Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0088
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0088, 905 aa
1>>>pF1KE0088 905 - 905 aa - 905 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3887+/-0.00125; mu= 20.0374+/- 0.075
mean_var=63.6979+/-12.842, 0's: 0 Z-trim(100.6): 53 B-trim: 300 in 1/48
Lambda= 0.160698
statistics sampled from 6111 (6164) to 6111 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 3.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 905) 5990 1398.4 0
CCDS82656.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 934) 5670 1324.3 0
CCDS5048.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 908) 4753 1111.7 0
CCDS5049.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 869) 4683 1095.4 0
CCDS55045.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 892) 4683 1095.4 0
CCDS416.1 GRIK3 gene_id:2899|Hs108|chr1 ( 919) 4512 1055.8 0
CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 920) 3330 781.8 0
CCDS42913.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 918) 3017 709.2 8.8e-204
CCDS82659.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 949) 3010 707.6 2.8e-203
CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 980) 2429 572.9 1e-162
CCDS77305.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 981) 2402 566.6 7.8e-161
CCDS8433.1 GRIK4 gene_id:2900|Hs108|chr11 ( 956) 2315 546.4 9e-155
CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 2061 487.5 4.6e-137
CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 2061 487.5 4.6e-137
CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 2059 487.1 6.3e-137
CCDS58987.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 2059 487.1 6.4e-137
CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 884) 2033 481.1 4e-135
CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 902) 2033 481.1 4.1e-135
CCDS58989.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 837) 1993 471.8 2.4e-132
CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 1961 464.4 4.3e-130
CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 1958 463.7 7e-130
CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 1951 462.0 2.1e-129
CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 1950 461.8 2.5e-129
CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 836) 1943 460.2 7.3e-129
CCDS58986.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 826) 1846 437.7 4.3e-122
CCDS31236.1 GRID1 gene_id:2894|Hs108|chr10 (1009) 854 207.7 8.7e-53
CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 938) 799 195.0 5.6e-49
CCDS55354.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 943) 799 195.0 5.6e-49
CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 885) 776 189.6 2.1e-47
CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 901) 776 189.6 2.2e-47
CCDS55355.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 906) 776 189.6 2.2e-47
CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12 (1484) 688 169.3 4.7e-41
CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1281) 649 160.3 2.2e-38
CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1464) 649 160.3 2.4e-38
CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19 (1336) 642 158.6 6.9e-38
CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 ( 873) 621 153.7 1.4e-36
CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 (1233) 620 153.5 2.2e-36
CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9 (1115) 605 150.0 2.3e-35
CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19 (1043) 566 141.0 1.1e-32
CCDS41707.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 433) 522 130.6 6.2e-30
CCDS68758.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 ( 912) 393 100.8 1.2e-20
CCDS3637.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 (1007) 393 100.9 1.3e-20
>>CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 (905 aa)
initn: 5990 init1: 5990 opt: 5990 Z-score: 7497.1 bits: 1398.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5990; 100.0% identity (100.0% similar) in 905 aa overlap (1-905:1-905)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 VERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 SDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 AILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 EFIYKSRKNNDIEQCLSFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EFIYKSRKNNDIEQCLSFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQR
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 KETVA
:::::
CCDS33 KETVA
>>CCDS82656.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 (934 aa)
initn: 5670 init1: 5670 opt: 5670 Z-score: 7096.0 bits: 1324.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5922; 96.9% identity (96.9% similar) in 934 aa overlap (1-905:1-934)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNKD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 LYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 VERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 SDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 AILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFIVLAAGLVLSVFVAIG
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KE0 EFIYKSRKNNDIEQ-----------------------------CLSFNAIMEELGISLKN
:::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS82 EFIYKSRKNNDIEQKGKSSRIRFYFRNKVRFHGRKKQSLGVEKCLSFNAIMEELGISLKN
850 860 870 880 890 900
880 890 900
pF1KE0 QKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQRKETVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQRKETVA
910 920 930
>>CCDS5048.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 (908 aa)
initn: 4721 init1: 2450 opt: 4753 Z-score: 5947.2 bits: 1111.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4753; 78.2% identity (92.4% similar) in 904 aa overlap (6-905:7-908)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFK
.:..: . : : :: .: : . .:::.::::: ::. :...:::::.
CCDS50 MKIIFPILSNPVF--RRTVKLLLCLLWIGYSQGTTHVLRFGGIFEYVESGPMGAEELAFR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 FAVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAV
:::..:::::::.:::::::: :.:::.::::::..:::::.:::::.::::::::..::
CCDS50 FAVNTINRNRTLLPNTTLTYDTQKINLYDSFEASKKACDQLSLGVAAIFGPSHSSSANAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 QSICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYED
::::::: :::::::::: :::: ::..::::....:::::::: ...::::::::.:
CCDS50 QSICNALGVPHIQTRWKHQVSDNKDSFYVSLYPDFSSLSRAILDLVQFFKWKTVTVVYDD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 STGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEI
::::::::::::::::::...::::::. .:::::::::::.::::.:::::::: :: :
CCDS50 STGLIRLQELIKAPSRYNLRLKIRQLPADTKDAKPLLKEMKRGKEFHVIFDCSHEMAAGI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LKQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSM
::: : ::::::::::.::::::::::.: ::::::::::::.:: .: .::::::::::
CCDS50 LKQALAMGMMTEYYHYIFTTLDLFALDVEPYRYSGVNMTGFRILNTENTQVSSIIEKWSM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ERLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPR
:::::::.:..:::::.:::.::::::::..:..: .. :.:::::::.::::::.: :
CCDS50 ERLQAPPKPDSGLLDGFMTTDAALMYDAVHVVSVAVQQFPQMTVSSLQCNRHKPWRFGTR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 FMNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLNMTDSNK
::.:::::.:.::::.:::::::::: :::::.::::::: :::: :. ::::::.:.:
CCDS50 FMSLIKEAHWEGLTGRITFNKTNGLRTDFDLDVISLKEEGLEKIGTWDPASGLNMTESQK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
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: .::::::.::.::::::::::::...::::::::::::::::.:::.:::.:::: :
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...:: :::::::.: .:.:::::.:::::.::::::::.::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::::::::::.:::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 SDVVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAF
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:::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::.:::::::::.:..::
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....::::::::.:::.:::::.::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::::
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.:::.:::.:: ..:. .:..::: .::: :...:.: .. . ... : .
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::::::::::::::::::::::::::::.::: :::::::::::::.:::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::::
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CCDS50 VGEFLYKSKKNAQLEKESSIWLVPPYHPDTV
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10 20 30 40 50
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::::::::::::::::::...::::::. .:::::::::::.::::.:::::::: :: :
CCDS55 STGLIRLQELIKAPSRYNLRLKIRQLPADTKDAKPLLKEMKRGKEFHVIFDCSHEMAAGI
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::: : ::::::::::.::::::::::.: ::::::::::::.:: .: .::::::::::
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:::::::.:..:::::.:::.::::::::..:..: .. :.:::::::.::::::.: :
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CCDS55 FMSLIKEAHWEGLTGRITFNKTNGLRTDFDLDVISLKEEGLEKIGTWDPASGLNMTESQK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS55 LTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLV
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pF1KE0 RNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKI
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CCDS55 KSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKI
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:::::::::::::::::::::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS55 TIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEESKEASALGVQNIGGIFIVLAAGLVLSVFVA
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.:::.:::.:: ..:.
CCDS55 VGEFLYKSKKNAQLEKRAKTKLPQDYVFLPILESVSISTVLSSSPSSSSLSSCS
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CCDS41 MNAEEHAFRFSANIINRNRTLLPNTTLTYDIQRIHFHDSFEATKKACDQLALGVVAIFGP
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:: ::.: ::::.::::.:.::::.:.::::.::: :::::::::::.: ::.:.:. .
CCDS41 HKAWRFGGRFMNFIKEAQWEGLTGRIVFNKTSGLRTDFDLDIISLKEDGLEKVGVWSPAD
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CCDS41 GLNITEVAKGRGPNVTDSLTNRSLIVTTVLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKE
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CCDS41 LAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFS
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. ::::: :.:::::::::::::::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS41 DAHPCNPGSEVVENNFTLLNSFWFGMGSLMQQGSELMPKALSTRIIGGIWWFFTLIIISS
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CCDS41 YTANLAAFLTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMS
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:. .:::.:..:::::.::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::.
CCDS41 SKP-SALVKNNEEGIQRALTADYALLMESTTIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPM
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CCDS41 GSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCPEEENKEASALGIQKIGGIFIVLAAG
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CCDS41 LVLSVLVAVGEFVYKLRKTAEREQRSFCSTVADEIRFSLTCQRRVKHKPQPPMMVKTDAV
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pF1KE0 LTCH---QRRTQRKETVA
.. : .:: :...:
CCDS41 INMHTFNDRRLPGKDSMACSTSLAPVFP
900 910
>>CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 (920 aa)
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CCDS82 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS82 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKAAGEVSKHLYKVWKKIGI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IIISSYTANLAAFLTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 WAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VLAAGLVLSVFVAIGEFIYKSRKNNDIEQCLSFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKS
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890 900
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::::::::::::::::::::
CCDS82 SFTSILTCHQRRTQRKETVA
910 920
>>CCDS42913.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 (918 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS42 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKAAGEVSKHLYKVWKKIGI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VIDFSKPFMTLGISILYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PYEWYNPHPCNPDSDVVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IIISSYTANLAAFLTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYG
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770 780 790 800 810 820
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFI
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KE0 VLAAGLVLSVFVAIGEFIYKSRKNNDIEQCLSFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKS
::::::::::::::::::::::::::::: . :
CCDS42 VLAAGLVLSVFVAIGEFIYKSRKNNDIEQAFCFFYGLQCKQTHPTNSTSGTTLSTDLECG
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890 900
pF1KE0 SFTSILTCHQRRTQRKETVA
CCDS42 KLIREERGIRKQSSVHTV
910
>>CCDS82659.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 (949 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFKF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSSVSAVQ
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SICNALEVPHIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVVYEDS
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETAAEIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEKWSME
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHRASQLTVSSLQCHRHKPWRLGPRF
310 320 330 340 350 360
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pF1KE0 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEK---------------IGI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS82 MNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKAAGEVSKHLYKVWKKIGI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 WNSNSGLNMTDSNKDKSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VIDFSKPFMTLGISILYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PYEWYNPHPCNPDSDVVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IIISSYTANLAAFLTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 WAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYG
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KE0 VGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCPEEDNKEASALGVENIGGIFI
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830 840 850
pF1KE0 VLAAGLVLSVFVAIGEFIYKSRKNNDIEQ-----------------------------CL
::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS82 VLAAGLVLSVFVAIGEFIYKSRKNNDIEQKGKSSRIRFYFRNKVRFHGRKKQSLGVEKCL
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860 870 880 890 900
pF1KE0 SFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQRKETVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SFNAIMEELGISLKNQKKIKKKSRTKGKSSFTSILTCHQRRTQRKETVA
910 920 930 940
>>CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 (980 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYILPQTAPQVLRIGGIFETVENEPV--NVEELAF
:: .: . . . ::: . .... : :.::.
CCDS12 MPAELLLLLIVAFASPSCQVLSSLRMAAILDDQTVCGRGERLAL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 KFAVTSINRNRTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHS-SSVS
.: .:: . .. . :: ... ...:.. :. : ::....::: : .:.:
CCDS12 ALAREQINGIIEVPAKARVEVDIFELQRDSQYETTDTMCQILPKGVVSVLGPSSSPASAS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AVQSICNALEVPHIQTRWKH-PSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWKTVTVV
.:. ::. :.:::.. .. : .. . ..:::. .: :. .. .:. .....
CCDS12 TVSHICGEKEIPHIKVGPEETPRLQYLRFASVSLYPSNEDVSLAVSRILKSFNYPSASLI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 YEDSTGLIRLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIFDCSHETA
. :.::.::... . ...:.: . ..: :::::.. : .:.: . .
CCDS12 CAKAECLLRLEELVRGFLISKETLSVRML-DDSRDPTPLLKEIRDDKVSTIIIDANASIS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 AEILKQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPHVSSIIEK
::.. .:: . .:.:..::.:. : :. .. :. :: ..: ..: ....
CCDS12 HLILRKASELGMTSAFYKYILTTMDFPILHLDGIVEDSSNILGFSMFNTSHPFYPEFVRS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 WSMERLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIAS---HRASQLTVSSLQCHRHKP
.: . :.. : . ::::.:::..:. : .:.... :. : : .
CCDS12 LNMSWRENC---EASTYLGPALS-AALMFDAVHVVVSAVRELNRSQEIGVKPLACTSANI
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 WRLGPRFMNLIKEARWDGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKIGIWNSNSGLN
: : .:: .. ...:::::.. :: ..: : .. : :. ...: ..::.: :: :
CCDS12 WPHGTSLMNYLRMVEYDGLTGRVEFN-SKGQRTNYTLRILEKSRQGHREIGVWYSNRTLA
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 MTDSNKDKSSNITDSLANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSN
:. .. : :....:::.::.::::::.:::: : . . : ::.::::.:.:.:.::..
CCDS12 MNATTLDI--NLSQTLANKTLVVTTILENPYVMRRPNFQALSGNERFEGFCVDMLRELAE
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 ILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPF
.: : : ..:: :: ::: . .: :.::: :::...:::::: .::: :::::::::::
CCDS12 LLRFRYRLRLVEDGLYGAPEPNGSWTGMVGELINRKADLAVAAFTITAEREKVIDFSKPF
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 MTLGISILYRKPNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPH
:::::::::: : .:: ::::.:.:: .:...::: :.::::::. ::..::::::::
CCDS12 MTLGISILYRVHMGRKPGYFSFLDPFSPAVWLFMLLAYLAVSCVLFLAARLSPYEWYNPH
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 PC-NPDSDVVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYT
:: ..::..:: ::.:: ::..::::::.::.::::: :.:.:: ::::::::::
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