Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7870
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7870, 588 aa
1>>>pF1KB7870 588 - 588 aa - 588 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7983+/-0.000959; mu= 16.7815+/- 0.058
mean_var=82.8416+/-16.194, 0's: 0 Z-trim(106.3): 74 B-trim: 89 in 1/49
Lambda= 0.140913
statistics sampled from 8811 (8889) to 8811 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16
Scan time: 3.570
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58220.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 588) 3905 804.0 0
CCDS58221.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 599) 3861 795.1 0
CCDS58219.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 622) 3516 725.0 6.9e-209
CCDS8712.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 636) 3505 722.7 3.3e-208
CCDS58222.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 540) 3310 683.1 2.5e-196
CCDS44543.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 582) 1663 348.3 1.6e-95
CCDS31430.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 625) 1663 348.3 1.7e-95
CCDS76387.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 583) 1657 347.0 3.8e-95
CCDS73259.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 626) 1657 347.1 4e-95
CCDS65641.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 775) 916 196.5 1.1e-49
CCDS971.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 774) 606 133.4 1e-30
CCDS65642.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 787) 605 133.2 1.2e-30
CCDS970.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 789) 605 133.2 1.2e-30
CCDS32307.1 ARNT2 gene_id:9915|Hs108|chr15 ( 717) 599 132.0 2.5e-30
CCDS55912.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 903) 320 75.3 3.6e-13
CCDS53892.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 920) 320 75.3 3.7e-13
CCDS53891.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 933) 320 75.4 3.7e-13
CCDS9645.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 901) 318 74.9 4.8e-13
CCDS2528.1 PER2 gene_id:8864|Hs108|chr2 (1255) 294 70.1 1.8e-11
CCDS1825.1 EPAS1 gene_id:2034|Hs108|chr2 ( 870) 291 69.4 2.1e-11
CCDS9754.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 735) 288 68.8 2.8e-11
CCDS9753.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 826) 288 68.8 3e-11
CCDS58324.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 850) 288 68.8 3.1e-11
>>CCDS58220.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 (588 aa)
initn: 3905 init1: 3905 opt: 3905 Z-score: 4291.4 bits: 804.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3905; 100.0% identity (100.0% similar) in 588 aa overlap (1-588:1-588)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAEEEAAAGGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAAEEEAAAGGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSDPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QEAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSAMIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QEAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSAMIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEGFLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEGFLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CKISVKEEHGCLPNSKKKEHRKFYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CKISVKEEHGCLPNSKKKEHRKFYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 IGRLQPYIVPQNSGEINVKPTEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IGRLQPYIVPQNSGEINVKPTEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 HQDDHNNLTDKHKAVLQSKEKILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HQDDHNNLTDKHKAVLQSKEKILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 NTLVLGHSEPGEASFLPCSSQSSEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NTLVLGHSEPGEASFLPCSSQSSEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 RLQSSSYLDDSSPTGLMKDTHTVNCRSMSNKELFPPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RLQSSSYLDDSSPTGLMKDTHTVNCRSMSNKELFPPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB7 PLLSDGAQLDFDALCDNDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PLLSDGAQLDFDALCDNDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
550 560 570 580
>>CCDS58221.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 (599 aa)
initn: 3861 init1: 3861 opt: 3861 Z-score: 4243.0 bits: 795.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3873; 98.2% identity (98.2% similar) in 599 aa overlap (1-588:1-599)
10 20 30 40
pF1KB7 MAAEEEAAAGG-----------KVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFP
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAAEEEAAAGGEVAGGEATAPGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 RKRKGSDSDPSQEAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSAMIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RKRKGSDSDPSQEAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSAMIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 RSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEGFLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEGFLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 DQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 SRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPNSKKKEHRKFYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPNSKKKEHRKFYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSK
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 KDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQNSGEINVKPTEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQNSGEINVKPTEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 ELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKHKAVLQSKEKILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKHKAVLQSKEKILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNP
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 WTKELEYIVSVNTLVLGHSEPGEASFLPCSSQSSEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WTKELEYIVSVNTLVLGHSEPGEASFLPCSSQSSEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 TDIANEILDLQRLQSSSYLDDSSPTGLMKDTHTVNCRSMSNKELFPPSPSEMGELEATRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TDIANEILDLQRLQSSSYLDDSSPTGLMKDTHTVNCRSMSNKELFPPSPSEMGELEATRQ
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 NQSTVAVHSHEPLLSDGAQLDFDALCDNDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NQSTVAVHSHEPLLSDGAQLDFDALCDNDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
550 560 570 580 590
>>CCDS58219.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 (622 aa)
initn: 3516 init1: 3516 opt: 3516 Z-score: 3863.7 bits: 725.0 E(32554): 6.9e-209
Smith-Waterman score: 3815; 94.5% identity (94.5% similar) in 620 aa overlap (3-588:3-622)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAEEEAAAGGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAAEEEAAAGGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSDPS
10 20 30 40 50 60
70 80
pF1KB7 Q----------------------------------EAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSAMI
: :::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QSGIMTEKVVEKLSQNPLTYLLSTRIEISASSGSREAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSAMI
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 PQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEGFL
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 FVVGCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FVVGCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKL
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 IDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPNSKKKEHRKFYTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPNSKKKEHRKFYTI
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 HCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQNSGEINVKPTEFITR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQNSGEINVKPTEFITR
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 FAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKHKAVLQSKEKILTDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKHKAVLQSKEKILTDS
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 YKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGHSEPGEASFLPCSSQSSEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGHSEPGEASFLPCSSQSSEES
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 SRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSSYLDDSSPTGLMKDTHTVNCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSSYLDDSSPTGLMKDTHTVNCR
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 SMSNKELFPPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHEPLLSDGAQLDFDALCDNDDTAMAAFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SMSNKELFPPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHEPLLSDGAQLDFDALCDNDDTAMAAFM
550 560 570 580 590 600
570 580
pF1KB7 NYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
::::::::::::::::::::::
CCDS58 NYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
610 620
>>CCDS8712.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 (636 aa)
initn: 3505 init1: 3505 opt: 3505 Z-score: 3851.5 bits: 722.7 E(32554): 3.3e-208
Smith-Waterman score: 3704; 92.3% identity (92.3% similar) in 620 aa overlap (17-588:17-636)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAEEEAAAGGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MAAEEEAAAGGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSDPS
10 20 30 40 50 60
70
pF1KB7 Q------------------------------------------------EAHSQTEKRRR
: :::::::::::
CCDS87 QSGIMTEKVVEKLSQNPLTYLLSTRIEISASSGSRVEDGEHQVKMKAFREAHSQTEKRRR
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 DKMNNLIEELSAMIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 DKMNNLIEELSAMIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDN
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 ELRHLILKTAEGFLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ELRHLILKTAEGFLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVK
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 EQLSSFDISPREKLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 EQLSSFDISPREKLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCL
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 PNSKKKEHRKFYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 PNSKKKEHRKFYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQN
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 SGEINVKPTEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SGEINVKPTEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKH
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 KAVLQSKEKILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGHSEPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 KAVLQSKEKILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGHSEPGE
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 ASFLPCSSQSSEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSSYLDDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ASFLPCSSQSSEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSSYLDDSS
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 PTGLMKDTHTVNCRSMSNKELFPPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHEPLLSDGAQLDFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 PTGLMKDTHTVNCRSMSNKELFPPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHEPLLSDGAQLDFD
550 560 570 580 590 600
560 570 580
pF1KB7 ALCDNDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ALCDNDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
610 620 630
>>CCDS58222.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 (540 aa)
initn: 3368 init1: 3310 opt: 3310 Z-score: 3638.3 bits: 683.1 E(32554): 2.5e-196
Smith-Waterman score: 3322; 97.7% identity (97.9% similar) in 519 aa overlap (1-508:1-519)
10 20 30 40
pF1KB7 MAAEEEAAAGG-----------KVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFP
::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAAEEEAAAGGEVAGGEATAPGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 RKRKGSDSDPSQEAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSAMIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RKRKGSDSDPSQEAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSAMIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 RSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEGFLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEGFLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 DQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPNSKKKEHRKFYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSK
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQNSGEINVKPTEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQ
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350 360 370 380 390 400
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKHKAVLQSKEKILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNP
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410 420 430 440 450 460
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WTKELEYIVSVNTLVLGHSEPGEASFLPCSSQSSEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 TDIANEILDLQRLQSSSYLDDSSPTGLMKDTHTVNCRSVMVHSWISMPYVTMMTQPWLHL
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:::: :.... : .:. ::.:::::::.: . ::: : .:. ::::....: :::
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::::.::::. .:..:. . ... :..::::::::. ..::: .::: :: :...:
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:..::::.:::::::::.::::::::::::::::::: ..:.. :. :::..::: :.
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.: . ... .:::. :: :::.:: ::.::....:...:: . ::: .
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. . : . : ..:... : :: : : . :.. . .:... .. .
CCDS44 ITS-TPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSS-GLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGI
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: . . ::..:::..:. :::..::: : ::::. : :
CCDS44 DMIDNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
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:. ..:. .::: .:... .. ::::::..:
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pF1KB7 VHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPN--SKKKEHRKFYTIHCTGYL
:.... : .:. ::.:::::::.: . ::: : .:. ::::....: ::: ::::
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CCDS31 KDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLP
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450 460 470 480 490 500
pF1KB7 -SEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSSYLD-DSSPTGLMKDT
.: . ... .:::. :: :::.:: ::.::....:...:: . ::: .. . :
CCDS31 SGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITS-T
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pF1KB7 HTVNCRSMSNKELF----PPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHEPLLSDGAQLDFDALCD
. : ..:... : :: : : . :.. . .:... .. .: . .
CCDS31 PPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSS-GLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDN
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560 570 580
pF1KB7 --------NDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
::..:::..:. :::..::: : ::::. : :
CCDS31 DQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
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: :.:::::::::::::::...:.: :: :. .::.:.::.:.::.::::..:.::::::
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pF1KB7 GCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKLIDA
::.::::::::.:: :::::.: .: ::::::.:::::.::::::::: : .:::.::::
CCDS76 GCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDA
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pF1KB7 KTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPN--SKKKEHRK-FYTI
:::: :.... : .:. ::.:::::::.: . ::: : .:. :::: :: : ::
CCDS76 KTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTI
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pF1KB7 HCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQN-SGEINVKPTEFIT
: ::::.::::. .:..:. . ... :..::::::::. ..::: .::: :: :...
CCDS76 HSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVS
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pF1KB7 RFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKHKAVLQSKEKILTD
: :..::::.:::::::::.::::::::::::::::::: ..:.. :. :::..::: :.
CCDS76 RHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTN
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pF1KB7 SYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGHS-EPGEASF--LPCSSQS
:::. :::::.::.:.:::: ::::::.:::::.::.::.. : :. .: : : .:
CCDS76 CYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHS
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pF1KB7 -------SEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSSYLD-DSSPT
.: . ... .:::. :: :::.:: ::.::....:...:: . :::
CCDS76 MDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPL
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pF1KB7 GLMKDTHTVNCRSMSNKELF----PPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHEPLLSDGAQLD
.. . : . : ..:... : :: : : . :.. . .:... ..
CCDS76 NITS-TPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSS-GLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIG
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pF1KB7 FDALCD--------NDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
.: . . ::..:::..:. :::..::: : ::::. : :
CCDS76 IDMIDNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
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pF1KB7 MAAEEEAAAGGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSD--
:. ..:. .::: .:... .. ::::::..:
CCDS73 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQ
10 20 30 40
60 70 80 90
pF1KB7 ---------P---------------SQEAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSAMIPQCNPMAR
: ..::::: :::::::::..:.::....: :: :.:
CCDS73 ESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSR
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 KLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEGFLFVVGCERG
::::::::::::::...:.: :: :. .::.:.::.:.::.::::..:.::::::::.::
CCDS73 KLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRG
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 KILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKLIDAKTGLQ
::::::.:: :::::.: .: ::::::.:::::.::::::::: : .:::.::::::::
CCDS73 KILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLP
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 VHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPN--SKKKEHRK-FYTIHCTGY
:.... : .:. ::.:::::::.: . ::: : .:. :::: :: : ::: :::
CCDS73 VKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGY
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280 290 300 310 320 330
pF1KB7 LRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQN-SGEINVKPTEFITRFAVN
:.::::. .:..:. . ... :..::::::::. ..::: .::: :: :...: :..
CCDS73 LKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAID
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 GKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKHKAVLQSKEKILTDSYKFR
::::.:::::::::.::::::::::::::::::: ..:.. :. :::..::: :. :::.
CCDS73 GKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFK
350 360 370 380 390 400
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pF1KB7 AKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGHS-EPGEASF--LPCSSQS-----
:::::.::.:.:::: ::::::.:::::.::.::.. : :. .: : : .:
CCDS73 IKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSML
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KB7 --SEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSSYLD-DSSPTGLMKD
.: . ... .:::. :: :::.:: ::.::....:...:: . ::: .. .
CCDS73 PSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITS-
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 THTVNCRSMSNKELF----PPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHEPLLSDGAQLDFDALC
: . : ..:... : :: : : . :.. . .:... .. .: .
CCDS73 TPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSS-GLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMID
530 540 550 560 570 580
560 570 580
pF1KB7 D--------NDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
. ::..:::..:. :::..::: : ::::. : :
CCDS73 NDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
590 600 610 620
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pF1KB7 SPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSDPSQEAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSAMIPQC
..: ::. :.:::.::. : ::: :.: :
CCDS65 LRCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTC
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pF1KB7 NPMARKLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEGFLFVV
. .::: ::::.:::::.:..::.: :. . ..:.:::: :.::.::::..:.::::.:
CCDS65 SALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIV
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pF1KB7 GCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKLIDA
.:: :....:: ::. .:: :. :..:.: .:: :: :..::::. . . ...:
CCDS65 SCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDL
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KB7 KTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSC------KISVKE----EHGCLPN--SKK
::: :... . . :. ::::::.::.. : .::.. .. : . : :
CCDS65 KTGT-VKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMR-CGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVK
240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 KEHRKFYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQNSGEIN
. .: ..:::::...::: : ..:: : ::::::::: :. . :
CCDS65 DGEPHFVVVHCTGYIKAWPPADDDPEAGQGSK-----F-CLVAIGRLQVTSSPNCTDMSN
290 300 310 320 330 340
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