FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8007, 922 aa
1>>>pF1KB8007 922 - 922 aa - 922 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4274+/-0.000513; mu= -0.3964+/- 0.031
mean_var=197.8713+/-41.766, 0's: 0 Z-trim(114.0): 335 B-trim: 753 in 2/54
Lambda= 0.091176
statistics sampled from 23262 (23655) to 23262 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 13.580
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005250817 (OMIM: 602307) PREDICTED: NEDD4-like ( 922) 6242 835.0 0
NP_008944 (OMIM: 602307) NEDD4-like E3 ubiquitin-p ( 922) 6242 835.0 0
XP_016868482 (OMIM: 602307) PREDICTED: NEDD4-like ( 921) 6220 832.1 0
XP_005250818 (OMIM: 602307) PREDICTED: NEDD4-like ( 921) 6220 832.1 0
XP_016868484 (OMIM: 602307) PREDICTED: NEDD4-like ( 743) 5112 686.4 1.4e-196
XP_016868485 (OMIM: 602307) PREDICTED: NEDD4-like ( 743) 5112 686.4 1.4e-196
XP_011515104 (OMIM: 602307) PREDICTED: NEDD4-like ( 898) 3757 508.2 7.6e-143
XP_016868483 (OMIM: 602307) PREDICTED: NEDD4-like ( 898) 3757 508.2 7.6e-143
XP_011521128 (OMIM: 602308) PREDICTED: NEDD4-like ( 754) 3345 453.9 1.3e-126
NP_001257382 (OMIM: 602308) NEDD4-like E3 ubiquiti ( 754) 3345 453.9 1.3e-126
NP_008945 (OMIM: 602308) NEDD4-like E3 ubiquitin-p ( 870) 3345 454.0 1.5e-126
NP_001257383 (OMIM: 602308) NEDD4-like E3 ubiquiti ( 870) 3345 454.0 1.5e-126
XP_016878370 (OMIM: 602308) PREDICTED: NEDD4-like ( 870) 3345 454.0 1.5e-126
XP_016878368 (OMIM: 602308) PREDICTED: NEDD4-like ( 870) 3345 454.0 1.5e-126
XP_011521127 (OMIM: 602308) PREDICTED: NEDD4-like ( 870) 3345 454.0 1.5e-126
XP_016878369 (OMIM: 602308) PREDICTED: NEDD4-like ( 870) 3345 454.0 1.5e-126
XP_011521125 (OMIM: 602308) PREDICTED: NEDD4-like ( 870) 3345 454.0 1.5e-126
NP_001311126 (OMIM: 606409,613385) E3 ubiquitin-pr ( 903) 3252 441.7 7.5e-123
NP_001244066 (OMIM: 606409,613385) E3 ubiquitin-pr ( 903) 3252 441.7 7.5e-123
XP_016883578 (OMIM: 606409,613385) PREDICTED: E3 u ( 903) 3252 441.7 7.5e-123
XP_016883580 (OMIM: 606409,613385) PREDICTED: E3 u ( 752) 3247 441.0 1e-122
NP_001244067 (OMIM: 606409,613385) E3 ubiquitin-pr ( 752) 3247 441.0 1e-122
NP_113671 (OMIM: 606409,613385) E3 ubiquitin-prote ( 862) 3247 441.1 1.1e-122
NP_001311127 (OMIM: 606409,613385) E3 ubiquitin-pr ( 862) 3247 441.1 1.1e-122
XP_016883579 (OMIM: 606409,613385) PREDICTED: E3 u ( 900) 3247 441.1 1.2e-122
XP_011527381 (OMIM: 606409,613385) PREDICTED: E3 u ( 692) 3232 439.0 3.7e-122
XP_005260627 (OMIM: 606409,613385) PREDICTED: E3 u ( 692) 3232 439.0 3.7e-122
XP_016868486 (OMIM: 602307) PREDICTED: NEDD4-like ( 719) 2627 359.5 3.5e-98
NP_955456 (OMIM: 602308) NEDD4-like E3 ubiquitin-p ( 431) 2509 343.8 1.1e-93
XP_016881170 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 684) 1501 211.3 1.3e-53
XP_016881169 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 750) 1501 211.4 1.4e-53
XP_006722488 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 772) 1501 211.4 1.4e-53
NP_001138443 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 834) 1501 211.4 1.5e-53
NP_001138442 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 834) 1501 211.4 1.5e-53
XP_016881166 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 838) 1501 211.4 1.5e-53
XP_016881168 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 854) 1501 211.4 1.6e-53
NP_001138437 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 1501 211.4 1.6e-53
NP_001138436 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 1501 211.4 1.6e-53
NP_001138438 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 854) 1501 211.4 1.6e-53
NP_001230889 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 911) 1501 211.4 1.6e-53
XP_005266720 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 922) 1501 211.4 1.7e-53
XP_005266717 (OMIM: 606384) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 942) 1501 211.4 1.7e-53
NP_001138441 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 947) 1501 211.4 1.7e-53
NP_056092 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein liga ( 955) 1501 211.4 1.7e-53
NP_001138440 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 967) 1501 211.4 1.7e-53
NP_001138439 (OMIM: 606384) E3 ubiquitin-protein l ( 975) 1501 211.4 1.7e-53
NP_001316141 (OMIM: 602278) E3 ubiquitin-protein l ( 753) 1483 209.0 7.2e-53
XP_011519929 (OMIM: 602278) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 827) 1483 209.0 7.8e-53
XP_011519928 (OMIM: 602278) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 849) 1483 209.0 8e-53
XP_011519927 (OMIM: 602278) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 849) 1483 209.0 8e-53
>>XP_005250817 (OMIM: 602307) PREDICTED: NEDD4-like E3 u (922 aa)
initn: 6242 init1: 6242 opt: 6242 Z-score: 4452.0 bits: 835.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6242; 100.0% identity (100.0% similar) in 922 aa overlap (1-922:1-922)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKRKKNWFGTAIYTEVVVDGEITKTAKSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKRKKNWFGTAIYTEVVVDGEITKTAKSSSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NPKWDEQLTVNVTPQTTLEFQVWSHRTLKADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKEQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NPKWDEQLTVNVTPQTTLEFQVWSHRTLKADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKEQLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LSLENKNGIAQTGELTVVLDGLVIEQENITNCSSSPTIEIQENGDALHENGEPSARTTAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LSLENKNGIAQTGELTVVLDGLVIEQENITNCSSSPTIEIQENGDALHENGEPSARTTAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LAVEGTNGIDNHVPTSTLVQNSCCSYVVNGDNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEPADD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LAVEGTNGIDNHVPTSTLVQNSCCSYVVNGDNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEPADD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENALSPNCTSTTVEDPPVQEILTSSENNECIPSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENALSPNCTSTTVEDPPVQEILTSSENNECIPSTS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 AELESEARSILEPDTSNSRSSSAFEAAKSRQPDGCMDPVRQQSGNANTETLPSGWEQRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AELESEARSILEPDTSNSRSSSAFEAAKSRQPDGCMDPVRQQSGNANTETLPSGWEQRKD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PHGRTYYVDHNTRTTTWERPQPLPPGWERRVDDRRRVYYVDHNTRTTTWQRPTMESVRNF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EQWQSQRNQLQGAMQQFNQRYLYSASMLAAENDPYGPLPPGWEKRVDSTDRVYFVNHNTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EQWQSQRNQLQGAMQQFNQRYLYSASMLAAENDPYGPLPPGWEKRVDSTDRVYFVNHNTK
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490 500 510 520 530 540
pF1KB8 TTQWEDPRTQGLQNEEPLPEGWEIRYTREGVRYFVDHNTRTTTFKDPRNGKSSVTKGGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IAYERGFRWKLAHFRYLCQSNALPSHVKINVSRQTLFEDSFQQIMALKPYDLRRRLYVIF
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610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RGEEGLDYGGLAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASTINPDHLSYFCFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGEEGLDYGGLAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASTINPDHLSYFCFI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 GRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNIEECGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNIEECGL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 EMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGF
730 740 750 760 770 780
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pF1KB8 NEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQEVDLADWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFVKETDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQEVDLADWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFVKETDN
790 800 810 820 830 840
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pF1KB8 EVRMRLLQFVTGTCRLPLGGFAELMGSNGPQKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFNRLDLPPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EVRMRLLQFVTGTCRLPLGGFAELMGSNGPQKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFNRLDLPPYK
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KB8 SYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
::::::::::::::::::::::
XP_005 SYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
910 920
>>NP_008944 (OMIM: 602307) NEDD4-like E3 ubiquitin-prote (922 aa)
initn: 6242 init1: 6242 opt: 6242 Z-score: 4452.0 bits: 835.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6242; 100.0% identity (100.0% similar) in 922 aa overlap (1-922:1-922)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKRKKNWFGTAIYTEVVVDGEITKTAKSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKRKKNWFGTAIYTEVVVDGEITKTAKSSSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NPKWDEQLTVNVTPQTTLEFQVWSHRTLKADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKEQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 NPKWDEQLTVNVTPQTTLEFQVWSHRTLKADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKEQLK
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 LSLENKNGIAQTGELTVVLDGLVIEQENITNCSSSPTIEIQENGDALHENGEPSARTTAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 LSLENKNGIAQTGELTVVLDGLVIEQENITNCSSSPTIEIQENGDALHENGEPSARTTAR
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pF1KB8 LAVEGTNGIDNHVPTSTLVQNSCCSYVVNGDNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEPADD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 LAVEGTNGIDNHVPTSTLVQNSCCSYVVNGDNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEPADD
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pF1KB8 TVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENALSPNCTSTTVEDPPVQEILTSSENNECIPSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 TVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENALSPNCTSTTVEDPPVQEILTSSENNECIPSTS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 AELESEARSILEPDTSNSRSSSAFEAAKSRQPDGCMDPVRQQSGNANTETLPSGWEQRKD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 PHGRTYYVDHNTRTTTWERPQPLPPGWERRVDDRRRVYYVDHNTRTTTWQRPTMESVRNF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 TTQWEDPRTQGLQNEEPLPEGWEIRYTREGVRYFVDHNTRTTTFKDPRNGKSSVTKGGPQ
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pF1KB8 IAYERGFRWKLAHFRYLCQSNALPSHVKINVSRQTLFEDSFQQIMALKPYDLRRRLYVIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 IAYERGFRWKLAHFRYLCQSNALPSHVKINVSRQTLFEDSFQQIMALKPYDLRRRLYVIF
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pF1KB8 RGEEGLDYGGLAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASTINPDHLSYFCFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 RGEEGLDYGGLAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASTINPDHLSYFCFI
610 620 630 640 650 660
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pF1KB8 GRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNIEECGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 GRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNIEECGL
670 680 690 700 710 720
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pF1KB8 EMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 EMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 NEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQEVDLADWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFVKETDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 NEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQEVDLADWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFVKETDN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 EVRMRLLQFVTGTCRLPLGGFAELMGSNGPQKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFNRLDLPPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 EVRMRLLQFVTGTCRLPLGGFAELMGSNGPQKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFNRLDLPPYK
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KB8 SYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
::::::::::::::::::::::
NP_008 SYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
910 920
>>XP_016868482 (OMIM: 602307) PREDICTED: NEDD4-like E3 u (921 aa)
initn: 5257 init1: 5257 opt: 6220 Z-score: 4436.3 bits: 832.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6220; 99.8% identity (99.9% similar) in 922 aa overlap (1-922:1-921)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKRKKNWFGTAIYTEVVVDGEITKTAKSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKRKKNWFGTAIYTEVVVDGEITKTAKSSSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NPKWDEQLTVNVTPQTTLEFQVWSHRTLKADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKEQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NPKWDEQLTVNVTPQTTLEFQVWSHRTLKADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKEQLK
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XP_016 SYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
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XP_016 MLAVEGTNGIDNHVPTSTLVQNSCCSYVVNG
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pF1KB8 DNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEPADDTVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENALS
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XP_016 DNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEPADDTVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENALS
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XP_016 FEYAGKNNYCLQINPASTINPDHLSYFCFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRMLSKK
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XP_016 LTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNIEECGLEMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNILVTE
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pF1KB8 ENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGFNEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQEVDLA
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XP_016 ENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGFNEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQEVDLA
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pF1KB8 DWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFVKETDNEVRMRLLQFVTGTCRLPLGGFAELMGSNGP
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XP_016 DWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFVKETDNEVRMRLLQFVTGTCRLPLGGFAELMGSNGP
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pF1KB8 QKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
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XP_011 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKRKKNWFGTAIYTEVVVDGEITKTAKSSSSS
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XP_011 SYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
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.:. :.. : .::. . .: . :. .:. .. :.: ::.::.... : :
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XP_011 WEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGAMQHFSQRFLYQSS
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....:: :::::::::: :. :::.:::::.:::::::::::. .: :: :::..:
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XP_011 TSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSH
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:::.::::::::::::::: .::::::::::.:.::::::::::.:::::::::::::::
XP_011 VKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNP
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:::::::::::::::::::::.::::::.:: ::::::::::.:::::::::.:::::::
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pF1KB8 LSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNIEECGLEMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNI
:.:. :.::::::: :::::..::..::.::::::.:: :::::::::.:.:: :: .:
XP_011 LNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKENNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEGGESI
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pF1KB8 LVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGFNEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQE
::::::.::: :.:.:::.:::.:::::::::::::.::.::.::::::::.:::::::
XP_011 RVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQE
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pF1KB8 VDLADWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFVKETDNEVRMRLLQFVTGTCRLPLGGFAELMG
.:..:::..:.:::::.::::: :::: ::: ::: :.:::::::::::::.::::::.:
XP_011 IDMSDWQKSTIYRHYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIG
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:::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::
XP_011 SNGPQKFCIDKVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEETEGFGQE
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pF1KB8 KADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKEQLKLSLENKNGIAQTGELTVVLDGLVIEQEN
:.:. :::..... ::::. ::: ... :
NP_001 MQLTLNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGN
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NP_001 V------P------NGSALTDGSQLPSRDSSGTAVAPEN---RHQPPST---NCFGGRSR
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. .. .: . : ...:. . .:. :. :..: :..:. :.. :
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pF1KB8 LSPNCTSTT-VEDPPVQEI-LTSSENNECIPSTSAELESEARSILEPDTSNSRSSSAFEA
.:. :.. : .::. . .: . :. .:. .. :.: ::.::.... : :
NP_001 TDPEEPSVVGVTSPPAAPLSVTPNPNTTSLPAPATPAEGE-----EPSTSGTQQLPA--A
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:.. ::. ::.:::::. :.::.:::::::.:::::: :::::
NP_001 AQA--PDA----------------LPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTTTWER--PLPPG
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pF1KB8 WERRVDDRRRVYYVDHNTRTTTWQRPTMESVRNFEQWQSQRNQLQGAMQQFNQRYLYSAS
::.:.: : : :::::::::::::::: : :::.:::::::::::::::.:.::.::..:
NP_001 WEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGAMQHFSQRFLYQSS
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....:: :::::::::: :. :::.:::::.:::::::::::. .: :: :::..:
NP_001 SASTDHDPLGPLPPGWEKRQDN-GRVYYVNHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPALPPGWEMKY
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pF1KB8 TREGVRYFVDHNTRTTTFKDPRNGKSSVTKGGPQIAYERGFRWKLAHFRYLCQSNALPSH
: :::::::::::::::::::: : : :: : ::.:.:::: .::.::.:::::::
NP_001 TSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSH
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:::.::::::::::::::: .::::::::::.:.::::::::::.:::::::::::::::
NP_001 VKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNP
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:::::::::::::::::::::.::::::.:: ::::::::::.:::::::::.:::::::
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:.:. :.::::::: :::::..::..::.::::::.:: :::::::::.:.:: :: .:
NP_001 LNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKENNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEGGESI
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::::::.::: :.:.:::.:::.:::::::::::::.::.::.::::::::.:::::::
NP_001 RVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQE
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