Result of FASTA (omim) for
pFN21AB8596
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8596, 898 aa
1>>>pF1KB8596 898 - 898 aa - 898 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7113+/-0.000563; mu= 4.7292+/- 0.035
mean_var=181.6450+/-37.304, 0's: 0 Z-trim(113.2): 279 B-trim: 632 in 1/52
Lambda= 0.095162
statistics sampled from 22112 (22394) to 22112 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 8.590
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016873868 (OMIM: 611271) PREDICTED: kinesin-lik ( 898) 5887 821.8 0
NP_112494 (OMIM: 611271) kinesin-like protein KIF1 ( 898) 5887 821.8 0
XP_016873869 (OMIM: 611271) PREDICTED: kinesin-lik ( 454) 3035 430.1 1.2e-119
XP_011522693 (OMIM: 614570) PREDICTED: kinesin-lik ( 437) 1535 224.2 1.1e-57
NP_001251503 (OMIM: 614570) kinesin-like protein K ( 833) 1535 224.3 1.9e-57
XP_011522691 (OMIM: 614570) PREDICTED: kinesin-lik ( 842) 1535 224.3 1.9e-57
NP_001252506 (OMIM: 614570) kinesin-like protein K ( 852) 1535 224.3 1.9e-57
XP_011522690 (OMIM: 614570) PREDICTED: kinesin-lik ( 861) 1535 224.3 1.9e-57
XP_011522689 (OMIM: 614570) PREDICTED: kinesin-lik ( 864) 1535 224.3 2e-57
XP_011522688 (OMIM: 614570) PREDICTED: kinesin-lik ( 864) 1535 224.3 2e-57
XP_011522687 (OMIM: 614570) PREDICTED: kinesin-lik ( 873) 1535 224.3 2e-57
XP_011522692 (OMIM: 614570) PREDICTED: kinesin-lik ( 838) 893 136.2 6.5e-31
XP_016864485 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 697) 825 126.8 3.6e-28
NP_008985 (OMIM: 604683) kinesin-like protein KIF3 ( 699) 821 126.3 5.3e-28
XP_006714589 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 724) 821 126.3 5.4e-28
NP_001287720 (OMIM: 604683) kinesin-like protein K ( 726) 821 126.3 5.4e-28
XP_016868746 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1490) 825 127.0 6.8e-28
XP_005273515 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1805) 825 127.0 7.9e-28
NP_056069 (OMIM: 607350) kinesin-like protein KIF1 (1826) 825 127.0 8e-28
XP_011542760 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1826) 825 127.0 8e-28
XP_011542759 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1847) 825 127.0 8.1e-28
XP_016864484 (OMIM: 604683) PREDICTED: kinesin-lik ( 700) 807 124.3 2e-27
NP_001287721 (OMIM: 604683) kinesin-like protein K ( 702) 807 124.3 2e-27
NP_001092763 (OMIM: 609184) chromosome-associated (1234) 811 125.0 2.2e-27
NP_004789 (OMIM: 603754) kinesin-like protein KIF3 ( 747) 798 123.1 5e-27
NP_036442 (OMIM: 300521,300923) chromosome-associa (1232) 801 123.6 5.7e-27
XP_011542761 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1783) 782 121.1 4.7e-26
XP_011542762 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1783) 782 121.1 4.7e-26
XP_011542763 (OMIM: 607350) PREDICTED: kinesin-lik (1783) 782 121.1 4.7e-26
XP_005246008 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 984) 762 118.2 1.9e-25
XP_005246007 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 985) 762 118.2 1.9e-25
XP_011540147 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 992) 762 118.2 1.9e-25
XP_011540146 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik ( 997) 762 118.2 1.9e-25
XP_011540145 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1017) 762 118.2 2e-25
NP_001116291 (OMIM: 605037) kinesin-like protein K (1028) 762 118.2 2e-25
NP_065867 (OMIM: 605037) kinesin-like protein KIF1 (1029) 762 118.2 2e-25
XP_011540144 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1031) 762 118.2 2e-25
XP_011540143 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1038) 762 118.3 2e-25
XP_011540142 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1042) 762 118.3 2e-25
XP_011540141 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1043) 762 118.3 2e-25
XP_011540140 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1062) 762 118.3 2e-25
XP_011540139 (OMIM: 605037) PREDICTED: kinesin-lik (1063) 762 118.3 2e-25
XP_016859551 (OMIM: 604593,615282) PREDICTED: kine ( 957) 761 118.1 2.1e-25
NP_004513 (OMIM: 604593,615282) kinesin heavy chai ( 957) 761 118.1 2.1e-25
NP_001099038 (OMIM: 605433) kinesin-like protein K (1749) 760 118.1 3.7e-25
NP_001099037 (OMIM: 605433) kinesin-like protein K (1757) 760 118.1 3.8e-25
XP_016866681 (OMIM: 605433) PREDICTED: kinesin-lik (1762) 760 118.1 3.8e-25
NP_001099036 (OMIM: 605433) kinesin-like protein K (1770) 760 118.1 3.8e-25
XP_016866679 (OMIM: 605433) PREDICTED: kinesin-lik (1784) 760 118.1 3.8e-25
XP_016866678 (OMIM: 605433) PREDICTED: kinesin-lik (1792) 760 118.1 3.8e-25
>>XP_016873868 (OMIM: 611271) PREDICTED: kinesin-like pr (898 aa)
initn: 5887 init1: 5887 opt: 5887 Z-score: 4381.0 bits: 821.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5887; 100.0% identity (100.0% similar) in 898 aa overlap (1-898:1-898)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSVTEEDLCHHMKVVVRVRPENTKEKAAGFHKVVHVVDKHILVFDPKQEEVSFFHGKKTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSVTEEDLCHHMKVVVRVRPENTKEKAAGFHKVVHVVDKHILVFDPKQEEVSFFHGKKTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NQNVIKKQNKDLKFVFDAVFDETSTQSEVFEHTTKPILRSFLNGYNCTVLAYGATGAGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NQNVIKKQNKDLKFVFDAVFDETSTQSEVFEHTTKPILRSFLNGYNCTVLAYGATGAGKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HTMLGSADEPGVMYLTMLHLYKCMDEIKEEKICSTAVSYLEVYNEQIRDLLVNSGPLAVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HTMLGSADEPGVMYLTMLHLYKCMDEIKEEKICSTAVSYLEVYNEQIRDLLVNSGPLAVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EDTQKGVVVHGLTLHQPKSSEEILHLLDNGNKNRTQHPTDMNATSSRSHAVFQIYLRQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDTQKGVVVHGLTLHQPKSSEEILHLLDNGNKNRTQHPTDMNATSSRSHAVFQIYLRQQD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KTASINQNVRIAKMSLIDLAGSERASTSGAKGTRFVEGTNINRSLLALGNVINALADSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KTASINQNVRIAKMSLIDLAGSERASTSGAKGTRFVEGTNINRSLLALGNVINALADSKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVSPSSVFYDDTYNTLKYANRAKDIKSSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVSPSSVFYDDTYNTLKYANRAKDIKSSLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SNVLNVNNHITQYVKICNEQKAEILLLKEKLKAYEEQKAFTNENDQAKLMISNPQEKEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SNVLNVNNHITQYVKICNEQKAEILLLKEKLKAYEEQKAFTNENDQAKLMISNPQEKEIE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 RFQEILNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENELKSFYQQQCHKQIEMMCSEDKVEKATGKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RFQEILNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENELKSFYQQQCHKQIEMMCSEDKVEKATGKR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 DHRLAMLKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNWLHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKKDLHCHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DHRLAMLKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNWLHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKKDLHCHH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 LHLQNKDLKAQIRHMMDLACLQEQQHRQTEAVLNALLPTLRKQYCTLKEAGLSNAAFESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHLQNKDLKAQIRHMMDLACLQEQQHRQTEAVLNALLPTLRKQYCTLKEAGLSNAAFESD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 FKEIEHLVERKKVVVWADQTAEQPKQNDLPGISVLMTFPQLGPVQPIPCCSSSGGTNLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FKEIEHLVERKKVVVWADQTAEQPKQNDLPGISVLMTFPQLGPVQPIPCCSSSGGTNLVK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 IPTEKRTRRKLMPSPLKGQHTLKSPPSQSVQLNDSLSKELQPIVYTPEDCRKAFQNPSTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPTEKRTRRKLMPSPLKGQHTLKSPPSQSVQLNDSLSKELQPIVYTPEDCRKAFQNPSTV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 TLMKPSSFTTSFQAISSNINSDNCLKMLCEVAIPHNRRKECGQEDLDSTFTICEDIKSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TLMKPSSFTTSFQAISSNINSDNCLKMLCEVAIPHNRRKECGQEDLDSTFTICEDIKSSK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 CKLPEQESLPNDNKDILQRLDPSSFSTKHSMPVPSMVPSYMAMTTAAKRKRKLTSSTSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CKLPEQESLPNDNKDILQRLDPSSFSTKHSMPVPSMVPSYMAMTTAAKRKRKLTSSTSNS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB8 SLTADVNSGFAKRVRQDNSSEKHLQENKPTMEHKRNICKINPSMVRKFGRNISKGNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLTADVNSGFAKRVRQDNSSEKHLQENKPTMEHKRNICKINPSMVRKFGRNISKGNLR
850 860 870 880 890
>>NP_112494 (OMIM: 611271) kinesin-like protein KIF18A [ (898 aa)
initn: 5887 init1: 5887 opt: 5887 Z-score: 4381.0 bits: 821.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5887; 100.0% identity (100.0% similar) in 898 aa overlap (1-898:1-898)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSVTEEDLCHHMKVVVRVRPENTKEKAAGFHKVVHVVDKHILVFDPKQEEVSFFHGKKTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 MSVTEEDLCHHMKVVVRVRPENTKEKAAGFHKVVHVVDKHILVFDPKQEEVSFFHGKKTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NQNVIKKQNKDLKFVFDAVFDETSTQSEVFEHTTKPILRSFLNGYNCTVLAYGATGAGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 NQNVIKKQNKDLKFVFDAVFDETSTQSEVFEHTTKPILRSFLNGYNCTVLAYGATGAGKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HTMLGSADEPGVMYLTMLHLYKCMDEIKEEKICSTAVSYLEVYNEQIRDLLVNSGPLAVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 HTMLGSADEPGVMYLTMLHLYKCMDEIKEEKICSTAVSYLEVYNEQIRDLLVNSGPLAVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EDTQKGVVVHGLTLHQPKSSEEILHLLDNGNKNRTQHPTDMNATSSRSHAVFQIYLRQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 EDTQKGVVVHGLTLHQPKSSEEILHLLDNGNKNRTQHPTDMNATSSRSHAVFQIYLRQQD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KTASINQNVRIAKMSLIDLAGSERASTSGAKGTRFVEGTNINRSLLALGNVINALADSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 KTASINQNVRIAKMSLIDLAGSERASTSGAKGTRFVEGTNINRSLLALGNVINALADSKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVSPSSVFYDDTYNTLKYANRAKDIKSSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 KNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVSPSSVFYDDTYNTLKYANRAKDIKSSLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SNVLNVNNHITQYVKICNEQKAEILLLKEKLKAYEEQKAFTNENDQAKLMISNPQEKEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 SNVLNVNNHITQYVKICNEQKAEILLLKEKLKAYEEQKAFTNENDQAKLMISNPQEKEIE
370 380 390 400 410 420
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pF1KB8 RFQEILNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENELKSFYQQQCHKQIEMMCSEDKVEKATGKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 RFQEILNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENELKSFYQQQCHKQIEMMCSEDKVEKATGKR
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pF1KB8 DHRLAMLKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNWLHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKKDLHCHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 DHRLAMLKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNWLHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKKDLHCHH
490 500 510 520 530 540
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pF1KB8 LHLQNKDLKAQIRHMMDLACLQEQQHRQTEAVLNALLPTLRKQYCTLKEAGLSNAAFESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 LHLQNKDLKAQIRHMMDLACLQEQQHRQTEAVLNALLPTLRKQYCTLKEAGLSNAAFESD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 FKEIEHLVERKKVVVWADQTAEQPKQNDLPGISVLMTFPQLGPVQPIPCCSSSGGTNLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 FKEIEHLVERKKVVVWADQTAEQPKQNDLPGISVLMTFPQLGPVQPIPCCSSSGGTNLVK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 IPTEKRTRRKLMPSPLKGQHTLKSPPSQSVQLNDSLSKELQPIVYTPEDCRKAFQNPSTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 IPTEKRTRRKLMPSPLKGQHTLKSPPSQSVQLNDSLSKELQPIVYTPEDCRKAFQNPSTV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 TLMKPSSFTTSFQAISSNINSDNCLKMLCEVAIPHNRRKECGQEDLDSTFTICEDIKSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 TLMKPSSFTTSFQAISSNINSDNCLKMLCEVAIPHNRRKECGQEDLDSTFTICEDIKSSK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 CKLPEQESLPNDNKDILQRLDPSSFSTKHSMPVPSMVPSYMAMTTAAKRKRKLTSSTSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 CKLPEQESLPNDNKDILQRLDPSSFSTKHSMPVPSMVPSYMAMTTAAKRKRKLTSSTSNS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB8 SLTADVNSGFAKRVRQDNSSEKHLQENKPTMEHKRNICKINPSMVRKFGRNISKGNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 SLTADVNSGFAKRVRQDNSSEKHLQENKPTMEHKRNICKINPSMVRKFGRNISKGNLR
850 860 870 880 890
>>XP_016873869 (OMIM: 611271) PREDICTED: kinesin-like pr (454 aa)
initn: 3035 init1: 3035 opt: 3035 Z-score: 2269.3 bits: 430.1 E(85289): 1.2e-119
Smith-Waterman score: 3035; 100.0% identity (100.0% similar) in 454 aa overlap (445-898:1-454)
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 QEKEIERFQEILNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENELKSFYQQQCHKQIEMMCSEDKVE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLLKENELKSFYQQQCHKQIEMMCSEDKVE
10 20 30
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 KATGKRDHRLAMLKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNWLHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KATGKRDHRLAMLKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNWLHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKK
40 50 60 70 80 90
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 DLHCHHLHLQNKDLKAQIRHMMDLACLQEQQHRQTEAVLNALLPTLRKQYCTLKEAGLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLHCHHLHLQNKDLKAQIRHMMDLACLQEQQHRQTEAVLNALLPTLRKQYCTLKEAGLSN
100 110 120 130 140 150
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 AAFESDFKEIEHLVERKKVVVWADQTAEQPKQNDLPGISVLMTFPQLGPVQPIPCCSSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAFESDFKEIEHLVERKKVVVWADQTAEQPKQNDLPGISVLMTFPQLGPVQPIPCCSSSG
160 170 180 190 200 210
660 670 680 690 700 710
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XP_016 GTNLVKIPTEKRTRRKLMPSPLKGQHTLKSPPSQSVQLNDSLSKELQPIVYTPEDCRKAF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNPSTVTLMKPSSFTTSFQAISSNINSDNCLKMLCEVAIPHNRRKECGQEDLDSTFTICE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DIKSSKCKLPEQESLPNDNKDILQRLDPSSFSTKHSMPVPSMVPSYMAMTTAAKRKRKLT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSTSNSSLTADVNSGFAKRVRQDNSSEKHLQENKPTMEHKRNICKINPSMVRKFGRNISK
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::::
XP_016 GNLR
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..::::::: . .: . . ::.:::...:::.:.. . .:
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..:::.. ...: :..:::::::::::::::.. ::: :. ::.::::::::: ::.:::
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430
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.. ...: :..:::::::::::::::.. ::: :. ::.::::::::: ::.:::::.:
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pF1KB8 KNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVSPSSVFYDDTYNTLKYANRAKDIKSSLK
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::: ... ::.::. ::.. .::. :..::..:: .. .. . : :.
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.. :.: ...:.. . ..: . ::. . ..: .: . . .:. . :. .
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. :.. ..: .. ... : :. ..:. .:. : : : . .. ::.
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pF1KB8 -EAGLSNAAFESDFKEIEHLVER---KKVVVWADQTAEQPKQNDLPGISVLMTFPQLGP-
: : ..: : . . :... ... : . : : . : .. :. ::
NP_001 IEPG-AEALRTSGLARGAPLAQELCSESIPVPSPLCPEPPGYTG-P-VTRTMARRLSGPL
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pF1KB8 ----VQPIPCCSSSGGTNLVKIPTEKRTRRKLMPSPLKGQHTLKSPPSQSVQLNDSLSKE
. : : :. . :. . : ::. :: :: :... . :..... ..
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pF1KB8 LQPIVYTPEDCRKAFQNPSTVTLMKPSSFTTSFQAISSNINSDN-CLKMLCEVAIP--HN
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pF1KB8 RRKECGQ------EDLDSTFTICEDIKSS----KC----KLPEQESLPNDNKDILQRLDP
..:. .::..:: . :. :. .: :.:.. : .. .. :
NP_001 AMQNCSTPLALPTRDLNATFDLSEEPPSKPSFHECIGWDKIPQE--LSRLDQPFIPRAPV
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pF1KB8 SSFSTKHSMPVPSMVPSYMAMTTAAKRKRKLTSSTSNS-SLTADVNSGFAKRVRQDNSSE
:. : :. :. :. :.: :.:: .::.:.. : : . :. ::
NP_001 PLFTMKGPKPTSSL-PG----TSACKKKRVASSSVSHGRSRIARLPSSTLKRPAGPLVLP
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NP_001 GDWH
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pF1KB8 MSVTEEDLCHHMKVVVRVRPENTKEKAAGFHKVVHVVDKHILVFDPKQEEVSFFH
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XP_011 LKWGGTHDGPKKKGKDLTFVFDRVFGEAATQQDVFQHTTHSVLDSFLQGYNCSVFAYGAT
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pF1KB8 PLAVREDTQKGVVVHGLTLHQPKSSEEILHLLDNGNKNRTQHPTDMNATSSRSHAVFQIY
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XP_011 PLAIREDPDKGVVVQGLSFHQPASAEQLLEILTRGNRNRTQHPTDANATSSRSHAIFQIF
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240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LRQQDKTASINQNVRIAKMSLIDLAGSERASTSGAKGTRFVEGTNINRSLLALGNVINAL
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XP_011 VKQQDRVPGLTQAVQVAKMSLIDLAGSERASSTHAKGERLREGANINRSLLALINVLNAL
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pF1KB8 ADSKRKNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVSPSSVFYDDTYNTLKYANRAKDI
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XP_011 ADAKGRKTHVPYRDSKLTRLLKDSLGGNCRTVMIAAISPSSLTYEDTYNTLKYADRAKEI
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pF1KB8 KSSLKSNVLNVNNHITQYVKICNEQKAEILLLKEKLKAYEEQKAFTNENDQAKLMISNPQ
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pF1KB8 EKEIERFQEILNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENELKSFYQQQCHKQIEMMCSEDKVEK
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XP_011 EH-----------------------------LPSSPLPPHPPSQ-------PCTPELPAG
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pF1KB8 ATGKRDHRLAM-LKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNWLHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKK
. ... :.: ...:.. . ..: . ::. . ..: .: . . .:. .
XP_011 PRALQEESLGMEAQVERAMEGNSSDQEQSPEDEDEGPAEEVPTQMPEQNPTHALPESPRL
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pF1KB8 DLHCHHL--HLQNKDLKAQIRHMMDLA--CLQEQQHRQTEAVLNALLPTLRKQYCTLK--
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XP_011 TLQPKPVVGHFSARELDGDRSKQLALKVLCVAQRQYSLLQAA-NLLTPDMITEFETLQQL
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pF1KB8 QLGP-----VQPIPCCSSSGGTNLVKIPTEKRTRRKLMPSPLKGQHTLKSPPSQSVQLND
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pF1KB8 SLSKELQPIVYTPEDCRKAFQNPSTVTLMKPSSFTTSFQAISSNINSDN-CLKMLCEVAI
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pF1KB8 P--HNRRKECGQ------EDLDSTFTICEDIKSS----KC----KLPEQESLPNDNKDIL
: . ..:. .::..:: . :. :. .: :.:.. : .. ..
XP_011 PLGPSAMQNCSTPLALPTRDLNATFDLSEEPPSKPSFHECIGWDKIPQE--LSRLDQPFI
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pF1KB8 QRLDPSSFSTKHSMPVPSMVPSYMAMTTAAKRKRKLTSSTSNS-SLTADVNSGFAKRVRQ
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XP_011 PRAPVPLFTMKGPKPTSSL-PG----TSACKKKRVASSSVSHGRSRIARLPSSTLKRPAG
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pF1KB8 DNSSEKHLQENKPTMEHKRNICKINPSMVRKFGRNISKGNLR
XP_011 PLVLPGDWH
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pF1KB8 MSVTEEDLCHHMKVVVRVRPENTKEKAAGFHKVVHVVDKHILVFDPKQEEVSFFHGKKTT
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pF1KB8 NQNVIKKQNKDLKFVFDAVFDETSTQSEVFEHTTKPILRSFLNGYNCTVLAYGATGAGKT
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pF1KB8 EDTQKGVVVHGLTLHQPKSSEEILHLLDNGNKNRTQHPTDMNATSSRSHAVFQIYLRQQD
:: .:::::.::..::: :.:..:..: ::.:::::::: :::::::::.:::...:::
NP_001 EDPDKGVVVQGLSFHQPASAEQLLEILTRGNRNRTQHPTDANATSSRSHAIFQIFVKQQD
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pF1KB8 KTASINQNVRIAKMSLIDLAGSERASTSGAKGTRFVEGTNINRSLLALGNVINALADSKR
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NP_001 RVPGLTQAVQVAKMSLIDLAGSERASSTHAKGERLREGANINRSLLALINVLNALADAKG
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NP_001 RKTHVPYRDSKLTRLLKDSLGGNCRTVMIAAISPSSLTYEDTYNTLKYADRAKEIRLSLK
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NP_001 SNVTSLDCHISQYATICQQLQAEVAALRKKLQVYE-----GGGQPPPQDLPGSPKSGPPP
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. : : . . ...: : .: : .. .: :.. :.. .
NP_001 EHQPCTPELPAGPRALQEESLGMEA-------------QVERAMEGNSSDQ--EQSPEDE
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pF1KB8 DHRLAMLKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNWLHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKKDLHCHH
: : :: :. :. : : . . : : :: . . ..
NP_001 D-------------EGPAEEVPTQMPEQ-NPTHALPESPRLTLQ----PKPVVGHFSARE
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: . : . :. . . :. ..:. .:. : : : . .. ::. : :
NP_001 L---DGDRSKQL--ALKVLCVAQRQYSLLQAA-NLLTPDMITEFETLQQLVQEEKIEPG-
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XP_011 ELPLSPLCPS--NRRN----GKDLIR-VGRALSAGNGVTKVS
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898 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 10:40:37 2016 done: Tue Nov 8 10:40:38 2016
Total Scan time: 8.590 Total Display time: 0.230
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]