FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0088, 905 aa
1>>>pF1KE0088 905 - 905 aa - 905 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3409+/-0.000534; mu= 20.5301+/- 0.033
mean_var=67.2193+/-13.167, 0's: 0 Z-trim(107.6): 148 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.156433
statistics sampled from 15524 (15687) to 15524 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 10.500
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_783300 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotr ( 905) 5990 1361.9 0
XP_005261001 (OMIM: 138245) PREDICTED: glutamate r ( 903) 5677 1291.3 0
NP_001317922 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 934) 5670 1289.7 0
NP_001307550 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 763) 4793 1091.7 0
NP_068775 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ( 908) 4753 1082.8 0
XP_005267002 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 908) 4753 1082.8 0
NP_786944 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ( 869) 4683 1067.0 0
XP_011534080 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 869) 4683 1067.0 0
NP_001159719 (OMIM: 138244,611092) glutamate recep ( 892) 4683 1067.0 0
XP_011534079 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 892) 4683 1067.0 0
XP_005267003 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 859) 4674 1064.9 0
NP_000822 (OMIM: 138243) glutamate receptor ionotr ( 919) 4512 1028.4 0
XP_016866270 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 707) 3760 858.6 0
NP_001307545 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 920) 3330 761.6 0
NP_000821 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotr ( 918) 3017 691.0 7e-198
NP_001317923 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 949) 3010 689.4 2.2e-197
XP_016866271 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 601) 3003 687.7 4.4e-197
NP_001307559 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 410) 2671 612.7 1.1e-174
NP_001307547 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 781) 2615 600.2 1.3e-170
NP_002079 (OMIM: 600283) glutamate receptor ionotr ( 980) 2429 558.3 6.6e-158
XP_005258878 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 980) 2429 558.3 6.6e-158
XP_011525164 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 981) 2418 555.8 3.7e-157
NP_001287959 (OMIM: 600283) glutamate receptor ion ( 981) 2402 552.2 4.5e-156
XP_011525165 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 981) 2402 552.2 4.5e-156
XP_011525167 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 982) 2391 549.7 2.5e-155
XP_011525169 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 913) 2375 546.1 2.9e-154
XP_011525170 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 901) 2364 543.6 1.6e-153
XP_016882202 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 914) 2364 543.6 1.6e-153
NP_001269399 (OMIM: 600282) glutamate receptor ion ( 956) 2315 532.6 3.6e-150
NP_055434 (OMIM: 600282) glutamate receptor ionotr ( 956) 2315 532.6 3.6e-150
XP_011535937 (OMIM: 138248) PREDICTED: glutamate r ( 886) 2061 475.2 6.1e-133
NP_001107655 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 i ( 906) 2061 475.2 6.2e-133
NP_001244951 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 i ( 916) 2061 475.2 6.2e-133
NP_000818 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 isof ( 906) 2059 474.8 8.4e-133
NP_001244950 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 i ( 916) 2059 474.8 8.5e-133
XP_011541089 (OMIM: 600282) PREDICTED: glutamate r ( 702) 2038 470.0 1.8e-131
XP_011541088 (OMIM: 600282) PREDICTED: glutamate r ( 714) 2038 470.0 1.8e-131
XP_011541077 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate r ( 884) 2033 468.9 4.8e-131
XP_006718886 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate r ( 902) 2033 468.9 4.9e-131
XP_005271575 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate r ( 902) 2033 468.9 4.9e-131
XP_011541086 (OMIM: 600282) PREDICTED: glutamate r ( 902) 2031 468.4 6.7e-131
NP_001070711 (OMIM: 138246) glutamate receptor 4 i ( 884) 2023 466.6 2.3e-130
NP_000820 (OMIM: 138246) glutamate receptor 4 isof ( 902) 2023 466.6 2.3e-130
NP_001269402 (OMIM: 600282) glutamate receptor ion ( 765) 2017 465.2 5.2e-130
XP_016864882 (OMIM: 138248) PREDICTED: glutamate r ( 837) 1995 460.3 1.8e-128
NP_001244952 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 i ( 837) 1993 459.9 2.4e-128
XP_016864881 (OMIM: 138248) PREDICTED: glutamate r ( 846) 1957 451.7 6.8e-126
NP_015564 (OMIM: 300699,305915) glutamate receptor ( 894) 1951 450.4 1.8e-125
NP_000819 (OMIM: 300699,305915) glutamate receptor ( 894) 1948 449.7 2.9e-125
NP_000817 (OMIM: 138247) glutamate receptor 2 isof ( 883) 1945 449.0 4.6e-125
>>NP_783300 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotropic (905 aa)
initn: 5990 init1: 5990 opt: 5990 Z-score: 7299.8 bits: 1361.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5990; 100.0% identity (100.0% similar) in 905 aa overlap (1-905:1-905)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 KSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 VKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 LYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 VERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 VERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 SDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 SDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 AILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 AILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 EFIYKSRKNNDIEQCLSFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_783 EFIYKSRKNNDIEQCLSFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQR
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 KETVA
:::::
NP_783 KETVA
>>XP_005261001 (OMIM: 138245) PREDICTED: glutamate recep (903 aa)
initn: 5677 init1: 5677 opt: 5677 Z-score: 6918.1 bits: 1291.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5677; 99.7% identity (99.8% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISI
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pF1KE0 LYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 VERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 SDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 AILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 EFIYKSRKNNDIEQCLSFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQR
:::::::::::::: . :
XP_005 EFIYKSRKNNDIEQAFCFFYGLQCKQTHPTNSTSGTTLSTDLECGKLIREERGIRKQSSV
850 860 870 880 890 900
>>NP_001317922 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotro (934 aa)
initn: 5670 init1: 5670 opt: 5670 Z-score: 6909.3 bits: 1289.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5922; 96.9% identity (96.9% similar) in 934 aa overlap (1-905:1-934)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 VERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 SDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 AILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIG
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KE0 EFIYKSRKNNDIEQ-----------------------------CLSFNAIMEELGISLKN
:::::::::::::: :::::::::::::::::
NP_001 EFIYKSRKNNDIEQKGKSSRIRFYFRNKVRFHGRKKQSLGVEKCLSFNAIMEELGISLKN
850 860 870 880 890 900
880 890 900
pF1KE0 QKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQRKETVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQRKETVA
910 920 930
>>NP_001307550 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotro (763 aa)
initn: 4791 init1: 4791 opt: 4793 Z-score: 5840.9 bits: 1091.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4793; 97.6% identity (98.4% similar) in 748 aa overlap (158-905:18-763)
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDSTGLIRLQ
: :.: .. : .:. : . ::::::
NP_001 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLR--IGLIRLQ
10 20 30 40
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEILKQILFMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEILKQILFMG
50 60 70 80 90 100
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 MMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSMERLQAPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSMERLQAPPR
110 120 130 140 150 160
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 PETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRFMNLIKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRFMNLIKEA
170 180 190 200 210 220
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 RWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKDKSSNITD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKDKSSNITD
230 240 250 260 270 280
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 SLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDG
290 300 310 320 330 340
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 KYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKPNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKPNG
350 360 370 380 390 400
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 TNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSDVVENNFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSDVVENNFT
410 420 430 440 450 460
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 LLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMESP
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670 680 690 700 710 720
pF1KE0 IDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQR
530 540 550 560 570 580
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 VLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQE
590 600 610 620 630 640
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 EGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIGEFIYKSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIGEFIYKSR
650 660 670 680 690 700
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 KNNDIEQCLSFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQRKETVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNNDIEQCLSFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQRKETVA
710 720 730 740 750 760
>>NP_068775 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ion (908 aa)
initn: 4721 init1: 2450 opt: 4753 Z-score: 5791.0 bits: 1082.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4753; 78.2% identity (92.4% similar) in 904 aa overlap (6-905:7-908)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFK
.:..: . : : :: .: : . .:::.::::: ::. :...:::::.
NP_068 MKIIFPILSNPVF--RRTVKLLLCLLWIGYSQGTTHVLRFGGIFEYVESGPMGAEELAFR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FAVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAV
:::..:::::::.:::::::: :.:::.::::::..:::::.:::::.::::::::..::
NP_068 FAVNTINRNRTLLPNTTLTYDTQKINLYDSFEASKKACDQLSLGVAAIFGPSHSSSANAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 QSICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYED
::::::: :::::::::: :::: ::..::::....:::::::: ...::::::::.:
NP_068 QSICNALGVPHIQTRWKHQVSDNKDSFYVSLYPDFSSLSRAILDLVQFFKWKTVTVVYDD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 STGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEI
::::::::::::::::::...::::::. .:::::::::::.::::.:::::::: :: :
NP_068 STGLIRLQELIKAPSRYNLRLKIRQLPADTKDAKPLLKEMKRGKEFHVIFDCSHEMAAGI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LKQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSM
::: : ::::::::::.::::::::::.: ::::::::::::.:: .: .::::::::::
NP_068 LKQALAMGMMTEYYHYIFTTLDLFALDVEPYRYSGVNMTGFRILNTENTQVSSIIEKWSM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ERLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPR
:::::::.:..:::::.:::.::::::::..:..: .. :.:::::::.::::::.: :
NP_068 ERLQAPPKPDSGLLDGFMTTDAALMYDAVHVVSVAVQQFPQMTVSSLQCNRHKPWRFGTR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 FMNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNK
::.:::::.:.::::.:::::::::: :::::.::::::: :::: :. ::::::.:.:
NP_068 FMSLIKEAHWEGLTGRITFNKTNGLRTDFDLDVISLKEEGLEKIGTWDPASGLNMTESQK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 DKSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIY
: .::::::.::.::::::::::::...::::::::::::::::.:::.:::.:::: :
NP_068 GKPANITDSLSNRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 DVKLVPDGKYGAQND-KGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGI
...:: :::::::.: .:.:::::.:::::.::::::::.::::::::::::::::::::
NP_068 EIRLVEDGKYGAQDDANGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 SILYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPD
::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::::::::::.:::::::::::::
NP_068 SILYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYILLAYLGVSCVLFVIARFSPYEWYNPHPCNPD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 SDVVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 SDVVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAF
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 LTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALV
:::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::.:::::::::.:..::
NP_068 LTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLV
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 RNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKI
....::::::::.:::.:::::.::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_068 KSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKI
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE0 TIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVA
:::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::::
NP_068 TIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEESKEASALGVQNIGGIFIVLAAGLVLSVFVA
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE0 IGEFIYKSRKNNDIEQCLSFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCH---Q
.:::.:::.:: ..:. .:..::: .::: :...:.: .. . ... : .
NP_068 VGEFLYKSKKNAQLEKRSFCSAMVEELRMSLKCQRRLKHKPQAPVIVKTEEVINMHTFND
840 850 860 870 880 890
900
pF1KE0 RRTQRKETVA
:: :::.:
NP_068 RRLPGKETMA
900
>>XP_005267002 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glutamat (908 aa)
initn: 4721 init1: 2450 opt: 4753 Z-score: 5791.0 bits: 1082.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4753; 78.2% identity (92.4% similar) in 904 aa overlap (6-905:7-908)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFK
.:..: . : : :: .: : . .:::.::::: ::. :...:::::.
XP_005 MKIIFPILSNPVF--RRTVKLLLCLLWIGYSQGTTHVLRFGGIFEYVESGPMGAEELAFR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FAVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAV
:::..:::::::.:::::::: :.:::.::::::..:::::.:::::.::::::::..::
XP_005 FAVNTINRNRTLLPNTTLTYDTQKINLYDSFEASKKACDQLSLGVAAIFGPSHSSSANAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 QSICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYED
::::::: :::::::::: :::: ::..::::....:::::::: ...::::::::.:
XP_005 QSICNALGVPHIQTRWKHQVSDNKDSFYVSLYPDFSSLSRAILDLVQFFKWKTVTVVYDD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 STGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEI
::::::::::::::::::...::::::. .:::::::::::.::::.:::::::: :: :
XP_005 STGLIRLQELIKAPSRYNLRLKIRQLPADTKDAKPLLKEMKRGKEFHVIFDCSHEMAAGI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LKQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSM
::: : ::::::::::.::::::::::.: ::::::::::::.:: .: .::::::::::
XP_005 LKQALAMGMMTEYYHYIFTTLDLFALDVEPYRYSGVNMTGFRILNTENTQVSSIIEKWSM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ERLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPR
:::::::.:..:::::.:::.::::::::..:..: .. :.:::::::.::::::.: :
XP_005 ERLQAPPKPDSGLLDGFMTTDAALMYDAVHVVSVAVQQFPQMTVSSLQCNRHKPWRFGTR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 FMNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNK
::.:::::.:.::::.:::::::::: :::::.::::::: :::: :. ::::::.:.:
XP_005 FMSLIKEAHWEGLTGRITFNKTNGLRTDFDLDVISLKEEGLEKIGTWDPASGLNMTESQK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 DKSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIY
: .::::::.::.::::::::::::...::::::::::::::::.:::.:::.:::: :
XP_005 GKPANITDSLSNRSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 DVKLVPDGKYGAQND-KGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGI
...:: :::::::.: .:.:::::.:::::.::::::::.::::::::::::::::::::
XP_005 EIRLVEDGKYGAQDDANGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 SILYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPD
::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::::::::::.:::::::::::::
XP_005 SILYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYILLAYLGVSCVLFVIARFSPYEWYNPHPCNPD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 SDVVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SDVVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAF
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 LTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALV
:::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::.:::::::::.:..::
XP_005 LTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLV
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 RNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKI
....::::::::.:::.:::::.::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::
XP_005 KSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKI
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE0 TIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVA
:::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::::
XP_005 TIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEESKEASALGVQNIGGIFIVLAAGLVLSVFVA
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE0 IGEFIYKSRKNNDIEQCLSFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCH---Q
.:::.:::.:: ..:. .:..::: .::: :...:.: .. . ... : .
XP_005 VGEFLYKSKKNAQLEKRSFCSAMVEELRMSLKCQRRLKHKPQAPVIVKTEEVINMHTFND
840 850 860 870 880 890
900
pF1KE0 RRTQRKETVA
:: :::.:
XP_005 RRLPGKETMA
900
>>NP_786944 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ion (869 aa)
initn: 4667 init1: 2450 opt: 4683 Z-score: 5705.9 bits: 1067.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4683; 81.2% identity (94.4% similar) in 850 aa overlap (6-854:7-854)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFK
.:..: . : : :: .: : . .:::.::::: ::. :...:::::.
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:::..:::::::.:::::::: :.:::.::::::..:::::.:::::.::::::::..::
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::::::: :::::::::: :::: ::..::::....:::::::: ...::::::::.:
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::::::::::::::::::...::::::. .:::::::::::.::::.:::::::: :: :
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::: : ::::::::::.::::::::::.: ::::::::::::.:: .: .::::::::::
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:::::::.:..:::::.:::.::::::::..:..: .. :.:::::::.::::::.: :
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...:: :::::::.: .:.:::::.:::::.::::::::.::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 STGLIRLQELIKAPSRYNLRLKIRQLPADTKDAKPLLKEMKRGKEFHVIFDCSHEMAAGI
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pF1KE0 DVKLVPDGKYGAQND-KGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGI
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XP_011 EIRLVEDGKYGAQDDANGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGI
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