Result of FASTA (omim) for
pFN21AB9896
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9896, 1177 aa
1>>>pF1KB9896 1177 - 1177 aa - 1177 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.9226+/-0.000518; mu= -22.3024+/- 0.032
mean_var=704.8394+/-148.142, 0's: 0 Z-trim(122.6): 17 B-trim: 0 in 0/59
Lambda= 0.048309
statistics sampled from 41104 (41124) to 41104 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.482), width: 16
Scan time: 19.710
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005291 (OMIM: 184756) sterol regulatory elem (1177) 7856 564.0 1.9e-159
NP_001308025 (OMIM: 184756) sterol regulatory elem (1123) 7493 538.7 7.7e-152
NP_004167 (OMIM: 184756) sterol regulatory element (1147) 7454 536.0 5.2e-151
XP_005256829 (OMIM: 184756) PREDICTED: sterol regu (1145) 7425 534.0 2.1e-150
XP_016880459 (OMIM: 184756) PREDICTED: sterol regu ( 766) 4581 335.6 7.3e-91
XP_016880460 (OMIM: 184756) PREDICTED: sterol regu ( 666) 4475 328.1 1.1e-88
NP_004590 (OMIM: 600481) sterol regulatory element (1141) 2017 157.1 6.1e-37
XP_006724373 (OMIM: 600481) PREDICTED: sterol regu (1111) 2013 156.8 7.2e-37
XP_011528649 (OMIM: 600481) PREDICTED: sterol regu (1016) 1649 131.4 2.9e-29
XP_016884410 (OMIM: 600481) PREDICTED: sterol regu ( 965) 1379 112.5 1.3e-23
XP_016884411 (OMIM: 600481) PREDICTED: sterol regu ( 749) 1084 91.9 1.7e-17
>>NP_001005291 (OMIM: 184756) sterol regulatory element- (1177 aa)
initn: 7856 init1: 7856 opt: 7856 Z-score: 2983.4 bits: 564.0 E(85289): 1.9e-159
Smith-Waterman score: 7856; 100.0% identity (100.0% similar) in 1177 aa overlap (1-1177:1-1177)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEGEVGAGRGRANGLDAPRAGADRGAMDCTFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEGEVGAGRGRANGLDAPRAGADRGAMDCTFE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 DMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 QAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 APAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 VSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 IEKRYRSSINDKIIELKDLVVGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEKRYRSSINDKIIELKDLVVGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 VHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 GGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGAR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 GLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 VTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 LIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 TATNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TATNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 AQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 ERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 PVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARALL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 GCAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GCAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 PAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 TRTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAVAELEPRPTRREHAEALLLASCYLPPGFLSAPGQRVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TRTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAVAELEPRPTRREHAEALLLASCYLPPGFLSAPGQRVG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170
pF1KB9 MLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTSS
1150 1160 1170
>>NP_001308025 (OMIM: 184756) sterol regulatory element- (1123 aa)
initn: 7493 init1: 7493 opt: 7493 Z-score: 2847.0 bits: 538.7 E(85289): 7.7e-152
Smith-Waterman score: 7493; 100.0% identity (100.0% similar) in 1123 aa overlap (55-1177:1-1123)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 LLTDIEGEVGAGRGRANGLDAPRAGADRGAMDCTFEDMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDCTFEDMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGS
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 GAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMP
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 AFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFST
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 GSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVPQQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVPQQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQ
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 QVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPLVSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATV
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 PLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLVVGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIIELKDLVVGTE
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 AKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLM
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 EGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGSGGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQR
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KB9 PSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGARGLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTES
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KB9 RDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEPVTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLA
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KB9 RGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQ
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KB9 DCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSALNLAECAGDAVSVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHLTATNLALSALNLAECAGDAVSVAT
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KB9 LAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVD
700 710 720 730 740 750
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pF1KB9 GDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFS
760 770 780 790 800 810
870 880 890 900 910 920
pF1KB9 DALGYLQLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DALGYLQLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAA
820 830 840 850 860 870
930 940 950 960 970 980
pF1KB9 ERLCPLVEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASGYLQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERLCPLVEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARALLGCAKAESGPASLTICEKASGYLQD
880 890 900 910 920 930
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB9 SLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGF
940 950 960 970 980 990
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB9 QRDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPTRTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPTRTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB9 AELEPRPTRREHAEALLLASCYLPPGFLSAPGQRVGMLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AELEPRPTRREHAEALLLASCYLPPGFLSAPGQRVGMLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQM
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1170
pF1KB9 LMRLGGGTTVTSS
:::::::::::::
NP_001 LMRLGGGTTVTSS
1120
>>NP_004167 (OMIM: 184756) sterol regulatory element-bin (1147 aa)
initn: 7452 init1: 7452 opt: 7454 Z-score: 2832.1 bits: 536.0 E(85289): 5.2e-151
Smith-Waterman score: 7576; 97.5% identity (97.5% similar) in 1177 aa overlap (1-1177:1-1147)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIEGEVGAGRGRANGLDAPRAGADRGAMDCTFE
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLTDIE------------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 DMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DMLQLINNQDSDFPGLFDPPYAGSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAFLSGP
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 QAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QAAPSPLSPPQPAPTPLKMYPSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQTPTPQPLPGALLPQSFP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 APAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 APAPPQFSSTPVLGYPSPPGGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 QQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QQLLTVTAAPTAAPVTTTVTSQIQQVPVLLQPHFIKADSLLLTAMKTDGATVKAAGLSPL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 VSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VSGTTVQTGPLPTLVSGGTILATVPLVVDAEKLPINRLAAGSKAPASAQSRGEKRTAHNA
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 IEKRYRSSINDKIIELKDLVVGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IEKRYRSSINDKIIELKDLVVGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 VHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VHKSKSLKDLVSACGSGGNTDVLMEGVKTEVEDTLTPPPSDAGSPFQSSPLSLGSRGSGS
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 GGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GGSGSDSEPDSPVFEDSKAKPEQRPSLHSRGMLDRSRLALCTLVFLCLSCNPLASLLGAR
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 GLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GLPSPSDTTSVYHSPGRNVLGTESRDGPGWAQWLLPPVVWLLNGLLVLVSLVLLFVYGEP
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 VTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VTRPHSGPAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWN
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGKHTGGHL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TATNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTSS
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::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTSS
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.: : : ::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LALRALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGRAGGLQQDCALRVDASASA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWES
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pF1KB9 LYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYLQLLNSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLERALNCVTQPNPSPGSADGDKEFSDALGYLQLLNSC
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pF1KB9 SDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDAAGAPAYSFSISSSMATTTGVDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AEALLLASCYLPPGFLSAPGQRVGMLAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTS
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pF1KB9 S
:
XP_016 S
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::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB9 ATNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QSGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB9 CAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASSSIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQQQPP
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pF1KB9 APAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPT
520 530 540 550 560 570
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pF1KB9 RTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAVAELEPRPTRREHAEALLLASCYLPPGFLSAPGQRVGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAVAELEPRPTRREHAEALLLASCYLPPGFLSAPGQRVGM
580 590 600 610 620 630
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pF1KB9 LAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LAEAARTLEKLGDRRLLHDCQQMLMRLGGGTTVTSS
640 650 660
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pF1KB9 EGEVGAGRGRANGLDAPRAGADRGAMDCTFEDMLQLINNQDSDFPGLFD-------PPYA
..:::...:: ..:: ::. : .
NP_004 MDDSGELGGLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGSG
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 GSGAGGTDPASPDTSSPGSLSPPPATLSSSLEAF--LSGPQAAPSPLSPPQPAPTPLKMY
:::... . .: ..:: : : :. : ..: .. :. .:: :: :. .:.
NP_004 GSGSSSGSSGSSSSSSNGRGSSSGAVDPSVQRSFTQVTLPSFSPSAASPQAPT-LQVKVS
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB9 PSMPAFSPGPGIKEESVPLSILQT-PTPQPLPGALLPQSFPAPAPPQFSSTPVLGYPSPP
:. .: ...: ::: : ::: : . : :. . : ::.:: . :
NP_004 PTSVPTTP------RATP--ILQPRPQPQPQPQTQLQQQ-TVMITPTFSTTPQTRIIQQP
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 GGFSTGSPPGNTQQPLPGLPLASPPGVPPVSLHTQVQSVVPQQLLTVTAA---PTAAPVT
..... .. :: :.. : ::... :::.: :..:: :: : ::.:
NP_004 LIYQNAATSFQVLQP-QVQSLVTSSQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPAT
170 180 190 200 210 220
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XP_011 VQTVAAPQVQQVPVLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTTPIQTAALQ
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XP_011 GSPLLDD-----------------------------------------------------
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