Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7993
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7993, 469 aa
1>>>pF1KB7993 469 - 469 aa - 469 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6341+/-0.000585; mu= -7.9350+/- 0.036
mean_var=290.1137+/-59.050, 0's: 0 Z-trim(115.6): 189 B-trim: 1269 in 3/53
Lambda= 0.075299
statistics sampled from 26007 (26219) to 26007 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 9.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskel ( 469) 2904 329.5 1.2e-89
XP_011536627 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 2492 284.7 3.4e-76
NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,14804 ( 590) 1741 203.2 1.6e-51
NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II c ( 564) 1722 201.2 6.3e-51
NP_775109 (OMIM: 612315,615735) keratin, type II c ( 564) 1710 199.9 1.6e-50
NP_005546 (OMIM: 148042,615728) keratin, type II c ( 564) 1709 199.7 1.7e-50
NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II c ( 551) 1707 199.5 1.9e-50
NP_001243222 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 483) 1693 198.0 4.9e-50
NP_002264 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskel ( 483) 1693 198.0 4.9e-50
NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytos ( 511) 1693 198.0 5.2e-50
XP_016874783 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, ty ( 292) 1657 193.9 5e-49
NP_476429 (OMIM: 122100,148043) keratin, type II c ( 628) 1623 190.4 1.2e-47
NP_002263 (OMIM: 123940,193900) keratin, type II c ( 520) 1616 189.6 1.7e-47
NP_787028 (OMIM: 611160) keratin, type II cytoskel ( 535) 1595 187.3 8.6e-47
NP_056932 (OMIM: 616671) keratin, type II cytoskel ( 638) 1569 184.6 7e-46
XP_011536637 (OMIM: 602766) PREDICTED: keratin, ty ( 600) 1558 183.4 1.5e-45
NP_149034 (OMIM: 602766) keratin, type II cuticula ( 600) 1558 183.4 1.5e-45
NP_778238 (OMIM: 608247) keratin, type II cytoskel ( 540) 1548 182.2 3e-45
NP_542785 (OMIM: 608246) keratin, type II cytoskel ( 511) 1546 182.0 3.3e-45
NP_001139697 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 511) 1546 182.0 3.3e-45
NP_006112 (OMIM: 113800,139350,144200,146590,60096 ( 644) 1514 178.6 4.4e-44
XP_016874325 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 419) 1508 177.8 4.9e-44
XP_016874323 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 442) 1504 177.4 7e-44
NP_258259 (OMIM: 608245,615896) keratin, type II c ( 523) 1494 176.4 1.7e-43
XP_016874238 (OMIM: 608245,615896) PREDICTED: kera ( 441) 1479 174.7 4.6e-43
NP_778253 (OMIM: 611158) keratin, type II cytoskel ( 578) 1467 173.5 1.4e-42
NP_778223 (OMIM: 194300,608248,613981,614929) kera ( 529) 1465 173.2 1.5e-42
NP_000414 (OMIM: 146800,600194) keratin, type II c ( 639) 1430 169.5 2.5e-41
NP_002274 (OMIM: 602032,602767) keratin, type II c ( 507) 1388 164.8 4.8e-40
NP_775487 (OMIM: 611159) keratin, type II cytoskel ( 520) 1387 164.7 5.3e-40
NP_149022 (OMIM: 601078) keratin, type II cuticula ( 513) 1372 163.1 1.6e-39
NP_002272 (OMIM: 158000,602153) keratin, type II c ( 505) 1348 160.5 9.8e-39
NP_001307127 (OMIM: 158000,601928) keratin, type I ( 486) 1347 160.4 1e-38
XP_016874785 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 486) 1347 160.4 1e-38
XP_005268923 (OMIM: 158000,601928) PREDICTED: kera ( 563) 1347 160.4 1.2e-38
NP_002273 (OMIM: 158000,602765) keratin, type II c ( 493) 1333 158.9 3e-38
XP_016874324 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 439) 1306 155.9 2.1e-37
XP_016874322 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 445) 1306 155.9 2.1e-37
NP_001287743 (OMIM: 611159) keratin, type II cytos ( 410) 1165 140.6 8e-33
XP_011536590 (OMIM: 611158) PREDICTED: keratin, ty ( 345) 1091 132.5 1.8e-30
NP_872313 (OMIM: 611161) keratin, type II cytoskel ( 452) 1063 129.5 1.9e-29
NP_001074961 (OMIM: 611161) keratin, type II cytos ( 422) 1057 128.8 2.8e-29
NP_001139698 (OMIM: 608246) keratin, type II cytos ( 469) 1027 125.6 2.9e-28
XP_011536559 (OMIM: 608247) PREDICTED: keratin, ty ( 508) 920 114.0 9.8e-25
XP_016874326 (OMIM: 608246) PREDICTED: keratin, ty ( 271) 911 112.8 1.2e-24
NP_001287739 (OMIM: 602032,602767) keratin, type I ( 295) 890 110.6 6e-24
NP_003371 (OMIM: 116300,193060) vimentin [Homo sap ( 466) 795 100.4 1.1e-20
XP_006717563 (OMIM: 116300,193060) PREDICTED: vime ( 466) 795 100.4 1.1e-20
NP_006149 (OMIM: 162280,607684,607734) neurofilame ( 543) 793 100.2 1.5e-20
XP_011536312 (OMIM: 611159) PREDICTED: keratin, ty ( 488) 782 99.0 3.1e-20
>>NP_005547 (OMIM: 148059) keratin, type II cytoskeletal (469 aa)
initn: 2904 init1: 2904 opt: 2904 Z-score: 1730.4 bits: 329.5 E(85289): 1.2e-89
Smith-Waterman score: 2904; 99.6% identity (100.0% similar) in 469 aa overlap (1-469:1-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGGLGSSSLYGLGASRPRVAVRSAYGGPVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGGLGSSSLYGLGASRPRVAVRSAYGGPVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKLLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TKWTLLQEQKSAKSSRLPDIFEAQIAGLRGQLEALQVDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TKWTLLQEQKSAKSSRLPDIFEAQIAGLRGQLEALQVDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTELQSQI
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EDEINHRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTELQSQI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQEELEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQEELEAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISVMNSTG
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LQRGKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISVMNSTG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB7 GSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPGLLKAYSIRTASASRRSARD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPGLLKAYSIRTASASRRSARD
430 440 450 460
>>XP_011536627 (OMIM: 148059) PREDICTED: keratin, type I (445 aa)
initn: 2492 init1: 2492 opt: 2492 Z-score: 1488.8 bits: 284.7 E(85289): 3.4e-76
Smith-Waterman score: 2492; 99.3% identity (100.0% similar) in 403 aa overlap (1-403:1-403)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGGLGSSSLYGLGASRPRVAVRSAYGGPVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGGLGSSSLYGLGASRPRVAVRSAYGGPVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKLLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TKWTLLQEQKSAKSSRLPDIFEAQIAGLRGQLEALQVDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TKWTLLQEQKSAKSSRLPDIFEAQIAGLRGQLEALQVDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTELQSQI
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDEINHRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTELQSQI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQEELEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQEELEAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISVMNSTG
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_011 LQRGKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRVCKLRPHAGFLFVNQVFL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB7 GSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPGLLKAYSIRTASASRRSARD
XP_011 EPSHTASFKYCLWLWLLYMTTEWSS
430 440
>>NP_000415 (OMIM: 131760,131800,131900,131960,148040,17 (590 aa)
initn: 1895 init1: 1328 opt: 1741 Z-score: 1046.2 bits: 203.2 E(85289): 1.6e-51
Smith-Waterman score: 1756; 61.7% identity (80.4% similar) in 491 aa overlap (1-468:74-559)
10 20 30
pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSAR
.:: :. : .: .: .: : ..:
NP_000 GGFGRVSLAGACGVGGYGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFG-GGAG
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80
pF1KB7 PG---GLGSSSLYGLGASRPRVAVRSAYGGP-----VGAGIREVTINQSLLAPLRLDADP
: : :... .:::.. .. ...::: .::.:::.:::::.:: :. ::
NP_000 SGFGFGGGAGGGFGLGGG---AGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDP
110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 SLQRVRQEESEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKLLETKWTLLQEQKSAKSSR--LPDI
:.:::: :: :::::::::::::::::::::::::.:.::::::::: . :. : : .
NP_000 SIQRVRTEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGT-KTVRQNLEPL
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 FEAQIAGLRGQLEALQVDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKD
:: : .:: ::... . :::..:::.:::.:::::::::::::.::.::::::.::::
NP_000 FEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKD
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 VDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGI
::::::.::::::::::: :::::.. . ..::...:...:::::::::::.:.::::.:
NP_000 VDAAYMNKVELEAKVDALMDEINFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSI
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 IAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQA
::::::::::.:. ::.:::.:::::.: :: ::.::::::::..::::::: ::::.:
NP_000 IAEVKAQYEEIANRSRTEAESWYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRA
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 EIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQEELEAALQRAKQDMARQLREYQELMS
::::.:.: :.:. :::.::.:::::::::: : ::: :::.::::::: ::::::::.
NP_000 EIDNVKKQCANLQNAIADAEQRGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMN
400 410 420 430 440 450
390 400 410 420 430
pF1KB7 VKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISVMNST------GGSSSGGGIGLTLGG
.:::::.::::::::::::: ::.:.::: :::::..:. .::. :::.: :::
NP_000 TKLALDVEIATYRKLLEGEECRLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGG
460 470 480 490 500 510
440 450 460
pF1KB7 TMG-------SNALSFSSSAGPGLLKAYSIRTASASRRSARD
.: :.. :::.: :: . :. .. : :.:
NP_000 GLGGGLAGGSSGSYYSSSSGGVGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFV
520 530 540 550 560 570
NP_000 STTSSSRKSFKS
580 590
>>NP_005545 (OMIM: 148041,615726) keratin, type II cytos (564 aa)
initn: 1794 init1: 1311 opt: 1722 Z-score: 1035.3 bits: 201.2 E(85289): 6.3e-51
Smith-Waterman score: 1722; 64.3% identity (84.9% similar) in 445 aa overlap (14-450:90-524)
10 20 30 40
pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGGLGSSSLYGLG
: .:.: :. .. :: : . .:::
NP_005 SLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFG----GGAGIG--FGLG
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90
pF1KB7 ASRPRVAVRSAYGGP-----VGAGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTL
.. ... ...::: .::.:::.:::::.:: :. ::..:::: :: ::::::
NP_005 GG---AGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTL
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 NNKFASFIDKVRFLEQQNKLLETKWTLLQEQKSAKSSR--LPDIFEAQIAGLRGQLEALQ
:::::::::::::::::::.::::::::::: . :. : : .:: : .:: ::...
NP_005 NNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGT-KTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIV
180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 VDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVD
. :::..:::.:::.:::::::::::::.:::::::::.::::::::::.::::.::.:
NP_005 GERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKAD
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 ALNDEINFLRTLNETELTELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSR
.:.:::::::.: ..::...:..::::::::::::.:.::::.:::::::::::.:. ::
NP_005 TLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSR
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 AEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAI
::::.:::::.: ::. ::.::::::::..::.:.:: ::::..:::..:.: :.:.:::
NP_005 AEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAI
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 AEAEERGELALKDARAKQEELEAALQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLL
:.::.:::.:::::. : : :: :::.::::.:: :.::::::.::::::.:::::::::
NP_005 ADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLL
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400 410 420 430 440 450
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:::: :: :.::: :::::..:: .:. ::. :. : : :... :..:. : :
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460
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10 20 30 40
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.. ... ...::: .::.:::.:::::.:: :. ::..:::: :: ::::::
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:::::::::::::::::::.:.::::::::: . :. : : .:: : .:: ::...
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. :::..:::.:::.:::.:::::::::.:::::::::.::::::::::.::::.::.:
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.:.:::::::.: ..::...:..::::::::::::.:.::::.:::::::::::.:. ::
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:::: :: :.::: ::.::..:: .:. ::. :. : : :... :..:. : :
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pF1KB7 SIRTASASRRSARD
NP_775 SSGRAIGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
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: .:.: :. .. :: : . .:::
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.. ... ...::: .::.:::.:::::.:: :. ::..:::: :: ::::::
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:::::::::::::::::::.:.::::::::: ..:. : : .:: : .:: ::. .
NP_005 NNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQ-GTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIV
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pF1KB7 VDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVD
. :::..:::.:::.:::.:::::::::.:::::::::.::::::::::.::::.::.:
NP_005 GERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKAD
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220 230 240 250 260 270
pF1KB7 ALNDEINFLRTLNETELTELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSR
.:.:::::::.: ..::...:..::::::::::::.:.::::.:::::::::::.:. ::
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pF1KB7 AEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAI
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NP_005 AEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAI
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pF1KB7 AEAEERGELALKDARAKQEELEAALQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLL
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NP_005 ADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLL
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pF1KB7 EGEESRLAGDGVGAVNISVMNST---G-GSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPGLL
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NP_005 EGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGG--GS---SYSYGSGLGVG
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pF1KB7 KAYSIRTASASRRSARD
..: .. :.
NP_005 GGFSSSSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
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>>NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II cytos (551 aa)
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pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGGL
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NP_004 SRQSSITFQSGSRRGFSTTSAITPAAGRSRFSS-VSVARSAA--GSGGLGRISSA-GASF
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pF1KB7 GSSSLYGLGASRPRVAV-------RSA----------------YGGPVGAG---------
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pF1KB7 ----IREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKL
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NP_004 PPGGIQEVTVNQSLLTPLHLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKV
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pF1KB7 LETKWTLLQEQKSAKSSR--LPDIFEAQIAGLRGQLEALQVDGGRLEAELRSMQDVVEDF
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NP_004 LETKWALLQEQGS-RTVRQNLEPLFDSYTSELRRQLESITTERGRLEAELRNMQDVVEDF
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pF1KB7 KNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTEL
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NP_004 KVRYEDEINKRTAAENEFVALKKDVDAAYMNKVELEAKVKSLPEEINFIHSVFDAELSQL
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 QSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAGK
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::::::::..::::::: ::::.::::..:.: ..:..:::.::.:::::::::::: .
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pF1KB7 LEAALQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISVM
:: :::.::::::: ::::::::..:::::.::::::::::::: ::.:.::. :::::.
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.:: :..:: :: .: ::: : ::..:.: .:
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:::::::::::::::::::::.:.::::::::::..:. ::::::. :: :.: ::. ::
NP_001 LQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAG
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pF1KB7 KHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQE
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NP_001 KHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLS
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pF1KB7 ELEAALQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISV
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NP_001 ELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLES---GMQNMSI
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pF1KB7 MNST-----GGSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPGLL-KAYSIRTASASRRSARD
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NP_001 GKLVSESSDVLPK
480
>>NP_002264 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskeletal (483 aa)
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pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGG-LGSSSLYGLGASRPRVAVRSAYG
: : :: :::.:. .. ::. ..:::. .:.: : .. ..::
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pF1KB7 GPVG-AGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQ
: : .:: ::.:::::.:: :..::..: :: .:.:::::::::::::::::::::::
NP_002 GASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQ
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NP_002 NKMLETKWSLLQQQKTARSN-MDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGLVED
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pF1KB7 FKNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEAKVDALNDEINFLRTLNETELTE
::::::::::.:: :::::..::::: :::.:::::.....:.::::::: : : :. :
NP_002 FKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLYEEEIRE
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pF1KB7 LQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAKCSRAEAEAWYQTKFETLQAQAG
:::::::::::::::::::::.:.::::::::::..:. ::::::. :: :.: ::. ::
NP_002 LQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYEELQSLAG
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pF1KB7 KHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLEAAIAEAEERGELALKDARAKQE
::::::: :..::::::: :.::::::...:.:::.::::::.::.:::::.::: ::
NP_002 KHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLEAAIADAEQRGELAIKDANAKLS
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pF1KB7 ELEAALQRAKQDMARQLREYQELMSVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLAGDGVGAVNISV
::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: . : :.:.
NP_002 ELEAALQRAKQDMARQLREYQELMNVKLALDIEIATYRKLLEGEESRLES---GMQNMSI
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pF1KB7 MNST-----GGSSSGGGIGLTLGGTMGSNALSFSSSAGPGLL-KAYSIRTASASRRSARD
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NP_002 HTKTTSGYAGGLSSAYG-GLTSPGLSYSLGSSFGSGAGSSSFSRTSSSRAVVVKKIETRD
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NP_002 GKLVSESSDVLPK
480
>>NP_001243211 (OMIM: 148060) keratin, type II cytoskele (511 aa)
initn: 1242 init1: 1242 opt: 1693 Z-score: 1018.9 bits: 198.0 E(85289): 5.2e-50
Smith-Waterman score: 1693; 62.9% identity (81.8% similar) in 472 aa overlap (6-469:37-498)
10 20 30
pF1KB7 MSIHFSSPVFTSRSAAFSGRGAQVRLSSARPGG-L
: : :: :::.:. .. ::. .
NP_001 SQDLQEGISAWFGPPASTPASTMSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRS-----YTSGPGSRI
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pF1KB7 GSSSLYGLGASRPRVAVRSAYGGPVG-AGIREVTINQSLLAPLRLDADPSLQRVRQEESE
.:::. .:.: : .. ..::: : .:: ::.:::::.:: :..::..: :: .:.:
NP_001 SSSSFSRVGSSNFRGGLGGGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKE
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pF1KB7 QIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKLLETKWTLLQEQKSAKSSRLPDIFEAQIAGLRGQLE
::::::::::::::::::::::::.:::::.:::.::.:.:. . ..::. : .:: :::
NP_001 QIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKMLETKWSLLQQQKTARSN-MDNMFESYINNLRRQLE
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pF1KB7 ALQVDGGRLEAELRSMQDVVEDFKNKYEDEINRRTAAENEFVVLKKDVDAAYMSKVELEA
.: . .::::: .:: .:::::::::::::.:: :::::..::::: :::.:::::.
NP_001 TLGQEKLKLEAELGNMQGLVEDFKNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELES
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KVDALNDEINFLRTLNETELTELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDLDGIIAEVKAQYEEMAK
....:.::::::: : : :. ::::::::::::::::::::::.:.::::::::::..:.
NP_001 RLEGLTDEINFLRQLYEEEIRELQSQISDTSVVLSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIAN
250 260 270 280 290 300
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pF1KB7 CSRAEAEAWYQTKFETLQAQAGKHGDDLRNTRNEISEMNRAIQRLQAEIDNIKNQRAKLE
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NP_001 RSRAEAESMYQIKYEELQSLAGKHGDDLRRTKTEISEMNRNISRLQAEIEGLKGQRASLE
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