Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8007
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8007, 922 aa
1>>>pF1KB8007 922 - 922 aa - 922 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9471+/-0.00117; mu= 8.0107+/- 0.069
mean_var=138.8169+/-28.847, 0's: 0 Z-trim(106.5): 95 B-trim: 312 in 2/50
Lambda= 0.108856
statistics sampled from 8903 (8998) to 8903 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 3.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8 ( 922) 6242 992.9 0
CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 754) 3345 537.9 2.7e-152
CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 870) 3345 537.9 3.1e-152
CCDS58768.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 903) 3252 523.3 7.9e-148
CCDS58769.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 752) 3247 522.5 1.2e-147
CCDS13234.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 862) 3247 522.5 1.3e-147
CCDS58477.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 431) 2509 406.5 5.6e-113
CCDS45876.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 834) 1501 248.3 4.5e-65
CCDS45875.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 854) 1501 248.3 4.5e-65
CCDS58632.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 911) 1501 248.3 4.8e-65
CCDS59323.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 947) 1501 248.3 5e-65
CCDS45873.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 955) 1501 248.3 5e-65
CCDS45874.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 967) 1501 248.3 5.1e-65
CCDS45872.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 975) 1501 248.3 5.1e-65
CCDS45265.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 ( 900) 1483 245.5 3.4e-64
CCDS10156.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1247) 1483 245.6 4.5e-64
CCDS61643.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1303) 1483 245.6 4.6e-64
CCDS61644.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1319) 1483 245.6 4.7e-64
CCDS32707.1 SMURF2 gene_id:64750|Hs108|chr17 ( 748) 1372 228.0 5.1e-59
CCDS34689.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 731) 1368 227.4 7.7e-59
CCDS34690.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 757) 1368 227.4 7.9e-59
CCDS77499.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1216) 1236 206.8 2.1e-52
CCDS33354.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1572) 1236 206.8 2.6e-52
CCDS69286.1 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1572) 1234 206.5 3.2e-52
CCDS5469.2 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1606) 1234 206.5 3.3e-52
CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX (4374) 1087 183.6 7e-45
CCDS5050.1 HACE1 gene_id:57531|Hs108|chr6 ( 909) 951 162.0 4.8e-39
CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 852) 700 122.5 3.3e-27
CCDS45191.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 872) 700 122.5 3.4e-27
CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 875) 700 122.5 3.4e-27
CCDS41971.1 AREL1 gene_id:9870|Hs108|chr14 ( 823) 644 113.7 1.4e-24
CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7 (1083) 613 108.9 5.3e-23
CCDS7274.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1049) 587 104.8 8.8e-22
CCDS41533.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1057) 587 104.8 8.9e-22
CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050) 574 102.8 3.6e-21
CCDS9129.1 UBE3B gene_id:89910|Hs108|chr12 (1068) 491 89.7 3.1e-17
CCDS7414.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 776) 473 86.9 1.7e-16
CCDS60591.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 780) 473 86.9 1.7e-16
CCDS10021.1 HERC2 gene_id:8924|Hs108|chr15 (4834) 476 87.7 5.8e-16
CCDS45277.1 HERC1 gene_id:8925|Hs108|chr15 (4861) 451 83.8 8.9e-15
CCDS3630.1 HERC5 gene_id:51191|Hs108|chr4 (1024) 400 75.4 6e-13
CCDS63145.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2 (1722) 397 75.1 1.3e-12
CCDS33391.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2 (1992) 397 75.1 1.5e-12
CCDS63146.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2 (2040) 397 75.1 1.5e-12
CCDS41939.1 HECTD1 gene_id:25831|Hs108|chr14 (2610) 383 73.0 8.5e-12
>>CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8 (922 aa)
initn: 6242 init1: 6242 opt: 6242 Z-score: 5305.1 bits: 992.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6242; 100.0% identity (100.0% similar) in 922 aa overlap (1-922:1-922)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKRKKNWFGTAIYTEVVVDGEITKTAKSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKRKKNWFGTAIYTEVVVDGEITKTAKSSSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NPKWDEQLTVNVTPQTTLEFQVWSHRTLKADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKEQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 NPKWDEQLTVNVTPQTTLEFQVWSHRTLKADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKEQLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LSLENKNGIAQTGELTVVLDGLVIEQENITNCSSSPTIEIQENGDALHENGEPSARTTAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LSLENKNGIAQTGELTVVLDGLVIEQENITNCSSSPTIEIQENGDALHENGEPSARTTAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LAVEGTNGIDNHVPTSTLVQNSCCSYVVNGDNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEPADD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LAVEGTNGIDNHVPTSTLVQNSCCSYVVNGDNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEPADD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENALSPNCTSTTVEDPPVQEILTSSENNECIPSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENALSPNCTSTTVEDPPVQEILTSSENNECIPSTS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 AELESEARSILEPDTSNSRSSSAFEAAKSRQPDGCMDPVRQQSGNANTETLPSGWEQRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AELESEARSILEPDTSNSRSSSAFEAAKSRQPDGCMDPVRQQSGNANTETLPSGWEQRKD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PHGRTYYVDHNTRTTTWERPQPLPPGWERRVDDRRRVYYVDHNTRTTTWQRPTMESVRNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 PHGRTYYVDHNTRTTTWERPQPLPPGWERRVDDRRRVYYVDHNTRTTTWQRPTMESVRNF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EQWQSQRNQLQGAMQQFNQRYLYSASMLAAENDPYGPLPPGWEKRVDSTDRVYFVNHNTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EQWQSQRNQLQGAMQQFNQRYLYSASMLAAENDPYGPLPPGWEKRVDSTDRVYFVNHNTK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 TTQWEDPRTQGLQNEEPLPEGWEIRYTREGVRYFVDHNTRTTTFKDPRNGKSSVTKGGPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 TTQWEDPRTQGLQNEEPLPEGWEIRYTREGVRYFVDHNTRTTTFKDPRNGKSSVTKGGPQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 IAYERGFRWKLAHFRYLCQSNALPSHVKINVSRQTLFEDSFQQIMALKPYDLRRRLYVIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 IAYERGFRWKLAHFRYLCQSNALPSHVKINVSRQTLFEDSFQQIMALKPYDLRRRLYVIF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RGEEGLDYGGLAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASTINPDHLSYFCFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RGEEGLDYGGLAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASTINPDHLSYFCFI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 GRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNIEECGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNIEECGL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 EMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 NEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQEVDLADWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFVKETDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 NEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQEVDLADWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFVKETDN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 EVRMRLLQFVTGTCRLPLGGFAELMGSNGPQKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFNRLDLPPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EVRMRLLQFVTGTCRLPLGGFAELMGSNGPQKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFNRLDLPPYK
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KB8 SYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
::::::::::::::::::::::
CCDS62 SYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
910 920
>>CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 (754 aa)
initn: 2834 init1: 2651 opt: 3345 Z-score: 2847.6 bits: 537.9 E(32554): 2.7e-152
Smith-Waterman score: 3404; 63.6% identity (80.6% similar) in 806 aa overlap (119-922:5-754)
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 KADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKEQLKLSLENKNGIAQTGELTVVLDGLVIEQEN
:.:. :::..... ::::. ::: ... :
CCDS58 MQLTLNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGN
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 ITNCSSSPTIEIQENGDALHENGEPSARTTARLAVEGTNGIDNHVPTSTLVQNSCCSYVV
. : ::.:: .... .: .. :: : : : :: : .
CCDS58 V------P------NGSALTDGSQLPSRDSSGTAVAPEN---RHQPPST---NCFGGRSR
40 50 60 70
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 NGDNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEPADDTVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENA
. .. .: . : ...:. . .:. :. :..: :..:. :.. :
CCDS58 THRHSGASARTTPATGEQSPGARSRHRQPVK---NSGHSGLA---NGTVNDEPTT----A
80 90 100 110 120
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 LSPNCTSTT-VEDPPVQEI-LTSSENNECIPSTSAELESEARSILEPDTSNSRSSSAFEA
.:. :.. : .::. . .: . :. .:. .. :.: ::.::.... : :
CCDS58 TDPEEPSVVGVTSPPAAPLSVTPNPNTTSLPAPATPAEGE-----EPSTSGTQQLPA--A
130 140 150 160 170
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 AKSRQPDGCMDPVRQQSGNANTETLPSGWEQRKDPHGRTYYVDHNTRTTTWERPQPLPPG
:.. ::. ::.:::::. :.::.:::::::.:::::: :::::
CCDS58 AQA--PDA----------------LPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTTTWER--PLPPG
180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 WERRVDDRRRVYYVDHNTRTTTWQRPTMESVRNFEQWQSQRNQLQGAMQQFNQRYLYSAS
::.:.: : : :::::::::::::::: : :::.:::::::::::::::.:.::.::..:
CCDS58 WEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGAMQHFSQRFLYQSS
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 MLAAENDPYGPLPPGWEKRVDSTDRVYFVNHNTKTTQWEDPRTQGLQNEEPLPEGWEIRY
....:: :::::::::: :. :::.:::::.:::::::::::. .: :: :::..:
CCDS58 SASTDHDPLGPLPPGWEKRQDN-GRVYYVNHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPALPPGWEMKY
280 290 300 310 320 330
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 TREGVRYFVDHNTRTTTFKDPRNGKSSVTKGGPQIAYERGFRWKLAHFRYLCQSNALPSH
: :::::::::::::::::::: : : :: : ::.:.:::: .::.::.:::::::
CCDS58 TSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSH
340 350 360 370 380 390
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 VKINVSRQTLFEDSFQQIMALKPYDLRRRLYVIFRGEEGLDYGGLAREWFFLLSHEVLNP
:::.::::::::::::::: .::::::::::.:.::::::::::.:::::::::::::::
CCDS58 VKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNP
400 410 420 430 440 450
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 MYCLFEYAGKNNYCLQINPASTINPDHLSYFCFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRM
:::::::::::::::::::::.::::::.:: ::::::::::.:::::::::.:::::::
CCDS58 MYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHLTYFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGFTLPFYKRM
460 470 480 490 500 510
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 LSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNIEECGLEMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNI
:.:. :.::::::: :::::..::..::.::::::.:: :::::::::.:.:: :: .:
CCDS58 LNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKENNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEGGESI
520 530 540 550 560 570
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 LVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGFNEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQE
::::::.::: :.:.:::.:::.:::::::::::::.::.::.::::::::.:::::::
CCDS58 RVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQE
580 590 600 610 620 630
810 820 830 840 850 860
pF1KB8 VDLADWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFVKETDNEVRMRLLQFVTGTCRLPLGGFAELMG
.:..:::..:.:::::.::::: :::: ::: ::: :.:::::::::::::.::::::.:
CCDS58 IDMSDWQKSTIYRHYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIG
640 650 660 670 680 690
870 880 890 900 910 920
pF1KB8 SNGPQKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
:::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::
CCDS58 SNGPQKFCIDKVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEETEGFGQE
700 710 720 730 740 750
>>CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 (870 aa)
initn: 2834 init1: 2651 opt: 3345 Z-score: 2846.6 bits: 537.9 E(32554): 3.1e-152
Smith-Waterman score: 3589; 60.0% identity (78.1% similar) in 927 aa overlap (1-922:1-870)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKRKKNWFGTAIYTEVVVDG---EITKTAKSS
::.:: . :: . : ::: : .. :.::.::: : ::.:
CCDS10 MASASSSRAGVALPFEKSQLTLKVVSAKPKVHNRQPRINSYVEVAVDGLPSETKKTGKRI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 SSSNPKWDEQLTVNVTPQTTLEFQVWSHRTLKADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKE
.::. :.: . .::: :. :...::: .::. . ::: :...:...: .. :.: ..
CCDS10 GSSELLWNEIIILNVTAQSHLDLKVWSCHTLRNE-LLGTASVNLSNVLKNNGGKMENMQL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 QLKLSLENKNGIAQTGELTVVLDGLVIEQENITNCSSSPTIEIQENGDALHENGEPSART
:.:. :::..... ::::. ::: ... :. : ::.:: .... .:
CCDS10 TLNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGNV------P------NGSALTDGSQLPSRD
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 TARLAVEGTNGIDNHVPTSTLVQNSCCSYVVNGDNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEP
.. :: : : : :: : . . .. .: . : ...:. . .:
CCDS10 SSGTAVAPEN---RHQPPST---NCFGGRSRTHRHSGASARTTPATGEQSPGARSRHRQP
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ADDTVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENALSPNCTSTT-VEDPPVQEI-LTSSENNEC
. :. :..: :..:. :.. : .:. :.. : .::. . .: . :.
CCDS10 VK---NSGHSGLA---NGTVNDEPTT----ATDPEEPSVVGVTSPPAAPLSVTPNPNTTS
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 IPSTSAELESEARSILEPDTSNSRSSSAFEAAKSRQPDGCMDPVRQQSGNANTETLPSGW
.:. .. :.: ::.::.... : ::.. ::. ::.::
CCDS10 LPAPATPAEGE-----EPSTSGTQQLPA--AAQA--PDA----------------LPAGW
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:::. :.::.:::::::.:::::: :::::::.:.: : : :::::::::::::::: :
CCDS10 EQRELPNGRVYYVDHNTKTTTWER--PLPPGWEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAE
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:::.:::::::::::::::.:.::.::..: ....:: :::::::::: :. :::.:
CCDS10 YVRNYEQWQSQRNQLQGAMQHFSQRFLYQSSSASTDHDPLGPLPPGWEKRQDN-GRVYYV
370 380 390 400 410 420
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::::.:::::::::::. .: :: :::..:: :::::::::::::::::::: : : :
CCDS10 NHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPALPPGWEMKYTSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFESGT
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: : ::.:.:::: .::.::.::::::::::.::::::::::::::: .::::::::
CCDS10 KQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRRR
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::.:.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.
CCDS10 LYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHLT
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:: ::::::::::.:::::::::.::::::::.:. :.::::::: :::::..::..::.
CCDS10 YFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKENNL
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::::::.:: :::::::::.:.:: :: .: ::::::.::: :.:.:::.:::.:::::
CCDS10 EECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKA
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::::::::.::.::.::::::::.:::::::.:..:::..:.:::::.::::: :::: :
CCDS10 FLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKSTIYRHYTKNSKQIQWFWQVV
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:: ::: :.:::::::::::::.::::::.::::::::::.::::.::::::::::::::
CCDS10 KEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCIDKVGKETWLPRSHTCFNRLD
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::::::::::.::::.:::::::::::
CCDS10 LPPYKSYEQLREKLLYAIEETEGFGQE
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..::: . ::: ::: . :.:.::::.:::.:.::: :..:. ..: .: :::.: :
CCDS58 NSPKWKQPLTVIVTPVSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTAALDIYETLKSNNMKLEEVVVTL
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.:. .:. :.:.. :::: .:.: .:: .. . ::: .:
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:: : ...:. : :. . : ...: : :.::. . .:.
CCDS58 RL--ECNSAISAH-----------CNLCLPGLSDSPISASRVAGFTGASQNDD--GSRSK
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:.: . ..: : : : :.: .: .:. ....:. . :: .:
CCDS58 DETRVSTNGSDDPEDAGAGENRRVSGNNSPSLSN-GGFKPSRPPRPSRPPPPTPRRPASV
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:. ::...: .. . . : : ..:. .: :.: : : . :. ..: :
CCDS58 NGS--PSATSESDGSSTGSLPPTNTNTNTS---EGATS----GLIIPLTISGGSGPRPLN
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:.. :: ::::: : :::.::::: . :::.::.:::::::::::. :.::::: :
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::::::.::. :::::::::. :::::::.:: ::.:::::::.:.: .:. ::::::
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::::. :::.:::.. .: ::::: : :. :. .::. ::. :.:.:.::.:.:.:::::
CCDS58 RTTTYIDPRTGKSALDNG-PQIAYVRDFKAKVQYFRFWCQQLAMPQHIKITVTRKTLFED
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::::::...: ::::::.::: :::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::
CCDS58 SFQQIMSFSPQDLRRRLWVIFPGEEGLDYGGVAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKDNY
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:::::::: ::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::.:.: . .::::::
CCDS58 CLQINPASYINPDHLKYFRFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRILNKPVGLKDLESI
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: ::::::::...:::::: :::::::: ::::.. ::::: .:.:::::::::.::: .
CCDS58 DPEFYNSLIWVKENNIEECDLEMYFSVDKEILGEIKSHDLKPNGGNILVTEENKEEYIRM
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CCDS58 VAEWRLSRGVEEQTQAFFEGFNEILPQQYLQYFDAKELEVLLCGMQEIDLNDWQRHAIYR
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CCDS58 HYARTSKQIMWFWQFVKEIDNEKRMRLLQFVTGTCRLPVGGFADLMGSNGPQKFCIEKVG
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CCDS58 KENWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
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CCDS58 MKLEEVVVTLQLG-GDKEPTETIGDLSICLD
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CCDS58 GLQLESEVVTNGETTCSESASQNDDGSRSKDE--TRVS-------TNGSDD--PEDA---
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CCDS58 GAGENRRVSGNNSPSL-SNGGFKPSRPPRP----SRPPPPT---------PRRPASVNGS
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: .: : . :.: :: :....: :: :. . ... : : .. :
CCDS58 P-----SATSESDGSSTGSLPP-----TNTNTN-----TS---EGATSGLIIPLTISGGS
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. .: ..:: : :: ::::: : :::.::::: . :::.::
CCDS58 GP--------RP---LNPVTQAP-------LPPGWEQRVDQHGRVYYVDHVEKRTTWDRP
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.:::::::::::. :.::::: ::::::::::.:::::.:::: ::.::::::::::::
CCDS58 EPLPPGWERRVDNMGRIYYVDHFTRTTTWQRPTLESVRNYEQWQLQRSQLQGAMQQFNQR
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..:. :. . : :: ::::::::::.::. :::::::::. :::::::.:: ::
CCDS58 FIYGNQDLFATSQSKEFDPLGPLPPGWEKRTDSNGRVYFVNHNTRITQWEDPRSQGQLNE
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pF1KB8 EPLPEGWEIRYTREGVRYFVDHNTRTTTFKDPRNGKSSVTKGGPQIAYERGFRWKLAHFR
.:::::::.:.: .:. :::::: ::::. :::.:::.. .: ::::: : :. :. .::
CCDS58 KPLPEGWEMRFTVDGIPYFVDHNRRTTTYIDPRTGKSALDNG-PQIAYVRDFKAKVQYFR
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pF1KB8 YLCQSNALPSHVKINVSRQTLFEDSFQQIMALKPYDLRRRLYVIFRGEEGLDYGGLAREW
. ::. :.:.:.::.:.:.:::::::::::...: ::::::.::: :::::::::.::::
CCDS58 FWCQQLAMPQHIKITVTRKTLFEDSFQQIMSFSPQDLRRRLWVIFPGEEGLDYGGVAREW
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pF1KB8 FFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASTINPDHLSYFCFIGRFIAMALFHGKFID
:::::::::::::::::::::.:::::::::: ::::::.:: :::::::::::::::::
CCDS58 FFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKDNYCLQINPASYINPDHLKYFRFIGRFIAMALFHGKFID
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pF1KB8 TGFSLPFYKRMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNIEECGLEMYFSVDMEILGKVT
::::::::::.:.: . .::::::: ::::::::...:::::: :::::::: ::::..
CCDS58 TGFSLPFYKRILNKPVGLKDLESIDPEFYNSLIWVKENNIEECDLEMYFSVDKEILGEIK
510 520 530 540 550 560
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pF1KB8 SHDLKLGGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGFNEVVPLQWLQYFDEK
::::: .:.:::::::::.::: ...:::.::::.:::.::..::::..: :.::::: :
CCDS58 SHDLKPNGGNILVTEENKEEYIRMVAEWRLSRGVEEQTQAFFEGFNEILPQQYLQYFDAK
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pF1KB8 ELEVMLCGMQEVDLADWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFVKETDNEVRMRLLQFVTGTCR
::::.::::::.:: ::::...::::.:.::::.:::::::: ::: :::::::::::::
CCDS58 ELEVLLCGMQEIDLNDWQRHAIYRHYARTSKQIMWFWQFVKEIDNEKRMRLLQFVTGTCR
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pF1KB8 LPLGGFAELMGSNGPQKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEE
::.::::.:::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LPVGGFADLMGSNGPQKFCIEKVGKENWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEE
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pF1KB8 TEGFGQE
:::::::
CCDS58 TEGFGQE
750
>>CCDS13234.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 (862 aa)
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pF1KB8 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKR-KKNWFGTAIYTEVVVDGEITKTAKSSSS
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CCDS13 MSDSGSQLGSMGSLTMKSQLQITVISAKLKENKKNWFGPSPYVEVTVDGQSKKTEKCNNT
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 SNPKWDEQLTVNVTPQTTLEFQVWSHRTLKADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKEQL
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CCDS13 NSPKWKQPLTVIVTPVSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTAALDIYETLKSNNMKLEEVVVTL
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pF1KB8 KLSLENKNGIAQTGELTVVLDGLVIEQENITNCSSSPTIEIQENGDALHENGEPSARTTA
.:. .:. :.:.. :::: .:.: .:: .. . ..: :. . . : .
CCDS13 QLG-GDKEPTETIGDLSICLDGLQLESEVVTNGETTCSESASQNDDGSRSKDE------T
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pF1KB8 RLAVEGTNGIDNHVPTSTLVQNSCCSYVVNGDNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEPAD
:.. ::: :. : .. .. . :.:.:.:: :. . .:. : : :.:
CCDS13 RVS---TNGSDD--PEDA---GAGENRRVSGNNSPSL-SNGGFKPSRPPRP----SRPPP
180 190 200 210 220
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pF1KB8 DTVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENALSPNCTSTTVEDPPVQEILTSSENNECIPST
: : :::.:.: .: : . :.: :: :....: :
CCDS13 PT---------PRRPASVNGSP-----SATSESDGSSTGSLPP-----TNTNTN-----T
230 240 250
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pF1KB8 SAELESEARSILEPDTSNSRSSSAFEAAKSRQPDGCMDPVRQQSGNANTETLPSGWEQRK
: :. . ... : : .. :. .: ..:: : :: :::::
CCDS13 S---EGATSGLIIPLTISGGSGP--------RP---LNPVTQAP-------LPPGWEQRV
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pF1KB8 DPHGRTYYVDHNTRTTTWERPQPLPPGWERRVDDRRRVYYVDHNTRTTTWQRPTMESVRN
: :::.::::: . :::.::.:::::::::::. :.::::: ::::::::::.:::::
CCDS13 DQHGRVYYVDHVEKRTTWDRPEPLPPGWERRVDNMGRIYYVDHFTRTTTWQRPTLESVRN
300 310 320 330 340 350
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pF1KB8 FEQWQSQRNQLQGAMQQFNQRYLYS-----ASMLAAENDPYGPLPPGWEKRVDSTDRVYF
.:::: ::.::::::::::::..:. :. . : :: ::::::::::.::. ::::
CCDS13 YEQWQLQRSQLQGAMQQFNQRFIYGNQDLFATSQSKEFDPLGPLPPGWEKRTDSNGRVYF
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pF1KB8 VNHNTKTTQWEDPRTQGLQNEEPLPEGWEIRYTREGVRYFVDHNTRTTTFKDPRNGKSSV
:::::. :::::::.:: ::.:::::::.:.: .:. :::::: ::::. :::.:::..
CCDS13 VNHNTRITQWEDPRSQGQLNEKPLPEGWEMRFTVDGIPYFVDHNRRTTTYIDPRTGKSAL
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pF1KB8 TKGGPQIAYERGFRWKLAHFRYLCQSNALPSHVKINVSRQTLFEDSFQQIMALKPYDLRR
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CCDS13 DNG-PQIAYVRDFKAKVQYFRFWCQQLAMPQHIKITVTRKTLFEDSFQQIMSFSPQDLRR
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pF1KB8 RLYVIFRGEEGLDYGGLAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASTINPDHL
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CCDS13 RLWVIFPGEEGLDYGGVAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKDNYCLQINPASYINPDHL
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pF1KB8 SYFCFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNN
.:: :::::::::::::::::::::::::::.:.: . .::::::: ::::::::...::
CCDS13 KYFRFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRILNKPVGLKDLESIDPEFYNSLIWVKENN
600 610 620 630 640 650
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pF1KB8 IEECGLEMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTK
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CCDS13 IEECDLEMYFSVDKEILGEIKSHDLKPNGGNILVTEENKEEYIRMVAEWRLSRGVEEQTQ
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pF1KB8 AFLDGFNEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQEVDLADWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQF
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CCDS13 AFFEGFNEILPQQYLQYFDAKELEVLLCGMQEIDLNDWQRHAIYRHYARTSKQIMWFWQF
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CCDS13 VKEIDNEKRMRLLQFVTGTCRLPVGGFADLMGSNGPQKFCIEKVGKENWLPRSHTCFNRL
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900 910 920
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CCDS13 DLPPYKSYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
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CCDS58 FKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQ
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CCDS58 NPASSINPDHLTYFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEF
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CCDS58 YNSIVWIKENNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLLTDW
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CCDS58 LPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEETEGFGQE
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CCDS45 PPPP------ASPGSRTSPQELSE-ELSRRLQITPDSNGEQFSSLIQREPSSRLRSCSVT
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: . . . : . . ::. .: ... : .. ... : :
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:. : .. . :::::: :. . : .:..:::::: ::::: . .:
CCDS45 PYN-SPKPQHKVTQSFLPPGWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSL
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. .. ::: ::: : .: ...:::.. : ..::: . ..: :: . : : :. :
CCDS45 NPNDLGPLPPGWEERIHLDGRTFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAIT--GPAVPYSREFKQK
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.:: .. : .:.. .... :...::.:...::..: : :. ::.. :..:.::::
CCDS45 YDYFRKKLKKPADIPNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDY
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::.:::::::::.:..::.: ::::.. .:: ::::: : . : :::::: :::: ..:
CCDS45 GGVAREWFFLLSKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLA
520 530 540 550 560 570
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pF1KB8 LFHGKFIDTGFSLPFYKRMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNIEECGLEMYFSVD
.::::..: : :::: ::.:..:..:.::.:.:.:::: :: .:. : :...: .:
CCDS45 VFHGKLLDGFFIRPFYKMMLGKQITLNDMESVDSEYYNSLKWILENDPTE--LDLMFCID
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pF1KB8 MEILGKVTSHDLKLGGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGFNEVVPLQ
: .:.. . ::: .::.:.::.::: ::: :. .::: ::.: .:::.::.:..:..
CCDS45 EENFGQTYQVDLKPNGSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPID
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.. :::.:::...::. .::. ::.....:.. : : : :::. : : : :.::
CCDS45 LIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRL
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:: :. . .: :: . . : . : ..: . : ::. . : . .. :
CCDS45 AS-PGSRTSPQE--LSEELSRRLQITPDSNGEQFSSLIQRE--PSSRLRSCSVTDAVAEQ
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CCDS45 GHLPPPSAPAGRA-RSSTVTGGEEPTPSVAYVHTTPGLPSGWEERKDAKGRTYYVNHNNR
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CCDS45 TTTWTRPIMQLAEDGASGSATNSNNHLIEPQIRRPRSLSSPTVTLSAPLEGAKDSPVRRA
290 300 310 320 330 340
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.. ... : : :. : .. . :::::: :. . : .:..:::::: ::::
CCDS45 VKDTLSNPQSPQPSPYN-SPKPQHKVTQSFLPPGWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDP
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: . .:. .. ::: ::: : .: ...:::.. : ..::: . ..:
CCDS45 RLKFPVHMRSKTSLNPNDLGPLPPGWEERIHLDGRTFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAIT-
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:: . : : :. : .:: .. : .:.. .... :...::.:...::..: : :.
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470 480 490 500 510 520
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::.. :..:.::::::.:::::::::.:..::.: ::::.. .:: ::::: : . : ::
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pF1KB8 LSYFCFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDN
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CCDS45 LSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRPFYKMMLGKQITLNDMESVDSEYYNSLKWILEN
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pF1KB8 NIEECGLEMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQT
. : :...: .: : .:.. . ::: .::.:.::.::: ::: :. .::: ::.:
CCDS45 DPTE--LDLMFCIDEENFGQTYQVDLKPNGSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQM
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CCDS45 NAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFW
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pF1KB8 QFVKETDNEVRMRLLQFVTGTCRLPLGGFAELMGSNGPQKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFN
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CCDS45 RLDLPPYETFEDLREKLLMAVENAQGFEGVD
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CCDS58 MATGLGEPVYGLSEDEGESRILRVKVVSGIDLAKKDIFGASDPYVKLSLYVADENRELAL
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CCDS58 VQTKTIKKTLNPKWNEEFYFRVNPSNHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLSH-LPTED
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pF1KB8 RKLERVKEQLKLSLENKNGIAQT-GELTVVLDGLVIEQENITNCSSSPTIEIQENGDALH
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CCDS58 PTMERPYTFKDFLLRPRSHKSRVKGFLR--LKMAYMPKNGGQDEENSDQRDDMEHGWEVV
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CCDS58 DSNDSASQHQEELPPPPLPPGWEEKV------DNLGRTYYVNHNNRTTQWHRPSLMDVSS
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pF1KB8 KNTPAPKPLASEPADDTVNG-----ESSSFAPTDNASVTGTP--VVSEENALSPNCTSTT
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CCDS58 ESDNNIRQINQEAAHRRFRSRRHISEDLEPEPSEGGDVP-EPWETISEEVNIAGDSLGLA
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CCDS58 LPPPP------ASPGSRTSPQELSE-ELSRRLQITPDSNGEQFSSLIQREPSSRLRSCSV
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pF1KB8 MDPVRQQSGNANTETLPSGWEQRKDPHGRTYYVDHNTRTTTWERPQPLPPGWERRVDDRR
: : .: :. :: :. : . ... .::. :
CCDS58 TDAVAEQ-GH-----LPPLAED--GASGSATNSNNHLIEPQIRRPRSL------------
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pF1KB8 RVYYVDHNTRTTTWQRPTMESVRNFEQWQSQRNQLQGAMQQFNQRYLYSASMLAAENDPY
.. :.: . : .:.... .. .. :.. : : :. : ..
CCDS58 -------SSPTVTLSAP-LEGAKDSPVRRAVKDTLSNP--QSPQPSPYN-SPKPQHKVTQ
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pF1KB8 GPLPPGWEKRVDSTDRVYFVNHNTKTTQWEDPRTQ---------GLQNEE--PLPEGWEI
. :::::: :. . : .:..:::::: ::::: . .:. .. ::: :::
CCDS58 SFLPPGWEMRIAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKFPVHMRSKTSLNPNDLGPLPPGWEE
440 450 460 470 480 490
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pF1KB8 RYTREGVRYFVDHNTRTTTFKDPRNGKSSVTKGGPQIAYERGFRWKLAHFRYLCQSNA-L
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CCDS58 RIHLDGRTFYIDHNSKITQWEDPRLQNPAIT--GPAVPYSREFKQKYDYFRKKLKKPADI
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pF1KB8 PSHVKINVSRQTLFEDSFQQIMALK-PYDLRRRLYVIFRGEEGLDYGGLAREWFFLLSHE
:.. .... :...::.:...::..: : :. ::.. :..:.::::::.:::::::::.:
CCDS58 PNRFEMKLHRNNIFEESYRRIMSVKRPDVLKARLWIEFESEKGLDYGGVAREWFFLLSKE
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pF1KB8 VLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASTI-NPDHLSYFCFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLP
..::.: ::::.. .:: ::::: : . : :::::: :::: ..:.::::..: : :
CCDS58 MFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFTFIGRVAGLAVFHGKLLDGFFIRP
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CCDS58 FYKMMLGKQITLNDMESVDSEYYNSLKWILENDPTE--LDLMFCIDEENFGQTYQVDLKP
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pF1KB8 GGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKAFLDGFNEVVPLQWLQYFDEKELEVML
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CCDS58 NGSEIMVTNENKREYIDLVIQWRFVNRVQKQMNAFLEGFTELLPIDLIKIFDENELELLM
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pF1KB8 CGMQEVDLADWQRNTVYRH-YTRNSKQIIWFWQFVKETDNEVRMRLLQFVTGTCRLPLGG
::. .::. ::.....:.. : : : :::. : : : :.::::::::: :.:..:
CCDS58 CGLGDVDVNDWRQHSIYKNGYCPNHPVIQWFWKAVLLMDAEKRIRLLQFVTGTSRVPMNG
790 800 810 820 830 840
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pF1KB8 FAELMGSNGPQKFCIEKVGKDTWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEETEGFG
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CCDS58 FAELYGSNGPQLFTIEQWGSPEKLPRAHTCFNRLDLPPYETFEDLREKLLMAVENAQGFE
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 QE
CCDS58 GVD
910
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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