Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0480
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0480, 475 aa
1>>>pF1KE0480 475 - 475 aa - 475 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1358+/-0.00142; mu= 12.9375+/- 0.084
mean_var=74.3804+/-15.345, 0's: 0 Z-trim(99.2): 161 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.148712
statistics sampled from 5477 (5649) to 5477 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.174), width: 16
Scan time: 2.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33848.2 KBTBD12 gene_id:166348|Hs108|chr3 ( 623) 2949 643.0 2.7e-184
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3 ( 601) 595 137.9 2.8e-32
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 ( 623) 575 133.7 5.6e-31
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 574 133.4 6.1e-31
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 555 129.4 1.1e-29
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 551 128.5 1.8e-29
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 551 128.5 1.9e-29
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 542 126.6 7e-29
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 537 125.5 1.5e-28
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 537 125.5 1.5e-28
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 536 125.3 1.7e-28
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 536 125.3 1.8e-28
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 534 124.9 2.6e-28
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 529 123.8 4.8e-28
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 529 123.8 5.1e-28
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 529 123.8 5.9e-28
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 529 123.8 6.3e-28
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 516 121.0 4.1e-27
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 516 121.0 4.2e-27
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 502 118.0 2.9e-26
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 497 116.9 5.8e-26
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 495 116.5 7.8e-26
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 495 116.5 7.8e-26
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 612) 489 115.2 2e-25
CCDS2234.1 KLHL41 gene_id:10324|Hs108|chr2 ( 606) 483 113.9 4.8e-25
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 479 113.1 8.9e-25
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 476 112.4 1.4e-24
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 472 111.6 2.5e-24
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 469 110.9 4.4e-24
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 461 109.2 1.3e-23
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 460 109.0 1.4e-23
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 456 108.1 2.5e-23
CCDS2236.1 KLHL23 gene_id:151230|Hs108|chr2 ( 558) 455 107.9 2.9e-23
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 451 107.1 6.8e-23
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 447 106.2 9.1e-23
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 444 105.6 2.2e-22
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 440 104.7 2.8e-22
CCDS9376.1 KBTBD6 gene_id:89890|Hs108|chr13 ( 674) 439 104.5 3.7e-22
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 438 104.3 3.9e-22
CCDS9377.1 KBTBD7 gene_id:84078|Hs108|chr13 ( 684) 434 103.4 7.8e-22
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 433 103.2 7.9e-22
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 422 100.8 3.5e-21
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 421 100.6 4.1e-21
CCDS2703.1 KLHL40 gene_id:131377|Hs108|chr3 ( 621) 411 98.5 2.2e-20
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 410 98.3 2.8e-20
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 382 92.2 1.6e-18
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 382 92.2 1.6e-18
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 382 92.2 1.6e-18
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 382 92.2 1.7e-18
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 382 92.3 1.7e-18
>>CCDS33848.2 KBTBD12 gene_id:166348|Hs108|chr3 (623 aa)
initn: 3019 init1: 2949 opt: 2949 Z-score: 3422.2 bits: 643.0 E(32554): 2.7e-184
Smith-Waterman score: 2949; 99.3% identity (100.0% similar) in 448 aa overlap (1-448:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MECKIEGKEKYQHSLNLLNKIKNMKELAEMIDVVLTAEGEKFPCHRLVLAAFSPYFKAMF
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MECKIEGKEKYQHSLNLLNKIQNMKELAEMIDVVLTAEGEKFPCHRLVLAAFSPYFKAMF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TCGLLECNQREVILYDITAESVSVLLNYMYNAALEINNANVQTVAMAAYFMQMEEVFSVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TCGLLECNQREVILYDITAESVSVLLNYMYNAALEINNANVQTVAMAAYFMQMEEVFSVC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QKYMMDHMDASNCLGIYYFAKQIGAEDLSDRSKKYLYQHFAEVSLHEEILEIEVHQFLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QKYMMDHMDASNCLGIYYFAKQIGAEDLSDRSKKYLYQHFAEVSLHEEILEIEVHQFLTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IKSDDLNISREESILDLVLRWVNHNKELRTVHLVELLKQVRLELVNPSFLRQALRRNTML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IKSDDLNISREESILDLVLRWVNHNKELRTVHLVELLKQVRLELVNPSFLRQALRRNTML
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LCDADCVDIIQNAFKAIKTPQQHSLNLRYGMETTSLLLCIGNNSSGIRSRHRSYGDASFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LCDADCVDIIQNAFKAIKTPQQHSLNLRYGMETTSLLLCIGNNSSGIRSRHRSYGDASFC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 YDPLSRKTYFISSPKYGEGLGTVCTGVVMENNTIIVAGEASASKLSRQKNKNVEIYRYHD
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YDPVSRKTYFISSPKYGEGLGTVCTGVVMENNTIIVAGEASASKLSRQKNKNVEIYRYHD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 RGNQFWEKLCTAEFRELYALGSIHNDLYVIGGQMKIKNQYLITNCVDKYSVERDNWKRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RGNQFWEKLCTAEFRELYALGSIHNDLYVIGGQMKIKNQYLITNCVDKYSVERDNWKRVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE0 PLPLQLACHAVVTVNNKLYVIGGWTPQVKKFPVYIIGMAILSLAAMLNIVVVVEC
:::::::::::::::::::::::::::.
CCDS33 PLPLQLACHAVVTVNNKLYVIGGWTPQMDLPDEEPDRLSNKLLQYDPSQDQWSVRAPMKY
430 440 450 460 470 480
>>CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3 (601 aa)
initn: 582 init1: 537 opt: 595 Z-score: 693.0 bits: 137.9 E(32554): 2.8e-32
Smith-Waterman score: 704; 28.5% identity (63.0% similar) in 459 aa overlap (13-460:31-469)
10 20 30 40
pF1KE0 MECKIEGKEKYQHSLNLLNKIKNMKELAEMIDVVLTAE-GEK
:. ..:...:.: . ... :.:. .. :.
CCDS29 MAASADLSKSSPTPNGIPSSDPASDAMDPFHACSILKQLKTMYDEGQLTDIVVEVDHGKT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 FPCHRLVLAAFSPYFKAMFTCGLLECNQREVILYDITAESVSVLLNYMYNAALEINNANV
: ::: ::::.::::..::: :: : .:.:: . . :::....::: :.. . ...:::
CCDS29 FSCHRNVLAAISPYFRSMFTSGLTESTQKEVRIVGVEAESMDLVLNYAYTSRVILTEANV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 QTVAMAAYFMQMEEVFSVCQKYMMDHMDASNCLGIYYFAKQIGAEDLSDRSKKYLYQHFA
:.. :: ..:. . . : :::..:.: .: .:.. :: . : ..:.::::.:. ..:
CCDS29 QALFTAASIFQIPSIQDQCAKYMISHLDPQNSIGVFIFADHYGHQELGDRSKEYIRKKFL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 EVSLHEEILEIEVHQFLTLIKSDDLNISREESILDLVLRWVNHNKELRTVHLVELL-KQV
:. ..:.:.. :..... :::::..::: . . ..:: .:... : ::: :.. : .
CCDS29 CVTKEQEFLQLTKDQLISILDSDDLNVDREEHVYESIIRWFEHEQNEREVHLPEIFAKCI
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KE0 RLELVNPSFLRQALRRNTMLLCDADCVDIIQNAFKAIKTPQQ-HSLNLRYGMETTSLLLC
:. :.. .:... . .. . . ::. : :.. .. . : :: .. ...:
CCDS29 RFPLMEDTFIEKIPPQFAQAIAKS-CVE---------KGPSNTNGCTQRLGMTASEMIIC
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 IGNNSSGIRSRHRSYGDASFCYDPLSRKTYFISSPKYGEGLGTVCTGV-VMENNTIIVAG
. .: . .. : : .. ... . .: . : : :. : .: : .::
CCDS29 FDAAH-----KHSGKKQTVPCLDIVTGRVFKLCKPP--NDLREV--GILVSPDNDIYIAG
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 --EASASKLSRQKNKNVEIYRYHDRGNQFWEKLCTAEFRELYALGSIHNDLYVIGGQMKI
. :.:..: ... . ... : :.. : . : : . .:.:::..
CCDS29 GYRPSSSEVSIDHKAENDFWMYDHSTNRWLSKPSLLRARIGCKLVYCCGKMYAIGGRVYE
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 KNQYLITNCVDKYSVERDNWKRVSPLPLQLACHAVVTVNNKLYVIGG-----WTPQVKKF
. . :. :. ... : : .:. . : .: ..:.::. : . :: : .
CCDS29 GDGRNSLKSVECYDSRENCWTTVCAMPVAMEFHNAVEYKEKIYVLQGEFFLFYEPQ-KDY
410 420 430 440 450 460
460 470
pF1KE0 PVYIIGMAILSLAAMLNIVVVVEC
.. :..
CCDS29 WGFLTPMTVPRIQGLAAVYKDSIYYIAGTCGNHQRMFTVEAYDIELNKWTRKKDFPCDQS
470 480 490 500 510 520
>>CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 (623 aa)
initn: 617 init1: 477 opt: 575 Z-score: 669.6 bits: 133.7 E(32554): 5.6e-31
Smith-Waterman score: 635; 27.4% identity (62.6% similar) in 452 aa overlap (1-441:1-434)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MECKIEGKEKYQHSLNLLNKIKNMKELAEMIDVVLTAEGEKFPCHRLVLAAFSPYFKAMF
: . : . . .....::...: . : . :.:: .:: .::::..:::. : ::.:::
CCDS34 MSTQDERQINTEYAVSLLEQLKLFYEQQLFTDIVLIVEGTEFPCHKMVLATCSSYFRAMF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TCGLLECNQREVILYDITAESVSVLLNYMYNAALEINNANVQTVAMAAYFMQMEEVFSVC
:: : .: .: : .. : .......: :.. : .:...:. . .: :.:.:.:.. :
CCDS34 MSGLSESKQTHVHLRNVDAATLQIIITYAYTGNLAMNDSTVEQLYETACFLQVEDVLQRC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 QKYMMDHMDASNCLGIYYFAKQIGAEDLSDRSKKYLYQHFAEVSLHEEILEIEVHQFLTL
..:.. ...: ::. . :: .. :.:.. .:... ..:. : .. .... .. .
CCDS34 REYLIKKINAENCVRLLSFADLFSCEELKQSAKRMVEHKFTAVYHQDAFMQLSHDLLIDI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IKSDDLNISREESILDLVLRWVNHNKELRTVHLVELLKQVRLELVNPSFLRQALRRNTML
..::.::. .::.. . .. :...: : :. .: .:.:.:.. .. : ..
CCDS34 LSSDNLNVEKEETVREAAMLWLEYNTESRSQYLSSVLSQIRIDALSEVTQRAWFQG----
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LCDADCVDIIQNAFKAIKTPQQHSLNLRYGMETTSLLLCIGNNSSGIRSRHRSYGDASFC
: : ..:. .:.. :. .. : :: ... : .: . : . .: :
CCDS34 LPPNDKSVVVQGLYKSM--PK--FFKPRLGMTKEEMMIFIEASSENPCSLY-----SSVC
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KE0 YDPLSRKTYFISSPKYGEGLGTVCTGVVMENNTIIVAG--------EASASKLSRQKN--
:.: ..:.: . :: : : : :: .: : .:: ... :: :. ..
CCDS34 YSPQAEKVYKLCSPP--ADLHKVGT-VVTPDNDIYIAGGQVPLKNTKTNHSKTSKLQTAF
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE0 KNVEIYRYHDRGNQFWEKLCTAEFRELY-ALGSIHNDLYVIGGQMKIKNQYLITNCVDKY
..:. . . : .. : : .. .: .. .:.:::. .. .. : :..:
CCDS34 RTVNCFYWFDAQQNTWFPKTPMLFVRIKPSLVCCEGYIYAIGGD-SVGGE-LNRRTVERY
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE0 SVERDNWKRVSPLPLQLACHAVVTVNNKLYVIGGWTPQVKKFPVYIIGMAILSLAAMLNI
..:.:.: ::::: :.:.:.. .::.
CCDS34 DTEKDEWTMVSPLPCAWQWSAAVVVHDCIYVMTLNLMYCYFPRSDSWVEMAMRQTSRSFA
410 420 430 440 450 460
470
pF1KE0 VVVVEC
CCDS34 SAAAFGDKIFYIGGLHIATNSGIRLPSGTVDGSSVTVEIYDVNKNEWKMAANIPAKRYSD
470 480 490 500 510 520
>>CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 (574 aa)
initn: 617 init1: 544 opt: 574 Z-score: 669.0 bits: 133.4 E(32554): 6.1e-31
Smith-Waterman score: 623; 27.0% identity (61.6% similar) in 430 aa overlap (21-443:28-437)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MECKIEGKEKYQHSLNLLNKIKNMKELAEMIDVVLTAEGEKFPCHRLVLAAFS
...... ... ::.: .:: ::.::::
CCDS33 MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLAASI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 PYFKAMFTCGLLECNQREVILYDITAESVSVLLNYMYNAALEINNANVQTVAMAAYFMQM
:::.:::: ..::.: :... . .. .:.:. ::. : :.. :::.. :.: :.:.
CCDS33 PYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGNLAIDQQNVQSLLMGASFLQL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 EEVFSVCQKYMMDHMDASNCLGIYYFAKQIGAEDLSDRSKKYLYQHFAEVSLHEEILEIE
. . ..: .. ... .::::. ::. . : : ......:::.:::. ::.: .
CCDS33 QSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFLALP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 VHQFLTLIKSDDLNISREESILDLVLRWVNHNKELRTVHLVELLKQVRLELVNPSFLRQA
... : :.. :.::.. ::.... .: :: ...: : .: :::...:: : :.:: .
CCDS33 LEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWVRYDREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFLSDR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LRRNTMLLCDADCVDIIQNA--FKAIKTPQQHSLNLRYGMETTSLLLCIGNNSSGIRSRH
.... .. : : :....: .. . . : .: . . . . .:. :
CCDS33 VQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMPERRPHLPAFRTRPRCCTSIAGLIYAVGGLNSAG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE0 RSYGDASFCYDPLS---RKTYFISSPKYGEGLGTVCTGVVMENNTIIVAGEASASKLSRQ
: .. .::.. .. ... . :...: .:... ..: . .::
CCDS33 DSL-NVVEVFDPIANCWERCRPMTTARSRVGVAVV-NGLLYA-----IGGYDGQLRLSTV
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 KNKNVEIYRYHDRGNQFWEKLCTAEFRELYALGSIHND--LYVIGGQMKIKNQYLITNCV
. : : .. : .. . . .. :.:.. : .:: :: :. : . :
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470
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CCDS76 PLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRCAPKVLC
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CCDS14 CLDYTADEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRH---TSMERYDPNID
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CCDS54 KLMVVVGGQAPKAIRSVE--------CYDFKEERWH-----QVAELPSRRCRAGMVYMAG
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