FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9645, 1032 aa
1>>>pF1KB9645 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0893+/-0.00037; mu= 1.0924+/- 0.023
mean_var=269.8450+/-58.644, 0's: 0 Z-trim(120.9): 9 B-trim: 72 in 2/56
Lambda= 0.078076
statistics sampled from 36795 (36804) to 36795 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.432), width: 16
Scan time: 17.900
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005777 (OMIM: 607842,614427) teashirt homolog 1 (1032) 6790 778.9 0
XP_005266698 (OMIM: 607842,614427) PREDICTED: teas (1032) 6790 778.9 0
NP_001295139 (OMIM: 607842,614427) teashirt homolo (1077) 6790 778.9 0
NP_065907 (OMIM: 614119) teashirt homolog 3 [Homo (1081) 2201 262.0 1.3e-68
NP_001180350 (OMIM: 614118) teashirt homolog 2 iso (1031) 1972 236.2 7.2e-61
XP_016883129 (OMIM: 614118) PREDICTED: teashirt ho (1034) 1972 236.2 7.3e-61
NP_775756 (OMIM: 614118) teashirt homolog 2 isofor (1034) 1972 236.2 7.3e-61
XP_016883130 (OMIM: 614118) PREDICTED: teashirt ho ( 995) 1782 214.8 1.9e-54
>>NP_005777 (OMIM: 607842,614427) teashirt homolog 1 iso (1032 aa)
initn: 6790 init1: 6790 opt: 6790 Z-score: 4146.7 bits: 778.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6790; 100.0% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MCNEETEIKEAQSYQNSPVSSATNQDAGYGSPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MCNEETEIKEAQSYQNSPVSSATNQDAGYGSPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 VSYPQDSLAQIKAVYANLFSESCWSSLALDLKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VSYPQDSLAQIKAVYANLFSESCWSSLALDLKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 STTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTSTSSSSGYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 STTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTSTSSSSGYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKDCSAAYDTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKDCSAAYDTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 WSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCGHSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 WSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCGHSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAIT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAGMAAEVALSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAGMAAEVALSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 WQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHMMVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 WQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHMMVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 QSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDSPAGSTTSEEKKEPEKEKPPVAGDAEKIKEESEDSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDSPAGSTTSEEKKEPEKEKPPVAGDAEKIKEESEDSLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KFEPSTLYPYLREEDLDDSPKGGLDILKSLENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KFEPSTLYPYLREEDLDDSPKGGLDILKSLENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 PGTVKPLPAAVQSVQVQPSYAGGVKSLSSAEHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PGTVKPLPAAVQSVQVQPSYAGGVKSLSSAEHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 VTGKVNIKKEERPPEKEKSSLAKAASPIAKENKDFPKTEEVSGKPQKKGPEAETGKAKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VTGKVNIKKEERPPEKEKSSLAKAASPIAKENKDFPKTEEVSGKPQKKGPEAETGKAKKE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 GPLDVHTPNGTEPLKAKVTNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GPLDVHTPNGTEPLKAKVTNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 PSLDPLAMLYKISNSMLDKPVYPATPVKQADAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PSLDPLAMLYKISNSMLDKPVYPATPVKQADAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 DSVASPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKSSTPSTVSEKSDADGSSFEEALDELSPVHKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DSVASPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKSSTPSTVSEKSDADGSSFEEALDELSPVHKR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 KGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETTEGKYIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETTEGKYIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 NVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 NQIQEQQNVSKVLTNKTLGPLGATEEDLGSTFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NQIQEQQNVSKVLTNKTLGPLGATEEDLGSTFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPE
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KB9 DHLIYVTELEKQ
::::::::::::
NP_005 DHLIYVTELEKQ
1030
>>XP_005266698 (OMIM: 607842,614427) PREDICTED: teashirt (1032 aa)
initn: 6790 init1: 6790 opt: 6790 Z-score: 4146.7 bits: 778.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6790; 100.0% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MCNEETEIKEAQSYQNSPVSSATNQDAGYGSPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MCNEETEIKEAQSYQNSPVSSATNQDAGYGSPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 VSYPQDSLAQIKAVYANLFSESCWSSLALDLKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSYPQDSLAQIKAVYANLFSESCWSSLALDLKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 STTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTSTSSSSGYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 STTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTSTSSSSGYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKDCSAAYDTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKDCSAAYDTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 WSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCGHSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCGHSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAIT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 KLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAGMAAEVALSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAGMAAEVALSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 WQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHMMVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHMMVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 QSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDSPAGSTTSEEKKEPEKEKPPVAGDAEKIKEESEDSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDSPAGSTTSEEKKEPEKEKPPVAGDAEKIKEESEDSLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KFEPSTLYPYLREEDLDDSPKGGLDILKSLENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KFEPSTLYPYLREEDLDDSPKGGLDILKSLENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 PGTVKPLPAAVQSVQVQPSYAGGVKSLSSAEHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PGTVKPLPAAVQSVQVQPSYAGGVKSLSSAEHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 VTGKVNIKKEERPPEKEKSSLAKAASPIAKENKDFPKTEEVSGKPQKKGPEAETGKAKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VTGKVNIKKEERPPEKEKSSLAKAASPIAKENKDFPKTEEVSGKPQKKGPEAETGKAKKE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 GPLDVHTPNGTEPLKAKVTNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GPLDVHTPNGTEPLKAKVTNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 PSLDPLAMLYKISNSMLDKPVYPATPVKQADAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PSLDPLAMLYKISNSMLDKPVYPATPVKQADAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 DSVASPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKSSTPSTVSEKSDADGSSFEEALDELSPVHKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSVASPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKSSTPSTVSEKSDADGSSFEEALDELSPVHKR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 KGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETTEGKYIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETTEGKYIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 NVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 NQIQEQQNVSKVLTNKTLGPLGATEEDLGSTFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NQIQEQQNVSKVLTNKTLGPLGATEEDLGSTFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPE
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KB9 DHLIYVTELEKQ
::::::::::::
XP_005 DHLIYVTELEKQ
1030
>>NP_001295139 (OMIM: 607842,614427) teashirt homolog 1 (1077 aa)
initn: 6790 init1: 6790 opt: 6790 Z-score: 4146.5 bits: 778.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6790; 100.0% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:46-1077)
10 20 30
pF1KB9 MCNEETEIKEAQSYQNSPVSSATNQDAGYG
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPEEELKAAEIDEEHVEDDGLSLDIQESEYMCNEETEIKEAQSYQNSPVSSATNQDAGYG
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 SPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDSVSYPQDSLAQIKAVYANLFSESCWSSLALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDSVSYPQDSLAQIKAVYANLFSESCWSSLALD
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 LKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPVSTTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTSTSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPVSTTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTSTSSSS
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 GYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFSTVQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKDCSAAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFSTVQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKDCSAAY
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 DTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKRWSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKRWSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCMYCGHS
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 FESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAITKLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAGMAAEVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAITKLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAGMAAEVA
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 LSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYTWQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYTWQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQQLTAHM
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 MVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKIQSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDSPAGSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVTGHFLKVTTSASKKGKQLVLDPVVEEKIQSIPLPPTTHTRLPASSIKKQPDSPAGSTT
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 SEEKKEPEKEKPPVAGDAEKIKEESEDSLEKFEPSTLYPYLREEDLDDSPKGGLDILKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SEEKKEPEKEKPPVAGDAEKIKEESEDSLEKFEPSTLYPYLREEDLDDSPKGGLDILKSL
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 ENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQLPGTVKPLPAAVQSVQVQPSYAGGVKSLSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENTVSTAISKAQNGAPSWGGYPSIHAAYQLPGTVKPLPAAVQSVQVQPSYAGGVKSLSSA
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 EHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEKVTGKVNIKKEERPPEKEKSSLAKAASPIAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EHNALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEKVTGKVNIKKEERPPEKEKSSLAKAASPIAK
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 ENKDFPKTEEVSGKPQKKGPEAETGKAKKEGPLDVHTPNGTEPLKAKVTNGCNNLGIIMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENKDFPKTEEVSGKPQKKGPEAETGKAKKEGPLDVHTPNGTEPLKAKVTNGCNNLGIIMD
680 690 700 710 720 730
700 710 720 730 740 750
pF1KB9 HSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVSPSLDPLAMLYKISNSMLDKPVYPATPVKQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVSPSLDPLAMLYKISNSMLDKPVYPATPVKQA
740 750 760 770 780 790
760 770 780 790 800 810
pF1KB9 DAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVADSVASPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVADSVASPLRESALMDISDMVKNLTGRLTPKS
800 810 820 830 840 850
820 830 840 850 860 870
pF1KB9 STPSTVSEKSDADGSSFEEALDELSPVHKRKGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETTEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STPSTVSEKSDADGSSFEEALDELSPVHKRKGRQSNWNPQHLLILQAQFASSLRETTEGK
860 870 880 890 900 910
880 890 900 910 920 930
pF1KB9 YIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YIMSDLGPQERVHISKFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDC
920 930 940 950 960 970
940 950 960 970 980 990
pF1KB9 ASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPLNQIQEQQNVSKVLTNKTLGPLGATEEDLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPLNQIQEQQNVSKVLTNKTLGPLGATEEDLGS
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1000 1010 1020 1030
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPEDHLIYVTELEKQ
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10 20 30
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:: :. . ::::::.. . ..
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40 50 60 70 80
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: .::.::..: :...: ..:.: . : . .::: :.:::: :..:.: ::.:
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90 100 110 120 130 140
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:.:.. .:.:... ::.: ::..:. .
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150 160 170 180 190 200
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:...::::.:.::::::.:. .:::::::::::::::..:::::.::::::::::::::
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210 220 230 240 250 260
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::::::::::::::::::::::.. :... :::::::::::.::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::: :. .:..:.:.:.: .: : ::. .: .
NP_065 HSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVTPVAAKIIPATRKKASLELELPSSPDSTGGTP
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....:.. :: .:::.:::::::.::::::.:.:::::.::::::::::::::::.:
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::::::::::.:::.:: :::: .: :: ..::.::.:: :: : :...
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: : . . . : ::: .::: :. . : :.. . :: . :. : :: :.::..:
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:::::::::::::::..::.:::::.::::::::::::::::. .: : .. .:. ..:
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. :. . .: .....:. :.: : : :.: ::::::.::: :: ..... . :. .
NP_065 MF-GNSEIVSPTKNQTLVSPPSSQTSPMPKTNFHAMEELVKKVTEKVAKVEEKMKEPDGK
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: .:. :: ..: . : : : . :...: : .:: . :: :
NP_065 LSPPKRATPSPCSSEVGEPIKMEASSDGGFRSQENSPSPPRDGCKDGSPLAEPVENGKEL
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pF1KB9 LKAKVTNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPVSPSLDPLAMLYKIS
.: ... .. .:: :: :: :.::::::::.:: ::::..:: :.:::..::.:.:
NP_065 VKPLASSLSGSTAIITDHPPEQPFVNPLSALQSVMNIHLGKAAKPSLPALDPMSMLFKMS
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::. .: . . : :.:: .:::.:. :.::::::::.:.
NP_065 NSLAEKAAVATPPPLQSKKADHLDRYFYHVNNDQPIDLTKGKSDKGCSLGSVLLSPTSTA
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: .:: . ..: :::::.:: :::::.:::: : ::::::..:::::
NP_065 PATSSSTVTTAKTSAVVSFMSNSPLRENALSDISDMLKNLTESHTSKSSTPSSISEKSDI
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::...::: .: .:..::::::::::::::::::::::.:::.:.:::::::::.::::.
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NP_065 HISRFTGLSMTTISHWLANVKYQLRRTGGTKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQIRTPSTYIS
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1010 1020 1030
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:::::::::::::::::::::.::.:
NP_065 SKHAVKLHLSKTHGKSPEDHLLYVSELEKQ
1060 1070 1080
>>NP_001180350 (OMIM: 614118) teashirt homolog 2 isoform (1031 aa)
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10 20
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.:.: .: :.: . : : .
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:..: .:::: ::.:.:::. . .:::::.::::::..:. :.::::::.:::..
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pF1KB9 CSAAYDTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKRWSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCM
:::::::::::::::::::::.:::: ::. . .::::::....:. :::::::::::
NP_001 CSAAYDTLVELTVHMNETGHYQDDNRKKDKLRPTSYSKPRKRAFQDMD-KEDAQKVLKCM
220 230 240 250 260 270
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.:: ::.:::::::::::::::::::::::::.:. :.: .:::.. :. ::::.
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pF1KB9 MAAEVALSESAKDQKAANPYVTPNNRYGYQNGASYTWQFEARKAQILKCMECGSSHDTLQ
.. ....: ..:: :: .. :::::::::::::::::: :.::::::::::::::::
NP_001 -STTGSFADSFSSQKNANLQLSSNNRYGYQNGASYTWQFEACKSQILKCMECGSSHDTLQ
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: .:.: ::: .::.: .. ::. .:. :: :.: ..:. : :::::::.:. :
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:: ::::::::::.:::.:::::::::..:::::::::: :: ::: . : .:..:.
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pF1KB9 AGGVKSLSSAEH-NALLHSPGSLTPPPHKSNVSAMEELVEKVTGKVNIKKEERPPEKEKS
.. .. .. . :. : :.: . .. : .. . : :: . :..: :
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pF1KB9 SLAKAASPIAKENKDFPKTEEVS-GKPQKKGPEAETGKAKKEGPLDVHTPNGTEPLKAKV
:.... :. .: :.: .: . :: : : ::: . . :. :: .: .
NP_001 SFSHS------EGDSFRKSETPPEAKKTELGPLKEEEKLMKEGS-EKEKPQPLEPTSA-L
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pF1KB9 TNGCNNLGIIMDHSPEPSFINPLSALQSIMNTHLGKVSKPV------SPSLDPLAMLYKI
.::: . .:.: :::::::::..:.::::...:. ::: . ..:..:
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pF1KB9 SNSMLDKPVYPATPVKQADAIDRYYYENSDQPIDLTKSKNKPLVSSVADSVASPLRESAL
. ...:::: . ...:.. :: .:::::::::::::.: :: :.: :: .. ::
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::.:::: : ::: .. : : : . : ::.. .:.: .::::::::::::::
NP_001 SDIADMVKVLPKATTPKPASSSRVPPMKLEMDVRRFEDVSSEVSTLHKRKGRQSNWNPQH
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:::::::::::: .:.::::..::::::::..::::::::::::::::::::::::.:::
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pF1KB9 TKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPLNQIQE-QQNVS
::::::.: :::.:.:.:::::::: ::::::::.::::..::...: ..: .. .:..:
NP_001 TKFLKNMDKGHPIFYCSDCASQFRTPSTYISHLESHLGFQMKDMTRLSVDQQSKVEQEIS
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pF1KB9 KVLTNKTLGPLGATEEDLGSTFQCKLCNRTFASKHAVKLHLSKTHGKSPEDHLIYVTELE
.: . . :.::: : :.:::: :::.:::::::::::::.:::: : .::...
NP_001 RVSSAQRSPETIAAEEDTDSKFKCKLCCRTFVSKHAVKLHLSKTHSKSPEHHSQFVTDVD
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pF1KB9 KQ
..
NP_001 EE
1030
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10 20
pF1KB9 MCNEETEIKEAQ----SYQNSPVSSATNQDAG
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XP_016 LKEEEEIKEEEEEEDSGSVAQLQGGNDTGTDEELETGPEQKGCFSYQNSPGSHLSNQDAE
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30 40 50 60 70 80
pF1KB9 YGSPFSESSDQLAHFKGSSSREEKEDPQCPDSVSYPQDS---LAQIKAVYANLFSESCWS
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XP_016 NESLLSDASDQVSDIKSVCGRDAS-DKKAHTHVRLPNEAHNCMDKMTAVYANILSDSYWS
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pF1KB9 SLALDLKKSGSTTSTNDASQKESSAPTPTPPTCPVSTTGPTTSTPSTSCSSSTSHSSTTS
.:.: .: :.: . : : .
XP_016 GLGLGFKLSNSERRNCD----------------------------------------TRN
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pF1KB9 TSSSSGYDWHQAALAKTLQQTSSYGLLPEPSLFSTVQLYRQNNKLYGSVFTGASKFRCKD
:..: .:::: ::.:.:::. . .:::::.::::::..:. :.::::::.:::..
XP_016 GSNKSDFDWHQDALSKSLQQNLPSRSVSKPSLFSSVQLYRQSSKMCGTVFTGASRFRCRQ
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pF1KB9 CSAAYDTLVELTVHMNETGHYRDDNRDKDSEKTKRWSKPRKRSLMEMEGKEDAQKVLKCM
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XP_016 CSAAYDTLVELTVHMNETGHYQDDNRKKDKLRPTSYSKPRKRAFQDMD-KEDAQKVLKCM
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pF1KB9 YCGHSFESLQDLSVHMIKTKHYQKVPLKEPVPAIT-KLVPSTKKRALQDLAPPCSPEPAG
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XP_016 -STTGSFADSFSSQKNANLQLSSNNRYGYQNGASYTWQFEACKSQILKCMECGSSHDTLQ
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pF1KB9 PAGSTTSEEKKEPEKEKPPVAGDAEKI--KEESEDSLEK-FEPSTLYPYLREEDLDDSPK
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XP_016 TA--STTELKKESKKERPEETSKDEKVVKSEDYEDPLQKPLDPTIKYQYLREEDLEDGSK
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980 990 1000 1010 1020 1030
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XP_016 EE
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pF1KB9 KQ
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NP_775 EE
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10 20
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pF1KB9 TKFLKNLDTGHPVFFCNDCASQFRTASTYISHLETHLGFSLKDLSKLPLNQIQE-QQNVS
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XP_016 RVSSAQRSPETIAAEEDTDSKFK
980 990
1032 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 06:12:30 2016 done: Sun Nov 6 06:12:32 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]