Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9966
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9966, 695 aa
1>>>pF1KB9966 695 - 695 aa - 695 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0814+/-0.00176; mu= 5.9171+/- 0.101
mean_var=310.4809+/-95.651, 0's: 0 Z-trim(101.5): 183 B-trim: 414 in 1/49
Lambda= 0.072787
statistics sampled from 6390 (6551) to 6390 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 3.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 695) 4582 497.0 3.8e-140
CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 669) 3540 387.6 3.2e-107
CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs108|chr2 ( 699) 2284 255.7 1.7e-67
CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 ( 764) 1561 179.8 1.3e-44
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 652 84.5 7.8e-16
CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 883) 577 76.6 1.8e-13
CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 835) 576 76.4 1.8e-13
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 907) 576 76.5 1.9e-13
CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 828) 552 73.9 1e-12
CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 915) 552 74.0 1.1e-12
CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 552 74.0 1.1e-12
>>CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 (695 aa)
initn: 4582 init1: 4582 opt: 4582 Z-score: 2629.5 bits: 497.0 E(32554): 3.8e-140
Smith-Waterman score: 4582; 99.7% identity (100.0% similar) in 695 aa overlap (1-695:1-695)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRV
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CCDS18 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 IQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLYINPEAFQNLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 IQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLYINPEAFQNLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NLQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQKVLLDIQDNINIHTIERNSFVGLSFESVILWLNKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NLQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQKVLLDIQDNINIHTIERNSFVGLSFESVILWLNKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 GIQEIHNCAFNGTQLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVILDISRTRIHSLPSYGLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GIQEIHNCAFNGTQLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVILDISRTRIHSLPSYGLEN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELHPICNKSILRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELHPICNKSILRQE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 VDYMTQTRGQRSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIM
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VDYMTQARGQRSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 GYNILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GYNILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 VDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 VQLRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VQLRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 AFVVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AFVVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 LITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB9 TVHNTHPRNGHCSSAPRVTNGSTYILVPLSHLAQN
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS18 TVHNTHPRNGHCSSAPRVTSGSTYILVPLSHLAQN
670 680 690
>>CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 (669 aa)
initn: 3473 init1: 3473 opt: 3540 Z-score: 2038.3 bits: 387.6 E(32554): 3.2e-107
Smith-Waterman score: 4358; 96.0% identity (96.3% similar) in 695 aa overlap (1-695:1-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIELRFVLTKLRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 IQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLYINPEAFQNLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 IQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLYINPEAFQNLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NLQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQKVLLDIQDNINIHTIERNSFVGLSFESVILWLNKN
::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS18 NLQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQKVLL--------------------------WLNKN
130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 GIQEIHNCAFNGTQLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVILDISRTRIHSLPSYGLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GIQEIHNCAFNGTQLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVILDISRTRIHSLPSYGLEN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELHPICNKSILRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELHPICNKSILRQE
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 VDYMTQTRGQRSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIM
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VDYMTQARGQRSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIM
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 GYNILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GYNILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIAS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 VDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 VQLRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VQLRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 AFVVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AFVVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVP
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 LITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSS
580 590 600 610 620 630
670 680 690
pF1KB9 TVHNTHPRNGHCSSAPRVTNGSTYILVPLSHLAQN
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS18 TVHNTHPRNGHCSSAPRVTSGSTYILVPLSHLAQN
640 650 660
>>CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs108|chr2 (699 aa)
initn: 2331 init1: 1538 opt: 2284 Z-score: 1325.3 bits: 255.7 E(32554): 1.7e-67
Smith-Waterman score: 2290; 53.0% identity (79.7% similar) in 681 aa overlap (2-674:7-670)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MALLLVSLLAFLS--LGSGCHHRICH--CSNRVFLCQESKVTEIPSDLPRNAI-E
:: :..:: .:. : . .. .: :. : . . . :. : .. .
CCDS18 MKQRFSALQLLKLLLLLQPPLPRALREALCPEPCN-----CVPDGALRCPG--PTAGLTR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLY
: .. ..:: . :: :.... :::::: : :: :::..:.:: .: :: :....:: :
CCDS18 LSLAYLPVKVIPSQAFRGLNEVIKIEISQIDSLERIEANAFDNLLNLSEILIQNTKNLRY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB9 INPEAFQNLPNLQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQK-VLLDIQDNINIHTIERNSFVGLS
:.: :: ::: :.:: : ::::...::: :. : .. .:.: ::..: :: :.: :..
CCDS18 IEPGAFINLPRLKYLSICNTGIRKFPDVTKVFSSESNFILEICDNLHITTIPGNAFQGMN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 FESVILWLNKNGIQEIHNCAFNGTQLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVILDISRTR
::: : : ::..:... ::::: : :.:..: .::.. : .:.::.:: :::: :.
CCDS18 NESVTLKLYGNGFEEVQSHAFNGTTLTSLELKENVHLEKMHNGAFRGATGPKTLDISSTK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 IHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISELH
...:::::::....: : :.:.:::::. : .: :.::.:::::::::: : . ...
CCDS18 LQALPSYGLESIQRLIATSSYSLKKLPSRETFVNLLEATLTYPSHCCAFRNLPTKEQNFS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 PICNKSILRQEVDYMTQTRGQR--SSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLCNEVVDVTCS
.... .: . . .. .. ::. ..: : :.: ..: .: . :.
CCDS18 HSISENFSKQCESTVRKVNNKTLYSSMLAESELS---GWD-----YEYGFCLPKTP-RCA
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 PKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFA
:.:::::::::::::..::::::.:.:::: ::. :: .: ::.:::::::::::::.::
CCDS18 PEPDAFNPCEDIMGYDFLRVLIWLINILAIMGNMTVLFVLLTSRYKLTVPRFLMCNLSFA
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 DLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLER
:.:.:.::::::::: .::.::.:.:::::::.::..:::::::::::::::::.:::::
CCDS18 DFCMGLYLLLIASVDSQTKGQYYNHAIDWQTGSGCSTAGFFTVFASELSVYTLTVITLER
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 WHTITHAMQLDCKVQLRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLS
:::::.:..:: :..:::: .:. ::.:. :..:. :.:.:::::::.:::... ::
CCDS18 WHTITYAIHLDQKLRLRHAILIMLGGWLFSSLIAMLPLVGVSNYMKVSICFPMDVETTLS
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 QLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAP
:.:....:.:::.:: .::.:::.::..::::.......::.:::.::.:::::: ::::
CCDS18 QVYILTILILNVVAFFIICACYIKIYFAVRNPELMATNKDTKIAKKMAILIFTDFTCMAP
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 ISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCY
::::::::..:::::::...:.:::::.::::::::::::::::.:.::::.:::: ::
CCDS18 ISFFAISAAFKVPLITVTNSKVLLVLFYPINSCANPFLYAIFTKTFQRDFFLLLSKFGCC
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690
pF1KB9 EMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNGHCSSAPRVTNGSTYILVPLSHLAQN
. .:..:: . :. .... .:: .:
CCDS18 KRRAELYRRKDFSA-YTSNCKNGFTGSNKPSQSTLKLSTLHCQGTALLDKTRYTEC
650 660 670 680 690
>>CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 (764 aa)
initn: 2216 init1: 1540 opt: 1561 Z-score: 914.6 bits: 179.8 E(32554): 1.3e-44
Smith-Waterman score: 2119; 49.1% identity (74.5% similar) in 691 aa overlap (15-655:21-707)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSN----RVFLCQESKVTEIPSDLPRNAIE
: :: :.: . :: :.. . .::: :: ..
CCDS98 MRPADLLQLVLLLDLPRDLGGMGCSSPPCECHQEEDFRV-TCKD--IQRIPS-LPPSTQT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEIRIEKANNLLY
:... :.::.: . :::.. .. .: .: . .:. .:. : :: :. .:.:... :: :
CCDS98 LKLIETHLRTIPSHAFSNLPNISRIYVSIDVTLQQLESHSFYNLSKVTHIEIRNTRNLTY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB9 INPEAFQNLPNLQYLLISNTGIKHLPDVHKIHSLQKV-LLDIQDNINIHTIERNSFVGLS
:.:.:...:: :..: : :::.: .::. :..: . .:.: :: . .: :.: ::
CCDS98 IDPDALKELPLLKFLGIFNTGLKMFPDLTKVYSTDIFFILEITDNPYMTSIPVNAFQGLC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 FESVILWLNKNGIQEIHNCAFNGTQLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGA-SGPVILDISRT
:.. : : .::. ... :::::.:: . :. :. : . .:.: :. ::: .::.:.:
CCDS98 NETLTLKLYNNGFTSVQGYAFNGTKLDAVYLNKNKYLTVIDKDAFGGVYSGPSLLDVSQT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 RIHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFANWRRQISEL
. .::: :::.::.: ::.:..::::: ... : .:.:.:::::::: : .. . :
CCDS98 SVTALPSKGLEHLKELIARNTWTLKKLPLSLSFLHLTRADLSYPSHCCAFKNQKKIRGIL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KB9 HPI-CNKSIL-----RQEVDYMTQTRGQ---------------RSSLAEDNESSYSR---
. . ::.: . :. :. ... : .:.. . .....
CCDS98 ESLMCNESSMQSLRQRKSVNALNSPLHQEYEENLGDSIVGYKEKSKFQDTHNNAHYYVFF
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360
pF1KB9 --------GFDMTY------------TEFDYDLCNEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNI
:: . ...:: .:.. :..:.:: : ::::::::::..
CCDS98 EEQEDEIIGFGQELKNPQEETLQAFDSHYDYTICGDSEDMVCTPKSDEFNPCEDIMGYKF
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIH
::...::.:.::. ::..::.:: ::.:::.:::::::::::::.:.:.:::::::::..
CCDS98 LRIVVWFVSLLALLGNVFVLLILLTSHYKLNVPRFLMCNLAFADFCMGMYLLLIASVDLY
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 TKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVYTLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLR
:.:.:.:.::::::: ::..:::::::::::::::::.::::::..:: ::.:: :..::
CCDS98 THSEYYNHAIDWQTGPGCNTAGFFTVFASELSVYTLTVITLERWYAITFAMRLDRKIRLR
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 HAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICLPMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAFVV
:: ..:: ::. : ::.:. ::::: ::::::::: ..::. :.. .:.::..:::.
CCDS98 HACAIMVGGWVCCFLLALLPLVGISSYAKVSICLPMDTETPLALAYIVFVLTLNIVAFVI
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 ICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITV
.: ::..::.:::::. ...::.::::::.::::::.:::::::.:.:: :. :::::
CCDS98 VCCCYVKIYITVRNPQYNPGDKDTKIAKRMAVLIFTDFICMAPISFYALSAILNKPLITV
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 SKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFFILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHN
:..:::::::.:.:::::::::::::: :.:: :::::: : . ::: ::
CCDS98 SNSKILLVLFYPLNSCANPFLYAIFTKAFQRDVFILLSKFGICKRQAQAYRGQRVPPKNS
660 670 680 690 700 710
670 680 690
pF1KB9 THPRNGHCSSAPRVTNGSTYILVPLSHLAQN
CCDS98 TDIQVQKVTHEMRQGLHNMEDVYELIENSHLTPKKQGQISEEYMQTVL
720 730 740 750 760
>>CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 (951 aa)
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20 30 40 50 60 70
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:: ..:. :..:.. .: .: .... .. ..: .::: ... .: . ...
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..... : .:. ::.: . : .:::. : ....:..:: :::... :
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..: .... .. : .:.. . :..: ::::. . . :..::... . . :. : .
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..: :. .: :: ::..:. .:..:. .:
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CCDS61 VDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPN-AFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLK
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CCDS61 LTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMD----D
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..:. .: :..::.: : .: . : .. ..:. .: ... :. ..:.::
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CCDS61 FSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEPSTMGYMVALILLNSLCF
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... : ..: .. . .. . : ..:..:.:.::. . :..:...:. ... .:
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. :..:.. :. .: ::.:: .:. .:..:. :
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CCDS61 VEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVPCL
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pF1KB9 TVPRFLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASE
. ..:. .: ... :. ..:.:: : ... .. :..:.:: . ::...::::
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CCDS90 SSVFLLTLAALERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGAS
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CCDS90 PLCLPLPFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDL-ENIWDCSMVKHI
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pF1KB9 AMLIFTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFR
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CCDS90 ALLLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFK
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CCDS90 EDLVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSP
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CCDS30 WELPSLQSLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYD
100 110 120 130 140 150
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CCDS30 NPI-QFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEF-PD-LKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGM
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CCDS30 CQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQ---------HNRIWEIGADTFSQLS
210 220 230 240 250
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CCDS30 QAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGM---CASFFKASGQWEAEDLHLDDEESSKRPLGL
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