Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8414
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8414, 913 aa
1>>>pF1KB8414 913 - 913 aa - 913 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0046+/-0.00139; mu= 13.8921+/- 0.083
mean_var=187.3304+/-36.011, 0's: 0 Z-trim(106.7): 130 B-trim: 47 in 2/48
Lambda= 0.093707
statistics sampled from 8996 (9126) to 8996 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 3.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6652.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9 ( 913) 6576 903.0 0
CCDS55320.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9 (1860) 6322 869.0 0
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CCDS73791.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 623) 2785 390.3 5.9e-108
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CCDS73792.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 664) 2785 390.3 6.1e-108
CCDS4081.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5 ( 753) 1968 280.0 1.2e-74
CCDS10364.1 FURIN gene_id:5045|Hs108|chr15 ( 794) 1941 276.3 1.5e-73
CCDS54881.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5 ( 706) 1893 269.8 1.3e-71
CCDS12069.2 PCSK4 gene_id:54760|Hs108|chr19 ( 755) 1776 254.0 7.7e-67
CCDS56180.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 619) 1623 233.2 1.1e-60
CCDS13125.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 638) 1623 233.2 1.2e-60
CCDS8382.1 PCSK7 gene_id:9159|Hs108|chr11 ( 785) 1545 222.8 2e-57
CCDS56179.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 603) 1528 220.4 8.2e-57
>>CCDS6652.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9 (913 aa)
initn: 6576 init1: 6576 opt: 6576 Z-score: 4819.5 bits: 903.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6576; 100.0% identity (100.0% similar) in 913 aa overlap (1-913:1-913)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NIGQIGALKDYYHFYHSRTIKRSVISSRGTHSFISMEPKVEWIQQQVVKKRTKRDYDFSR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AQSTYFNDPKWPSMWYMHCSDNTHPCQSDMNIEGAWKRGYTGKNIVVTILDDGIERTHPD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LMQNYDALASCDVNGNDLDPMPRYDASNENKHGTRCAGEVAAAANNSHCTVGIAFNAKIG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GVRMLDGDVTDMVEAKSVSFNPQHVHIYSASWGPDDDGKTVDGPAPLTRQAFENGVRMGR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RGLGSVFVWASGNGGRSKDHCSCDGYTNSIYTISISSTAESGKKPWYLEECSSTLATTYS
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pF1KB8 SGESYDKKIITTDLRQRCTDNHTGTSASAPMAAGIIALALEANPFLTWRDVQHVIVRTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SGESYDKKIITTDLRQRCTDNHTGTSASAPMAAGIIALALEANPFLTWRDVQHVIVRTSR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AGHLNANDWKTNAAGFKVSHLYGFGLMDAEAMVMEAEKWTTVPRQHVCVESTDRQIKTIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AGHLNANDWKTNAAGFKVSHLYGFGLMDAEAMVMEAEKWTTVPRQHVCVESTDRQIKTIR
430 440 450 460 470 480
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pF1KB8 PNSAVRSIYKASGCSDNPNRHVNYLEHVVVRITITHPRRGDLAIYLTSPSGTRSQLLANR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PNSAVRSIYKASGCSDNPNRHVNYLEHVVVRITITHPRRGDLAIYLTSPSGTRSQLLANR
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pF1KB8 LFDHSMEGFKNWEFMTIHCWGERAAGDWVLEVYDTPSQLRNFKTPGKLKEWSLVLYGTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LFDHSMEGFKNWEFMTIHCWGERAAGDWVLEVYDTPSQLRNFKTPGKLKEWSLVLYGTSV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 QPYSPTNEFPKVERFRYSRVEDPTDDYGTEDYAGPCDPECSEVGCDGPGPDHCNDCLHYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QPYSPTNEFPKVERFRYSRVEDPTDDYGTEDYAGPCDPECSEVGCDGPGPDHCNDCLHYY
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670 680 690 700 710 720
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 YKLKNNTRICVSSCPPGHYHADKKRCRKCAPNCESCFGSHGDQCMSCKYGYFLNEETNSC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 VTHCPDGSYQDTKKNLCRKCSENCKTCTEFHNCTECRDGLSLQGSRCSVSCEDGRYFNGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VTHCPDGSYQDTKKNLCRKCSENCKTCTEFHNCTECRDGLSLQGSRCSVSCEDGRYFNGQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 DCQPCHRFCATCAGAGADGCINCTEGYFMEDGRCVQSCSISYYFDHSSENGYKSCKKCDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DCQPCHRFCATCAGAGADGCINCTEGYFMEDGRCVQSCSISYYFDHSSENGYKSCKKCDI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 SCLTCNGPGFKNCTSCPSGYLLDLGMCQMGAICKDATEESWAEGGFCMLVKKNNLCQRKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SCLTCNGPGFKNCTSCPSGYLLDLGMCQMGAICKDATEESWAEGGFCMLVKKNNLCQRKV
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB8 LQQLCCKTCTFQG
:::::::::::::
CCDS66 LQQLCCKTCTFQG
910
>>CCDS55320.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9 (1860 aa)
initn: 6298 init1: 6298 opt: 6322 Z-score: 4630.3 bits: 869.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6322; 97.1% identity (97.9% similar) in 910 aa overlap (1-909:1-906)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGWGSRCCCPGRLDLLCVLALLGGCLLPVCRTRVYTNHWAVKIAGGFPEANRIASKYGFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MGWGSRCCCPGRLDLLCVLALLGGCLLPVCRTRVYTNHWAVKIAGGFPEANRIASKYGFI
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 NIGQIGALKDYYHFYHSRTIKRSVISSRGTHSFISMEPKVEWIQQQVVKKRTKRDYDFSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NIGQIGALKDYYHFYHSRTIKRSVISSRGTHSFISMEPKVEWIQQQVVKKRTKRDYDFSR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AQSTYFNDPKWPSMWYMHCSDNTHPCQSDMNIEGAWKRGYTGKNIVVTILDDGIERTHPD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LMQNYDALASCDVNGNDLDPMPRYDASNENKHGTRCAGEVAAAANNSHCTVGIAFNAKIG
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250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GVRMLDGDVTDMVEAKSVSFNPQHVHIYSASWGPDDDGKTVDGPAPLTRQAFENGVRMGR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RGLGSVFVWASGNGGRSKDHCSCDGYTNSIYTISISSTAESGKKPWYLEECSSTLATTYS
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SGESYDKKIITTDLRQRCTDNHTGTSASAPMAAGIIALALEANPFLTWRDVQHVIVRTSR
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AGHLNANDWKTNAAGFKVSHLYGFGLMDAEAMVMEAEKWTTVPRQHVCVESTDRQIKTIR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PNSAVRSIYKASGCSDNPNRHVNYLEHVVVRITITHPRRGDLAIYLTSPSGTRSQLLANR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LFDHSMEGFKNWEFMTIHCWGERAAGDWVLEVYDTPSQLRNFKTPGKLKEWSLVLYGTSV
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pF1KB8 QPYSPTNEFPKVERFRYSRVEDPTDDYGTEDYAGPCDPECSEVGCDGPGPDHCNDCLHYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QPYSPTNEFPKVERFRYSRVEDPTDDYGTEDYAGPCDPECSEVGCDGPGPDHCNDCLHYY
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pF1KB8 YKLKNNTRICVSSCPPGHYHADKKRCRKCAPNCESCFGSHGDQCMSCKYGYFLNEETNSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YKLKNNTRICVSSCPPGHYHADKKRCRKCAPNCESCFGSHGDQCMSCKYGYFLNEETNSC
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pF1KB8 VTHCPDGSYQDTKKNLCRKCSENCKTCTEFHNCTECRDGLSLQGSRCSVSCEDGRYFNGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTHCPDGSYQDTKKNLCRKCSENCKTCTEFHNCTECRDGLSLQGSRCSVSCEDGRYFNGQ
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pF1KB8 DCQPCHRFCATCAGAGADGCINCTEGYFMEDGRCVQSCSISYYFDHSSENGYKSCKKCDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DCQPCHRFCATCAGAGADGCINCTEGYFMEDGRCVQSCSISYYFDHSSENGYKSCKKCDI
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pF1KB8 SCLTCNGPGFKNCTSCPSGYLLDLGMCQMGAICKDATEESWAEGGFCMLVKKNNL-CQRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::. : : : :. . . ::
CCDS55 SCLTCNGPGFKNCTSCPSGYLLDLGMCQMGAICKDG--EYVDEHGHCQTCEASCAKCQGP
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900 910
pF1KB8 VLQQLCCKTCTFQG
. .. : ::
CCDS55 TQED--CTTCPMTRIFDDGRCVSNCPSWKFEFENQCHPCHHTCQRCQGSGPTHCTSCGAD
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>>CCDS73789.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 (956 aa)
initn: 3329 init1: 2474 opt: 3014 Z-score: 2216.8 bits: 421.5 E(32554): 3.7e-117
Smith-Waterman score: 3777; 56.3% identity (78.3% similar) in 932 aa overlap (2-913:38-956)
10 20 30
pF1KB8 MGWGSRCCCPGRLDLLCVLALLGGCLLPVCR
: : : : : .::: ..: : :
CCDS73 APGPRPPPRAAAATDTAAGAGGAGGAGGAGGPGFRPLAPRPWRWLLLLALPAACSAPPPR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 TRVYTNHWAVKIAGGFPEANRIASKYGFINIGQIGALKDYYHFYHSRTIKRSVISSRGTH
::::::::.. :: ::.:.:. .:..:.:::: :.::::::::.:.:::..:::: :
CCDS73 P-VYTNHWAVQVLGGPAEADRVAAAHGYLNLGQIGNLEDYYHFYHSKTFKRSTLSSRGPH
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100 110 120 130 140 150
pF1KB8 SFISMEPKVEWIQQQVVKKRTKRDYDFSRAQSTYFNDPKWPSMWYMHCSDNTHPCQSDMN
.:. :.:.:.:.::: ::.:.::. : :. ::::: : .:::.::.:.. :.:.::
CCDS73 TFLRMDPQVKWLQQQEVKRRVKRQVR-SDPQALYFNDPIWSNMWYLHCGDKNSRCRSEMN
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160 170 180 190 200 210
pF1KB8 IEGAWKRGYTGKNIVVTILDDGIERTHPDLMQNYDALASCDVNGNDLDPMPRYDASNENK
...::::::::::.:::::::::::.:::: :::. :: :::::: :: ::::::::::
CCDS73 VQAAWKRGYTGKNVVVTILDDGIERNHPDLAPNYDSYASYDVNGNDYDPSPRYDASNENK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 HGTRCAGEVAAAANNSHCTVGIAFNAKIGGVRMLDGDVTDMVEAKSVSFNPQHVHIYSAS
:::::::::::.::::.: ::::.::::::.:::::::::.:::::... :... :::::
CCDS73 HGTRCAGEVAASANNSYCIVGIAYNAKIGGIRMLDGDVTDVVEAKSLGIRPNYIDIYSAS
250 260 270 280 290 300
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pF1KB8 WGPDDDGKTVDGPAPLTRQAFENGVRMGRRGLGSVFVWASGNGGRSKDHCSCDGYTNSIY
:::::::::::::. :..:::: :.. ::.::::.:::::::::: :.:::::::::::
CCDS73 WGPDDDGKTVDGPGRLAKQAFEYGIKKGRQGLGSIFVWASGNGGREGDYCSCDGYTNSIY
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pF1KB8 TISISSTAESGKKPWYLEECSSTLATTYSSGESYDKKIITTDLRQRCTDNHTGTSASAPM
:::.::..:.: ::::::::.:::::::::: :..::.::::::::::.:::::.::::
CCDS73 TISVSSATENGYKPWYLEECASTLATTYSSGAFYERKIVTTDLRQRCTDGHTGTSVSAPM
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pF1KB8 AAGIIALALEANPFLTWRDVQHVIVRTSRAGHLNANDWKTNAAGFKVSHLYGFGLMDAEA
.::::::::::: ::::::::..:.::: .::.:.:::.:.:: ::::.:::::.::::
CCDS73 VAGIIALALEANSQLTWRDVQHLLVKTSRPAHLKASDWKVNGAGHKVSHFYGFGLVDAEA
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460 470 480 490 500 510
pF1KB8 MVMEAEKWTTVPRQHVCVESTDRQIKTIRPNSAVRSIYKASGCSDNPNRHVNYLEHVVVR
.:.::.:::.:: ::.:: ..:.. ..: ...:. .:.:... ...: ::::::::
CCDS73 LVVEAKKWTAVPSQHMCVAASDKRPRSIPLVQVLRTTALTSACAEHSDQRVVYLEHVVVR
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 ITITHPRRGDLAIYLTSPSGTRSQLLANRLFDHSMEGFKNWEFMTIHCWGERAAGDWVLE
.:.::::::: :::.:::::.:::::.::.: : ::: ::::::.:::::.: :.:.::
CCDS73 TSISHPRRGDLQIYLVSPSGTKSQLLAKRLLDLSNEGFTNWEFMTVHCWGEKAEGQWTLE
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610
pF1KB8 VYDTPSQLRNFKTPGKLKEWSLVLYGTSVQPY----------------SPTNEFPKVERF
. : :::.:: . ::::::::.::::. .:: .: : ::. .
CCDS73 IQDLPSQVRNPEKQGKLKEWSLILYGTAEHPYHTFSAHQSRSRMLELSAPELEPPKAA-L
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KB8 RYSRVEDPTDDYGTEDYAGPCDPECSEVGCDGPGPDHCNDCLHYYYKLKNNTRICVSSCP
:.:: : :. :::.: : :::.. :::::. :.: .:.:. ...: ::: ::
CCDS73 SPSQVEVPEDE---EDYTGVCHPECGDKGCDGPNADQCLNCVHFSLGSVKTSRKCVSVCP
670 680 690 700 710 720
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pF1KB8 PGHY-HADKKRCRKCAPNCESCFGSHGDQCMSCKYGYFLNEETNSCVTHCPDGSYQDTKK
:.. . .:::.: .::.: . . ::.::. :.. ..: :.::: :: : : : ..
CCDS73 LGYFGDTAARRCRRCHKGCETCSSRAATQCLSCRRGFYHHQEMNTCVTLCPAGFYADESQ
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740 750 760 770 780 790
pF1KB8 NLCRKCSENCKTCT-EFHNCTECRDGLSLQGSRCSVSCEDGRYFNGQ--DCQPCHRFCAT
. : :: .:: :. : ..:: :..:.:: . : .:: : ::... : ::. :.:
CCDS73 KNCLKCHPSCKKCVDEPEKCTVCKEGFSLARGSCIPDCEPGTYFDSELIRCGECHHTCGT
790 800 810 820 830 840
800 810 820 830 840 850
pF1KB8 CAGAGADGCINCTEGYFMEDGRCVQSCSISYYFDHSSENGYKSCKKCDISCLTCNGPGFK
:.: : . ::.:.... ..: .:: .:. ..: .. .: :..:: .::.: : . .
CCDS73 CVGPGREECIHCAKNFHFHDWKCVPACGEGFYPEEMPGLPHKVCRRCDENCLSCAGSS-R
850 860 870 880 890 900
860 870 880 890 900 910
pF1KB8 NCTSCPSGYLLDLGMCQMGAICKDATEESWAEGGFCMLVKKNNLCQRKVLQQLCCKTCTF
::. : .:. :.:. : : :. :: .::.: ::.::.. :.::.:: .
CCDS73 NCSRCKTGFT------QLGTSCITNHTCSNADETFCEMVKSNRLCERKLFIQFCCRTCLL
910 920 930 940 950
pF1KB8 QG
:
CCDS73 AG
>>CCDS73790.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 (969 aa)
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910
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CCDS73 IQFCCRTCLLAG
960
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pF1KB8 NAKIGGVRMLDGDVTDMVEAKSVSFNPQHVHIYSASWGPDDDGKTVDGPAPLTRQAFENG
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CCDS40 VWTSEYDPLANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFGLLNAKALVDLADPRTWRSVPEKKECVVKD
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CCDS40 NDFEPRALKANGEVIIEIPTRACEGQENA-IKSLEHVQFEATIEYSRRGDLHVTLTSAAG
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CCDS40 SKSPSSSSVGGRRDELEEGAPSQAMLRLLQSAFSKNSPPKQSPKKSPSAKLNIPYENFYE
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CCDS10 DYSADGFNDWAFMTTHSWDEDPSGEWVLEIENT-SEANNY---GTLTKFTLVLYGTA---
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pF1KB8 CKYGYFLNEETNSCVTHCPDGSYQDTKKNLCRKCSENCKTCTEFHNCTECRDGLSLQGSR
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CCDS10 CPSHASLDPVEQTCSRQSQSSRESPPQQQPPRLPPEVEAGQRLRAGLLPSHLPEVVAGLS
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CCDS54 HITKRLSDDDRVIWAEQQYEKERSKRSALRDSALNL-FNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPK
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pF1KB8 -DMNIEGAWKRGYTGKNIVVTILDDGIERTHPDLMQNYDALASCDVNGNDLDPMPRYDAS
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CCDS54 LDLHVIPVWQKGITGKGVVITVLDDGLEWNHTDIYANYDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPT
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CCDS54 NENKHGTRCAGEIAMQANNHKCGVGVAYNSKVGGIRMLDGIVTDAIEASSIGFNPGHVDI
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CCDS54 YSASWGPNDDGKTVEGPGRLAQKAFEYGVKQGRQGKGSIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYT
220 230 240 250 260 270
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CCDS54 DSIYTISISSASQQGLSPWYAEKCSSTLATSYSSGDYTDQRITSADLHNDCTETHTGTSA
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pF1KB8 SAPMAAGIIALALEANPFLTWRDVQHVIVRTSRAGHLNAND-WKTNAAGFKVSHLYGFGL
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CCDS54 SAPLAAGIFALALEANPNLTWRDMQHLVVWTSEYDPLANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFGL
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pF1KB8 MDAEAMVMEAEK--WTTVPRQHVCV-ESTDRQIKTIRPNSAVRSIYKASGCSDNPNRHVN
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CCDS54 LNAKALVDLADPRTWRSVPEKKECVVKDNDFEPRALKANGEVIIEIPTRACEGQENA-IK
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CCDS54 PIGTWTLRITDMSGRIQN---EGRIVNWKLILHGTSSQPEHMKQ--PRV-YTSYNTVQN-
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Tue Nov 8 06:43:44 2016 done: Tue Nov 8 06:43:45 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]