Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8537
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8537, 972 aa
1>>>pF1KB8537 972 - 972 aa - 972 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2526+/-0.00105; mu= 17.3107+/- 0.064
mean_var=97.1291+/-19.018, 0's: 0 Z-trim(106.0): 26 B-trim: 284 in 1/51
Lambda= 0.130137
statistics sampled from 8750 (8760) to 8750 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16
Scan time: 4.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46371.1 INPP4A gene_id:3631|Hs108|chr2 ( 972) 6466 1225.2 0
CCDS46369.1 INPP4A gene_id:3631|Hs108|chr2 ( 977) 6446 1221.5 0
CCDS46370.1 INPP4A gene_id:3631|Hs108|chr2 ( 938) 3718 709.3 9e-204
CCDS46372.1 INPP4A gene_id:3631|Hs108|chr2 ( 954) 3718 709.3 9.2e-204
CCDS3757.1 INPP4B gene_id:8821|Hs108|chr4 ( 924) 1355 265.6 3.2e-70
CCDS82958.1 INPP4B gene_id:8821|Hs108|chr4 ( 938) 1133 224.0 1.1e-57
>>CCDS46371.1 INPP4A gene_id:3631|Hs108|chr2 (972 aa)
initn: 6466 init1: 6466 opt: 6466 Z-score: 6559.9 bits: 1225.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6466; 99.9% identity (99.9% similar) in 972 aa overlap (1-972:1-972)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTAREHSPRHGARARAMQRASTIDVAADMLGLSLAGNIQDPDEPILEFSLACSELHTPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTAREHSPRHGARARAMQRASTIDVAADMLGLSLAGNIQDPDEPILEFSLACSELHTPSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DRKPNSFVAVSVTTPPQAFWTKHAQTEIIEGTNNPIFLSSIAFFQDSLINQMTQVKLSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DRKPNSFVAVSVTTPPQAFWTKHAQTEIIEGTNNPIFLSSIAFFQDSLINQMTQVKLSVY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DVKDRSQGTMYLLGSGTFIVKDLLQDRHHRLHLTLRSAESDRVGNITVIGWQMEEKSDQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DVKDRSQGTMYLLGSGTFIVKDLLQDRHHRLHLTLRSAESDRVGNITVIGWQMEEKSDQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PPVTRSVDTVNGRMVLPVDESLTEALGIRSKYASLRKDTLLKSVFGGAICRMYRFPTTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PPVTRSVDTVNGRMVLPVDESLTEALGIRSKYASLRKDTLLKSVFGGAICRMYRFPTTDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NHLRILEQMAESVLSLHVPRQFVKLLLEEDAARVCELEELGELSPCWESLRRQIVTQYQT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IILTYQENLTDLHQYRGPSFKASSLKADKKLEFVPTNLHIQRMRVQDDGGSDQNYDIVTI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GAPAAHCQGFKSGGLRKKLHKFEETKKHTSSGCQSIIYIPQDVVRAKEIIAQINTLKTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GAPAAHCQGFKSGGLRKKLHKFEETKKHTSSGCQSIIYIPQDVVRAKEIIAQINTLKTQV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SYYAERLSRAAKDRSATGLERTLAILADKTRQLVTVCDCKLLANSIHGLNAARPDYIASK
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490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ASPTSTEEEQVMLRNDQDTLMARWTGRNSRSSLQVDWHEEEWEKVWLNVDKSLECIIQRV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DKLLQKERLHGEGCEDVFPCAGSCTSKKGNPDSHAYWIRPEDPFCDVPSSPCPSTMPSTA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 CHPHLTTHCSPPPEESSPGEWSEALYPLLTTLTDCVAMMSDKAKKAMVFLLMQDSAPTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CHPHLTTHCSPPPEESSPGEWSEALYPLLTTLTDCVAMMSDKAKKAMVFLLMQDSAPTIA
610 620 630 640 650 660
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pF1KB8 TYLSLQYRRDVVFCQTLTALICGFIIKLRNCLHDDGFLRQLYTIGLLAQFESLLSTYGEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TYLSLQYRRDVVFCQTLTALICGFIIKLRNCLHDDGFLRQLYTIGLLAQFESLLSTYGEE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LAMLEDMSLGIMDLRNVTFKVTQATSSASADMLPVITGNRDEFNVRVPLPGPLFDALPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS46 LAMLEDMSLGIMDLRNVTFKVTQATSSASADMLPVITGNRDGFNVRVPLPGPLFDALPRE
730 740 750 760 770 780
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pF1KB8 IQSGMLLRVQPVLFNVGINEQQTLAERFGDTSLQEVINVESLVRLNSYFEQFKEVLPEDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IQSGMLLRVQPVLFNVGINEQQTLAERFGDTSLQEVINVESLVRLNSYFEQFKEVLPEDC
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pF1KB8 LPRSRSQTCLPELLRFLGQNVHARKNKNVDILWQAAEICRRLNGVRFTSCKSAKDRTAMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPRSRSQTCLPELLRFLGQNVHARKNKNVDILWQAAEICRRLNGVRFTSCKSAKDRTAMS
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pF1KB8 VTLEQCLILQHEHGMAPQVFTQALECMRSEGCRRENTMKNVGSRKYAFNSLQLKAFPKHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VTLEQCLILQHEHGMAPQVFTQALECMRSEGCRRENTMKNVGSRKYAFNSLQLKAFPKHY
910 920 930 940 950 960
970
pF1KB8 RPPEGTYGKVET
::::::::::::
CCDS46 RPPEGTYGKVET
970
>>CCDS46369.1 INPP4A gene_id:3631|Hs108|chr2 (977 aa)
initn: 3916 init1: 3916 opt: 6446 Z-score: 6539.6 bits: 1221.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6446; 99.4% identity (99.4% similar) in 977 aa overlap (1-972:1-977)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTAREHSPRHGARARAMQRASTIDVAADMLGLSLAGNIQDPDEPILEFSLACSELHTPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTAREHSPRHGARARAMQRASTIDVAADMLGLSLAGNIQDPDEPILEFSLACSELHTPSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DRKPNSFVAVSVTTPPQAFWTKHAQTEIIEGTNNPIFLSSIAFFQDSLINQMTQVKLSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DRKPNSFVAVSVTTPPQAFWTKHAQTEIIEGTNNPIFLSSIAFFQDSLINQMTQVKLSVY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DVKDRSQGTMYLLGSGTFIVKDLLQDRHHRLHLTLRSAESDRVGNITVIGWQMEEKSDQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DVKDRSQGTMYLLGSGTFIVKDLLQDRHHRLHLTLRSAESDRVGNITVIGWQMEEKSDQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PPVTRSVDTVNGRMVLPVDESLTEALGIRSKYASLRKDTLLKSVFGGAICRMYRFPTTDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NHLRILEQMAESVLSLHVPRQFVKLLLEEDAARVCELEELGELSPCWESLRRQIVTQYQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NHLRILEQMAESVLSLHVPRQFVKLLLEEDAARVCELEELGELSPCWESLRRQIVTQYQT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IILTYQENLTDLHQYRGPSFKASSLKADKKLEFVPTNLHIQRMRVQDDGGSDQNYDIVTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IILTYQENLTDLHQYRGPSFKASSLKADKKLEFVPTNLHIQRMRVQDDGGSDQNYDIVTI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB8 GAPAAHCQGFKSGGLRKKLHKFEETKKH-----TSSGCQSIIYIPQDVVRAKEIIAQINT
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GAPAAHCQGFKSGGLRKKLHKFEETKKHFEECCTSSGCQSIIYIPQDVVRAKEIIAQINT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKTQVSYYAERLSRAAKDRSATGLERTLAILADKTRQLVTVCDCKLLANSIHGLNAARPD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YIASKASPTSTEEEQVMLRNDQDTLMARWTGRNSRSSLQVDWHEEEWEKVWLNVDKSLEC
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pF1KB8 IIQRVDKLLQKERLHGEGCEDVFPCAGSCTSKKGNPDSHAYWIRPEDPFCDVPSSPCPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IIQRVDKLLQKERLHGEGCEDVFPCAGSCTSKKGNPDSHAYWIRPEDPFCDVPSSPCPST
550 560 570 580 590 600
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pF1KB8 MPSTACHPHLTTHCSPPPEESSPGEWSEALYPLLTTLTDCVAMMSDKAKKAMVFLLMQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MPSTACHPHLTTHCSPPPEESSPGEWSEALYPLLTTLTDCVAMMSDKAKKAMVFLLMQDS
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 APTIATYLSLQYRRDVVFCQTLTALICGFIIKLRNCLHDDGFLRQLYTIGLLAQFESLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APTIATYLSLQYRRDVVFCQTLTALICGFIIKLRNCLHDDGFLRQLYTIGLLAQFESLLS
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pF1KB8 TYGEELAMLEDMSLGIMDLRNVTFKVTQATSSASADMLPVITGNRDEFNVRVPLPGPLFD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS46 TYGEELAMLEDMSLGIMDLRNVTFKVTQATSSASADMLPVITGNRDGFNVRVPLPGPLFD
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pF1KB8 ALPREIQSGMLLRVQPVLFNVGINEQQTLAERFGDTSLQEVINVESLVRLNSYFEQFKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ALPREIQSGMLLRVQPVLFNVGINEQQTLAERFGDTSLQEVINVESLVRLNSYFEQFKEV
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB8 LPEDCLPRSRSQTCLPELLRFLGQNVHARKNKNVDILWQAAEICRRLNGVRFTSCKSAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPEDCLPRSRSQTCLPELLRFLGQNVHARKNKNVDILWQAAEICRRLNGVRFTSCKSAKD
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pF1KB8 RTAMSVTLEQCLILQHEHGMAPQVFTQALECMRSEGCRRENTMKNVGSRKYAFNSLQLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RTAMSVTLEQCLILQHEHGMAPQVFTQALECMRSEGCRRENTMKNVGSRKYAFNSLQLKA
910 920 930 940 950 960
960 970
pF1KB8 FPKHYRPPEGTYGKVET
:::::::::::::::::
CCDS46 FPKHYRPPEGTYGKVET
970
>>CCDS46370.1 INPP4A gene_id:3631|Hs108|chr2 (938 aa)
initn: 4955 init1: 2560 opt: 3718 Z-score: 3771.8 bits: 709.3 E(32554): 9e-204
Smith-Waterman score: 6038; 95.3% identity (95.3% similar) in 977 aa overlap (1-972:1-938)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTAREHSPRHGARARAMQRASTIDVAADMLGLSLAGNIQDPDEPILEFSLACSELHTPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTAREHSPRHGARARAMQRASTIDVAADMLGLSLAGNIQDPDEPILEFSLACSELHTPSL
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70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DRKPNSFVAVSVTTPPQAFWTKHAQTEIIEGTNNPIFLSSIAFFQDSLINQMTQVKLSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DRKPNSFVAVSVTTPPQAFWTKHAQTEIIEGTNNPIFLSSIAFFQDSLINQMTQVKLSVY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 DVKDRSQGTMYLLGSGTFIVKDLLQDRHHRLHLTLRSAESDRVGNITVIGWQMEEKSDQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DVKDRSQGTMYLLGSGTFIVKDLLQDRHHRLHLTLRSAESDRVGNITVIGWQMEEKSDQR
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pF1KB8 PPVTRSVDTVNGRMVLPVDESLTEALGIRSKYASLRKDTLLKSVFGGAICRMYRFPTTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PPVTRSVDTVNGRMVLPVDESLTEALGIRSKYASLRKDTLLKSVFGGAICRMYRFPTTDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NHLRILEQMAESVLSLHVPRQFVKLLLEEDAARVCELEELGELSPCWESLRRQIVTQYQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NHLRILEQMAESVLSLHVPRQFVKLLLEEDAARVCELEELGELSPCWESLRRQIVTQYQT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IILTYQENLTDLHQYRGPSFKASSLKADKKLEFVPTNLHIQRMRVQDDGGSDQNYDIVTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IILTYQENLTDLHQYRGPSFKASSLKADKKLEFVPTNLHIQRMRVQDDGGSDQNYDIVTI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB8 GAPAAHCQGFKSGGLRKKLHKFEETKKH-----TSSGCQSIIYIPQDVVRAKEIIAQINT
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GAPAAHCQGFKSGGLRKKLHKFEETKKHFEECCTSSGCQSIIYIPQDVVRAKEIIAQINT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 LKTQVSYYAERLSRAAKDRSATGLERTLAILADKTRQLVTVCDCKLLANSIHGLNAARPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKTQVSYYAERLSRAAKDRSATGLERTLAILADKTRQLVTVCDCKLLANSIHGLNAARPD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 YIASKASPTSTEEEQVMLRNDQDTLMARWTGRNSRSSLQVDWHEEEWEKVWLNVDKSLEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YIASKASPTSTEEEQVMLRNDQDTLMARWTGRNSRSSLQVDWHEEEWEKVWLNVDKSLEC
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 IIQRVDKLLQKERLHGEGCEDVFPCAGSCTSKKGNPDSHAYWIRPEDPFCDVPSSPCPST
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IIQRVDKLLQKERLHGEGCEDVFPCAGSCTSKK---------------------------
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pF1KB8 MPSTACHPHLTTHCSPPPEESSPGEWSEALYPLLTTLTDCVAMMSDKAKKAMVFLLMQDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ------------DCSPPPEESSPGEWSEALYPLLTTLTDCVAMMSDKAKKAMVFLLMQDS
580 590 600 610 620
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pF1KB8 APTIATYLSLQYRRDVVFCQTLTALICGFIIKLRNCLHDDGFLRQLYTIGLLAQFESLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APTIATYLSLQYRRDVVFCQTLTALICGFIIKLRNCLHDDGFLRQLYTIGLLAQFESLLS
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 TYGEELAMLEDMSLGIMDLRNVTFKVTQATSSASADMLPVITGNRDEFNVRVPLPGPLFD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS46 TYGEELAMLEDMSLGIMDLRNVTFKVTQATSSASADMLPVITGNRDGFNVRVPLPGPLFD
690 700 710 720 730 740
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 ALPREIQSGMLLRVQPVLFNVGINEQQTLAERFGDTSLQEVINVESLVRLNSYFEQFKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ALPREIQSGMLLRVQPVLFNVGINEQQTLAERFGDTSLQEVINVESLVRLNSYFEQFKEV
750 760 770 780 790 800
840 850 860 870 880 890
pF1KB8 LPEDCLPRSRSQTCLPELLRFLGQNVHARKNKNVDILWQAAEICRRLNGVRFTSCKSAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPEDCLPRSRSQTCLPELLRFLGQNVHARKNKNVDILWQAAEICRRLNGVRFTSCKSAKD
810 820 830 840 850 860
900 910 920 930 940 950
pF1KB8 RTAMSVTLEQCLILQHEHGMAPQVFTQALECMRSEGCRRENTMKNVGSRKYAFNSLQLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RTAMSVTLEQCLILQHEHGMAPQVFTQALECMRSEGCRRENTMKNVGSRKYAFNSLQLKA
870 880 890 900 910 920
960 970
pF1KB8 FPKHYRPPEGTYGKVET
:::::::::::::::::
CCDS46 FPKHYRPPEGTYGKVET
930
>>CCDS46372.1 INPP4A gene_id:3631|Hs108|chr2 (954 aa)
initn: 5845 init1: 2550 opt: 3718 Z-score: 3771.7 bits: 709.3 E(32554): 9.2e-204
Smith-Waterman score: 5764; 94.4% identity (94.7% similar) in 946 aa overlap (1-941:1-907)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTAREHSPRHGARARAMQRASTIDVAADMLGLSLAGNIQDPDEPILEFSLACSELHTPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTAREHSPRHGARARAMQRASTIDVAADMLGLSLAGNIQDPDEPILEFSLACSELHTPSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DRKPNSFVAVSVTTPPQAFWTKHAQTEIIEGTNNPIFLSSIAFFQDSLINQMTQVKLSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DRKPNSFVAVSVTTPPQAFWTKHAQTEIIEGTNNPIFLSSIAFFQDSLINQMTQVKLSVY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 DVKDRSQGTMYLLGSGTFIVKDLLQDRHHRLHLTLRSAESDRVGNITVIGWQMEEKSDQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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972 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]