Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7883
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7883, 579 aa
1>>>pF1KB7883 579 - 579 aa - 579 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0840+/-0.000823; mu= 8.3217+/- 0.050
mean_var=187.5268+/-38.491, 0's: 0 Z-trim(115.0): 15 B-trim: 164 in 1/50
Lambda= 0.093658
statistics sampled from 15537 (15547) to 15537 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.783), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16
Scan time: 3.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46110.1 RELB gene_id:5971|Hs108|chr19 ( 579) 4018 555.1 8.7e-158
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CCDS44651.1 RELA gene_id:5970|Hs108|chr11 ( 548) 1133 165.3 1.9e-40
CCDS73322.1 RELA gene_id:5970|Hs108|chr11 ( 448) 1115 162.7 8.6e-40
CCDS74515.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2 ( 587) 975 143.9 5.2e-34
CCDS1864.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2 ( 619) 975 143.9 5.4e-34
CCDS54783.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4 ( 968) 529 83.8 1.1e-15
CCDS3657.1 NFKB1 gene_id:4790|Hs108|chr4 ( 969) 529 83.8 1.1e-15
CCDS41565.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10 ( 899) 477 76.8 1.3e-13
CCDS41564.1 NFKB2 gene_id:4791|Hs108|chr10 ( 900) 477 76.8 1.3e-13
>>CCDS46110.1 RELB gene_id:5971|Hs108|chr19 (579 aa)
initn: 4018 init1: 4018 opt: 4018 Z-score: 2946.3 bits: 555.1 E(32554): 8.7e-158
Smith-Waterman score: 4018; 100.0% identity (100.0% similar) in 579 aa overlap (1-579:1-579)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLRSGPASGPSVPTGRAMPSRRVARPPAAPELGALGSPDLSSLSLAVSRSTDELEIIDEY
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CCDS46 MLRSGPASGPSVPTGRAMPSRRVARPPAAPELGALGSPDLSSLSLAVSRSTDELEIIDEY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IKENGFGLDGGQPGPGEGLPRLVSRGAASLSTVTLGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPAPG
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CCDS46 IKENGFGLDGGQPGPGEGLPRLVSRGAASLSTVTLGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPAPG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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CCDS46 PGPQPHLVITEQPKQRGMRFRYECEGRSAGSILGESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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CCDS46 TACLVWKDWPHRVHPHSLVGKDCTDGICRVRLRPHVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RKIQLGIDPYNAGSLKNHQEVDMNVVRICFQASYRDQQGQMRRMDPVLSEPVYDKKSTNT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SELRICRINKESGPCTGGEELYLLCDKVQKEDISVVFSRASWEGRADFSQADVHRQIAIV
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CCDS46 SELRICRINKESGPCTGGEELYLLCDKVQKEDISVVFSRASWEGRADFSQADVHRQIAIV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 FKTPPYEDLEIVEPVTVNVFLQRLTDGVCSEPLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLG
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CCDS46 FKTPPYEDLEIVEPVTVNVFLQRLTDGVCSEPLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ELNSSDPHGIESKRRKKKPAILDHFLPNHGSGPFLPPSALLPDPDFFSGTVSLPGLEPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ELNSSDPHGIESKRRKKKPAILDHFLPNHGSGPFLPPSALLPDPDFFSGTVSLPGLEPPG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 GPDLLDDGFAYDPTAPTLFTMLDLLPPAPPHASAVVCSGGAGAVVGETPGPEPLTLDSYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GPDLLDDGFAYDPTAPTLFTMLDLLPPAPPHASAVVCSGGAGAVVGETPGPEPLTLDSYQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB7 APGPGDGGTASLVGSNMFPNHYREAAFGGGLLSPGPEAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APGPGDGGTASLVGSNMFPNHYREAAFGGGLLSPGPEAT
550 560 570
>>CCDS31609.1 RELA gene_id:5970|Hs108|chr11 (551 aa)
initn: 1080 init1: 736 opt: 1142 Z-score: 846.4 bits: 166.5 E(32554): 8e-41
Smith-Waterman score: 1142; 42.4% identity (68.4% similar) in 446 aa overlap (114-552:7-436)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 SRGAASLSTVTLGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPA-PGPGPQPHLVITEQPKQRGMRFRY
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CCDS31 MDELFPLIFPAEPAQASGPYVEIIEQPKQRGMRFRY
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 ECEGRSAGSILGESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKD
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CCDS31 KCEGRSAGSIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRIS--LVTKDPPHRPHPHELVGKD
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 CTDGICRVRLRPHVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIERKIQLGIDPYNAGSLKNHQEVD
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CCDS31 CRDGFYEAELCPDRCI-HSFQNLGIQCVKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQVPIEEQRGDYD
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 MNVVRICFQASYRDQQGQMRRMDPVLSEPVYDKKSTNTSELRICRINKESGPCTGGEELY
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CCDS31 LNAVRLCFQVTVRDPSGRPLRLPPVLSHPIFDNRAPNTAELKICRVNRNSGSCLGGDEIF
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 LLCDKVQKEDISVVFSRASWEGRADFSQADVHRQIAIVFKTPPYEDLEIVEPVTVNVFLQ
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CCDS31 LLCDKVQKEDIEVYFTGPGWEARGSFSQADVHRQVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLR
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 RLTDGVCSEPLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLGELNSSDPHGIESKRRKKKPAIL
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CCDS31 RPSDRELSEPMEFQYLPDTDDRHRIEEKRKRTYETFKSIMKKSPFSGPTDPR----PPPR
280 290 300 310 320
450 460 470 480 490
pF1KB7 DHFLPNHGSGPFLPPSALLPDPDFFSGTVS------LPGLEPPGGPDLLDDGFAYDPTAP
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CCDS31 RIAVPSRSSASVPKPA---PQPYPFTSSLSTINYDEFPTMVFPSGQ--ISQASALAPAPP
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 TLFTMLDLLPPAPPHASAVVCSGGAGAVVGETPGPEPLTLDSYQAPGPGDGGTASLVGSN
.. . ::: .::.. . . :. .::: : .. . :: : ..: ..:
CCDS31 QVLPQAPAPAPAPAMVSALAQAPAPVPVL--APGP-PQAV-APPAPKPTQAGEGTLSEAL
390 400 410 420 430 440
560 570
pF1KB7 MFPNHYREAAFGGGLLSPGPEAT
CCDS31 LQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAI
450 460 470 480 490 500
>>CCDS44651.1 RELA gene_id:5970|Hs108|chr11 (548 aa)
initn: 975 init1: 614 opt: 1133 Z-score: 839.8 bits: 165.3 E(32554): 1.9e-40
Smith-Waterman score: 1133; 42.4% identity (68.2% similar) in 446 aa overlap (114-552:7-433)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 SRGAASLSTVTLGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPA-PGPGPQPHLVITEQPKQRGMRFRY
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CCDS44 MDELFPLIFPAEPAQASGPYVEIIEQPKQRGMRFRY
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 ECEGRSAGSILGESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKD
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CCDS44 KCEGRSAGSIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRIS--LVTKDPPHRPHPHELVGKD
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 CTDGICRVRLRPHVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIERKIQLGIDPYNAGSLKNHQEVD
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CCDS44 CRDGFYEAELCPDRCI-HSFQNLGIQCVKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQE---EQRGDYD
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 MNVVRICFQASYRDQQGQMRRMDPVLSEPVYDKKSTNTSELRICRINKESGPCTGGEELY
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CCDS44 LNAVRLCFQVTVRDPSGRPLRLPPVLSHPIFDNRAPNTAELKICRVNRNSGSCLGGDEIF
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 LLCDKVQKEDISVVFSRASWEGRADFSQADVHRQIAIVFKTPPYEDLEIVEPVTVNVFLQ
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CCDS44 LLCDKVQKEDIEVYFTGPGWEARGSFSQADVHRQVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLR
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 RLTDGVCSEPLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLGELNSSDPHGIESKRRKKKPAIL
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CCDS44 RPSDRELSEPMEFQYLPDTDDRHRIEEKRKRTYETFKSIMKKSPFSGPTDPR----PPPR
280 290 300 310 320
450 460 470 480 490
pF1KB7 DHFLPNHGSGPFLPPSALLPDPDFFSGTVS------LPGLEPPGGPDLLDDGFAYDPTAP
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CCDS44 RIAVPSRSSASVPKPA---PQPYPFTSSLSTINYDEFPTMVFPSGQ--ISQASALAPAPP
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 TLFTMLDLLPPAPPHASAVVCSGGAGAVVGETPGPEPLTLDSYQAPGPGDGGTASLVGSN
.. . ::: .::.. . . :. .::: : .. . :: : ..: ..:
CCDS44 QVLPQAPAPAPAPAMVSALAQAPAPVPVL--APGP-PQAV-APPAPKPTQAGEGTLSEAL
390 400 410 420 430
560 570
pF1KB7 MFPNHYREAAFGGGLLSPGPEAT
CCDS44 LQLQFDDEDLGALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAI
440 450 460 470 480 490
>>CCDS73322.1 RELA gene_id:5970|Hs108|chr11 (448 aa)
initn: 1046 init1: 736 opt: 1115 Z-score: 827.9 bits: 162.7 E(32554): 8.6e-40
Smith-Waterman score: 1138; 43.3% identity (66.6% similar) in 434 aa overlap (114-535:7-432)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 SRGAASLSTVTLGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPA-PGPGPQPHLVITEQPKQRGMRFRY
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CCDS73 MDELFPLIFPAEPAQASGPYVEIIEQPKQRGMRFRY
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 ECEGRSAGSILGESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKD
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CCDS73 KCEGRSAGSIPGERSTDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRIS--LVTKDPPHRPHPHELVGKD
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 CTDGICRVRLRPHVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIERKIQLGIDPYNAGSLKNHQEVD
: ::. ...: : :::.:::::::.:...: :: ..:: . .:... ... . :
CCDS73 CRDGFYEAELCPDRCI-HSFQNLGIQCVKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQVPIEEQRGDYD
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 MNVVRICFQASYRDQQGQMRRMDPVLSEPVYDKKSTNTSELRICRINKESGPCTGGEELY
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CCDS73 LNAVRLCFQVTVRDPSGRPLRLPPVLSHPIFDNRAPNTAELKICRVNRNSGSCLGGDEIF
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 LLCDKVQKEDISVVFSRASWEGRADFSQADVHRQIAIVFKTPPYEDLEIVEPVTVNVFLQ
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CCDS73 LLCDKVQKEDIEVYFTGPGWEARGSFSQADVHRQVAIVFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLR
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430
pF1KB7 RLTDGVCSEPLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLGELNSSDPHGIESKR----RKKK
: .: :::. : ::: : . ...:::: . . ...: : . : :
CCDS73 RPSDRELSEPMEFQYLPDTDDRHRIEEKRKRTYETFKSIMKKSPFSGPTDPRPPPRRIAV
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 PAILDHFLPNHGSGPFLPPSAL-------LPDPDFFSGTVSLPGLEPPGGPDLLDDGFAY
:. . .:. . :. :.: .: : :: .: . :. :..: .. :
CCDS73 PSRSSASVPKPAPQPYPFTSSLSTINYDEFPTMVFPSGQISQASALAPAPPQVLPQAPAP
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 DPTAPTLFTMLDLLPPAPPHASAVVCSGGAGAVVGETPGPEPLTLDSYQAPGPGDGGTAS
: ::.. . : :: : : :. : : : : ..
CCDS73 AP-APAMVSALAQRPPDPAPAPL----GAPGLPNGLLSGDEDFSSIADMDFSALLSQISS
400 410 420 430 440
560 570
pF1KB7 LVGSNMFPNHYREAAFGGGLLSPGPEAT
>>CCDS74515.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2 (587 aa)
initn: 557 init1: 457 opt: 975 Z-score: 724.0 bits: 143.9 E(32554): 5.2e-34
Smith-Waterman score: 975; 50.3% identity (76.4% similar) in 292 aa overlap (125-413:8-295)
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 LGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPAPGPGPQPHLVITEQPKQRGMRFRYECEGRSAGSILG
:.. : :::.::::::::.::::::::: :
CCDS74 MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGSIPG
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKDCTDGICRVRLRP
: ::. ..: :.:.. . : .:..: :: :. :.. :::.:::::: :: ....
CCDS74 EHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGKVRIT--LVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQ
40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 HVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIERKIQLGIDPYNAG--SLKNHQEVDMNVVRICFQA
. : :.::::.::.:::.. :: .:. ::.:.:. .:.. .. :.::::.:::.
CCDS74 ERRPLF-FQNLGIRCVKKKEVKEAIITRIKAGINPFNVPEKQLNDIEDCDLNVVRLCFQV
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 SYRDQQGQMRR-MDPVLSEPVYDKKSTNTSELRICRINKESGPCTGGEELYLLCDKVQKE
:..:.. . ::.:.:.::... ::.::::::.::. : ::.:..::::::::.
CCDS74 FLPDEHGNLTTALPPVVSNPIYDNRAPNTAELRICRVNKNCGSVRGGDEIFLLCDKVQKD
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 DISVVFSRASWEGRADFSQADVHRQIAIVFKTPPYEDLEIVEPVTVNVFLQRLTDGVCSE
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CCDS74 DIEVRFVLNDWEAKGIFSQADVHRQVAIVFKTPPYCK-AITEPVTVKMQLRRPSDQEVSE
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 PLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLGELNSSDPHGIESKRRKKKPAILDHFLPNHGS
. : ::: ..:.:: :...
CCDS74 SMDFRYLPDEKDTYGNKAKKQKTTLLFQKLCQDHVNFPERPRPGLLGSIGEGRYFKKEPN
280 290 300 310 320 330
>>CCDS1864.1 REL gene_id:5966|Hs108|chr2 (619 aa)
initn: 557 init1: 457 opt: 975 Z-score: 723.7 bits: 143.9 E(32554): 5.4e-34
Smith-Waterman score: 988; 40.9% identity (66.4% similar) in 440 aa overlap (125-552:8-428)
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 LGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPAPGPGPQPHLVITEQPKQRGMRFRYECEGRSAGSILG
:.. : :::.::::::::.::::::::: :
CCDS18 MASGAYNPYIEIIEQPRQRGMRFRYKCEGRSAGSIPG
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKDCTDGICRVRLRP
: ::. ..: :.:.. . : .:..: :: :. :.. :::.:::::: :: ....
CCDS18 EHSTDNNRTYPSIQIMNYYGKGKVRIT--LVTKNDPYKPHPHDLVGKDCRDGYYEAEFGQ
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 HVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIERKIQLGIDPYNAG--SLKNHQEVDMNVVRICFQA
. : :.::::.::.:::.. :: .:. ::.:.:. .:.. .. :.::::.:::.
CCDS18 ERRPLF-FQNLGIRCVKKKEVKEAIITRIKAGINPFNVPEKQLNDIEDCDLNVVRLCFQV
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 SYRDQQGQMRR-MDPVLSEPVYDKKSTNTSELRICRINKESGPCTGGEELYLLCDKVQKE
:..:.. . ::.:.:.::... ::.::::::.::. : ::.:..::::::::.
CCDS18 FLPDEHGNLTTALPPVVSNPIYDNRAPNTAELRICRVNKNCGSVRGGDEIFLLCDKVQKD
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 DISVVFSRASWEGRADFSQADVHRQIAIVFKTPPYEDLEIVEPVTVNVFLQRLTDGVCSE
:: : : .::... :::::::::.::::::::: :.:::::.. :.: .: ::
CCDS18 DIEVRFVLNDWEAKGIFSQADVHRQVAIVFKTPPYCK-AITEPVTVKMQLRRPSDQEVSE
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 PLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLGELNSSDPHGIESKRRKKKPAILDHFLPNHGS
. : ::: ..:.:: .: .:. .. .: . : .:. :. :. : . :.
CCDS18 SMDFRYLPDEKDTYG-NKAKKQKTTLLFQKL--CQDH-VETGFRHVDQDGLE--LLTSGD
280 290 300 310 320
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 GPFLPPSALLPDPDFFSG-TVSLPGLEPPGGPDLLDDGFAYDPTAPTLFTMLDLLPPAPP
: : .. .: ::..: :: . .: : :.::. .. :
CCDS18 PPTLASQS--------AGITVNFPERPRPGLLGSIGEG-RYFKKEPNLFSHDAVVREMPT
330 340 350 360 370
520 530 540 550 560
pF1KB7 HASAVVCS-----GGAGAVVGETPGPEPLTLDSYQA---PGPGDGGTASLVGSNMFPNHY
.:. . : : .. ... . :: .:... : : .:.: :
CCDS18 GVSSQAESYYPSPGPISSGLSHHASMAPLPSSSWSSVAHPTPRSGNTNPLSSFSTRTLPS
380 390 400 410 420 430
570
pF1KB7 REAAFGGGLLSPGPEAT
CCDS18 NSQGIPPFLRIPVGNDLNASNACIYNNADDIVGMEASSMPSADLYGISDPNMLSNCSVNM
440 450 460 470 480 490
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: :.: : :::::::.:::: ::: : :
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.. : :: . .:. : ... :. . ..: . :: . ..: :::::: : :::: :
CCDS54 GLPGASSEKNKKSYPQVKI--CNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGICTV
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:. . .: :::: : ::.. ..: : . : :: :
CCDS54 TAGPK-DMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHPDLAYLQAEGGG
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pF1KB7 ---------------SLKNHQEVDMNVVRICFQASYRDQQGQM-RRMDPVLSEPVYDKKS
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CCDS54 DRQLGDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYDSKA
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CCDS54 PNASNLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPTD
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::::.::::::: :.:..:..:..: : :.: .: ::: :: : :. .:. :..::.
CCDS54 VHRQFAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEVQRKRQ
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. :: : :: : : ... . :.: :. .: : ..:
CCDS54 KLMP------NFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGS-TGPGYSFPHYGFPTYGGI
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. ::
CCDS54 TFHPGTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVG
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pF1KB7 ESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKDCTDGICRVRLRP
:: . .:. : ... :. . ..: . :: . ..: :::::: : :::: : :
CCDS36 ASSEKNKKSYPQVKI--CNYVGPAKVIVQLVTNGKNIHLHAHSLVGKHCEDGICTVTAGP
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. . .: :::: : ::.. ..: : . : :: :
CCDS36 K-DMVVGFANLGILHVTKKKVFETLEARMTEACIRGYNPGLLVHPDLAYLQAEGGGDRQL
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pF1KB7 -----------SLKNHQEVDMNVVRICFQASYRDQQGQM-RRMDPVLSEPVYDKKSTNTS
.:.. .:.:..:::. : : :. :.. ::..::.:. .::.:. :.:
CCDS36 GDREKELIRQAALQQTKEMDLSVVRLMFTAFLPDSTGSFTRRLEPVVSDAIYDSKAPNAS
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pF1KB7 ELRICRINKESGPCTGGEELYLLCDKVQKEDISVVFSRAS-----WEGRADFSQADVHRQ
.:.: :... .: :::::.:::::::::.::.. : . ::: .::: .:::::
CCDS36 NLKIVRMDRTAGCVTGGEEIYLLCDKVQKDDIQIRFYEEEENGGVWEGFGDFSPTDVHRQ
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CCDS36 FAIVFKTPKYKDINITKPASVFVQLRRKSDLETSEPKPFLYYPEIKDKEEVQRKRQKLMP
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pF1KB7 DVLGELNSSDPHGIESKRRKKKPAILDHFLPNHGSGPFLPPSALLPDPDF--FSGTVSLP
: :: : : ... . :.: :. .: : ..: . :
CCDS36 ------NFSDSFGGGSGAGAGGGGMFGSGGGGGGTGS-TGPGYSFPHYGFPTYGGITFHP
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pF1KB7 GLEPPGGPDLLDDGFAYDPTAPTLFTMLDLLPPAPPHASAVVCSGGAGAVVGETPGPEPL
:
CCDS36 GTTKSNAGMKHGTMDTESKKDPEGCDKSDDKNTVNLFGKVIETTEQDQEPSEATVGNGEV
430 440 450 460 470 480
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pF1KB7 RSAGSILGESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKDCTD-
: :.. : :: .. :: :.... . : ..:: :: .. : :.: ::::::.:..
CCDS41 PSHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVD--LVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSEL
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pF1KB7 GICRVRLRPHVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIERKIQ---LGIDPYN---AGSLKNHQ
::: : . :. . .:::::. : ::.. ... .:.: : : . : . . .:
CCDS41 GICAVSVGPK-DMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQ
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 E-------VDMNVVRICFQASYRDQQGQMRR-MDPVLSEPVYDKKSTNTSELRICRINKE
: .:...::. :.: : ..:.. . ::.:.:..:.:: ..:.:.: :..:
CCDS41 EAKELKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKT
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pF1KB7 SGPCTGGEELYLLCDKVQKEDISVVF---SRASWEGRADFSQADVHRQIAIVFKTPPYED
.: ::.:.:::::::::.:: : : .. .:.. .::: .:::.: ::::.::::.
CCDS41 AGSVRGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHK
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pF1KB7 LEIVEPVTVNVFLQRLTDGVCSEPLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLGELNSSDPH
..: .:::: . :.: : :. ::: : .:. :..::....: :.:
CCDS41 MKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTF------SQPF
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pF1KB7 GIESKRRKKKPAILDHFLPNHGSGPF-LPPSALLPDPDFFSGTVSLPGLEPPGG------
: :. . . . :.: . . ::.: .: . ::. . : : ::
CCDS41 GGGSHMGGGSGGAAGGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSP-YQSGAGPM-GCYPGGGGGAQMA
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pF1KB7 ---PDLLDDGF-AYDPTAPTLFTMLDLLPPAPPHASAVVCSGGAGAVVGETPGPEPLTLD
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pF1KB7 SYQAPGPGDGGTASLVGSNMFPNHYREAAFGGGLLSPGPEAT
CCDS41 VTADARALLAGQRHLLTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNH
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pF1KB7 AASLSTVTLGPVAPPATPPPWGCPLGRLVSPAPGPGPQPHLVITEQPKQRGMRFRYECEG
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CCDS41 MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEG
10 20 30 40 50
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pF1KB7 RSAGSILGESSTEASKTLPAIELRDCGGLREVEVTACLVWKDWPHRVHPHSLVGKDCTD-
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CCDS41 PSHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVD--LVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSEL
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 GICRVRLRPHVSPRHSFNNLGIQCVRKKEIEAAIERKIQ---LGIDPYN---AGSLKNHQ
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CCDS41 GICAVSVGPK-DMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQ
120 130 140 150 160 170
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 E-------VDMNVVRICFQASYRDQQGQMRR-MDPVLSEPVYDKKSTNTSELRICRINKE
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CCDS41 EAKELKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKT
180 190 200 210 220 230
320 330 340 350 360
pF1KB7 SGPCTGGEELYLLCDKVQKEDISVVF---SRASWEGRADFSQADVHRQIAIVFKTPPYED
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CCDS41 AGSVRGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHK
240 250 260 270 280 290
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pF1KB7 LEIVEPVTVNVFLQRLTDGVCSEPLPFTYLPRDHDSYGVDKKRKRGMPDVLGELNSSDPH
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CCDS41 MKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTF------SQPF
300 310 320 330 340 350
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pF1KB7 GIESKRRKKKPAILDHFLPNHGSGPF-LPPSALLPDPDFFSGTVSLPGLEPPGG------
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CCDS41 GGGSHMGGGSGGAAGGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSP-YQSGAGPM-GCYPGGGGGAQMA
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pF1KB7 ---PDLLDDGF-AYDPTAPTLFTMLDLLPPAPPHASAVVCSGGAGAVVGETPGPEPLTLD
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CCDS41 ATVPSR-DSGEEAAEPSAPSRTPQCE--PQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYG
410 420 430 440 450 460
540 550 560 570
pF1KB7 SYQAPGPGDGGTASLVGSNMFPNHYREAAFGGGLLSPGPEAT
CCDS41 VTADARALLAGQRHLLTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNH
470 480 490 500 510 520
579 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]