Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8802
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8802, 346 aa
1>>>pF1KB8802 346 - 346 aa - 346 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8757+/-0.000877; mu= 18.6198+/- 0.052
mean_var=112.7411+/-35.314, 0's: 0 Z-trim(106.7): 252 B-trim: 1080 in 2/49
Lambda= 0.120791
statistics sampled from 8755 (9159) to 8755 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 ( 346) 2390 427.8 6.4e-120
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 1197 220.0 2.6e-57
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 1194 219.4 3.6e-57
CCDS1810.1 OXER1 gene_id:165140|Hs108|chr2 ( 423) 699 133.2 3.7e-31
CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 ( 319) 611 117.7 1.3e-26
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 511 100.4 2.4e-21
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 478 94.7 1.3e-19
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 421 84.7 1.3e-16
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 420 84.5 1.5e-16
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 415 83.7 2.8e-16
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 405 81.9 9.1e-16
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 401 81.2 1.4e-15
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 397 80.5 2.2e-15
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 394 80.0 3.4e-15
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 393 79.9 4.2e-15
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 390 79.3 5.6e-15
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 389 79.1 6e-15
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 389 79.1 6.1e-15
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 383 78.1 1.3e-14
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 382 78.0 1.5e-14
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 370 75.8 6e-14
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 370 75.8 6.2e-14
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 366 75.1 1e-13
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 365 75.0 1.2e-13
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 364 74.9 1.4e-13
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 363 74.6 1.4e-13
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 359 73.9 2.4e-13
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 359 74.0 2.4e-13
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 359 74.0 2.4e-13
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 359 74.0 2.4e-13
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 359 74.0 2.5e-13
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 358 73.7 2.5e-13
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 359 74.0 2.5e-13
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 359 74.0 2.5e-13
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 359 74.0 2.6e-13
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 359 74.1 2.8e-13
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 357 73.6 3.1e-13
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 356 73.4 3.4e-13
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 354 73.0 4.2e-13
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 352 72.6 5.1e-13
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 351 72.5 6.1e-13
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 350 72.3 6.8e-13
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 348 72.0 9e-13
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 347 71.8 1e-12
CCDS2541.1 GPR35 gene_id:2859|Hs108|chr2 ( 309) 346 71.5 1e-12
CCDS56174.1 GPR35 gene_id:2859|Hs108|chr2 ( 340) 346 71.6 1.1e-12
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 346 71.6 1.1e-12
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 346 71.7 1.2e-12
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 343 71.1 1.6e-12
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 342 70.9 1.8e-12
>>CCDS9236.1 HCAR1 gene_id:27198|Hs108|chr12 (346 aa)
initn: 2390 init1: 2390 opt: 2390 Z-score: 2266.4 bits: 427.8 E(32554): 6.4e-120
Smith-Waterman score: 2390; 100.0% identity (100.0% similar) in 346 aa overlap (1-346:1-346)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVALCGFCFHMKTWKPSTVYLFNLAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVALCGFCFHMKTWKPSTVYLFNLAVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLAMNRAGSIVFLTVVAADRYFKVVHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 DFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLAMNRAGSIVFLTVVAADRYFKVVHP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HHAVNTISTRVAAGIVCTLWALVILGTVYLLLENHLCVQETAVSCESFIMESANGWHDIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 HHAVNTISTRVAAGIVCTLWALVILGTVYLLLENHLCVQETAVSCESFIMESANGWHDIM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRRQQLARQARMKKATRFIMVVAIVFITCYLPSVSAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 FQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRRQQLARQARMKKATRFIMVVAIVFITCYLPSVSAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LYFLWTVPSSACDPSVHGALHITLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFPKFYNKLKICSLKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LYFLWTVPSSACDPSVHGALHITLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFPKFYNKLKICSLKPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB8 QPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVANSFQSQSDGQWDPHIVEWH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 QPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVANSFQSQSDGQWDPHIVEWH
310 320 330 340
>>CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 (387 aa)
initn: 1153 init1: 863 opt: 1197 Z-score: 1142.3 bits: 220.0 E(32554): 2.6e-57
Smith-Waterman score: 1197; 52.8% identity (76.0% similar) in 341 aa overlap (5-340:17-355)
10 20 30 40
pF1KB8 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVALCGFCFHMKTWK
.:: .. : :..:.::.: . :..: ::::.:: ::::.:.::
CCDS53 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIAKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 PSTVYLFNLAVADFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLAMNRAGSIVFLTV
: ..:::::::::::.::::: :::.:: : :::::::. :: .:::: :::.::::
CCDS53 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFVMDYYVRRSDWKFGDIPCRLVLFMFAMNRQGSIIFLTV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 VAADRYFKVVHPHHAVNTISTRVAAGIVCTLWALVILGTVYLLLENHLCVQETAVSCESF
::.::::.:::::::.: ::. .:: : : ::.... ::.:: .. : . :: : ::
CCDS53 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNWTAAIISCLLWGITVGLTVHLLKKKLLIQNGTANVCISF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 IMESANGWHDIMFQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRRQQLARQARMKKATRFIMVVAIV
. . ::. :: ::::.::::::::: .:.::::.:: . :.:..:.: ::::::::
CCDS53 SICHTFRWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQ-MDRHAKIKRAITFIMVVAIV
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 FITCYLPSVSARLYFLWTVPSSA---CDP--SVHGALHITLSFTYMNSMLDPLVYYFSSP
:. :.:::: .:....: . .:. :. :: :. ::::::::::::::.:::::::
CCDS53 FVICFLPSVVVRIHIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSSP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 SFPKFYNKLKICSLKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVANSFQSQSDGQWDPHIV
:::.:.. : :. : :. ..: . ... .. .. ... ..: :.:
CCDS53 SFPNFFSTLINRCLQRKITGEPDNNRSTSVELTGDPNKTR-GAPEALIANSGEPWSPSYL
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 EWH
CCDS53 GPTSNNHSKKGHCHQEPASLEKQLGCCIE
360 370 380
>>CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 (363 aa)
initn: 1140 init1: 853 opt: 1194 Z-score: 1139.8 bits: 219.4 E(32554): 3.6e-57
Smith-Waterman score: 1194; 52.6% identity (76.9% similar) in 342 aa overlap (5-340:17-355)
10 20 30 40
pF1KB8 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVALCGFCFHMKTWK
.:: .. : : .:.::.: . :..: ::::.:: ::::.:.::
CCDS92 MNRHHLQDHFLEIDKKNCCVFRDDFIVKVLPPVLGLEFIFGLLGNGLALWIFCFHLKSWK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 PSTVYLFNLAVADFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLAMNRAGSIVFLTV
: ..:::::::::::.::::: : :.:: : :::::::. :: ::::: :::.::::
CCDS92 SSRIFLFNLAVADFLLIICLPFLMDNYVRRWDWKFGDIPCRLMLFMLAMNRQGSIIFLTV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 VAADRYFKVVHPHHAVNTISTRVAAGIVCTLWALVILGTVYLLLENHLCVQETAVS-CES
::.::::.:::::::.: ::.:.:: : : ::...: ::.:: .... .:. ... : :
CCDS92 VAVDRYFRVVHPHHALNKISNRTAAIISCLLWGITIGLTVHLL-KKKMPIQNGGANLCSS
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 FIMESANGWHDIMFQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRRQQLARQARMKKATRFIMVVAI
: . . ::. :: ::::.::::::::: .:.::::.:: . :.:..:.: :::::::
CCDS92 FSICHTFQWHEAMFLLEFFLPLGIILFCSARIIWSLRQRQ-MDRHAKIKRAITFIMVVAI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 VFITCYLPSVSARLYFLWTVPSSA---CDP--SVHGALHITLSFTYMNSMLDPLVYYFSS
::. :.:::: .:. ..: . .:. :. :: :. ::::::::::::::.::::::
CCDS92 VFVICFLPSVVVRIRIFWLLHTSGTQNCEVYRSVDLAFFITLSFTYMNSMLDPVVYYFSS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 PSFPKFYNKLKICSLKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVANSFQSQSDGQWDPHI
::::.:.. : :. :. :. ..: . ... .. .. ......: :.:
CCDS92 PSFPNFFSTLINRCLQRKMTGEPDNNRSTSVELTGDPNKTR-GAPEALMANSGEPWSPSY
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VEWH
CCDS92 LGPTSP
360
>>CCDS1810.1 OXER1 gene_id:165140|Hs108|chr2 (423 aa)
initn: 545 init1: 440 opt: 699 Z-score: 672.9 bits: 133.2 E(32554): 3.7e-31
Smith-Waterman score: 699; 39.8% identity (67.8% similar) in 289 aa overlap (4-285:81-362)
10 20 30
pF1KB8 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGN
: : .. .: . :.: . :::: .::
CCDS18 SLSSSVLPPSFSPSPSSAPSAFTTVGGSSGGPCHPTSSSLVSAFLAPILALEFVLGLVGN
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 GVALCGFCFHMKTWKPSTVYLFNLAVADFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLF
..:: ::.: . : .::.: .:..:::::. ::.:.:::: .. : :: :.:.::
CCDS18 SLALFIFCIHTRPWTSNTVFLVSLVAADFLLISNLPLRVDYYLLHETWRFGAAACKVNLF
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 TLAMNRAGSIVFLTVVAADRYFKVVHPHHAVNTISTRVAAGIVCTLWALVILGTVYLLLE
:. ::..:.::::..: .::.:::.:::... :. .:: .. ::. ..: . .:::
CCDS18 MLSTNRTASVVFLTAIALNRYLKVVQPHHVLSRASVGAAARVAGGLWVGILLLNGHLLLS
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200
pF1KB8 NHLCVQETAVSCESFIM---ESAN-GWHDIMFQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRRQQL
. .. :: :. . ::. ::. .. ::::.::..::: .: ..: : :
CCDS18 TF-----SGPSCLSYRVGTKPSASLRWHQALYLLEFFLPLALILFAIVSIGLTIRNRG-L
240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 ARQARMKKATRFIMVVAIVFITCYLPSV---SARLYFLWTVPSSACDPSVHGALHITLSF
. :: ..: : . .:. :. :.:::. : . .: . : .. .: .:.:
CCDS18 GGQAGPQRAMRVLAMVVAVYTICFLPSIIFGMASMVAFWLSACRSLDLCTQ-LFHGSLAF
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 TYMNSMLDPLVYYFSSPSFPKFYNKLKICSLKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISV
::.::.:::..: ::::.:
CCDS18 TYLNSVLDPVLYCFSSPNFLHQSRALLGLTRGRQGPVSDESSYQPSRQWRYREASRKAEA
350 360 370 380 390 400
>>CCDS5299.1 GPR31 gene_id:2853|Hs108|chr6 (319 aa)
initn: 434 init1: 359 opt: 611 Z-score: 591.3 bits: 117.7 E(32554): 1.3e-26
Smith-Waterman score: 611; 34.4% identity (67.0% similar) in 294 aa overlap (7-292:6-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVALCGFCFHMKTWKPSTVYLFNLAVA
: . ... .. :: . :: :::.::: : :....::: .:::.:::.:
CCDS52 MPFPNCSAPSTVVATAVGVLLGLECGLGLLGNAVALWTFLFRVRVWKPYAVYLLNLALA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLAMNRAGSIVFLTVVAADRYFKVVHP
:.:: :::: . .:: . : .: . : . : : ..:. ...::..:: :::..::::
CCDS52 DLLLAACLPFLAAFYLSLQAWHLGRVGCWALHFLLDLSRSVGMAFLAAVALDRYLRVVHP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 HHAVNTISTRVAAGIVCTLWALVILGTVYLLLENHLCVQETAVSCESFIMESANG-----
. :: .: ..: :. .: :.. : :: .. . .... :.:: . :.:
CCDS52 RLKVNLLSPQAALGVSGLVWLLMVALTCPGLLISE--AAQNSTRCHSF-YSRADGSFSII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 WHDIMFQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRR-QQLARQARMKKATRFIMVVAIVFITCYL
:.. . :.: .:.:.:.::. :. .:..: .. .: ....: .. .:...: :.:
CCDS52 WQEALSCLQFVLPFGLIVFCNAGIIRALQKRLREPEKQPKLQRAQALVTLVVVLFALCFL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 PSVSAR--LYFLWTVPSSACDPSVHGALHITLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFPKFYNKL
: :: .... .. : .: . .: :.::..:.:.:.:: ::::.: . : ..
CCDS52 PCFLARVLMHIFQNLGSCRALCAVAHTSDVTGSLTYLHSVLNPVVYCFSSPTFRSSYRRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB8 KICSLKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVANSFQSQSDGQWDPHIVEWH
CCDS52 FHTLRGKGQAAEPPDFNPRDSYS
300 310
>>CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 (346 aa)
initn: 483 init1: 339 opt: 511 Z-score: 496.8 bits: 100.4 E(32554): 2.4e-21
Smith-Waterman score: 511; 30.5% identity (62.5% similar) in 315 aa overlap (3-308:27-331)
10 20 30
pF1KB8 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVA
:. : :: . . .: . .. : :.::::..
CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSNNNSRNCTIE-NFKREFFPIVYLIIFFWGVLGNGLS
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LCGFCFHMKTWKPST---VYLFNLAVADFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLF
. : .. .: :: :...:::..:.:.. ::::.::::: .: :::. ::. .
CCDS94 IYVF---LQPYKKSTSVNVFMLNLAISDLLFISTLPFRADYYLRGSNWIFGDLACRIMSY
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 TLAMNRAGSIVFLTVVAADRYFKVVHPHHAVNTISTRVAAGIVC-TLWALVILGTVYLLL
.: .: .:: ::::... :.. .::: . ... : : .: :.: .: :.. ... .::
CCDS94 SLYVNMYSSIYFLTVLSVVRFLAMVHPFRLLHVTSIR-SAWILCGIIWILIMASSI-MLL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KB8 ENHLCVQETAVSC---ESFIMESANGWHDIMFQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRRQQL
.. . ...:: . . . . . . : . . ..:. . .: . :. : . .
CCDS94 DSGSEQNGSVTSCLELNLYKIAKLQTMNYIALVVGCLLPFFTLSICYLLIIRVLLKVEVP
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 ARQARM--KKATRFIMVVAIVFITCYLPSVSARLYFLWTVPSSACDPSVHGALHITLSFT
:. .:: :... :.:. :.:: . : : : . : .: :: :::...
CCDS94 ESGLRVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRTVHLTTWKVGLCKDRLHKALVITLALA
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 YMNSMLDPLVYYFSSPSFPKFYNKLKICSLKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVA
:. ..::.:::.. .: ..:: .:. .: ..::.
CCDS94 AANACFNPLLYYFAGENFK---DRLK-SALRKGHPQKAKTKCVFPVSVWLRKETRV
300 310 320 330 340
330 340
pF1KB8 NSFQSQSDGQWDPHIVEWH
>>CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 (367 aa)
initn: 412 init1: 355 opt: 478 Z-score: 465.4 bits: 94.7 E(32554): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 478; 30.5% identity (60.4% similar) in 318 aa overlap (7-316:51-362)
10 20 30
pF1KB8 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVA
: : .... . .. :.:. .:: .:
CCDS21 SGSDSSQSMNGLEVAPPGLITNFSLATAEQCGQETPLENMLFASFYLLDFILALVGNTLA
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LCGFCFHMKTWKPSTVYLFNLAVADFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLA
: : :. :..:.:..:::::. .. :: : :.. :: ::.: ::. : .
CCDS21 LWLFIRDHKSGTPANVFLMHLAVADLSCVLVLPTRLVYHFSGNHWPFGEIACRLTGFLFY
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MNRAGSIVFLTVVAADRYFKVVHPHHAVNTISTR--VAAGIVCT-LWALVILGTVYLLLE
.: .:: ::: ..:::.. .::: :.... : . : ..:. ::..: .. . ::.
CCDS21 LNMYASIYFLTCISADRFLAIVHP---VKSLKLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAPLLVS
150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 NHLCVQETAVSCESFIMESANGWHDIMFQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRRQQLARQA
. . .: : .. :.:. . . . : .:. . : . :. :: :: : .
CCDS21 PQTVQTNHTVVCLQLYREKASHHALVSLAVAFTFPFITTVTCYLLIIRSL--RQGLRVEK
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KB8 RMK-KATRFIMVVAIVFITCYLP-SVSARLYFL-WTVPSSACDPSVHGAL--HITLSFTY
:.: ::.:.: .: .:..:..: :. .: : . ...: . :: .:: .:
CCDS21 RLKTKAVRMIAIVLAIFLVCFVPYHVNRSVYVLHYRSHGASCATQRILALANRITSCLTS
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 MNSMLDPLVYYFSSPSFPKFYNKLKICSLKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVAN
.:. :::..:.: . .: . .: .:. . : : : . .: .:
CCDS21 LNGALDPIMYFFVAEKFRHALCNL-LCGKRLKGPPPSFEGKTNESSLSAKSEL
320 330 340 350 360
330 340
pF1KB8 SFQSQSDGQWDPHIVEWH
>>CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 (365 aa)
initn: 289 init1: 237 opt: 421 Z-score: 411.8 bits: 84.7 E(32554): 1.3e-16
Smith-Waterman score: 421; 27.7% identity (61.4% similar) in 321 aa overlap (7-314:13-325)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVA-FVLGALGNGVALCGFCFHMKTWKPSTVY
: :. :: :.. :.. :. .:.: .: ..: ...:. . ::
CCDS98 MGNITADNSSMSCTID-HTIHQTLAPVVYVTVLVVGFPANCLSLYFGYLQIKARNELGVY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LFNLAVADFLLMIC-LPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLAMNRAGSIVFLTVVAAD
: ::.::: :..:: ::: .: :.. .:. ::. :.: . : : :. :: ...:
CCDS98 LCNLTVAD-LFYICSLPFWLQYVLQHDNWSHGDLSCQVCGILLYENIYISVGFLCCISVD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 RYFKVVHPHHAVNTISTRVAAGIVCTLWALVILGTVYLLLENHLCVQETA--VSCESFIM
::. :.:: . . . ..:.:. ..:: .: ..:.:..... .:. : : . .
CCDS98 RYLAVAHPFRFHQFRTLKAAVGVSVVIWAKELLTSIYFLMHEEVIEDENQHRVCFEHYPI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 ESANGWHDIM----FQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLRRRQQLARQARMKKATRFIMVVA
.. :. . : . :..:. ..: :.. . ::.. ....: . :... ..
CCDS98 QA---WQRAINYYRFLVGFLFPICLLL-ASYQGILRAVRRSHGTQKSRKDQIQRLVLSTV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 IVFITCYLPSVSARLYFLWTVPSSACD--PSVHGALHITLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPS
..:..:.:: : .. .: ..:: .: .: :..: .: .: . ::..: : : .
CCDS98 VIFLACFLP--YHVLLLVRSVWEASCDFAKGVFNAYHFSLLLTSFNCVADPVLYCFVSET
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 FPKFYNKLK-ICS--LKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVANSFQSQSDGQWDPH
. .:. : : .. :... : :
CCDS98 THRDLARLRGACLAFLTCSRTGRAREAYPLGAPEASGKSGAQGEEPELLTKLHPAFQTPN
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 IVEWH
CCDS98 SPGSGGFPTGRLA
360
>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX (370 aa)
initn: 313 init1: 199 opt: 420 Z-score: 410.8 bits: 84.5 E(32554): 1.5e-16
Smith-Waterman score: 489; 32.4% identity (62.1% similar) in 306 aa overlap (24-310:48-347)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVALCGFCFHMKTWKPSTVY
:.:.:: . :.:.: :::.:: . ....
CCDS14 LRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVSLFVFCFRMKMRSETAIF
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LFNLAVADFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLAMNRAGSIVFLTVVAADR
. ::::.:.:.. :::. .: ::: ::: :... .. : ::..::: ...::
CCDS14 ITNLAVSDLLFVCTLPFKI-FYNFNRHWPFGDTLCKISGTAFLTNIYGSMLFLTCISVDR
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 YFKVVHPHHAVNTISTRVAAGIVCT-LWALVILGTVYLLLENHLCVQETAVSC-ESFIME
.. .:.: .. :: :: ..:::. .: ::. : . : . :......: :.:
CCDS14 FLAIVYPFRS-RTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFSTTNVNNATTTCFEGF---
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220
pF1KB8 SANGWHDIMFQLEFFM-------PLGIILFCSFKIVWSLRRRQQLAR-QARMKKATRFIM
: :. . .. .:. :: . . :: .. .::. :.. . ::. ..:
CCDS14 SKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPATLSQIGTNKKKVLKMIT
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270
pF1KB8 VVAIVFITCYLPSVSARLYFLWTVPSSA---C--DPSVHGALHITLSFTYMNSMLDPLVY
: ::..:..: :. :.. : :.: : . .. ::: .. .: .::..:
CCDS14 VHMAVFVVCFVPYNSV-LFLYALVRSQAITNCFLERFAKIMYPITLCLATLNCCFDPFIY
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 YFSSPSFPK-FY--NKLKICSL-KPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVANSFQSQS
::. :: : :: .... :: : . : .: . :
CCDS14 YFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQTTNNGGELMLESTF
320 330 340 350 360 370
340
pF1KB8 DGQWDPHIVEWH
>>CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 (388 aa)
initn: 300 init1: 141 opt: 415 Z-score: 405.8 bits: 83.7 E(32554): 2.8e-16
Smith-Waterman score: 415; 29.5% identity (60.0% similar) in 285 aa overlap (27-298:59-334)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MYNGSCCRIEGDTISQVMPPLLIVAFVLGALGNGVALCGFCFHMKTWKPSTVYLFN
..: .::.... . . : ...::.:
CCDS42 PAEAEEAVAGPGDARAAGMVAIQCIYALVCLVGLVGNALVIFVILRYAKMKTATNIYLLN
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LAVADFLLMICLPFRTDYYLRRRHWAFGDIPCRVGLFTLAMNRAGSIVFLTVVAADRYFK
::::: :.:. .:: .. : :: ::.. ::. : . ..: :. :::...:::
CCDS42 LAVADELFMLSVPFVASSAALR-HWPFGSVLCRAVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRYVA
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 VVHPHHAVNTISTRVAAGIVCTLW--ALVILGTVYLLLENHLCVQETAVSCESFIMESAN
:::: .:.. :: : .: .:.. . .. ... ::.:. ..
CCDS42 VVHPLRAATYRRPSVAKLINLGVWLASLLVTLPIAIFADTRPARGGQAVACN--LQWPHP
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220
pF1KB8 GWHDIM----FQLEFFMPLGIILFCSFKIVWSLR----RRQQLARQARMKKATRFIMVVA
.: .. : : :..:. : .: . :: ..: : :. :: ::....:.
CCDS42 AWSAVFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYLLIVGKMRAVALRAGWQQRRRSEKKITRLVLMVV
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 IVFITCYLPSVSARLYFLWTVPSSACDPSVHGALHITLSFTYMNSMLDPLVYYFSSPSFP
.::. :..: ..: :.. .. : .:. :..: ..: :: .:..: : : .:
CCDS42 VVFVLCWMPFYVVQLLNLFV---TSLDATVN---HVSLILSYANSCANPILYGFLSDNFR
270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 KFYNK---LKICSLKPKQPGHSKTQRPEEMPISNLGRRSCISVANSFQSQSDGQWDPHIV
.:... :. : :.
CCDS42 RFFQRVLCLRCCLLEGAGGAEEEPLDYYATALKSKGGAGCMCPPLPCQQEALQPEPGRKR
320 330 340 350 360 370
346 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 14:40:48 2016 done: Sun Nov 6 14:40:49 2016
Total Scan time: 2.420 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]