Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7846
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7846, 620 aa
1>>>pF1KB7846 620 - 620 aa - 620 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0517+/-0.00111; mu= -15.0826+/- 0.066
mean_var=520.3428+/-110.030, 0's: 0 Z-trim(117.4): 666 B-trim: 1092 in 1/52
Lambda= 0.056225
statistics sampled from 17390 (18153) to 17390 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.827), E-opt: 0.2 (0.558), width: 16
Scan time: 4.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1 ( 620) 4412 372.5 9e-103
CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 775) 1337 123.2 1.3e-27
CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 930) 1337 123.3 1.5e-27
CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2 (1586) 775 77.9 1.2e-13
CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1065) 767 77.1 1.4e-13
CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1106) 767 77.1 1.4e-13
CCDS53807.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 ( 978) 763 76.7 1.6e-13
CCDS5465.1 GLI3 gene_id:2737|Hs108|chr7 (1580) 765 77.1 2e-13
CCDS10511.1 GLIS2 gene_id:84662|Hs108|chr16 ( 524) 750 75.4 2.1e-13
>>CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1 (620 aa)
initn: 4412 init1: 4412 opt: 4412 Z-score: 1958.5 bits: 372.5 E(32554): 9e-103
Smith-Waterman score: 4412; 100.0% identity (100.0% similar) in 620 aa overlap (1-620:1-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEARTSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLATPAPSCYLLGSEPSSGLGLQPETHLPEG
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CCDS58 MAEARTSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLATPAPSCYLLGSEPSSGLGLQPETHLPEG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SLKRCCVLGLPPTSPASSSPCASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRSPPLTGDLGGPSKRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLKRCCVLGLPPTSPASSSPCASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRSPPLTGDLGGPSKRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RPGPASTDSHEGSLQLEACRKASFLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RPGPASTDSHEGSLQLEACRKASFLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GLGLGLAGRVVAGRQACRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 KPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PDTEADVLTECLVLQQLHTSTQLAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PDTEADVLTECLVLQQLHTSTQLAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 AHDVPSRHHPLDATTSSHHHLSPLPMAESTRDGLGPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQS
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CCDS58 AHDVPSRHHPLDATTSSHHHLSPLPMAESTRDGLGPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HSPGGQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HSPGGQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 DGLVGETHGFNPLRPNGYHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDCGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DGLVGETHGFNPLRPNGYHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDCGF
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB7 FPNGAFDHCLGHIPSIYTDT
::::::::::::::::::::
CCDS58 FPNGAFDHCLGHIPSIYTDT
610 620
>>CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 (775 aa)
initn: 1184 init1: 1184 opt: 1337 Z-score: 609.2 bits: 123.2 E(32554): 1.3e-27
Smith-Waterman score: 1394; 41.6% identity (62.1% similar) in 659 aa overlap (4-619:141-774)
10 20 30
pF1KB7 MAEARTSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLAT
::.. : .::. :. :.. :. :
CCDS64 SNSLPSYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSPT
120 130 140 150 160 170
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 PAPSCYLLGSEPS-SGLGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLPPTSPASSSPC--ASSDVTSII
. :. ::. : ..:. :::.. ... :. : :.:.. : . ..
CCDS64 SLVA-YINGSRASPANLSPQPEVYGHFLGVRGSCI-PQPRPVPGSQKGVLVAPGGLALPA
180 190 200 210 220
100 110 120 130 140
pF1KB7 RSSQTSLV-----TCVNGLRSPPLTGDLGGPSKRARPGPASTDSHEGSLQLEACRK--AS
. . .: .: .: :.. . ... ::: : .. : .. : .. .:
CCDS64 YGEDGALEHERMQQLEHGGLQPGLVNHM--VVQHGLPGPDSQSA--GLFKTERLEEFPGS
230 240 250 260 270 280
150 160 170 180 190
pF1KB7 FLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLGGLGLGLA---------GRV--VA
. :: . : : : :::: : :: . :: :.. ..
CCDS64 TVDLPPAPPLPPL--PPPPGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQATLDDDGEMDGIG
290 300 310 320 330 340
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 GRQACRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIH
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CCDS64 GKHCCRWIDCSALYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYKLLIH
350 360 370 380 390 400
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 MRVHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKH
:::::::::::: :::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKH
410 420 430 440 450 460
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 QRTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHAGPDTEADVLTECL
:::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.::::... . . :.::.::
CCDS64 QRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARKKLRSSTELHPDLLTDCL
470 480 490 500 510 520
380 390 400 410 420
pF1KB7 VLQQLH--TSTQLAASDGKGGC--GLGQELLPG-VYPGSITPHNGLASGLLPPAHDV--P
..:.:. :: . ::..: : : : .: . .. .. . ..: :.: .:: : : :
CCDS64 TVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPGPGPDLYSAPIFSSNYSSRSGTAAGAVPPPHPVSHP
530 540 550 560 570 580
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SRHHPLDATTSS-HHHLSPLPMAESTRDGLGPGLLSPI-VSPLKGLGPPPLPPSS-QSHS
: : .... . .: :: ... . ..:. :: .:: . : : : : .
CCDS64 SPGHNVQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRR----VPAPSSILQRTQ
590 600 610 620 630
490 500 510 520 530
pF1KB7 PGGQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQ--GSFHSIQS-CFP-YGDCYRMAEPAA
: :. :: .: : .:.: . : . ..:. : : : : :.. :..
CCDS64 P---PYTQQPSGSHLKSYQ-PETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPPHYPDSQRIVPPVS
640 650 660 670 680 690
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 GG-------DGLVGETHGFNPLRPNGYH-SLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDV
. : :: . : . . .: ..:: : :. :.. . .:..
CCDS64 SCSVVPSFEDCLVPTSMGQASF--DVFHRAFSTHSGITVYDL------PSSSSSLFGESL
700 710 720 730 740
600 610 620
pF1KB7 VSSGPEDCGFFPNGAFDHCLGHIPSIYTDT
:: :: :. .. :.: ... :.::.
CCDS64 -RSGAEDATFLQISTVDRCPSQLSSVYTEG
750 760 770
>>CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 (930 aa)
initn: 1184 init1: 1184 opt: 1337 Z-score: 608.2 bits: 123.3 E(32554): 1.5e-27
Smith-Waterman score: 1394; 41.6% identity (62.1% similar) in 659 aa overlap (4-619:296-929)
10 20 30
pF1KB7 MAEARTSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLAT
::.. : .::. :. :.. :. :
CCDS43 SNSLPSYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSPT
270 280 290 300 310 320
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 PAPSCYLLGSEPS-SGLGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLPPTSPASSSPC--ASSDVTSII
. :. ::. : ..:. :::.. ... :. : :.:.. : . ..
CCDS43 SLVA-YINGSRASPANLSPQPEVYGHFLGVRGSCI-PQPRPVPGSQKGVLVAPGGLALPA
330 340 350 360 370 380
100 110 120 130 140
pF1KB7 RSSQTSLV-----TCVNGLRSPPLTGDLGGPSKRARPGPASTDSHEGSLQLEACRK--AS
. . .: .: .: :.. . ... ::: : .. : .. : .. .:
CCDS43 YGEDGALEHERMQQLEHGGLQPGLVNHM--VVQHGLPGPDSQSA--GLFKTERLEEFPGS
390 400 410 420 430
150 160 170 180 190
pF1KB7 FLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLGGLGLGLA---------GRV--VA
. :: . : : : :::: : :: . :: :.. ..
CCDS43 TVDLPPAPPLPPL--PPPPGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQATLDDDGEMDGIG
440 450 460 470 480 490
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 GRQACRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIH
:.. :::.:: : :.::::::::::: ::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS43 GKHCCRWIDCSALYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYKLLIH
500 510 520 530 540 550
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 MRVHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKH
:::::::::::: :::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKH
560 570 580 590 600 610
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 QRTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHAGPDTEADVLTECL
:::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.::::... . . :.::.::
CCDS43 QRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARKKLRSSTELHPDLLTDCL
620 630 640 650 660 670
380 390 400 410 420
pF1KB7 VLQQLH--TSTQLAASDGKGGC--GLGQELLPG-VYPGSITPHNGLASGLLPPAHDV--P
..:.:. :: . ::..: : : : .: . .. .. . ..: :.: .:: : : :
CCDS43 TVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPGPGPDLYSAPIFSSNYSSRSGTAAGAVPPPHPVSHP
680 690 700 710 720 730
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SRHHPLDATTSS-HHHLSPLPMAESTRDGLGPGLLSPI-VSPLKGLGPPPLPPSS-QSHS
: : .... . .: :: ... . ..:. :: .:: . : : : : .
CCDS43 SPGHNVQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRR----VPAPSSILQRTQ
740 750 760 770 780 790
490 500 510 520 530
pF1KB7 PGGQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQ--GSFHSIQS-CFP-YGDCYRMAEPAA
: :. :: .: : .:.: . : . ..:. : : : : :.. :..
CCDS43 P---PYTQQPSGSHLKSYQ-PETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPPHYPDSQRIVPPVS
800 810 820 830 840
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 GG-------DGLVGETHGFNPLRPNGYH-SLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDV
. : :: . : . . .: ..:: : :. :.. . .:..
CCDS43 SCSVVPSFEDCLVPTSMGQASF--DVFHRAFSTHSGITVYDL------PSSSSSLFGESL
850 860 870 880 890 900
600 610 620
pF1KB7 VSSGPEDCGFFPNGAFDHCLGHIPSIYTDT
:: :: :. .. :.: ... :.::.
CCDS43 -RSGAEDATFLQISTVDRCPSQLSSVYTEG
910 920 930
>>CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2 (1586 aa)
initn: 653 init1: 483 opt: 775 Z-score: 358.8 bits: 77.9 E(32554): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 810; 33.1% identity (54.2% similar) in 649 aa overlap (1-572:260-869)
10 20
pF1KB7 MAEARTSLSAH-CRGPLATG-LHPDLDLPG
. ..:.: .: : :..: : : . .:
CCDS33 KRALSISPLSDASLDLQRMIRTSPNSLVAYINNSRSSSAASGSYGHLSAGALSPAFTFP-
230 240 250 260 270 280
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 RSLATPAPSCYLLGSEPSSG--LGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLP-----PTSPASSSPC
.:. .:... . : .: : : .. ..: ::. .::: :
CCDS33 -HPINPVAYQQILSQQRGLGSAFGHTPPLIQPSPTFLAQQPMALTSINATPTQLSSSSNC
290 300 310 320 330 340
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 ASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRSPPLTGDLGGPSKRARPGPASTDSHEGSLQLEACRK
: :... .::.... . :: :.. ::.. ..:. :. :
CCDS33 LS-DTNQNKQSSESAVSSTVN-----PVA-----IHKRSK---VKTEP-------EGLRP
350 360 370 380
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 ASFLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPP-GPSLGGLGLGLAGRVVAGRQACRWV
:: : : ... : . : : :: .: ..:: . :.:
CCDS33 ASPL----ALTQGQVSGHGSCGCALPLSQEQLADLKEDLDRDDCKQEAEVVIYETNCHWE
390 400 410 420 430 440
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 DCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEK
:: :. ::.::.::.. :: .: : :.: : .:.:. :::.:.: :..::: :.:::
CCDS33 DCTKEYDTQEQLVHHINNEHIHGEKKE-FVCRWQACTREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEK
450 460 470 480 490 500
270 280 290 300 310
pF1KB7 PNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDT
:.:: :::::::.::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: .
CCDS33 PHKCTFEGCSKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNE
510 520 530 540 550 560
320 330 340 350
pF1KB7 KPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVK------AHSAKEQQ----VRKKL------------
::: :.::::.:::::::::::::: :: .:.:. .: :
CCDS33 KPYICKIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKKQRNDVHLRTPLLKENGDSEAGTE
570 580 590 600 610 620
360 370 380 390
pF1KB7 HAGPD-TEAD----VLTECLVLQQLHT-STQLAASD--GKGGCG-----LGQE-------
.::. :::. .. .:: .. ..: :. : :. ....:. ::.
CCDS33 PGGPESTEASSTSQAVEDCLHVRAIKTESSGLCQSSPGAQSSCSSEPSPLGSAPNNDSGV
630 640 650 660 670 680
400 410 420 430 440
pF1KB7 LLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHDVPSRHHPLDATTSSHHHLSPLPMAE--------S
.::. :::. ..: . ::. :. . : . . ..:.. . : :
CCDS33 EMPGTGPGSLGDLTALDD--TPPGADTSALAAPSAGGLQLRKHMTTMHRFEQLKKEKLKS
690 700 710 720 730
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 TRDGLGPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQ-----SHSPGGQPFPTLPSKPSYPPFQSPP
.:. . . .: . : :::: :.. : : :: : ::. : ...
CCDS33 LKDSCSWAGPTPHTRNTKL---PPLPGSGSILENFSGSGGGGPAGLLPN-PRLSELSASE
740 750 760 770 780 790
510 520 530 540 550
pF1KB7 PPPLPSPQGYQGSFHS-IQSCF----------PYGDCYRMAEPAAGGDGLVGETHGFNPL
: . : . : : ..: . :: . : .: . : .:. : :
CCDS33 VTMLSQLQERRDSSTSTVSSAYTVSRRSSGISPYFSSRRSSEASPLG---AGRPH--NAS
800 810 820 830 840 850
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 RPNGYHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDCGFFPNGAFDHCLGHI
..: .:: . ::
CCDS33 SADSYDPISTDASRRSSEASQCSGGSGLLNLTPAQQYSLRAKYAAATGGPPPTPLPGLER
860 870 880 890 900 910
>>CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1065 aa)
initn: 617 init1: 481 opt: 767 Z-score: 357.5 bits: 77.1 E(32554): 1.4e-13
Smith-Waterman score: 803; 32.9% identity (52.7% similar) in 583 aa overlap (36-570:16-546)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 TSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLATPAPSCYLLGSEPSSGLGLQPETHLPEGSLKRC
: : : ::.: : . : .: .
CCDS53 MFNSMTPPPISSYGEPCC--LRPLPSQG---APSVGT-EVKLTKK
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB7 CVLGLPPTSPASSSPCASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRSPP-----------LTGDLG
.:.. : : :: :. ..::.: .:::. .:. . : .. .::
CCDS53 RALSISPLSDASL------DLQTVIRTSPSSLVAFINSRCTSPGGSYGHLSIGTMSPSLG
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KB7 GPSKRA-RPGPAST---------DSHEGSLQLEACRKASFLKQEPADEFSELFGPHQQGL
:.. . ::. . :: .:.. . .. : . .:.. : : ..
CCDS53 FPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHDSARGGMIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVGKCRE--
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200
pF1KB7 PPPYPLSQLPPGPSLGGLG---LG-LAGRVVAGRQA-----------CRWVDCCAAYEQQ
:: .:. :. :: : :: :. ::: : ...:
CCDS53 ---EPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGREDLEREEKREPESVYETDCRWDGCSQEFDSQ
160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 EELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCMFEGC
:.::.::.. :: .. : :.: :.:: :. .::.:.: :..::: :.::::.:: ::::
CCDS53 EQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGC
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 SKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDTKPYACQIPG
:..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . :::.:..::
CCDS53 RKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPG
270 280 290 300 310 320
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pF1KB7 CSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHA-GPDTEADVLTECLVLQQLHTSTQLAASD
:.::::::::::::::. . . .: :. .. :: .: . :: .
CCDS53 CTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSI-----------STVEPKRE
330 340 350 360 370
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pF1KB7 GKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHD-VPSRHHPLDATTSSHHHLSPLPM
.:: . .: : :.. :. . : :.. : : : ..... .
CCDS53 REGG-PIREESRLTVPEGAMKPQPS------PGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGN
380 390 400 410 420
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pF1KB7 AESTRDGL-----GPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQSHSPG--GQPFPTLPSKPSYPP
: .. . : :: . . .: :. : : : . : : .:.: .
CCDS53 AGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKLPSLSHTGTTVS
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pF1KB7 FQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGGDGLVGETHGFNPLRP--NG
. :: : . ..: ::.: . . .: : : : : ::
CCDS53 RRVGPPVSL---ERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP-------------FPPGSPPENG
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pF1KB7 YHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDCGFFPNGAFDHCLGHIPSIY
:: .:: :
CCDS53 ASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAG
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: :: . :.. : :. : : :. : : : : :
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pF1KB7 PETH-LPEGSL---KRCCVLGLPPTSPASSSPC--ASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRS
::. :: : : : : : :: :: :. ..::.: .:::. .:. .
CCDS89 RETNSCTEGPLFSSPRSAV-KLTKKRALSISPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFINSRCT
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pF1KB7 PP-----------LTGDLGGPSKRA-RPGPAST---------DSHEGSLQLEACRKASFL
: .. .:: :.. . ::. . :: .:.. . .. :
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pF1KB7 KQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLGGLG---LG-LAGRVVAGRQA-----
. .:.. : : .. :: .:. :. :: : :: :.
CCDS89 TCQLKSELDMLVGKCRE-----EPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGREDLEREEKREPE
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pF1KB7 ------CRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLL
::: : ...::.::.::.. :: .. : :.: :.:: :. .::.:.: :.
CCDS89 SVYETDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLV
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.::: :.::::.:: :::: :..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::
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pF1KB7 KHQ-RTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHA-GPDTEADVL
::: ::: . :::.:..:::.::::::::::::::. . . .: :. .. :: .: .
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pF1KB7 TECLVLQQLHTSTQLAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHD-VPSR
:: . .:: . .: : :.. :. . : :.. :
CCDS89 -----------STVEPKREREGG-PIREESRLTVPEGAMKPQPS------PGAQSSCSSD
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: : ..... . : .. . : :: . . .: :. : : : .
CCDS89 HSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRP
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pF1KB7 PG--GQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGG
: : .:.: . . :: : . ..: ::.: . . .: :
CCDS89 IGTRGLKLPSLSHTGTTVSRRVGPPVSL---ERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP----
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550 560 570 580 590
pF1KB7 DGLVGETHGFNPLRP--NGYHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDC
: : : :: :: .:: :
CCDS89 ---------FPPGSPPENGASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGL
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pF1KB7 GFFPNGAFDHCLGHIPSIYTDT
CCDS89 PMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARVQRFKSLGCVHTPPTVAGGGQN
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pF1KB7 SSPCASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRSPPLTGDLGG--PSKRAR-PGPASTDSHEGSL
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CCDS53 MSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHDSARGGMIPHPQSRGPFPTCQLKSELDM
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pF1KB7 QLEACRKASFLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLGGLGLGLAGRVVAGR
. :: .:: . ... .:.. :. : :..: .: : .
CCDS53 LVGKCR------EEPLE--GDMSSPNSTGIQDPL-LGMLDGREDLEREEKREPESVY--E
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pF1KB7 QACRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMR
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CCDS53 TDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMR
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pF1KB7 VHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-
:.::::.:: :::: :..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.:::::::
CCDS53 RHTGEKPHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQN
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pF1KB7 RTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHA-GPDTEADVLTECL
::: . :::.:..:::.::::::::::::::. . . .: :. .. :: .: .
CCDS53 RTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSI----
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pF1KB7 VLQQLHTSTQLAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHD-VPSRHHPL
:: . .:: . .: : :.. :. . : :.. : : :
CCDS53 -------STVEPKREREGG-PIREESRLTVPEGAMKPQPS------PGAQSSCSSDHSPA
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pF1KB7 DATTSSHHHLSPLPMAESTRDGL-----GPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQSHSPG--
..... . : .. . : :: . . .: :. : : : . :
CCDS53 GSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTR
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pF1KB7 GQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGGDGLV
: .:.: . . :: : . ..: ::.: . . .: :
CCDS53 GLKLPSLSHTGTTVSRRVGPPVSL---ERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP--------
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pF1KB7 GETHGFNPLRP--NGYHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDCGFFP
: : : :: :: .:: :
CCDS53 -----FPPGSPPENGASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPP
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pF1KB7 LGSEPSSGLGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLPPTSPASSSPCASSDVTSIIRSSQTSLVTC
: : . :: .: . . : : : :: .
CCDS54 PNSLVTILNNSRSSSSASGSYGHLSASAISPALSFTYSSAPVSLHMHQQILSRQQSLGSA
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pF1KB7 VNGLRSPPLTGDLGG-PSKRARPG------PASTDS--HEGSLQLEACRKASFLKQEPAD
. .:::: :..: :: :....: :.: . . ..: .:
CCDS54 FG--HSPPLIHPAPTFPTQRPIPGIPTVLNPVQVSSGPSESSQNKPTSESAVSSTGDPMH
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pF1KB7 EFSELFGPHQQGLPPPYPLSQL--PPGPSL----GGLGLGLAGRVVAGRQACRWVDCCAA
. . : .. :: : .: : : .: : . : . :.: :
CCDS54 NKRSKIKPDED-LPSPGARGQQEQPEGTTLVKEEGDKDESKQEPEVIYETNCHWEGCARE
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pF1KB7 YEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCM
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CCDS54 FDTQEQLVHHINNDHIHGEKKE-FVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCT
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pF1KB7 FEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDTKPYAC
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CCDS54 FEGCTKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVC
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pF1KB7 QIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKK----LHAGPDTEADVLTECLVLQQLHTS
.::::.::::::::::::::. . : .: :: .: : : . :..
CCDS54 KIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPEAHVTKKQRGDIHPRPPPPRDSGS--------HSQ
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pF1KB7 TQLAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHDVPSRHHPLDATTSSHHH
.. . .:. : :.:
CCDS54 SRSPGRPTQGALGEQQDLSNTTSKREECLQVKTVKAEKPMTSQPSPGGQSSCSSQQSPIS
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pF1KB7 CYLLGSEPSSGLGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLPPTSPASSSPCASSDVTSIIRSSQTSL
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CCDS10 LKLSITKLRAAREKRERTLGVVRPRALHRELGLVDDSPTPGSP--GSPPSGFLLNSK--F
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 VTCVNG-LRSPPLTG-DLGGPSKRARPGPASTDSHE--GSLQLEACRKAS------FLKQ
:.: . . ::. .:. :: :. .:. : : :. .: .:: .:
CCDS10 PEKVEGRFSAAPLVDLSLSPPSGLDSPNGSSSLSPERQGNGDLPPVPSASDFQPLRYLDG
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CCDS10 VPSS-F-QFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPLPKQLV-----CRWAKCNQL
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pF1KB7 YEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCM
.: ..:: :.. :. .: . : : ::.:. . ::::::.:::.:.:..:::..:
CCDS10 FELLQDLVDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYKMLIHIRTHTNEKPHRC-
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pF1KB7 FEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQ
:::.:::::::::: :::::::::.: . ::.: .:::::: :: ::: ::: :.
CCDS10 -PTCSKSFSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSDRFKHTRTHYVDKPYYCK
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CCDS10 MPGCHKRYTDPSSLRKHIKAHGHFVSHEQQELLQLRPPP------------------KPP
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CCDS10 LPAPDGGPYVSGAQIIIPN--PAALFGGPGL------PGLPLPLAPGPLDLSALACGNGG
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pF1KB7 PLPMAESTRDGLGPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQSHSPGGQPFPTLPSKPSYPPFQS
. . :.:::: .:.. ::. :. :: :: . :: .:..
CCDS10 ----GSGGGGGMGPGLPGPVL-PLN-LAKNPLLPSP--FGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKA
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CCDS10 EGEKGRGSVPTRALGMEGHKTPLERTESSCSRPSPDGLPLLPGTVLDLSTGVNSAASSPE
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620 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]