKATHSSSTSWFRKPMTRAELVAISSSEDEGNLRFVYELLSWVEEMQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 MKLERAEWGNDLPSVELQLETQQHIHTSVEELGSSVKEARLYEGKMSQNFHTSYAETLGK
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CCDS43 MKLERAEWGNDLPSVELQLETQQHIHTSVEELGSSVKEARLYEGKMSQNFHTSYAETLGK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 LETQYCKLKETSSFRMRHLQSLHKFVSRATAELIWLNEKEEEELAYDWSDNNSNISAKRN
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CCDS43 LETQYCKLKETSSFRMRHLQSLHKFVSRATAELIWLNEKEEEELAYDWSDNNSNISAKRN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 YFSELTMELEEKQDVFRSLQDTAELLSLENHPAKQTVEAYSAAVQSQLQWMKQLCLCVEQ
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CCDS43 YFSELTMELEEKQDVFRSLQDTAELLSLENHPAKQTVEAYSAAVQSQLQWMKQLCLCVEQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 HVKENTAYFQFFSDARELESFLRNLQDSIKRKYSCDHNTSLSRLEDLLQDSMDEKEQLIQ
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CCDS43 HVKENTAYFQFFSDARELESFLRNLQDSIKRKYSCDHNTSLSRLEDLLQDSMDEKEQLIQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 SKSSVASLVGRSKTIVQLKPRSPDHVLKNTISVKAVCDYRQIEITICKNDECVLEDNSQR
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CCDS43 SKSSVASLVGRSKTIVQLKPRSPDHVLKNTISVKAVCDYRQIEITICKNDECVLEDNSQR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 TKWKVISPTGNEAMVPSVCFLIPPPNKDAIEMASRVEQSYQKVMALWHQLHVNTKSLISW
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CCDS43 TKWKVISPTGNEAMVPSVCFLIPPPNKDAIEMASRVEQSYQKVMALWHQLHVNTKSLISW
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 NYLRKDLDLVQTWNLEKLRSSAPGECHQIMKNLQAHYEDFLQDSRDSVLFSVADRLRLEE
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CCDS43 NYLRKDLDLVQTWNLEKLRSSAPGECHQIMKNLQAHYEDFLQDSRDSVLFSVADRLRLEE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 EVEACKARFQHLMKSMENEDKEETVAKMYISELKNIRLRLEEYEQRVVKRIQSLASSRTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EVEACKARFQHLMKSMENEDKEETVAKMYISELKNIRLRLEEYEQRVVKRIQSLASSRTD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE0 RDAWQDNALRIAEQEHTQEDLQQLRSDLDAVSMKCDSFLHQSPSSSSVPTLRSELNLLVE
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CCDS43 RDAWQDNALRIAEQEHTQEDLQQLRSDLDAVSMKCDSFLHQSPSSSSVPTLRSELNLLVE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE0 KMDHVYGLSTVYLNKLKTVDVIVRSIQDAELLVKGYEIKLSQEEVVLADLSALEAHWSTL
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CCDS43 KMDHVYGLSTVYLNKLKTVDVIVRSIQDAELLVKGYEIKLSQEEVVLADLSALEAHWSTL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE0 RHWLSDVKDKNSVFSVLDEEIAKAKVVAEQMSRLTPERNLDLERYQEKGSQLQERWHRVI
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CCDS43 RHWLSDVKDKNSVFSVLDEEIAKAKVVAEQMSRLTPERNLDLERYQEKGSQLQERWHRVI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE0 AQLEIRQSELESIQEVLGDYRACHGTLIKWIEETTAQQEMMKPGQAEDSRVLSEQLSQQT
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CCDS43 AQLEIRQSELESIQEVLGDYRACHGTLIKWIEETTAQQEMMKPGQAEDSRVLSEQLSQQT
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE0 ALFAEIERNQTKLDQCQKFSQQYSTIVKDYELQLMTYKAFVESQQKSPGKRRRMLSSSDA
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CCDS43 ALFAEIERNQTKLDQCQKFSQQYSTIVKDYELQLMTYKAFVESQQKSPGKRRRMLSSSDA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE0 ITQEFMDLRTRYTALVTLTTQHVKYISDALRRLEEEEKVVEEEKQEHVEKVKELLGWVST
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CCDS43 ITQEFMDLRTRYTALVTLTTQHVKYISDALRRLEEEEKVVEEEKQEHVEKVKELLGWVST
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE0 LARNTQGKATSSETKESTDIEKAILEQQVLSEELTTKKEQVSEAIKTSQIFLAKHGHKLS
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CCDS43 LARNTQGKATSSETKESTDIEKAILEQQVLSEELTTKKEQVSEAIKTSQIFLAKHGHKLS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE0 EKEKKQISEQLNALNKAYHDLCDGSANQLQQLQSQLAHQTEQKTLQKQQNTCHQQLEDLC
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CCDS43 EKEKKQISEQLNALNKAYHDLCDGSANQLQQLQSQLAHQTEQKTLQKQQNTCHQQLEDLC
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE0 SWVGQAERALAGHQGRTTQQDLSALQKNQSDLKDLQDDIQNRATSFATVVKDIEGFMEEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SWVGQAERALAGHQGRTTQQDLSALQKNQSDLKDLQDDIQNRATSFATVVKDIEGFMEEN
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE0 QTKLSPRELTALREKLHQAKEQYEALQEETRVAQKELEEAVTSALQQETEKSKAAKELAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QTKLSPRELTALREKLHQAKEQYEALQEETRVAQKELEEAVTSALQQETEKSKAAKELAE
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE0 NKKKIDALLDWVTSVGSSGGQLLTNLPGMEQLSGASLEKGALDTTDGYMGVNQAPEKLDK
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CCDS43 NKKKIDALLDWVTSVGSSGGQLLTNLPGMEQLSGASLEKGALDTTDGYMGVNQAPEKLDK
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE0 QCEMMKARHQELLSQQQNFILATQSAQAFLDQHGHNLTPEEQQMLQQKLGELKEQYSTSL
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CCDS43 QCEMMKARHQELLSQQQNFILATQSAQAFLDQHGHNLTPEEQQMLQQKLGELKEQYSTSL
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE0 AQSEAELKQVQTLQDELQKFLQDHKEFESWLERSEKELENMHKGGSSPETLPSLLKRQGS
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CCDS43 AQSEAELKQVQTLQDELQKFLQDHKEFESWLERSEKELENMHKGGSSPETLPSLLKRQGS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE0 FSEDVISHKGDLRFVTISGQKVLDMENSFKEGKEPSEIGNLVKDKLKDATERYTALHSKC
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CCDS43 FSEDVISHKGDLRFVTISGQKVLDMENSFKEGKEPSEIGNLVKDKLKDATERYTALHSKC
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE0 TRLGSHLNMLLGQYHQFQNSADSLQAWMQACEANVEKLLSDTVASDPGVLQEQLATTKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TRLGSHLNMLLGQYHQFQNSADSLQAWMQACEANVEKLLSDTVASDPGVLQEQLATTKQL
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE0 QEELAEHQVPVEKLQKVARDIMEIEGEPAPDHRHVQETTDSILSHFQSLSYSLAERSSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QEELAEHQVPVEKLQKVARDIMEIEGEPAPDHRHVQETTDSILSHFQSLSYSLAERSSLL
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE0 QKAIAQSQSVQESLESLLQSIGEVEQNLEGKQVSSLSSGVIQEALATNMKLKQDIARQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QKAIAQSQSVQESLESLLQSIGEVEQNLEGKQVSSLSSGVIQEALATNMKLKQDIARQKS
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE0 SLEATREMVTRFMETADSTTAAVLQGKLAEVSQRFEQLCLQQQEKESSLKKLLPQAEMFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLEATREMVTRFMETADSTTAAVLQGKLAEVSQRFEQLCLQQQEKESSLKKLLPQAEMFE
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE0 HLSGKLQQFMENKSRMLASGNQPDQDITHFFQQIQELNLEMEDQQENLDTLEHLVTELSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HLSGKLQQFMENKSRMLASGNQPDQDITHFFQQIQELNLEMEDQQENLDTLEHLVTELSS
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE0 CGFALDLCQHQDRVQNLRKDFTELQKTVKEREKDASSCQEQLDEFRKLVRTFQKWLKETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CGFALDLCQHQDRVQNLRKDFTELQKTVKEREKDASSCQEQLDEFRKLVRTFQKWLKETE
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE0 GSIPPTETSMSAKELEKQIEHLKSLLDDWASKGTLVEEINCKGTSLENLIMEITAPDSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSIPPTETSMSAKELEKQIEHLKSLLDDWASKGTLVEEINCKGTSLENLIMEITAPDSQG
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370
pF1KE0 KT---------------------DLTEIQCDMSDVNLKYEKLGGVLHERQESLQAILNRM
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KTGSILPSVGSSVGSVNGYHTCKDLTEIQCDMSDVNLKYEKLGGVLHERQESLQAILNRM
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2380 2390 2400 2410 2420 2430
pF1KE0 EEVHKEANSVLQWLESKEEVLKSMDAMSSPTKTETVKAQAESNKAFLAELEQNSPKIQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EEVHKEANSVLQWLESKEEVLKSMDAMSSPTKTETVKAQAESNKAFLAELEQNSPKIQKV
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2440 2450 2460 2470 2480 2490
pF1KE0 KEALAGLLVTYPNSQEAENWKKIQEELNSRWERATEVTVARQRQLEESASHLACFQAAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KEALAGLLVTYPNSQEAENWKKIQEELNSRWERATEVTVARQRQLEESASHLACFQAAES
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2500 2510 2520 2530 2540 2550
pF1KE0 QLRPWLMEKELMMGVLGPLSIDPNMLNAQKQQVQFMLKEFEARRQQHEQLNEAAQGILTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLRPWLMEKELMMGVLGPLSIDPNMLNAQKQQVQFMLKEFEARRQQHEQLNEAAQGILTG
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pF1KE0 PGDVSLSTSQVQKELQSINQKWVELTDKLNSRSSQIDQAIVKSTQYQELLQDLSEKVRAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PGDVSLSTSQVQKELQSINQKWVELTDKLNSRSSQIDQAIVKSTQYQELLQDLSEKVRAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GQRLSVQSAISTQPEAVKQQLEETSEIRSDLEQLDHEVKEAQTLCDELSVLIGEQYLKDE
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pF1KE0 LKKRLETVALPLQGLEDLAADRINRLQAALASTQQFQQMFDELRTWLDDKQSQQAKNCPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LKKRLETVALPLQGLEDLAADRINRLQAALASTQQFQQMFDELRTWLDDKQSQQAKNCPI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SAKLERLQSQLQENEEFQKSLNQHSGSYEVIVAEGESLLLSVPPGEEKRTLQNQLVELKN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HWEELSKKTADRQSRLKDCMQKAQKYQWHVEDLVPWIEDCKAKMSELRVTLDPVQLESSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE0 DCDVQGLEHDMEEINARWNTLNKKVAQRIAQLQEALLHCGKFQDALEPLLSWLADTEELI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ESLESRWTELLSKAAARQKQLEDILVLAKQFHETAEPISDFLSVTEKKLANSEPVGTQTA
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CCDS43 AADAELAWVAETKRKLMALGPIRLEQDQTTAQLQVQKAFSIDIIRHKDSMDELFSHRSEI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LIPAEVDKIRECISDNKSATVELEKLQPSFEALKRRGEELIGRSQGADKDLAAKEIQDKL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:.:. .:::: : :... :: :::.:.:: .:.::: : .::: ..:. :: .:.:
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:...:: ::...: ::.. . : . :: . : :
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CCDS47 SSSMTSGLSSGMTSRLTPSVTPAYTPGFPSGLVPNFSSGVEPNSLQTLKLMQIRKPLLKS
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CCDS47 ESSLKEAKISEIQMTAPLKLTYAEKLHRLESQYAKLLNTSRNQERHLDTLHNFVSRATNE
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CCDS47 LIWLNEKEEEEVAYDWSERNTNIARKKDYHAELMRELDQKEENIKSVQEIAEQLLLENHP
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CCDS47 IKAICDYRQIEITIYKDDECVLANNSHRAKWKVISPTGNEAMVPSVCFTVPPPNKEAVDL
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CCDS47 ANRIEQQYQNVLTLWHESHINMKSVVSWHYLINEIDRIRASNVASIKTMLPGEHQQVLSN
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CCDS47 LQSRFEDFLEDSQESQVFSGSDITQLEKEVNVCKQYYQELLKSAEREEQEESVYNLYISE
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CCDS47 VRNIRLRLENCEDRLIRQIRT----PLERDDLHESVFRITEQEKLKKELERLKDDLGTIT
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CCDS47 NKCEEFFSQAAASSSVPTLRSELNVVLQNMNQVYSMSSTYIDKLKTVNLVLKNTQAAEAL
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CCDS47 VKLYETKLCEEEAVIADKNNIENLISTLKQWRSEVDEKRQVFHALEDELQKAKAISDEMF
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CCDS47 QVETTQRKIQENQPENSKTLATQLNQQKMLVSEIEMKQSKMDECQKYAEQYSATVKDYEL
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CCDS47 QTMTYRAMVDSQQKSPVKRRRMQSSADLIIQEFMDLRTRYTALVTLMTQYIKFAGDSLKR
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CCDS47 LEEEEKSLEEEKKEHVEKAKELQKWVSNISKTLKDAEKAGKPPFS--------KQKISSE
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CCDS47 QTSGDVKVEEKIVAERQQEYKEKLQGICDLLTQTENRLIGHQEAFMIGDGTVELKKYQSK
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CCDS47 QNGTHFQEGDGKSAIGEEDEVNGNLLETDVDGQVGTTQ--ENLNQQYQKVKAQHEKIISQ
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CCDS47 ELEKFDADYTEFEHWLQQSEQELENLEAGADDINGLMTKLKRQKSFSEDVISHKGDLRYI
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CCDS47 DKYQHYEDASCGLLAGLQACEATASKHLSEPIAVDPKNLQRQLEETKALQGQISSQQVAV
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CCDS47 TKTQALTEVDVPGKDVTELSQYMQESTSEFLEHKKHLEVLHSLLKEISSHGLPSDKALVL
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CCDS47 EKTNNLSKKFKEMEDTIKEKKEAVTSCQEQLDAFQVLVKSLKSWIKETTKKVPIVQPSFG
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CCDS47 ESLIKDHKDFSKTLTAQSHMYEKTIAEGENLLLKTQ-GSEKAALQLQLNTIKTNWDTFNK
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CCDS47 EMFSQFAEFDDELDSMAPVGRDAETLQKQKETIKAFLKKLEALMASNDNANKTCKMMLAT
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CCDS47 EETSPDLVGIKRDLEALSKQCNKLLDRAQAREEQVEGTIKRLEEFYSKLKEFSILLQKAE
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CCDS47 SAEFKVVKAQIQEQKLLQRLLDDRKSTVEVIKREGEKIATTAEPADKVKILKQLSLLDSR
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CCDS47 WEALLNKAETRNRQLEGISVVAQQFHETLEPLNEWLTTIEKRLVNCEPIGTQASKLEEQI
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.::::...:.:
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: :.: .:::::::::::::::::::.::..:::::: ::. :.:..::::.::.:::::
CCDS75 LEERIINRQHKLEGALLALGQFQHALDELLAWLTHTEGLLSEQKPVGGDPKAIEIELAKH
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pF1KE0 HVLKNDVLAHQATVETVNKAGNELLESSAGDDASSLRSRLEAMNQCWESVLQKTEEREQQ
:::.:::::::.:::.::::::.:.:::::..::.:...::..:: :..::.:::.:.::
CCDS75 HVLQNDVLAHQSTVEAVNKAGNDLIESSAGEEASNLQNKLEVLNQRWQNVLEKTEQRKQQ
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pF1KE0 LQSTLQQAQGFHSEIEDFLLELTRMESQLSASKPTGGLPETAREQLDTHMELYSQLKAKE
:...:.::.:::.::::. :: : .: :::: :::::::.:::..:::. . ..:::
CCDS75 LDGALRQAKGFHGEIEDLQQWLTDTERHLLASKPLGGLPETAKEQLNVHMEVCAAFEAKE
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:::..:..::. :: .: ... .. .:.. :..::. : .:..:::.::::::::: :
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..::..:::::::::::::.:::::::::::: .::::::::::::::::::::.::..:
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::..:. :::::::.::::::: ::..::::::.::.:. ::::: ::::.::::: : .
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:. :::..:.:.::::::.::::::::.:::::::::::: ::::::.::::.:::::::
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:::::::.::::::.: ::.:::::::::..::.::::.:::::.::::..::: :.:::
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::::.::: ::.:::.::: ::.::: :...:: :::::.::::::::.:.:::: .::.
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.::: :::::::.::::...:.:..::...::.:::: :::::::::::::::::::.::
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::::::: .::. :.:. :::: ::::.::::::: ..:.: :::.:..:::::::::::
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:.::::.: : ..:::::::::::.:::::::::::::.::::::::.::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::.:::::..:::.:::::::::::::::::::
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:::::::::::.: :::::::::::::::.:::::::::::::.::::: :::::
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:. ... : .::::. : . :.. .:. :. . :.. ..:.
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:: ::. :::::::::.:::::::::::::::::. : ::.:::. .. ...
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:: . ::::::: ..:.
CCDS75 SRPSTAKPSKIPTPQRKSPASKLDKSSKR
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>--
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::::::::::.:.:::::.:::::::::.:.::::::::.::::::::::::::::::::
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:: :::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::
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CCDS75 FQISDIHVTGESEDMSAKERLLLWTQQATEGYAGIRCENFTTCWRDGKLFNAIIHKYRPD
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>>CCDS4959.1 DST gene_id:667|Hs108|chr6 (2649 aa)
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:...:: ::...: ::.. . : . :: . : :
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. .:.. :. :: .:::. ..
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:. . .:.: :..:: .::.::.:::..:.:.:::.:::::: .::.....: ..::.
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::.:::.. : .:. .. .::: : .::.:: :: .:: . :::..::.:::::: :
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CCDS49 LIWLNEKEEEEVAYDWSERNTNIARKKDYHAELMRELDQKEENIKSVQEIAEQLLLENHP
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:. :.::: ::.:.: .:. ::: :::::.:::::::.::.::.: ..::::.:.:.::
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::::...:. .::::.:.::.:::.:.: ::..:.:.:..:::.:::::. : ::..:
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CCDS49 ANRIEQQYQNVLTLWHESHINMKSVVSWHYLINEIDRIRASNVASIKTMLPGEHQQVLSN
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CCDS49 VRNIRLRLENCEDRLIRQIRT----PLERDDLHESVFRITEQEKLKKELERLKDDLGTIT
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:: :: :: .::.:.:: . .: :::..: :.: .: .:: .:..:. :::.....:
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.. . :. .. .: :.:..:. ::.:: : .::: .:.:.:.:::...:::. ::::::
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CCDS49 QTMTYRAMVDSQQKSPVKRRRMQSSADLIIQEFMDLRTRYTALVTLMTQYIKFAGDSLKR
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::::: .: .:: : .:. .:.. :: . : . ....: ... .
CCDS49 LEEEEIKRCKETSEHGAYSDLLQRQKATVLENSKLTGKISELE-RMVAELKK---QKSRV
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CCDS49 EEELPKVREAAENELRKQQRNVEDISLQKIRAESEAKQYRRELETIVREK----EAAERE
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. .. : . .: .:.. .::: :.. . .:::. . .. . :: .
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CCDS49 DQAEKGYSQQLRELGRQLNQTTGKAEEAMQEASDLKKIKRNYQLELESLNHEKGK---LQ
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:.... . : :. ... ....... . . : : ... ..:. ::. :.
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.:...: . ...... .: : .: . ::. .:. : ... :.: :.
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pF1KE0 IPWIKQHTILMSDKTFPQNPVELKALYNQYIHFKETEILAKEREKGRIEELYKLLEVWIE
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CCDS43 LQWMRHHTAAFEERRFPSSFEEIEILWSQFLKFKEMELPAKEADKNRSKGIYQSLEGAVQ
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pF1KE0 FGRIKLPQGYHPNDVEEEWGKLIIEMLEREKSLRPAVERLELLLQIANKIQNGALNCEEK
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CCDS43 AGQLKVPPGYHPLDVEKEWGKLHVAILEREKQLRSEFERLECLQRIVTKLQMEAGLCEEQ
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pF1KE0 LTLAKNTLQADAAHLESGQPVQCESDVIMYIQECEGLIRQLQVDLQILRDENYYQLEELA
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CCDS43 LNQADALLQSDVRLLAAGKVPQRAGEVERDLDKADSMIRLLFNDVQTLKDGRHPQGEQMY
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....::::::......::::::::..:::::: . :. ...:. :.:..:::::: : :
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CCDS43 QGAEEVLRAHEEQLKEAQAVPATLPELEATKASLKKLRAQAEAQQPTFDALRDELRGAQE
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. .:. :. ..: . .. :. . :. :.. . . .... ::..
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: ... . . :.:.. .. :.. . .:. . . . :: : . .
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: :. . .: .:: :.. ... :. .: .: .. :. :: .. .
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: ..: :.. . .: :.. ..:..: . : . .: . .
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CCDS43 RVIDR------ELYQQLQRGE---RSVRDVAEVDTVRRALRGANVIAGVWLEEAGQKLSI
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CCDS43 YNALKKDLL-PSDMAVALLEAQAGTGHIIDPATSARLTVDEAVRAGLVGPEFHEKLLSAE
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CCDS43 KAVTGYRDPYTGQSVSLFQALKKGLIPREQGLRLLDAQLSTGGIVDPSKSHRVPLDVACA
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. .. .: :. .: . . . :. : .:: .: . :: .: : ::
CCDS43 RGCLDEETSRALSAPRADAKAYSDPSTGEPATYGELQQRCR-PDQLTGL--SLLPLSEKA
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pF1KE0 LQQLRSDLDAVSMKCDSFLHQSPSSSSVPTLRSELNLLVEKMDHVYGLSTVYLNKLKTVD
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CCDS43 VEGLGKGVARLSAEAEKVLALPEPSPAAPTLRSELELTLGKLEQVRSLSAIYLEKLKTIS
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pF1KE0 VIVRSIQDAELLVKGYEIKLSQEEVVLADLSALEAHWSTLRHWLSDVKDKNSVFSVLDEE
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CCDS43 LVIRGTQGAEEVLRAHEEQLKEAQAVPATLPELEATKASLKKLRAQAEAQQPTFDALRDE
1100 1110 1120 1130 1140 1150
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pF1KE0 IAKAKVVAEQMSRLTPERNLDLERYQEKGSQLQERWHRVIAQLEIRQSELESIQEVLGDY
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CCDS43 LRGAQEVGERLQQRHGERDVEVERWRERVAQLLERWQAVLAQTDVRQRELEQLGRQLRYY
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CCDS43 KQYINAIKDYELQLVTYKAQLEPVA-SPAKKPKVQSGSESVIQEYVDLRTHYSELTTLTS
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CCDS43 QYIKFISETLRRMEEEERLAEQQRAEERERLAEVE---AALEKQRQLAEAHAQAKAQAER
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CCDS43 EAKEL-QQRMQEEVVRREEAAVDA----------------QQQKRSIQEELQQLRQSSE-
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CCDS43 ----AEIQAKARQAEAAERSRLR-IEEEIRVVRLQLEATERQRGGAEGELQALRARAEEA
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CCDS43 QAEEVAQQKSLAQAEAEKQKEEAEREARRRG-KAEEQAVRQRELAEQELEKQRQLAEGTA
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CCDS43 Q--QRLAAEQELIRLRAETEQGEQQRQLLEEELARLQR-----EAAAATQKRQ-ELEAEL
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CCDS43 AKVRAEMEVLLASKAR------AEEESRSTSEKS---KQRLEAEAGRFRELAEEAARLRA
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CCDS43 -----LAEEAKRQRQLAEEDAARQRAEA--ERVLAEKLAAIGEATRLKTEAEIALKEKEA
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CCDS43 EDTLRQRRQVEEEILALKASF---EKAAAGKAELELELGRIRSNAEDTLR-----SKEQA
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CCDS43 ELEAARQ----------RQLAAEEERRRREAEERVQKSLAAEEEAARQRKAALEEVE---
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CCDS43 ----RLKAKVEEARRLRERAEQESARQLQLAQEAAQKRLQAEEKAHAF-AVQQKEQELQQ
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CCDS43 T-----LQQEQSVLDQLRGEAEAARRAAEEAEEARVQAEREAAQSRRQVEEAER-LKQSA
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CCDS43 -----EEQAQARAQAQAAAEKLRKEAEQEAARRAQAEQAALRQKQAADAEMEKHKKFAEQ
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CCDS43 MEELSKLKARIEAENRALILRDKDNTQRFLQE---EAEKMKQVAEEAARLSVA---AQEA
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pF1KE0 ENWKKIQEELNSRWERATEVTVARQRQLEESASHLACFQAAESQLRPWLMEKELMMGVLG
... :: .. . .: . .. : . :..: ::..: ..::: .
CCDS43 ARLRQLAEEDLAQQRALAEKMLKEKMQAVQEATRLK----AEAEL--LQQQKELAQEQAR
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CCDS43 RFRKQAEEIGEKLHRTELATQEKVTLVQTLEIQRQQSDHDAERLREAIAELEREKE-KLQ
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:: : :. . .: .:: :.. ... :. .: .: .. :. :: .
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. .. . .::. ::: :: ... :: : ..: . ..: :..
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.: .. .. : .:.. .::.. . .:.. : .. . : :. ..: :
CCDS43 EAEPEHSFDGLRRKVS--AQRLQEAGILSAEELQRLAQGHTTV--DELARREDVRHYL--
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. . .: ::. : : :. . .. . :. ..: . .: .....:
CCDS43 EAVKEGVVGPELHHKLLSAERAVTGYKDPYTGQQISLFQAMQKGLIVREHGIRLLEA---
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: .. .. ..... . .: : :. : . . . : :: .. . . .. ..
CCDS43 QIATGGVIDPVHSHR-----VPVDVAYRRGYFDEEMNRVLADPSDDTKGFFDPNTHENLT
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.:.. .: ..: :.. . .: :.. ..:..: . : . .
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CCDS43 IWEIINSEYFTAEQRRDLLRQFRTGRITVEKIIKIIITVVEEQEQKGRLCFEGLRSLVPA
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. ... .: .: : : : :... . .. :. . .. . ..:. .:
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.:.:. .. ..:. . : .: :. : :. . ... : .... . :..
CCDS43 GQKLSIYNALKKDLL-PSDMAVALLEAQAGTGHIIDPATSARLTVDEAVRAGLVGPEFHE
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. . .: :. : ... .. .: : ::. .: .. .: .
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:. :. .. .: :. .: . . . :. : .:: .: . :: .:
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: ::: :::..: . : . :..: :.. : .:: .: .:: ::. .
CCDS43 PLSEKAARARQEELYSELQARETFEKTPVEVPVGGFKGRTVTVWELISSEYF---TAEQR
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:...: .. . : .:...:: :. : ::: : ::.:. :...
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:.:.. :. :. . ::: .: :. ::. . .: : ...
CCDS43 SIYEAMRRGLLRATTAAL---LLEA---QAATGF--LVDPVRNQRLYVHEAV-------K
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CCDS43 AGVVGPELHEQLLSAEKAVTG--YRDPYSGSTISLFQAMQKGLVLRQHGIRLLEAQIATG
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CCDS43 GIIDPVHSHRVPVDVAYQRGYFSEEMNRVLADPSDDTKGFFDPNTHENLTYRQLLERC--
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:.. :: .: : .: ... . . .:. :. :: . . . : .:
CCDS43 -VEDP-ETGLRLLPLKGAEKAEVVET-TQVYTEEETRRAFEETQIDIPGGGSHGGSTMSL
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.. . ..: ::: :.:. : : . ...: . . . ..:.: .
CCDS43 WEV--MQSDLIPEE--------QRAQLMADFQAGRVTKERMIIIIIEIIEKTEIIR----
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. : . . . :: :. :.. ... . . .. . : . . .. : :
CCDS43 -QQGLASYDYVRRRLTAEDLFEARIISLETYNLLREGTRSLREALEAESAWCYLYGTGSV
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:. . :. : . : . .. : . : . .:: .. .:.. : :.
CCDS43 AGVYLPGSRQTLS---IYQALKKGLLSAEVARLLLEAQAATGFLLDPVK-GERLTVDEAV
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. . .: . . : : .: . ...:.: .: : :.: :.:
CCDS43 RKGLVGPELHDRLLSAERAVTGYRDPYTEQTISLFQAMKKELIPTEEAL---RLLDAQL-
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: : :.. . :. ::: ...: . . ... :. . . . :
CCDS43 -ATGGIVDPRLGFHLPLEVAYQRGYLNKDTHDQLSE-PSEVRSYVDPSTDERLSYTQL--
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CCDS43 --LRRCRRDD-GT--GQLLLPLSDARKLTFRGLRKQITME------ELVRSQVMDEATAL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]