Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9968
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9968, 700 aa
1>>>pF1KB9968 700 - 700 aa - 700 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5945+/-0.000979; mu= 18.8171+/- 0.059
mean_var=89.8780+/-17.873, 0's: 0 Z-trim(106.6): 108 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.135284
statistics sampled from 8962 (9078) to 8962 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 3.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 700) 4739 935.7 0
CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 642) 4284 846.8 0
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 3146 624.8 1.5e-178
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 3146 624.8 1.5e-178
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 1952 392.1 4.1e-108
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 1952 392.1 4.1e-108
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 1927 387.1 1e-106
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 1927 387.1 1e-106
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 1921 385.9 2.2e-106
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 1921 386.0 2.7e-106
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 1918 385.4 3.4e-106
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501) 1903 382.4 2.6e-105
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 1903 382.4 2.6e-105
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 1903 382.5 3.1e-105
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 1877 377.5 1.1e-103
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 1874 376.8 1.3e-103
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439) 1490 301.8 4.6e-81
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440) 1490 301.8 4.6e-81
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1452) 1473 298.5 4.6e-80
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1465) 1473 298.5 4.6e-80
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1446) 1468 297.5 9e-80
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1462) 1468 297.5 9.1e-80
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441) 1467 297.3 1e-79
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1460) 1467 297.3 1e-79
CCDS335.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1436) 1310 266.7 1.7e-70
CCDS334.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1446) 1310 266.7 1.7e-70
CCDS53290.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1433) 1299 264.5 7.6e-70
CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 1293 263.5 2.5e-69
CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 1288 262.4 3.4e-69
CCDS44098.2 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1440) 1276 260.0 1.7e-68
CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445) 1172 239.8 2.2e-62
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 992 204.5 7e-52
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 992 204.6 7.7e-52
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 ( 937) 743 155.9 2.6e-37
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 (1115) 743 155.9 2.9e-37
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 744 156.3 3.8e-37
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 744 156.3 3.8e-37
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1997) 744 156.3 4e-37
CCDS81713.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2127) 744 156.4 4.2e-37
CCDS44943.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2215) 744 156.4 4.3e-37
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11 (1337) 736 154.6 8.6e-37
CCDS73501.1 PTPRQ gene_id:374462|Hs108|chr12 (2299) 701 148.0 1.5e-34
CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 595) 684 144.2 5.3e-34
CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 597) 684 144.2 5.3e-34
CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 624) 683 144.0 6.3e-34
CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 377) 642 135.8 1.1e-31
CCDS44837.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 405) 640 135.5 1.5e-31
CCDS8674.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1188) 642 136.2 2.6e-31
CCDS8675.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1216) 640 135.9 3.5e-31
CCDS11864.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 353) 596 126.8 5.3e-29
>>CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 (700 aa)
initn: 4739 init1: 4739 opt: 4739 Z-score: 5000.2 bits: 935.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4739; 100.0% identity (100.0% similar) in 700 aa overlap (1-700:1-700)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MEPLCPLLLVGFSLPLARALRGNETTADSNETTTTSGPPDPGASQPLLAWLLLPLLLLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MEPLCPLLLVGFSLPLARALRGNETTADSNETTTTSGPPDPGASQPLLAWLLLPLLLLLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 VLLLAAYFFRFRKQRKAVVSTSDKKMPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VLLLAAYFFRFRKQRKAVVSTSDKKMPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPKKYFPIPVEHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 EEEIRIRSADDCKQFREEFNSLPSGHIQGTFELANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EEEIRIRSADDCKQFREEFNSLPSGHIQGTFELANKEENREKNRYPNILPNDHSRVILSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LDGIPCSDYINASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMVWEQKSATIVMLTNLKERK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LDGIPCSDYINASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMVWEQKSATIVMLTNLKERK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 EEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCVEDCVVLVDYTIRKFCIQPQLPDGCKAPRLVSQLHFTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCVEDCVVLVDYTIRKFCIQPQLPDGCKAPRLVSQLHFTS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 WPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTLNPVHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMAMMHAEQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 WPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTLNPVHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMAMMHAEQK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 VDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVSSLEKHLQTMHGTTTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVSSLEKHLQTMHGTTTH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 FDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 FDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 YINASFIDGYRQKDYFIATQGPLAHTVEDFWRMIWEWKSHTIVMLTEVQEREQDKCYQYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YINASFIDGYRQKDYFIATQGPLAHTVEDFWRMIWEWKSHTIVMLTEVQEREQDKCYQYW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 PTEGSVTHGEITIEIKNDTLSEAISIRDFLVTLNQPQARQEEQVRVVRQFHFHGWPEIGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PTEGSVTHGEITIEIKNDTLSEAISIRDFLVTLNQPQARQEEQVRVVRQFHFHGWPEIGI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 PAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB9 AVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK
670 680 690 700
>>CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 (642 aa)
initn: 4284 init1: 4284 opt: 4284 Z-score: 4520.8 bits: 846.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4284; 100.0% identity (100.0% similar) in 630 aa overlap (71-700:13-642)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 PGASQPLLAWLLLPLLLLLLVLLLAAYFFRFRKQRKAVVSTSDKKMPNGILEEQEQQRVM
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MSNRSSFSRLTWFRKQRKAVVSTSDKKMPNGILEEQEQQRVM
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 LLSRSPSGPKKYFPIPVEHLEEEIRIRSADDCKQFREEFNSLPSGHIQGTFELANKEENR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LLSRSPSGPKKYFPIPVEHLEEEIRIRSADDCKQFREEFNSLPSGHIQGTFELANKEENR
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 EKNRYPNILPNDHSRVILSQLDGIPCSDYINASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EKNRYPNILPNDHSRVILSQLDGIPCSDYINASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWR
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 MVWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCVEDCVVLVDYTIRKFCIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MVWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCVEDCVVLVDYTIRKFCIQ
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 PQLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTLNPVHAGPIVVHCSAGVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PQLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTLNPVHAGPIVVHCSAGVG
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 RTGTFIVIDAMMAMMHAEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RTGTFIVIDAMMAMMHAEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDT
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 ELDVSSLEKHLQTMHGTTTHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ELDVSSLEKHLQTMHGTTTHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQI
350 360 370 380 390 400
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pF1KB9 IPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLAHTVEDFWRMIWEWKSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLAHTVEDFWRMIWEWKSH
410 420 430 440 450 460
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pF1KB9 TIVMLTEVQEREQDKCYQYWPTEGSVTHGEITIEIKNDTLSEAISIRDFLVTLNQPQARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TIVMLTEVQEREQDKCYQYWPTEGSVTHGEITIEIKNDTLSEAISIRDFLVTLNQPQARQ
470 480 490 500 510 520
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pF1KB9 EEQVRVVRQFHFHGWPEIGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EEQVRVVRQFHFHGWPEIGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTF
530 540 550 560 570 580
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 IALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK
590 600 610 620 630 640
>>CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 (793 aa)
initn: 3130 init1: 1423 opt: 3146 Z-score: 3319.1 bits: 624.8 E(32554): 1.5e-178
Smith-Waterman score: 3146; 68.0% identity (85.5% similar) in 682 aa overlap (22-700:123-793)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEPLCPLLLVGFSLPLARALRGNETTADSNETTTTSGPPDPGASQPLLAWL
:: .:: :: . ::. :..: .
CCDS13 STNSIGITISPNGTWLPDNQFTDARTEPWEGNSSTA---ATTPETFPPSD--ETPIIAVM
100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 L-LPLLLLLLVLLLAAYFFRFRKQRKAVVSTSDKKMPNGILEEQEQQRVMLLSRSPSGPK
. : ::... .... :..::.: ..: ... .. :: :. : : : ::.:::: .
CCDS13 VALSSLLVIVFIIIVLYMLRFKKYKQAGSHSNSFRLSNGRTEDVEPQSVPLLARSPSTNR
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 KYFPIPVEHLEEEIRIRSADDCKQFREEFNSLPSGHIQGTFELANKEENREKNRYPNILP
:: :.::..::::: : ::: : ::::::.::. ::.: : :.::::.::::: ::::
CCDS13 KYPPLPVDKLEEEINRRMADDNKLFREEFNALPACPIQATCEAASKEENKEKNRYVNILP
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 NDHSRVILSQLDGIPCSDYINASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMVWEQKSATI
::::: :. ..:.: :::::::.:.::.::::::::::::.:::::::::.:::..:::
CCDS13 YDHSRVHLTPVEGVPDSDYINASFINGYQEKNKFIAAQGPKEETVNDFWRMIWEQNTATI
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280
pF1KB9 VMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCVEDCVVLVDYTIRKFCIQPQLPDGC--K
::.:::::::: :: :::::::::::::::: ::: .::::::.:::::: :. : :
CCDS13 VMVTNLKERKECKCAQYWPDQGCWTYGNIRVSVEDVTVLVDYTVRKFCIQ-QVGDMTNRK
330 340 350 360 370 380
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 APRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTLNPVHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVI
::..:.:::::::::::::::::::::::::. :: .:: :::::::::::::::.::
CCDS13 PQRLITQFHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKACNPQYAGAIVVHCSAGVGRTGTFVVI
390 400 410 420 430 440
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 DAMMAMMHAEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVSSLE
:::. :::.:.::::. :::::: :: :::::::::.::::::::.::::::::.:.:::
CCDS13 DAMLDMMHTERKVDVYGFVSRIRAQRCQMVQTDMQYVFIYQALLEHYLYGDTELEVTSLE
450 460 470 480 490 500
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 KHLQTMHGTTTHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKENMRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRV
::: ... .. ::::::.:::...:....:::::::::::: ::.:::::.::::
CCDS13 THLQKIYNKIPGTSNNGLEEEFKKLTSIKIQNDKMRTGNLPANMKKNRVLQIIPYEFNRV
510 520 530 540 550 560
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 ILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGPLAHTVEDFWRMIWEWKSHTIVMLTEV
:. .:::.: :::.:::::::::::: .::.:::: ::.:::::::::::: .::::::.
CCDS13 IIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQKDSYIASQGPLLHTIEDFWRMIWEWKSCSIVMLTEL
570 580 590 600 610 620
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 QEREQDKCYQYWPTEGSVTHGEITIEIKNDTLSEAISIRDFLVTLNQPQARQEEQVRVVR
.:: :.:: ::::..: :..:.::.:.:.. :. ..::.::: .:.. : .:
CCDS13 EERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECESYTVRDLLVT-----NTRENKSRQIR
630 640 650 660 670 680
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 QFHFHGWPEIGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILE
:::::::::.:::..:::::..::::::::::.::::::::::::::::::: :::..::
CCDS13 QFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPITVHCSAGAGRTGTFCALSTVLE
690 700 710 720 730 740
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CCDS13 RVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQEYIDAFSDYANFK
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CCDS13 STNRKYPPLPVDKLEEEINRRMADDNKLFREEFNALPACPIQATCEAASKEENKEKNRYV
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CCDS13 TATIVMVTNLKERKECKCAQYWPDQGCWTYGNIRVSVEDVTVLVDYTVRKFCIQ-QVGDM
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CCDS13 TSLETHLQKIYNKIPGTSNNGLEEEFKKLTSIKIQNDKMRTGNLPANMKKNRVLQIIPYE
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CCDS13 FNRVIIPVKRGEENTDYVNASFIDGYRQKDSYIASQGPLLHTIEDFWRMIWEWKSCSIVM
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CCDS13 LTELEERGQEKCAQYWPSDGLVSYGDITVELKKEEECESYTVRDLLVT-----NTRENKS
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pF1KB9 RVVRQFHFHGWPEIGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSAGAGRTGTFIALS
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CCDS13 RQIRQFHFHGWPEVGIPSDGKGMISIIAAVQKQQQQSGNHPITVHCSAGAGRTGTFCALS
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650 660 670 680 690 700
pF1KB9 NILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK
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CCDS13 TVLERVKAEGILDVFQTVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQEYIDAFSDYANFK
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10 20
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pF1KB9 -NHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEF
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pF1KB9 CYKVVQDFIDIFSDYANFK
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CCDS49 CYRAALEYLGSFDHYAT
1890
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10 20
pF1KB9 MEPLCP------LLLVGFSLPLARALRGNETT
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CCDS48 SDEIVVQVT---PAQQQEEPEMLWVTGPVLAVILIILIVIAILLFKRKRTHSPSSKDEQS
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CCDS48 IGLKDSLLAHSSDPVEMRRLNYQTPGMRDHPPIPITDLADNIERLKANDGLKFSQEYESI
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pF1KB9 KFIAAQGPKQETVNDFWRMVWEQKSATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVC
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CCDS48 AYIATQGPLPETMGDFWRMVWEQRTATVVMMTRLEEKSRVKCDQYWPARGTETCGLIQVT
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pF1KB9 VEDCVVLVDYTIRKFCIQPQLPDGCKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKT
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CCDS48 LLDTVELATYTVRTFALH---KSGSSEKRELRQFQFMAWPDHGVPEYPTPILAFLRRVKA
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pF1KB9 LNPVHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVIDAMMAMMHAEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDM
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CCDS48 CNPLDAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERMKHEKTVDIYGHVTCMRSQRNYMVQTED
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pF1KB9 QYTFIYQALLEYYLYGDTELDVSSLEKHLQTMHGTTTHFDKIGLEEEFRKLTNVRIMKEN
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CCDS48 QYVFIHEALLEAATCGHTEVPARNLYAHIQKLGQVPPGESVTAMELEFKLLASSKAHTSR
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pF1KB9 MRTGNLPANMKKARVIQIIPYDFNRVILSMKRGQEYTDYINASFIDGYRQKDYFIATQGP
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CCDS48 FISANLPCNKFKNRLVNIMPYELTRVCLQPIRGVEGSDYINASFLDGYRQQKAYIATQGP
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::...::::::.:: .: :::::...: ..::.::::.: :. . .... .
CCDS48 LAESTEDFWRMLWEHNSTIIVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMP
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pF1KB9 AISIRDFLVTLNQPQARQEEQVRVVRQFHFHGWPEIGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTG
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CCDS48 QYILREFKVT----DAR-DGQSRTIRQFQFTDWPEQGVPKTGEGFIDFIGQVHKTKEQFG
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pF1KB9 -NHPITVHCSAGAGRTGTFIALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEF
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CCDS48 QDGPITVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDMFQTVKTLRTQRPAMVQTEDQYQL
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pF1KB9 CYKVVQDFIDIFSDYANFK
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CCDS48 CYRAALEYLGSFDHYAT
1900
>>CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502 aa)
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pF1KB9 MEPLCPLLLVGFSLPLARALRGNETTADSNETTTTSGPPDPGASQPL-LAWLLL
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CCDS55 GFTNKQLQSGQEYVFFVLAVMEHAESKMYATSPYSDPVVSMDLDPQPITDEEEGLIWVVG
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CCDS55 PVLAVVFIICIVIAILLYKSKPDRKRAESDSRKSSIPNNKEIPSHHPTDPVELRRLNFQT
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CCDS55 PGMASHPPIPILELADHIERLKANDNLKFSQEYESIDPGQ-QFTWEHSNLEVNKPKNRYA
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pF1KB9 NILPNDHSRVILSQLDGIPCSDYINASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMVWEQK
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CCDS55 NVIAYDHSRVLLSAIEGIPGSDYVNANYIDGYRKQNAYIATQGSLPETFGDFWRMIWEQR
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pF1KB9 SATIVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCVEDCVVLVDYTIRKFCIQPQLPDG
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CCDS55 SATVVMMTKLEERSRVKCDQYWPSRGTETHGLVQVTLLDTVELATYCVRTFALYK---NG
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pF1KB9 CKAPRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTLNPVHAGPIVVHCSAGVGRTGTFI
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CCDS55 SSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEHPTPFLAFLRRVKTCNPPDAGPMVVHCSAGVGRTGCFI
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pF1KB9 VIDAMMAMMHAEQKVDVFEFVSRIRNQRPQMVQTDMQYTFIYQALLEYYLYGDTELDVSS
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CCDS55 VIDAMLERIKHEKTVDIYGHVTLMRAQRNYMVQTEDQYIFIHDALLEAVTCGNTEVPARN
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CCDS55 LYAYIQKLTQIETGENVTGMELEFKRLASSKAHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYEST
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CCDS55 RVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTEDFWRMLWEHNSTIVVMLT
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CCDS55 KLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREFKVT----DAR-DGQSRT
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CCDS55 VRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAGVGRTGVFITLSI
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CCDS55 VLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDQYQFSYRAALEYLGSFDHYAT
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CCDS43 ASHPPIPILELADHIERLKANDNLKFSQEYESIDPGQ-QFTWEHSNLEVNKPKNRYANVI
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pF1KB9 PNDHSRVILSQLDGIPCSDYINASYIDGYKEKNKFIAAQGPKQETVNDFWRMVWEQKSAT
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CCDS43 AYDHSRVLLSAIEGIPGSDYVNANYIDGYRKQNAYIATQGSLPETFGDFWRMIWEQRSAT
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pF1KB9 IVMLTNLKERKEEKCHQYWPDQGCWTYGNIRVCVEDCVVLVDYTIRKFCIQPQLPDGCKA
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CCDS43 VVMMTKLEERSRVKCDQYWPSRGTETHGLVQVTLLDTVELATYCVRTFALYK---NGSSE
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pF1KB9 PRLVSQLHFTSWPDFGVPFTPIGMLKFLKKVKTLNPVHAGPIVVHCSAGVGRTGTFIVID
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CCDS43 KREVRQFQFTAWPDHGVPEHPTPFLAFLRRVKTCNPPDAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVID
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]